SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_058932854.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058932854.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
44% identity, 95% coverage: 4:298/312 of query aligns to 6:282/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
V
Q
 
D
R
 
G
A
 
P
S
 
D
G
 
P
I
 
A
E
 
E
A
 
-
H
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
R
P
 
D
V
 
V
Q
 
D
F
 
L
V
 
L
G
 
T
R
 
H
Y
 
I
G
 
G
R
|
R
D
 
D
A
 
A
Y
 
R
G
 
G
D
 
R
S
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
E
H
 
Y
L
 
I
R
 
E
S
 
S
S
 
S
S
 
G
V
 
V
M
 
Q
L
 
L
P
 
V
L
x
S
G
|
G
P
 
S
-
 
Q
-
 
T
-
 
A
D
 
D
E
 
R
L
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
A
V
 
T
A
 
A
T
 
R
A
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
T
Y
 
Y
T
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
E
W
 
W
E
 
Q
L
 
I
P
 
P
G
 
D
L
 
T
S
 
P
D
 
P
R
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
-
M
 
-
L
 
V
Q
 
A
G
 
P
T
 
P
T
 
L
L
 
L
L
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
A
 
A
T
 
A
M
 
A
L
 
R
A
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
C
A
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
A
A
 
A
A
 
L
V
 
L
E
 
D
H
 
A
A
 
Y
H
 
R
P
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
C
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
I
 
L
I
 
S
T
 
A
D
 
D
V
 
P
D
 
D
Y
 
L
A
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
R
A
 
I
E
 
Q
K
 
R
F
 
L
V
 
V
T
 
E
L
 
R
S
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
H
W
 
W
L
 
I
Y
 
D
P
 
P
G
 
T
V
 
Q
D
 
P
V
 
P
L
 
E
E
 
Q
S
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
A
L
 
C
G
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
L
G
 
G
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
P
 
A
W
 
V
G
 
A
I
 
F
T
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
P
A
 
A
A
 
S
I
 
V
D
 
-
A
 
-
P
 
P
R
 
A
V
 
Q
E
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
F
 
F
M
 
M
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
D
G
 
T
I
 
L
V
 
W
D
 
E
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
D
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
N
 
R
R
 
R
K
 
T
D
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
K
L
 
I
P
 
G
A
 
V
E
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
E
H
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
L
A
 
T
A
 
S
A
 
A
V
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
A
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
31% identity, 98% coverage: 1:306/312 of query aligns to 7:312/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
M
 
M
L
 
I
T
 
L
V
 
C
I
 
C
G
 
G
E
 
E
G
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
M
V
 
L
Q
 
P
R
 
R
A
 
E
S
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
T
G
 
A
I
 
F
E
 
Q
A
 
P
H
 
F
V
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
V
L
 
F
N
 
N
V
 
T
A
 
A
V
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
V
P
 
P
V
 
T
Q
 
G
F
 
F
V
 
F
G
 
S
R
 
G
Y
 
I
G
 
S
R
 
S
D
 
D
A
 
F
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
S
 
V
V
 
L
A
 
R
A
 
D
H
 
T
L
 
L
R
 
A
S
 
R
S
 
S
S
 
N
V
 
V
M
 
D
L
 
Y
P
 
S
L
 
F
G
 
A
P
 
A
-
 
I
D
 
S
E
 
N
L
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
F
A
 
V
V
 
R
I
 
L
D
 
V
D
 
D
D
 
-
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
T
 
R
Y
 
Y
T
 
A
F
 
F
-
 
Y
-
 
D
-
 
E
D
 
N
L
 
T
A
 
A
W
 
G
E
 
R
L
 
M
P
 
L
G
 
S
L
 
R
S
 
N
D
 
D
R
 
-
L
 
M
A
 
P
F
 
Y
M
 
V
L
 
D
Q
 
E
G
 
T
T
 
I
T
 
S
L
 
A
L
 
M
H
 
L
T
 
F
G
 
G
S
 
C
I
 
I
A
 
S
T
 
L
M
 
I
L
 
S
A
 
E
P
 
P
G
 
C
A
 
G
A
 
S
A
 
V
V
 
Y
L
 
E
A
 
T
A
 
L
V
 
L
E
 
A
H
 
R
A
 
E
H
 
A
P
 
P
A
 
N
A
 
R
T
 
V
I
 
M
S
 
F
F
 
L
D
 
D
P
 
P
N
 
N
C
 
I
R
 
R
P
 
A
S
 
N
I
 
L
I
 
I
T
 
T
D
 
V
V
 
R
D
 
K
Y
 
T
A
 
H
R
 
L
R
 
T
Q
 
R
A
 
M
E
 
K
K
 
R
F
 
M
V
 
I
T
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
D
W
 
W
L
 
F
Y
 
G
P
 
E
G
 
K
V
 
G
D
 
S
V
 
H
L
 
D
E
 
E
S
 
I
A
 
A
R
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
S
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
P
A
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
|
T
R
 
K
G
|
G
A
|
A
A
 
H
G
|
G
P
 
A
W
 
V
G
 
A
I
 
Y
T
 
T
A
 
N
A
 
H
G
 
A
E
 
T
A
 
V
A
 
P
I
 
V
D
 
P
A
 
G
P
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
x
V
M
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
L
 
L
S
 
A
G
 
S
I
 
L
V
 
H
D
 
S
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
D
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
L
N
 
T
R
 
K
K
 
D
D
 
A
L
 
L
R
 
A
E
 
N
L
 
L
P
 
S
A
 
E
E
 
D
G
 
Q
L
 
I
A
 
H
E
 
S
L
 
A
L
 
V
A
 
A
H
 
L
A
 
G
A
x
V
R
 
R
A
 
A
A
|
A
A
 
A
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
P
 
P
P
 
P
T
 
W
R
 
A
A
 
H
E
 
E
L
 
M

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
33% identity, 74% coverage: 24:253/312 of query aligns to 27:256/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
P
L
 
A
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
S
H
 
G
P
 
R
V
 
S
Q
 
A
F
 
F
V
 
F
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
R
 
N
D
 
D
A
 
P
Y
 
F
G
 
G
D
 
R
S
 
F
V
 
M
A
 
Q
A
 
Q
H
 
T
L
 
L
R
 
T
S
 
D
S
 
E
S
 
Q
V
 
V
-
 
D
-
 
C
-
 
Q
M
 
H
L
 
L
P
 
H
L
 
F
G
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
H
L
 
-
P
 
R
T
 
T
S
 
S
V
 
T
A
 
V
T
 
V
A
 
V
V
 
D
I
 
L
D
 
D
D
 
E
D
x
H
G
 
G
A
 
E
A
 
R
T
 
S
Y
x
F
T
 
T
F
|
F
D
 
M
L
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
S
A
 
A
W
 
D
E
 
Q
L
 
F
P
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
I
L
 
P
A
 
S
F
 
F
M
 
-
L
 
-
Q
 
Q
G
 
K
T
 
G
T
 
E
L
 
W
L
 
L
H
 
H
T
 
V
G
 
C
S
 
S
I
 
I
A
 
A
T
 
L
M
 
A
L
 
N
A
 
Q
P
 
P
G
 
S
A
 
R
A
 
S
A
 
S
V
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
I
-
 
A
E
 
Q
H
 
M
A
 
K
H
 
E
P
 
V
A
 
G
A
 
G
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
C
 
L
R
|
R
P
 
E
S
 
E
I
 
V
I
 
W
T
 
S
D
 
E
V
 
P
D
 
Q
Y
 
E
A
 
L
R
 
Q
R
 
A
Q
 
T
A
 
V
E
 
M
K
 
R
F
 
A
V
 
V
T
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
W
 
F
L
 
L
Y
 
-
P
 
T
G
 
G
V
 
T
D
 
Q
V
 
S
L
 
I
E
 
E
S
 
E
A
 
G
R
 
L
R
 
Q
W
 
-
L
 
-
S
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
D
S
 
F
E
 
Q
G
 
I
P
 
P
A
 
-
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
|
A
A
 
K
G
 
G
P
 
A
W
 
L
G
 
V
I
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
N
G
 
S
E
 
Q
A
 
Q
A
 
I
I
 
V
D
 
S
A
 
G
P
 
K
R
x
A
V
|
V
E
 
K
V
 
P
A
 
I
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
32% identity, 74% coverage: 24:253/312 of query aligns to 31:260/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
P
L
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
S
H
 
G
P
 
R
V
 
S
Q
 
A
F
 
F
V
 
F
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
R
 
N
D
 
D
A
 
P
Y
 
F
G
 
G
D
 
R
S
 
F
V
 
M
A
 
Q
A
 
Q
H
 
T
L
 
L
R
 
T
S
 
D
S
 
E
S
 
Q
V
 
V
-
 
D
-
 
C
-
 
Q
M
 
H
L
 
L
P
 
H
L
 
F
G
 
D
P
 
P
D
 
V
E
 
H
L
 
-
P
 
R
T
 
T
S
 
S
V
 
T
A
 
V
T
 
V
A
 
V
V
 
D
I
 
L
D
 
D
D
 
E
D
 
C
G
 
G
A
 
E
A
 
R
T
 
S
Y
x
F
T
 
T
F
|
F
D
 
M
L
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
S
A
 
A
W
 
D
E
 
Q
L
 
F
P
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
I
L
 
P
A
 
S
F
 
F
M
 
-
L
 
-
Q
 
Q
G
 
K
T
 
G
T
 
E
L
 
W
L
 
L
H
 
H
T
 
V
G
 
C
S
 
S
I
 
I
A
 
A
T
 
L
M
 
A
L
 
N
A
 
Q
P
 
P
G
 
S
A
 
R
A
 
S
A
 
S
V
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
I
-
 
A
E
 
Q
H
 
M
A
 
K
H
 
E
P
 
V
A
 
G
A
 
G
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
C
 
L
R
|
R
P
 
E
S
 
E
I
 
V
I
 
W
T
 
S
D
 
E
V
 
P
D
 
Q
Y
 
E
A
 
L
R
 
Q
R
 
A
Q
 
T
A
 
V
E
 
M
K
 
R
F
 
A
V
 
V
T
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
|
K
A
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
W
 
F
L
 
L
Y
 
-
P
 
T
G
 
G
V
 
T
D
 
Q
V
 
S
L
 
I
E
 
E
S
 
E
A
 
G
R
 
L
R
 
Q
W
 
-
L
 
-
S
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
D
S
 
F
E
 
Q
G
 
I
P
 
P
A
 
-
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
 
A
A
 
K
G
 
G
P
 
A
W
 
L
G
 
V
I
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
N
G
 
S
E
 
Q
A
 
Q
A
 
I
I
 
V
D
 
S
A
 
G
P
 
K
R
x
A
V
|
V
E
 
K
V
 
P
A
 
I
D
 
D
T
 
C
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
28% identity, 82% coverage: 1:256/312 of query aligns to 2:256/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
M
 
L
L
 
I
T
 
A
V
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
I
Q
 
S
R
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
I
 
F
E
 
E
A
 
K
H
 
H
V
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
L
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
V
P
 
K
V
 
S
Q
 
S
F
 
L
V
 
I
G
 
S
R
 
K
Y
 
V
G
 
G
R
 
N
D
 
D
A
 
P
Y
 
F
G
 
G
D
 
E
S
 
Y
V
 
L
A
 
I
A
 
E
H
 
E
L
 
L
R
 
S
S
 
K
S
 
E
S
 
N
V
 
V
-
 
D
M
 
T
L
 
R
P
 
G
L
 
I
G
 
V
P
 
K
D
 
D
E
 
E
L
 
K
P
 
K
T
 
H
S
 
T
V
 
G
A
 
I
T
 
V
A
 
F
V
 
V
I
 
Q
D
 
L
D
 
K
D
 
G
G
 
A
A
 
S
A
 
P
T
 
S
Y
 
F
T
 
L
F
 
L
-
 
Y
-
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
E
 
F
L
 
N
P
 
M
G
 
T
L
 
L
S
 
N
D
 
D
R
 
I
L
 
N
A
 
W
F
 
D
M
 
I
L
 
V
Q
 
E
G
 
E
T
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
V
H
 
N
T
 
F
G
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
I
T
 
L
M
 
A
L
 
R
A
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
R
A
 
E
A
 
T
V
 
V
L
 
M
A
 
K
A
 
V
V
 
I
E
 
K
H
 
K
A
 
I
H
 
K
P
 
G
A
 
S
A
 
S
T
 
L
I
 
I
S
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
C
 
L
R
 
R
P
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
L
D
 
D
Y
 
L
A
 
W
R
 
R
R
 
G
Q
 
Q
A
 
E
E
 
E
K
 
E
F
 
M
-
 
I
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
S
V
 
I
T
 
K
L
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
L
W
 
Y
L
 
L
-
 
E
Y
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
E
V
 
V
L
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
K
G
 
G
P
 
S
A
 
M
L
 
L
V
 
T
V
 
A
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
 
P
A
 
K
G
 
G
P
 
F
W
 
R
G
 
L
I
 
I
T
 
-
A
 
-
A
 
K
G
 
N
E
 
E
A
 
T
A
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
V
P
 
P
R
 
S
V
 
Y
E
 
N
V
|
V
A
 
N
-
 
P
-
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
28% identity, 82% coverage: 1:256/312 of query aligns to 1:255/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
M
 
L
L
 
I
T
 
A
V
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
I
Q
 
S
R
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
I
 
F
E
 
E
A
 
K
H
 
H
V
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
L
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
V
P
 
K
V
 
S
Q
 
S
F
 
L
V
 
I
G
 
S
R
 
K
Y
 
V
G
 
G
R
 
N
D
 
D
A
 
P
Y
 
F
G
 
G
D
 
E
S
 
Y
V
 
L
A
 
I
A
 
E
H
 
E
L
 
L
R
 
S
S
 
K
S
 
E
S
 
N
V
 
V
-
 
D
M
 
T
L
 
R
P
 
G
L
 
I
G
 
V
P
 
K
D
 
D
E
 
E
L
 
K
P
 
K
T
 
H
S
 
T
V
 
G
A
 
I
T
 
V
A
 
F
V
 
V
I
 
Q
D
 
L
D
 
K
D
 
G
G
 
A
A
 
S
A
 
P
T
 
S
Y
 
F
T
 
L
F
 
L
-
 
Y
-
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
E
 
F
L
 
N
P
 
M
G
 
T
L
 
L
S
 
N
D
 
D
R
 
I
L
 
N
A
 
W
F
 
D
M
 
I
L
 
V
Q
 
E
G
 
E
T
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
V
H
 
N
T
 
F
G
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
I
T
 
L
M
 
A
L
 
R
A
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
R
A
 
E
A
 
T
V
 
V
L
 
M
A
 
K
A
 
V
V
 
I
E
 
K
H
 
K
A
 
I
H
 
K
P
 
G
A
 
S
A
 
S
T
 
L
I
 
I
S
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
C
 
L
R
 
R
P
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
L
D
 
D
Y
 
L
A
 
W
R
 
R
R
 
G
Q
 
Q
A
 
E
E
 
E
K
 
E
F
 
M
-
 
I
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
S
V
 
I
T
 
K
L
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
K
|
K
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
L
W
 
Y
L
 
L
-
 
E
Y
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
E
V
 
V
L
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
K
G
 
G
P
 
S
A
 
M
L
 
L
V
 
T
V
 
A
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
 
P
A
 
K
G
 
G
P
 
F
W
 
R
G
 
L
I
 
I
T
 
-
A
 
-
A
 
K
G
 
N
E
 
E
A
 
T
A
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
V
P
 
P
R
 
S
V
 
Y
E
 
N
V
|
V
A
 
N
-
x
P
-
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
34% identity, 82% coverage: 1:257/312 of query aligns to 1:262/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
M
 
M
L
 
L
T
 
E
V
 
V
I
 
V
-
 
T
-
 
A
G
 
G
E
 
E
G
 
P
L
 
L
V
 
V
D
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
P
R
 
Q
A
 
E
S
 
P
G
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
V
H
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
E
L
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
V
P
 
K
V
 
V
Q
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
R
 
E
D
 
D
A
 
E
Y
 
L
G
 
G
D
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
E
H
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
A
S
 
E
S
 
G
V
 
V
M
 
D
L
 
L
P
 
T
-
 
H
-
 
F
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
G
-
 
L
L
 
Y
G
 
L
P
 
R
D
 
E
E
 
Y
L
 
L
P
 
P
T
 
L
S
 
G
V
 
Q
A
 
G
T
 
R
A
 
V
V
 
F
I
 
Y
D
 
Y
D
 
R
D
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
 
G
Y
 
S
T
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
A
S
 
F
D
 
D
R
 
-
L
 
-
A
 
P
F
 
D
M
 
Y
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
V
T
 
R
L
 
F
L
 
L
H
 
H
T
 
L
G
 
S
S
 
G
I
 
I
A
 
T
T
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
F
-
 
S
L
 
L
A
 
W
A
 
A
V
 
M
E
 
E
H
 
E
A
 
A
-
 
K
H
 
R
P
 
R
A
 
G
A
 
V
T
 
R
I
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
C
 
Y
R
 
R
P
 
Q
S
 
T
I
 
L
I
 
W
T
 
S
D
 
P
V
 
-
D
 
E
Y
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
G
Q
 
F
A
 
L
E
 
E
K
 
R
F
 
A
V
 
L
T
 
P
L
 
G
S
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
L
K
 
F
A
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
W
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
G
G
 
R
V
 
V
D
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
E
A
 
A
R
 
L
R
 
R
W
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
A
 
A
A
 
K
G
 
G
P
 
A
W
 
W
G
 
A
I
 
F
T
 
V
A
 
D
A
 
G
G
 
R
E
 
R
A
 
V
A
 
E
I
 
G
D
 
S
A
|
A
P
x
F
R
 
A
V
|
V
E
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
G
 
G
I
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
34% identity, 82% coverage: 1:257/312 of query aligns to 1:262/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
M
 
M
L
 
L
T
 
E
V
 
V
I
 
V
-
 
T
-
 
A
G
 
G
E
 
E
G
 
P
L
 
L
V
 
V
D
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
P
R
 
Q
A
 
E
S
 
P
G
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
V
H
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
x
E
L
x
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
V
P
 
K
V
 
V
Q
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
R
 
E
D
 
D
A
 
E
Y
 
L
G
 
G
D
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
E
H
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
A
S
 
E
S
 
G
V
 
V
M
 
D
L
 
L
P
 
T
-
 
H
-
 
F
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
G
-
 
L
L
 
Y
G
 
L
P
 
R
D
 
E
E
 
Y
L
 
L
P
 
P
T
 
L
S
 
G
V
 
Q
A
 
G
T
 
R
A
 
V
V
 
F
I
x
Y
D
x
Y
D
x
R
D
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
 
G
Y
 
S
T
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
A
S
 
F
D
 
D
R
 
-
L
 
-
A
 
P
F
 
D
M
 
Y
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
V
T
 
R
L
 
F
L
 
L
H
 
H
T
 
L
G
 
S
S
 
G
I
 
I
A
 
T
T
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
F
-
 
S
L
 
L
A
 
W
A
 
A
V
 
M
E
 
E
H
 
E
A
 
A
-
 
K
H
 
R
P
 
R
A
 
G
A
 
V
T
 
R
I
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
C
 
Y
R
|
R
P
 
Q
S
 
T
I
 
L
I
 
W
T
 
S
D
 
P
V
 
-
D
 
E
Y
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
G
Q
 
F
A
 
L
E
 
E
K
 
R
F
 
A
V
 
L
T
 
P
L
 
G
S
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
L
K
 
F
A
 
L
S
|
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
W
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
G
G
 
R
V
 
V
D
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
E
A
 
A
R
 
L
R
 
R
W
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
L
T
x
K
R
|
R
G
|
G
A
|
A
A
x
K
G
|
G
P
x
A
W
 
W
G
 
A
I
 
F
T
 
V
A
 
D
A
 
G
G
 
R
E
 
R
A
 
V
A
 
E
I
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
F
R
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
G
 
G
I
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
34% identity, 82% coverage: 1:257/312 of query aligns to 1:262/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
M
 
M
L
 
L
T
 
E
V
 
V
I
 
V
-
 
T
-
 
A
G
 
G
E
 
E
G
 
P
L
|
L
V
 
V
D
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
P
R
 
Q
A
 
E
S
 
P
G
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
V
H
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
E
L
 
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
V
P
 
K
V
 
V
Q
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
R
 
E
D
 
D
A
 
E
Y
 
L
G
 
G
D
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
E
H
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
A
S
 
E
S
 
G
V
 
V
M
 
D
L
 
L
P
 
T
-
 
H
-
 
F
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
G
-
 
L
L
x
Y
G
 
L
P
 
R
D
 
E
E
 
Y
L
 
L
P
 
P
T
 
L
S
 
G
V
 
Q
A
 
G
T
 
R
A
 
V
V
 
F
I
 
Y
D
 
Y
D
x
R
D
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
 
G
Y
 
S
T
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
A
S
 
F
D
 
D
R
 
-
L
 
-
A
 
P
F
 
D
M
 
Y
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
V
T
 
R
L
 
F
L
 
L
H
 
H
T
 
L
G
 
S
S
 
G
I
 
I
A
 
T
T
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
F
-
 
S
L
 
L
A
 
W
A
 
A
V
 
M
E
 
E
H
 
E
A
 
A
-
 
K
H
 
R
P
 
R
A
 
G
A
 
V
T
 
R
I
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
C
 
Y
R
|
R
P
 
Q
S
 
T
I
 
L
I
 
W
T
 
S
D
 
P
V
 
-
D
 
E
Y
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
G
Q
 
F
A
 
L
E
 
E
K
 
R
F
 
A
V
 
L
T
 
P
L
 
G
S
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
L
K
 
F
A
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
W
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
G
G
 
R
V
 
V
D
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
E
A
 
A
R
 
L
R
 
R
W
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
A
|
A
A
 
K
G
 
G
P
 
A
W
 
W
G
 
A
I
 
F
T
 
V
A
 
D
A
 
G
G
 
R
E
 
R
A
 
V
A
 
E
I
 
G
D
 
S
A
 
A
P
 
F
R
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
G
 
G
I
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
29% identity, 95% coverage: 2:298/312 of query aligns to 5:303/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
L
 
I
T
 
L
V
 
C
I
 
F
G
 
G
E
 
E
G
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
M
V
 
L
Q
 
A
R
 
Q
A
 
P
-
 
L
-
 
P
S
 
R
G
 
A
I
 
F
E
 
L
A
 
Q
H
 
C
V
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
L
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
G
P
 
A
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
M
Y
 
L
G
 
G
R
 
S
D
 
D
A
 
M
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
S
 
F
V
 
L
A
 
F
A
 
D
H
 
S
L
 
F
R
 
A
S
 
E
S
 
A
S
 
G
V
 
V
M
 
V
L
 
T
P
 
D
L
 
G
G
 
I
P
 
V
D
 
R
E
 
T
L
 
S
P
 
T
T
 
A
S
 
K
V
 
T
A
 
A
T
 
L
A
 
A
V
 
F
I
 
V
D
 
A
D
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
E
A
 
R
T
 
S
Y
 
F
T
 
S
F
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
L
W
 
F
E
 
R
L
 
V
P
 
E
G
 
H
L
 
F
S
 
Q
D
 
D
R
 
A
L
 
-
A
 
-
F
 
-
M
 
S
L
 
F
Q
 
S
G
 
D
T
 
A
T
 
L
L
 
I
L
 
F
H
 
H
T
 
A
G
 
C
S
 
S
I
 
N
A
 
S
T
 
M
M
 
T
L
 
D
A
 
A
P
 
D
G
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
V
V
 
T
L
 
F
A
 
E
A
 
G
V
 
M
E
 
R
H
 
R
A
 
A
H
 
Q
P
 
A
A
 
A
-
 
G
A
 
A
T
 
I
I
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
L
N
 
N
C
 
F
R
 
R
P
 
P
S
 
M
I
 
L
I
 
W
T
 
P
D
 
N
V
 
G
D
 
E
Y
 
N
A
 
P
R
 
A
R
 
S
Q
 
R
A
 
L
E
 
W
K
 
K
F
 
G
V
 
L
T
 
S
L
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
L
S
 
S
D
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
D
W
 
Y
L
 
L
Y
 
A
P
 
N
G
 
T
V
 
L
D
 
A
V
 
A
L
 
D
E
 
A
S
 
N
A
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
Q
R
 
Q
R
 
L
W
 
W
L
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
Q
G
 
G
P
 
R
A
 
A
L
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
L
T
 
V
R
x
T
G
x
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
W
W
 
Y
G
 
T
I
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
-
A
 
-
I
 
V
D
 
P
A
x
T
P
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
A
 
Q
D
 
D
T
 
S
V
 
N
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
M
L
 
L
S
 
Y
G
 
T
I
 
F
V
 
A
D
 
Q
R
 
Q
G
 
-
L
 
F
D
 
D
G
 
D
A
 
A
Q
 
A
N
 
A
R
 
L
K
 
I
D
 
D
L
 
F
R
 
C
E
 
H
L
 
D
P
 
P
A
 
-
E
 
E
G
 
S
L
 
I
A
 
V
E
 
S
L
 
T
L
 
L
A
 
R
H
 
F
A
 
A
A
|
A
R
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
L
T
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
P
 
Q
G
 
G
A
 
A

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
28% identity, 80% coverage: 4:253/312 of query aligns to 9:259/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
A
L
 
S
V
 
V
D
|
D
V
 
L
V
 
V
-
 
P
Q
 
E
R
 
K
A
 
Q
S
 
N
G
 
S
I
 
Y
E
 
L
A
 
K
H
 
C
V
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
L
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
G
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
G
P
 
E
V
 
C
Q
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
C
Y
 
L
G
 
G
R
 
D
D
 
D
A
 
D
Y
 
A
G
 
G
D
 
R
S
 
F
V
 
L
A
 
R
A
 
Q
H
 
V
L
 
F
R
 
Q
S
 
D
S
 
N
S
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
T
M
 
F
L
 
L
P
 
R
L
 
L
G
 
D
P
 
A
D
 
D
E
 
-
L
 
L
P
 
T
T
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
L
T
 
I
A
 
V
V
 
N
I
 
L
D
 
T
D
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
E
A
 
R
T
 
S
Y
 
F
T
 
T
F
x
Y
D
 
L
L
 
V
A
 
H
W
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
A
S
 
D
D
 
T
R
 
Y
L
 
V
A
 
S
F
 
P
M
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
P
L
 
F
Q
 
R
G
 
Q
T
 
Y
T
 
E
L
 
W
L
 
F
H
 
Y
T
 
F
G
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
G
T
 
L
M
 
T
L
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
A
A
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
V
 
A
E
 
R
H
 
R
A
 
M
H
 
R
P
 
E
A
 
A
A
 
G
-
 
G
T
 
Y
I
 
V
S
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
C
 
L
R
|
R
P
 
S
S
 
K
I
 
M
I
 
W
T
 
G
D
 
N
V
 
T
D
 
D
Y
 
E
A
 
I
R
 
P
R
 
E
Q
 
L
A
 
I
E
 
A
K
 
R
F
 
S
V
x
A
T
x
A
L
 
L
S
x
A
D
 
S
V
 
I
V
 
C
K
 
K
A
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
C
W
 
Q
L
 
L
Y
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
D
 
S
V
 
H
L
 
W
E
 
Q
S
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
Y
W
 
Y
L
 
L
S
 
R
L
 
D
G
 
L
G
|
G
S
 
C
E
 
D
G
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
T
V
 
T
V
 
I
V
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
P
 
A
W
 
L
G
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
F
A
 
H
I
 
F
D
 
P
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
28% identity, 80% coverage: 4:253/312 of query aligns to 5:248/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
x
D
G
 
A
L
x
S
V
 
V
D
|
D
V
 
L
V
 
V
-
 
P
Q
 
E
R
 
K
A
 
Q
S
 
N
G
 
S
I
 
Y
E
 
L
A
 
K
H
x
C
V
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
L
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
G
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
G
P
 
E
V
 
C
Q
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
C
Y
 
L
G
 
G
R
 
D
D
 
D
A
 
D
Y
 
A
G
 
G
D
 
R
S
 
F
V
 
L
A
 
R
A
 
Q
H
 
V
L
 
F
R
 
Q
S
 
D
S
 
N
S
 
G
V
 
V
M
 
D
L
 
V
P
 
T
L
 
F
G
 
L
P
 
R
D
 
L
E
 
D
L
 
A
P
 
D
T
 
L
S
 
T
V
 
S
A
 
A
T
 
V
A
x
L
V
 
I
I
 
V
D
 
N
D
 
S
-
x
F
-
 
T
-
x
Y
-
 
L
-
 
V
-
 
H
D
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
D
T
 
T
Y
 
Y
T
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
S
A
 
P
W
 
Q
E
 
D
L
 
L
P
 
P
G
 
P
L
 
F
S
 
R
D
 
Q
R
 
Y
L
 
E
A
 
W
F
 
F
M
 
Y
L
 
F
Q
 
S
G
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
S
I
 
I
A
 
G
T
 
L
M
 
T
L
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
A
A
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
V
 
A
E
 
R
H
 
R
A
 
M
H
 
R
P
 
E
A
 
A
A
 
G
-
 
G
T
 
Y
I
 
V
S
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
C
 
L
R
|
R
P
 
S
S
 
K
I
x
M
I
 
W
T
 
G
D
 
N
V
 
T
D
 
D
Y
 
E
A
 
I
R
 
P
R
 
E
Q
 
L
A
 
I
E
 
A
K
 
R
F
 
S
V
 
A
T
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
S
V
 
I
V
 
C
K
 
K
A
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
C
W
 
Q
L
 
L
Y
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
D
 
S
V
 
H
L
 
W
E
 
Q
S
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
Y
W
 
Y
L
 
L
S
 
R
L
 
D
G
 
L
G
 
G
S
 
C
E
 
D
G
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
T
V
 
T
V
 
I
V
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
P
 
A
W
 
L
G
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
F
A
 
H
I
 
F
D
 
P
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
28% identity, 80% coverage: 4:253/312 of query aligns to 5:248/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
x
D
G
 
A
L
 
S
V
 
V
D
|
D
V
 
L
V
 
V
-
 
P
Q
 
E
R
 
K
A
 
Q
S
 
N
G
 
S
I
 
Y
E
 
L
A
 
K
H
x
C
V
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
L
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
G
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
G
P
 
E
V
 
C
Q
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
C
Y
 
L
G
 
G
R
 
D
D
 
D
A
 
D
Y
 
A
G
 
G
D
 
R
S
 
F
V
 
L
A
 
R
A
 
Q
H
 
V
L
 
F
R
 
Q
S
 
D
S
 
N
S
 
G
V
 
V
M
 
D
L
 
V
P
 
T
L
 
F
G
 
L
P
 
R
D
 
L
E
 
D
L
 
A
P
 
D
T
 
L
S
 
T
V
 
S
A
 
A
T
 
V
A
 
L
V
 
I
I
 
V
D
 
N
D
 
S
-
x
F
-
 
T
-
x
Y
-
 
L
-
 
V
-
 
H
D
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
D
T
 
T
Y
 
Y
T
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
S
A
 
P
W
 
Q
E
 
D
L
 
L
P
 
P
G
 
P
L
 
F
S
 
R
D
 
Q
R
 
Y
L
 
E
A
 
W
F
 
F
M
 
Y
L
 
F
Q
 
S
G
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
S
I
 
I
A
 
G
T
 
L
M
 
T
L
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
A
A
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
V
 
A
E
 
R
H
 
R
A
 
M
H
 
R
P
 
E
A
 
A
A
 
G
-
 
G
T
 
Y
I
 
V
S
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
|
N
C
 
L
R
|
R
P
 
S
S
 
K
I
x
M
I
 
W
T
 
G
D
 
N
V
 
T
D
 
D
Y
 
E
A
 
I
R
 
P
R
 
E
Q
 
L
A
 
I
E
 
A
K
 
R
F
 
S
V
 
A
T
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
S
V
 
I
V
 
C
K
|
K
A
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
x
E
L
 
L
E
 
C
W
 
Q
L
 
L
Y
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
D
 
S
V
 
H
L
 
W
E
 
Q
S
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
Y
W
 
Y
L
 
L
S
 
R
L
 
D
G
 
L
G
 
G
S
 
C
E
 
D
G
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
T
V
 
T
V
 
I
V
 
I
T
x
S
R
 
L
G
|
G
A
|
A
A
 
D
G
|
G
P
 
A
W
 
L
G
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
F
A
 
H
I
 
F
D
 
P
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4xckA Vibrio cholerae o395 ribokinase complexed with adp, ribose and cesium ion. (see paper)
25% identity, 93% coverage: 24:312/312 of query aligns to 38:304/306 of 4xckA

query
sites
4xckA
G
 
G
G
|
G
S
x
K
P
 
G
L
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
Q
H
 
A
P
 
D
V
 
V
Q
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
C
Y
 
V
G
 
G
R
 
D
D
 
D
A
 
S
Y
 
F
G
 
G
D
 
I
S
 
N
V
 
I
A
 
R
A
 
E
H
 
S
L
 
F
R
 
K
S
 
L
S
 
D
S
 
G
V
 
I
M
 
N
-
 
T
-
 
A
-
 
G
L
 
V
P
 
K
L
 
L
G
 
Q
P
 
P
D
 
N
E
 
-
L
 
C
P
 
P
T
 
T
S
 
G
V
 
I
A
|
A
T
 
M
A
 
I
V
 
Q
I
 
V
D
 
S
D
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
E
A
 
N
T
 
S
Y
x
I
T
 
C
F
x
I
D
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
I
A
 
E
W
 
P
E
 
D
L
 
L
P
 
A
G
 
A
L
 
I
S
 
R
D
 
D
R
 
A
L
 
R
A
 
Y
F
 
L
M
 
L
L
 
M
Q
 
Q
G
 
L
T
x
E
T
 
T
L
 
P
L
 
L
H
 
D
T
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
Q
H
 
E
A
 
A
H
 
K
P
 
T
A
 
A
A
 
K
T
 
T
I
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
-
N
 
-
C
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
N
I
 
V
I
 
I
T
 
L
D
 
N
V
 
P
D
 
A
Y
 
P
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Q
 
L
A
 
P
E
 
D
K
 
E
F
 
L
V
 
L
T
 
K
L
 
C
S
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
I
K
 
T
A
 
P
S
 
N
D
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
A
E
 
E
W
 
V
L
 
L
Y
 
T
P
 
-
G
 
G
V
 
I
D
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
-
 
D
-
 
S
S
 
S
A
 
A
R
 
Q
R
 
Q
W
 
A
L
 
A
S
 
D
L
 
A
G
 
L
G
 
H
S
 
C
E
 
K
G
 
G
P
 
I
A
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
I
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
x
S
A
 
K
G
 
G
P
 
V
W
 
W
G
 
L
I
 
S
T
 
Q
A
 
N
A
 
G
G
 
R
E
 
G
A
 
Q
A
 
R
I
 
I
D
 
P
A
 
G
P
 
F
R
 
V
V
|
V
E
 
K
V
 
A
A
 
T
D
 
D
T
|
T
V
x
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
|
F
M
 
N
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
M
P
 
P
A
 
L
E
 
E
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
S
L
 
A
L
 
I
A
 
K
H
 
F
A
 
A
A
x
H
R
 
A
A
 
A
A
|
A
A
 
A
V
 
I
T
 
S
V
|
V
S
 
T
R
 
R
P
 
F
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
T
-
 
S
-
 
I
P
 
P
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
V
N
 
E
A
 
A
V
 
F
P
 
L
A
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3ikhA Crystal structure of ribokinase in complex with atp and glycerol in the active site from klebsiella pneumoniae
23% identity, 78% coverage: 19:261/312 of query aligns to 33:248/286 of 3ikhA

query
sites
3ikhA
I
 
V
E
 
S
A
 
Q
H
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
K
P
 
G
L
 
A
N
 
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
I
G
 
I
L
 
L
A
 
S
R
 
R
L
 
C
D
 
G
H
 
I
P
 
E
V
 
T
Q
 
R
F
 
L
V
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
T
G
 
G
R
 
N
D
 
D
A
 
S
Y
 
N
G
 
G
D
 
A
S
 
W
V
 
I
A
 
R
A
 
Q
H
 
Q
L
 
I
R
 
K
S
 
N
S
 
E
S
 
P
V
 
L
M
 
M
L
 
L
-
 
L
P
 
P
L
 
D
G
 
G
P
 
H
D
 
F
E
 
N
L
 
Q
P
 
H
T
 
S
S
 
D
V
 
T
A
 
S
T
 
I
A
 
I
V
 
L
I
 
N
D
 
S
D
 
A
D
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
A
Y
 
D
T
 
T
F
 
F
D
 
S
L
 
L
A
 
D
W
 
E
E
 
M
L
 
I
P
 
P
G
 
H
L
 
M
S
 
A
D
 
D
R
 
A
L
 
V
A
 
A
F
 
-
M
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
T
 
D
T
 
I
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
T
 
Q
G
 
G
S
 
N
I
 
F
A
 
S
T
 
L
M
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
D
A
 
K
V
 
T
L
 
R
A
 
A
A
 
L
V
 
F
E
 
Q
H
 
Y
A
 
A
H
 
R
P
 
S
-
 
R
A
 
G
A
 
M
T
 
T
I
 
T
S
 
V
F
 
F
D
 
N
P
 
P
N
 
S
C
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
F
 
-
V
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
P
S
 
V
D
 
N
E
 
P
D
 
D
L
 
F
E
 
C
W
 
H
L
 
L
Y
 
W
P
 
P
G
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
A
E
 
V
S
 
V
A
x
N
R
 
E
R
 
S
W
 
E
L
 
A
S
 
E
L
 
L
G
 
L
G
 
Q
S
 
P
E
 
Y
G
 
G
P
 
V
A
 
K
L
 
T
V
 
L
V
 
V
V
 
I
T
|
T
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
A
W
 
W
G
 
L
I
 
V
T
 
Q
A
 
E
A
 
G
G
 
Q
E
 
R
A
 
Q
A
 
F
I
 
C
D
 
P
A
 
A
P
 
V
R
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
|
F
M
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
M
L
 
L
S
 
A
G
 
S
I
 
A
V
 
L
D
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3i3yD Crystal structure of ribokinase in complex with d-ribose from klebsiella pneumoniae
23% identity, 78% coverage: 19:261/312 of query aligns to 32:247/285 of 3i3yD

query
sites
3i3yD
I
 
V
E
 
S
A
 
Q
H
 
D
V
 
I
G
|
G
G
|
G
S
x
K
P
 
G
L
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
I
G
 
I
L
 
L
A
 
S
R
 
R
L
 
C
D
 
G
H
 
I
P
 
E
V
 
T
Q
 
R
F
 
L
V
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
T
G
 
G
R
 
N
D
 
D
A
 
S
Y
 
N
G
 
G
D
 
A
S
 
W
V
 
I
A
 
R
A
 
Q
H
 
Q
L
 
I
R
 
K
S
 
N
S
 
E
S
 
P
V
 
L
M
 
M
L
 
L
-
 
L
P
 
P
L
 
D
G
 
G
P
 
H
D
 
F
E
 
N
L
 
Q
P
 
H
T
 
S
S
 
D
V
 
T
A
x
S
T
 
I
A
 
I
V
 
L
I
 
N
D
 
S
D
 
A
D
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
A
Y
 
D
T
 
T
F
 
F
D
 
S
L
 
L
A
 
D
W
 
E
E
 
M
L
 
I
P
 
P
G
 
H
L
 
M
S
 
A
D
 
D
R
 
A
L
 
V
A
 
A
F
 
-
M
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
T
 
D
T
 
I
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
T
 
Q
G
 
G
S
 
N
I
 
F
A
 
S
T
 
L
M
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
D
A
 
K
V
 
T
L
 
R
A
 
A
A
 
L
V
 
F
E
 
Q
H
 
Y
A
 
A
H
 
R
P
 
S
-
 
R
A
 
G
A
 
M
T
 
T
I
 
T
S
 
V
F
 
F
D
 
N
P
 
P
N
 
S
C
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
F
 
-
V
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
P
S
 
V
D
 
N
E
 
P
D
 
D
L
 
F
E
 
C
W
 
H
L
 
L
Y
 
W
P
 
P
G
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
A
E
 
V
S
 
V
A
 
N
R
 
E
R
 
S
W
 
E
L
 
A
S
 
E
L
 
L
G
 
L
G
 
Q
S
 
P
E
 
Y
G
 
G
P
 
V
A
 
K
L
 
T
V
 
L
V
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
A
W
 
W
G
 
L
I
 
V
T
 
Q
A
 
E
A
 
G
G
 
Q
E
 
R
A
 
Q
A
 
F
I
 
C
D
 
P
A
 
A
P
 
V
R
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
 
F
M
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
M
L
 
L
S
 
A
G
 
S
I
 
A
V
 
L
D
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V

Sites not aligning to the query:

P0A9J6 Ribokinase; RK; EC 2.7.1.15 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
26% identity, 91% coverage: 24:308/312 of query aligns to 41:303/309 of P0A9J6

query
sites
P0A9J6
G
 
G
G
|
G
S
x
K
P
x
G
L
x
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
S
D
 
G
H
 
A
P
 
N
V
 
I
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
C
Y
 
T
G
 
G
R
 
D
D
 
D
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
D
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
R
A
 
Q
H
 
Q
L
 
L
R
 
A
S
 
T
S
 
D
S
 
N
V
 
I
M
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
E
 
I
L
 
T
P
 
P
T
 
V
S
 
S
V
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
T
A
 
G
T
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
I
D
 
F
D
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
E
A
 
G
T
 
E
Y
 
N
T
 
V
F
 
I
D
 
G
L
 
I
-
 
H
A
 
A
W
 
G
E
 
A
L
 
N
P
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
P
R
 
A
L
 
L
A
 
-
F
 
V
M
 
E
L
 
A
Q
 
Q
G
 
R
T
 
E
T
 
R
L
 
I
L
 
A
H
 
N
T
 
A
G
 
S
S
 
A
I
 
L
A
 
L
T
 
M
M
 
Q
L
 
L
A
x
E
P
 
S
G
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
S
V
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
A
E
 
K
H
 
I
A
 
A
H
 
H
P
 
Q
A
 
N
A
 
K
T
 
T
I
 
I
-
 
V
S
 
A
F
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
-
C
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
A
Y
 
P
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Q
 
L
A
 
P
E
 
D
K
 
E
F
 
L
V
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
I
K
 
T
A
 
P
S
x
N
D
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
A
E
 
E
W
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
-
G
 
G
V
 
I
D
 
R
V
 
V
L
 
E
-
 
N
-
 
D
E
 
E
S
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
K
W
 
A
L
 
A
S
 
Q
L
 
V
G
 
L
G
 
H
S
 
E
E
 
K
G
 
G
P
 
I
A
 
R
L
 
T
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
|
T
R
x
L
G
|
G
A
x
S
A
x
R
G
|
G
P
 
V
W
 
W
G
 
A
I
 
S
T
 
V
A
 
N
A
 
G
G
 
E
E
 
G
A
 
Q
A
 
R
I
 
V
D
 
P
A
 
G
P
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
I
G
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
 
F
M
 
N
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
T
G
 
A
I
 
L
V
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
R
H
 
F
A
 
A
A
x
H
R
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
P
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
 
S
-
 
V
P
 
P
T
 
W
R
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
I
N
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1rk2A E. Coli ribokinase complexed with ribose and adp, solved in space group p212121 (see paper)
26% identity, 91% coverage: 24:308/312 of query aligns to 38:300/305 of 1rk2A

query
sites
1rk2A
G
|
G
G
|
G
S
x
K
P
 
G
L
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
S
D
 
G
H
 
A
P
 
N
V
 
I
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
C
Y
 
T
G
 
G
R
 
D
D
 
D
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
D
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
R
A
 
Q
H
 
Q
L
 
L
R
 
A
S
 
T
S
 
D
S
 
N
V
 
I
M
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
E
 
I
L
 
T
P
 
P
T
 
V
S
 
S
V
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
T
A
 
G
T
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
I
D
 
F
D
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
E
A
 
G
T
 
E
Y
 
N
T
 
V
F
 
I
D
 
G
L
 
I
-
 
H
A
 
A
W
 
G
E
 
A
L
 
N
P
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
P
R
 
A
L
 
L
A
 
-
F
 
V
M
 
E
L
 
A
Q
 
Q
G
 
R
T
 
E
T
 
R
L
 
I
L
 
A
H
 
N
T
 
A
G
 
S
S
 
A
I
 
L
A
 
L
T
 
M
M
 
Q
L
 
L
A
x
E
P
 
S
G
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
S
V
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
A
E
 
K
H
 
I
A
 
A
H
 
H
P
 
Q
A
 
N
A
 
K
T
 
T
I
 
I
-
 
V
S
 
A
F
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
A
C
 
P
R
 
-
P
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Q
 
L
A
 
P
E
 
D
K
 
E
F
 
L
V
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
I
K
 
T
A
 
P
S
 
N
D
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
A
E
 
E
W
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
-
G
 
G
V
 
I
D
 
R
V
 
V
L
 
E
-
 
N
-
 
D
E
 
E
S
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
K
W
 
A
L
 
A
S
 
Q
L
 
V
G
 
L
G
 
H
S
 
E
E
 
K
G
|
G
P
 
I
A
x
R
L
 
T
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
x
S
A
 
R
G
 
G
P
 
V
W
 
W
G
 
A
I
 
S
T
 
V
A
 
N
A
 
G
G
 
E
E
 
G
A
 
Q
A
 
R
I
 
V
D
 
P
A
 
G
P
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
V
D
|
D
T
 
T
V
 
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
 
F
M
 
N
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
T
G
 
A
I
 
L
V
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
R
H
 
F
A
 
A
A
x
H
R
 
A
A
 
A
A
|
A
A
 
A
V
 
I
T
x
A
V
 
V
S
 
T
R
|
R
P
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
x
S
-
 
V
P
 
P
T
 
W
R
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
I
N
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1gqtB Activation of ribokinase by monovalent cations (see paper)
26% identity, 91% coverage: 24:308/312 of query aligns to 40:302/307 of 1gqtB

query
sites
1gqtB
G
 
G
G
|
G
S
 
K
P
 
G
L
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
S
D
 
G
H
 
A
P
 
N
V
 
I
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
C
Y
 
T
G
 
G
R
 
D
D
 
D
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
D
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
R
A
 
Q
H
 
Q
L
 
L
R
 
A
S
 
T
S
 
D
S
 
N
V
 
I
M
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
E
 
I
L
 
T
P
 
P
T
 
V
S
 
S
V
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
T
A
 
G
T
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
I
D
 
F
D
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
E
A
 
G
T
 
E
Y
 
N
T
 
V
F
 
I
D
 
G
L
 
I
-
 
H
A
 
A
W
 
G
E
 
A
L
 
N
P
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
P
R
 
A
L
 
L
A
 
-
F
 
V
M
 
E
L
 
A
Q
 
Q
G
 
R
T
 
E
T
 
R
L
 
I
L
 
A
H
 
N
T
 
A
G
 
S
S
 
A
I
 
L
A
 
L
T
 
M
M
 
Q
L
 
L
A
x
E
P
 
S
G
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
S
V
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
A
E
 
K
H
 
I
A
 
A
H
 
H
P
 
Q
A
 
N
A
 
K
T
 
T
I
 
I
-
 
V
S
 
A
F
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
-
C
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
A
Y
 
P
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Q
 
L
A
 
P
E
 
D
K
 
E
F
 
L
V
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
I
K
 
T
A
 
P
S
x
N
D
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
A
E
 
E
W
 
K
L
 
L
Y
 
T
P
 
-
G
 
G
V
 
I
D
 
R
V
 
V
L
 
E
-
 
N
-
 
D
E
 
E
S
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
K
W
 
A
L
 
A
S
 
Q
L
 
V
G
 
L
G
 
H
S
 
E
E
 
K
G
 
G
P
 
I
A
 
R
L
 
T
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
x
S
A
 
R
G
 
G
P
 
V
W
 
W
G
 
A
I
 
S
T
 
V
A
 
N
A
 
G
G
 
E
E
 
G
A
 
Q
A
 
R
I
 
V
D
 
P
A
 
G
P
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
A
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
 
F
M
 
N
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
T
G
 
A
I
 
L
V
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
R
H
 
F
A
 
A
A
x
H
R
 
A
A
 
A
A
|
A
A
 
A
V
 
I
T
x
A
V
 
V
S
 
T
R
|
R
P
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
x
S
-
 
V
P
 
P
T
 
W
R
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
I
N
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
24% identity, 74% coverage: 25:254/312 of query aligns to 36:263/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
G
 
G
S
 
A
P
 
P
L
 
A
N
 
I
V
 
F
A
 
I
V
 
D
G
 
Q
L
 
V
A
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
G
H
 
V
P
 
P
V
 
C
Q
 
G
F
 
I
V
 
I
G
 
S
R
 
C
Y
 
V
G
 
G
R
 
N
D
 
D
A
 
G
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
S
 
I
V
 
N
A
 
I
A
 
H
H
 
R
L
 
L
R
 
A
S
 
A
S
 
D
S
 
G
V
 
V
M
 
D
L
 
I
P
 
R
L
 
-
G
 
G
P
 
I
D
 
S
E
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
L
S
 
E
V
 
A
A
 
T
T
 
G
A
 
S
V
 
A
I
 
F
D
 
V
D
 
T
D
 
Y
G
 
G
A
 
D
A
 
R
T
 
D
Y
 
F
T
 
I
F
 
F
D
 
N
L
 
I
A
 
K
W
 
N
E
 
A
L
 
A
P
 
C
G
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
I
L
 
L
S
 
K
D
 
D
R
 
C
L
 
T
A
 
H
F
 
F
M
 
H
L
 
I
Q
 
M
G
 
G
T
 
S
T
 
S
L
 
L
L
 
F
H
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
S
I
 
F
A
 
H
T
 
M
M
 
V
L
 
D
A
 
A
P
 
V
G
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
T
L
 
I
A
 
V
A
 
K
V
 
A
E
 
N
H
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
G
A
 
G
T
 
V
I
 
I
S
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
C
 
I
R
 
R
P
 
K
S
 
E
I
 
M
I
 
L
T
 
-
D
 
D
V
 
I
D
 
P
Y
 
E
A
 
M
R
 
R
R
 
D
Q
 
A
A
 
L
E
 
H
K
 
F
F
 
V
V
 
L
T
 
E
L
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
I
V
 
Y
K
 
M
A
 
P
S
|
S
D
 
E
E
 
G
D
 
E
L
 
V
E
 
L
W
 
L
L
 
L
Y
 
S
P
 
P
G
 
H
V
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
S
S
 
T
A
 
P
R
 
E
R
 
R
W
 
A
L
 
I
S
 
A
L
 
G
G
 
F
G
 
L
S
 
E
E
 
E
G
 
G
P
 
V
A
 
K
L
 
E
V
 
V
V
 
I
V
 
V
T
x
K
R
 
R
G
|
G
A
 
N
A
 
Q
G
 
G
P
 
A
W
 
S
G
 
Y
I
 
Y
T
 
S
A
 
A
A
 
N
G
 
E
E
 
Q
A
 
F
A
 
H
I
 
V
D
 
E
A
 
S
P
 
Y
R
 
P
V
 
V
E
 
E
V
x
E
A
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
C
F
|
F
M
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
I
S
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_058932854.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058932854.1
MLTVIGEGLVDVVQRASGIEAHVGGSPLNVAVGLARLDHPVQFVGRYGRDAYGDSVAAHL
RSSSVMLPLGPDELPTSVATAVIDDDGAATYTFDLAWELPGLSDRLAFMLQGTTLLHTGS
IATMLAPGAAAVLAAVEHAHPAATISFDPNCRPSIITDVDYARRQAEKFVTLSDVVKASD
EDLEWLYPGVDVLESARRWLSLGGSEGPALVVVTRGAAGPWGITAAGEAAIDAPRVEVAD
TVGAGDSFMAALLSGIVDRGLDGAQNRKDLRELPAEGLAELLAHAARAAAVTVSRPGANP
PTRAELNAVPAE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory