SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_061533926.1 NCBI__GCF_001584165.1:WP_061533926.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
58% identity, 98% coverage: 2:238/242 of query aligns to 1:236/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
R
I
 
I
D
 
R
N
 
N
V
 
L
K
 
H
K
 
K
S
 
W
F
|
F
G
 
G
D
 
P
N
 
L
Q
 
H
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
H
L
 
L
D
 
E
V
 
V
E
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
K
I
 
L
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
R
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
E
I
 
V
S
 
V
V
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
L
H
 
S
L
 
V
G
 
-
K
 
K
T
 
D
E
 
D
L
 
R
E
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
I
R
 
R
L
 
R
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
R
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
R
V
 
V
K
 
R
G
 
R
T
 
W
S
 
P
E
 
R
S
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
E
K
 
K
S
 
K
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
L
E
 
D
K
 
Q
F
 
A
D
 
R
A
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
Q
 
K
A
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
D
V
 
V
V
 
M
R
 
R
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
C
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
H
 
V
E
 
E
I
 
E
G
 
G
P
 
R
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
F
 
F
A
 
T
N
 
R
P
 
P
K
 
K
T
 
E
L
 
E
E
 
R
L
 
T
Q
 
R
Q
 
S
F
 
F
L
 
L

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
55% identity, 98% coverage: 3:238/242 of query aligns to 3:238/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
L
 
M
I
 
I
A
 
D
I
 
V
D
 
H
N
 
Q
V
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
D
 
S
N
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
L
 
V
D
 
H
V
 
I
E
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
N
 
E
I
 
I
S
 
I
V
 
I
A
 
D
G
 
G
S
 
I
H
 
N
L
 
L
G
 
K
K
 
A
T
 
K
E
 
D
L
 
T
E
 
N
L
 
L
R
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
R
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
K
V
 
V
K
 
R
G
 
K
T
 
W
S
 
P
E
 
R
S
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
E
K
 
A
S
 
K
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
A
D
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
Q
 
K
A
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
S
V
 
V
V
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
H
 
I
E
 
E
I
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
L
F
 
F
A
 
D
N
 
R
P
 
P
K
 
Q
T
 
H
L
 
E
E
 
R
L
 
T
Q
 
K
Q
 
A
F
 
F
L
 
L

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
55% identity, 98% coverage: 3:238/242 of query aligns to 3:238/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
L
 
M
I
 
I
A
 
D
I
 
V
D
 
H
N
 
Q
V
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
D
 
S
N
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
L
 
V
D
 
H
V
 
I
E
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
N
 
E
I
 
I
S
 
I
V
 
I
A
 
D
G
 
G
S
 
I
H
 
N
L
 
L
G
 
K
K
 
A
T
 
K
E
 
D
L
 
T
E
 
N
L
 
L
R
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
R
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
K
V
 
V
K
 
R
G
 
K
T
 
W
S
 
P
E
 
R
S
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
E
K
 
A
S
 
K
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
A
D
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
Q
 
K
A
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
|
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
S
V
 
V
V
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
H
 
I
E
 
E
I
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
L
F
 
F
A
 
D
N
 
R
P
 
P
K
 
Q
T
 
H
L
 
E
E
 
R
L
 
T
Q
 
K
Q
 
A
F
 
F
L
 
L

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
55% identity, 98% coverage: 3:238/242 of query aligns to 3:238/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
L
 
M
I
 
I
A
 
D
I
 
V
D
 
H
N
 
Q
V
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
D
 
S
N
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
L
 
V
D
 
H
V
 
I
E
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
N
 
E
I
 
I
S
 
I
V
 
I
A
 
D
G
 
G
S
 
I
H
 
N
L
 
L
G
 
K
K
 
A
T
 
K
E
 
D
L
 
T
E
 
N
L
 
L
R
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
R
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
K
V
 
V
K
 
R
G
 
K
T
 
W
S
 
P
E
 
R
S
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
E
K
 
A
S
 
K
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
A
D
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
Q
 
K
A
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
S
V
 
V
V
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
H
 
I
E
 
E
I
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
L
F
 
F
A
 
D
N
 
R
P
 
P
K
 
Q
T
 
H
L
 
E
E
 
R
L
 
T
Q
 
K
Q
 
A
F
 
F
L
 
L

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
55% identity, 98% coverage: 3:238/242 of query aligns to 3:238/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
L
 
M
I
 
I
A
 
D
I
 
V
D
 
H
N
 
Q
V
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
D
 
S
N
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
L
 
V
D
 
H
V
 
I
E
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
D
I
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
N
 
E
I
 
I
S
 
I
V
 
I
A
 
D
G
 
G
S
 
I
H
 
N
L
 
L
G
 
K
K
 
A
T
 
K
E
 
D
L
 
T
E
 
N
L
 
L
R
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
R
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
K
V
 
V
K
 
R
G
 
K
T
 
W
S
 
P
E
 
R
S
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
E
K
 
A
S
 
K
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
E
 
D
K
 
K
F
 
A
D
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
Q
 
K
A
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
S
V
 
V
V
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
H
 
I
E
 
E
I
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
L
F
 
F
A
 
D
N
 
R
P
 
P
K
 
Q
T
 
H
L
 
E
E
 
R
L
 
T
Q
 
K
Q
 
A
F
 
F
L
 
L

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
54% identity, 98% coverage: 3:238/242 of query aligns to 1:236/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
M
I
 
I
A
 
F
I
 
V
D
 
N
N
 
D
V
 
V
K
 
Y
K
 
K
S
 
N
F
|
F
G
 
G
D
 
S
N
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
K
V
 
V
E
 
N
P
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
E
I
 
P
D
 
T
E
 
K
G
 
G
N
 
E
I
 
V
S
 
F
V
 
I
A
 
D
G
 
G
S
 
V
H
 
K
L
 
I
G
 
N
K
 
N
T
 
G
E
 
K
L
 
V
E
 
N
L
 
I
R
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
Q
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
I
R
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
M
 
V
I
 
K
V
 
V
K
 
K
G
 
K
T
 
M
S
 
N
E
 
K
S
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
E
K
 
E
S
 
L
A
 
A
Q
 
V
E
 
D
N
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
D
K
 
K
F
 
K
D
 
D
A
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
I
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
M
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
E
A
 
V
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
|
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
N
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
N
V
 
V
V
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
M
H
 
D
Q
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
I
H
 
V
E
 
E
I
 
E
G
 
G
P
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
F
 
F
A
 
Y
N
 
R
P
 
A
K
 
K
T
 
N
L
 
E
E
 
R
L
 
T
Q
 
R
Q
 
E
F
 
F
L
 
L

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
52% identity, 97% coverage: 8:241/242 of query aligns to 7:252/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
N
 
D
V
 
L
K
 
H
K
 
K
S
 
R
F
x
Y
G
 
G
D
 
G
N
x
H
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
S
L
 
L
D
 
Q
V
 
A
E
 
R
P
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
S
I
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
G
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
K
I
 
P
D
 
S
E
 
E
G
 
G
N
 
A
I
 
I
S
 
I
V
 
V
A
 
N
G
 
G
S
 
Q
H
 
N
L
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
G
 
G
K
 
Q
T
 
L
E
 
K
L
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
T
K
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
R
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
M
L
 
E
S
 
A
P
 
P
M
 
I
I
 
Q
V
 
V
K
 
L
G
 
G
T
 
L
S
 
S
E
 
K
S
 
H
E
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
E
S
 
R
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
D
E
 
E
K
 
R
F
 
A
D
 
Q
A
 
G
-
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
V
Q
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
R
V
 
I
V
 
M
R
 
Q
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
H
V
 
V
C
 
S
D
 
S
R
 
H
V
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
L
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
H
 
E
E
 
E
I
 
E
G
 
G
P
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
Q
I
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
N
P
 
P
K
 
Q
T
 
S
L
 
P
E
 
R
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
G
S
 
S

P02915 Histidine/lysine/arginine/ornithine transport ATP-binding protein HisP; EC 7.4.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
52% identity, 97% coverage: 8:241/242 of query aligns to 11:256/258 of P02915

query
sites
P02915
N
 
D
V
 
L
K
 
H
K
 
K
S
 
R
F
 
Y
G
 
G
D
 
G
N
 
H
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
S
L
 
L
D
 
Q
V
 
A
E
 
R
P
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
S
I
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
G
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
K
I
 
P
D
 
S
E
 
E
G
 
G
N
 
A
I
 
I
S
 
I
V
 
V
A
 
N
G
 
G
S
 
Q
H
 
N
L
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
G
 
G
K
 
Q
T
 
L
E
 
K
L
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
T
K
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
R
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
M
L
 
E
S
 
A
P
 
P
M
 
I
I
 
Q
V
 
V
K
 
L
G
 
G
T
 
L
S
 
S
E
 
K
S
 
H
E
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
E
S
 
R
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
D
E
 
E
K
 
R
F
 
A
D
 
Q
A
 
G
-
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
V
Q
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
R
V
 
I
V
 
M
R
 
Q
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
H
V
 
V
C
 
S
D
 
S
R
 
H
V
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
L
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
H
 
E
E
 
E
I
 
E
G
 
G
P
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
Q
I
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
N
P
 
P
K
 
Q
T
 
S
L
 
P
E
 
R
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
G
S
 
S

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
42% identity, 99% coverage: 3:241/242 of query aligns to 1:244/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
M
I
 
I
A
 
K
I
 
L
D
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
T
K
 
K
S
 
V
F
 
F
G
 
H
D
 
Q
N
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
R
 
S
L
 
L
D
 
H
V
 
V
E
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
R
I
 
P
D
 
T
E
 
E
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
 
L
V
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
Q
H
 
E
L
 
L
G
 
T
K
 
T
-
 
L
T
 
S
E
 
E
L
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
K
L
 
A
R
 
R
L
 
R
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
F
R
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
-
P
 
P
M
 
L
I
 
E
V
 
L
K
 
D
G
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
V
R
 
K
K
 
R
S
 
R
A
 
V
Q
 
T
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
H
D
 
D
A
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
S
Q
 
N
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
|
E
I
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
L
M
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
I
 
Q
G
 
D
P
 
T
P
 
V
E
 
S
D
 
E
I
 
V
F
 
F
A
 
S
N
 
H
P
 
P
K
 
K
T
 
T
L
 
P
E
 
L
L
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
F
 
F
L
 
I
G
 
Q
A
 
S
S
 
T

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:241/242 of query aligns to 2:245/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
M
I
 
I
A
 
K
I
 
L
D
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
G
 
H
D
x
Q
N
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
x
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
R
 
S
L
 
L
D
 
H
V
 
V
E
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
R
I
 
P
D
 
T
E
 
E
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
 
L
V
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
Q
H
 
E
L
 
L
G
 
T
K
 
T
-
 
L
T
 
S
E
 
E
L
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
K
L
 
A
R
 
R
L
 
R
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
F
R
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
-
P
 
P
M
 
L
I
 
E
V
 
L
K
 
D
G
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
V
R
 
K
K
 
R
S
 
R
A
 
V
Q
 
T
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
H
D
 
D
A
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
S
Q
 
N
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
I
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
L
M
 
L
V
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
R
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
I
 
Q
G
 
D
P
 
T
P
 
V
E
 
S
D
 
E
I
 
V
F
 
F
A
 
S
N
 
H
P
 
P
K
 
K
T
 
T
L
 
P
E
 
L
L
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
F
 
F
L
 
I
G
 
Q
A
 
S
S
 
T

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:241/242 of query aligns to 2:245/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
M
I
 
I
A
 
K
I
 
L
D
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
G
 
H
D
x
Q
N
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
R
 
S
L
 
L
D
 
H
V
 
V
E
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
R
I
 
P
D
 
T
E
 
E
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
 
L
V
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
Q
H
 
E
L
 
L
G
 
T
K
 
T
-
 
L
T
 
S
E
 
E
L
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
K
L
 
A
R
 
R
L
 
R
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
F
R
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
-
P
 
P
M
 
L
I
 
E
V
 
L
K
 
D
G
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
V
R
 
K
K
 
R
S
 
R
A
 
V
Q
 
T
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
H
D
 
D
A
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
S
Q
 
N
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
I
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
L
M
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
I
 
Q
G
 
D
P
 
T
P
 
V
E
 
S
D
 
E
I
 
V
F
 
F
A
 
S
N
 
H
P
 
P
K
 
K
T
 
T
L
 
P
E
 
L
L
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
F
 
F
L
 
I
G
 
Q
A
 
S
S
 
T

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:241/242 of query aligns to 2:245/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
M
I
 
I
A
 
K
I
 
L
D
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
G
 
H
D
 
Q
N
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
R
 
S
L
 
L
D
 
H
V
 
V
E
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
A
S
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
R
I
 
P
D
 
T
E
 
E
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
 
L
V
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
Q
H
 
E
L
 
L
G
 
T
K
 
T
-
 
L
T
 
S
E
 
E
L
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
K
L
 
A
R
 
R
L
 
R
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
F
R
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
-
P
 
P
M
 
L
I
 
E
V
 
L
K
 
D
G
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
V
R
 
K
K
 
R
S
 
R
A
 
V
Q
 
T
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
H
D
 
D
A
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
A
M
 
S
Q
 
N
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
I
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
T
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
L
M
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
R
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
H
 
I
E
 
E
I
 
Q
G
 
D
P
 
T
P
 
V
E
 
S
D
 
E
I
 
V
F
 
F
A
 
S
N
 
H
P
 
P
K
 
K
T
 
T
L
 
P
E
 
L
L
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
F
 
F
L
 
I
G
 
Q
A
 
S
S
 
T

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 98% coverage: 2:239/242 of query aligns to 16:249/378 of P69874

query
sites
P69874
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
L
D
 
A
N
 
G
V
 
I
K
 
R
K
 
K
S
x
C
F
|
F
G
 
D
D
 
G
N
 
K
Q
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
P
G
 
Q
I
 
L
R
 
D
L
 
L
D
 
T
V
 
I
E
 
N
P
 
N
G
 
G
E
 
E
V
x
F
I
 
L
A
 
T
I
 
L
I
 
L
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
L
|
L
R
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
S
G
 
G
N
 
R
I
 
I
S
 
M
V
x
L
A
 
D
G
 
N
S
 
E
H
 
D
L
 
I
G
 
T
K
 
H
T
 
V
E
 
P
L
 
A
E
 
E
L
 
N
R
 
R
A
 
Y
L
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
V
G
 
N
M
 
T
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
F
R
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
F
S
 
G
P
 
-
M
 
L
I
 
R
V
 
M
K
 
Q
G
 
K
T
 
T
S
 
P
E
 
A
S
 
A
E
 
E
A
 
I
R
 
T
K
 
P
S
 
R
A
 
V
Q
 
M
E
 
E
N
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
A
 
E
E
 
T
K
 
F
F
 
A
D
 
Q
A
 
R
Y
 
K
P
 
P
D
 
H
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
V
M
 
N
Q
 
K
P
 
P
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
L
 
L
C
 
L
D
|
D
E
 
E
I
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
K
L
 
L
V
 
R
N
 
K
E
 
Q
V
 
M
L
 
Q
T
 
N
V
 
E
V
 
L
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
E
 
K
-
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
V
M
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
R
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
T
V
 
M
C
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
V
F
 
V
M
 
M
H
 
R
Q
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
I
H
 
E
E
 
Q
I
 
D
G
 
G
P
 
T
P
 
P
E
 
R
D
 
E
I
 
I
F
 
Y
A
 
E
N
 
E
P
 
P
K
 
K
T
 
N
L
 
L
E
 
F
L
 
V
Q
 
A
Q
 
G
F
 
F
L
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P75831 Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
40% identity, 91% coverage: 2:222/242 of query aligns to 3:226/648 of P75831

query
sites
P75831
P
 
P
L
 
L
I
 
L
A
 
E
I
 
L
D
 
K
N
 
D
V
 
I
K
 
R
K
 
R
S
 
S
F
 
Y
-
 
P
-
 
A
G
 
G
D
 
D
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
-
 
E
-
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
I
E
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
M
I
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
C
 
I
I
 
L
N
 
G
G
 
C
L
 
L
E
 
D
S
 
K
I
 
A
D
 
T
E
 
S
G
 
G
N
 
T
I
 
Y
S
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
Q
H
 
D
L
 
V
G
 
A
K
 
T
T
 
L
E
 
D
L
 
A
E
 
D
L
 
A
R
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
L
L
 
R
R
 
R
L
 
E
K
 
H
V
 
F
G
 
G
M
 
F
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
Y
N
 
H
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
E
R
 
Q
N
 
N
V
 
V
M
 
E
L
 
V
S
 
-
P
 
P
M
 
A
I
 
V
V
 
Y
K
 
A
G
 
G
T
 
L
S
 
E
E
 
R
S
 
K
E
 
Q
A
 
R
R
 
L
K
 
L
S
 
R
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
N
 
L
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
E
E
 
D
K
 
R
F
 
T
D
 
E
A
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
M
M
 
N
Q
 
G
P
 
G
Q
 
Q
A
 
V
L
 
I
L
 
L
C
 
A
D
|
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
L
 
S
V
 
G
N
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
M
T
 
A
V
 
I
V
 
L
R
 
H
G
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
D
E
 
R
G
 
G
M
 
H
T
 
T
L
 
V
L
 
I
M
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
P
R
 
Q
F
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
Q
V
 
-
C
 
A
D
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
E
M
 
I
H
 
R
Q
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
I
H
 
V
E
 
R
I
 
-
G
 
N
P
 
P
P
 
P

8y5iA Cryo-em structure of e.Coli spermidine transporter potd-potabc in translocation intermidiate state (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:239/242 of query aligns to 1:234/358 of 8y5iA

query
sites
8y5iA
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
L
D
 
A
N
 
G
V
 
I
K
 
R
K
 
K
S
 
C
F
|
F
G
 
D
D
 
G
N
x
K
Q
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
P
G
 
Q
I
 
L
R
 
D
L
 
L
D
 
T
V
 
I
E
 
N
P
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
L
A
 
T
I
 
L
I
 
L
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
C
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
V
L
 
L
R
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
S
G
 
G
N
 
R
I
 
I
S
 
M
V
 
L
A
 
D
G
 
N
S
 
E
H
 
D
L
 
I
G
 
T
K
 
H
T
 
V
E
 
P
L
 
A
E
 
E
L
 
N
R
 
R
A
 
Y
L
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
V
G
 
N
M
 
T
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
F
R
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
F
S
 
G
P
 
-
M
 
L
I
 
R
V
 
M
K
 
Q
G
 
K
T
 
T
S
 
P
E
 
A
S
 
A
E
 
E
A
 
I
R
 
T
K
 
P
S
 
R
A
 
V
Q
 
M
E
 
E
N
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
M
V
 
V
G
 
Q
L
 
L
A
 
E
E
 
T
K
 
F
F
 
A
D
 
Q
A
x
R
Y
 
K
P
 
P
D
 
H
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
V
M
 
N
Q
 
K
P
 
P
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
L
 
L
C
 
L
D
 
D
E
 
Q
I
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
K
L
 
L
V
 
R
N
 
K
E
 
Q
V
 
M
L
 
Q
T
 
N
V
 
E
V
 
L
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
E
 
K
-
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
V
M
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
R
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
T
V
 
M
C
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
V
F
 
V
M
 
M
H
 
R
Q
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
I
H
 
E
E
 
Q
I
 
D
G
 
G
P
 
T
P
 
P
E
 
R
D
 
E
I
 
I
F
 
Y
A
 
E
N
 
E
P
 
P
K
 
K
T
 
N
L
 
L
E
 
F
L
 
V
Q
 
A
Q
 
G
F
 
F
L
 
I
G
 
G

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
43% identity, 86% coverage: 3:210/242 of query aligns to 3:215/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
L
 
L
I
 
I
A
 
S
I
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
I
K
 
F
K
 
R
S
 
S
F
 
Y
-
 
R
-
 
N
G
 
G
D
 
D
N
 
Q
-
 
E
-
 
L
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
N
L
 
L
D
 
E
V
 
V
E
 
N
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
C
 
T
I
 
I
N
 
G
G
 
M
L
 
L
E
 
D
S
 
T
I
 
P
D
 
T
E
 
S
G
 
G
N
 
E
I
 
Y
S
 
Y
V
 
L
A
 
E
G
 
G
S
 
Q
H
 
E
L
 
V
-
 
A
G
 
G
K
 
L
T
 
G
E
 
E
L
 
K
E
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
K
L
 
V
R
 
R
-
 
N
L
 
Q
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
F
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
F
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
K
L
 
L
T
 
N
V
 
A
G
 
L
R
 
Q
N
 
N
V
 
V
M
 
E
L
 
L
S
 
-
P
 
P
M
 
L
I
 
I
V
 
Y
K
 
A
G
 
G
T
 
V
S
 
S
E
 
S
S
 
S
E
 
K
A
 
R
R
 
R
K
 
K
S
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
N
 
Y
L
 
L
A
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
E
L
 
L
A
 
T
E
 
E
K
 
R
F
 
S
D
 
H
A
 
H
Y
 
L
P
 
P
D
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
V
M
 
N
Q
 
N
P
 
P
Q
 
S
A
 
I
L
 
I
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
E
 
K
L
 
T
V
 
G
N
 
N
E
 
Q
V
 
I
L
 
M
T
 
Q
V
 
L
V
 
L
R
 
V
G
 
D
L
 
L
A
 
N
E
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
L
 
I
L
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
P
R
 
E
F
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
Y
V
 
A
C
 
K
D
 
R
R
 
Q
V
 
I
V
 
V
F
 
I

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
38% identity, 87% coverage: 7:216/242 of query aligns to 8:217/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
D
 
D
N
 
V
V
 
V
K
 
K
K
 
K
S
x
Y
F
 
D
G
 
N
D
 
G
N
x
T
Q
 
T
V
x
A
L
 
L
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
S
L
 
V
D
 
S
V
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
A
A
 
Y
I
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
C
 
S
I
 
L
N
 
Y
G
 
R
L
 
E
E
 
V
S
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
K
G
 
G
N
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
F
H
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
-
 
I
T
 
K
E
 
K
L
 
K
E
 
D
L
 
V
R
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
R
K
 
S
V
 
V
G
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
F
 
L
P
 
P
H
 
K
L
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
Y
R
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
Y
S
 
A
P
 
-
M
 
M
I
 
E
V
 
V
K
 
I
G
 
G
T
 
E
S
 
N
E
 
R
S
 
R
E
 
N
A
 
I
R
 
K
K
 
R
S
 
R
A
 
V
Q
 
M
E
 
E
N
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
E
 
H
K
 
K
F
 
V
D
 
R
A
 
S
Y
 
F
P
 
P
D
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
T
 
V
M
 
N
Q
 
N
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
I
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
N
V
 
S
N
 
W
E
 
E
V
 
I
L
 
M
T
 
N
V
 
L
V
 
L
R
 
E
G
 
R
L
 
I
A
 
N
E
 
L
E
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
L
M
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
R
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
E
 
T
V
 
L
C
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
A
M
 
I
H
 
E
Q
 
N
G
 
G
K
 
R
V
 
V

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
38% identity, 87% coverage: 7:216/242 of query aligns to 8:217/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
D
 
D
N
 
V
V
 
V
K
 
K
K
 
K
S
 
Y
F
 
D
G
 
N
D
 
G
N
 
T
Q
 
T
V
 
A
L
 
L
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
S
L
 
V
D
 
S
V
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
A
A
 
Y
I
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
C
 
S
I
 
L
N
 
Y
G
 
R
L
 
E
E
 
V
S
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
K
G
 
G
N
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
F
H
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
-
 
I
T
 
K
E
 
K
L
 
K
E
 
D
L
 
V
R
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
R
K
 
S
V
 
V
G
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
F
 
L
P
 
P
H
 
K
L
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
Y
R
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
Y
S
 
A
P
 
-
M
 
M
I
 
E
V
 
V
K
 
I
G
 
G
T
 
E
S
 
N
E
 
R
S
 
R
E
 
N
A
 
I
R
 
K
K
 
R
S
 
R
A
 
V
Q
 
M
E
 
E
N
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
E
 
H
K
 
K
F
 
V
D
 
R
A
 
S
Y
 
F
P
 
P
D
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
T
 
V
M
 
N
Q
 
N
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
I
C
 
A
D
|
D
E
|
E
I
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
N
V
 
S
N
 
W
E
 
E
V
 
I
L
 
M
T
 
N
V
 
L
V
 
L
R
 
E
G
 
R
L
 
I
A
 
N
E
 
L
E
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
L
M
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
R
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
E
 
T
V
 
L
C
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
A
M
 
I
H
 
E
Q
 
N
G
 
G
K
 
R
V
 
V

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
38% identity, 87% coverage: 7:216/242 of query aligns to 8:217/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
D
 
D
N
 
V
V
 
V
K
 
K
K
 
K
S
x
Y
F
 
D
G
 
N
D
x
G
N
 
T
Q
 
T
V
x
A
L
 
L
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
S
L
 
V
D
 
S
V
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
A
A
 
Y
I
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
C
 
S
I
 
L
N
 
Y
G
 
R
L
 
E
E
 
V
S
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
K
G
 
G
N
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
F
H
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
-
 
I
T
 
K
E
 
K
L
 
K
E
 
D
L
 
V
R
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
R
K
 
S
V
 
V
G
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
F
 
L
P
 
P
H
 
K
L
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
Y
R
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
Y
S
 
A
P
 
-
M
 
M
I
 
E
V
 
V
K
 
I
G
 
G
T
 
E
S
 
N
E
 
R
S
 
R
E
 
N
A
 
I
R
 
K
K
 
R
S
 
R
A
 
V
Q
 
M
E
 
E
N
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
E
 
H
K
 
K
F
 
V
D
 
R
A
 
S
Y
 
F
P
 
P
D
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
T
 
V
M
 
N
Q
 
N
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
I
C
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
N
V
 
S
N
 
W
E
 
E
V
 
I
L
 
M
T
 
N
V
 
L
V
 
L
R
 
E
G
 
R
L
 
I
A
 
N
E
 
L
E
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
L
M
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
R
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
E
 
T
V
 
L
C
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
A
M
 
I
H
 
E
Q
 
N
G
 
G
K
 
R
V
 
V

8hprC Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:240/242 of query aligns to 3:236/363 of 8hprC

query
sites
8hprC
I
 
I
A
 
V
I
 
L
D
 
D
N
 
R
V
 
V
K
 
T
K
 
K
S
 
S
F
x
Y
G
 
P
D
 
D
-
 
V
N
 
R
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
E
I
 
F
R
 
S
L
 
M
D
 
T