SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_061534005.1 NCBI__GCF_001584165.1:WP_061534005.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7wwxA Crystal structure of herbaspirillum huttiense l-arabinose 1- dehydrogenase (NAD bound form) (see paper)
75% identity, 96% coverage: 11:262/263 of query aligns to 2:253/254 of 7wwxA

query
sites
7wwxA
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
H
 
N
F
 
F
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
V
D
|
D
I
|
I
A
 
A
V
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
S
V
 
E
A
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
N
R
 
D
L
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
H
V
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
F
R
 
R
H
 
H
C
|
C
D
|
D
I
x
L
R
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
F
Q
 
Q
S
 
A
T
 
T
I
 
I
R
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
H
 
H
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
L
E
 
E
F
 
Y
Y
 
W
D
 
N
N
 
D
G
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
S
F
 
F
F
 
F
T
 
A
C
 
V
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
A
 
V
P
 
E
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
K
 
R
K
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
x
F
S
|
S
S
|
S
I
 
I
S
 
S
W
 
W
H
 
H
L
 
Q
S
 
S
N
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
T
 
T
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
S
V
 
T
I
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
H
N
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
T
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
M
 
M
T
 
T
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
I
 
I
A
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
E
G
 
G
E
 
K
E
 
K
D
 
A
I
 
I
K
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
Q
C
 
C
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
K
 
D
L
 
L
Q
 
L
P
 
P
W
 
W
H
 
H
L
 
L
A
 
A
R
 
R
M
 
M
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
S
 
S
V
 
A
M
 
M
C
 
C
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
I
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W

5wjsA Crystal structure of oxidoreductase (short chain dehydrogenase/reductase family) from burkholderia thailandensis complexed with nadh
55% identity, 96% coverage: 11:263/263 of query aligns to 7:258/258 of 5wjsA

query
sites
5wjsA
Q
 
R
L
 
Y
A
 
A
H
 
R
F
 
Y
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
R
S
 
A
V
 
V
F
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
T
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
S
I
 
F
V
 
V
S
 
E
A
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
V
D
|
D
I
x
L
A
 
D
V
 
-
E
 
E
A
 
Q
S
 
A
V
 
A
A
 
R
L
 
A
C
 
L
D
 
A
R
 
A
L
 
R
Q
 
L
A
 
A
A
 
D
G
 
A
F
 
A
V
 
H
K
 
E
P
 
P
L
 
V
F
 
F
R
 
V
H
 
A
C
 
C
D
|
D
I
x
L
R
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
T
 
A
I
 
I
R
 
E
D
 
A
L
 
I
A
 
R
Q
 
A
E
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
P
F
 
I
D
 
A
V
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
N
 
N
D
 
D
Q
 
V
R
 
R
H
 
H
Q
 
A
L
 
I
E
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
P
E
 
D
F
 
S
Y
 
F
D
 
D
N
 
A
G
 
C
I
 
I
A
 
A
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
R
 
R
P
 
H
L
 
Q
F
 
F
F
 
F
T
 
A
C
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
D
G
 
D
M
 
M
Q
 
K
K
 
R
K
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
|
L
S
x
G
S
|
S
I
 
I
S
 
S
W
 
W
H
 
M
L
 
L
S
 
K
N
 
N
G
 
A
G
 
G
Y
|
Y
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
T
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
F
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
L
S
 
V
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
M
 
M
T
 
T
E
 
D
R
x
K
Q
 
Q
I
 
R
A
 
R
L
 
L
W
 
W
L
 
L
D
 
D
A
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
R
E
 
A
D
 
A
I
 
I
K
 
K
R
 
A
N
 
G
Q
 
Q
C
 
C
L
 
I
P
 
D
G
 
A
K
 
E
L
 
L
Q
 
L
P
 
P
W
 
G
H
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
M
 
M
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
S
 
S
V
 
R
M
 
M
C
 
I
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
F
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
A

F1SWA0 Zerumbone synthase; EC 1.1.1.326 from Zingiber zerumbet (Shampoo ginger) (Amomum zerumbet) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 18:263/263 of query aligns to 3:257/267 of F1SWA0

query
sites
F1SWA0
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
S
I
 
I
V
 
A
S
 
R
A
 
L
F
 
F
A
 
I
E
 
E
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
A
 
C
F
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
Q
V
 
D
E
 
E
A
 
L
S
 
G
V
 
Q
A
 
Q
L
 
V
C
 
S
D
 
Q
R
 
R
L
 
L
Q
 
-
A
 
-
A
 
G
G
 
G
F
 
D
V
 
P
K
 
H
P
 
A
L
 
C
F
 
Y
R
 
F
H
 
H
C
 
C
D
 
D
I
 
V
R
 
T
D
 
V
I
 
E
A
 
D
A
 
D
L
 
V
Q
 
R
S
 
R
T
 
A
I
 
V
R
 
D
D
 
F
L
 
T
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
Y
G
 
G
D
 
T
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
M
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
-
 
I
-
 
T
N
 
G
D
 
D
Q
 
K
R
 
V
H
 
I
Q
 
D
L
 
I
E
 
R
D
 
D
V
 
A
T
 
D
V
 
F
E
 
N
F
 
E
Y
 
F
D
 
K
N
 
K
G
 
V
I
 
F
A
 
D
I
 
I
N
 
N
Q
 
V
R
 
N
P
 
G
L
 
V
F
 
F
F
 
L
T
 
G
C
 
M
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
A
 
A
P
 
R
G
 
I
M
 
M
Q
 
I
K
 
P
K
 
K
G
 
M
G
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
A
S
|
S
I
 
V
S
|
S
W
 
S
H
 
V
L
 
I
S
 
A
N
 
G
G
 
A
G
 
G
Y
 
P
P
 
H
V
 
G
Y
|
Y
T
 
T
T
 
G
A
 
A
K
|
K
S
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
 
S
L
 
V
A
 
A
R
 
A
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
H
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
C
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
Y
W
 
A
V
 
V
M
 
P
T
 
T
E
 
R
R
 
L
Q
 
S
I
 
M
A
 
P
L
 
Y
W
 
L
L
 
P
D
 
E
A
 
S
A
 
E
G
 
M
E
 
Q
E
 
E
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
F
-
 
L
-
 
T
-
 
F
I
 
V
K
 
R
R
 
S
N
 
N
Q
 
A
C
 
N
L
 
L
P
 
K
G
 
G
-
 
V
K
 
D
L
 
L
Q
 
M
P
 
P
W
 
N
H
 
D
L
 
V
A
 
A
R
 
E
M
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
T
D
 
E
D
 
E
S
 
S
V
 
K
M
 
Y
C
 
V
T
 
S
A
 
G
Q
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
F
A
 
S

5ha5D Crystal structure of an NAD-bound oxidoreductase from brucella ovis
36% identity, 93% coverage: 18:262/263 of query aligns to 4:241/244 of 5ha5D

query
sites
5ha5D
L
 
L
K
 
K
G
 
E
K
 
K
S
 
L
V
 
V
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
S
S
 
S
A
 
G
F
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
I
F
 
L
V
 
V
D
|
D
I
|
I
A
 
D
V
 
G
E
 
T
A
 
A
S
 
A
V
 
K
A
 
A
L
 
Q
C
 
A
D
 
D
R
 
A
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
A
P
 
E
L
 
-
F
 
G
R
 
H
H
 
A
C
x
L
D
|
D
I
x
V
R
 
T
D
 
D
I
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
S
 
A
T
 
L
I
 
A
R
 
D
D
 
D
L
 
I
A
 
L
Q
 
S
E
 
R
L
 
F
G
 
G
D
 
G
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
N
 
V
D
 
A
Q
 
G
R
 
R
H
 
A
Q
 
A
L
 
F
E
 
D
D
 
Q
V
 
P
-
 
E
T
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
V
Y
 
W
D
 
D
N
 
R
G
 
V
I
 
I
A
 
G
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
R
 
E
P
 
G
L
 
A
F
 
F
F
 
N
T
 
V
C
 
S
Q
 
H
A
 
A
V
 
L
A
 
V
P
 
P
G
 
A
M
 
L
Q
 
-
K
 
K
K
 
A
G
 
A
G
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
I
 
V
N
 
H
L
 
L
S
 
C
S
|
S
I
 
V
S
 
A
W
 
G
H
 
F
L
 
V
S
 
S
N
 
G
G
 
G
G
 
S
Y
 
T
P
 
A
V
 
G
Y
|
Y
T
 
V
T
 
V
A
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
R
G
 
S
L
 
L
T
 
T
R
 
Q
G
 
V
L
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
A
P
 
P
H
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
|
G
W
 
I
V
x
M
M
 
M
T
x
S
E
 
E
R
 
M
Q
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
W
K
 
F
R
 
M
N
 
N
Q
 
R
C
 
V
L
 
M
P
 
M
G
 
K
K
 
R
L
 
I
-
 
G
Q
 
E
P
 
T
W
 
S
H
 
E
L
 
V
A
 
V
R
 
D
M
 
P
V
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
P
D
 
M
S
 
A
V
 
S
M
 
Y
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
T
E
 
I
F
 
L
I
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
F

5wuwA Serratia marcescens short-chain dehydrogenase/reductase f98l/f202l mutant (see paper)
36% identity, 94% coverage: 18:263/263 of query aligns to 3:244/245 of 5wuwA

query
sites
5wuwA
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
Q
G
|
G
G
 
G
G
 
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
K
A
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
S
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
T
D
x
Y
I
x
A
A
|
A
-
 
S
V
 
A
E
 
D
A
 
R
S
 
A
V
 
E
A
 
A
L
 
V
C
 
A
D
 
S
R
 
A
L
 
V
Q
 
T
A
 
T
A
 
A
G
 
G
F
 
G
V
 
-
K
 
K
P
 
V
L
 
L
F
 
A
R
 
I
H
 
K
C
 
A
D
|
D
I
x
S
R
 
A
D
 
D
I
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
T
 
A
I
 
V
R
 
R
D
 
Q
L
 
A
A
 
V
Q
 
S
E
 
H
L
 
F
G
 
G
D
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
V
D
 
L
Q
 
T
R
 
L
H
 
G
Q
 
G
L
 
T
E
 
E
D
 
E
V
 
L
T
 
A
V
 
L
E
 
D
F
 
D
Y
 
L
D
 
D
N
 
R
G
 
M
I
 
L
A
 
A
I
 
V
N
 
N
Q
 
V
R
 
R
P
 
S
L
 
V
F
 
F
F
 
V
T
 
A
C
 
S
Q
 
Q
A
 
E
V
 
A
A
 
A
P
 
R
G
 
H
M
 
M
Q
 
N
K
 
D
K
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
H
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
T
-
 
N
S
 
A
W
 
E
H
 
R
L
 
V
S
 
P
N
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
P
 
A
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
T
 
M
A
 
S
K
|
K
S
 
S
A
 
A
V
x
L
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
R
N
 
S
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
N
V
 
V
S
 
Q
P
 
P
G
|
G
W
x
P
V
|
V
M
 
D
T
 
T
E
 
E
R
 
M
Q
 
N
I
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
P
A
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
-
 
L
-
 
A
E
 
D
D
 
Q
I
 
L
K
 
K
R
 
Q
N
 
L
Q
 
M
C
 
A
L
 
I
P
 
G
G
 
R
K
 
Y
L
 
G
Q
 
K
P
 
D
W
 
E
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
G
M
 
F
V
 
V
L
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
P
D
 
Q
S
 
A
V
 
G
M
 
Y
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
E
 
S
F
 
L
I
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
F
A
 
S

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
35% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 3:243/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
K
S
 
L
V
 
A
F
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
S
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
I
V
 
A
D
|
D
I
x
L
-
 
V
-
 
P
A
 
A
V
 
P
E
 
E
A
 
A
S
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
I
C
 
R
D
 
N
R
 
L
L
 
G
Q
 
R
A
 
R
A
 
V
G
 
L
F
 
T
V
 
V
K
 
K
P
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
H
 
-
C
|
C
D
|
D
I
x
V
R
 
S
D
 
Q
I
 
P
A
 
G
A
 
D
L
 
V
Q
 
E
S
 
A
T
 
F
I
 
G
R
 
K
D
 
Q
L
 
V
A
 
I
Q
 
S
E
 
T
L
 
F
G
 
G
D
 
R
F
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
N
 
I
D
 
Y
Q
 
P
R
 
L
H
 
I
Q
 
P
L
 
F
E
 
D
D
 
E
V
 
L
T
 
T
V
 
F
E
 
E
F
 
Q
Y
 
W
D
 
K
N
 
K
G
 
T
I
 
F
A
 
E
I
 
I
N
 
N
Q
 
V
R
 
D
P
 
S
L
 
G
F
 
F
F
 
L
T
 
M
C
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
K
 
R
K
 
N
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
|
S
I
 
T
S
 
T
W
 
Y
H
 
W
L
 
L
S
 
K
N
 
I
G
 
E
G
 
A
Y
|
Y
P
 
T
V
 
H
Y
|
Y
T
 
I
T
 
S
A
 
T
K
|
K
S
 
A
A
 
A
V
 
N
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
K
H
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
I
S
 
A
P
|
P
G
x
S
W
x
L
V
|
V
M
 
R
T
 
T
E
 
A
R
x
T
Q
 
T
I
 
E
A
 
A
L
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
A
A
 
M
G
 
F
E
 
D
E
 
V
D
 
L
I
 
P
K
 
N
R
 
M
N
 
L
Q
 
Q
C
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
R
K
 
L
L
 
Q
Q
 
V
P
 
P
W
 
L
H
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
G
M
 
A
V
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
A
V
 
S
M
 
F
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
E
 
T
F
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain DSM 19018 / LMG 30748 / EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
35% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 5:245/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
K
S
 
L
V
 
A
F
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
S
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
I
V
 
A
D
|
D
I
 
L
-
 
V
-
 
P
A
 
A
V
 
P
E
 
E
A
 
A
S
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
I
C
 
R
D
 
N
R
 
L
L
 
G
Q
 
R
A
 
R
A
 
V
G
 
L
F
 
T
V
 
V
K
 
K
P
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
H
 
-
C
|
C
D
|
D
I
x
V
R
 
S
D
 
Q
I
 
P
A
 
G
A
 
D
L
 
V
Q
 
E
S
 
A
T
 
F
I
 
G
R
 
K
D
 
Q
L
 
V
A
 
I
Q
 
S
E
 
T
L
 
F
G
 
G
D
 
R
F
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
N
 
I
D
x
Y
Q
 
P
R
 
L
H
 
I
Q
 
P
L
 
F
E
 
D
D
 
E
V
 
L
T
 
T
V
 
F
E
 
E
F
 
Q
Y
 
W
D
 
K
N
 
K
G
 
T
I
 
F
A
 
E
I
 
I
N
 
N
Q
 
V
R
 
D
P
 
S
L
 
G
F
 
F
F
 
L
T
 
M
C
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
K
 
R
K
 
N
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
S
I
 
T
S
 
T
W
 
Y
H
 
W
L
 
L
S
 
K
N
 
I
G
 
E
G
 
A
Y
 
Y
P
 
T
V
 
H
Y
 
Y
T
 
I
T
 
S
A
 
T
K
|
K
S
 
A
A
 
A
V
 
N
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
K
H
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
I
S
 
A
P
|
P
G
x
S
W
x
L
V
|
V
M
 
R
T
 
T
E
 
A
R
x
T
Q
 
T
I
 
E
A
 
A
L
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
A
A
 
M
G
 
F
E
 
D
E
 
V
D
 
L
I
 
P
K
 
N
R
 
M
N
 
L
Q
 
Q
C
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
R
K
 
L
L
 
Q
Q
 
V
P
 
P
W
 
L
H
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
G
M
 
A
V
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
A
V
 
S
M
 
F
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
E
 
T
F
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6j7uA Crystal structure of blue fluorescent protein from metagenomic library in complex with NADPH (see paper)
36% identity, 94% coverage: 17:263/263 of query aligns to 2:246/247 of 6j7uA

query
sites
6j7uA
S
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
F
V
 
T
D
x
Y
I
x
V
A
x
S
V
 
A
E
 
S
A
x
S
-
 
K
-
 
N
-
 
V
S
 
A
V
 
T
A
 
A
L
 
L
C
 
V
D
 
Q
R
 
E
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
R
V
 
-
K
 
R
P
 
A
L
 
R
F
 
A
R
 
I
H
 
Q
C
 
A
D
|
D
I
x
S
R
 
A
D
 
D
I
 
P
A
 
A
A
 
Q
L
 
V
Q
 
R
S
 
Q
T
 
A
I
 
V
R
 
E
D
 
Q
L
 
A
A
 
I
Q
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
D
 
P
F
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
I
D
 
F
Q
 
L
R
 
A
H
 
G
Q
 
P
L
 
L
E
 
G
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
L
E
 
D
F
 
D
Y
 
Y
D
 
E
N
 
R
G
 
T
I
 
M
A
 
N
I
|
I
N
 
N
Q
 
V
R
 
R
P
 
A
L
 
P
F
 
F
F
 
V
T
 
A
C
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
Q
P
 
A
G
 
S
M
 
M
Q
 
P
K
 
D
K
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
 
I
S
x
G
S
|
S
-
 
C
I
 
L
S
 
A
W
 
E
H
 
R
L
 
A
S
 
G
N
 
R
G
 
A
G
 
G
Y
 
V
P
 
T
V
 
L
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
A
 
S
K
|
K
S
 
S
A
 
A
V
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
A
H
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
T
 
V
V
 
V
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
 
P
V
 
I
M
 
D
T
|
T
E
 
D
R
x
M
Q
x
N
I
 
P
A
 
A
L
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
G
A
 
E
G
 
R
E
 
S
E
 
G
D
 
E
I
 
L
K
 
V
R
 
A
N
 
V
Q
 
L
C
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
H
K
 
Y
L
 
G
Q
 
E
P
 
V
W
 
R
H
 
D
L
 
I
A
 
A
R
 
G
M
 
M
V
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
P
D
 
D
S
 
G
V
 
R
M
 
Y
C
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
E
 
S
F
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
F
A
 
A

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
32% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 3:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
L
 
L
K
 
A
G
 
N
K
 
R
S
 
V
V
 
A
F
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
I
I
 
Y
V
 
A
S
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
V
V
 
A
D
|
D
I
 
I
A
 
N
V
 
E
E
 
P
A
 
K
S
 
A
V
 
T
A
 
E
L
 
V
C
 
A
D
 
S
R
 
S
L
 
I
Q
 
T
A
 
S
A
 
L
G
 
G
F
 
G
V
 
-
K
 
R
P
 
A
L
 
I
F
 
A
R
 
A
H
 
A
C
 
V
D
 
D
I
x
V
R
 
S
D
 
D
I
 
V
A
 
E
A
 
S
L
 
V
Q
 
N
S
 
R
T
 
M
I
 
V
R
 
D
D
 
S
L
 
A
A
 
V
Q
 
E
E
 
A
L
 
F
G
 
G
D
 
T
F
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
-
 
I
-
 
F
-
x
S
N
 
T
D
 
L
Q
 
K
R
 
M
H
 
K
Q
 
P
L
 
F
E
 
E
D
 
E
V
 
I
T
 
S
V
 
G
E
 
D
F
 
E
Y
 
W
D
 
D
N
 
K
G
 
L
I
 
F
A
 
A
I
 
V
N
 
N
Q
 
A
R
 
K
P
 
G
L
 
T
F
 
F
F
 
L
T
 
C
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
M
Q
 
R
K
 
K
K
 
N
G
 
Q
G
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
x
I
S
|
S
S
|
S
I
 
S
S
 
V
W
 
V
H
 
V
L
 
T
S
 
G
N
 
R
G
 
P
G
 
N
Y
 
Y
P
 
A
V
 
H
Y
|
Y
T
 
I
T
 
A
A
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
G
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
D
 
E
L
 
M
G
 
G
P
 
T
H
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
x
H
W
 
G
V
x
I
M
 
I
T
 
T
E
 
E
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
L
x
I
W
 
P
L
 
R
D
 
E
A
 
T
A
 
I
G
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
G
I
 
W
K
 
R
R
 
R
N
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
C
 
A
L
 
L
P
 
K
G
 
R
K
 
K
L
 
G
Q
 
D
P
 
A
W
 
S
H
 
D
L
 
L
A
 
V
R
 
G
M
 
I
V
 
L
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
K
M
 
F
C
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
E
 
T
F
 
V
I
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
31% identity, 95% coverage: 13:262/263 of query aligns to 1:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
A
 
S
H
 
Q
F
 
F
P
 
M
S
 
N
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
A
S
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
F
 
G
V
 
T
D
 
A
I
x
T
A
 
S
V
 
E
E
 
S
A
 
G
S
 
A
V
 
Q
A
 
A
L
 
I
C
 
S
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
Q
 
G
A
 
D
A
 
N
G
 
G
F
 
K
V
 
G
K
 
M
P
 
A
L
 
L
F
 
-
R
 
-
H
 
-
C
 
-
D
x
N
I
x
V
R
 
T
D
 
N
I
 
P
A
 
E
A
 
S
L
 
I
Q
 
E
S
 
A
T
 
V
I
 
L
R
 
K
D
 
A
L
 
I
A
 
T
Q
 
D
E
 
E
L
 
F
G
 
G
D
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
N
x
I
D
 
T
Q
 
R
R
 
D
H
 
N
Q
 
L
L
 
L
E
 
M
D
 
R
V
 
M
T
 
K
V
 
E
E
 
E
F
 
E
Y
 
W
D
 
S
N
 
D
G
 
I
I
 
M
A
 
E
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
R
 
T
P
 
S
L
 
I
F
 
F
F
 
R
T
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
Q
 
M
K
 
K
K
 
K
G
 
R
G
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
S
 
V
W
 
G
H
 
T
L
 
M
S
 
G
N
 
N
G
 
A
G
 
G
Y
 
Q
P
 
A
V
 
N
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
G
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
H
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
x
I
M
 
E
T
|
T
E
 
D
R
x
M
Q
 
T
I
 
K
A
 
A
L
 
L
W
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
N
D
 
D
I
 
E
K
 
Q
R
 
R
N
 
T
Q
 
A
C
 
T
L
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
P
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
-
 
G
Q
 
D
P
 
P
W
 
R
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
S
M
 
A
V
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
P
D
 
E
S
 
A
V
 
A
M
 
Y
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
E
E
 
T
F
 
L
I
 
H
V
 
V
D
 
N
A
 
G
G
 
G
W
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
32% identity, 93% coverage: 17:261/263 of query aligns to 2:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
S
 
K
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
V
 
A
S
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
F
 
A
V
 
G
D
|
D
I
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
L
|
L
C
 
G
D
 
D
R
 
L
L
 
T
Q
 
Y
A
 
S
A
 
H
G
 
P
F
 
N
V
 
V
K
 
E
P
 
G
L
 
M
F
 
Y
R
 
-
H
 
-
C
x
L
D
x
N
I
x
V
R
 
T
D
 
D
I
 
V
A
 
T
A
 
G
L
 
V
Q
 
E
S
 
K
T
 
F
I
 
Y
R
 
Q
D
 
S
L
 
V
A
 
I
Q
 
D
E
 
K
L
 
Y
G
 
G
D
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
I
D
 
T
Q
 
K
R
 
D
H
 
A
Q
 
M
L
 
T
E
 
R
D
 
K
V
 
M
T
 
T
V
 
E
E
 
A
F
 
Q
Y
 
W
D
 
D
N
 
A
G
 
V
I
 
I
A
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
R
 
K
P
 
G
L
 
V
F
 
F
F
 
N
T
 
L
C
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
G
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
K
 
T
K
 
N
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
W
 
G
H
 
V
L
 
F
S
 
G
N
 
N
G
 
I
G
 
G
Y
 
Q
P
 
A
V
 
N
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
M
G
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
D
 
E
-
 
F
-
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
G
H
 
A
N
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
I
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
V
x
I
M
 
M
T
|
T
E
 
D
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
I
L
 
L
D
 
K
A
 
T
A
 
V
G
 
P
E
 
Q
E
 
D
D
 
L
I
 
L
K
 
D
R
 
K
N
 
F
Q
 
A
C
 
A
L
 
L
P
 
T
-
 
M
-
 
L
G
 
N
K
 
R
L
 
L
-
 
G
Q
 
Q
P
 
P
W
 
E
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
K
M
 
V
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
A
V
 
S
M
 
Y
C
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
E
 
T
F
 
I
I
 
N
V
 
V
D
 
N
A
 
G
G
 
G

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
33% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 6:249/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
L
 
L
K
 
A
G
 
N
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
G
 
S
G
x
T
S
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
I
 
I
V
 
A
S
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
A
 
V
F
 
V
-
 
S
-
x
S
-
x
R
-
x
K
-
 
Q
-
 
Q
-
x
N
V
 
V
D
 
D
I
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
-
A
 
-
S
 
A
V
 
T
A
 
L
L
 
Q
C
 
G
D
 
E
R
 
G
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
A
 
T
G
 
G
F
 
T
V
 
V
K
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
H
 
-
C
 
C
D
x
H
I
x
V
R
 
G
D
 
K
I
 
A
A
 
E
A
 
D
L
 
R
Q
 
E
S
 
R
T
 
L
I
 
V
R
 
A
D
 
T
L
 
A
A
 
V
Q
 
K
E
 
L
L
 
H
G
 
G
D
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
A
|
A
-
 
V
N
 
N
D
 
P
Q
 
F
R
 
F
H
 
G
Q
 
S
L
 
I
E
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
E
E
 
E
F
 
V
Y
 
W
D
 
D
N
 
K
G
 
T
I
 
L
A
 
D
I
 
I
N
 
N
Q
 
V
R
 
K
P
 
A
L
 
P
F
 
A
F
 
L
T
 
M
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
V
P
 
P
G
 
E
M
 
M
Q
 
E
K
 
K
K
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
L
 
V
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
A
W
 
A
H
 
F
L
 
S
S
 
P
N
 
S
G
 
P
G
 
G
Y
x
F
P
 
S
V
 
P
Y
|
Y
T
 
N
T
 
V
A
 
S
K
|
K
S
 
T
A
 
A
V
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
H
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
C
V
 
L
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
x
L
V
x
I
M
 
K
T
|
T
E
 
S
R
x
F
Q
x
S
I
 
R
A
 
M
L
 
L
W
 
W
L
 
M
D
 
D
A
x
K
A
 
E
G
 
K
E
 
E
E
 
E
D
 
S
I
 
M
K
 
K
R
 
E
N
 
T
Q
 
L
C
 
R
L
 
I
P
 
R
G
 
R
K
 
L
L
 
G
Q
 
E
P
 
P
W
 
E
H
 
D
L
 
C
A
 
A
R
 
G
M
 
I
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
A
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
A
V
 
S
M
 
Y
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
E
E
 
T
F
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
G
A
 
G
G
 
G

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
33% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 30:273/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
L
 
L
K
 
A
G
 
N
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
A
G
 
S
G
 
T
S
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
I
 
I
V
 
A
S
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
A
 
V
F
 
V
-
 
S
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
Q
-
 
Q
-
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
-
A
 
-
S
 
A
V
 
T
A
 
L
L
 
Q
C
 
G
D
 
E
R
 
G
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
A
 
T
G
 
G
F
 
T
V
 
V
K
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
H
 
-
C
 
C
D
 
H
I
 
V
R
 
G
D
 
K
I
 
A
A
 
E
A
 
D
L
 
R
Q
 
E
S
 
R
T
 
L
I
 
V
R
 
A
D
 
T
L
 
A
A
 
V
Q
 
K
E
 
L
L
 
H
G
 
G
D
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
-
 
V
N
 
N
D
 
P
Q
 
F
R
 
F
H
 
G
Q
 
S
L
 
I
E
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
E
E
 
E
F
 
V
Y
 
W
D
 
D
N
 
K
G
 
T
I
 
L
A
 
D
I
 
I
N
 
N
Q
 
V
R
 
K
P
 
A
L
 
P
F
 
A
F
 
L
T
 
M
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
V
P
 
P
G
 
E
M
 
M
Q
 
E
K
 
K
K
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
L
 
V
S
 
S
S
 
S
I
 
I
S
 
A
W
 
A
H
 
F
L
 
S
S
 
P
N
x
S
G
 
P
G
 
G
Y
x
F
P
 
S
V
 
P
Y
 
Y
T
 
N
T
 
V
A
 
S
K
 
K
S
 
T
A
 
A
V
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
x
T
L
 
L
A
 
A
R
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
H
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
C
V
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
L
V
 
I
M
 
K
T
 
T
E
 
S
R
 
F
Q
 
S
I
 
R
A
 
M
L
 
L
W
 
W
L
 
M
D
 
D
A
 
K
A
 
E
G
 
K
E
 
E
E
 
E
D
 
S
I
 
M
K
 
K
R
 
E
N
 
T
Q
 
L
C
 
R
L
 
I
P
 
R
G
 
R
K
 
L
L
 
G
Q
 
E
P
 
P
W
 
E
H
 
D
L
 
C
A
 
A
R
 
G
M
 
I
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
A
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
A
V
 
S
M
 
Y
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
E
E
 
T
F
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
G
A
 
G
G
 
G

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
31% identity, 93% coverage: 18:262/263 of query aligns to 2:257/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
G
I
 
I
V
 
A
S
 
T
A
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
V
F
 
L
V
 
N
D
 
G
I
x
F
A
 
G
V
 
D
E
 
A
A
 
A
S
 
E
V
 
I
A
 
E
L
 
K
C
 
V
D
 
R
R
 
A
-
 
G
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
H
F
 
G
V
 
V
K
 
K
P
 
V
L
 
L
F
 
Y
R
 
D
H
 
G
C
 
A
D
 
D
I
x
L
R
 
S
D
 
K
I
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
S
 
G
T
 
L
I
 
V
R
 
D
D
 
N
L
 
A
A
 
V
Q
 
R
E
 
Q
L
 
M
G
 
G
D
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
N
 
I
D
x
Q
Q
 
H
R
 
T
H
 
A
Q
 
L
L
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
F
T
 
P
V
 
T
E
 
E
F
 
K
Y
 
W
D
 
D
N
 
A
G
 
I
I
 
L
A
 
A
I
x
L
N
|
N
Q
 
L
R
 
S
P
 
A
L
 
V
F
 
F
F
 
H
T
 
G
C
 
T
Q
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
Q
 
K
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
G
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
I
 
A
S
x
H
W
 
G
H
 
L
L
 
V
S
 
A
N
 
S
G
 
A
G
 
N
Y
x
K
P
 
S
V
 
A
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
G
 
V
L
 
T
A
 
A
R
 
L
D
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
G
H
 
Q
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
T
 
A
V
 
I
S
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
V
|
V
M
 
R
T
|
T
-
 
P
-
 
L
-
x
V
E
 
E
R
 
K
Q
|
Q
I
 
I
A
 
S
L
 
A
W
x
L
L
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
N
G
 
G
-
 
V
E
 
D
E
 
Q
D
 
E
I
 
T
K
 
A
R
 
A
N
 
R
Q
 
E
C
 
L
L
 
L
P
 
S
G
 
E
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
-
 
F
L
 
V
Q
 
T
P
 
P
W
 
E
H
 
Q
L
 
L
A
 
G
R
 
G
M
 
T
V
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
A
S
 
A
V
 
A
M
 
Q
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
T
E
 
T
F
 
V
I
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
W

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
31% identity, 93% coverage: 18:262/263 of query aligns to 2:257/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
A
F
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
L
A
 
G
I
 
I
V
 
A
S
 
T
A
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
V
F
 
L
V
 
N
D
 
G
I
 
F
A
 
G
V
 
D
E
 
A
A
 
A
S
 
E
V
 
I
A
 
E
L
 
K
C
 
V
D
 
R
R
 
A
-
 
G
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
H
F
 
G
V
 
V
K
 
K
P
 
V
L
 
L
F
 
Y
R
 
D
H
 
G
C
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
S
D
 
K
I
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
S
 
G
T
 
L
I
 
V
R
 
D
D
 
N
L
 
A
A
 
V
Q
 
R
E
 
Q
L
 
M
G
 
G
D
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
N
 
I
D
 
Q
Q
 
H
R
 
T
H
 
A
Q
 
L
L
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
F
T
 
P
V
 
T
E
 
E
F
 
K
Y
 
W
D
 
D
N
 
A
G
 
I
I
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
Q
 
L
R
 
S
P
 
A
L
 
V
F
 
F
F
 
H
T
 
G
C
 
T
Q
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
Q
 
K
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
G
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
I
 
A
S
 
H
W
 
G
H
 
L
L
 
V
S
 
A
N
 
S
G
 
A
G
 
N
Y
 
K
P
 
S
V
 
A
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
G
 
V
L
 
T
A
 
A
R
 
L
D
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
G
H
 
Q
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
T
 
A
V
 
I
S
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
M
 
R
T
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
V
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
A
 
S
L
 
A
W
x
L
L
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
N
G
 
G
-
 
V
E
 
D
E
 
Q
D
 
E
I
 
T
K
 
A
R
 
A
N
 
R
Q
 
E
C
 
L
L
 
L
P
 
S
G
 
E
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
-
 
F
L
 
V
Q
 
T
P
 
P
W
 
E
H
 
Q
L
 
L
A
 
G
R
 
G
M
 
T
V
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
A
S
 
A
V
 
A
M
 
Q
C
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
T
E
 
T
F
 
V
I
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
|
W

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
34% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
S
 
V
V
 
A
F
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
I
 
T
V
 
A
S
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
I
V
 
N
D
|
D
I
|
I
A
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
S
 
V
V
 
R
A
 
A
L
 
T
C
 
V
D
 
D
R
 
E
L
 
F
Q
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
F
 
H
V
 
-
K
 
R
P
 
V
L
 
L
F
 
G
R
 
A
H
 
V
C
 
A
D
 
D
I
|
I
R
 
G
D
 
N
I
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
D
S
 
G
T
 
M
I
 
V
R
 
K
D
 
Q
L
 
T
A
 
I
Q
 
D
E
 
A
L
 
F
G
 
G
D
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
N
 
M
D
 
E
Q
 
R
R
 
A
H
 
G
Q
 
A
L
 
L
E
 
R
D
 
K
V
 
L
T
 
S
V
 
E
E
 
A
F
 
D
Y
 
W
D
 
D
N
 
V
G
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
R
 
K
P
 
G
L
 
T
F
 
F
F
 
L
T
 
C
C
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
Q
 
V
K
 
E
K
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
x
I
S
 
A
S
|
S
I
 
R
S
 
A
W
 
W
H
 
-
L
 
L
S
 
G
N
 
G
G
 
A
G
 
G
Y
 
Q
P
 
T
V
 
P
Y
|
Y
T
 
S
T
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
H
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
C
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
L
V
x
I
M
 
H
T
 
T
E
 
P
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
M
W
 
W
L
 
-
D
 
D
A
 
E
A
 
L
G
 
P
E
 
E
E
 
K
D
 
D
I
 
Q
K
 
Q
-
 
F
-
 
L
R
 
L
N
 
S
Q
 
R
C
 
Q
L
 
P
P
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
-
 
G
Q
 
E
P
 
P
W
 
D
H
 
D
L
 
I
A
 
A
R
 
N
M
 
T
V
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
D
D
 
D
D
 
D
S
 
S
V
 
G
M
 
F
C
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
E
 
V
F
 
L
I
 
Y
V
 
V
D
 
C
A
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
34% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
S
 
V
V
 
A
F
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
I
 
T
V
 
A
S
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
I
V
 
N
D
|
D
I
 
I
A
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
S
 
V
V
 
R
A
 
A
L
 
T
C
 
V
D
 
D
R
 
E
L
 
F
Q
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
F
 
H
V
 
-
K
 
R
P
 
V
L
 
L
F
 
G
R
 
A
H
 
V
C
 
A
D
|
D
I
|
I
R
 
G
D
 
N
I
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
D
S
 
G
T
 
M
I
 
V
R
 
K
D
 
Q
L
 
T
A
 
I
Q
 
D
E
 
A
L
 
F
G
 
G
D
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
N
 
M
D
 
E
Q
 
R
R
 
A
H
 
G
Q
 
A
L
 
L
E
 
R
D
 
K
V
 
L
T
 
S
V
 
E
E
 
A
F
 
D
Y
 
W
D
 
D
N
 
V
G
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
R
 
K
P
 
G
L
 
T
F
 
F
F
 
L
T
 
C
C
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
Q
 
V
K
 
E
K
 
N