SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_061534454.1 NCBI__GCF_001584165.1:WP_061534454.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

4qhqA The structure of a nutrient binding protein from burkholderia cenocepacia bound to methionine
62% identity, 88% coverage: 32:267/267 of query aligns to 2:241/241 of 4qhqA

query
sites
4qhqA
I
 
I
K
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
T
T
 
V
G
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
D
A
 
S
Q
 
E
I
 
V
L
 
W
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
Q
K
 
K
V
 
V
A
 
A
-
 
K
A
 
E
K
 
K
D
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
V
Q
 
K
I
 
V
V
 
I
E
 
E
F
 
F
S
 
N
D
 
D
Y
|
Y
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
S
G
 
G
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
A
N
 
N
S
 
S
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
Q
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
E
 
D
A
 
S
Q
 
Q
I
 
V
K
 
K
D
 
Q
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
I
V
 
V
N
 
S
V
 
A
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
I
 
Y
T
 
I
F
 
S
P
 
P
M
 
I
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
K
 
K
V
 
F
K
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
P
N
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
L
G
 
A
V
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
S
N
 
N
G
 
E
G
 
N
R
|
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
Q
G
 
G
L
 
V
L
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
N
K
 
N
A
 
A
T
 
T
P
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
T
 
A
D
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
S
E
 
E
I
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
R
 
R
S
 
V
L
 
L
D
 
S
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
T
N
|
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
N
L
 
L
D
 
Q
P
 
P
T
 
T
K
 
K
D
 
D
G
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
S
A
 
L
K
 
T
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
N
|
N
V
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
A
A
 
K
D
 
D
K
 
K
D
 
D
K
 
Q
P
 
P
W
 
W
V
 
V
A
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
H
 
Q
S
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
V
K
 
K
Q
 
E
Y
 
F
V
 
I
V
 
K
T
 
K
Q
 
Q
F
 
F
K
 
K
S
 
G
S
 
S
V
 
M
I
 
V
P
 
A
A
 
S
W
 
F

3tqwA Structure of a abc transporter, periplasmic substrate-binding protein from coxiella burnetii (see paper)
54% identity, 88% coverage: 32:266/267 of query aligns to 2:235/235 of 3tqwA

query
sites
3tqwA
I
 
V
K
 
R
I
 
V
G
 
G
A
 
T
T
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
E
A
 
T
Q
 
Q
I
 
L
L
 
M
E
 
E
V
 
V
V
 
A
K
 
K
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
L
-
 
N
K
 
R
D
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
H
I
 
V
Q
 
N
I
 
I
V
 
I
E
 
T
F
 
F
S
 
S
D
 
D
Y
|
Y
V
 
N
Q
 
T
P
 
P
N
 
N
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
G
 
G
D
 
S
L
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
N
S
 
M
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
E
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
K
 
E
D
 
M
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
I
V
 
V
N
 
S
V
 
I
G
 
G
Y
 
K
T
 
T
I
 
F
T
 
V
F
 
Y
P
 
P
M
 
M
G
 
G
V
 
L
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
T
S
 
A
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
L
 
L
K
 
K
N
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
A
V
 
V
P
 
P
N
 
S
D
 
D
P
 
P
T
 
S
N
|
N
G
 
E
G
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
K
Q
 
A
G
 
Q
L
 
L
L
 
I
K
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
T
D
 
H
A
 
-
G
 
-
L
 
I
K
 
N
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
M
D
 
D
I
 
I
T
 
A
D
 
S
N
 
N
P
 
P
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
N
|
N
G
 
T
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
I
S
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
S
P
 
P
T
 
S
K
 
R
D
 
D
G
 
A
I
 
L
A
 
L
I
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
P
K
 
N
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
N
|
N
V
 
V
I
 
V
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
E
A
 
D
D
 
D
K
 
K
D
 
N
K
 
D
P
 
P
W
 
R
V
 
L
A
 
K
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
K
 
S
A
 
A
Y
 
L
H
 
H
S
 
S
P
 
P
E
 
A
V
 
V
K
 
L
Q
 
S
Y
 
A
V
 
A
V
 
K
T
 
K
Q
 
I
F
 
F
K
 
G
S
 
D
S
 
G
V
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A

4yahX Crystal structure of the methionine binding protein, metq (see paper)
52% identity, 88% coverage: 32:267/267 of query aligns to 5:243/245 of 4yahX

query
sites
4yahX
I
 
I
K
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
V
T
 
I
G
 
V
G
 
G
P
 
A
H
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
A
K
 
Q
K
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
K
-
 
D
K
 
K
D
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
V
Q
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
T
F
 
F
S
 
N
D
 
D
Y
|
Y
V
 
V
Q
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
N
S
 
A
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
K
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
V
N
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
N
T
 
T
I
 
F
T
 
V
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
A
V
 
G
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
D
D
 
E
L
 
L
K
 
Q
N
 
D
G
 
G
A
 
S
R
 
Q
I
 
V
G
 
A
V
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
T
N
|
N
G
 
L
G
 
G
R
|
R
A
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
A
 
K
Q
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
D
D
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
P
T
 
T
P
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
T
 
V
D
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
P
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
Q
L
 
I
D
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
V
I
 
I
N
|
N
G
 
T
N
x
T
Y
 
Y
A
 
A
E
 
S
S
 
Q
A
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
T
P
 
P
T
 
A
K
 
K
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
F
I
 
V
E
 
E
G
 
D
A
 
K
K
 
E
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
A
 
V
N
|
N
V
 
L
I
 
I
A
 
V
V
 
T
R
 
R
I
 
E
A
 
D
D
 
N
K
 
K
D
 
D
K
 
A
P
 
E
W
 
N
V
 
V
A
 
K
K
 
K
L
 
F
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
H
 
Q
S
 
S
P
 
D
E
 
E
V
 
V
K
 
Y
Q
 
E
Y
 
A
V
 
A
V
 
N
T
 
K
Q
 
V
F
 
F
K
 
N
S
 
G
S
 
G
V
 
A
I
 
V
P
 
K
A
 
G
W
 
W

P04846 Lipoprotein 28 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
46% identity, 89% coverage: 30:267/267 of query aligns to 32:272/272 of P04846

query
sites
P04846
K
 
K
P
 
H
I
 
I
K
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
V
T
 
I
G
 
N
G
 
G
P
 
A
H
 
E
A
 
Q
Q
 
D
I
 
V
L
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
A
-
 
K
A
 
E
K
 
K
D
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
V
Q
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
G
Y
 
S
V
 
L
Q
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
D
A
 
A
L
 
T
A
 
N
A
 
H
G
 
G
D
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
A
N
 
N
S
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
H
L
 
R
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
Q
 
D
I
 
N
K
 
Q
D
 
A
R
 
H
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
V
N
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
N
T
 
T
I
 
F
T
 
V
F
 
F
P
 
P
M
 
M
G
 
A
V
 
G
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
K
S
 
T
L
 
V
K
 
A
D
 
Q
L
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
V
G
 
A
V
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
T
N
 
N
G
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
A
 
K
Q
 
E
G
 
K
L
 
L
L
 
I
K
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
E
D
 
G
A
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
P
T
 
T
P
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
T
 
T
D
 
D
N
 
N
P
 
P
K
 
R
K
 
H
L
 
L
K
 
Q
I
 
I
V
 
M
E
 
E
I
 
L
D
 
E
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
R
 
R
S
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
D
-
 
P
-
 
K
L
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
I
I
 
I
N
 
S
G
 
T
N
 
T
Y
 
Y
A
 
I
E
 
Q
S
 
Q
A
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
S
P
 
P
T
 
V
K
 
H
D
 
D
G
 
S
I
 
V
A
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
D
A
 
K
K
 
N
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
A
 
V
N
 
N
V
 
I
I
 
L
A
 
V
V
 
A
R
 
R
I
 
E
A
 
D
D
 
N
K
 
K
D
 
N
K
 
A
P
 
E
W
 
N
V
 
V
A
 
K
K
 
E
L
 
F
I
 
L
K
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
H
 
Q
S
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
V
K
 
A
Q
 
K
Y
 
A
V
 
A
V
 
E
T
 
T
Q
 
I
F
 
F
K
 
N
S
 
G
S
 
G
V
 
A
I
 
V
P
 
P
A
 
G
W
 
W

Sites not aligning to the query:

3k2dA Crystal structure of immunogenic lipoprotein a from vibrio vulnificus (see paper)
51% identity, 82% coverage: 32:251/267 of query aligns to 8:228/237 of 3k2dA

query
sites
3k2dA
I
 
V
K
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
V
T
 
M
G
 
A
G
 
G
P
 
A
H
 
E
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
A
K
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
-
 
K
A
 
E
K
 
K
D
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
V
Q
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
T
F
 
F
S
 
T
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
T
P
 
P
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
D
G
 
G
D
 
S
L
 
I
D
 
D
A
 
M
N
 
N
S
 
A
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
K
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
E
 
D
A
 
R
Q
 
Q
I
 
V
K
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
D
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
T
N
 
I
V
 
A
G
 
G
Y
 
N
T
 
T
I
 
F
T
 
V
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
A
V
 
G
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
K
 
Q
V
 
V
K
 
K
S
 
S
L
 
V
K
 
A
D
 
A
L
 
L
K
 
A
N
 
D
G
 
G
A
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
A
V
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
T
N
 
N
G
 
L
G
 
G
R
|
R
A
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
P
D
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
V
L
 
R
D
 
D
I
 
I
T
 
V
D
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
K
K
 
N
L
 
I
K
 
T
I
 
I
V
 
M
E
 
E
I
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
L
 
V
D
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
T
N
 
T
Y
 
Y
A
 
A
E
 
S
S
 
S
A
 
I
G
 
N
L
 
L
D
 
T
P
 
P
T
 
E
K
 
K
D
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
F
I
 
V
E
 
E
G
 
D
A
 
K
K
 
E
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
A
 
V
N
|
N
V
 
L
I
 
I
A
 
V
V
 
A
R
 
R
I
 
Q
A
 
D
D
 
N
K
 
V
D
 
Q
K
 
N
P
 
E
W
 
N
V
 
V
A
 
Q
K
 
N
L
 
F
I
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
H
 
Q
S
 
T
P
 
E
E
 
E
V
 
V

4ib2A Crystal structure of a putative lipoprotein (rumgna_00858) from ruminococcus gnavus atcc 29149 at 1.76 a resolution
42% identity, 88% coverage: 30:265/267 of query aligns to 6:245/247 of 4ib2A

query
sites
4ib2A
K
 
K
P
 
T
I
 
I
K
 
K
I
 
V
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
A
G
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
Q
V
 
A
K
 
K
K
 
S
V
 
I
A
 
L
A
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
G
L
 
Y
N
 
Q
I
 
L
Q
 
E
I
 
V
V
 
T
E
 
V
F
 
F
S
 
D
D
 
D
Y
|
Y
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
N
A
 
E
A
 
V
L
 
V
A
 
E
A
 
S
G
 
G
D
 
E
L
 
F
D
 
D
A
 
A
N
 
N
S
 
Y
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
S
Q
 
F
I
 
N
K
 
E
D
 
E
R
 
K
G
 
G
Y
 
T
K
 
H
L
 
L
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
Y
 
D
T
 
I
I
 
H
T
 
Y
F
x
E
P
 
P
M
 
F
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
S
 
P
K
 
G
K
 
T
V
 
K
K
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
D
D
 
E
L
 
I
K
 
S
N
 
E
G
 
G
A
 
D
R
 
K
I
 
I
G
 
A
V
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
T
T
 
T
N
|
N
G
 
E
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
A
 
D
Q
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
I
K
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
D
D
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
N
A
 
A
T
 
T
P
 
V
L
 
N
D
 
D
I
 
I
T
 
E
D
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
Y
K
 
N
L
 
V
K
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
P
 
A
R
 
R
S
 
V
L
 
T
D
 
G
D
 
E
L
 
T
D
 
A
A
 
Y
A
 
V
A
 
V
I
 
L
N
|
N
G
 
G
N
|
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
L
S
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
D
 
S
P
 
V
T
 
A
K
 
K
D
 
D
G
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
Y
E
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
S
G
 
E
A
 
A
K
 
A
G
 
K
P
 
T
Y
 
Y
A
 
V
N
|
N
V
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
K
I
 
E
A
 
G
D
 
N
K
 
E
D
 
K
K
 
E
P
 
E
W
 
K
V
 
I
A
 
Q
K
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
L
H
 
K
S
 
S
P
 
D
E
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
E
Y
 
Y
V
 
I
V
 
E
T
 
K
Q
 
T
F
 
Y
K
 
D
S
 
G
S
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P

1xs5A The crystal structure of lipoprotein tp32 from treponema pallidum (see paper)
36% identity, 90% coverage: 28:266/267 of query aligns to 1:240/240 of 1xs5A

query
sites
1xs5A
Q
 
K
D
 
D
K
 
E
P
 
T
I
 
V
K
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
V
T
 
L
G
 
S
G
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
A
K
 
K
K
 
E
V
 
E
A
 
V
A
 
K
K
 
K
D
 
Q
G
 
H
L
 
I
N
 
E
I
 
L
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
T
D
 
N
Y
|
Y
V
 
V
Q
 
A
P
 
L
N
 
N
A
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
M
A
 
R
G
 
G
D
 
D
L
 
I
D
 
L
A
 
M
N
 
N
S
 
F
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
V
P
 
P
Y
x
H
L
 
M
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
F
I
 
N
K
 
Q
D
 
E
R
 
H
G
 
N
Y
 
G
K
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
S
V
 
V
G
 
G
Y
 
N
T
 
V
I
 
H
T
 
V
F
x
E
P
 
P
M
 
L
G
 
A
V
 
L
Y
 
Y
S
 
S
K
 
R
K
 
T
V
 
Y
K
 
R
S
 
H
L
 
V
K
 
S
D
 
D
L
 
F
K
 
P
N
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
V
I
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
S
T
 
S
N
|
N
G
 
E
G
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
L
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
L
 
F
L
 
I
K
 
R
L
 
M
K
 
R
A
 
A
D
 
G
A
 
S
G
 
G
L
 
L
K
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
V
L
 
E
D
 
D
I
 
V
T
 
Q
D
 
Q
N
 
N
P
 
V
K
 
R
K
 
N
L
 
V
K
 
V
I
 
L
V
 
Q
E
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
S
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
S
 
V
L
 
F
D
 
D
D
 
Q
L
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
V
I
 
I
N
|
N
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
I
S
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
S
P
 
A
T
 
R
K
 
R
D
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
A
I
 
V
E
 
E
G
 
P
A
 
D
K
 
A
G
 
S
P
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
|
N
V
 
V
I
 
L
A
 
V
V
 
V
R
 
K
I
 
R
A
 
G
D
 
N
K
 
E
D
 
A
K
 
D
P
 
A
W
 
R
V
 
V
A
 
Q
K
 
A
L
 
V
I
 
L
K
 
R
A
 
A
Y
 
L
H
 
C
S
 
G
P
 
G
E
 
R
V
 
V
K
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
V
 
L
V
 
K
T
 
E
Q
 
R
F
 
Y
K
 
K
-
 
G
S
 
G
S
 
E
V
 
V
I
 
A
P
 
P
A
 
A

3gxaC Crystal structure of gna1946 (see paper)
41% identity, 89% coverage: 30:266/267 of query aligns to 1:237/244 of 3gxaC

query
sites
3gxaC
K
 
K
P
 
E
I
 
I
K
 
V
I
 
F
G
 
G
A
 
T
T
 
T
G
 
V
G
 
G
P
 
D
H
 
F
A
 
G
Q
 
D
I
 
M
L
 
V
-
 
K
E
 
E
V
 
Q
V
 
I
K
 
Q
K
 
P
V
 
E
A
 
L
A
 
E
K
 
K
D
 
K
G
 
G
L
 
Y
N
 
T
I
 
V
Q
 
K
I
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
T
D
 
D
Y
|
Y
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
N
 
N
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
I
N
 
N
S
 
V
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
K
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
E
 
D
A
 
D
Q
 
F
I
 
K
K
 
K
D
 
E
R
 
H
G
 
N
Y
 
L
K
 
D
L
 
I
V
 
T
N
 
E
V
 
V
G
 
F
Y
 
Q
T
 
V
I
 
P
T
 
T
F
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
L
Y
 
Y
S
 
P
K
 
G
K
 
K
V
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
E
L
 
V
K
 
K
N
 
D
G
 
G
A
 
S
R
 
T
I
 
V
G
 
S
V
 
A
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
S
N
 
N
G
 
F
G
 
A
R
|
R
A
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
W
L
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
D
D
 
G
A
 
I
G
 
N
-
 
P
L
 
L
K
 
T
A
 
A
T
 
S
P
 
K
L
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
A
D
 
E
N
 
N
P
 
L
K
 
K
K
 
N
L
 
I
K
 
K
I
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
F
A
 
A
A
 
V
I
 
V
N
|
N
G
 
G
N
|
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
I
S
 
S
A
 
S
G
 
G
L
 
M
D
 
K
P
 
L
T
 
T
K
 
E
D
 
-
G
 
-
I
 
A
A
 
L
I
 
F
E
 
Q
G
 
E
A
 
P
K
 
S
G
 
F
P
 
A
Y
 
Y
A
 
V
N
|
N
V
 
W
I
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
K
I
 
T
A
 
A
D
 
D
K
 
K
D
 
D
K
 
S
P
 
Q
W
 
W
V
 
L
A
 
K
K
 
D
L
 
V
I
 
T
K
 
E
A
 
A
Y
 
Y
H
 
N
S
 
S
P
 
D
E
 
A
V
 
F
K
 
K
Q
 
A
Y
 
Y
V
 
A
V
 
H
T
 
K
Q
 
R
F
 
F
K
 
E
S
 
G
S
 
Y
V
 
K
I
 
S
P
 
P
A
 
A

6dzxA Crystal structure of the n. Meningitides methionine-binding protein in its d-methionine bound conformation. (see paper)
41% identity, 88% coverage: 32:266/267 of query aligns to 2:236/240 of 6dzxA

query
sites
6dzxA
I
 
I
K
 
V
I
 
F
G
 
G
A
 
T
T
 
T
G
 
V
G
 
G
P
 
D
H
 
F
A
 
G
Q
 
D
I
 
M
L
 
V
-
 
K
E
 
E
V
 
Q
V
 
I
K
 
Q
K
 
A
V
 
E
A
 
L
A
 
E
K
 
K
D
 
K
G
 
G
L
 
Y
N
 
T
I
 
V
Q
 
K
I
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
T
D
 
D
Y
|
Y
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
N
 
N
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
I
N
 
N
S
 
V
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
K
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
E
 
D
A
 
D
Q
 
F
I
 
K
K
 
K
D
 
E
R
 
H
G
 
N
Y
 
L
K
 
D
L
 
I
V
 
T
N
 
E
V
 
V
G
 
F
Y
 
Q
T
 
V
I
 
P
T
 
T
F
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
L
Y
 
Y
S
 
P
K
 
G
K
 
K
V
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
E
L
 
V
K
 
K
N
 
D
G
 
G
A
 
S
R
 
T
I
 
V
G
 
S
V
 
A
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
S
N
|
N
G
 
F
G
 
A
R
|
R
A
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
W
L
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
D
D
 
G
A
 
I
G
 
N
-
 
P
L
 
L
K
 
T
A
 
A
T
 
S
P
 
K
L
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
A
D
 
E
N
 
N
P
 
L
K
 
K
K
 
N
L
 
I
K
 
K
I
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
F
A
 
A
A
 
V
I
 
V
N
|
N
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
I
S
 
S
A
 
S
G
 
G
L
 
M
D
 
K
P
 
L
T
 
T
K
 
E
D
 
-
G
 
-
I
 
A
A
 
L
I
 
F
E
 
Q
G
 
E
A
 
P
K
 
S
G
 
F
P
 
A
Y
 
Y
A
 
V
N
|
N
V
 
W
I
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
K
I
 
T
A
 
A
D
 
D
K
 
K
D
 
D
K
 
S
P
 
Q
W
 
W
V
 
L
A
 
K
K
 
D
L
 
V
I
 
T
K
 
E
A
 
A
Y
 
Y
H
 
N
S
 
S
P
 
D
E
 
A
V
 
F
K
 
K
Q
 
A
Y
 
Y
V
 
A
V
 
H
T
 
K
Q
 
R
F
 
F
K
 
E
S
 
G
S
 
Y
V
 
K
I
 
S
P
 
P
A
 
A

1p99A 1.7a crystal structure of protein pg110 from staphylococcus aureus (see paper)
43% identity, 82% coverage: 46:265/267 of query aligns to 15:239/255 of 1p99A

query
sites
1p99A
E
 
E
V
 
K
V
 
V
K
 
K
K
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
K
D
 
D
G
 
D
L
 
I
N
 
D
I
 
V
Q
 
E
I
 
I
V
 
K
E
 
H
F
 
F
S
 
S
D
 
D
Y
|
Y
V
 
N
Q
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
N
A
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
D
 
D
A
 
M
N
 
N
S
 
A
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
F
P
 
A
Y
x
F
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
Q
 
Y
I
 
K
K
 
K
-
 
A
D
 
H
R
 
K
G
 
G
Y
 
T
K
 
K
L
 
I
V
 
S
N
 
A
V
 
L
G
 
S
Y
 
T
T
 
T
I
 
V
T
 
L
F
x
A
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
S
 
S
K
 
D
K
 
K
V
 
I
K
 
K
S
 
D
L
 
V
K
 
K
D
 
K
L
 
V
K
 
K
N
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
V
V
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
V
T
 
S
N
 
N
G
 
Q
G
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
L
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
K
D
 
D
A
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
A
A
 
G
T
 
T
P
 
V
L
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
T
D
 
S
N
 
N
P
 
P
K
 
K
K
 
H
L
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
T
E
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
T
P
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
I
A
 
A
A
 
V
I
 
I
N
|
N
G
x
N
N
x
G
Y
 
V
A
 
A
E
 
T
S
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
K
D
 
D
P
 
P
T
 
K
K
 
N
D
 
D
G
 
P
I
 
I
A
 
F
I
 
L
E
 
E
G
 
K
A
 
S
K
 
N
G
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
K
P
 
P
Y
 
Y
A
 
I
N
|
N
V
 
I
I
 
V
A
 
A
V
 
V
R
 
N
I
 
D
A
 
K
D
 
D
K
 
L
D
 
D
K
 
N
P
 
K
W
 
T
V
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
I
I
 
V
K
 
E
A
 
L
Y
 
Y
H
 
H
S
 
S
P
 
K
E
 
E
V
 
A
K
 
Q
Q
 
K
Y
 
A
V
 
L
V
 
Q
T
 
E
Q
 
D
F
 
V
K
 
K
S
 
D
S
 
G
V
 
E
I
 
K
P
 
P

4oteB Crystal structure of a putative lipoprotein (cd630_1653) from clostridium difficile 630 at 2.20 a resolution
38% identity, 90% coverage: 29:267/267 of query aligns to 3:240/240 of 4oteB

query
sites
4oteB
D
 
D
K
 
K
P
 
K
I
 
I
K
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
L
G
 
V
P
 
P
H
 
G
A
 
G
Q
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
P
V
 
L
A
 
I
A
 
K
K
 
E
D
 
K
G
 
G
L
 
Y
N
 
T
I
 
L
Q
 
E
I
 
V
V
 
K
E
 
N
F
 
F
S
x
D
D
|
D
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
A
 
N
G
 
G
D
 
E
L
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
N
S
 
L
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
H
L
 
E
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
A
 
E
Q
 
A
I
 
V
K
 
K
D
 
A
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
L
 
I
V
 
M
N
 
A
V
 
G
G
 
K
Y
 
K
T
 
L
I
 
Y
T
 
V
F
 
C
P
 
P
M
 
A
G
 
I
V
 
L
Y
 
Y
S
 
S
K
 
Y
K
 
K
V
 
I
K
 
K
S
 
S
L
 
V
K
 
D
D
 
E
L
 
F
K
 
K
N
 
K
G
 
G
A
 
D
R
 
T
I
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
S
N
 
N
D
 
N
P
 
P
T
 
S
N
 
S
G
 
C
G
 
S
R
 
K
A
 
N
L
 
L
L
 
R
L
 
Y
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
T
L
 
L
K
 
P
A
 
K
D
 
G
A
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
-
A
 
V
T
 
S
P
 
P
L
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
I
D
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
K
K
 
G
L
 
I
K
 
Q
I
 
F
V
 
K
E
 
E
I
 
L
D
 
D
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
R
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
P
D
 
D
L
 
V
D
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
F
I
 
I
N
 
D
G
 
T
N
 
T
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
S
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
A
T
 
K
K
 
K
D
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
I
 
T
E
 
A
G
 
P
A
 
I
K
 
N
G
 
D
P
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
L
I
 
L
A
 
A
V
 
F
R
 
R
I
 
T
A
 
E
D
 
D
K
 
K
D
 
D
K
 
S
P
 
E
W
 
K
V
 
I
A
 
K
K
 
V
L
 
L
I
 
Q
K
 
D
A
 
V
Y
 
L
H
 
T
S
 
S
P
 
D
E
 
K
V
 
A
K
 
R
Q
 
S
Y
 
L
V
 
I
V
 
E
T
 
E
Q
 
K
F
 
Y
K
 
K
S
 
G
S
 
I
V
 
V
I
 
I
P
 
P
A
 
T
W
 
F

4ntlA Crystal structure of a lipoprotein, yaec family (ef3198) from enterococcus faecalis v583 at 1.80 a resolution
38% identity, 90% coverage: 29:267/267 of query aligns to 1:242/242 of 4ntlA

query
sites
4ntlA
D
 
D
K
 
K
P
 
E
I
 
I
K
 
T
I
 
V
G
 
A
A
 
V
T
 
Q
G
 
L
G
x
E
P
 
S
H
 
S
A
 
K
Q
x
D
I
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
E
A
 
A
A
 
E
K
 
K
D
 
K
G
 
G
L
 
Y
N
 
K
I
 
I
Q
 
N
I
 
I
V
 
M
E
 
E
F
 
V
S
 
S
D
 
D
Y
 
N
V
 
V
Q
 
A
P
 
Y
N
 
N
A
x
D
A
 
A
L
 
V
A
 
Q
A
x
H
G
 
D
D
x
E
L
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
N
S
 
F
Y
 
A
Q
 
Q
H
 
H
L
 
Q
P
 
P
Y
 
F
L
 
M
E
 
E
A
 
M
Q
 
F
I
 
N
K
 
K
D
 
E
R
 
K
G
 
K
Y
 
A
K
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
A
V
 
V
G
 
Q
Y
 
P
T
 
I
I
 
Y
T
 
Y
F
 
F
P
 
A
M
 
G
G
 
G
V
 
F
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
K
 
E
V
 
Y
K
 
Q
S
 
D
L
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
P
N
 
E
G
 
N
A
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
I
P
 
P
N
 
S
D
 
D
P
 
P
T
 
T
N
 
N
G
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
I
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
E
D
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
F
K
 
N
A
 
G
T
 
T
P
 
V
L
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
V
D
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
K
K
 
N
L
 
I
K
 
T
I
 
F
V
 
E
E
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
L
A
 
L
Q
 
N
L
 
L
P
 
A
R
 
K
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
D
 
E
L
 
K
D
 
D
A
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
V
N
 
F
G
 
C
N
 
Y
-
 
P
-
 
A
Y
 
Y
A
 
L
E
 
E
S
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
-
P
 
T
T
 
T
K
 
K
D
 
D
G
 
A
I
 
I
A
 
L
I
 
L
E
 
E
G
 
D
-
 
K
-
 
E
A
 
A
K
 
S
G
 
K
P
 
H
Y
 
Y
A
 
A
N
 
L
V
 
Q
I
 
V
A
 
V
V
 
T
R
 
R
I
 
K
A
 
G
D
 
E
K
 
K
D
 
D
K
 
S
P
 
E
W
 
K
V
 
I
A
 
K
K
 
V
L
 
L
I
 
K
K
 
E
A
 
A
Y
 
M
H
 
T
S
 
T
P
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
A
Q
 
E
Y
 
Y
V
 
I
V
 
K
T
 
K
Q
 
N
F
 
S
K
 
K
S
 
G
S
 
A
V
 
N
I
 
I
P
 
P
A
 
A
W
 
F

6jf1A Crystal structure of the substrate binding protein of a methionine transporter from streptococcus pneumoniae (see paper)
34% identity, 88% coverage: 32:267/267 of query aligns to 13:260/260 of 6jf1A

query
sites
6jf1A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
G
 
A
A
 
T
T
 
V
-
 
N
-
 
R
G
 
S
G
 
G
P
 
S
H
 
E
A
x
E
Q
 
K
I
 
R
L
 
W
E
x
D
V
 
K
V
 
I
K
 
Q
K
 
E
V
 
L
A
 
V
A
 
K
K
 
K
D
 
D
G
 
G
L
 
I
N
 
T
I
 
L
Q
 
E
I
 
F
V
 
T
E
|
E
F
 
F
S
 
T
D
 
D
Y
|
Y
V
 
S
Q
 
Q
P
 
P
N
 
N
A
 
K
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
D
G
 
G
D
 
E
L
 
V
D
 
D
A
 
L
N
 
N
S
 
A
Y
x
F
Q
|
Q
H
|
H
L
 
Y
P
 
N
Y
x
F
L
 
L
E
 
N
A
 
N
Q
 
W
I
 
N
K
 
K
D
 
E
R
 
N
G
 
G
Y
 
K
K
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
A
V
 
I
G
 
A
Y
 
D
T
 
T
I
 
Y
T
 
I
F
 
S
P
 
P
M
 
I
G
 
R
V
 
L
Y
 
Y
S
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
A
K
 
N
K
 
K
V
 
Y
K
 
T
S
 
K
L
 
V
K
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
P
N
 
A
G
 
N
A
 
G
R
 
E
I
 
I
G
 
A
V
 
V
P
 
P
N
|
N
D
 
D
P
 
A
T
 
T
N
|
N
G
x
E
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
D
A
 
V
D
 
S
A
 
G
G
 
T
L
 
A
K
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
V
L
 
A
D
 
N
I
 
I
T
 
K
D
 
E
N
 
N
P
 
P
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
T
E
|
E
I
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
S
Q
 
Q
L
 
T
P
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
S
D
 
S
L
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
V
N
|
N
G
x
N
N
x
T
Y
 
F
A
 
V
E
 
T
S
 
E
A
 
A
G
 
K
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
T
 
K
K
 
K
D
 
S
G
 
L
I
 
F
A
 
K
I
 
E
E
 
Q
G
 
A
A
 
D
K
 
N
G
 
S
P
 
K
-
 
Q
Y
 
W
A
 
Y
N
|
N
V
 
I
I
 
I
A
 
V
V
 
A
R
 
K
I
 
-
A
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
K
 
K
P
 
D
W
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
A
V
 
I
A
 
K
K
 
K
L
 
V
I
 
I
K
 
A
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
S
 
T
P
 
D
E
 
D
V
 
V
K
 
K
Q
 
K
Y
 
V
V
 
I
V
 
E
T
 
E
Q
 
S
F
 
S
K
 
D
S
 
G
S
 
L
V
 
D
I
 
Q
P
 
P
A
 
V
W
 
W

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_061534454.1 NCBI__GCF_001584165.1:WP_061534454.1
MNRRQLVNLFAGLSVIASLGAAAPAFTQDKPIKIGATGGPHAQILEVVKKVAAKDGLNIQ
IVEFSDYVQPNAALAAGDLDANSYQHLPYLEAQIKDRGYKLVNVGYTITFPMGVYSKKVK
SLKDLKNGARIGVPNDPTNGGRALLLLQAQGLLKLKADAGLKATPLDITDNPKKLKIVEI
DAAQLPRSLDDLDAAAINGNYAESAGLDPTKDGIAIEGAKGPYANVIAVRIADKDKPWVA
KLIKAYHSPEVKQYVVTQFKSSVIPAW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory