SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_061942382.1 NCBI__GCF_001584185.1:WP_061942382.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q97U29 2-dehydro-3-deoxygluconokinase/2-dehydro-3-deoxygalactonokinase; 2-dehydro-3-deoxyglucono/galactono-kinase; 2-keto-3-deoxy-galactonokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; KDGal kinase; EC 2.7.1.178 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
32% identity, 87% coverage: 3:268/306 of query aligns to 2:273/313 of Q97U29

query
sites
Q97U29
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
P
M
 
L
V
 
I
E
 
Q
F
 
F
N
 
N
Q
 
S
R
 
F
Q
 
N
H
 
P
D
 
G
T
 
P
R
 
L
M
 
R
Y
 
F
L
 
V
Q
 
N
G
 
Y
F
 
F
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
V
G
 
A
G
|
G
D
x
S
T
x
E
S
x
L
N
|
N
F
 
F
C
 
C
I
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
V
R
 
R
Q
 
N
G
 
H
A
 
L
R
 
S
S
 
C
G
 
S
Y
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
R
L
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
E
F
 
F
G
 
G
E
 
K
Q
 
N
L
 
I
R
 
I
A
 
E
L
 
Y
W
 
S
Q
 
R
A
 
A
E
 
Q
Q
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
T
S
 
S
H
 
H
V
 
I
A
 
K
R
 
V
D
 
D
A
 
N
N
 
E
A
 
S
A
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
|
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
-
H
 
-
D
 
-
Q
 
Q
D
 
R
G
 
G
H
 
Y
-
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
K
-
 
S
H
 
E
F
 
L
D
 
V
Y
|
Y
L
x
Y
R
|
R
A
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
Y
 
L
S
 
S
S
 
P
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
P
 
N
L
 
E
A
 
N
A
 
Y
I
 
V
A
 
R
A
 
N
A
 
S
K
 
R
V
 
L
L
 
V
H
 
H
L
 
S
S
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
D
S
 
N
A
 
A
C
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
V
L
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
F
A
 
E
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
R
G
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
N
|
N
L
x
I
R
|
R
L
 
P
K
 
K
L
 
L
W
 
W
-
 
S
P
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
K
 
T
I
 
I
R
 
L
A
 
S
A
 
I
F
 
L
A
 
K
L
 
K
C
 
Y
D
 
D
I
 
I
-
 
E
-
 
V
C
 
L
L
 
I
P
 
T
S
 
D
W
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
T
S
 
K
A
 
I
L
 
L
T
 
L
S
 
D
L
 
V
D
 
T
D
 
D
R
 
P
D
 
D
A
 
E
I
 
A
V
 
Y
D
 
R
E
 
K
L
 
Y
L
 
K
S
 
E
Y
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
K
L
 
V
I
 
L
A
 
L
F
 
Y
K
|
K
L
|
L
G
|
G
A
x
S
E
x
K
G
|
G
C
 
A
Y
 
I
V
 
A
A
 
Y
T
 
K
A
 
D
K
 
N
E
 
V
R
 
K
R
 
A
L
 
F
V
 
K
P
 
D
P
 
A
Y
 
Y
S
 
K
V
 
V
E
 
P
A
 
V
I
 
E
D
 
D
A
 
P
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
 
M
G
 
A
G
 
G
A
 
T
F
 
F
I
 
V
A
 
S
R
 
L
I
 
Y
V
 
L
A
 
Q
G
 
G
D
 
K
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2varA Crystal structure of sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate kinase complexed with 2-keto-3-deoxygluconate (see paper)
32% identity, 87% coverage: 3:268/306 of query aligns to 1:272/311 of 2varA

query
sites
2varA
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
P
M
x
L
V
 
I
E
 
Q
F
 
F
N
 
N
Q
 
S
R
 
F
Q
 
N
H
 
P
D
 
G
T
 
P
R
 
L
M
 
R
Y
 
F
L
 
V
Q
 
N
G
 
Y
F
 
F
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
V
G
 
A
G
|
G
D
x
S
T
 
E
S
 
L
N
 
N
F
 
F
C
 
C
I
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
V
R
 
R
Q
 
N
G
 
H
A
 
L
R
 
S
S
 
C
G
 
S
Y
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
R
L
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
E
F
 
F
G
 
G
E
 
K
Q
 
N
L
 
I
R
 
I
A
 
E
L
 
Y
W
 
S
Q
 
R
A
 
A
E
 
Q
Q
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
T
S
 
S
H
 
H
V
 
I
A
 
K
R
 
V
D
 
D
A
 
N
N
 
E
A
 
S
A
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
|
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
-
H
 
-
D
 
-
Q
 
Q
D
 
R
G
 
G
H
 
Y
-
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
K
-
 
S
H
 
E
F
x
L
D
 
V
Y
|
Y
L
 
Y
R
|
R
A
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
Y
 
L
S
 
S
S
 
P
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
P
 
N
L
 
E
A
 
N
A
 
Y
I
 
V
A
 
R
A
 
N
A
 
S
K
 
R
V
 
L
L
 
V
H
 
H
L
 
S
S
 
T
G
 
G
I
|
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
D
S
 
N
A
 
A
C
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
V
L
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
F
A
 
E
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
R
G
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
I
R
|
R
L
 
P
K
 
K
L
 
L
W
 
W
-
 
S
P
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
K
 
T
I
 
I
R
 
L
A
 
S
A
 
I
F
 
L
A
 
K
L
 
K
C
 
Y
D
 
D
I
 
I
-
 
E
-
 
V
C
 
L
L
 
I
P
 
T
S
 
D
W
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
T
S
 
K
A
 
I
L
 
L
T
 
L
S
 
D
L
 
V
D
 
T
D
 
D
R
 
P
D
 
D
A
 
E
I
 
A
V
 
Y
D
 
R
E
 
K
L
 
Y
L
 
K
S
 
E
Y
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
K
L
 
V
I
 
L
A
 
L
F
 
Y
K
|
K
L
 
L
G
|
G
A
x
S
E
 
K
G
|
G
C
 
A
Y
 
I
V
 
A
A
 
Y
T
 
K
A
 
D
K
 
N
E
 
V
R
 
K
R
 
A
L
 
F
V
 
K
P
 
D
P
 
A
Y
 
Y
S
 
K
V
 
V
E
 
P
A
 
V
I
 
E
D
 
D
A
 
P
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
x
M
G
 
A
G
 
G
A
 
T
F
 
F
I
 
V
A
 
S
R
 
L
I
 
Y
V
 
L
A
 
Q
G
 
G
D
 
K
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2dcnA Crystal structure of 2-keto-3-deoxygluconate kinase from sulfolobus tokodaii complexed with 2-keto-6-phosphogluconate (alpha-furanose form)
30% identity, 98% coverage: 5:303/306 of query aligns to 3:305/308 of 2dcnA

query
sites
2dcnA
I
 
L
L
 
I
A
 
T
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
I
M
 
L
V
 
I
E
 
E
F
 
F
N
 
N
Q
 
A
R
 
L
Q
 
S
H
 
P
D
 
G
T
 
P
R
 
L
M
 
R
Y
 
H
L
 
V
Q
 
S
G
 
Y
F
 
F
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
V
G
 
A
G
|
G
D
 
S
T
 
E
S
 
A
N
 
N
F
 
Y
C
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
F
A
 
I
R
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
N
R
 
E
S
 
C
G
 
G
Y
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
K
L
 
V
G
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
E
F
 
F
G
 
G
E
 
Y
Q
 
N
L
 
A
R
 
I
A
 
E
L
 
W
W
 
L
Q
 
R
A
 
G
E
 
Q
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
S
 
S
H
 
H
V
 
M
A
 
K
R
 
I
D
 
D
A
 
P
N
 
S
A
 
A
A
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
x
F
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
H
 
-
D
 
-
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
R
H
 
H
F
 
Y
D
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
I
Y
|
Y
L
 
Y
R
|
R
A
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
K
Y
 
L
S
 
S
S
 
P
E
 
E
Q
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
E
A
 
E
A
 
Y
I
 
V
A
 
K
A
 
S
A
 
A
K
 
D
V
 
L
L
 
V
H
 
H
L
 
S
S
 
S
G
 
G
I
|
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
S
S
 
T
A
 
A
C
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
V
L
 
Y
A
 
K
A
 
A
M
 
F
A
 
E
Y
 
I
A
 
A
R
 
S
K
 
N
H
 
R
G
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
S
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
I
R
|
R
L
 
L
K
 
K
L
 
L
W
 
W
P
 
S
L
 
A
E
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
L
K
 
K
I
 
L
R
 
L
A
 
S
A
 
K
F
 
F
A
 
H
L
 
L
C
 
-
D
 
K
I
 
F
C
 
L
L
 
I
P
 
T
S
x
D
W
 
T
D
 
D
D
 
D
I
 
S
S
 
K
A
 
I
L
 
I
T
 
L
S
 
G
L
 
E
D
 
S
D
 
D
R
 
P
D
 
D
A
 
K
I
 
A
V
 
A
D
 
K
E
 
A
L
 
F
L
 
S
S
 
D
Y
 
Y
G
 
A
I
 
-
G
 
E
L
 
I
I
 
I
A
 
V
F
 
M
K
|
K
L
 
L
G
|
G
A
x
P
E
 
K
G
|
G
C
 
A
Y
 
I
V
 
V
A
 
Y
T
 
Y
A
 
D
K
 
G
E
 
K
R
 
K
R
 
Y
L
 
Y
V
 
S
P
 
S
P
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
V
 
V
E
 
P
A
x
V
I
 
E
D
 
D
A
 
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
T
F
 
F
I
 
L
A
 
S
R
 
L
I
 
Y
V
 
Y
A
 
K
G
 
G
D
 
F
D
 
E
P
 
M
F
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
D
Y
 
Y
A
 
A
N
x
I
V
 
V
C
 
A
A
x
S
A
 
T
L
 
L
S
 
N
T
x
V
T
 
M
G
 
I
Y
 
R
G
 
G
A
x
D
V
 
Q
A
 
E
P
 
N
I
 
L
P
 
P
H
 
T
A
 
T
A
 
K
Q
 
D
V
 
I
E
 
E
E
 
T
I
 
F
L
 
L

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
30% identity, 94% coverage: 9:297/306 of query aligns to 8:299/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
G
 
G
E
x
D
A
 
A
M
 
V
V
 
V
E
x
D
F
 
L
-
 
I
-
 
P
N
 
D
Q
 
G
R
 
Q
Q
 
Q
H
 
H
D
 
-
T
 
-
R
 
-
M
 
-
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
C
F
 
P
G
 
G
G
|
G
D
x
A
T
 
P
S
 
A
N
|
N
F
 
V
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
S
A
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
A
Y
 
F
I
 
F
S
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Q
 
F
L
 
M
R
 
Q
A
 
Q
L
 
T
W
 
L
Q
 
T
A
 
D
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
A
 
C
S
 
Q
H
 
H
V
 
L
A
 
H
R
 
F
D
 
D
A
 
P
N
 
V
A
 
H
A
 
R
T
 
T
G
 
S
V
 
T
Y
 
V
F
 
V
V
 
V
S
 
D
H
 
L
D
 
D
Q
 
E
D
x
H
G
 
G
H
 
E
H
 
R
-
 
S
F
|
F
D
 
T
Y
x
F
L
 
M
R
 
V
A
 
K
G
 
P
S
 
S
A
 
A
A
 
D
S
 
Q
R
 
F
Y
 
L
S
 
Q
S
 
L
E
 
S
Q
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
-
A
 
-
A
 
S
I
 
F
A
 
Q
A
 
K
A
 
G
K
 
E
V
 
W
L
 
L
H
 
H
L
 
V
S
 
C
G
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
N
S
 
Q
A
 
P
S
 
S
A
 
R
C
 
S
D
 
S
A
 
T
G
 
-
L
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
A
Y
 
Q
A
 
M
R
 
K
K
 
E
H
 
V
G
 
G
V
 
G
K
 
Y
T
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
L
 
E
K
 
E
L
 
V
W
 
W
-
 
S
P
 
E
L
 
P
E
 
Q
R
 
E
A
 
L
Q
 
Q
E
 
A
K
 
T
I
 
V
R
 
M
A
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
G
L
 
L
C
 
A
D
 
D
I
 
V
C
 
V
L
 
K
P
 
F
S
 
S
W
 
E
D
 
E
D
 
E
I
 
L
S
 
Q
A
 
F
L
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
T
D
 
Q
D
 
S
R
 
I
D
 
E
A
 
E
I
 
G
V
 
L
D
 
Q
E
 
A
L
 
I
L
 
A
S
 
D
Y
 
F
G
 
Q
I
 
I
G
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
F
 
V
K
x
T
L
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
K
 
N
E
 
S
R
 
Q
R
 
Q
L
 
I
V
 
V
P
 
S
P
 
G
Y
 
K
S
x
A
V
|
V
E
 
K
A
 
P
I
 
I
D
 
D
A
x
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
|
F
G
 
V
G
 
G
A
 
G
F
 
L
I
 
L
A
 
Y
R
 
R
I
 
L
V
 
S
A
 
V
G
 
A
D
 
Q
D
 
D
-
 
W
-
 
H
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
T
P
 
I
F
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
K
Y
 
W
A
 
A
N
|
N
V
 
G
C
 
C
A
x
G
A
|
A
L
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
G
 
Q
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
A
 
T
P
 
A
I
 
L
P
 
P
H
 
N
A
 
Q
A
 
A

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
30% identity, 94% coverage: 9:297/306 of query aligns to 12:303/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
G
 
G
E
x
D
A
 
A
M
 
V
V
 
V
E
x
D
F
 
L
-
 
I
-
 
P
N
 
D
Q
 
G
R
 
Q
Q
 
Q
H
 
H
D
 
-
T
 
-
R
 
-
M
 
-
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
C
F
 
P
G
 
G
G
|
G
D
x
A
T
 
P
S
 
A
N
 
N
F
 
V
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
S
A
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
A
Y
 
F
I
 
F
S
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Q
 
F
L
 
M
R
 
Q
A
 
Q
L
 
T
W
 
L
Q
 
T
A
 
D
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
A
 
C
S
 
Q
H
 
H
V
 
L
A
 
H
R
 
F
D
 
D
A
 
P
N
 
V
A
 
H
A
 
R
T
 
T
G
 
S
V
 
T
Y
 
V
F
 
V
V
 
V
S
 
D
H
 
L
D
 
D
Q
 
E
D
 
C
G
 
G
H
 
E
H
 
R
-
 
S
F
|
F
D
 
T
Y
x
F
L
 
M
R
 
V
A
 
K
G
 
P
S
 
S
A
 
A
A
 
D
S
 
Q
R
 
F
Y
 
L
S
 
Q
S
 
L
E
 
S
Q
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
-
A
 
-
A
 
S
I
 
F
A
 
Q
A
 
K
A
 
G
K
 
E
V
 
W
L
 
L
H
 
H
L
 
V
S
 
C
G
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
N
S
 
Q
A
 
P
S
 
S
A
 
R
C
 
-
D
 
S
A
 
S
G
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
A
Y
 
Q
A
 
M
R
 
K
K
 
E
H
 
V
G
 
G
V
 
G
K
 
Y
T
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
L
 
E
K
 
E
L
 
V
W
 
W
-
 
S
P
 
E
L
 
P
E
 
Q
R
 
E
A
 
L
Q
 
Q
E
 
A
K
 
T
I
 
V
R
 
M
A
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
G
L
 
L
C
 
A
D
 
D
I
 
V
C
 
V
L
x
K
P
 
F
S
 
S
W
 
E
D
 
E
D
 
E
I
 
L
S
 
Q
A
 
F
L
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
T
D
 
Q
D
 
S
R
 
I
D
 
E
A
 
E
I
 
G
V
 
L
D
 
Q
E
 
A
L
 
I
L
 
A
S
 
D
Y
 
F
G
 
Q
I
 
I
G
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
F
 
V
K
x
T
L
 
L
G
|
G
A
 
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
K
 
N
E
 
S
R
 
Q
R
 
Q
L
 
I
V
 
V
P
 
S
P
 
G
Y
 
K
S
x
A
V
|
V
E
 
K
A
 
P
I
 
I
D
 
D
A
 
C
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
C
 
A
F
|
F
G
 
V
G
 
G
A
 
G
F
 
L
I
 
L
A
 
Y
R
 
R
I
 
L
V
 
S
A
 
V
G
 
A
D
 
Q
D
 
D
-
 
W
-
 
H
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
T
P
 
I
F
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
K
Y
 
W
A
 
A
N
|
N
V
 
G
C
 
C
A
x
G
A
|
A
L
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
G
 
Q
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
A
 
T
P
 
A
I
 
L
P
 
P
H
 
N
A
 
Q
A
 
A

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
30% identity, 88% coverage: 36:305/306 of query aligns to 41:307/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
F
 
F
C
 
I
I
 
D
A
 
Q
A
 
V
A
 
T
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
P
S
 
C
G
 
G
Y
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
C
L
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
D
Q
 
I
L
 
N
R
 
I
A
 
H
L
 
R
W
 
L
Q
 
A
A
 
A
E
 
D
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
I
S
 
R
H
 
G
V
 
I
A
 
S
R
 
V
D
 
L
A
 
P
N
 
L
A
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
S
Y
 
A
F
 
F
V
 
V
S
 
T
H
 
Y
-
 
G
D
 
D
Q
 
R
D
 
D
G
 
-
H
 
-
H
 
-
F
 
F
D
 
I
Y
 
F
L
 
N
R
 
I
A
 
K
G
 
N
S
 
A
A
 
A
A
 
C
S
 
G
R
 
K
Y
 
L
S
 
S
S
 
A
E
 
Q
Q
 
H
L
 
V
P
 
D
L
 
E
A
 
N
A
 
I
I
 
L
A
 
K
A
 
D
A
 
C
K
 
T
V
 
H
L
 
F
H
 
H
L
 
I
S
 
M
G
 
G
I
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
-
I
 
F
S
 
S
A
 
F
S
 
H
A
 
M
C
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
V
L
 
K
A
 
K
A
 
A
M
 
V
A
 
T
Y
 
I
A
 
V
R
 
K
K
 
A
H
 
N
G
 
G
V
 
G
K
 
V
T
 
I
S
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
N
 
N
L
 
I
R
 
R
L
 
K
K
 
E
L
 
M
W
 
L
P
 
D
L
 
I
E
 
P
R
 
E
A
 
M
Q
 
R
E
 
D
K
 
A
I
 
L
R
 
H
A
 
F
A
 
V
F
 
L
A
 
E
L
 
L
C
 
T
D
 
D
I
 
I
C
 
Y
L
 
M
P
 
P
S
|
S
W
 
E
D
 
G
D
 
E
I
 
V
S
 
L
A
 
L
L
 
L
T
 
S
S
 
P
L
 
H
D
 
S
D
 
T
R
 
P
D
 
E
A
 
R
I
 
A
V
 
I
D
 
A
E
 
G
L
 
F
L
 
L
S
 
E
Y
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
K
L
 
E
I
 
V
A
 
I
F
 
V
K
|
K
L
 
R
G
|
G
A
 
N
E
 
Q
G
 
G
C
 
A
Y
 
S
V
 
Y
A
 
Y
T
 
S
A
 
A
K
 
N
E
 
E
R
 
Q
R
 
F
L
 
H
V
 
V
P
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
P
V
 
V
E
 
E
A
x
E
I
 
V
D
 
D
A
 
P
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
C
F
|
F
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
W
I
 
I
A
 
A
R
 
C
I
 
R
V
 
Q
A
 
L
G
 
G
D
 
F
D
 
D
P
 
A
F
 
H
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
N
|
N
V
 
A
C
 
C
A
x
G
A
 
A
L
 
L
S
 
A
T
 
V
T
 
T
G
 
R
Y
 
R
G
 
G
A
 
P
V
 
M
A
 
E
P
 
G
I
 
T
P
 
S
H
 
R
A
 
L
A
 
M
Q
 
E
V
 
I
E
 
E
E
 
T
I
 
F
L
 
I
P
 
Q
R
 
R

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
28% identity, 99% coverage: 2:303/306 of query aligns to 1:301/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
T
 
M
I
 
L
D
 
E
I
 
V
L
 
V
A
 
T
Y
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
M
x
L
V
 
V
E
 
A
F
 
L
N
 
V
Q
 
P
R
 
Q
Q
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
L
H
 
R
D
 
G
T
 
K
R
 
R
M
 
L
Y
 
L
L
 
E
Q
 
V
G
 
Y
F
 
V
G
 
G
G
|
G
D
x
A
T
 
E
S
 
V
N
|
N
F
 
V
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
V
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
N
 
E
D
 
D
H
 
E
F
 
L
G
 
G
E
 
A
Q
 
M
L
 
V
R
 
E
A
 
E
L
 
R
W
 
L
Q
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
L
S
 
T
H
 
H
V
 
F
A
 
-
R
 
R
D
 
R
A
 
A
N
 
P
A
 
G
A
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
L
Y
|
Y
F
 
L
V
 
R
S
 
E
H
 
Y
D
 
L
Q
 
P
D
 
L
G
 
G
H
 
Q
-
 
G
H
 
R
F
 
V
D
 
F
Y
 
Y
L
 
Y
R
|
R
A
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
A
Y
 
L
S
 
A
S
 
P
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
P
 
D
L
 
P
A
 
D
A
 
Y
I
 
L
A
 
E
A
 
G
A
 
V
K
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
A
 
A
I
 
L
S
 
S
A
 
P
S
 
E
A
 
A
C
 
R
D
 
A
A
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
W
A
 
A
M
 
M
A
 
E
Y
 
E
A
 
A
R
 
K
K
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
R
T
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
|
R
L
 
Q
K
 
T
L
 
L
W
 
W
P
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
R
E
 
G
K
 
F
I
 
L
R
 
E
A
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
P
L
 
G
C
 
V
D
 
D
I
 
L
C
 
L
L
 
F
P
 
L
S
 
S
W
 
E
D
 
E
D
 
E
I
 
A
S
 
E
A
 
L
L
 
L
T
 
F
S
 
G
L
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
R
I
 
V
V
 
E
D
 
E
E
 
A
L
 
L
L
 
R
S
 
A
Y
 
L
G
 
S
I
 
A
G
 
P
L
 
E
I
 
V
A
 
V
F
 
L
K
|
K
L
 
R
G
|
G
A
|
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
W
V
 
A
A
 
F
T
 
V
A
 
D
K
 
G
E
 
R
R
 
R
R
 
V
L
 
E
V
 
G
P
 
S
P
 
A
Y
 
F
S
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
P
T
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
L
A
 
A
R
 
G
I
 
A
V
 
V
A
 
W
G
 
G
D
 
L
D
 
P
P
 
V
F
 
E
R
 
E
A
 
R
A
 
L
R
 
R
Y
 
L
A
 
A
N
|
N
V
 
L
C
 
L
A
 
G
A
|
A
L
 
S
S
 
V
T
 
A
T
 
A
G
 
S
Y
 
R
G
 
G
A
x
D
V
 
H
A
 
E
P
 
G
I
 
A
P
 
P
H
 
Y
A
 
R
A
 
E
Q
 
D
V
 
L
E
 
E
E
 
V
I
 
L
L
 
L

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
28% identity, 98% coverage: 3:303/306 of query aligns to 2:301/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
I
 
L
D
 
E
I
 
V
L
 
V
A
 
T
Y
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
M
 
L
V
 
V
E
 
A
F
 
L
N
 
V
Q
 
P
R
 
Q
Q
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
L
H
 
R
D
 
G
T
 
K
R
 
R
M
 
L
Y
 
L
L
 
E
Q
 
V
G
 
Y
F
 
V
G
 
G
G
|
G
D
x
A
T
x
E
S
x
V
N
|
N
F
 
V
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
V
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
N
 
E
D
 
D
H
 
E
F
 
L
G
 
G
E
 
A
Q
 
M
L
 
V
R
 
E
A
 
E
L
 
R
W
 
L
Q
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
L
S
 
T
H
 
H
V
 
F
A
 
-
R
 
R
D
 
R
A
 
A
N
 
P
A
 
G
A
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
L
Y
 
Y
F
 
L
V
 
R
S
 
E
H
 
Y
D
 
L
Q
 
P
D
 
L
G
 
G
H
 
Q
-
 
G
H
 
R
F
 
V
D
 
F
Y
|
Y
L
x
Y
R
|
R
A
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
A
Y
 
L
S
 
A
S
 
P
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
P
 
D
L
 
P
A
 
D
A
 
Y
I
 
L
A
 
E
A
 
G
A
 
V
K
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
A
 
A
I
 
L
S
 
S
A
 
P
S
 
E
A
 
A
C
 
R
D
 
A
A
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
W
A
 
A
M
 
M
A
 
E
Y
 
E
A
 
A
R
 
K
K
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
R
T
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
|
R
L
 
Q
K
 
T
L
 
L
W
 
W
P
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
R
E
 
G
K
 
F
I
 
L
R
 
E
A
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
P
L
 
G
C
 
V
D
 
D
I
 
L
C
 
L
L
 
F
P
 
L
S
|
S
W
 
E
D
 
E
D
 
E
I
 
A
S
 
E
A
 
L
L
 
L
T
 
F
S
 
G
L
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
R
I
 
V
V
 
E
D
 
E
E
 
A
L
 
L
L
 
R
S
 
A
Y
 
L
G
 
S
I
 
A
G
 
P
L
 
E
I
 
V
A
 
V
F
 
L
K
|
K
L
x
R
G
|
G
A
|
A
E
x
K
G
|
G
C
x
A
Y
 
W
V
 
A
A
 
F
T
 
V
A
 
D
K
 
G
E
 
R
R
 
R
R
 
V
L
 
E
V
 
G
P
 
S
P
 
A
Y
 
F
S
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
P
T
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
L
A
 
A
R
 
G
I
 
A
V
 
V
A
 
W
G
 
G
D
 
L
D
 
P
P
 
V
F
 
E
R
 
E
A
 
R
A
 
L
R
 
R
Y
 
L
A
 
A
N
|
N
V
 
L
C
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
S
S
 
V
T
 
A
T
 
A
G
 
S
Y
 
R
G
 
G
A
x
D
V
 
H
A
 
E
P
 
G
I
 
A
P
 
P
H
 
Y
A
 
R
A
 
E
Q
 
D
V
 
L
E
 
E
E
 
V
I
 
L
L
 
L

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
29% identity, 92% coverage: 2:281/306 of query aligns to 1:279/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
T
 
M
I
 
L
D
 
E
I
 
V
L
 
V
A
 
T
Y
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
M
 
L
V
 
V
E
 
A
F
 
L
N
 
V
Q
 
P
R
 
Q
Q
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
L
H
 
R
D
 
G
T
 
K
R
 
R
M
 
L
Y
 
L
L
 
E
Q
 
V
G
 
Y
F
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
A
T
 
E
S
 
V
N
 
N
F
 
V
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
V
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
N
 
E
D
 
D
H
 
E
F
 
L
G
 
G
E
 
A
Q
 
M
L
 
V
R
 
E
A
 
E
L
 
R
W
 
L
Q
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
L
S
 
T
H
 
H
V
 
F
A
 
-
R
 
R
D
 
R
A
 
A
N
 
P
A
 
G
A
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
L
Y
 
Y
F
 
L
V
 
R
S
 
E
H
 
Y
D
 
L
Q
 
P
D
 
L
G
 
G
H
 
Q
-
 
G
H
 
R
F
 
V
D
 
F
Y
 
Y
L
 
Y
R
 
R
A
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
A
Y
 
L
S
 
A
S
 
P
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
P
 
D
L
 
P
A
 
D
A
 
Y
I
 
L
A
 
E
A
 
G
A
 
V
K
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
A
 
A
I
 
L
S
 
S
A
 
P
S
 
E
A
 
A
C
 
R
D
 
A
A
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
W
A
 
A
M
 
M
A
 
E
Y
 
E
A
 
A
R
 
K
K
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
R
T
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
 
R
L
 
Q
K
 
T
L
 
L
W
 
W
P
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
R
E
 
G
K
 
F
I
 
L
R
 
E
A
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
P
L
 
G
C
 
V
D
 
D
I
 
L
C
 
L
L
 
F
P
 
L
S
 
S
W
 
E
D
 
E
D
 
E
I
 
A
S
 
E
A
 
L
L
 
L
T
 
F
S
 
G
L
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
R
I
 
V
V
 
E
D
 
E
E
 
A
L
 
L
L
 
R
S
 
A
Y
 
L
G
 
S
I
 
A
G
 
P
L
 
E
I
 
V
A
 
V
F
 
L
K
|
K
L
 
R
G
|
G
A
 
A
E
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
W
V
 
A
A
 
F
T
 
V
A
 
D
K
 
G
E
 
R
R
 
R
R
 
V
L
 
E
V
 
G
P
 
S
P
x
A
Y
x
F
S
 
A
V
|
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
P
T
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
L
A
 
A
R
 
G
I
 
A
V
 
V
A
 
W
G
 
G
D
 
L
D
 
P
P
 
V
F
 
E
R
 
E
A
 
R
A
 
L
R
 
R
Y
 
L
A
 
A
N
|
N
V
 
L
C
 
L
A
 
G
A
|
A

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
29% identity, 98% coverage: 5:303/306 of query aligns to 7:307/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
I
 
V
L
 
W
A
 
V
Y
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
A
M
 
S
V
 
V
E
x
D
F
 
L
N
 
V
Q
 
P
R
 
E
Q
 
K
H
 
Q
D
 
N
T
 
S
R
 
-
M
 
-
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
C
F
 
P
G
 
G
G
|
G
D
 
A
T
 
S
S
 
A
N
 
N
F
 
V
C
 
G
I
 
V
A
 
C
A
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
E
S
 
C
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
S
 
G
A
 
C
L
 
L
G
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
D
F
 
A
G
 
G
E
 
R
Q
 
F
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
L
 
V
W
 
F
Q
 
Q
A
 
D
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
S
 
T
H
 
F
V
 
L
A
 
R
R
 
L
D
 
D
A
 
A
N
 
D
A
 
L
A
 
T
T
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
N
H
 
L
D
 
T
Q
 
A
D
 
D
G
 
G
H
 
E
H
 
R
-
 
S
F
 
F
D
 
T
Y
|
Y
L
 
L
R
 
V
A
 
H
G
 
P
S
 
G
A
 
A
A
 
D
S
 
T
R
 
Y
Y
 
V
S
 
S
S
 
P
E
 
Q
Q
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
-
A
 
-
A
 
P
I
 
F
A
 
R
A
 
Q
A
 
Y
K
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
T
I
 
-
S
 
D
A
 
R
S
 
P
A
 
A
C
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
M
 
A
A
 
R
Y
 
R
A
 
M
R
 
R
K
 
E
H
 
A
G
 
G
V
 
G
K
 
Y
T
 
V
S
 
L
L
 
F
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
L
 
S
K
 
K
L
 
M
W
 
W
-
 
G
P
 
N
L
 
T
E
 
D
R
 
E
A
 
I
Q
 
P
E
 
E
K
 
L
I
 
I
R
 
A
A
 
R
A
 
S
F
x
A
A
|
A
L
 
L
C
x
A
D
 
S
I
 
I
C
 
C
L
 
K
P
 
V
S
 
S
W
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
L
S
 
C
A
 
Q
L
 
L
T
 
S
S
 
G
L
 
A
D
 
S
D
 
H
R
 
W
D
 
Q
A
 
D
I
 
A
V
 
R
D
 
Y
E
 
Y
L
 
L
L
 
R
S
 
D
Y
 
L
G
|
G
I
 
C
G
 
D
L
 
T
I
 
T
A
 
I
F
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
C
 
A
Y
 
L
V
 
L
A
 
I
T
 
T
A
 
A
K
 
E
E
 
G
R
 
E
R
 
F
L
 
H
V
 
F
P
 
P
P
 
A
Y
 
P
S
 
R
V
 
V
E
 
D
A
 
V
I
 
V
D
|
D
A
 
T
T
|
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
C
 
A
F
 
F
G
 
V
G
 
G
A
 
G
F
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
T
I
 
L
A
 
S
R
 
R
I
 
A
V
 
N
A
 
C
G
 
W
D
 
D
D
 
H
P
 
A
F
 
L
-
 
L
-
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
S
Y
 
N
A
 
A
N
 
N
V
 
A
C
 
C
A
 
G
A
 
A
L
 
M
S
x
A
T
 
V
T
 
T
G
x
A
Y
 
K
G
|
G
A
 
A
V
 
M
A
 
T
P
 
A
I
 
L
P
 
P
H
 
F
A
 
P
A
 
D
Q
 
Q
V
 
L
E
 
N
E
 
T
I
 
F
L
 
L

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
29% identity, 98% coverage: 5:303/306 of query aligns to 3:296/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
I
 
V
L
 
W
A
 
V
Y
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
M
x
S
V
 
V
E
x
D
F
 
L
N
 
V
Q
 
P
R
 
E
Q
 
K
H
 
Q
D
 
N
T
 
S
R
 
-
M
 
-
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
x
C
F
 
P
G
 
G
G
|
G
D
 
A
T
 
S
S
 
A
N
 
N
F
 
V
C
 
G
I
 
V
A
 
C
A
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
E
S
 
C
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
S
 
G
A
 
C
L
 
L
G
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
D
F
 
A
G
 
G
E
 
R
Q
 
F
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
L
 
V
W
 
F
Q
 
Q
A
 
D
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
S
 
T
H
 
F
V
 
L
A
 
R
R
 
L
D
 
D
A
 
A
N
 
D
A
 
L
A
 
T
T
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
x
L
F
 
I
V
 
V
S
 
-
H
 
-
D
 
-
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
N
H
 
S
F
|
F
D
 
T
Y
|
Y
L
 
L
R
 
V
A
 
H
G
 
P
S
 
G
A
 
A
A
 
D
S
 
T
R
 
Y
Y
 
V
S
 
S
S
 
P
E
 
Q
Q
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
-
A
 
-
A
 
P
I
 
F
A
 
R
A
 
Q
A
 
Y
K
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
T
I
 
-
S
 
D
A
 
R
S
 
P
A
 
A
C
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
M
 
A
A
 
R
Y
 
R
A
 
M
R
 
R
K
 
E
H
 
A
G
 
G
V
 
G
K
 
Y
T
 
V
S
 
L
L
 
F
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
L
 
S
K
 
K
L
x
M
W
 
W
-
 
G
P
 
N
L
 
T
E
 
D
R
 
E
A
 
I
Q
 
P
E
 
E
K
 
L
I
 
I
R
 
A
A
 
R
A
 
S
F
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
A
D
 
S
I
 
I
C
 
C
L
 
K
P
 
V
S
 
S
W
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
L
S
 
C
A
 
Q
L
 
L
T
 
S
S
 
G
L
 
A
D
 
S
D
 
H
R
 
W
D
 
Q
A
 
D
I
 
A
V
 
R
D
 
Y
E
 
Y
L
 
L
L
 
R
S
 
D
Y
 
L
G
 
G
I
 
C
G
 
D
L
 
T
I
 
T
A
 
I
F
 
I
K
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
C
 
A
Y
 
L
V
 
L
A
 
I
T
 
T
A
 
A
K
 
E
E
 
G
R
 
E
R
 
F
L
 
H
V
 
F
P
 
P
P
 
A
Y
 
P
S
 
R
V
 
V
E
 
D
A
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
 
F
G
 
V
G
 
G
A
 
G
F
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
T
I
 
L
A
 
S
R
 
R
I
 
A
V
 
N
A
 
C
G
 
W
D
 
D
D
 
H
P
 
A
F
 
L
-
 
L
-
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
S
Y
 
N
A
 
A
N
 
N
V
 
A
C
 
C
A
 
G
A
 
A
L
 
M
S
 
A
T
 
V
T
 
T
G
 
A
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
A
 
T
P
 
A
I
 
L
P
 
P
H
 
F
A
 
P
A
 
D
Q
 
Q
V
 
L
E
 
N
E
 
T
I
 
F
L
 
L

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
29% identity, 98% coverage: 5:303/306 of query aligns to 3:296/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
I
 
V
L
 
W
A
 
V
Y
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
M
 
S
V
 
V
E
x
D
F
 
L
N
 
V
Q
 
P
R
 
E
Q
 
K
H
 
Q
D
 
N
T
 
S
R
 
-
M
 
-
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
x
C
F
 
P
G
 
G
G
|
G
D
 
A
T
 
S
S
 
A
N
 
N
F
 
V
C
 
G
I
 
V
A
 
C
A
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
E
S
 
C
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
S
 
G
A
 
C
L
 
L
G
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
D
F
 
A
G
 
G
E
 
R
Q
 
F
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
L
 
V
W
 
F
Q
 
Q
A
 
D
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
S
 
T
H
 
F
V
 
L
A
 
R
R
 
L
D
 
D
A
 
A
N
 
D
A
 
L
A
 
T
T
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
-
H
 
-
D
 
-
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
N
H
 
S
F
|
F
D
 
T
Y
|
Y
L
 
L
R
 
V
A
 
H
G
 
P
S
 
G
A
 
A
A
 
D
S
 
T
R
 
Y
Y
 
V
S
 
S
S
 
P
E
 
Q
Q
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
-
A
 
-
A
 
P
I
 
F
A
 
R
A
 
Q
A
 
Y
K
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
T
I
 
-
S
 
D
A
 
R
S
 
P
A
 
A
C
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
M
 
A
A
 
R
Y
 
R
A
 
M
R
 
R
K
 
E
H
 
A
G
 
G
V
 
G
K
 
Y
T
 
V
S
 
L
L
 
F
D
 
D
T
 
V
N
|
N
L
 
L
R
|
R
L
 
S
K
 
K
L
x
M
W
 
W
-
 
G
P
 
N
L
 
T
E
 
D
R
 
E
A
 
I
Q
 
P
E
 
E
K
 
L
I
 
I
R
 
A
A
 
R
A
 
S
F
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
A
D
 
S
I
 
I
C
 
C
L
x
K
P
 
V
S
 
S
W
 
A
D
 
D
D
x
E
I
 
L
S
 
C
A
 
Q
L
 
L
T
 
S
S
 
G
L
 
A
D
 
S
D
 
H
R
 
W
D
 
Q
A
 
D
I
 
A
V
 
R
D
 
Y
E
 
Y
L
 
L
L
 
R
S
 
D
Y
 
L
G
 
G
I
 
C
G
 
D
L
 
T
I
 
T
A
 
I
F
 
I
K
x
S
L
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
D
G
|
G
C
 
A
Y
 
L
V
 
L
A
 
I
T
 
T
A
 
A
K
 
E
E
 
G
R
 
E
R
 
F
L
 
H
V
 
F
P
 
P
P
 
A
Y
 
P
S
 
R
V
 
V
E
 
D
A
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
|
F
G
 
V
G
 
G
A
 
G
F
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
T
I
 
L
A
 
S
R
 
R
I
 
A
V
 
N
A
 
C
G
 
W
D
 
D
D
 
H
P
 
A
F
 
L
-
 
L
-
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
S
Y
 
N
A
 
A
N
|
N
V
 
A
C
 
C
A
x
G
A
|
A
L
 
M
S
 
A
T
 
V
T
 
T
G
 
A
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
A
 
T
P
 
A
I
 
L
P
 
P
H
 
F
A
 
P
A
 
D
Q
 
Q
V
 
L
E
 
N
E
 
T
I
 
F
L
 
L

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
29% identity, 93% coverage: 5:289/306 of query aligns to 2:283/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
I
 
I
L
 
A
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
M
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
L
N
 
I
Q
 
S
R
 
V
Q
 
E
H
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
K
D
 
D
T
 
V
R
 
R
M
 
L
Y
 
F
L
 
E
Q
 
K
G
 
H
F
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
A
T
 
P
S
 
A
N
 
N
F
 
V
C
 
A
I
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
S
G
 
S
Y
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
K
L
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
Y
L
 
L
R
 
I
A
 
E
L
 
E
W
 
L
Q
 
S
A
 
K
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
R
H
 
G
V
 
I
A
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
E
N
 
K
A
 
K
A
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
Q
H
 
L
D
 
K
Q
 
G
D
 
A
G
 
S
H
 
P
H
 
S
F
 
F
D
 
-
Y
 
L
L
 
L
R
 
Y
A
 
D
G
 
D
S
 
V
A
 
A
A
 
Y
S
 
F
R
 
N
Y
 
M
S
 
T
S
 
L
E
 
N
Q
 
D
L
 
I
P
 
N
L
 
W
A
 
D
A
 
I
I
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
V
H
 
N
L
 
F
S
 
G
G
 
S
I
 
V
S
 
I
L
 
L
A
 
A
I
 
R
S
 
N
A
 
P
S
 
S
A
 
R
C
 
E
D
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
T
A
 
V
M
 
M
A
 
K
Y
 
V
A
 
I
R
 
K
K
 
K
H
 
-
G
 
-
V
 
I
K
 
K
T
 
G
S
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
A
L
 
F
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
L
 
L
K
 
D
L
 
L
W
 
W
P
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
E
 
E
K
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
K
-
 
V
I
 
L
R
 
E
A
 
E
A
 
S
F
 
I
A
 
K
L
 
L
C
 
A
D
 
D
I
 
I
C
 
V
L
x
K
P
 
A
S
 
S
W
 
E
D
 
E
D
 
E
I
 
V
S
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
L
S
 
Y
L
 
L
D
 
E
D
 
N
R
 
Q
D
 
G
A
 
V
I
 
E
V
 
V
D
 
K
E
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
G
I
 
S
G
 
M
L
 
L
I
 
T
A
 
A
F
 
I
K
x
T
L
 
L
G
|
G
A
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
F
Y
 
R
V
 
L
A
 
I
T
 
K
A
 
N
K
 
E
E
 
T
R
 
V
R
 
V
L
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
S
Y
 
Y
S
 
N
V
|
V
E
 
N
A
x
P
I
 
L
D
 
D
A
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
 
F
G
 
M
G
 
A
A
 
A
F
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
G
I
 
I
-
 
L
-
 
K
V
 
L
A
 
K
G
 
G
D
 
L
D
 
D
P
 
L
F
 
L
R
 
K
A
 
L
A
 
G
R
 
K
Y
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
L
C
 
V
A
|
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
T
T
 
Q
G
 
K
Y
 
R
G
 
G
A
 
A

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
29% identity, 93% coverage: 5:289/306 of query aligns to 3:284/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
I
 
I
L
 
A
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
M
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
L
N
 
I
Q
 
S
R
 
V
Q
 
E
H
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
K
D
 
D
T
 
V
R
 
R
M
 
L
Y
 
F
L
 
E
Q
 
K
G
 
H
F
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
A
T
 
P
S
 
A
N
 
N
F
 
V
C
 
A
I
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
S
G
 
S
Y
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
K
L
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
Y
L
 
L
R
 
I
A
 
E
L
 
E
W
 
L
Q
 
S
A
 
K
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
R
H
 
G
V
 
I
A
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
E
N
 
K
A
 
K
A
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
Q
H
 
L
D
 
K
Q
 
G
D
 
A
G
 
S
H
 
P
H
 
S
F
 
F
D
 
-
Y
 
L
L
 
L
R
 
Y
A
 
D
G
 
D
S
 
V
A
 
A
A
 
Y
S
 
F
R
 
N
Y
 
M
S
 
T
S
 
L
E
 
N
Q
 
D
L
 
I
P
 
N
L
 
W
A
 
D
A
 
I
I
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
V
H
 
N
L
 
F
S
 
G
G
 
S
I
 
V
S
 
I
L
 
L
A
 
A
I
 
R
S
 
N
A
 
P
S
 
S
A
 
R
C
 
E
D
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
T
A
 
V
M
 
M
A
 
K
Y
 
V
A
 
I
R
 
K
K
 
K
H
 
-
G
 
-
V
 
I
K
 
K
T
 
G
S
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
A
L
 
F
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
L
 
L
K
 
D
L
 
L
W
 
W
P
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
E
 
E
K
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
K
-
 
V
I
 
L
R
 
E
A
 
E
A
 
S
F
 
I
A
 
K
L
 
L
C
 
A
D
 
D
I
 
I
C
 
V
L
 
K
P
 
A
S
 
S
W
 
E
D
 
E
D
 
E
I
 
V
S
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
L
S
 
Y
L
 
L
D
 
E
D
 
N
R
 
Q
D
 
G
A
 
V
I
 
E
V
 
V
D
 
K
E
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
G
I
 
S
G
 
M
L
 
L
I
 
T
A
 
A
F
 
I
K
x
T
L
 
L
G
|
G
A
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
F
Y
 
R
V
 
L
A
 
I
T
 
K
A
 
N
K
 
E
E
 
T
R
 
V
R
 
V
L
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
S
Y
 
Y
S
 
N
V
|
V
E
 
N
A
 
P
I
 
L
D
 
D
A
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
A
F
 
F
G
 
M
G
 
A
A
 
A
F
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
G
I
 
I
-
 
L
-
 
K
V
 
L
A
 
K
G
 
G
D
 
L
D
 
D
P
 
L
F
 
L
R
 
K
A
 
L
A
 
G
R
 
K
Y
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
L
C
 
V
A
|
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
T
T
 
Q
G
 
K
Y
 
R
G
 
G
A
 
A

3in1A Crystal structure of a putative ribokinase in complex with adp from e.Coli
26% identity, 90% coverage: 30:303/306 of query aligns to 39:308/312 of 3in1A

query
sites
3in1A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
A
S
 
I
N
 
N
F
 
E
C
 
A
I
 
T
A
 
I
A
 
I
A
 
S
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
H
R
 
R
S
 
T
G
 
A
Y
 
L
I
 
M
S
 
S
A
 
R
L
 
I
G
 
G
N
 
K
D
 
D
H
 
A
F
 
A
G
 
G
E
 
Q
Q
 
F
L
 
I
R
 
L
A
 
D
L
 
H
W
 
C
Q
 
R
A
 
K
E
 
E
Q
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
I
S
 
Q
H
 
S
V
 
L
A
 
K
R
 
Q
D
 
D
A
 
V
N
 
S
A
 
I
A
 
D
T
 
T
G
 
S
V
 
I
Y
 
N
F
 
V
V
 
G
S
 
L
H
 
V
D
 
T
Q
 
E
D
 
D
G
 
G
H
 
E
H
x
R
F
 
T
D
 
F
Y
 
V
L
 
T
R
 
N
A
 
R
G
 
N
S
 
G
A
 
S
A
 
L
S
 
W
R
 
K
Y
 
L
S
 
N
S
 
I
E
 
D
Q
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
I
 
F
A
 
S
A
 
Q
A
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
H
 
S
L
 
L
S
 
A
G
 
S
I
 
I
-
 
F
-
 
N
S
 
S
L
 
P
A
 
L
I
 
L
S
 
D
A
 
G
S
 
K
A
 
A
C
 
L
D
 
-
A
 
T
G
 
E
L
 
I
A
 
F
A
 
T
M
 
Q
A
 
A
Y
 
K
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
H
 
M
G
 
I
V
 
I
K
 
C
T
 
A
S
 
D
L
 
M
D
 
-
T
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
I
W
 
K
P
 
P
-
 
R
L
 
L
E
 
N
R
 
E
A
 
T
Q
 
L
E
 
D
K
 
D
I
 
I
R
 
C
A
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
S
L
 
Y
C
 
V
D
 
D
I
 
Y
C
 
L
L
 
F
P
 
P
S
x
N
W
 
F
D
 
A
D
 
E
I
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
K
D
 
E
D
 
T
R
 
L
D
 
D
A
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
D
E
 
C
L
 
F
L
 
L
S
 
A
Y
 
C
G
 
G
I
 
V
G
 
K
L
 
T
I
 
V
A
 
V
F
 
I
K
|
K
L
 
T
G
|
G
A
 
K
E
 
D
G
|
G
C
 
C
Y
 
F
V
 
I
A
 
K
T
 
R
A
 
G
K
 
D
E
 
M
R
 
T
R
 
M
L
 
K
V
 
V
P
 
P
P
x
A
Y
 
V
S
 
A
-
 
G
V
 
I
E
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
x
T
T
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
N
F
 
F
G
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
A
R
 
A
I
 
L
V
 
L
A
 
E
G
 
G
D
 
K
D
 
N
P
 
L
F
 
R
R
 
E
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
N
|
N
V
 
A
C
 
T
A
|
A
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
V
T
 
L
G
 
S
Y
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
T
A
 
T
P
 
G
I
 
V
P
 
K
H
 
N
A
 
R
A
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
L
 
L

6a8cA Ribokinase from leishmania donovani with adp (see paper)
24% identity, 97% coverage: 3:299/306 of query aligns to 24:322/327 of 6a8cA

query
sites
6a8cA
I
 
L
D
|
D
I
 
Y
L
 
V
A
 
G
Y
 
Y
G
 
V
E
 
D
A
 
H
M
 
M
V
 
P
E
 
Q
F
 
V
N
 
G
Q
 
E
R
 
T
Q
 
M
H
 
H
D
x
S
T
 
V
R
x
S
M
 
F
Y
 
H
L
 
-
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
|
G
G
|
G
D
 
K
T
 
G
S
 
A
N
|
N
F
 
Q
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
S
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
V
S
 
S
A
 
M
L
 
V
G
 
G
N
 
T
D
 
D
H
 
G
F
 
D
G
 
G
E
 
S
Q
 
D
L
 
Y
R
 
I
A
 
K
L
 
E
W
 
L
Q
 
E
A
 
R
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
A
H
 
Y
V
 
M
A
 
F
R
 
R
D
 
T
A
 
G
N
 
K
A
 
S
A
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
L
Y
 
A
F
 
M
V
 
I
S
 
L
H
 
V
D
 
D
Q
 
T
D
 
K
G
 
S
H
 
S
H
 
N
F
 
N
D
 
E
Y
 
I
L
 
V
R
 
I
A
 
C
G
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
T
S
 
N
R
 
H
Y
 
F
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
L
L
 
L
P
 
R
L
 
A
A
 
Q
A
 
T
I
 
N
A
 
N
A
 
Y
A
 
E
K
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
H
L
 
-
S
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
K
L
 
Y
A
 
L
I
 
I
S
 
C
A
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
I
A
 
P
C
 
L
D
 
P
A
 
T
G
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
T
M
 
I
A
 
K
Y
 
E
A
 
A
R
 
H
K
 
S
H
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
Y
T
 
T
S
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
S
N
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
A
L
 
P
W
 
A
P
 
P
L
 
K
E
 
P
R
 
A
A
 
E
Q
 
V
E
 
E
K
 
Q
I
 
I
R
 
K
A
 
P
A
 
F
F
 
L
A
 
P
L
 
Y
C
 
V
D
 
S
I
 
L
C
 
F
L
 
C
P
 
P
S
 
N
W
 
E
D
 
V
D
 
E
I
 
A
S
 
T
A
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
G
L
 
V
D
 
K
D
 
V
R
 
T
D
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
S
-
 
A
-
 
F
A
 
S
I
 
A
V
 
I
D
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
Q
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
R
L
 
D
I
 
V
A
 
V
F
 
I
K
 
T
L
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
A
G
 
G
C
 
F
Y
 
V
V
 
L
A
 
S
-
 
E
T
 
N
A
 
G
K
 
A
E
 
E
R
 
P
R
 
V
L
 
H
V
 
V
P
 
T
P
 
G
Y
 
K
S
 
H
V
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
x
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
C
 
C
F
 
F
G
 
V
G
 
G
A
 
S
F
 
M
I
 
V
A
 
Y
R
 
F
I
 
M
V
 
S
A
 
R
G
 
G
D
 
R
D
 
N
P
 
L
F
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
C
R
 
K
Y
 
R
A
 
A
N
|
N
V
 
E
C
 
C
A
|
A
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
V
T
 
T
G
 
R
Y
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
Q
A
 
L
P
 
S
I
 
Y
P
 
P
H
 
H
A
 
P
A
 
S
Q
 
E
V
 
L

6a8bA Ribokinase from leishmania donovani with amppcp (see paper)
24% identity, 97% coverage: 3:299/306 of query aligns to 24:322/327 of 6a8bA

query
sites
6a8bA
I
 
L
D
|
D
I
 
Y
L
 
V
A
 
G
Y
 
Y
G
 
V
E
 
D
A
 
H
M
 
M
V
 
P
E
 
Q
F
 
V
N
 
G
Q
 
E
R
 
T
Q
 
M
H
 
H
D
 
S
T
 
V
R
 
S
M
 
F
Y
 
H
L
 
-
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
|
G
G
|
G
D
 
K
T
 
G
S
 
A
N
|
N
F
 
Q
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
S
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
V
S
 
S
A
 
M
L
 
V
G
 
G
N
 
T
D
 
D
H
 
G
F
 
D
G
 
G
E
 
S
Q
 
D
L
 
Y
R
 
I
A
 
K
L
 
E
W
 
L
Q
 
E
A
 
R
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
A
H
 
Y
V
 
M
A
 
F
R
 
R
D
 
T
A
 
G
N
 
K
A
 
S
A
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
L
Y
 
A
F
 
M
V
 
I
S
 
L
H
 
V
D
 
D
Q
 
T
D
 
K
G
 
S
H
 
S
H
 
N
F
 
N
D
 
E
Y
 
I
L
 
V
R
 
I
A
 
C
G
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
T
S
 
N
R
 
H
Y
 
F
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
L
L
 
L
P
 
R
L
 
A
A
 
Q
A
 
T
I
 
N
A
 
N
A
 
Y
A
 
E
K
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
H
L
 
-
S
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
K
L
 
Y
A
 
L
I
 
I
S
 
C
A
 
Q
S
x
N
-
 
E
-
x
I
A
 
P
C
 
L
D
 
P
A
 
T
G
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
T
M
 
I
A
 
K
Y
 
E
A
 
A
R
 
H
K
 
S
H
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
Y
T
 
T
S
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
S
N
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
A
L
 
P
W
 
A
P
 
P
L
 
K
E
 
P
R
 
A
A
x
E
Q
 
V
E
 
E
K
 
Q
I
 
I
R
 
K
A
 
P
A
 
F
F
 
L
A
 
P
L
 
Y
C
 
V
D
 
S
I
 
L
C
 
F
L
 
C
P
 
P
S
 
N
W
 
E
D
 
V
D
 
E
I
 
A
S
 
T
A
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
G
L
 
V
D
 
K
D
 
V
R
 
T
D
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
S
-
 
A
-
 
F
A
 
S
I
 
A
V
 
I
D
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
Q
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
R
L
 
D
I
 
V
A
 
V
F
 
I
K
 
T
L
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
A
G
 
G
C
 
F
Y
 
V
V
 
L
A
 
S
-
 
E
T
 
N
A
 
G
K
 
A
E
 
E
R
 
P
R
 
V
L
 
H
V
 
V
P
 
T
P
 
G
Y
 
K
S
 
H
V
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
x
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
C
 
C
F
 
F
G
 
V
G
 
G
A
 
S
F
 
M
I
 
V
A
 
Y
R
 
F
I
 
M
V
 
S
A
 
R
G
 
G
D
 
R
D
 
N
P
 
L
F
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
C
R
 
K
Y
 
R
A
 
A
N
|
N
V
 
E
C
 
C
A
|
A
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
x
V
T
 
T
G
 
R
Y
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
Q
A
 
L
P
 
S
I
 
Y
P
 
P
H
 
H
A
 
P
A
 
S
Q
 
E
V
 
L

6a8aA Ribokinase from leishmania donovani with atp (see paper)
24% identity, 97% coverage: 3:299/306 of query aligns to 24:322/327 of 6a8aA

query
sites
6a8aA
I
 
L
D
|
D
I
 
Y
L
 
V
A
 
G
Y
 
Y
G
 
V
E
 
D
A
 
H
M
 
M
V
 
P
E
 
Q
F
 
V
N
 
G
Q
 
E
R
 
T
Q
 
M
H
 
H
D
 
S
T
 
V
R
 
S
M
 
F
Y
 
H
L
 
-
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
|
G
G
|
G
D
 
K
T
 
G
S
 
A
N
|
N
F
 
Q
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
S
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
V
S
 
S
A
 
M
L
 
V
G
 
G
N
 
T
D
 
D
H
 
G
F
 
D
G
 
G
E
 
S
Q
 
D
L
 
Y
R
 
I
A
 
K
L
 
E
W
 
L
Q
 
E
A
 
R
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
A
H
 
Y
V
 
M
A
 
F
R
 
R
D
 
T
A
 
G
N
 
K
A
 
S
A
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
L
Y
 
A
F
 
M
V
 
I
S
 
L
H
 
V
D
 
D
Q
 
T
D
 
K
G
 
S
H
 
S
H
 
N
F
 
N
D
 
E
Y
 
I
L
 
V
R
 
I
A
 
C
G
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
T
S
 
N
R
 
H
Y
 
F
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
L
L
 
L
P
 
R
L
 
A
A
 
Q
A
 
T
I
 
N
A
 
N
A
 
Y
A
 
E
K
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
H
L
 
-
S
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
K
L
 
Y
A
 
L
I
 
I
S
 
C
A
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
I
A
 
P
C
 
L
D
 
P
A
 
T
G
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
T
M
 
I
A
 
K
Y
 
E
A
 
A
R
 
H
K
 
S
H
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
Y
T
 
T
S
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
S
N
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
A
L
 
P
W
 
A
P
 
P
L
 
K
E
 
P
R
 
A
A
 
E
Q
 
V
E
 
E
K
 
Q
I
 
I
R
 
K
A
 
P
A
 
F
F
 
L
A
 
P
L
 
Y
C
 
V
D
 
S
I
 
L
C
 
F
L
 
C
P
 
P
S
x
N
W
 
E
D
 
V
D
 
E
I
 
A
S
 
T
A
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
G
L
 
V
D
 
K
D
 
V
R
 
T
D
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
S
-
 
A
-
 
F
A
 
S
I
 
A
V
 
I
D
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
Q
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
R
L
 
D
I
 
V
A
 
V
F
 
I
K
x
T
L
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
A
G
|
G
C
 
F
Y
 
V
V
 
L
A
 
S
-
 
E
T
 
N
A
 
G
K
 
A
E
 
E
R
 
P
R
 
V
L
 
H
V
 
V
P
 
T
P
 
G
Y
 
K
S
 
H
V
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
x
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
C
 
C
F
 
F
G
 
V
G
 
G
A
 
S
F
 
M
I
 
V
A
 
Y
R
 
F
I
 
M
V
 
S
A
 
R
G
 
G
D
 
R
D
 
N
P
 
L
F
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
C
R
 
K
Y
 
R
A
 
A
N
|
N
V
 
E
C
 
C
A
|
A
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
x
V
T
 
T
G
 
R
Y
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
Q
A
 
L
P
 
S
I
 
Y
P
 
P
H
 
H
A
 
P
A
 
S
Q
 
E
V
 
L

4xckA Vibrio cholerae o395 ribokinase complexed with adp, ribose and cesium ion. (see paper)
28% identity, 92% coverage: 23:303/306 of query aligns to 31:302/306 of 4xckA

query
sites
4xckA
R
 
R
M
 
N
Y
 
Y
L
 
Q
Q
 
V
G
 
I
F
 
P
G
 
G
G
|
G
D
x
K
T
 
G
S
 
A
N
|
N
F
 
Q
C
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
M
G
 
Q
A
 
A
R
 
D
S
 
V
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
S
 
A
A
 
C
L
 
V
G
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
S
F
 
F
G
 
G
E
 
I
Q
 
N
L
 
I
R
 
R
A
 
E
L
 
S
W
 
F
Q
 
K
A
 
L
E
 
D
Q
 
G
V
 
I
D
 
N
A
 
T
S
 
A
H
 
G
V
 
V
A
 
K
R
 
L
D
 
Q
A
 
P
N
 
N
A
 
C
A
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
x
A
F
 
M
V
 
I
S
 
Q
H
 
V
D
 
S
Q
 
D
D
 
S
G
 
G
H
 
E
H
 
N
F
 
S
D
x
I
Y
 
C
L
x
I
R
 
S
A
 
A
G
 
E
S
 
A
A
 
N
A
 
A
S
 
K
R
 
L
Y
 
T
S
 
A
S
 
A
E
 
A
Q
 
I
L
 
E
P
 
P
-
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
R
A
 
D
A
 
A
K
 
R
V
 
Y
L
 
L
H
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
L
A
 
M
I
 
Q
S
 
L
A
x
E
S
 
T
A
 
P
C
 
L
D
 
D
A
 
G
G
 
I
L
 
L
A
 
K
A
 
A
M
 
A
A
 
Q
Y
 
E
A
 
A
R
 
K
K
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
S
 
T
L
 
A
D
 
K
T
 
T
N
 
N
L
 
V
R
 
I
L
 
L
K
 
N
L
 
P
W
 
A
P
 
P
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
K
 
L
I
 
P
R
 
D
A
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
K
L
 
C
C
 
V
D
 
D
I
 
L
C
 
I
L
 
T
P
 
P
S
 
N
W
 
E
D
 
T
D
 
E
I
 
A
S
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
I
-
 
T
-
 
V
-
 
Y
D
 
D
D
 
D
R
 
S
D
 
S
A
 
A
-
 
Q
-
 
Q
I
 
A
V
 
A
D
 
D
E
 
A
L
 
L
L
 
H
S
 
C
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
I
F
 
I
K
x
T
L
 
L
G
|
G
A
x
S
E
 
K
G
 
G
C
 
V
Y
 
W
V
 
L
A
 
S
T
 
Q
A
 
N
K
 
G
E
 
R
R
 
G
R
 
Q
L
 
R
V
 
I
P
 
P
P
 
G
Y
 
F
S
 
V
V
|
V
E
 
K
A
 
A
I
 
T
D
 
D
A
x
T
T
|
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
T
F
|
F
G
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
L
I
 
V
A
 
T
R
 
G
I
 
L
V
 
L
A
 
Q
G
 
-
D
 
E
D
 
M
P
 
P
F
 
L
R
 
E
A
 
S
A
 
A
-
 
I
R
 
K
Y
 
F
A
 
A
N
x
H
V
 
A
C
 
A
A
|
A
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
x
V
T
 
T
G
 
R
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
A
 
T
P
 
S
I
 
I
P
 
P
H
 
T
A
 
R
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4ebuA Crystal structure of a sugar kinase (target efi-502312) from oceanicola granulosus, with bound amp/adp crystal form i
31% identity, 86% coverage: 3:266/306 of query aligns to 15:279/306 of 4ebuA

query
sites
4ebuA
I
 
M
D
 
H
I
 
I
L
 
L
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
C
M
 
M
V
 
A
E
 
E
F
 
L
N
 
A
Q
 
P
R
 
A
Q
 
D
H
 
L
D
 
P
T
 
G
R
 
-
M
 
T
Y
 
Y
L
 
R
Q
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
T
S
 
F
N
 
N
-
 
T
-
 
A
F
 
W
C
 
Y
I
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
L
R
 
R
Q
 
P
G
 
E
A
 
S
R
 
R
S
 
I
G
 
S
Y
 
Y
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
I
G
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
A
F
 
L
G
 
S
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
M
R
 
R
A
 
A
L
 
A
W
 
M
Q
 
S
A
 
A
E
 
A
Q
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
S
 
G
H
 
G
V
 
L
A
 
R
R
 
V
D
 
I
A
 
P
N
 
G
A
 
R
A
 
T
T
 
V
G
 
G
V
 
L
Y
 
Y
F
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
L
D
 
-
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
R
H
 
S
F
 
F
D
 
A
Y
 
Y
L
 
W
R
 
R
A
 
G
G
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
R
R
 
E
Y
 
L
-
 
A
S
 
G
S
 
D
E
 
A
Q
 
D
L
 
A
P
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
A
A
 
R
A
 
A
K
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
L
A
 
D
S
 
Q
A
 
C
C
 
G
D
 
R
A
 
A
G
 
T
L
 
L
A
 
L
-
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
Y
 
Q
A
 
A
R
 
R
K
 
A
H
 
T
G
 
G
V
 
R
K
 
T
T
 
I
S
 
A
L
 
F
D
 
D
T
 
P
N
 
N
L
 
L
R
 
R
L
 
P
K
 
R
L
 
L
W
 
W
P
 
A
-
 
G
L
 
T
E
 
G
R
 
E
A
 
M
Q
 
T
E
 
E
K
 
T
I
 
I
R
 
M
A
 
Q
A
 
G
F
 
A
A
 
A
L
 
V
C
 
S
D
 
D
I
 
I
C
 
A
L
 
L
P
 
P
S
|
S
W
 
F
D
 
E
D
 
D
I
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
W
T
 
F
S
 
G
L
 
D
D
 
A
D
 
G
R
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
T
V
 
A
D
 
D
E
 
R
L
 
Y
L
 
A
S
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
R
L
 
S
I
 
V
A
 
V
F
 
V
K
|
K
L
 
N
G
|
G
A
 
P
E
 
H
G
 
A
C
 
V
-
 
H
Y
 
F
V
 
L
A
 
Q
T
 
D
A
 
G
K
 
R
E
 
R
R
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
P
P
 
V
P
 
P
Y
 
P
S
x
V
V
 
A
E
 
Q
A
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
|
F
G
 
N
G
 
A
A
 
G
F
 
L
I
 
L
A
 
D
R
 
S
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_061942382.1 NCBI__GCF_001584185.1:WP_061942382.1
MTIDILAYGEAMVEFNQRQHDTRMYLQGFGGDTSNFCIAAARQGARSGYISALGNDHFGE
QLRALWQAEQVDASHVARDANAATGVYFVSHDQDGHHFDYLRAGSAASRYSSEQLPLAAI
AAAKVLHLSGISLAISASACDAGLAAMAYARKHGVKTSLDTNLRLKLWPLERAQEKIRAA
FALCDICLPSWDDISALTSLDDRDAIVDELLSYGIGLIAFKLGAEGCYVATAKERRLVPP
YSVEAIDATGAGDCFGGAFIARIVAGDDPFRAARYANVCAALSTTGYGAVAPIPHAAQVE
EILPRA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory