SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_064574663.1 NCBI__GCF_001655005.1:WP_064574663.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

P32170 L-rhamnose isomerase; RhamIso; EC 5.3.1.14 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
85% identity, 100% coverage: 1:418/418 of query aligns to 1:418/419 of P32170

query
sites
P32170
M
 
M
T
 
T
T
 
T
L
 
Q
I
 
L
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
S
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
Q
M
 
L
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
M
 
M
H
 
H
C
 
C
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
G
F
 
F
E
 
E
N
 
N
P
 
P
E
 
E
G
 
G
S
 
S
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
M
 
Q
A
 
A
L
 
M
S
 
R
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
K
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
H
|
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
S
D
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
S
R
 
R
N
 
D
K
 
Q
I
 
I
E
 
K
P
 
P
R
 
E
H
 
H
F
 
F
A
 
K
H
 
N
W
 
W
V
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
A
H
 
N
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
S
C
 
C
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
H
S
 
A
D
 
D
P
 
D
E
 
S
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
D
H
 
H
C
 
C
Q
 
K
A
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
V
 
V
M
 
M
N
 
N
I
 
I
W
 
W
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
I
P
 
T
I
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
H
 
H
H
 
H
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
E
|
E
S
|
S
K
|
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
|
D
A
 
A
G
 
G
H
|
H
F
 
F
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
D
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
S
E
 
E
I
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
H
D
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
 
F
D
 
D
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
M
K
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
A
H
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
W
 
W
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
C
 
C
Q
 
Q
R
 
R
N
 
H
D
 
D
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
G
A
 
S
R
 
E
W
 
W
L
 
L
N
 
E
A
 
S
V
 
V
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
R
 
R

1de5A L-rhamnose isomerase (see paper)
85% identity, 100% coverage: 2:418/418 of query aligns to 1:417/417 of 1de5A

query
sites
1de5A
T
 
T
T
 
T
L
 
Q
I
 
L
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
S
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
Q
M
 
L
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
M
 
M
H
 
H
C
 
C
W
|
W
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
G
F
 
F
E
 
E
N
 
N
P
 
P
E
 
E
G
 
G
S
 
S
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
|
I
Q
 
Q
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
M
 
Q
A
 
A
L
 
M
S
 
R
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
K
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
H
|
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
S
D
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
S
R
 
R
N
 
D
K
 
Q
I
 
I
E
 
K
P
 
P
R
 
E
H
 
H
F
 
F
A
 
K
H
 
N
W
 
W
V
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
A
H
 
N
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
S
C
 
C
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
H
S
 
A
D
 
D
P
 
D
E
 
S
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
D
H
 
H
C
 
C
Q
 
K
A
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
V
 
V
M
 
M
N
 
N
I
 
I
W
|
W
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
I
P
 
T
I
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
H
 
H
H
 
H
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
E
|
E
S
 
S
K
|
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
|
D
A
 
A
G
 
G
H
|
H
F
 
F
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
D
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
S
E
 
E
I
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
H
D
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
 
F
D
 
D
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
M
K
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
A
H
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
W
 
W
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
C
 
C
Q
 
Q
R
 
R
N
 
H
D
 
D
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
G
A
 
S
R
 
E
W
 
W
L
 
L
N
 
E
A
 
S
V
 
V
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
R
 
R

1de6A L-rhamnose isomerase (see paper)
85% identity, 100% coverage: 3:418/418 of query aligns to 1:416/416 of 1de6A

query
sites
1de6A
T
 
T
L
 
Q
I
 
L
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
S
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
Q
M
 
L
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
M
 
M
H
 
H
C
 
C
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
G
F
 
F
E
 
E
N
 
N
P
 
P
E
 
E
G
 
G
S
 
S
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
|
I
Q
 
Q
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
M
 
Q
A
 
A
L
 
M
S
 
R
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
K
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
H
 
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
S
D
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
S
R
 
R
N
 
D
K
 
Q
I
 
I
E
 
K
P
 
P
R
 
E
H
 
H
F
 
F
A
 
K
H
 
N
W
 
W
V
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
A
H
 
N
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
S
C
 
C
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
H
S
 
A
D
 
D
P
 
D
E
 
S
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
D
H
 
H
C
 
C
Q
 
K
A
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
R
I
 
V
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
V
 
V
M
 
M
N
 
N
I
 
I
W
|
W
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
I
P
 
T
I
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
H
 
H
H
 
H
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
E
|
E
S
 
S
K
|
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
|
D
A
 
A
G
 
G
H
|
H
F
 
F
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
D
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
S
E
 
E
I
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
H
D
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
|
F
D
 
D
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
M
K
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
A
H
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
W
 
W
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
C
 
C
Q
 
Q
R
 
R
N
 
H
D
 
D
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
G
A
 
S
R
 
E
W
 
W
L
 
L
N
 
E
A
 
S
V
 
V
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
R
 
R

3uvaC Crystal structure of l-rhamnose isomerase mutant w38f from bacillus halodurans in complex with mn (see paper)
59% identity, 98% coverage: 9:418/418 of query aligns to 6:405/405 of 3uvaC

query
sites
3uvaC
W
 
F
E
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
K
Q
 
I
R
 
E
F
 
Y
S
 
G
A
 
Q
V
 
W
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
E
T
 
R
M
 
L
E
 
K
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
V
 
I
S
 
S
M
 
I
H
 
H
C
 
C
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
N
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
L
T
 
S
G
 
G
N
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
R
 
T
N
 
T
A
 
P
A
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
M
D
 
D
L
 
L
E
 
E
M
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
K
K
 
H
R
 
R
L
 
V
N
 
N
L
 
L
H
 
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
A
E
 
E
S
 
T
D
 
D
T
 
G
P
 
K
V
 
V
A
 
V
-
 
E
R
 
R
N
 
D
K
 
Q
I
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
H
 
H
F
 
F
A
 
E
H
 
K
W
 
W
V
 
V
E
 
R
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
R
H
 
H
H
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
T
C
 
L
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
E
L
 
K
S
 
A
A
 
K
D
 
D
G
 
G
F
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
H
S
 
P
D
 
D
P
 
Q
E
 
A
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
D
H
 
H
C
 
C
Q
 
I
A
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
K
I
 
I
S
 
G
A
 
E
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
E
T
 
T
P
 
P
S
 
C
V
 
L
M
 
T
N
 
N
I
 
I
W
|
W
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
Y
K
 
K
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
K
S
 
E
A
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
V
 
I
I
 
F
S
 
A
E
 
A
K
 
E
L
 
I
N
 
N
P
 
E
A
 
A
H
 
Y
H
 
N
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
E
|
E
S
 
S
K
|
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
S
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
N
 
H
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
S
 
K
R
 
N
Q
 
D
T
 
K
A
 
L
L
 
C
C
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
T
G
 
G
H
|
H
F
 
Y
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
T
I
 
V
S
 
S
D
 
N
K
 
K
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
 
F
V
 
H
P
 
D
R
 
K
L
 
L
L
 
A
L
 
L
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
T
L
 
F
D
 
D
D
 
D
E
 
E
T
 
L
Q
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
L
E
 
E
I
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
N
D
 
D
L
 
A
F
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
 
F
D
 
D
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
V
K
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
F
A
 
A
L
 
M
L
 
L
E
 
I
P
 
P
T
 
H
E
 
K
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
W
E
 
Q
E
 
E
S
 
T
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
Q
 
F
K
 
K
S
 
T
L
 
Y
P
 
P
W
 
L
Q
 
G
A
 
A
V
 
I
W
 
W
E
 
N
M
 
E
Y
 
Y
C
 
C
Q
 
E
R
 
R
N
 
M
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
I
D
 
K
A
 
E
R
 
E
W
 
W
L
 
L
N
 
K
A
 
E
V
 
I
R
 
A
E
 
I
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
L
Q
 
Q
R
 
R

8jq5B Crystal structure of lactobacillus rhamnosus l-rhamnose isomerase in complex with d-allulose (see paper)
51% identity, 99% coverage: 5:418/418 of query aligns to 7:420/421 of 8jq5B

query
sites
8jq5B
I
 
V
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
W
 
Y
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
F
 
Y
S
 
A
A
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
T
E
 
D
N
 
A
A
 
A
L
 
M
K
 
K
T
 
E
M
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
S
M
 
V
H
 
H
C
 
C
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
H
G
 
G
F
 
F
E
 
L
N
 
F
P
 
P
E
 
N
G
 
Q
S
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
|
I
Q
 
G
A
 
V
T
 
S
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
T
A
 
P
A
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
A
S
 
G
D
 
D
L
 
M
E
 
H
M
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
K
K
 
H
R
 
R
L
 
V
N
 
Q
L
 
L
H
|
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
A
E
 
V
S
 
T
D
 
D
T
 
K
P
 
K
V
 
R
A
 
D
R
 
L
N
 
D
K
 
T
I
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
E
H
 
D
F
 
F
A
 
D
H
 
Y
W
 
W
V
 
I
E
 
D
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
H
 
E
H
 
G
L
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
G
S
 
T
C
 
F
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
M
S
 
V
A
 
K
D
 
D
G
 
N
F
 
M
T
 
T
L
 
V
S
 
S
S
 
S
S
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
D
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
R
H
 
H
C
 
G
Q
 
K
A
 
I
S
 
S
R
 
R
R
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
N
Y
 
Y
F
 
I
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
Q
S
 
V
V
 
V
M
 
N
N
 
N
I
 
F
W
|
W
I
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
F
K
 
K
D
 
D
T
 
N
P
 
P
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
K
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Q
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
L
S
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
S
 
K
E
 
D
K
 
P
L
 
L
N
 
P
P
 
E
A
 
K
H
 
N
H
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
F
E
|
E
S
 
G
K
|
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
I
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
T
G
 
G
S
 
S
N
 
H
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
T
 
K
A
 
L
L
 
W
C
 
T
L
 
I
D
|
D
A
 
A
G
 
G
H
|
H
F
 
F
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
V
S
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
F
S
 
S
S
 
A
A
 
F
M
 
F
L
 
P
Y
 
F
V
 
G
P
 
K
R
 
G
L
 
L
L
 
F
L
 
M
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
D
D
 
D
E
 
A
T
 
L
Q
 
I
A
 
R
I
 
I
A
 
T
N
 
R
E
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
R
H
 
D
D
 
G
L
 
Y
F
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
|
F
D
 
D
A
 
A
S
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
R
N
 
A
M
 
T
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
L
 
L
E
 
A
P
 
P
T
 
I
E
 
D
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
D
E
 
E
E
 
L
S
 
N
G
 
A
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
A
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
F
P
 
P
W
 
F
Q
 
G
A
 
A
V
 
V
W
 
W
E
 
D
M
 
K
Y
 
F
C
 
C
Q
 
Q
R
 
D
N
 
H
D
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
G
A
 
F
R
 
D
W
 
W
L
 
M
N
 
N
A
 
N
V
 
I
R
 
H
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
D
V
 
V
L
 
Q
S
 
F
Q
 
K
R
 
R

8jq5A Crystal structure of lactobacillus rhamnosus l-rhamnose isomerase in complex with d-allulose (see paper)
51% identity, 99% coverage: 5:418/418 of query aligns to 7:420/420 of 8jq5A

query
sites
8jq5A
I
 
V
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
W
 
Y
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
F
 
Y
S
 
A
A
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
T
E
 
D
N
 
A
A
 
A
L
 
M
K
 
K
T
 
E
M
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
S
M
 
V
H
 
H
C
 
C
W
|
W
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
H
G
 
G
F
 
F
E
 
L
N
 
F
P
 
P
E
 
N
G
 
Q
S
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
|
I
Q
 
G
A
 
V
T
 
S
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
T
A
 
P
A
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
A
S
 
G
D
 
D
L
 
M
E
 
H
M
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
K
K
 
H
R
 
R
L
 
V
N
 
Q
L
 
L
H
|
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
A
E
 
V
S
 
T
D
 
D
T
 
K
P
 
K
V
 
R
A
 
D
R
 
L
N
 
D
K
 
T
I
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
E
H
 
D
F
 
F
A
 
D
H
 
Y
W
 
W
V
 
I
E
 
D
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
H
 
E
H
 
G
L
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
G
S
 
T
C
 
F
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
M
S
 
V
A
 
K
D
 
D
G
 
N
F
 
M
T
 
T
L
 
V
S
 
S
S
 
S
S
 
P
D
|
D
P
 
P
E
x
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
D
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
R
H
 
H
C
 
G
Q
 
K
A
 
I
S
 
S
R
 
R
R
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
N
Y
 
Y
F
 
I
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
Q
S
 
V
V
 
V
M
 
N
N
 
N
I
 
F
W
|
W
I
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
F
K
 
K
D
 
D
T
 
N
P
 
P
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
K
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Q
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
L
S
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
S
 
K
E
 
D
K
 
P
L
 
L
N
 
P
P
 
E
A
 
K
H
 
N
H
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
F
E
|
E
S
 
G
K
|
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
I
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
T
G
 
G
S
 
S
N
 
H
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
T
 
K
A
 
L
L
 
W
C
 
T
L
 
I
D
|
D
A
 
A
G
 
G
H
|
H
F
 
F
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
V
S
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
F
S
 
S
S
 
A
A
 
F
M
 
F
L
 
P
Y
 
F
V
 
G
P
 
K
R
 
G
L
 
L
L
 
F
L
 
M
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
D
D
 
D
E
 
A
T
 
L
Q
 
I
A
 
R
I
 
I
A
 
T
N
 
R
E
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
R
H
 
D
D
 
G
L
 
Y
F
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
|
F
D
 
D
A
 
A
S
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
R
N
 
A
M
 
T
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
L
 
L
E
 
A
P
 
P
T
 
I
E
 
D
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
D
E
 
E
E
 
L
S
 
N
G
 
A
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
A
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
F
P
 
P
W
 
F
Q
 
G
A
 
A
V
 
V
W
 
W
E
 
D
M
 
K
Y
 
F
C
 
C
Q
 
Q
R
 
D
N
 
H
D
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
G
A
 
F
R
 
D
W
 
W
L
 
M
N
 
N
A
 
N
V
 
I
R
 
H
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
D
V
 
V
L
 
Q
S
 
F
Q
 
K
R
 
R

8jq6C Crystal structure of lactobacillus rhamnosus l-rhamnose isomerase in complex with d-allose (see paper)
50% identity, 99% coverage: 5:418/418 of query aligns to 7:409/409 of 8jq6C

query
sites
8jq6C
I
 
V
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
W
 
Y
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
F
 
Y
S
 
A
A
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
T
E
 
D
N
 
A
A
 
A
L
 
M
K
 
K
T
 
E
M
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
S
M
 
V
H
 
H
C
 
C
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
H
G
 
G
F
 
F
E
 
L
N
 
F
P
 
P
E
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
T
A
 
P
A
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
A
S
 
G
D
 
D
L
 
M
E
 
H
M
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
K
K
 
H
R
 
R
L
 
V
N
 
Q
L
 
L
H
|
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
A
E
 
V
S
 
T
D
 
D
T
 
K
P
 
K
V
 
R
A
 
D
R
 
L
N
 
D
K
 
T
I
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
E
H
 
D
F
 
F
A
 
D
H
 
Y
W
 
W
V
 
I
E
 
D
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
H
 
E
H
 
G
L
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
G
S
 
T
C
 
F
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
M
S
 
V
A
 
K
D
 
D
G
 
N
F
 
M
T
 
T
L
 
V
S
 
S
S
 
S
S
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
D
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
R
H
 
H
C
 
G
Q
 
K
A
 
I
S
 
S
R
 
R
R
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
N
Y
 
Y
F
 
I
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
Q
S
 
V
V
 
V
M
 
N
N
 
N
I
 
F
W
|
W
I
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
F
K
 
K
D
 
D
T
 
N
P
 
P
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
K
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Q
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
L
S
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
S
 
K
E
 
D
K
 
P
L
 
L
N
 
P
P
 
E
A
 
K
H
 
N
H
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
F
E
|
E
S
 
G
K
|
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
I
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
T
G
 
G
S
 
S
N
 
H
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
T
 
K
A
 
L
L
 
W
C
 
T
L
 
I
D
|
D
A
 
A
G
 
G
H
|
H
F
 
F
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
V
S
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
F
S
 
S
S
 
A
A
 
F
M
 
F
L
 
P
Y
 
F
V
 
G
P
 
K
R
 
G
L
 
L
L
 
F
L
 
M
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
D
D
 
D
E
 
A
T
 
L
Q
 
I
A
 
R
I
 
I
A
 
T
N
 
R
E
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
R
H
 
D
D
 
G
L
 
Y
F
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
 
F
D
 
D
A
 
A
S
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
R
N
 
A
M
 
T
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
L
 
L
E
 
A
P
 
P
T
 
I
E
 
D
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
D
E
 
E
E
 
L
S
 
N
G
 
A
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
A
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
F
P
 
P
W
 
F
Q
 
G
A
 
A
V
 
V
W
 
W
E
 
D
M
 
K
Y
 
F
C
 
C
Q
 
Q
R
 
D
N
 
H
D
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
G
A
 
F
R
 
D
W
 
W
L
 
M
N
 
N
A
 
N
V
 
I
R
 
H
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
D
V
 
V
L
 
Q
S
 
F
Q
 
K
R
 
R

8jq6A Crystal structure of lactobacillus rhamnosus l-rhamnose isomerase in complex with d-allose (see paper)
50% identity, 99% coverage: 5:418/418 of query aligns to 7:409/409 of 8jq6A

query
sites
8jq6A
I
 
V
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
W
 
Y
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
F
 
Y
S
 
A
A
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
T
E
 
D
N
 
A
A
 
A
L
 
M
K
 
K
T
 
E
M
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
S
M
 
V
H
 
H
C
 
C
W
|
W
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
H
G
 
G
F
 
F
E
 
L
N
 
F
P
 
P
E
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
T
A
 
P
A
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
A
S
 
G
D
 
D
L
 
M
E
 
H
M
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
K
K
 
H
R
 
R
L
 
V
N
 
Q
L
 
L
H
|
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
A
E
 
V
S
 
T
D
 
D
T
 
K
P
 
K
V
 
R
A
 
D
R
 
L
N
 
D
K
 
T
I
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
E
H
 
D
F
 
F
A
 
D
H
 
Y
W
 
W
V
 
I
E
 
D
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
H
 
E
H
 
G
L
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
G
S
 
T
C
 
F
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
M
S
 
V
A
 
K
D
 
D
G
 
N
F
 
M
T
 
T
L
 
V
S
 
S
S
 
S
S
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
D
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
R
H
 
H
C
 
G
Q
 
K
A
 
I
S
 
S
R
 
R
R
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
N
Y
 
Y
F
 
I
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
Q
S
 
V
V
 
V
M
 
N
N
 
N
I
 
F
W
|
W
I
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
F
K
 
K
D
 
D
T
 
N
P
 
P
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
K
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Q
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
L
S
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
S
 
K
E
 
D
K
 
P
L
 
L
N
 
P
P
 
E
A
 
K
H
 
N
H
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
F
E
|
E
S
 
G
K
|
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
I
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
T
G
 
G
S
 
S
N
 
H
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
T
 
K
A
 
L
L
 
W
C
 
T
L
 
I
D
|
D
A
 
A
G
 
G
H
|
H
F
 
F
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
V
S
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
F
S
 
S
S
 
A
A
 
F
M
 
F
L
 
P
Y
 
F
V
 
G
P
 
K
R
 
G
L
 
L
L
 
F
L
 
M
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
D
D
 
D
E
 
A
T
 
L
Q
 
I
A
 
R
I
 
I
A
 
T
N
 
R
E
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
R
H
 
D
D
 
G
L
 
Y
F
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
 
F
D
 
D
A
 
A
S
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
R
N
 
A
M
 
T
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
L
 
L
E
 
A
P
 
P
T
 
I
E
 
D
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
D
E
 
E
E
 
L
S
 
N
G
 
A
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
A
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
F
P
 
P
W
 
F
Q
 
G
A
 
A
V
 
V
W
 
W
E
 
D
M
 
K
Y
 
F
C
 
C
Q
 
Q
R
 
D
N
 
H
D
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
G
A
 
F
R
x
D
W
 
W
L
x
M
N
|
N
A
 
N
V
 
I
R
 
H
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
D
V
 
V
L
 
Q
S
 
F
Q
 
K
R
 
R

8jq4A Crystal structure of lactobacillus rhamnosus l-rhamnose isomerase in complex with l-rhamnose (see paper)
50% identity, 99% coverage: 5:418/418 of query aligns to 7:408/408 of 8jq4A

query
sites
8jq4A
I
 
V
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
W
 
Y
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
F
 
Y
S
 
A
A
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
T
E
 
D
N
 
A
A
 
A
L
 
M
K
 
K
T
 
E
M
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
S
M
 
V
H
 
H
C
 
C
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
H
G
 
G
F
 
F
E
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
L
T
 
F
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
T
A
 
P
A
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
A
S
 
G
D
 
D
L
 
M
E
 
H
M
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
K
K
 
H
R
 
R
L
 
V
N
 
Q
L
 
L
H
|
H
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
A
E
 
V
S
 
T
D
 
D
T
 
K
P
 
K
V
 
R
A
 
D
R
 
L
N
 
D
K
 
T
I
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
E
H
 
D
F
 
F
A
x
D
H
 
Y
W
 
W
V
 
I
E
x
D
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
H
 
E
H
 
G
L
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
N
 
N
P
 
G
S
 
T
C
 
F
F
 
F
S
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
M
S
 
V
A
 
K
D
 
D
G
 
N
F
 
M
T
 
T
L
 
V
S
 
S
S
 
S
S
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
D
F
 
F
W
 
W
I
 
I
E
 
R
H
 
H
C
 
G
Q
 
K
A
 
I
S
 
S
R
 
R
R
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
N
Y
 
Y
F
 
I
G
 
G
E
 
E
Q
x
K
L
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
Q
S
 
V
V
 
V
M
 
N
N
 
N
I
 
F
W
|
W
I
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
M
 
F
K
 
K
D
 
D
T
 
N
P
 
P
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
K
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Q
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
L
S
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
S
 
K
E
 
D
K
 
P
L
 
L
N
 
P
P
 
E
A
 
K
H
 
N
H
 
T
I
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
F
E
|
E
S
 
G
K
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
I
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
T
G
 
G
S
 
S
N
 
H
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
T
 
K
A
 
L
L
 
W
C
 
T
L
 
I
D
|
D
A
 
A
G
 
G
H
|
H
F
 
F
H
 
H
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
V
S
 
S
D
 
D
K
 
K
I
 
F
S
 
S
S
 
A
A
 
F
M
 
F
L
 
P
Y
 
F
V
 
G
P
 
K
R
 
G
L
 
L
L
 
F
L
 
M
H
|
H
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
R
 
R
W
 
W
D
|
D
S
 
S
D
|
D
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
D
D
 
D
E
 
A
T
 
L
Q
 
I
A
 
R
I
 
I
A
 
T
N
 
R
E
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
R
H
 
D
D
 
G
L
 
Y
F
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
H
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
F
 
F
F
 
F
D
 
D
A
 
A
S
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
W
 
W
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
R
N
 
A
M
 
T
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
L
 
L
E
 
A
P
 
P
T
 
I
E
 
D
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
D
E
 
E
E
 
L
S
 
N
G
 
A
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
A
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
F
P
 
P
W
 
F
Q
 
G
A
 
A
V
 
V
W
 
W
E
 
D
M
 
K
Y
 
F
C
 
C
Q
 
Q
R
 
D
N
 
H
D
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
G
A
 
F
R
 
D
W
 
W
L
 
M
N
 
N
A
 
N
V
 
I
R
 
H
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
E
 
K
Q
 
D
V
 
V
L
 
Q
S
 
F
Q
 
K
R
 
R

Query Sequence

>WP_064574663.1 NCBI__GCF_001655005.1:WP_064574663.1
MTTLIDQAWELAKQRFSAVGVDVENALKTMEQLPVSMHCWQGDDVAGFENPEGSLTGGIQ
ATGNYPGKARNAAELRSDLEMALSLIPGPKRLNLHAIYLESDTPVARNKIEPRHFAHWVE
WAKKHHLGLDFNPSCFSHPLSADGFTLSSSDPEIRQFWIEHCQASRRISAYFGEQLGTPS
VMNIWIPDGMKDTPIDRLAPRQRLASALDEVISEKLNPAHHIDAVESKLFGIGAESYTVG
SNEFYLGYAASRQTALCLDAGHFHPTEVISDKISSAMLYVPRLLLHVSRPVRWDSDHVVL
LDDETQAIANEIVRHDLFDRVHIGLDFFDASINRIAAWVIGTRNMKKALLRALLEPTEHL
RELEESGDYTARLALLEEQKSLPWQAVWEMYCQRNDVPADARWLNAVREYEEQVLSQR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory