SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_066328927.1 NCBI__GCF_900100165.1:WP_066328927.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ey5B Lbcats
62% identity, 96% coverage: 9:386/393 of query aligns to 1:380/383 of 5ey5B

query
sites
5ey5B
G
 
G
Y
 
R
Y
 
F
G
 
G
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
R
I
 
A
M
 
K
A
 
N
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
E
F
 
L
D
 
E
Q
 
Y
L
 
Y
L
 
L
K
 
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
K
 
E
R
 
N
L
 
L
S
 
T
E
 
K
K
 
D
Y
 
L
N
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
A
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
K
R
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
C
 
A
A
 
A
L
 
M
M
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
E
C
 
C
I
 
V
V
 
V
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
R
 
R
P
 
P
A
 
V
L
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
V
N
 
T
N
 
N
P
 
V
V
 
E
D
 
D
T
 
T
H
 
F
Y
 
Y
I
 
I
I
 
I
G
 
G
S
|
S
A
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
M
M
 
M
V
 
V
T
 
R
R
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
A
K
 
R
W
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
H
H
 
P
F
 
F
L
 
I
H
 
D
E
 
D
P
 
E
E
 
S
V
 
V
G
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
K
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
L
K
 
S
L
 
A
G
 
G
K
 
R
V
 
P
G
 
G
I
 
V
I
 
L
H
 
H
G
 
G
C
 
A
K
 
M
T
 
T
L
 
Y
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
I
E
 
E
P
 
A
Y
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
E
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
Q
E
 
L
L
 
L
C
 
S
K
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
V
 
Y
L
 
A
N
 
-
D
 
-
K
 
M
K
 
K
F
 
L
K
 
A
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
D
D
 
Q
V
 
I
V
 
I
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
V
N
 
N
N
 
T

8vhhA Engineered holo tryptophan synthase (tm9d8 ) Derived from t. Maritima trpb (see paper)
59% identity, 97% coverage: 8:390/393 of query aligns to 1:380/389 of 8vhhA

query
sites
8vhhA
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
G
N
 
A
V
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
G
I
 
I
M
 
M
A
 
K
E
 
D
P
 
E
D
 
S
F
 
F
K
 
W
A
 
K
E
 
E
F
 
F
D
 
N
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
N
 
G
T
 
A
K
 
R
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
A
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
F
G
 
G
L
 
M
E
 
E
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
E
I
 
E
D
 
D
I
 
T
A
 
I
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
E
R
 
R
M
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
R
 
V
P
 
P
A
 
V
L
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
I
N
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
N
 
T
N
 
N
P
 
L
V
 
Q
D
 
T
T
 
T
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
I
 
F
G
 
G
S
|
S
A
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
I
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
N
F
 
F
Q
 
Q
S
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
K
Q
 
Q
L
 
I
K
 
P
E
 
E
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
-
N
 
L
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
Y
H
 
P
F
 
F
L
 
I
H
 
-
E
 
D
P
 
S
E
 
G
V
 
V
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
E
G
 
G
I
 
L
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
K
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
S
S
 
L
K
 
L
L
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
I
G
 
G
I
 
Y
I
 
L
H
 
H
G
 
G
C
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
F
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
D
D
 
W
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
T
 
Q
E
 
V
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
V
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
W
A
 
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
V
E
 
L
F
 
Y
F
 
D
S
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
I
E
 
E
L
 
L
C
 
S
K
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
N
 
K
D
 
K
K
 
I
K
 
N
F
 
I
K
 
K
P
 
G
E
 
K
D
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
N
 
E
N
 
S
Y
 
V
I
 
L
E
 
N
Y
 
H

8eh0A Engineered tyrosine synthase (tmtyrs1) derived from t. Maritima trpb with ser bound as the amino-acrylate intermediate and complexed with quinoline n-oxide (see paper)
58% identity, 97% coverage: 9:390/393 of query aligns to 1:379/385 of 8eh0A

query
sites
8eh0A
G
 
G
Y
 
N
Y
 
F
G
 
G
Q
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
Y
 
N
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
G
N
 
A
V
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
G
I
 
I
M
 
M
A
 
K
E
 
D
P
 
E
D
 
S
F
 
F
K
 
W
A
 
K
E
 
E
F
 
Y
D
 
N
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
N
 
G
T
 
A
K
 
R
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
A
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
T
A
 
A
E
 
G
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
F
G
 
G
L
 
M
E
 
E
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
E
I
 
E
D
 
D
I
 
T
A
 
I
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
E
R
 
R
M
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
R
 
V
P
 
P
A
 
V
L
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
x
I
N
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
N
 
T
N
 
N
P
 
L
V
 
Q
D
 
T
T
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
I
 
V
I
x
P
G
|
G
S
|
S
A
 
V
I
x
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
I
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
N
F
 
F
Q
 
Q
S
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
K
Q
 
Q
L
 
I
K
 
P
E
 
E
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
 
S
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
Y
H
 
P
F
 
F
L
 
I
H
 
-
E
 
D
P
 
S
E
 
G
V
 
V
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
E
G
 
G
I
 
L
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
K
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
S
S
 
L
K
 
L
L
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
I
G
 
G
I
 
Y
I
 
L
H
 
H
G
 
G
C
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
F
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
D
D
 
W
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
T
 
Q
E
 
A
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
V
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
W
A
 
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
V
E
 
L
F
 
Y
F
 
D
S
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
I
E
 
E
L
 
L
C
 
S
K
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
N
 
K
D
 
K
K
 
I
K
 
N
F
 
I
K
 
K
P
 
G
E
 
K
D
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
N
 
E
N
 
S
Y
 
V
I
 
L
E
 
N
Y
 
H

8egzA Engineered tyrosine synthase (tmtyrs1) derived from t. Maritima trpb with ser bound as the amino-acrylate intermediate (see paper)
58% identity, 97% coverage: 9:390/393 of query aligns to 1:379/385 of 8egzA

query
sites
8egzA
G
 
G
Y
 
N
Y
 
F
G
 
G
Q
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
Y
 
N
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
G
N
 
A
V
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
G
I
 
I
M
 
M
A
 
K
E
 
D
P
 
E
D
 
S
F
 
F
K
 
W
A
 
K
E
 
E
F
 
Y
D
 
N
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
N
 
G
T
 
A
K
 
R
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
A
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
T
A
 
A
E
 
G
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
F
G
 
G
L
 
M
E
 
E
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
E
I
 
E
D
 
D
I
 
T
A
 
I
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
E
R
 
R
M
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
R
 
V
P
 
P
A
 
V
L
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
I
N
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
N
 
T
N
 
N
P
 
L
V
 
Q
D
 
T
T
 
T
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
I
 
P
G
 
G
S
|
S
A
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
I
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
N
F
 
F
Q
 
Q
S
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
K
Q
 
Q
L
 
I
K
 
P
E
 
E
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
x
S
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
Y
H
 
P
F
 
F
L
 
I
H
 
-
E
 
D
P
 
S
E
 
G
V
 
V
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
E
G
 
G
I
 
L
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
K
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
S
S
 
L
K
 
L
L
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
I
G
 
G
I
 
Y
I
 
L
H
 
H
G
 
G
C
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
F
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
D
D
 
W
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
T
 
Q
E
 
A
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
V
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
W
A
 
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
V
E
 
L
F
 
Y
F
 
D
S
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
I
E
 
E
L
 
L
C
 
S
K
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
N
 
K
D
 
K
K
 
I
K
 
N
F
 
I
K
 
K
P
 
G
E
 
K
D
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
N
 
E
N
 
S
Y
 
V
I
 
L
E
 
N
Y
 
H

8eh1A Engineered tyrosine synthase (tmtyrs1) derived from t. Maritima trpb with ser bound as the amino-acrylate intermediate and complexed with 4-hydroxyquinoline (see paper)
58% identity, 97% coverage: 9:390/393 of query aligns to 1:379/383 of 8eh1A

query
sites
8eh1A
G
 
G
Y
 
N
Y
 
F
G
 
G
Q
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
Y
 
N
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
G
N
 
A
V
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
G
I
 
I
M
 
M
A
 
K
E
 
D
P
 
E
D
 
S
F
 
F
K
 
W
A
 
K
E
 
E
F
 
Y
D
 
N
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
N
 
G
T
 
A
K
 
R
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
A
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
T
A
 
A
E
x
G
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
F
G
 
G
L
 
M
E
 
E
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
E
I
 
E
D
 
D
I
 
T
A
 
I
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
E
R
 
R
M
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
R
 
V
P
 
P
A
 
V
L
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
x
I
N
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
N
 
T
N
 
N
P
 
L
V
 
Q
D
 
T
T
 
T
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
I
 
P
G
|
G
S
|
S
A
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
I
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
N
F
 
F
Q
 
Q
S
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
K
Q
 
Q
L
 
I
K
 
P
E
 
E
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
 
S
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
Y
H
 
P
F
 
F
L
 
I
H
 
-
E
 
D
P
 
S
E
 
G
V
 
V
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
E
G
 
G
I
 
L
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
K
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
S
S
 
L
K
 
L
L
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
I
G
 
G
I
 
Y
I
 
L
H
 
H
G
 
G
C
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
F
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
D
D
 
W
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
T
 
Q
E
 
A
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
V
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
W
A
 
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
V
E
 
L
F
 
Y
F
 
D
S
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
I
E
 
E
L
 
L
C
 
S
K
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
N
 
K
D
 
K
K
 
I
K
 
N
F
 
I
K
 
K
P
 
G
E
 
K
D
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
N
 
E
N
 
S
Y
 
V
I
 
L
E
 
N
Y
 
H

5kzmB Crystal structure of tryptophan synthase alpha-beta chain complex from francisella tularensis (see paper)
56% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 7:383/395 of 5kzmB

query
sites
5kzmB
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
Y
 
F
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
V
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
D
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
Q
Q
 
E
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
I
 
A
M
 
Q
A
 
A
E
 
D
P
 
E
D
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
Q
E
 
E
F
 
F
D
 
K
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
Q
D
 
E
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
 
T
K
 
R
R
 
N
L
 
I
S
 
V
E
 
K
K
 
N
Y
 
T
N
 
R
T
 
T
K
 
K
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
K
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
D
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
V
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
K
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
A
N
 
N
P
 
Y
V
 
S
D
 
K
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
F
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
Q
Q
 
Q
L
 
M
K
 
L
E
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
D
E
 
E
P
 
K
E
 
N
V
 
V
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
K
V
 
T
G
 
G
I
 
I
I
 
F
H
 
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
T
 
N
P
 
S
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
|
E
P
x
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
Y
 
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
A
T
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
K
F
 
Y
F
 
A
S
 
S
V
 
A
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
 
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
L
V
 
K
L
 
L
N
 
A
D
 
Y
K
 
E
K
 
D
F
 
P
K
 
N
P
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

P0A879 Tryptophan synthase beta chain; EC 4.2.1.20 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
54% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 8:384/397 of P0A879

query
sites
P0A879
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
R
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
L
 
V
K
 
S
I
 
A
M
 
Q
A
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
N
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
x
C
K
 
Q
R
 
N
L
 
I
S
 
T
E
 
A
K
 
G
Y
 
T
N
 
N
T
 
T
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
K
 
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
E
D
 
T
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
A
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
E
K
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
N
E
 
E
P
 
T
E
 
N
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
H
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
H
 
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
L
L
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
 
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
V
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
M
K
 
M
K
 
R
F
 
E
K
 
N
P
 
P
-
 
D
-
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5tciH Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - brd4592-bound form (see paper)
53% identity, 99% coverage: 3:393/393 of query aligns to 8:403/406 of 5tciH

query
sites
5tciH
Y
 
H
N
 
D
V
 
P
D
 
D
E
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
H
Y
 
F
G
 
G
Q
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
R
Y
 
Y
I
 
V
P
|
P
E
 
E
M
 
A
L
|
L
Y
 
M
P
 
A
N
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
R
 
T
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
K
 
K
I
 
E
M
 
R
A
 
V
E
 
S
P
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
L
A
 
D
E
 
D
F
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
Q
K
 
A
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
E
A
 
A
K
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
K
 
H
Y
 
A
N
 
G
T
 
S
-
 
A
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
S
H
 
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
D
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
A
A
 
V
L
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
V
N
 
A
N
 
N
P
 
A
V
 
D
D
 
N
T
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
I
 
C
I
x
F
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
x
F
P
 
P
D
 
T
M
 
M
V
 
V
T
 
R
R
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
G
E
 
M
E
 
E
I
 
A
K
 
R
W
 
V
Q
 
Q
L
 
I
K
 
Q
E
 
G
K
 
Q
E
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
H
H
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
D
G
 
G
I
 
V
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
R
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
F
K
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
P
G
 
G
I
 
A
I
 
F
H
|
H
G
 
G
C
 
S
K
 
F
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
T
 
I
E
 
E
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
W
L
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
F
 
Y
F
 
R
S
 
P
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
S
D
 
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
-
 
A
-
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
K
N
 
L
D
 
G
K
 
V
K
 
E
F
 
L
K
 
G
P
 
R
E
 
G
D
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
V
N
 
E
N
 
T
Y
 
A
I
 
A
E
 
K
Y
 
W
F
 
F
K
 
G
I
 
L

6usaB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and gsk1-bound form (see paper)
53% identity, 99% coverage: 3:393/393 of query aligns to 7:402/404 of 6usaB

query
sites
6usaB
Y
 
H
N
 
D
V
 
P
D
 
D
E
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
H
Y
 
F
G
 
G
Q
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
R
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
A
L
 
L
Y
 
M
P
 
A
N
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
R
 
T
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
K
 
K
I
 
E
M
 
R
A
 
V
E
 
S
P
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
L
A
 
D
E
 
D
F
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
Q
K
 
A
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
E
A
 
A
K
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
K
 
H
Y
 
A
N
 
G
T
 
S
-
 
A
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
S
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
D
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
A
A
 
V
L
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
x
F
R
 
R
D
 
D
W
|
W
I
 
V
N
 
A
N
 
N
P
 
A
V
 
D
D
 
N
T
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
I
 
C
I
x
F
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
|
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
x
F
P
 
P
D
 
T
M
 
M
V
 
V
T
 
R
R
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
G
E
 
M
E
 
E
I
 
A
K
 
R
W
 
V
Q
 
Q
L
 
I
K
 
Q
E
 
G
K
 
Q
E
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
H
H
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
D
G
 
G
I
 
V
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
R
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
F
K
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
P
G
 
G
I
 
A
I
 
F
H
|
H
G
|
G
C
 
S
K
 
F
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
T
 
I
E
 
E
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
W
L
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
F
 
Y
F
 
R
S
 
P
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
S
D
 
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
|
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
-
 
A
-
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
K
N
 
L
D
 
G
K
 
V
K
 
E
F
 
L
K
 
G
P
 
R
E
 
G
D
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
V
N
 
E
N
 
T
Y
 
A
I
 
A
E
 
K
Y
 
W
F
 
F
K
 
G
I
 
L

6dweB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and brd0059-bound form
53% identity, 99% coverage: 3:393/393 of query aligns to 7:402/404 of 6dweB

query
sites
6dweB
Y
 
H
N
 
D
V
 
P
D
 
D
E
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
H
Y
 
F
G
 
G
Q
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
R
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
A
L
 
L
Y
 
M
P
 
A
N
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
R
 
T
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
K
 
K
I
 
E
M
 
R
A
 
V
E
 
S
P
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
L
A
 
D
E
 
D
F
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
Q
K
 
A
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
E
A
 
A
K
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
K
 
H
Y
 
A
N
 
G
T
 
S
-
 
A
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
S
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
D
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
A
A
 
V
L
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
x
F
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
V
N
 
A
N
 
N
P
 
A
V
 
D
D
 
N
T
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
I
 
C
I
x
F
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
x
F
P
 
P
D
 
T
M
 
M
V
 
V
T
 
R
R
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
G
E
 
M
E
 
E
I
 
A
K
 
R
W
 
V
Q
 
Q
L
 
I
K
 
Q
E
 
G
K
 
Q
E
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
H
H
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
D
G
 
G
I
 
V
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
R
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
F
K
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
P
G
 
G
I
 
A
I
 
F
H
|
H
G
 
G
C
 
S
K
 
F
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
T
 
I
E
 
E
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
W
L
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
F
 
Y
F
 
R
S
 
P
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
S
D
 
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
|
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
-
 
A
-
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
K
N
 
L
D
 
G
K
 
V
K
 
E
F
 
L
K
 
G
P
 
R
E
 
G
D
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
V
N
 
E
N
 
T
Y
 
A
I
 
A
E
 
K
Y
 
W
F
 
F
K
 
G
I
 
L

5ocwB Structure of mycobacterium tuberculosis tryptophan synthase in space group f222 (see paper)
53% identity, 99% coverage: 3:393/393 of query aligns to 3:398/399 of 5ocwB

query
sites
5ocwB
Y
 
H
N
 
D
V
 
P
D
 
D
E
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
H
Y
 
F
G
 
G
Q
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
R
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
A
L
 
L
Y
 
M
P
 
A
N
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
R
 
T
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
K
 
K
I
 
E
M
 
R
A
 
V
E
 
S
P
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
L
A
 
D
E
 
D
F
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
Q
K
 
A
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
E
A
 
A
K
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
K
 
H
Y
 
A
N
 
G
T
 
S
-
 
A
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
S
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
D
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
A
A
 
V
L
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
V
N
 
A
N
 
N
P
 
A
V
 
D
D
 
N
T
 
T
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
C
I
 
F
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
F
P
 
P
D
 
T
M
 
M
V
 
V
T
 
R
R
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
G
E
 
M
E
 
E
I
 
A
K
 
R
W
 
V
Q
 
Q
L
 
I
K
 
Q
E
 
G
K
 
Q
E
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
H
H
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
D
G
 
G
I
 
V
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
R
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
F
K
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
P
G
 
G
I
 
A
I
 
F
H
 
H
G
 
G
C
 
S
K
 
F
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
T
 
I
E
 
E
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
W
L
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
F
 
Y
F
 
R
S
 
P
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
S
D
 
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
|
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
-
 
A
-
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
K
N
 
L
D
 
G
K
 
V
K
 
E
F
 
L
K
 
G
P
 
R
E
 
G
D
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
V
N
 
E
N
 
T
Y
 
A
I
 
A
E
 
K
Y
 
W
F
 
F
K
 
G
I
 
L

6uapB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - open form with brd6309 bound
53% identity, 99% coverage: 3:393/393 of query aligns to 7:402/405 of 6uapB

query
sites
6uapB
Y
 
H
N
 
D
V
 
P
D
 
D
E
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
H
Y
 
F
G
 
G
Q
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
R
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
A
L
 
L
Y
 
M
P
 
A
N
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
R
 
T
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
K
 
K
I
 
E
M
 
R
A
 
V
E
 
S
P
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
L
A
 
D
E
 
D
F
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
Q
K
 
A
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
E
A
 
A
K
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
K
 
H
Y
 
A
N
 
G
T
 
S
-
 
A
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
S
H
 
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
D
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
A
A
 
V
L
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
x
I
N
|
N
E
 
E
A
 
A
I
x
F
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
V
N
 
A
N
 
N
P
 
A
V
 
D
D
 
N
T
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
I
 
C
I
x
F
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
x
F
P
 
P
D
 
T
M
 
M
V
 
V
T
 
R
R
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
G
E
 
M
E
 
E
I
 
A
K
 
R
W
 
V
Q
 
Q
L
 
I
K
 
Q
E
 
G
K
 
Q
E
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
H
H
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
D
G
 
G
I
 
V
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
R
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
F
K
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
P
G
 
G
I
 
A
I
 
F
H
|
H
G
 
G
C
 
S
K
 
F
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
T
 
I
E
 
E
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
W
L
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
F
 
Y
F
 
R
S
 
P
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
S
D
 
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
-
 
A
-
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
K
N
 
L
D
 
G
K
 
V
K
 
E
F
 
L
K
 
G
P
 
R
E
 
G
D
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
V
N
 
E
N
 
T
Y
 
A
I
 
A
E
 
K
Y
 
W
F
 
F
K
 
G
I
 
L

6u6cB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and gsk2-bound form (see paper)
53% identity, 99% coverage: 3:393/393 of query aligns to 8:403/405 of 6u6cB

query
sites
6u6cB
Y
 
H
N
 
D
V
 
P
D
 
D
E
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
H
Y
 
F
G
 
G
Q
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
R
Y
|
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
A
L
 
L
Y
 
M
P
 
A
N
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
V
R
 
T
Q
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
K
 
K
I
 
E
M
 
R
A
 
V
E
 
S
P
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
L
A
 
D
E
 
D
F
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
Q
K
 
A
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
E
A
 
A
K
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
K
 
H
Y
 
A
N
 
G
T
 
S
-
 
A
K
 
R
I
 
I
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
S
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
A
C
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
D
C
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
A
A
 
V
L
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
x
F
R
 
R
D
 
D
W
|
W
I
 
V
N
 
A
N
 
N
P
 
A
V
 
D
D
 
N
T
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
I
 
C
I
x
F
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
|
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
F
P
 
P
D
 
T
M
 
M
V
 
V
T
 
R
R
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
G
E
 
M
E
 
E
I
 
A
K
 
R
W
 
V
Q
 
Q
L
 
I
K
 
Q
E
 
G
K
 
Q
E
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
Y
 
H
H
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
G
V
 
V
G
 
R
I
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
D
G
 
G
I
 
V
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
R
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
F
K
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
S
V
 
P
G
 
G
I
 
A
I
 
F
H
|
H
G
|
G
C
 
S
K
 
F
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
T
 
D
P
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
T
 
I
E
 
E
P
 
S
Y
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
E
H
 
H
A
 
A
H
 
W
L
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
F
 
Y
F
 
R
S
 
P
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
S
D
 
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
|
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
-
 
A
-
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
K
N
 
L
D
 
G
K
 
V
K
 
E
F
 
L
K
 
G
P
 
R
E
 
G
D
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
V
N
 
E
N
 
T
Y
 
A
I
 
A
E
 
K
Y
 
W
F
 
F
K
 
G
I
 
L

2clfB Tryptophan synthase in complex with n-(4'- trifluoromethoxybenzoyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f6) - highf6 complex (see paper)
54% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 7:383/394 of 2clfB

query
sites
2clfB
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
I
 
V
P
|
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
L
 
V
K
 
R
I
 
A
M
 
Q
A
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
 
C
K
 
Q
R
 
N
L
 
I
S
 
T
E
 
A
K
 
G
Y
 
T
N
 
R
T
 
T
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
S
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
x
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
E
D
 
T
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
I
x
L
G
|
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
A
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
D
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
N
E
 
D
P
 
T
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
H
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
H
x
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
S
T
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
V
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
M
K
 
M
K
 
R
F
 
E
K
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1a5sB Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with 5- fluoroindole propanol phosphate and l-ser bound as amino acrylate to the beta site (see paper)
54% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 6:382/387 of 1a5sB

query
sites
1a5sB
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
L
 
V
K
 
R
I
 
A
M
 
Q
A
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
 
C
K
 
Q
R
 
N
L
 
I
S
 
T
E
 
A
K
 
G
Y
 
T
N
 
R
T
 
T
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
S
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
|
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
E
D
 
T
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
A
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
D
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
N
E
 
D
P
 
T
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
H
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
H
 
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
S
T
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
V
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
M
K
 
M
K
 
R
F
 
E
K
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

1beuB Trp synthase (d60n-ipp-ser) with k+ (see paper)
54% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 6:382/389 of 1beuB

query
sites
1beuB
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
L
 
V
K
 
R
I
 
A
M
 
Q
A
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
 
C
K
 
Q
R
 
N
L
 
I
S
 
T
E
 
A
K
 
G
Y
 
T
N
 
R
T
 
T
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
S
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
E
D
 
T
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
A
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
D
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
N
E
 
D
P
 
T
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
H
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
H
 
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
|
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
S
T
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
V
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
M
K
 
M
K
 
R
F
 
E
K
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

1a50B Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with 5- fluoroindole propanol phosphate (see paper)
54% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 7:383/390 of 1a50B

query
sites
1a50B
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
L
 
V
K
 
R
I
 
A
M
 
Q
A
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
 
C
K
 
Q
R
 
N
L
 
I
S
 
T
E
 
A
K
 
G
Y
 
T
N
 
R
T
 
T
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
S
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
E
D
 
T
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
A
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
D
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
N
E
 
D
P
 
T
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
H
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
H
 
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
S
T
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
|
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
V
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
M
K
 
M
K
 
R
F
 
E
K
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

7lv5B The internal aldimine form of the wild-type salmonella typhimurium tryptophan synthase in complex with inhibitor n-(4'- trifluoromethoxybenzenesulfonyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f9f) at the enzyme alpha-site, cesium ion at the metal coordination site and l-histidine at the enzyme beta-site at 1.55 angstrom resolution
54% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 7:383/393 of 7lv5B

query
sites
7lv5B
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
L
 
V
K
 
S
I
 
A
M
 
Q
A
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
 
C
K
 
Q
R
 
N
L
 
I
S
 
T
E
 
A
K
 
G
Y
 
T
N
 
R
T
 
T
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
S
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
E
D
 
T
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
A
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
D
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
N
E
 
D
P
 
T
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
H
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
H
 
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
S
T
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
V
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
M
K
 
M
K
 
R
F
 
E
K
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

3cepB Structure of a tryptophan synthase quinonoid intermediate (see paper)
54% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 7:383/393 of 3cepB

query
sites
3cepB
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
L
 
V
K
 
S
I
 
A
M
 
Q
A
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
 
C
K
 
Q
R
 
N
L
 
I
S
 
T
E
 
A
K
 
G
Y
 
T
N
 
R
T
 
T
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
S
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
E
D
 
T
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
A
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
D
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
N
E
 
D
P
 
T
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
H
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
H
 
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
x
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
S
T
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
V
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
M
K
 
M
K
 
R
F
 
E
K
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

4kkxB Crystal structure of tryptophan synthase from salmonella typhimurium with 2-aminophenol quinonoid in the beta site and the f6 inhibitor in the alpha site (see paper)
54% identity, 95% coverage: 10:384/393 of query aligns to 7:383/395 of 4kkxB

query
sites
4kkxB
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
N
 
A
V
 
L
E
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
Y
 
F
L
 
V
K
 
S
I
 
A
M
 
Q
A
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
E
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Y
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
Y
 
T
F
 
K
A
 
C
K
 
Q
R
 
N
L
 
I
S
 
T
E
 
A
K
 
G
Y
 
T
N
 
R
T
 
T
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
L
H
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
Q
T
 
V
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
R
L
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
S
R
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
A
C
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
C
 
C
I
 
R
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
I
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
N
 
N
V
 
V
A
 
F
R
 
R
M
 
M
K
 
R
M
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
A
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
C
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
S
N
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
E
D
 
T
T
 
A
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
G
S
x
T
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
T
M
 
I
V
 
V
T
 
R
R
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
K
W
 
A
Q
 
Q
L
 
I
K
 
L
E
 
D
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
L
N
 
-
P
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
F
Y
 
A
H
 
D
F
 
F
L
 
I
H
 
N
E
 
D
P
 
T
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
H
G
 
G
I
 
I
H
 
E
S
 
T
G
 
G
H
 
E
S
 
H
A
 
G
A
 
A
T
 
P
S
 
L
K
 
K
L
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
H
 
F
G
 
G
C
 
M
K
 
K
T
 
A
L
 
P
L
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
x
F
P
 
P
G
 
S
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
Q
H
 
H
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
S
T
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
F
 
V
S
 
S
V
 
I
T
 
T
D
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
K
E
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
R
L
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
H
V
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
M
K
 
M
K
 
R
F
 
E
K
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
K
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
C
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
I

Query Sequence

>WP_066328927.1 NCBI__GCF_900100165.1:WP_066328927.1
MLYNVDEKGYYGQFGGAYIPEMLYPNVEELRQQYLKIMAEPDFKAEFDQLLKDYVGRPSP
LYFAKRLSEKYNTKIYLKREDLNHTGAHKINNTIGQILVAKKLGKKRIIAETGAGQHGVA
TATVCALMGLECIVYMGEIDIARQAPNVARMKMLGATVRPALSGSRTLKDATNEAIRDWI
NNPVDTHYIIGSAIGPHPYPDMVTRFQSVISEEIKWQLKEKEGRENPDYVVACIGGGSNA
AGTFYHFLHEPEVGIIAVEAAGKGIHSGHSAATSKLGKVGIIHGCKTLLMQTPDGQITEP
YSISAGLDYPGVGPMHAHLAETGRAEFFSVTDDDAMQAGLELCKLEGIIPAIESSHALAV
LNDKKFKPEDVVVICLSGRGDKDLNNYIEYFKI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory