SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_066549662.1 NCBI__GCF_001636925.1:WP_066549662.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4pg7A Crystal structure of s. Aureus homoserine dehydrogenase at ph7.5 (see paper)
27% identity, 51% coverage: 276:572/583 of query aligns to 2:306/402 of 4pg7A

query
sites
4pg7A
L
 
M
P
 
K
P
 
K
L
 
L
K
 
N
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
V
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
V
G
 
-
K
 
K
L
 
I
L
 
I
N
 
E
D
 
E
P
 
N
R
 
R
Y
 
Q
E
 
Q
V
 
I
V
 
Q
G
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
H
V
 
I
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
D
P
 
K
K
 
S
K
 
K
A
 
K
R
 
R
D
 
P
V
 
L
D
 
N
C
 
I
P
 
S
A
 
Q
S
 
Y
L
 
H
F
 
L
T
 
T
S
 
E
N
 
D
P
 
V
A
 
N
D
 
E
L
 
I
W
 
L
A
 
N
K
 
D
K
 
D
P
 
S
-
 
L
D
 
D
V
 
I
V
 
I
L
 
V
E
 
E
A
 
V
L
 
M
S
 
G
E
 
G
G
 
I
E
 
E
A
 
P
G
 
T
H
 
V
A
 
D
V
 
W
I
 
L
R
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
N
G
 
K
C
 
K
D
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
 
D
A
 
L
V
 
L
S
 
A
R
 
V
D
 
H
P
 
L
G
 
K
G
 
L
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
V
R
 
A
M
 
L
F
 
K
W
 
F
S
 
E
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
P
P
 
N
M
 
N
I
 
I
E
 
S
T
 
K
V
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
M
A
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
S
N
 
N
F
 
F
M
 
I
L
 
L
E
 
S
R
 
K
L
 
M
G
 
T
-
 
K
D
 
E
G
 
Q
A
 
T
A
 
T
F
 
F
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
R
A
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
A
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
D
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
V
D
|
D
A
 
A
A
 
A
A
 
R
K
|
K
V
 
V
R
 
V
L
 
I
L
 
T
C
 
S
H
 
Y
E
 
L
A
 
S
F
 
F
G
 
N
R
 
Q
S
 
V
P
 
I
D
 
K
-
 
L
G
 
N
D
 
D
V
 
V
P
 
K
R
 
R
-
x
R
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
x
G
-
 
V
-
 
T
-
 
L
D
 
T
H
 
D
L
 
I
T
 
N
E
 
V
A
 
A
T
 
D
S
 
Q
A
 
L
A
 
G
G
 
Y
G
 
K
V
 
I
R
 
K
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
K
A
 
G
H
 
I
L
 
Y
K
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
K
I
 
V
R
 
N
P
 
A
S
 
S
V
 
V
S
 
E
L
 
P
N
 
T
A
 
L
D
 
I
H
 
D
G
 
K
D
 
K
P
 
H
L
 
Q
F
 
L
S
 
A
T
 
A
L
 
V
R
 
E
G
 
D
E
 
E
G
 
Y
N
 
N
A
 
A
L
 
I
K
 
Y
V
 
V
Y
 
I
G
 
G
A
 
D
D
 
A
G
 
V
R
 
G
V
 
D
W
 
T
R
 
M
C
 
F
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
S
W
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
G
E
 
S
S
 
A
I
 
V
M
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
L
E
 
N
I
 
V

Sites not aligning to the query:

F9VNG5 Homoserine dehydrogenase; HDH; HSD; StHSD; EC 1.1.1.3 from Sulfurisphaera tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7) (Sulfolobus tokodaii) (see 3 papers)
29% identity, 41% coverage: 337:574/583 of query aligns to 65:301/304 of F9VNG5

query
sites
F9VNG5
K
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
I
L
 
V
E
 
D
A
 
V
L
x
S
S
 
S
-
 
A
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
E
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
P
G
 
S
H
 
L
A
 
S
V
 
L
I
 
Y
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
V
D
 
N
V
 
I
A
 
I
S
 
T
A
x
T
N
 
N
K
|
K
Q
 
A
A
 
P
V
 
L
S
 
A
R
 
L
D
 
A
P
 
F
G
 
N
G
 
E
L
 
I
Q
 
F
E
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
N
 
K
G
 
G
R
 
V
R
 
K
M
 
I
F
 
G
W
 
F
S
 
Q
A
 
G
S
 
T
V
 
V
G
 
M
G
 
S
G
 
G
S
 
T
P
 
P
M
 
S
I
 
I
E
 
N
T
 
L
V
 
Y
R
 
R
A
 
V
A
 
L
R
 
P
A
 
G
A
 
S
G
 
-
E
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
K
F
 
I
E
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
T
N
 
N
F
 
F
M
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
L
L
 
M
G
 
N
D
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
S
F
 
F
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
A
 
R
G
|
G
F
 
Y
A
 
A
E
|
E
E
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
L
D
 
D
L
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
I
R
 
T
L
 
I
L
 
L
C
 
A
H
 
N
E
 
F
A
 
M
F
 
I
G
 
G
R
 
N
S
 
S
P
 
V
D
 
T
-
 
I
G
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
K
R
 
F
D
 
E
H
 
G
L
 
I
T
 
N
E
 
R
A
 
D
T
 
L
S
 
P
A
 
K
A
 
N
G
 
E
G
 
K
V
 
I
R
 
K
Q
 
L
I
 
I
G
 
A
A
 
Y
A
 
A
H
 
D
L
 
E
K
 
K
D
 
E
G
 
V
V
 
W
I
 
V
R
 
K
P
 
P
S
 
-
V
 
-
S
 
-
L
 
L
N
 
P
A
 
I
D
 
S
H
 
Q
G
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
S
 
N
T
 
-
L
 
V
R
 
D
G
 
G
E
 
V
G
 
E
N
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
E
V
 
I
Y
 
-
G
 
T
A
 
T
D
 
D
G
 
I
R
 
Q
V
 
S
W
 
I
R
 
L
C
 
I
R
 
R
G
 
G
R
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
R
 
P
W
 
V
A
 
N
T
 
A
T
 
A
E
 
Y
S
 
G
I
 
A
M
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
L
I
 
L
V
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7f4cA The crystal structure of the immature holo-enzyme of homoserine dehydrogenase complexed with NADP and 1,4-butandiol from the hyperthermophilic archaeon sulfurisphaera tokodaii. (see paper)
29% identity, 41% coverage: 337:574/583 of query aligns to 65:297/300 of 7f4cA

query
sites
7f4cA
K
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
I
L
 
V
E
 
D
A
x
V
L
x
S
S
|
S
-
 
A
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
E
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
P
G
 
S
H
 
L
A
 
S
V
 
L
I
 
Y
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
V
D
 
N
V
 
I
A
 
I
S
 
T
A
x
T
N
 
N
K
|
K
Q
 
A
A
 
P
V
 
L
S
 
A
R
 
L
D
 
A
P
 
F
G
 
N
G
 
E
L
 
I
Q
 
F
E
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
N
 
K
G
 
G
R
 
V
R
 
K
M
 
I
F
 
G
W
 
F
S
 
Q
A
x
G
S
 
T
V
 
V
G
 
M
G
x
S
G
 
G
S
 
T
P
 
P
M
 
S
I
 
I
E
 
N
T
 
L
V
 
Y
R
 
R
A
 
V
A
 
L
R
 
P
A
 
G
A
 
S
G
 
-
E
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
K
F
 
I
E
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
T
N
 
N
F
 
F
M
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
L
L
 
M
G
 
N
D
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
S
F
 
F
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
E
|
E
E
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
L
D
 
D
L
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
I
R
 
T
L
 
I
L
 
L
C
 
A
H
 
N
E
 
F
A
 
M
F
 
I
G
 
G
R
 
N
S
 
S
P
 
V
D
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
T
P
 
I
R
 
K
D
 
D
H
 
V
L
 
K
T
 
F
E
 
E
A
 
G
T
 
I
S
 
N
A
 
R
A
 
D
G
 
L
G
 
K
V
 
I
R
 
K
Q
 
L
I
 
I
G
 
A
A
 
Y
A
 
A
H
 
D
L
 
E
K
 
K
D
 
E
G
 
V
V
 
W
I
 
V
R
 
K
P
 
P
S
 
-
V
 
-
S
 
-
L
 
L
N
 
P
A
 
I
D
 
S
H
 
Q
G
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
S
 
N
T
 
-
L
 
V
R
 
D
G
 
G
E
 
V
G
 
E
N
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
E
V
 
I
Y
 
-
G
 
T
A
 
T
D
 
D
G
 
I
R
 
Q
V
 
S
W
 
I
R
 
L
C
 
I
R
 
R
G
 
G
R
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
R
 
P
W
 
V
A
 
N
T
x
A
T
 
A
E
 
Y
S
 
G
I
 
A
M
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
L
I
 
L
V
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6a0tB Homoserine dehydrogenase k99a mutant from thermus thermophilus hb8 complexed with hse and NADP+ (see paper)
34% identity, 34% coverage: 279:475/583 of query aligns to 4:201/332 of 6a0tB

query
sites
6a0tB
L
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
L
G
|
G
C
x
G
G
|
G
V
x
T
V
|
V
G
 
G
G
 
S
G
 
A
V
 
F
L
 
Y
G
 
N
K
 
L
L
 
V
L
 
L
N
 
E
D
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
V
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
E
 
-
V
 
-
V
 
L
G
 
G
V
 
V
L
|
L
V
|
V
R
|
R
N
x
D
P
 
P
K
 
R
K
|
K
A
 
P
R
|
R
D
 
A
V
 
I
D
 
-
C
 
-
P
 
P
A
 
Q
S
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
R
S
 
A
N
 
E
P
 
P
A
 
F
D
 
D
L
 
L
W
 
L
A
 
-
K
 
-
K
 
E
P
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
L
 
V
E
 
E
A
|
A
L
x
M
S
x
G
E
 
G
G
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
P
H
 
L
A
 
R
V
 
L
I
 
V
R
 
L
A
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
I
D
 
P
V
 
L
A
 
I
S
 
T
A
|
A
N
|
N
K
 
K
Q
 
A
A
 
L
V
 
L
S
 
A
R
 
E
D
 
A
P
 
W
G
 
E
G
 
S
L
 
L
Q
 
R
E
 
P
L
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
E
N
 
G
G
 
-
R
 
-
R
 
L
M
 
I
F
 
Y
W
 
H
S
 
E
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
M
G
 
A
G
 
G
S
 
T
P
 
P
M
 
A
I
 
L
E
 
S
T
 
F
V
 
L
R
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
R
A
 
G
A
 
S
G
 
-
E
 
E
V
 
L
V
 
L
G
 
E
F
 
L
E
 
H
A
 
G
V
 
I
L
 
L
N
|
N
G
|
G
T
|
T
V
 
T
N
 
L
F
 
Y
M
 
I
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
L
 
M
G
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
R
A
 
T
F
 
Y
N
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
L
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
A
 
L
G
|
G
F
x
Y
A
 
A
E
|
E
E
 
A
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
L
D
|
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
I
D
|
D
A
 
A
A
 
A
A
 
H
K
|
K
V
 
L
R
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
A
H
 
R

Sites not aligning to the query:

6a0sA Homoserine dehydrogenase from thermus thermophilus hb8 complexed with hse and NADPH (see paper)
34% identity, 34% coverage: 279:475/583 of query aligns to 4:201/331 of 6a0sA

query
sites
6a0sA
L
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
C
x
G
G
|
G
V
x
T
V
|
V
G
 
G
G
 
S
G
 
A
V
 
F
L
 
Y
G
 
N
K
 
L
L
 
V
L
 
L
N
 
E
D
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
V
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
E
 
-
V
 
-
V
 
L
G
 
G
V
 
V
L
|
L
V
|
V
R
|
R
N
x
D
P
 
P
K
 
R
K
|
K
A
 
P
R
|
R
D
 
A
V
 
I
D
 
-
C
 
-
P
 
P
A
 
Q
S
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
R
S
 
A
N
 
E
P
 
P
A
 
F
D
 
D
L
 
L
W
 
L
A
 
-
K
 
-
K
 
E
P
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
L
 
V
E
 
E
A
|
A
L
x
M
S
 
G
E
 
G
G
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
P
H
 
L
A
 
R
V
 
L
I
 
V
R
 
L
A
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
I
D
 
P
V
 
L
A
 
I
S
 
T
A
|
A
N
 
N
K
|
K
Q
 
A
A
 
L
V
 
L
S
 
A
R
 
E
D
 
A
P
 
W
G
 
E
G
 
S
L
 
L
Q
 
R
E
 
P
L
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
E
N
 
G
G
 
-
R
 
-
R
 
L
M
 
I
F
 
Y
W
 
H
S
 
E
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
M
G
 
A
G
 
G
S
 
T
P
 
P
M
 
A
I
 
L
E
 
S
T
 
F
V
 
L
R
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
R
A
 
G
A
 
S
G
 
-
E
 
E
V
 
L
V
 
L
G
 
E
F
 
L
E
 
H
A
 
G
V
 
I
L
 
L
N
|
N
G
|
G
T
|
T
V
 
T
N
 
L
F
 
Y
M
 
I
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
L
 
M
G
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
R
A
 
T
F
 
Y
N
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
L
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
A
 
L
G
|
G
F
x
Y
A
 
A
E
|
E
E
 
A
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
L
D
|
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
I
D
|
D
A
 
A
A
 
A
A
 
H
K
|
K
V
 
L
R
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
A
H
 
R

Sites not aligning to the query:

2ejwA Homoserine dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
34% identity, 34% coverage: 279:475/583 of query aligns to 4:201/331 of 2ejwA

query
sites
2ejwA
L
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
C
 
G
G
 
G
V
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
S
G
 
A
V
 
F
L
 
Y
G
 
N
K
 
L
L
 
V
L
 
L
N
 
E
D
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
V
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
E
 
-
V
 
-
V
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
R
K
 
K
A
 
P
R
 
R
D
 
A
V
 
I
D
 
-
C
 
-
P
 
P
A
 
Q
S
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
R
S
 
A
N
 
E
P
 
P
A
 
F
D
 
D
L
 
L
W
 
L
A
 
-
K
 
-
K
 
E
P
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
L
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
S
 
G
E
 
G
G
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
P
H
 
L
A
 
R
V
 
L
I
 
V
R
 
L
A
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
I
D
 
P
V
 
L
A
 
I
S
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
 
A
A
 
L
V
 
L
S
 
A
R
 
E
D
 
A
P
 
W
G
 
E
G
 
S
L
 
L
Q
 
R
E
 
P
L
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
E
N
 
G
G
 
-
R
 
-
R
 
L
M
 
I
F
 
Y
W
 
H
S
x
E
A
 
A
S
 
S
V
|
V
G
x
M
G
x
A
G
 
G
S
x
T
P
 
P
M
 
A
I
 
L
E
 
S
T
 
F
V
 
L
R
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
R
A
 
G
A
 
S
G
 
-
E
 
E
V
 
L
V
 
L
G
 
E
F
 
L
E
 
H
A
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
T
N
 
L
F
 
Y
M
 
I
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
L
 
M
G
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
R
A
 
T
F
 
Y
N
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
L
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
A
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
L
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
I
D
|
D
A
 
A
A
 
A
A
 
H
K
|
K
V
 
L
R
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
A
H
 
R

Q5F8J4 Homoserine dehydrogenase; HDH; HSD; NAD(+)-dependent homoserine dehydrogenase; NAD(+)-dependent HSD; NgHSD; EC 1.1.1.3 from Neisseria gonorrhoeae (strain ATCC 700825 / FA 1090) (see paper)
30% identity, 46% coverage: 314:581/583 of query aligns to 48:325/435 of Q5F8J4

query
sites
Q5F8J4
K
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
D
 
-
C
 
C
P
 
P
A
 
S
S
 
A
L
 
A
F
 
F
T
 
V
S
 
K
N
 
D
P
 
P
A
 
F
D
 
E
L
 
L
W
 
V
A
 
A
K
 
R
K
 
K
P
 
D
-
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
F
S
 
G
-
 
G
E
 
T
G
 
G
E
 
I
A
 
A
G
 
K
H
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
-
L
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
C
 
K
D
 
H
V
 
I
A
 
V
S
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
 
K
A
 
L
V
 
L
S
 
A
R
 
E
D
 
Y
P
 
G
G
 
N
G
 
E
L
 
I
Q
 
F
E
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
R
 
V
R
 
I
M
 
V
F
 
Q
W
 
F
S
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
I
P
 
P
M
 
I
I
 
I
E
 
K
T
 
A
V
 
L
R
 
R
A
 
E
A
 
G
R
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
N
E
 
R
V
 
I
V
 
K
G
 
S
F
 
I
E
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
S
N
 
N
F
 
F
M
 
I
L
 
L
E
 
S
R
 
E
L
 
M
G
 
R
D
 
E
-
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
A
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
N
D
 
D
A
 
A
A
 
G
A
 
H
K
 
K
V
 
I
R
 
T
L
 
I
L
 
M
C
 
S
H
 
A
E
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
T
S
 
P
P
 
M
D
 
N
G
 
F
D
 
S
V
 
A
-
 
C
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
D
P
 
S
R
 
R
D
 
D
H
 
-
L
 
I
T
 
K
E
 
Y
A
 
A
T
 
E
S
 
E
A
 
L
A
 
G
G
 
Y
G
 
R
V
 
I
R
 
K
Q
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
T
H
 
R
L
 
K
K
 
T
D
 
G
G
 
K
V
 
G
I
 
I
R
 
E
P
 
L
S
 
R
V
 
V
S
 
H
L
 
P
N
 
T
A
 
L
D
 
I
H
 
P
G
 
E
D
 
S
P
 
R
L
 
L
F
 
L
S
 
A
T
 
N
L
 
V
R
 
D
G
 
G
E
 
V
G
 
M
N
 
N
A
 
A
L
 
V
K
 
R
V
 
V
Y
 
N
G
 
A
A
 
D
D
 
M
G
 
V
R
 
G
V
 
E
W
 
T
R
 
L
C
 
Y
R
 
Y
G
 
G
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
A
W
 
L
A
 
P
T
 
T
T
 
A
E
 
S
S
 
A
I
 
V
M
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
I
E
 
D
I
 
I
V
 
A
R
 
R
A
 
L
R
 
V
R
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
T
G
 
A

Sites not aligning to the query:

5x9dA Crystal structure of homoserine dehydrogenase in complex with l- cysteine and NAD (see paper)
29% identity, 41% coverage: 337:574/583 of query aligns to 65:299/302 of 5x9dA

query
sites
5x9dA
K
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
I
L
 
V
E
 
D
A
x
V
L
x
S
S
|
S
-
 
A
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
E
 
N
G
 
G
E
 
E
A
x
P
G
 
S
H
 
L
A
 
S
V
 
L
I
 
Y
R
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
V
D
 
N
V
 
I
A
 
I
S
 
T
A
x
T
N
|
N
K
|
K
Q
 
A
A
 
P
V
 
L
S
 
A
R
 
L
D
 
A
P
 
F
G
 
N
G
 
E
L
 
I
Q
 
F
E
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
N
 
K
G
 
G
R
 
V
R
 
K
M
 
I
F
 
G
W
 
F
S
 
Q
A
x
G
S
 
T
V
 
V
G
 
M
G
x
S
G
 
G
S
 
T
P
 
P
M
 
S
I
 
I
E
 
N
T
 
L
V
 
Y
R
 
R
A
 
V
A
 
L
R
 
P
A
 
G
A
 
S
G
 
-
E
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
K
F
 
I
E
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
L
N
|
N
G
|
G
T
|
T
V
 
T
N
 
N
F
 
F
M
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
L
L
 
M
G
 
N
D
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
S
F
 
F
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
A
 
R
G
 
G
F
x
Y
A
|
A
E
|
E
E
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
L
D
|
D
L
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
F
D
|
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
V
 
I
R
 
T
L
 
I
L
 
L
C
 
A
H
 
N
E
 
F
A
 
M
F
 
I
G
 
G
R
 
N
S
 
S
P
 
V
D
 
T
-
 
I
G
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
K
R
 
F
D
 
E
H
 
G
L
 
I
T
 
N
E
 
R
A
 
D
T
 
P
S
 
K
A
 
N
A
 
E
G
 
-
G
 
K
V
 
I
R
 
K
Q
 
L
I
 
I
G
 
A
A
 
Y
A
 
A
H
 
D
L
 
E
K
 
K
D
 
E
G
 
V
V
 
W
I
 
V
R
 
K
P
 
P
S
 
L
V
 
-
S
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
P
D
 
I
H
 
S
G
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
S
 
N
T
 
-
L
 
V
R
 
D
G
 
G
E
 
V
G
 
E
N
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
E
V
 
I
Y
 
-
G
 
T
A
 
T
D
 
D
G
 
I
R
 
Q
V
 
S
W
 
I
R
 
L
C
 
I
R
 
R
G
 
G
R
 
P
G
 
G
A
|
A
G
|
G
R
 
P
W
 
V
A
 
N
T
x
A
T
 
A
E
 
Y
S
 
G
I
 
A
M
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
L
I
 
L
V
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4xb1A Hyperthermophilic archaeal homoserine dehydrogenase in complex with NADPH (see paper)
29% identity, 27% coverage: 325:483/583 of query aligns to 71:229/319 of 4xb1A

query
sites
4xb1A
L
 
V
F
 
Y
T
 
N
S
 
F
N
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
E
L
 
L
W
 
V
A
 
E
K
 
E
-
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
I
V
 
L
L
 
V
E
 
D
A
x
V
L
x
S
S
|
S
E
 
W
G
 
D
E
 
E
A
 
A
G
 
-
H
 
H
A
 
E
V
 
M
I
 
Y
R
 
K
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
G
A
 
E
G
 
G
C
 
I
D
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
T
A
x
S
N
 
N
K
|
K
Q
 
P
A
 
P
V
 
I
S
 
A
R
 
N
D
 
Y
P
 
Y
G
 
D
G
 
E
L
 
L
Q
 
M
E
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
N
 
N
G
 
N
R
 
A
R
 
G
M
 
I
F
 
F
W
 
F
S
 
E
A
x
S
S
 
T
V
 
V
G
 
M
G
 
A
G
 
G
S
 
T
P
 
P
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
E
A
 
N
R
 
L
A
 
L
A
 
G
G
 
E
E
 
N
V
 
I
V
 
K
G
 
R
F
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
N
G
 
A
T
 
S
V
 
T
N
 
T
F
 
F
M
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
K
L
 
M
G
 
S
D
 
E
G
 
G
A
 
K
A
 
T
F
 
L
N
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
S
A
 
L
G
 
G
F
 
I
A
 
L
E
 
E
E
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
S
S
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
D
G
 
G
L
 
I
D
|
D
A
 
A
A
 
Y
A
 
Y
K
|
K
V
 
A
R
 
K
L
 
I
L
 
L
C
 
H
H
 
W
E
 
V
A
 
S
F
 
Y
G
 
G
R
 
E
S
 
P
P
 
P
D
 
E

Sites not aligning to the query:

O58802 Homoserine dehydrogenase; HDH; HSD; HseDH; EC 1.1.1.3 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see paper)
29% identity, 27% coverage: 325:483/583 of query aligns to 71:229/319 of O58802

query
sites
O58802
L
 
V
F
 
Y
T
 
N
S
 
F
N
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
E
L
 
L
W
 
V
A
 
E
K
 
E
-
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
I
V
 
L
L
 
V
E
 
D
A
 
V
L
x
S
S
|
S
E
 
W
G
 
D
E
 
E
A
 
A
G
 
-
H
 
H
A
 
E
V
 
M
I
 
Y
R
 
K
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
G
A
 
E
G
 
G
C
 
I
D
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
T
A
x
S
N
 
N
K
|
K
Q
 
P
A
 
P
V
 
I
S
 
A
R
 
N
D
 
Y
P
 
Y
G
 
D
G
 
E
L
 
L
Q
 
M
E
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
N
 
N
G
 
N
R
 
A
R
 
G
M
 
I
F
 
F
W
 
F
S
x
E
A
 
S
S
 
T
V
|
V
G
 
M
G
x
A
G
 
G
S
x
T
P
 
P
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
E
A
 
N
R
 
L
A
 
L
A
 
G
G
 
E
E
 
N
V
 
I
V
 
K
G
 
R
F
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
N
G
 
A
T
 
S
V
 
T
N
 
T
F
 
F
M
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
K
L
 
M
G
 
S
D
 
E
G
 
G
A
 
K
A
 
T
F
 
L
N
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
S
A
 
L
G
 
G
F
 
I
A
 
L
E
 
E
E
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
S
S
 
K
D
 
D
L
 
I
E
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
Y
A
 
Y
K
 
K
V
 
A
R
 
K
L
 
I
L
 
L
C
 
H
H
 
W
E
 
V
A
 
S
F
 
Y
G
 
G
R
 
E
S
 
P
P
 
P
D
 
E

Sites not aligning to the query:

4xb2A Hyperthermophilic archaeal homoserine dehydrogenase mutant in complex with NADPH (see paper)
29% identity, 27% coverage: 325:483/583 of query aligns to 71:229/319 of 4xb2A

query
sites
4xb2A
L
 
V
F
 
Y
T
 
N
S
 
F
N
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
E
L
 
L
W
 
V
A
 
E
K
 
E
-
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
I
V
 
L
L
 
V
E
 
D
A
x
V
L
x
S
S
|
S
E
 
W
G
 
D
E
 
E
A
 
A
G
 
-
H
 
H
A
 
E
V
 
M
I
 
Y
R
 
K
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
G
A
 
E
G
 
G
C
 
I
D
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
T
A
x
S
N
|
N
K
|
K
Q
 
P
A
 
P
V
 
I
S
 
A
R
 
N
D
 
Y
P
 
Y
G
 
D
G
 
E
L
 
L
Q
 
M
E
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
N
 
N
G
 
N
R
 
A
R
 
G
M
 
I
F
 
F
W
 
F
S
 
E
A
x
S
S
 
T
V
 
V
G
 
M
G
 
A
G
 
G
S
 
T
P
 
P
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
E
A
 
N
R
 
L
A
 
L
A
 
G
G
 
E
E
 
N
V
 
I
V
 
K
G
 
R
F
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
N
G
x
A
T
x
S
V
 
T
N
 
T
F
 
F
M
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
K
L
 
M
G
 
S
D
 
E
G
 
G
A
 
K
A
 
T
F
 
L
N
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
S
A
 
L
G
 
G
F
 
I
A
 
L
E
 
E
E
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
S
S
 
K
D
|
D
L
 
I
E
 
D
G
 
G
L
 
I
D
|
D
A
 
A
A
 
Y
A
 
Y
K
|
K
V
 
A
R
 
K
L
 
I
L
 
L
C
 
H
H
 
W
E
 
V
A
 
S
F
 
Y
G
 
G
R
 
E
S
 
P
P
 
P
D
 
E

Sites not aligning to the query:

6dzsA Mycobacterial homoserine dehydrogenase thra in complex with NADP
34% identity, 38% coverage: 278:497/583 of query aligns to 4:233/431 of 6dzsA

query
sites
6dzsA
P
 
P
L
 
I
K
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
L
G
|
G
C
x
L
G
|
G
V
x
N
V
|
V
G
 
G
G
 
S
G
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
-
K
 
R
L
 
I
L
 
I
N
 
D
D
 
E
P
 
S
R
 
A
Y
 
T
E
 
D
V
 
L
V
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
G
V
|
V
R
|
R
N
x
R
P
 
V
K
 
S
K
 
A
A
 
D
R
|
R
D
 
G
V
 
V
D
 
-
C
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
T
S
 
D
N
 
N
P
x
I
A
 
E
D
 
E
L
 
L
W
 
V
A
 
S
K
 
R
K
 
D
P
 
D
-
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
E
A
x
L
L
x
M
S
 
G
E
 
P
G
 
V
E
 
E
A
x
P
G
 
A
H
 
R
A
 
K
V
 
A
I
 
I
R
 
L
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
C
 
K
D
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
T
A
|
A
N
 
N
K
|
K
Q
 
A
A
 
L
V
 
M
S
 
S
R
 
V
D
 
S
P
 
T
G
 
G
G
 
E
L
 
L
Q
 
A
E
 
Q
L
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
A
N
 
A
G
 
H
R
 
V
R
 
D
M
 
L
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
I
P
 
P
M
 
V
I
 
I
E
 
R
T
 
P
V
 
L
R
 
T
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
D
E
 
T
V
 
V
V
 
T
G
 
R
F
 
V
E
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
V
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
T
N
 
N
F
 
Y
M
 
I
L
 
L
E
 
S
R
 
A
L
 
M
-
 
D
G
 
S
D
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
D
F
 
Y
N
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
A
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
A
R
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
A
H
 
S
E
 
I
A
 
A
F
 
F
-
 
H
G
 
T
R
 
R
S
 
V
P
 
T
D
 
A
G
 
D
D
 
D
V
 
V
P
 
Y
R
 
R
D
 
E
H
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
K
A
 
V
T
 
T
S
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5yeiC Mechanistic insight into the regulation of pseudomonas aeruginosa aspartate kinase (see paper)
34% identity, 31% coverage: 29:209/583 of query aligns to 2:182/397 of 5yeiC

query
sites
5yeiC
V
 
L
V
 
I
V
 
V
L
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
S
 
G
S
 
T
I
 
S
L
 
V
R
 
G
S
 
T
P
 
V
A
 
E
E
 
R
A
 
I
P
 
E
L
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
E
A
 
K
V
 
V
Y
 
K
G
 
K
H
 
F
V
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
D
K
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
M
G
 
S
G
 
G
A
 
E
T
 
T
D
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
R
 
N
A
 
Q
L
 
I
G
 
M
L
 
E
A
 
Q
H
 
P
S
 
V
N
 
P
D
 
R
L
 
E
L
 
L
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
V
 
V
A
 
S
L
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
Q
K
 
V
S
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
I
 
M
A
 
A
C
 
L
D
 
I
R
 
K
I
 
R
G
 
G
L
 
V
D
 
P
A
 
A
C
 
V
A
 
S
L
 
Y
S
 
T
V
 
G
R
 
N
E
 
Q
L
 
V
G
 
R
I
 
I
V
 
L
A
 
T
E
 
D
G
 
S
E
 
A
P
 
H
E
 
T
H
 
K
S
 
A
R
 
R
P
 
I
C
 
L
G
 
H
L
 
I
R
 
D
P
 
D
D
 
T
H
 
H
L
 
I
K
 
R
Q
 
A
A
 
D
L
 
L
D
 
K
R
 
A
H
 
G
E
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
Q
A
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
G
D
 
N
G
 
G
K
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
T
T
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
L
G
 
K
L
 
A
K
 
D
K
 
E
V
 
C
R
 
Q
L
 
I
V
 
Y
K
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
H
 
T
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3ingA Crystal structure of homoserine dehydrogenase (np_394635.1) from thermoplasma acidophilum at 1.95 a resolution
27% identity, 34% coverage: 279:479/583 of query aligns to 3:223/319 of 3ingA

query
sites
3ingA
L
 
I
K
 
R
V
 
I
A
 
I
V
 
L
A
 
M
G
|
G
C
x
T
G
|
G
V
x
N
V
|
V
G
 
G
G
 
L
G
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
R
K
 
I
L
 
I
-
 
D
-
 
A
L
 
S
N
 
N
D
 
R
P
 
R
R
 
R
Y
 
F
-
 
S
-
 
I
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
S
-
x
D
V
x
S
R
 
R
N
 
S
P
 
Y
K
 
A
K
 
S
A
 
G
R
 
R
D
 
N
V
 
L
D
 
D
C
 
I
P
 
S
A
 
S
S
 
I
L
 
I
F
 
S
T
 
N
-
x
K
-
 
E
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
F
S
 
S
N
 
G
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
L
W
 
M
A
 
G
K
 
E
K
 
A
P
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
L
L
 
V
E
 
D
-
x
C
-
x
T
-
x
P
A
 
A
L
 
S
S
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
V
A
 
R
G
 
E
H
 
Y
A
 
S
V
 
L
I
 
Y
R
 
R
A
 
M
A
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
S
G
 
G
C
 
M
D
 
N
V
 
V
A
 
V
S
 
T
A
|
A
N
|
N
K
|
K
Q
 
S
A
 
G
V
 
L
S
 
A
R
 
N
D
 
K
P
 
W
G
 
H
G
 
D
L
 
I
Q
 
M
E
 
D
L
 
S
A
 
A
K
 
N
A
 
Q
N
 
N
G
 
S
R
 
K
R
 
Y
M
 
I
F
 
R
W
 
Y
S
 
E
A
|
A
S
 
T
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
V
P
 
P
M
 
L
I
 
F
E
 
S
T
 
V
V
 
L
R
 
D
A
 
Y
A
 
S
R
 
I
A
 
L
A
 
P
G
 
S
E
 
K
V
 
V
V
 
K
G
 
R
F
 
F
E
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
V
N
 
S
G
 
S
T
 
T
V
 
I
N
 
N
F
 
Y
M
 
V
L
 
I
E
 
R
R
 
N
L
 
M
G
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
R
A
 
S
F
 
L
N
 
R
E
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
I
A
 
K
A
 
K
G
 
G
F
 
I
A
 
A
E
|
E
E
x
S
D
 
N
P
 
P
S
 
Q
S
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
G
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
A
A
 
A
A
 
R
K
|
K
V
 
S
R
 
V
L
 
I
L
 
L
C
 
V
H
 
N
E
 
H
A
 
I
F
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P61489 Aspartokinase; Aspartate kinase; AK; ASK; Threonine-sensitive AK; ThrA; EC 2.7.2.4 from Thermus thermophilus (see paper)
32% identity, 31% coverage: 29:210/583 of query aligns to 3:184/405 of P61489

query
sites
P61489
V
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
Q
K
|
K
F
 
Y
G
|
G
S
x
G
S
 
T
I
 
S
L
 
V
R
 
G
S
 
D
P
 
L
A
 
E
E
 
R
A
 
I
P
 
H
L
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
A
 
R
V
 
I
Y
 
A
G
 
H
H
 
Y
V
 
R
R
 
E
A
 
K
G
 
G
R
 
H
K
 
R
V
 
L
V
 
A
A
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
A
|
A
F
 
M
G
 
G
G
 
H
A
 
T
T
|
T
D
 
D
R
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
E
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
N
L
 
P
A
 
R
H
 
P
S
 
P
N
 
F
D
 
R
L
 
E
L
 
L
P
 
D
G
 
L
Y
 
L
V
 
T
A
 
T
L
 
T
G
 
G
E
|
E
E
 
Q
K
 
V
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
I
 
M
A
 
Q
C
 
L
D
 
W
R
 
A
I
 
M
G
 
G
L
 
I
D
 
P
A
 
A
C
 
K
A
 
G
L
 
F
S
 
V
V
 
Q
R
 
H
E
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
T
A
 
T
E
 
D
G
 
G
E
 
R
P
 
Y
E
 
G
H
 
D
S
 
A
R
 
R
P
 
I
C
 
L
G
 
E
L
 
V
R
 
N
P
 
P
D
 
A
H
 
R
L
 
I
K
 
R
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
Q
H
 
G
E
 
F
V
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
P
 
A
G
|
G
F
 
F
G
 
M
A
 
G
V
 
T
R
 
T
P
 
P
D
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
I
A
 
T
L
 
T
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
|
D
L
 
T
T
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
K
K
 
E
V
 
C
R
 
E
L
 
I
V
 
Y
K
 
T
D
|
D
V
 
T
D
 
E
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
H
 
T
D
|
D
P
 
P
N
 
H

P41398 Aspartokinase; Aspartate kinase; EC 2.7.2.4 from Corynebacterium flavescens (see paper)
37% identity, 31% coverage: 29:209/583 of query aligns to 3:184/421 of P41398

query
sites
P41398
V
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
S
 
G
S
 
S
I
 
S
L
 
L
R
 
E
S
 
S
P
 
A
A
 
E
E
 
R
A
 
I
P
 
R
L
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
E
A
 
R
V
 
I
Y
 
V
G
 
A
H
 
T
V
 
K
R
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
N
K
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
C
S
 
S
A
 
A
F
 
M
G
 
G
G
 
D
A
 
T
T
 
T
D
 
D
R
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
E
E
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
V
G
 
N
L
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
P
A
 
A
H
 
R
S
 
E
N
 
M
D
 
D
L
 
M
L
 
L
P
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
L
A
 
T
L
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
R
K
 
I
S
 
S
A
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
A
C
 
I
D
 
E
R
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
A
D
 
E
A
 
A
C
 
Q
A
 
S
L
 
F
S
 
T
V
 
G
R
 
S
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
L
A
 
T
E
 
T
G
 
E
E
 
R
P
 
H
E
 
G
H
 
N
S
 
A
R
 
R
P
 
I
C
 
V
G
 
D
L
 
V
R
 
T
P
 
P
D
 
G
H
 
R
L
 
V
K
 
R
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
E
H
 
G
E
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
P
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
Q
A
 
G
V
 
V
R
 
N
P
 
K
D
 
E
G
 
T
K
 
R
-
 
D
V
 
V
A
 
T
L
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
T
T
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
L
G
 
N
L
 
A
K
 
D
K
 
V
V
 
C
R
 
E
L
 
I
V
 
Y
K
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
H
 
A
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P26512 Aspartokinase; Aspartate kinase; EC 2.7.2.4 from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / JCM 1318 / BCRC 11384 / CCUG 27702 / LMG 3730 / NBRC 12168 / NCIMB 10025 / NRRL B-2784 / 534) (see 2 papers)
37% identity, 31% coverage: 29:209/583 of query aligns to 3:184/421 of P26512

query
sites
P26512
V
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
Q
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
S
 
G
S
 
S
I
 
S
L
 
L
R
 
E
S
 
S
P
 
A
A
 
E
E
 
R
A
 
I
P
 
R
L
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
E
A
 
R
V
 
I
Y
 
V
G
 
A
H
 
T
V
 
K
R
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
N
K
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
C
S
 
S
A
 
A
F
 
M
G
 
G
G
 
D
A
 
T
T
 
T
D
 
D
R
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
E
E
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
V
G
 
N
L
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
P
A
 
A
H
 
R
S
 
E
N
 
M
D
 
D
L
 
M
L
 
L
P
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
L
A
 
T
L
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
R
K
 
I
S
 
S
A
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
A
C
 
I
D
 
E
R
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
A
D
 
E
A
 
A
C
 
Q
A
 
S
L
 
F
S
 
T
V
 
G
R
 
S
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
L
A
 
T
E
 
T
G
 
E
E
 
R
P
 
H
E
 
G
H
 
N
S
 
A
R
 
R
P
 
I
C
 
V
G
 
D
L
 
V
R
 
T
P
 
P
D
 
G
H
 
R
L
 
V
K
 
R
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
E
H
 
G
E
 
K
V
 
I
V
 
C
V
 
I
V
 
V
P
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
Q
A
 
G
V
 
V
R
 
N
P
 
K
D
 
E
G
 
T
K
 
R
-
 
D
V
 
V
A
 
T
L
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
T
T
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
L
G
 
N
L
 
A
K
 
D
K
 
V
V
 
C
R
 
E
L
 
I
V
 
Y
K
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
H
 
A
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3jsaA Homoserine dehydrogenase from thermoplasma volcanium complexed with NAD
29% identity, 25% coverage: 335:481/583 of query aligns to 81:228/321 of 3jsaA

query
sites
3jsaA
A
 
A
K
 
R
K
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
D
A
|
A
L
x
T
-
x
P
-
 
A
-
 
S
S
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
K
A
 
K
G
 
E
H
 
L
A
 
A
V
 
F
I
 
Y
R
 
K
A
 
E
A
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
N
G
 
G
C
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
V
S
 
T
A
|
A
N
|
N
K
 
K
Q
 
S
A
 
G
V
 
L
S
 
A
R
 
N
D
 
F
P
 
W
G
 
P
G
 
E
L
 
I
Q
 
M
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
K
 
R
A
 
S
N
 
N
G
 
N
R
 
R
R
 
R
M
 
I
F
 
R
W
 
Y
S
 
E
A
|
A
S
 
T
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
V
P
 
P
M
 
L
I
 
F
E
 
S
T
 
F
V
 
I
R
 
D
A
 
Y
A
 
S
R
 
V
A
 
L
A
 
P
G
 
S
E
 
R
V
 
I
V
 
K
G
 
K
F
 
F
E
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
V
N
 
S
G
 
L
T
 
T
V
 
I
N
 
N
F
 
Y
M
 
F
L
 
I
E
 
R
R
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
N
G
 
K
A
 
R
A
 
E
F
 
F
N
 
D
E
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
K
A
 
L
G
 
G
F
 
I
A
 
V
E
 
-
E
 
-
D
 
N
P
 
Y
S
 
K
S
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
T
G
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
A
A
 
A
A
 
R
K
|
K
V
 
S
R
 
V
L
 
I
L
 
L
C
 
C
H
 
N
E
 
H
A
 
L
F
 
Y
G
 
G
R
 
S
S
 
S

Sites not aligning to the query:

O81852 Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2, chloroplastic; AK-HD 2; AK-HSDH 2; Beta-aspartyl phosphate homoserine 2; EC 2.7.2.4; EC 1.1.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 22% coverage: 359:487/583 of query aligns to 662:794/916 of O81852

query
sites
O81852
L
 
L
E
 
R
A
 
K
G
 
G
C
 
I
D
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
T
A
 
P
N
 
N
K
 
K
Q
 
K
A
 
A
V
 
N
S
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
L
R
 
D
D
 
Q
P
 
Y
G
 
L
G
 
K
L
 
L
Q
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
Q
K
 
R
A
 
K
N
 
S
G
 
Y
R
 
T
R
 
H
M
 
Y
F
 
F
W
 
Y
S
 
E
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
L
P
 
P
M
 
I
I
 
I
E
 
S
T
 
T
V
 
L
R
 
R
A
 
G
A
 
L
R
 
L
A
 
E
A
 
T
G
 
G
E
 
D
-
 
K
V
 
I
V
 
L
G
 
R
F
 
I
E
 
E
A
 
G
V
 
I
L
 
C
N
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
L
N
 
S
F
 
Y
M
 
L
L
 
F
E
 
N
R
 
N
L
 
F
G
 
V
D
 
G
G
 
D
A
 
R
A
 
S
F
 
F
N
 
S
E
 
E
A
 
V
L
 
V
A
 
T
D
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
P
D
 
D
P
 
P
S
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
T
D
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
R
K
 
K
V
 
V
R
 
I
L
 
I
L
 
L
C
 
A
H
 
R
E
 
E
A
 
S
F
 
G
G
 
L
R
 
K
S
 
L
P
 
D
D
 
L
G
 
A
D
 
D
V
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3l76A Crystal structure of aspartate kinase from synechocystis (see paper)
33% identity, 31% coverage: 29:209/583 of query aligns to 2:173/585 of 3l76A

query
sites
3l76A
V
 
L
V
 
I
V
 
V
L
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
S
 
G
S
 
T
I
 
S
L
 
V
R
 
G
S
 
T
P
 
V
A
 
E
E
 
R
A
 
I
P
 
Q
L
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
A
 
R
V
 
I
Y
 
K
G
 
R
H
 
T
V
 
V
R
 
Q
A
 
G
G
 
G
R
 
N
K
 
S
V
 
L
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
M
G
 
G
G
 
K
A
 
S
T
 
T
D
 
D
R
 
V
L
 
L
L
 
V
G
 
D
E
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
L
 
I
G
 
S
L
 
P
A
 
N
H
 
P
S
 
C
N
 
R
D
 
R
L
 
E
L
 
M
P
 
D
G
 
M
Y
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
Q
K
 
V
S
 
S
A
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
I
 
L
A
 
A
C
 
L
D
 
Q
R
 
E
I
 
I
G
 
D
L
 
Q
D
 
P
A
 
A
C
 
I
A
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
G
R
 
A
E
 
Q
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
V
A
 
T
E
 
E
G
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
I
C
 
L
G
 
E
L
 
I
R
 
R
P
 
P
D
 
D
H
 
R
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
H
L
 
L
D
 
R
R
 
E
H
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
Q
A
 
G
V
 
I
R
 
H
P
 
L
D
 
E
G
 
-
K
 
-
V
 
I
A
 
T
L
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
T
T
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
L
G
 
K
L
 
A
K
 
D
K
 
F
V
 
C
R
 
E
L
 
I
V
 
Y
K
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
P
G
 
G
L
 
I
Y
 
L
D
 
T
H
 
T
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_066549662.1 NCBI__GCF_001636925.1:WP_066549662.1
MSAQLAVVEKSESLGPSSQPSPDLVGPEVVVLKFGSSILRSPAEAPLVASAVYGHVRAGR
KVVAVVSAFGGATDRLLGEARALGLAHSNDLLPGYVALGEEKSAALVAIACDRIGLDACA
LSVRELGIVAEGEPEHSRPCGLRPDHLKQALDRHEVVVVPGFGAVRPDGKVALLGRGGSD
LTAVFLAAELGLKKVRLVKDVDGLYDHDPNDKTAPALRYRRASWDVARKLGGALVQHDAI
DLGESRGVEIEVAALDRADGTVIGDRSAPPGPAPALPPLKVAVAGCGVVGGGVLGKLLND
PRYEVVGVLVRNPKKARDVDCPASLFTSNPADLWAKKPDVVLEALSEGEAGHAVIRAALE
AGCDVASANKQAVSRDPGGLQELAKANGRRMFWSASVGGGSPMIETVRAARAAGEVVGFE
AVLNGTVNFMLERLGDGAAFNEALADARAAGFAEEDPSSDLEGLDAAAKVRLLCHEAFGR
SPDGDVPRDHLTEATSAAGGVRQIGAAHLKDGVIRPSVSLNADHGDPLFSTLRGEGNALK
VYGADGRVWRCRGRGAGRWATTESIMADLAEIVRARRADAGLN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory