SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_066918130.1 NCBI__GCF_001579945.1:WP_066918130.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

3vayA Crystal structure of 2-haloacid dehalogenase from pseudomonas syringae pv. Tomato dc3000 (see paper)
38% identity, 86% coverage: 2:204/237 of query aligns to 1:206/230 of 3vayA

query
sites
3vayA
V
 
M
V
 
I
R
 
K
A
 
L
V
 
V
C
 
T
F
 
F
D
|
D
L
 
L
D
|
D
N
 
D
T
 
T
L
 
L
W
 
W
D
 
D
V
 
T
R
 
A
P
 
P
V
 
A
I
 
I
R
 
V
R
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
M
 
L
Y
 
R
D
 
D
L
 
W
L
 
L
A
 
A
T
 
E
R
 
Q
Y
 
A
P
 
P
R
 
K
V
 
L
V
 
-
A
 
G
A
 
P
L
 
V
T
 
P
A
 
V
E
 
E
D
 
H
L
 
L
R
 
W
E
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
S
R
 
R
I
 
L
A
 
L
E
 
D
T
 
E
F
 
D
P
 
P
Q
 
S
M
 
F
R
 
K
H
 
H
D
 
R
F
 
I
T
 
S
F
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
R
 
F
D
 
H
H
 
A
A
 
L
R
 
E
D
 
D
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
-
 
D
-
 
S
-
 
D
-
 
E
P
 
A
E
 
Q
I
 
Q
M
 
L
V
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
S
F
 
F
A
 
E
A
 
V
F
 
F
I
 
L
R
 
H
A
 
G
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
Q
L
 
I
Y
 
F
P
 
P
D
 
E
V
 
V
R
 
Q
P
 
P
G
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
I
L
 
L
F
 
A
A
 
K
Q
 
T
Y
 
F
R
 
T
L
 
L
F
 
G
T
 
V
V
 
I
T
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
A
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
R
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
H
 
D
Y
 
Y
F
 
F
E
 
A
R
 
F
M
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
A
R
 
E
Q
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
I
L
 
G
K
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
A
I
 
P
F
 
F
R
 
L
Q
 
E
V
 
A
V
 
L
A
 
R
G
 
R
S
 
A
G
 
K
L
 
V
A
 
D
L
 
A
H
 
S
E
 
A
V
 
A
V
 
V
Y
 
H
V
 
V
G
 
G
D
|
D
D
 
H
P
 
P
E
 
S
L
 
D
D
 
D
V
 
I
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
M
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
W
 
W
M
 
Y
N
 
N
R
 
P
D
 
Q
D
 
G
A
 
K
R
 
A
W
 
W

4ygrA Crystal structure of had phosphatase from thermococcus onnurineus (see paper)
28% identity, 95% coverage: 3:227/237 of query aligns to 1:212/215 of 4ygrA

query
sites
4ygrA
V
 
M
R
 
K
A
 
A
V
 
V
C
 
L
F
 
F
D
|
D
L
 
I
D
|
D
N
 
G
T
 
T
L
 
I
W
 
L
D
 
T
V
x
E
R
 
E
P
 
P
V
 
L
I
 
I
R
 
M
R
 
L
A
 
F
E
 
L
Q
 
P
A
 
Q
M
 
V
Y
 
Y
D
 
D
L
 
K
L
 
L
A
 
S
T
 
R
R
 
K
Y
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
G
L
 
I
T
 
S
A
x
K
E
 
D
D
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
E
A
 
A
R
 
R
V
 
E
R
 
R
I
 
F
A
 
L
E
 
S
T
 
E
F
 
I
P
x
L
Q
 
G
M
 
R
R
|
R
-
 
D
-
 
S
-
 
Y
-
 
D
-
x
W
H
 
H
D
 
D
F
x
W
T
 
N
F
 
F
L
 
F
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
F
R
 
K
D
 
L
H
 
F
A
 
D
R
 
L
D
 
D
F
 
L
G
 
K
Y
 
Y
P
 
E
E
 
E
I
 
L
M
 
L
V
 
E
E
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
I
 
-
R
 
R
A
 
Y
R
 
P
N
 
H
Q
 
K
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
T
R
 
I
P
 
P
G
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
W
L
 
L
F
 
R
-
 
D
A
 
T
Q
 
G
Y
 
Y
R
 
K
L
 
L
F
 
G
T
 
I
V
 
V
T
|
T
N
x
S
G
|
G
-
 
P
-
 
K
-
 
Y
-
 
Q
N
 
R
A
 
L
D
 
K
L
 
L
E
 
K
Q
 
L
I
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
L
H
 
D
Y
 
Y
F
 
F
E
 
D
R
 
V
M
 
V
L
 
I
A
 
T
A
 
R
R
 
D
Q
 
D
A
 
V
G
 
N
A
 
A
L
 
I
K
|
K
P
 
P
D
 
E
P
 
P
A
 
K
I
 
I
F
 
F
R
 
L
Q
 
Y
V
 
T
V
 
I
A
 
E
G
 
R
S
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
E
L
 
P
H
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
V
Y
 
M
V
 
V
G
|
G
D
|
D
D
 
S
P
x
L
E
 
S
L
x
Q
D
|
D
V
 
V
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
K
R
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
M
Q
 
T
A
 
A
I
 
V
W
 
W
M
 
I
N
 
N
R
 
R
D
 
N
D
 
G
A
 
D
R
 
R
W
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
G
L
 
Y
E
 
N
Q
 
M
P
 
A
V
 
D
H
 
Y
M
 
E
V
 
I
R
 
R
S
 
T
V
 
L
V
 
Y
D
 
E
L
 
L
I
 
R
P
 
K
L
 
I
L
 
L
S
 
G
A
 
G

4knvA The crystal structure of apo human hdhd4 from se-mad (see paper)
28% identity, 95% coverage: 3:228/237 of query aligns to 1:235/241 of 4knvA

query
sites
4knvA
V
 
M
R
 
R
A
 
A
V
 
V
C
 
F
F
 
F
D
|
D
L
|
L
D
|
D
N
 
N
T
 
T
L
 
L
W
 
I
D
 
D
V
 
T
R
 
A
P
 
G
V
 
A
I
 
S
R
 
R
R
 
R
A
 
G
E
 
M
Q
 
L
A
 
E
M
 
V
Y
 
I
D
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
R
 
K
Y
 
Y
P
 
H
R
 
Y
V
 
K
V
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
E
T
 
I
A
 
I
E
 
C
D
 
D
L
 
K
R
 
V
E
 
Q
A
 
V
R
 
K
V
 
L
R
 
S
I
 
-
A
 
K
E
 
E
T
 
C
F
 
F
P
 
H
Q
 
P
M
 
Y
R
 
N
H
 
T
D
 
C
F
 
I
T
 
T
F
 
D
L
 
L
R
 
R
-
 
T
-
 
S
-
 
H
-
 
W
Q
 
E
Q
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
D
 
E
H
 
-
A
 
T
R
 
K
D
 
G
F
 
G
G
 
A
Y
 
A
P
 
N
E
 
R
I
 
K
M
 
L
V
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
C
F
 
Y
A
 
F
A
 
L
F
 
W
I
 
K
R
 
S
A
 
T
R
 
R
N
 
L
Q
 
Q
-
 
H
V
 
M
E
 
T
L
 
L
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
K
P
 
A
G
 
M
L
 
L
D
 
T
L
 
E
L
 
L
F
 
R
A
 
K
Q
 
E
Y
 
V
R
 
R
L
 
L
F
 
L
T
 
L
V
 
L
T
|
T
N
|
N
G
 
G
N
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
Q
-
 
R
A
 
E
D
 
K
L
 
I
E
 
E
Q
 
A
I
 
C
G
 
A
L
 
C
A
 
Q
H
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
D
R
 
A
M
 
V
L
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
G
Q
 
E
A
 
Q
G
 
R
A
 
E
L
 
E
K
|
K
P
 
P
D
 
A
P
 
P
A
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
Y
Q
 
Y
V
 
C
V
 
C
A
 
N
G
 
L
S
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
Q
L
 
P
H
 
G
E
 
D
V
 
C
V
 
V
Y
 
M
V
 
V
G
 
G
D
|
D
D
 
T
P
 
L
E
 
E
L
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
Q
G
 
G
A
 
G
R
 
L
R
 
N
A
 
A
G
 
G
M
 
L
Q
 
K
A
 
A
-
 
T
I
 
V
W
 
W
M
 
I
N
 
N
R
 
K
D
 
N
D
 
G
A
 
I
R
 
V
W
 
P
P
 
L
S
 
K
G
 
S
L
 
S
E
 
P
Q
 
V
P
 
P
V
 
H
H
 
Y
M
 
M
V
 
V
R
 
S
S
 
S
V
 
V
V
 
L
D
 
E
L
 
L
I
 
P
P
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
A
 
S
L
 
I

6q7oA Crystal structure of oe1 (see paper)
27% identity, 84% coverage: 2:199/237 of query aligns to 1:201/230 of 6q7oA

query
sites
6q7oA
V
 
M
V
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
C
 
F
F
 
F
D
|
D
L
 
S
D
x
L
N
 
G
T
 
T
L
 
L
W
 
N
D
 
S
V
 
V
R
 
E
P
 
G
V
 
A
I
 
A
R
 
K
R
 
S
A
 
H
E
 
L
Q
 
K
A
 
I
M
 
M
Y
 
E
D
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
G
T
 
D
R
 
-
Y
 
Y
P
 
P
R
 
L
V
 
N
V
 
P
A
 
K
A
 
T
L
 
L
T
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
Y
L
 
E
R
 
K
E
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
E
R
 
A
I
 
F
A
 
S
E
 
N
T
 
Y
F
 
A
P
 
G
Q
 
K
M
 
P
R
 
Y
H
 
R
D
 
P
F
 
L
T
 
R
F
 
D
L
 
I
R
 
L
Q
 
E
Q
 
E
A
 
V
L
 
M
R
 
R
D
 
K
H
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
-
 
F
-
 
K
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
I
 
N
M
 
F
V
 
W
E
 
E
E
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
I
A
 
S
F
 
L
I
 
R
R
 
M
A
 
S
R
 
Q
N
 
R
Q
 
Y
V
 
G
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
E
G
 
V
L
 
L
D
 
K
L
 
S
L
 
L
F
 
K
A
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
R
 
H
L
 
V
F
 
G
T
 
M
V
 
I
T
 
T
N
 
D
G
 
S
N
 
D
A
 
T
D
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
M
-
 
A
-
 
F
L
 
L
E
 
D
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
K
H
 
D
Y
 
L
F
 
F
E
 
D
R
 
S
M
 
I
L
 
T
A
 
T
A
 
S
R
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
F
L
 
F
K
 
K
P
 
P
D
 
H
P
 
P
A
 
R
I
 
I
F
 
F
R
 
E
Q
 
L
V
 
A
V
 
L
A
 
K
G
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
K
L
 
G
H
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
|
D
D
 
N
P
 
P
E
 
V
L
 
K
D
 
D
V
 
C
E
 
G
G
 
G
A
 
S
R
 
K
R
 
N
A
 
L
G
 
G
M
 
M
Q
 
T
A
 
S
I
 
I
W
 
L
M
 
L
N
 
D
R
 
R

6q7nA Crystal structure of bh32 alkylated with the mechanistic inhibitor 2- bromoacetophenone (see paper)
27% identity, 84% coverage: 2:199/237 of query aligns to 1:201/230 of 6q7nA

query
sites
6q7nA
V
 
M
V
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
C
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
S
D
 
L
N
 
G
T
 
T
L
 
L
W
 
N
D
 
S
V
 
V
R
 
E
P
 
G
V
 
A
I
 
A
R
 
K
R
 
S
A
x
H
E
 
L
Q
 
K
A
 
I
M
 
M
Y
 
E
D
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
G
T
 
D
R
 
-
Y
 
Y
P
 
P
R
 
L
V
 
N
V
 
P
A
 
K
A
 
T
L
 
L
T
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
Y
L
 
E
R
 
K
E
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
E
R
 
A
I
 
F
A
 
S
E
 
N
T
 
Y
F
 
A
P
 
G
Q
 
K
M
 
P
R
 
Y
H
 
R
D
 
P
F
 
L
T
 
R
F
 
D
L
 
I
R
x
L
Q
 
E
Q
 
E
A
 
V
L
 
M
R
 
R
D
 
K
H
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
-
 
F
-
 
K
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
I
 
N
M
 
F
V
x
W
E
 
E
E
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
I
A
x
S
F
x
L
I
 
R
R
 
M
A
x
S
R
 
Q
N
 
R
Q
 
Y
V
 
G
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
E
G
 
V
L
 
L
D
 
K
L
 
S
L
 
L
F
 
K
A
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
R
 
H
L
 
V
F
 
G
T
 
M
V
 
I
T
 
T
N
 
D
G
 
S
N
 
D
A
 
T
D
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
M
-
 
A
-
 
F
L
 
L
E
 
D
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
K
H
 
D
Y
 
L
F
 
F
E
 
D
R
 
S
M
 
I
L
 
T
A
 
T
A
 
S
R
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
F
L
 
F
K
 
K
P
 
P
D
 
H
P
 
P
A
 
R
I
 
I
F
 
F
R
 
E
Q
 
L
V
 
A
V
 
L
A
 
K
G
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
K
L
 
G
H
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
N
P
 
P
E
 
V
L
 
K
D
 
D
V
 
C
E
 
G
G
 
G
A
 
S
R
 
K
R
 
N
A
 
L
G
 
G
M
 
M
Q
 
T
A
 
S
I
 
I
W
 
L
M
 
L
N
 
D
R
 
R

8bp1A Crystal structure of bhmehis1.0, an engineered enzyme for the morita- baylis-hillman reaction (see paper)
27% identity, 85% coverage: 2:203/237 of query aligns to 1:205/231 of 8bp1A

query
sites
8bp1A
V
 
M
V
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
C
 
F
F
 
F
D
|
D
L
 
S
D
x
L
N
 
G
T
 
T
L
 
L
W
 
I
D
 
S
V
 
V
R
 
E
P
 
G
V
 
A
I
 
Y
R
 
K
R
 
V
A
 
H
E
 
L
Q
 
K
A
 
I
M
 
M
Y
 
E
D
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
G
T
 
D
R
 
-
Y
 
Y
P
 
P
R
 
L
V
 
N
V
 
P
A
 
K
A
 
T
L
 
L
T
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
Y
L
 
E
R
 
K
E
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
E
R
 
A
I
 
F
A
 
S
E
 
N
T
 
Y
F
 
A
P
 
G
Q
 
K
M
 
P
R
 
Y
H
 
R
D
 
P
F
 
L
T
 
R
F
 
D
L
 
I
R
 
L
Q
 
E
Q
 
E
A
 
V
L
 
M
R
 
R
D
 
K
H
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
-
 
F
-
 
K
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
I
 
N
M
 
L
V
 
W
E
 
E
E
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
I
A
 
S
F
 
L
I
 
R
R
 
M
A
 
A
R
 
Q
N
 
R
Q
 
Y
V
 
G
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
V
 
V
R
 
V
P
 
E
G
 
V
L
 
L
D
 
K
L
 
S
L
 
L
F
 
K
A
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
R
 
H
L
 
V
F
 
G
T
 
V
V
 
I
T
x
L
N
|
N
-
x
R
-
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
P
G
 
A
N
 
T
A
 
A
D
 
F
L
 
L
E
 
D
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
K
H
 
D
Y
 
L
F
 
F
E
 
D
R
 
S
M
 
I
L
 
T
A
 
T
A
 
S
R
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
F
L
 
F
K
 
K
P
 
P
D
 
H
P
 
P
A
 
R
I
 
I
F
 
F
R
 
E
Q
 
L
V
 
A
V
 
L
A
 
K
G
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
K
L
 
G
H
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
|
D
D
 
N
P
 
P
E
 
V
L
 
K
D
 
D
V
 
A
E
 
G
G
 
G
A
 
S
R
 
K
R
 
N
A
 
L
G
 
G
M
 
M
Q
 
T
A
 
S
I
 
I
W
 
L
M
 
L
N
 
D
R
 
R
D
 
K
D
 
G
A
 
E
R
 
K

3qnmA Haloalkane dehalogenase family member from bacteroides thetaiotaomicron of unknown function
27% identity, 95% coverage: 1:225/237 of query aligns to 1:230/231 of 3qnmA

query
sites
3qnmA
M
 
L
V
 
K
V
 
Y
R
 
K
A
 
N
V
 
L
C
 
F
F
 
F
D
|
D
L
 
L
D
|
D
N
 
D
T
 
T
L
 
I
W
 
W
-
 
A
-
 
F
-
 
S
-
 
R
D
 
N
V
 
A
R
 
R
P
 
D
V
 
T
I
 
F
R
 
E
R
 
E
A
 
V
E
 
Y
Q
 
Q
A
 
K
M
 
Y
-
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
D
-
 
S
Y
 
F
D
 
D
L
 
H
L
 
Y
A
 
Y
T
 
T
R
 
L
Y
 
Y
P
 
Q
R
 
R
V
 
R
V
 
N
A
 
T
A
 
E
L
 
L
T
 
W
A
 
L
E
 
E
D
 
-
L
 
Y
R
 
G
E
 
E
A
 
G
R
 
K
V
 
V
R
 
T
I
 
K
A
 
E
E
 
E
T
 
L
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
M
 
N
R
 
R
H
 
Q
D
 
R
F
 
F
T
 
F
F
 
Y
-
 
P
L
 
L
R
 
Q
Q
 
A
Q
 
V
A
 
G
L
 
V
R
 
E
D
 
D
H
 
E
A
 
A
R
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
L
P
 
A
E
 
E
I
 
R
M
 
F
V
 
S
E
 
E
E
 
D
A
 
F
F
 
F
A
 
A
A
 
I
F
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
I
R
 
P
N
 
T
Q
 
K
V
 
S
E
 
G
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
D
 
H
V
 
A
R
 
K
P
 
E
G
 
V
L
 
L
D
 
E
L
 
Y
L
 
L
F
 
A
A
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
R
 
N
L
 
L
F
 
Y
T
 
I
V
 
L
T
 
S
N
 
N
G
 
G
N
 
F
A
 
R
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
R
Q
 
S
I
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
D
H
 
R
Y
 
Y
F
 
F
E
 
K
R
 
K
M
 
I
L
 
I
A
 
L
A
 
S
R
 
E
Q
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
P
D
 
R
P
 
P
A
 
E
I
 
I
F
 
F
R
 
H
Q
 
F
V
 
A
V
 
L
A
 
S
G
 
A
S
 
T
G
 
Q
L
 
S
A
 
E
L
 
L
H
 
R
E
 
E
V
 
S
V
 
L
Y
 
M
V
 
I
G
 
G
D
|
D
D
 
S
P
 
W
E
 
E
L
 
A
D
 
D
V
 
I
E
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
H
R
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
M
-
 
H
Q
 
Q
A
 
A
I
 
F
W
 
Y
M
 
N
N
 
V
R
 
T
D
 
E
D
 
R
A
 
T
R
 
V
W
 
F
P
 
P
S
 
F
G
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
 
Q
P
 
P
V
 
T
H
 
Y
M
 
H
V
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
L
V
 
K
D
 
E
L
 
L
I
 
M
P
 
N
L
 
L
L
 
L

2no5B Crystal structure analysis of a dehalogenase with intermediate complex (see paper)
27% identity, 56% coverage: 95:226/237 of query aligns to 88:224/226 of 2no5B

query
sites
2no5B
F
 
L
I
 
M
R
 
S
A
 
A
R
 
Y
N
 
K
Q
 
E
V
 
L
E
 
S
L
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
A
R
 
A
P
 
E
G
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
K
L
 
L
-
 
K
F
 
S
A
 
A
Q
 
G
Y
 
Y
R
 
I
L
 
V
F
 
A
T
 
I
V
 
L
T
x
S
N
|
N
G
 
G
N
 
N
A
 
D
D
 
E
L
 
M
E
 
L
Q
 
Q
I
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
D
H
 
R
Y
 
V
F
 
L
E
 
D
R
 
S
M
 
C
L
 
L
A
 
S
A
 
A
R
 
D
Q
 
D
A
 
L
G
 
K
A
 
I
L
 
Y
K
|
K
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
R
I
 
I
F
 
Y
R
 
Q
Q
 
F
V
 
A
V
 
C
A
 
D
G
 
R
S
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
N
L
 
P
H
 
N
E
 
E
V
 
V
V
 
C
Y
 
F
V
 
V
G
x
S
D
 
S
D
x
N
P
x
A
E
 
-
L
x
W
D
|
D
V
 
L
E
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
G
R
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
F
Q
 
N
A
 
T
I
 
V
W
 
R
M
 
I
N
 
N
R
 
R
D
 
Q
D
 
G
A
 
N
R
 
P
W
 
P
P
 
E
S
 
Y
G
 
E
L
 
F
E
 
A
Q
 
P
P
 
L
V
 
K
H
 
H
M
 
Q
V
 
V
R
 
N
S
 
S
V
 
L
V
 
S
D
 
E
L
 
L
I
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
L
S
 
A

Sites not aligning to the query:

Q51645 (S)-2-haloacid dehalogenase 4A; 2-haloalkanoic acid dehalogenase IVA; Halocarboxylic acid halidohydrolase IVA; L-2-haloacid dehalogenase IVA; EC 3.8.1.2 from Burkholderia cepacia (Pseudomonas cepacia) (see 2 papers)
27% identity, 56% coverage: 95:226/237 of query aligns to 88:224/231 of Q51645

query
sites
Q51645
F
 
L
I
 
M
R
 
S
A
 
A
R
 
Y
N
 
K
Q
 
E
V
 
L
E
 
S
L
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
A
R
 
A
P
 
E
G
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
K
L
 
L
-
 
K
F
 
S
A
 
A
Q
 
G
Y
 
Y
R
 
I
L
 
V
F
 
A
T
 
I
V
 
L
T
x
S
N
|
N
G
 
G
N
 
N
A
 
D
D
 
E
L
 
M
E
 
L
Q
 
Q
I
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
D
H
 
R
Y
 
V
F
 
L
E
 
D
R
 
S
M
 
C
L
 
L
A
 
S
A
 
A
R
 
D
Q
 
D
A
 
L
G
 
K
A
 
I
L
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
R
I
 
I
F
 
Y
R
 
Q
Q
 
F
V
 
A
V
 
C
A
 
D
G
 
R
S
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
N
L
 
P
H
 
N
E
 
E
V
 
V
V
 
C
Y
 
F
V
 
V
G
 
S
D
 
S
D
 
N
P
 
A
E
 
-
L
 
W
D
 
D
V
 
L
E
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
G
R
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
F
Q
 
N
A
 
T
I
 
V
W
 
R
M
 
I
N
 
N
R
 
R
D
 
Q
D
 
G
A
 
N
R
 
P
W
 
P
P
 
E
S
 
Y
G
 
E
L
 
F
E
 
A
Q
 
P
P
 
L
V
 
K
H
 
H
M
 
Q
V
 
V
R
 
N
S
 
S
V
 
L
V
 
S
D
 
E
L
 
L
I
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
L
S
 
A

Sites not aligning to the query:

3i76B The crystal structure of the orthorhombic form of the putative had- hydrolase yfnb from bacillus subtilis bound to magnesium reveals interdomain movement
24% identity, 62% coverage: 79:226/237 of query aligns to 75:227/229 of 3i76B

query
sites
3i76B
R
 
K
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
P
 
E
E
 
A
-
 
D
-
 
G
I
 
A
M
 
L
V
 
L
E
 
E
E
 
Q
A
 
K
F
 
Y
A
 
R
A
 
R
F
 
F
I
 
L
R
 
E
A
 
E
R
 
G
N
 
H
Q
 
Q
V
 
L
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
I
R
 
D
P
 
G
G
 
A
L
 
F
D
 
D
L
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
N
L
 
L
F
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
Y
 
F
R
 
D
L
 
L
F
 
Y
T
 
I
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
V
A
 
S
D
 
H
-
 
T
-
 
Q
-
 
Y
-
 
K
-
 
R
L
 
L
E
 
R
Q
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
F
H
 
P
Y
 
F
F
 
F
E
 
K
R
 
D
M
 
I
L
 
F
A
 
V
A
 
S
R
 
E
Q
 
D
A
 
T
G
 
G
A
 
F
L
 
Q
K
 
K
P
 
P
D
 
M
P
 
K
A
 
E
I
 
Y
F
 
F
R
 
N
Q
 
Y
V
 
V
V
 
F
A
 
E
G
 
R
-
 
I
S
 
P
G
 
Q
L
 
F
A
 
S
L
 
A
H
 
E
E
 
H
V
 
T
V
 
L
Y
 
I
V
 
I
G
 
G
D
|
D
D
 
S
P
 
L
E
 
T
L
 
A
D
 
D
V
 
I
E
 
K
G
 
G
A
 
G
R
 
Q
R
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
Q
 
D
A
 
T
I
 
C
W
 
W
M
 
M
N
 
N
R
 
P
D
 
D
-
 
M
D
 
K
A
 
P
R
 
N
W
 
V
P
 
P
S
 
E
G
 
I
L
 
I
E
 
-
Q
 
-
P
 
P
V
 
T
H
 
Y
M
 
E
V
 
I
R
 
R
S
 
K
V
 
L
V
 
E
D
 
E
L
 
L
I
 
Y
P
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
N

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_066918130.1 NCBI__GCF_001579945.1:WP_066918130.1
MVVRAVCFDLDNTLWDVRPVIRRAEQAMYDLLATRYPRVVAALTAEDLREARVRIAETFP
QMRHDFTFLRQQALRDHARDFGYPEIMVEEAFAAFIRARNQVELYPDVRPGLDLLFAQYR
LFTVTNGNADLEQIGLAHYFERMLAARQAGALKPDPAIFRQVVAGSGLALHEVVYVGDDP
ELDVEGARRAGMQAIWMNRDDARWPSGLEQPVHMVRSVVDLIPLLSALGSRRSAGSA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory