SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_067476622.1 NCBI__GCF_001659785.1:WP_067476622.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1kerB The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from streptococcus suis with dtdp-d-glucose bound (see paper)
56% identity, 100% coverage: 2:334/334 of query aligns to 5:346/347 of 1kerB

query
sites
1kerB
R
 
N
L
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
H
L
 
Y
T
 
V
G
 
Y
R
 
N
V
 
N
R
 
H
P
 
P
D
 
D
T
 
V
H
 
H
I
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
x
G
N
 
N
E
 
K
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
E
D
 
A
A
 
I
P
 
L
C
 
G
D
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
E
V
 
L
I
 
V
R
 
V
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
A
D
 
D
P
 
A
G
 
E
V
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
K
I
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
K
D
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
F
x
Y
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
 
H
N
|
N
D
 
D
N
 
N
S
 
S
I
 
L
A
 
N
S
 
D
P
 
P
G
 
S
Q
 
P
F
 
F
V
 
I
H
 
H
T
|
T
N
 
N
I
 
F
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
 
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
E
G
 
G
T
 
P
P
 
G
E
 
E
A
 
K
F
 
F
T
 
T
E
 
A
D
 
E
T
 
T
A
 
N
Y
 
Y
R
 
N
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
W
 
W
I
 
V
R
 
R
T
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
I
S
 
S
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
V
 
I
E
 
E
K
|
K
F
|
F
I
 
I
P
 
P
R
|
R
Q
|
Q
I
 
I
T
 
T
T
 
N
L
 
I
I
 
L
D
 
A
G
 
G
G
 
I
R
 
K
P
 
P
R
x
K
L
|
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
E
G
 
G
E
 
K
N
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
H
 
H
V
 
T
D
 
N
D
 
D
H
 
H
N
 
S
A
 
T
A
 
G
V
 
V
W
 
W
E
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
S
 
N
N
|
N
R
 
K
E
 
E
I
 
V
V
 
L
R
 
E
E
 
L
L
 
I
C
 
L
L
 
E
L
 
K
C
 
M
D
 
G
R
 
Q
D
 
P
P
 
K
D
 
D
E
 
A
V
 
Y
D
 
D
F
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
|
R
P
 
A
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
H
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
F
R
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
E
T
 
T
V
 
I
E
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
R
 
T
E
 
D
N
 
N
R
 
Q
E
 
D
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
A
V
 
E
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
V
 
T
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
I

1ketA The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from streptococcus suis with thymidine diphosphate bound (see paper)
56% identity, 100% coverage: 2:334/334 of query aligns to 4:345/346 of 1ketA

query
sites
1ketA
R
 
N
L
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
H
L
 
Y
T
 
V
G
 
Y
R
 
N
V
 
N
R
 
H
P
 
P
D
 
D
T
 
V
H
 
H
I
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
|
A
A
x
G
N
 
N
E
 
K
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
E
D
 
A
A
 
I
P
 
L
C
 
G
D
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
E
V
 
L
I
 
V
R
 
V
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
A
D
 
D
P
 
A
G
 
E
V
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
K
I
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
K
D
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
F
x
Y
A
 
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
 
H
N
 
N
D
 
D
N
 
N
S
 
S
I
 
L
A
 
N
S
 
D
P
 
P
G
 
S
Q
 
P
F
 
F
V
 
I
H
 
H
T
|
T
N
 
N
I
 
F
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
 
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
E
G
 
G
T
 
P
P
 
G
E
 
E
A
 
K
F
 
F
T
 
T
E
 
A
D
 
E
T
 
T
A
 
N
Y
 
Y
R
 
N
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
W
 
W
I
 
V
R
 
R
T
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
I
S
 
S
N
 
N
C
 
C
S
 
S
N
|
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
V
 
I
E
 
E
K
 
K
F
|
F
I
 
I
P
 
P
R
|
R
Q
|
Q
I
 
I
T
 
T
T
 
N
L
 
I
I
 
L
D
 
A
G
 
G
G
 
I
R
 
K
P
 
P
R
x
K
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
E
G
 
G
E
 
K
N
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
H
 
H
V
 
T
D
 
N
D
 
D
H
 
H
N
 
S
A
 
T
A
 
G
V
 
V
W
 
W
E
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
S
 
N
N
|
N
R
 
K
E
 
E
I
 
V
V
 
L
R
 
E
E
 
L
L
 
I
C
 
L
L
 
E
L
 
K
C
 
M
D
 
G
R
 
Q
D
 
P
P
 
K
D
 
D
E
 
A
V
 
Y
D
 
D
F
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
|
R
P
 
A
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
H
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
F
R
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
E
T
 
T
V
 
I
E
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
R
 
T
E
 
D
N
 
N
R
 
Q
E
 
D
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
A
V
 
E
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
V
 
T
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
I

1kepA The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from streptococcus suis with dtdp-xylose bound (see paper)
56% identity, 100% coverage: 2:334/334 of query aligns to 4:345/346 of 1kepA

query
sites
1kepA
R
 
N
L
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
H
L
 
Y
T
 
V
G
 
Y
R
 
N
V
 
N
R
 
H
P
 
P
D
 
D
T
 
V
H
 
H
I
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
x
G
N
 
N
E
 
K
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
E
D
 
A
A
 
I
P
 
L
C
 
G
D
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
E
V
 
L
I
 
V
R
 
V
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
A
D
 
D
P
 
A
G
 
E
V
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
K
I
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
K
D
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
F
x
Y
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
 
H
N
 
N
D
 
D
N
 
N
S
 
S
I
 
L
A
 
N
S
 
D
P
 
P
G
 
S
Q
 
P
F
 
F
V
 
I
H
 
H
T
|
T
N
 
N
I
 
F
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
 
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
E
G
 
G
T
 
P
P
 
G
E
 
E
A
 
K
F
 
F
T
 
T
E
 
A
D
 
E
T
 
T
A
 
N
Y
 
Y
R
 
N
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
W
 
W
I
 
V
R
 
R
T
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
I
S
 
S
N
 
N
C
 
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
V
 
I
E
 
E
K
|
K
F
 
F
I
 
I
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
T
 
N
L
 
I
I
 
L
D
 
A
G
 
G
G
 
I
R
 
K
P
 
P
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
E
G
 
G
E
 
K
N
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
H
 
H
V
 
T
D
 
N
D
 
D
H
 
H
N
 
S
A
 
T
A
 
G
V
 
V
W
 
W
E
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
S
 
N
N
 
N
R
 
K
E
 
E
I
 
V
V
 
L
R
 
E
E
 
L
L
 
I
C
 
L
L
 
E
L
 
K
C
 
M
D
 
G
R
 
Q
D
 
P
P
 
K
D
 
D
E
 
A
V
 
Y
D
 
D
F
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
|
R
P
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
H
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
F
R
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
E
T
 
T
V
 
I
E
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
R
 
T
E
 
D
N
 
N
R
 
Q
E
 
D
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
A
V
 
E
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
V
 
T
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
I

P95780 dTDP-glucose 4,6-dehydratase; EC 4.2.1.46 from Streptococcus mutans serotype c (strain ATCC 700610 / UA159) (see paper)
55% identity, 99% coverage: 3:334/334 of query aligns to 7:347/348 of P95780

query
sites
P95780
L
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
H
L
 
Y
T
 
V
G
 
Y
R
 
N
V
 
N
R
 
H
P
 
P
D
 
D
T
 
V
H
 
H
I
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
N
 
N
E
 
R
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
E
D
 
E
A
 
I
P
 
L
C
 
G
D
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
E
V
 
L
I
 
V
R
 
V
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
A
D
 
D
P
 
S
G
 
E
V
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
K
I
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
K
D
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
F
x
Y
A
|
A
A
|
A
E
|
E
S
|
S
H
 
H
N
|
N
D
 
D
N
 
N
S
 
S
I
 
L
A
 
K
S
 
D
P
 
P
G
 
S
Q
 
P
F
 
F
V
 
I
H
 
Y
T
|
T
N
 
N
I
 
F
T
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
I
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
 
V
S
 
S
T
|
T
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
E
G
 
G
T
 
P
P
 
G
E
 
E
A
 
K
F
 
F
T
 
T
E
 
A
D
 
E
T
 
T
A
 
K
Y
 
Y
R
 
N
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
W
 
W
I
 
V
R
 
R
T
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
I
S
 
S
N
 
N
C
 
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
V
 
I
E
 
E
K
|
K
F
|
F
I
|
I
P
|
P
R
|
R
Q
|
Q
I
 
I
T
 
T
T
 
N
L
 
I
I
 
L
D
 
S
G
 
G
G
 
I
R
 
K
P
 
P
R
x
K
L
|
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
E
G
 
G
E
 
K
N
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
H
 
H
V
 
T
D
 
N
D
 
D
H
 
H
N
 
S
A
 
T
A
 
G
V
 
V
W
 
W
E
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
T
R
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
S
 
N
N
|
N
R
 
K
E
 
E
I
 
V
V
 
L
R
 
E
E
 
L
L
 
I
C
 
L
L
 
E
L
 
K
C
 
M
D
 
S
R
 
Q
D
 
P
P
 
K
D
 
N
E
 
A
V
 
Y
D
 
D
F
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
R
P
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
K
P
 
P
E
 
Q
H
 
F
T
 
T
D
 
N
L
 
F
R
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
D
T
 
T
V
 
I
E
 
K
W
 
W
Y
 
Y
R
 
T
E
 
E
N
 
H
R
 
E
E
 
D
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
A
V
 
E
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
V
 
T
E
 
Q
E
 
K
V
 
I
L
 
L

1kewA The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from salmonella enterica serovar typhimurium with thymidine diphosphate bound (see paper)
45% identity, 99% coverage: 1:329/334 of query aligns to 1:354/361 of 1kewA

query
sites
1kewA
M
 
M
R
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
H
T
 
I
G
 
I
R
 
K
V
 
N
R
 
T
P
 
Q
D
 
D
T
 
T
H
 
V
I
 
V
T
 
N
V
 
I
L
 
-
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
|
A
A
x
G
N
 
N
E
 
L
A
 
E
S
 
S
V
 
L
A
 
S
D
 
D
A
 
I
P
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
N
-
 
R
C
 
Y
D
 
N
V
 
F
I
 
E
R
 
H
G
 
A
D
|
D
V
x
I
A
 
C
D
 
D
P
 
S
G
 
A
V
 
E
L
 
I
D
 
T
E
 
R
I
 
I
L
 
F
A
 
E
G
 
Q
F
 
Y
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
-
A
 
A
I
 
V
V
 
M
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
T
S
 
G
P
 
P
G
 
A
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
|
T
N
 
N
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
K
H
 
Y
-
 
W
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
N
D
 
N
V
 
F
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
x
I
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
H
G
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
V
T
 
T
P
x
L
E
 
P
A
x
L
F
|
F
T
 
T
E
 
E
D
x
T
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
A
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
S
 
S
A
 
S
D
 
D
M
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
A
W
 
W
I
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
T
T
 
I
L
 
V
S
 
T
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
H
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
|
K
F
x
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
V
I
 
I
T
 
L
T
 
N
L
 
A
I
 
L
D
 
E
G
 
G
G
 
K
R
 
P
P
 
L
R
x
P
L
 
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
D
N
 
Q
V
 
I
R
|
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
Y
V
 
V
D
 
E
D
 
D
H
 
H
N
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
L
W
 
H
E
 
M
I
 
V
L
 
V
E
 
T
R
 
E
G
 
G
R
 
K
M
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
H
G
 
N
Q
 
E
A
 
K
S
 
K
N
|
N
R
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
F
E
 
T
L
 
I
C
 
C
L
 
D
L
 
L
C
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
I
P
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
D
 
E
E
 
Q
V
 
I
D
 
T
F
 
Y
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
|
R
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
K
 
K
L
 
I
R
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
K
P
 
P
E
 
L
H
 
E
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
R
D
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
Y
R
 
L
E
 
A
N
 
N
R
 
T
E
 
Q
W
 
W
W
 
V
E
 
N
P
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
S
A
 
G
V
 
A
E
 
Y
A
 
Q
K
 
S
Y
 
W
A
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1keuA The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from salmonella enterica serovar typhimurium with dtdp-d-glucose bound (see paper)
45% identity, 99% coverage: 1:329/334 of query aligns to 1:354/361 of 1keuA

query
sites
1keuA
M
 
M
R
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
H
T
 
I
G
 
I
R
 
K
V
 
N
R
 
T
P
 
Q
D
 
D
T
 
T
H
 
V
I
 
V
T
 
N
V
 
I
L
 
-
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
x
G
N
 
N
E
 
L
A
 
E
S
 
S
V
 
L
A
 
S
D
 
D
A
 
I
P
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
N
-
 
R
C
 
Y
D
 
N
V
 
F
I
 
E
R
 
H
G
 
A
D
|
D
V
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
S
G
 
A
V
 
E
L
 
I
D
 
T
E
 
R
I
 
I
L
 
F
A
 
E
G
 
Q
F
 
Y
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
-
A
 
A
I
 
V
V
 
M
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
T
S
 
G
P
 
P
G
 
A
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
|
T
N
 
N
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
K
H
 
Y
-
 
W
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
N
D
 
N
V
 
F
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
 
I
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
H
G
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
V
T
 
T
P
x
L
E
 
P
A
x
L
F
|
F
T
 
T
E
 
E
D
x
T
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
A
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
S
 
S
A
 
S
D
 
D
M
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
A
W
 
W
I
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
T
T
 
I
L
 
V
S
 
T
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
H
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
|
K
F
x
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
V
I
 
I
T
 
L
T
 
N
L
 
A
I
 
L
D
 
E
G
 
G
G
 
K
R
 
P
P
 
L
R
x
P
L
 
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
D
N
 
Q
V
 
I
R
|
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
Y
V
 
V
D
 
E
D
 
D
H
 
H
N
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
L
W
 
H
E
 
M
I
 
V
L
 
V
E
 
T
R
 
E
G
 
G
R
 
K
M
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
H
G
 
N
Q
 
E
A
 
K
S
 
K
N
|
N
R
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
F
E
 
T
L
 
I
C
 
C
L
 
D
L
 
L
C
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
I
P
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
D
 
E
E
 
Q
V
 
I
D
 
T
F
 
Y
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
|
R
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
K
 
K
L
 
I
R
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
K
P
 
P
E
 
L
H
 
E
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
R
D
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
Y
R
 
L
E
 
A
N
 
N
R
 
T
E
 
Q
W
 
W
W
 
V
E
 
N
P
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
S
A
 
G
V
 
A
E
 
Y
A
 
Q
K
 
S
Y
 
W
A
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P26391 dTDP-glucose 4,6-dehydratase; EC 4.2.1.46 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
45% identity, 99% coverage: 1:329/334 of query aligns to 1:354/361 of P26391

query
sites
P26391
M
 
M
R
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
H
T
 
I
G
 
I
R
 
K
V
 
N
R
 
T
P
 
Q
D
 
D
T
 
T
H
 
V
I
 
V
T
 
N
V
 
I
L
 
-
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
N
 
N
E
 
L
A
 
E
S
 
S
V
 
L
A
 
S
D
 
D
A
 
I
P
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
N
-
 
R
C
 
Y
D
 
N
V
 
F
I
 
E
R
 
H
G
 
A
D
|
D
V
x
I
A
 
C
D
 
D
P
 
S
G
 
A
V
 
E
L
 
I
D
 
T
E
 
R
I
 
I
L
 
F
A
 
E
G
 
Q
F
 
Y
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
-
A
 
A
I
 
V
V
 
M
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
|
E
S
|
S
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
T
S
 
G
P
 
P
G
 
A
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
|
T
N
 
N
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
K
H
 
Y
-
 
W
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
N
D
 
N
V
 
F
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
 
I
S
 
S
T
|
T
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
H
G
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
V
T
 
T
P
 
L
E
 
P
A
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
E
D
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
A
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
A
|
A
S
|
S
K
|
K
A
 
A
S
 
S
A
 
S
D
 
D
M
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
A
W
 
W
I
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
T
T
 
I
L
 
V
S
 
T
N
 
N
C
 
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
H
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
|
K
F
x
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
V
I
 
I
T
 
L
T
 
N
L
 
A
I
 
L
D
 
E
G
 
G
G
 
K
R
 
P
P
 
L
R
x
P
L
x
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
D
N
 
Q
V
 
I
R
|
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
Y
V
 
V
D
 
E
D
 
D
H
 
H
N
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
L
W
 
H
E
 
M
I
 
V
L
 
V
E
 
T
R
 
E
G
 
G
R
 
K
M
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
H
G
 
N
Q
 
E
A
 
K
S
 
K
N
|
N
R
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
F
E
 
T
L
 
I
C
 
C
L
 
D
L
 
L
C
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
I
P
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
D
 
E
E
 
Q
V
 
I
D
 
T
F
 
Y
V
 
V
T
 
A
D
|
D
R
|
R
P
|
P
G
|
G
H
|
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
K
 
K
L
 
I
R
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
K
P
 
P
E
 
L
H
 
E
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
R
D
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
Y
R
 
L
E
 
A
N
 
N
R
 
T
E
 
Q
W
 
W
W
 
V
E
 
N
P
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
S
A
 
G
V
 
A
E
 
Y
A
 
Q
K
 
S
Y
 
W
A
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P27830 dTDP-glucose 4,6-dehydratase 2; EC 4.2.1.46 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
46% identity, 96% coverage: 2:320/334 of query aligns to 3:342/355 of P27830

query
sites
P27830
R
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
T
 
I
G
 
I
R
 
N
V
 
E
R
 
T
P
 
S
D
 
D
T
 
A
H
 
-
I
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
V
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
N
 
N
E
 
L
A
 
M
S
 
S
V
 
L
A
 
A
D
 
P
A
 
V
P
 
A
C
 
Q
D
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
A
V
 
F
I
 
E
R
 
K
G
 
V
D
|
D
V
x
I
A
 
C
D
 
D
P
 
R
G
 
A
V
 
E
L
 
L
D
 
A
E
 
R
I
 
V
L
 
F
A
 
T
G
 
E
F
 
H
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
-
A
 
C
I
 
V
V
 
M
H
 
H
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
S
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
D
S
 
G
P
 
P
G
 
A
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
|
T
N
 
N
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
A
-
 
Y
-
 
W
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
K
R
 
K
H
 
S
D
 
A
V
 
F
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
 
I
S
 
S
T
 
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
H
L
 
-
G
 
S
T
 
T
P
 
D
E
 
D
A
 
F
F
 
F
T
 
T
E
 
E
D
 
T
T
 
T
A
 
P
Y
 
Y
R
 
A
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
A
|
A
S
|
S
K
|
K
A
 
A
S
 
S
A
 
S
D
 
D
M
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
A
W
 
W
I
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
T
T
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
N
C
 
C
S
 
S
N
 
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
H
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
M
I
 
I
T
 
L
T
 
N
L
 
A
I
 
L
D
 
A
G
 
G
G
 
K
R
 
S
P
 
L
R
 
P
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
Q
N
 
Q
V
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
Y
V
 
V
D
 
E
D
 
D
H
 
H
N
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
L
W
 
Y
E
 
C
I
 
V
L
 
A
E
 
T
R
 
T
G
 
G
R
 
K
M
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
H
G
 
N
Q
 
E
A
 
R
S
 
K
N
 
N
R
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
E
E
 
T
L
 
I
C
 
C
-
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
E
D
 
E
R
 
L
D
 
A
P
 
P
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
Y
-
 
R
D
 
D
E
 
L
V
 
I
D
 
T
F
 
F
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
R
P
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
L
 
I
R
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
L
P
 
P
E
 
Q
H
 
E
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
R
D
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
R
 
L
E
 
A
N
 
N
R
 
E
E
 
S
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
Q
V
 
V
K
 
Q

1r66A Crystal structure of desiv (dtdp-glucose 4,6-dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and tyd bound (see paper)
50% identity, 96% coverage: 1:320/334 of query aligns to 1:322/322 of 1r66A

query
sites
1r66A
M
 
M
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
F
 
F
V
 
V
R
 
R
-
 
Q
L
 
L
T
 
L
G
 
A
R
 
G
V
 
A
R
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
H
 
E
I
 
V
T
 
I
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
S
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
x
G
N
 
N
E
 
R
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
A
D
 
P
A
 
V
P
 
D
C
 
A
D
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
R
V
 
F
I
 
V
R
 
H
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
D
P
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
R
I
 
E
L
 
L
A
 
R
G
 
G
F
 
V
G
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
|
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
S
 
G
P
 
A
G
 
S
Q
 
V
F
 
F
V
 
T
H
 
E
T
|
T
N
 
N
I
 
V
T
 
Q
G
 
G
T
 
T
F
 
Q
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
C
A
 
A
R
 
V
R
 
D
H
 
A
D
 
G
V
 
V
-
 
G
R
 
R
L
 
V
H
 
V
H
 
H
V
|
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
I
P
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
S
P
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
T
E
 
E
D
 
S
T
 
S
A
 
P
Y
 
L
R
 
E
P
 
P
S
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
S
 
G
A
 
S
D
 
D
M
 
L
L
 
V
V
 
A
R
 
R
A
 
A
W
 
Y
I
 
H
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
D
A
 
V
T
 
R
L
 
I
S
 
T
N
 
R
C
 
C
S
 
C
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
V
 
P
E
 
E
K
|
K
F
x
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
F
I
 
V
T
 
T
T
 
N
L
 
L
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
T
P
 
L
R
x
P
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
A
N
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
E
W
 
W
I
 
V
H
 
H
V
 
T
D
 
D
D
 
D
H
 
H
N
 
C
A
 
R
A
 
G
V
 
I
W
 
A
E
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
A
R
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
I
Y
 
Y
L
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
G
G
 
L
Q
 
E
A
 
L
S
 
T
N
|
N
R
 
R
E
 
E
I
 
L
V
 
T
R
 
G
E
 
I
L
 
L
C
 
L
L
 
D
L
 
S
C
 
L
D
 
G
R
 
A
D
 
D
P
 
W
D
 
S
E
 
S
V
 
V
D
 
R
F
 
K
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
|
R
P
 
K
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
G
K
 
K
L
 
I
R
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
A
 
R
P
 
P
E
 
Q
H
 
-
T
 
V
D
 
S
L
 
F
R
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
R
T
 
T
V
 
V
E
 
R
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
N
 
N
R
 
R
E
 
G
W
 
W
W
 
W
E
 
E
P
 
P
V
 
L
K
 
K

1r6dA Crystal structure of desiv double mutant (dtdp-glucose 4,6- dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and dau bound (see paper)
49% identity, 96% coverage: 1:320/334 of query aligns to 1:322/322 of 1r6dA

query
sites
1r6dA
M
 
M
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
F
 
F
V
 
V
R
 
R
-
 
Q
L
 
L
T
 
L
G
 
A
R
 
G
V
 
A
R
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
H
 
E
I
 
V
T
 
I
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
S
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
|
A
A
x
G
N
 
N
E
 
R
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
A
D
 
P
A
 
V
P
 
D
C
 
A
D
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
R
V
 
F
I
 
V
R
 
H
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
D
P
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
R
I
 
E
L
 
L
A
 
R
G
 
G
F
 
V
G
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
|
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
S
 
G
P
 
A
G
 
S
Q
 
V
F
 
F
V
 
T
H
 
E
T
|
T
N
 
N
I
 
V
T
 
Q
G
 
G
T
 
T
F
 
Q
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
C
A
 
A
R
 
V
R
 
D
H
 
A
D
 
G
V
 
V
-
 
G
R
 
R
L
 
V
H
 
V
H
 
H
V
|
V
S
|
S
T
|
T
D
x
N
E
x
Q
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
I
P
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
S
P
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
T
E
 
E
D
 
S
T
 
S
A
 
P
Y
 
L
R
 
E
P
 
P
S
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
S
 
G
A
 
S
D
 
D
M
 
L
L
 
V
V
 
A
R
 
R
A
 
A
W
 
Y
I
 
H
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
D
A
 
V
T
 
R
L
 
I
S
 
T
N
 
R
C
 
C
S
 
C
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
V
 
P
E
 
E
K
|
K
F
x
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
F
I
 
V
T
 
T
T
 
N
L
 
L
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
T
P
 
L
R
x
P
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
A
N
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
E
W
 
W
I
 
V
H
 
H
V
 
T
D
 
D
D
 
D
H
 
H
N
 
C
A
 
R
A
 
G
V
 
I
W
 
A
E
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
A
R
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
I
Y
 
Y
L
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
G
G
 
L
Q
 
E
A
 
L
S
 
T
N
|
N
R
 
R
E
 
E
I
 
L
V
 
T
R
 
G
E
 
I
L
 
L
C
 
L
L
 
D
L
 
S
C
 
L
D
 
G
R
 
A
D
 
D
P
 
W
D
 
S
E
 
S
V
 
V
D
 
R
F
 
K
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
|
R
P
 
K
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
|
Y
A
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
G
K
 
K
L
 
I
R
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
A
 
R
P
 
P
E
 
Q
H
 
-
T
 
V
D
 
S
L
 
F
R
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
R
T
 
T
V
 
V
E
 
R
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
N
 
N
R
 
R
E
 
G
W
 
W
W
 
W
E
 
E
P
 
P
V
 
L
K
 
K

2hunA Crystal structure of hypothetical protein ph0414 from pyrococcus horikoshii ot3
44% identity, 96% coverage: 1:319/334 of query aligns to 2:316/329 of 2hunA

query
sites
2hunA
M
 
M
R
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
M
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
Y
T
 
I
G
 
L
R
 
E
V
 
K
R
 
H
P
 
P
D
 
D
T
 
W
H
 
E
I
 
V
T
 
I
V
 
N
L
 
I
D
|
D
A
x
K
F
 
L
T
 
G
Y
 
Y
A
 
G
A
x
S
N
 
N
E
 
P
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
L
P
 
E
C
 
D
D
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
Y
-
 
T
V
 
F
I
 
V
R
 
K
G
 
G
D
|
D
V
|
V
A
 
A
D
 
D
P
 
Y
G
 
E
V
 
L
L
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
L
L
 
V
A
 
R
G
 
K
F
 
V
G
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
G
I
 
V
V
 
V
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
E
Q
 
I
F
 
F
V
 
L
H
 
H
T
x
S
N
 
N
I
 
V
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
I
R
 
R
R
 
R
H
 
E
D
 
N
-
 
P
-
 
E
V
 
V
R
 
R
L
 
F
H
 
V
H
 
H
V
 
V
S
 
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
I
P
 
L
L
 
K
G
 
G
T
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
S
F
 
F
T
 
T
E
 
E
D
 
N
T
 
D
A
 
R
Y
 
L
R
 
M
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
D
M
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
L
A
 
G
W
 
W
I
 
T
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
N
L
 
L
R
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
I
S
 
T
N
 
R
C
|
C
S
x
T
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
K
Q
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
R
L
 
A
I
 
S
D
 
L
G
 
G
G
 
L
R
 
K
P
 
I
R
 
P
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
G
 
-
E
 
-
N
 
-
V
 
V
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
Y
V
 
V
D
 
E
D
 
D
H
 
H
N
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
I
W
 
E
E
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
L
R
 
K
G
 
G
R
 
E
M
 
S
G
 
R
E
 
E
T
 
I
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
S
A
 
A
D
 
G
G
 
E
Q
 
E
A
 
K
S
 
T
N
 
N
R
 
L
E
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
K
E
 
I
L
 
I
C
 
L
L
 
R
L
 
L
C
 
M
D
 
G
R
 
K
D
 
G
P
 
E
D
 
E
E
 
L
V
 
I
D
 
E
F
 
L
V
 
V
T
 
E
D
 
D
R
 
R
P
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
S
T
 
W
K
 
K
L
 
I
R
 
T
R
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
K
W
 
W
A
 
R
P
 
P
E
 
K
H
 
Y
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
D
S
 
E
G
 
G
L
 
I
A
 
K
D
 
K
T
 
T
V
 
I
E
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
L
E
 
K
N
 
N
R
 
E
E
 
W
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
P
V
 
L

6bi4C 2.9 angstrom resolution crystal structure of dtdp-glucose 4,6- dehydratase (rfbb) from bacillus anthracis str. Ames in complex with NAD. (see paper)
43% identity, 96% coverage: 1:320/334 of query aligns to 2:311/311 of 6bi4C

query
sites
6bi4C
M
 
M
R
 
N
L
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
H
L
 
Y
T
 
M
G
 
L
R
 
Q
V
 
S
R
 
Y
P
 
E
D
 
T
T
 
Y
H
 
K
I
 
I
T
 
I
V
 
N
L
 
F
D
|
D
A
|
A
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
x
S
A
x
G
N
 
N
-
 
L
-
 
N
-
 
N
E
 
V
A
 
K
S
 
S
V
 
I
A
 
Q
D
 
D
A
 
H
P
 
P
-
 
N
C
 
Y
D
 
Y
V
 
F
I
 
V
R
 
K
G
 
G
D
x
E
V
x
I
A
x
Q
D
x
N
P
x
G
G
x
E
V
 
L
L
 
L
D
 
E
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
K
G
 
E
F
 
R
G
 
D
P
 
V
D
 
Q
D
 
-
A
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
N
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
I
N
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
P
F
 
F
V
 
Y
H
 
D
T
|
T
N
 
N
I
 
V
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
V
R
 
K
R
 
K
H
 
Y
-
 
P
D
 
H
V
 
I
R
 
K
L
 
L
H
 
V
H
 
Q
V
|
V
S
 
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
L
P
 
-
L
 
-
G
 
G
T
 
K
P
 
T
E
 
G
A
 
R
F
 
F
T
 
T
E
 
E
D
 
E
T
 
T
A
 
P
Y
 
L
R
 
A
P
 
P
S
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
I
V
 
A
R
 
L
A
 
A
W
 
Y
I
 
Y
R
 
K
T
 
T
Y
 
Y
G
 
Q
L
 
L
R
 
P
A
 
V
T
 
I
L
 
V
S
 
T
N
 
R
C
|
C
S
|
S
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
Y
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
M
I
 
V
T
 
T
T
 
N
L
 
A
I
 
L
D
 
E
G
 
G
G
 
K
R
 
K
P
 
L
R
 
P
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
L
N
 
N
V
 
V
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
H
V
 
V
D
 
T
D
 
D
H
 
H
N
 
C
A
 
S
A
 
A
V
 
I
W
 
D
E
 
V
I
 
V
L
 
L
E
 
H
R
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
V
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
N
G
 
N
Q
 
E
A
 
K
S
 
T
N
 
N
R
 
V
E
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
E
E
 
Q
L
 
I
C
 
I
L
 
T
L
 
L
C
 
L
D
 
G
R
 
K
D
 
T
P
 
K
D
 
K
E
 
D
V
 
I
D
 
E
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
-
P
 
-
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
N
A
 
A
T
 
E
K
 
K
L
 
M
R
 
K
R
 
N
E
 
E
L
 
F
G
 
D
W
 
W
A
 
E
P
 
P
E
 
K
H
 
Y
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
Q
D
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
R
 
E
E
 
K
N
 
N
R
 
E
E
 
E
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
P
V
 
L
K
 
K

8du1A Crystal structure of NAD bound dtdp-glucose 4,6-dehydratase from elizabethkingia anophelis
43% identity, 98% coverage: 2:329/334 of query aligns to 5:357/361 of 8du1A

query
sites
8du1A
R
 
N
L
 
I
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
F
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
E
T
 
F
G
 
V
R
 
I
V
 
K
R
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
I
H
 
T
I
 
I
T
 
I
V
 
N
L
 
L
D
|
D
A
|
A
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
x
G
N
 
N
E
 
L
A
 
E
S
 
N
V
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
F
P
 
P
C
 
N
D
 
Y
V
 
V
I
 
F
-
 
E
R
 
K
G
 
A
D
|
D
V
x
I
A
 
T
D
 
K
P
 
P
G
 
E
V
 
E
L
 
L
D
 
R
E
 
K
I
 
V
L
 
F
A
 
E
G
 
K
F
 
Y
G
 
N
P
 
P
D
 
D
D
 
-
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
T
S
 
D
P
 
P
G
 
N
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
H
 
N
T
|
T
N
 
N
I
 
V
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
A
E
 
N
I
 
L
L
 
L
E
 
N
A
 
L
A
 
C
R
 
R
R
 
E
-
 
F
-
 
W
-
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
T
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
F
-
 
P
H
 
N
D
 
E
V
 
P
R
 
R
-
 
T
-
 
N
-
 
L
L
 
F
H
 
Y
H
 
H
V
 
V
S
|
S
T
|
T
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
L
P
 
-
L
 
-
G
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
G
A
 
F
F
 
F
T
 
L
E
 
E
D
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
P
 
P
S
 
Q
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
D
 
D
M
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
A
W
 
Y
I
 
G
R
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
R
 
P
A
 
F
T
 
I
L
 
V
S
 
S
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
N
Q
 
H
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
C
I
 
I
T
 
S
T
 
N
L
 
I
I
 
L
D
 
N
G
 
E
G
 
K
R
 
P
P
 
L
R
 
P
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
K
N
 
Y
V
 
T
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
Y
V
 
V
D
 
I
D
 
D
H
 
H
N
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
I
W
 
H
E
 
Q
I
 
I
L
 
F
E
 
N
R
 
E
G
 
A
R
 
K
M
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
F
G
 
N
Q
 
E
A
 
W
S
 
Q
N
 
N
R
 
I
E
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
L
C
 
I
L
 
K
L
 
Q
C
 
L
D
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
G
R
 
H
D
 
S
P
 
E
D
 
K
E
 
L
V
 
I
D
 
T
F
 
F
V
 
V
T
 
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
T
K
 
K
L
 
L
R
 
N
R
 
K
E
 
D
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
K
P
 
P
E
 
S
H
 
V
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
K
T
 
T
V
 
I
E
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
L
E
 
D
N
 
N
R
 
K
E
 
E
W
 
W
W
 
L
E
 
E
P
 
N
V
 
V
K
 
T
A
 
S
A
 
G
V
 
D
E
 
Y
A
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
A
 
Y
E
 
E

6bi4B 2.9 angstrom resolution crystal structure of dtdp-glucose 4,6- dehydratase (rfbb) from bacillus anthracis str. Ames in complex with NAD. (see paper)
43% identity, 96% coverage: 1:320/334 of query aligns to 2:310/310 of 6bi4B

query
sites
6bi4B
M
 
M
R
 
N
L
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
H
L
 
Y
T
 
M
G
 
L
R
 
Q
V
 
S
R
 
Y
P
 
E
D
 
T
T
 
Y
H
 
K
I
 
I
T
 
I
V
 
N
L
 
F
D
|
D
A
|
A
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
x
S
A
x
G
N
 
N
-
 
L
-
 
N
-
 
N
E
 
V
A
 
K
S
 
S
V
 
I
A
 
Q
D
 
D
A
 
H
P
 
P
-
 
N
C
 
Y
D
 
Y
V
 
F
I
 
V
R
 
K
G
 
G
D
x
E
V
 
I
A
x
Q
D
x
N
P
 
G
G
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
E
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
K
G
 
E
F
 
R
G
 
D
P
 
V
D
 
Q
D
 
-
A
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
N
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
I
N
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
P
F
 
F
V
 
Y
H
 
D
T
|
T
N
 
N
I
 
V
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
V
R
 
K
R
 
K
H
 
Y
-
 
P
D
 
H
V
 
I
R
 
K
L
 
L
H
 
V
H
 
Q
V
 
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
L
P
 
-
L
 
-
G
 
G
T
 
K
P
 
T
E
 
G
A
 
R
F
 
F
T
 
T
E
 
E
D
 
E
T
 
T
A
 
P
Y
 
L
R
 
A
P
 
P
S
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
I
V
 
A
R
 
L
A
 
A
W
 
Y
I
 
Y
R
 
K
T
 
T
Y
 
Y
G
 
Q
L
 
L
R
 
P
A
 
V
T
 
I
L
 
V
S
 
T
N
 
R
C
|
C
S
 
S
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
Y
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
M
I
 
V
T
 
T
T
 
N
L
 
A
I
 
L
D
 
E
G
 
G
G
 
K
R
 
K
P
 
L
R
 
P
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
L
N
 
N
V
 
V
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
H
V
 
V
D
 
T
D
 
D
H
 
H
N
 
C
A
 
S
A
 
A
V
 
I
W
 
D
E
 
V
I
 
V
L
 
L
E
 
H
R
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
V
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
N
G
 
N
Q
 
E
A
 
K
S
 
T
N
 
N
R
 
V
E
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
E
E
 
Q
L
 
I
C
 
I
L
 
T
L
 
L
C
 
L
D
 
G
R
 
K
D
 
T
P
 
K
D
 
K
E
 
D
V
 
I
D
 
E
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
N
A
 
A
T
 
E
K
 
K
L
 
M
R
 
K
R
 
N
E
 
E
L
 
F
G
 
D
W
 
W
A
 
E
P
 
P
E
 
K
H
 
Y
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
Q
D
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
R
 
E
E
 
K
N
 
N
R
 
E
E
 
E
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
P
V
 
L
K
 
K

1bxkB Dtdp-glucose 4,6-dehydratase from e. Coli
44% identity, 96% coverage: 2:320/334 of query aligns to 3:336/344 of 1bxkB

query
sites
1bxkB
R
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
T
 
I
G
 
I
R
 
N
V
 
E
R
 
T
P
 
S
D
 
D
T
 
A
H
 
-
I
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
V
D
|
D
A
x
K
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
|
A
A
x
G
N
 
N
E
 
L
A
 
M
S
 
S
V
 
L
A
 
A
D
 
P
A
 
V
P
 
A
C
 
Q
D
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
A
V
 
F
I
 
E
R
 
K
G
 
V
D
|
D
V
x
I
A
 
C
D
 
D
P
 
R
G
 
A
V
 
E
L
 
L
D
 
A
E
 
R
I
 
V
L
 
F
A
 
T
G
 
E
F
 
H
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
-
A
 
C
I
 
V
V
 
M
H
 
H
F
x
L
A
 
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
D
S
 
G
P
 
P
G
 
A
Q
 
A
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
|
T
N
 
N
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
A
-
 
Y
-
 
W
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
K
R
 
K
H
x
S
D
 
A
V
 
F
R
 
R
L
 
F
H
 
H
H
 
H
V
x
I
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
H
L
 
-
G
 
S
T
 
T
P
 
D
E
 
D
A
 
F
F
 
F
T
 
T
E
 
E
D
 
T
T
 
T
A
 
P
Y
 
Y
R
 
A
P
 
P
S
 
S
S
|
S
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
S
 
S
A
 
S
D
 
D
M
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
A
W
 
W
I
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
T
T
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
H
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
M
I
 
I
T
 
L
T
 
N
L
 
A
I
 
L
D
 
A
G
 
G
G
 
K
R
 
S
P
 
L
R
 
P
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
Q
N
 
Q
V
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
L
H
 
Y
V
 
V
D
 
E
D
 
D
H
 
H
N
 
A
A
 
R
A
 
A
V
 
L
W
 
Y
E
 
C
I
 
V
L
 
A
E
 
T
R
 
T
G
 
G
R
 
K
M
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
H
G
 
N
Q
 
E
A
 
R
S
 
K
N
 
N
R
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
E
E
 
T
L
 
I
C
 
C
-
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
E
D
 
E
R
 
L
D
 
A
P
 
P
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
Y
-
 
R
D
 
D
E
 
L
V
 
I
D
 
T
F
 
F
V
 
V
T
 
A
D
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
L
 
I
R
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
C
A
 
V
P
 
P
E
 
Q
H
 
E
T
 
T
D
 
-
L
 
F
R
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
R
D
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
R
 
L
E
 
A
N
 
N
R
 
E
E
 
S
W
 
W
W
 
W
E
 
K
P
 
Q
V
 
V
K
 
Q

8sk0A Crystal structure of evds6 decarboxylase in ligand bound state (see paper)
43% identity, 97% coverage: 2:324/334 of query aligns to 8:329/329 of 8sk0A

query
sites
8sk0A
R
 
R
L
 
V
L
 
F
V
 
V
T
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
-
 
E
-
 
L
L
 
V
T
 
A
G
 
G
R
 
A
V
 
Y
R
 
A
-
 
G
-
 
W
P
 
Q
D
 
G
T
 
C
H
 
E
I
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
S
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
x
G
N
 
N
E
 
L
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
V
-
 
R
-
 
D
P
 
A
C
 
V
D
 
T
V
 
F
I
 
V
R
 
R
G
 
G
D
|
D
V
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
G
G
 
R
V
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
P
G
 
G
F
 
H
G
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
L
H
 
N
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
x
T
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
S
 
D
P
 
S
G
 
A
Q
 
E
F
 
F
V
 
L
H
 
R
T
|
T
N
 
N
I
 
V
T
 
Q
G
 
G
T
 
V
F
 
Q
E
 
S
I
 
L
L
 
M
E
 
Q
A
 
A
A
 
C
R
 
L
R
 
T
H
 
A
D
 
G
V
 
V
-
 
P
R
 
T
L
 
I
H
 
V
H
 
Q
V
|
V
S
|
S
T
|
T
D
 
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
I
P
 
E
L
 
A
G
 
G
T
 
S
P
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
S
E
 
E
D
 
D
T
 
A
A
 
P
Y
 
L
R
 
A
P
 
P
S
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
S
 
G
A
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
A
R
 
L
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
V
T
 
R
L
 
I
S
 
T
N
 
R
C
 
C
S
 
G
N
|
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
|
K
F
x
V
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
F
I
 
L
T
 
T
T
 
R
L
 
L
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
R
R
 
S
P
 
V
R
x
P
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
R
N
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
H
 
H
V
 
V
D
 
A
D
 
D
H
 
H
N
 
C
A
 
R
A
 
G
V
 
I
W
 
Q
E
 
T
I
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
R
 
A
M
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
V
Y
 
Y
L
 
H
I
 
I
G
 
A
A
 
G
D
 
T
G
 
A
Q
 
E
A
 
L
S
 
T
N
|
N
R
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
T
R
 
Q
E
 
H
L
 
L
C
 
L
L
 
D
L
 
A
C
 
V
D
 
G
R
 
G
D
 
S
P
 
W
D
 
D
E
 
A
V
 
V
D
 
E
F
 
R
V
 
V
T
 
P
D
 
D
R
|
R
P
 
K
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
I
 
L
D
 
S
A
 
D
T
 
A
K
 
K
L
 
L
R
 
-
R
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
 
R
H
 
-
T
 
V
D
 
P
L
 
F
R
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
A
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
E
 
A
N
 
N
R
 
R
E
 
H
W
 
W
W
 
W
E
 
E
P
 
P
V
 
L
K
 
R
A
 
K
A
 
Q
V
 
L
E
 
D

8sk0B Crystal structure of evds6 decarboxylase in ligand bound state (see paper)
43% identity, 97% coverage: 2:324/334 of query aligns to 9:330/330 of 8sk0B

query
sites
8sk0B
R
 
R
L
 
V
L
 
F
V
 
V
T
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
-
 
E
-
 
L
L
 
V
T
 
A
G
 
G
R
 
A
V
 
Y
R
 
A
-
 
G
-
 
W
P
 
Q
D
 
G
T
 
C
H
 
E
I
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
S
F
x
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
A
x
G
N
 
N
E
 
L
A
 
A
S
 
N
V
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
V
-
 
R
-
 
D
P
 
A
C
 
V
D
 
T
V
 
F
I
 
V
R
 
R
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
C
D
 
D
P
 
G
G
 
R
V
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
P
G
 
G
F
 
H
G
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
L
H
 
N
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
x
T
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
S
 
D
P
 
S
G
 
A
Q
 
E
F
 
F
V
 
L
H
 
R
T
|
T
N
 
N
I
 
V
T
 
Q
G
 
G
T
 
V
F
 
Q
E
 
S
I
 
L
L
 
M
E
 
Q
A
 
A
A
 
C
R
 
L
R
 
T
H
 
A
D
 
G
V
 
V
-
 
P
R
 
T
L
 
I
H
 
V
H
 
Q
V
|
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
I
P
 
E
L
 
A
G
 
G
T
 
S
P
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
S
E
 
E
D
 
D
T
 
A
A
 
P
Y
 
L
R
 
A
P
 
P
S
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
S
 
G
A
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
A
R
 
L
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
V
T
 
R
L
 
I
S
 
T
N
 
R
C
 
C
S
x
G
N
 
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
Y
Q
 
Q
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
V
I
 
I
P
 
P
R
 
L
Q
 
F
I
 
L
T
 
T
T
 
R
L
 
L
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
R
R
 
S
P
 
V
R
 
P
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
R
N
 
N
V
 
V
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
H
 
H
V
 
V
D
 
A
D
 
D
H
 
H
N
 
C
A
 
R
A
 
G
V
 
I
W
 
Q
E
 
T
I
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
R
 
A
M
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
V
Y
 
Y
L
 
H
I
 
I
G
 
A
A
 
G
D
 
T
G
 
A
Q
 
E
A
 
L
S
 
T
N
 
N
R
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
T
R
 
Q
E
 
H
L
 
L
C
 
L
L
 
D
L
 
A
C
 
V
D
 
G
R
 
G
D
 
S
P
 
W
D
 
D
E
 
A
V
 
V
D
 
E
F
 
R
V
 
V
T
 
P
D
 
D
R
 
R
P
 
K
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
I
 
L
D
 
S
A
 
D
T
 
A
K
 
K
L
 
L
R
 
-
R
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
 
R
H
 
-
T
 
V
D
 
P
L
 
F
R
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
A
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
E
 
A
N
 
N
R
 
R
E
 
H
W
 
W
W
 
W
E
 
E
P
 
P
V
 
L
K
 
R
A
 
K
A
 
Q
V
 
L
E
 
D

Q9SYM5 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM1; Protein REPRESSOR OF LRX1 1; Rhamnose biosynthetic enzyme 1; AtRHM1; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 3 papers)
37% identity, 96% coverage: 3:323/334 of query aligns to 9:333/669 of Q9SYM5

query
sites
Q9SYM5
L
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
A
S
 
S
N
 
H
F
 
V
V
 
A
R
 
N
L
 
R
T
 
L
G
 
I
R
 
R
V
 
S
R
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
Y
H
 
K
I
 
I
T
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
K
F
 
L
T
 
D
Y
 
Y
A
 
C
A
 
S
N
 
N
E
 
L
A
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
N
D
 
P
A
 
S
P
 
K
-
 
H
-
 
S
-
 
P
-
 
N
C
 
F
D
 
K
V
 
F
I
 
V
R
 
K
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
S
P
 
A
G
 
D
V
 
L
L
 
V
D
 
N
E
 
H
I
 
L
L
 
L
A
 
I
G
 
T
F
 
E
G
 
G
P
 
I
D
 
D
D
 
-
A
 
T
I
 
I
V
 
M
H
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
S
 
T
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
S
I
 
F
A
 
G
S
 
N
P
 
S
G
 
F
Q
 
E
F
 
F
V
 
T
H
 
K
T
 
N
N
 
N
I
 
I
T
 
Y
G
 
G
T
 
T
F
 
H
E
 
V
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
C
R
 
K
R
 
V
-
 
T
-
 
G
H
 
Q
D
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
F
H
 
I
H
 
H
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
L
 
T
P
 
D
L
 
E
G
 
D
T
 
A
P
 
L
E
 
V
A
 
G
F
 
N
T
 
H
E
 
E
D
 
A
T
 
S
A
 
Q
Y
 
L
R
 
L
P
 
P
S
 
T
S
 
N
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
G
A
 
A
D
 
E
M
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
M
A
 
A
W
 
Y
I
 
G
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
V
T
 
I
L
 
T
S
 
T
N
 
R
C
 
G
S
 
N
N
 
N
N
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
N
Q
 
Q
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
K
Q
 
F
I
 
I
T
 
L
T
 
L
L
 
A
I
 
M
D
 
R
G
 
G
G
 
Q
R
 
V
P
 
L
R
 
P
L
 
I
Y
 
H
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
S
N
 
N
V
 
V
R
 
R
D
 
S
W
 
Y
I
 
L
H
 
Y
V
 
C
D
 
E
D
 
D
H
 
V
N
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
F
W
 
E
E
 
V
I
 
V
L
 
L
E
 
H
R
 
K
G
 
G
R
 
E
M
 
V
G
 
G
E
 
H
T
 
V
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
T
D
 
K
G
 
K
Q
 
E
A
 
R
S
 
R
N
 
V
R
 
N
E
 
D
I
 
V
V
 
A
R
 
K
E
 
D
L
 
I
C
 
C
L
 
K
L
 
L
C
 
F
D
 
N
R
 
M
D
 
D
P
 
P
D
 
E
-
 
A
E
 
N
V
 
I
D
 
K
F
 
F
V
 
V
T
 
D
D
 
N
R
|
R
P
 
P
G
 
F
H
 
N
D
 
D
R
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
A
 
F
I
 
L
D
 
D
A
 
D
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
R
 
K
R
 
K
E
 
-
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
S
P
 
-
E
 
E
H
 
R
T
 
T
D
 
T
L
 
W
R
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
K
T
 
T
V
 
M
E
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
T
E
 
Q
N
 
N
R
 
P
E
 
E
W
 
W
W
 
W
E
 
G
P
 
D
V
 
V
K
 
S
A
 
G
A
 
A
V
 
L

Q9LPG6 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM2; NDP-rhamnose synthase; Protein MUCILAGE-MODIFIED 4; Protein RHAMNOSE BIOSYNTHESIS 2; Rhamnose biosynthetic enzyme 2; AtRHM2; UDP-L-rhamnose synthase MUM4; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
37% identity, 96% coverage: 3:323/334 of query aligns to 11:335/667 of Q9LPG6

query
sites
Q9LPG6
L
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
 
F
I
 
I
G
 
A
S
 
S
N
 
H
F
 
V
V
 
A
R
 
N
L
 
R
T
 
L
G
 
I
R
 
R
V
 
N
R
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
Y
H
x
K
I
 
I
T
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
K
F
 
L
T
 
D
Y
 
Y
A
 
C
A
 
S
N
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
L
E
 
D
A
 
P
S
 
S
V
 
F
A
 
S
D
 
S
A
 
P
P
 
N
C
 
F
D
 
K
V
 
F
I
 
V
R
 
K
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
S
P
 
D
G
 
D
V
 
L
L
 
V
D
 
N
E
 
Y
I
 
L
L
 
L
A
 
I
G
 
T
F
 
E
G
 
N
P
 
I
D
 
D
D
 
-
A
 
T
I
 
I
V
 
M
H
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
S
 
T
H
 
H
N
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
S
I
 
F
A
 
G
S
 
N
P
 
S
G
 
F
Q
 
E
F
 
F
V
 
T
H
 
K
T
 
N
N
 
N
I
 
I
T
 
Y
G
 
G
T
 
T
F
 
H
E
 
V
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
C
R
 
K
R
 
V
-
 
T
-
 
G
H
 
Q
D
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
F
H
 
I
H
 
H
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
L
 
T
P
 
D
L
 
E
G
 
D
T
 
A
P
 
A
E
 
V
A
 
G
F
 
N
T
 
H
E
 
E
D
 
A
T
 
S
A
 
Q
Y
 
L
R
 
L
P
 
P
S
 
T
S
 
N
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
S
 
G
A
 
A
D
 
E
M
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
M
A
 
A
W
 
Y
I
 
G
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
P
A
 
V
T
 
I
L
 
T
S
 
T
N
 
R
C
 
G
S
 
N
N
 
N
N
 
V
Y
 
Y
G
|
G
P
 
P
R
 
N
Q
 
Q
H
 
F
V
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
M
I
 
I
P
 
P
R
 
K
Q
 
F
I
 
I
T
 
L
T
 
L
L
 
A
I
 
M
D
 
S
G
 
G
G
 
K
R
 
P
P
 
L
R
 
P
L
 
I
Y
 
H
G
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
S
N
 
N
V
 
V
R
 
R
D
 
S
W
 
Y
I
 
L
H
 
Y
V
 
C
D
 
E
D
 
D
H
 
V
N
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
F
W
 
E
E
 
V
I
 
V
L
 
L
E
 
H
R
 
K
G
 
G
R
 
E
M
 
I
G
 
G
E
 
H
T
 
V
Y
 
Y
L
 
N
I
 
V
G
 
G
A
 
T
D
 
K
G
 
R
Q
 
E
A
 
R
S
 
R
N
 
V
R
 
I
E
 
D
I
 
V
V
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
L
 
K
L
 
L
C
 
F
D
 
G
R
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
E
-
 
S
E
 
S
V
 
I
D
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
E
D
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
F
H
 
N
D
 
D
R
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
A
 
F
I
 
L
D
 
D
A
 
D
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
R
 
K
R
 
K
E
 
-
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
Q
P
 
-
E
 
E
H
 
R
T
 
T
D
 
N
L
 
W
R
 
E
S
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
K
T
 
T
V
 
M
E
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
T
E
 
Q
N
 
N
R
 
P
E
 
E
W
 
W
W
 
W
E
 
G
P
 
D
V
 
V
K
 
S
A
 
G
A
 
A
V
 
L

Sites not aligning to the query:

6vloA X-ray structure of the r141 sugar 4,6-dehydratase from acanthamoeba polyphaga minivirus (see paper)
35% identity, 94% coverage: 3:316/334 of query aligns to 6:319/319 of 6vloA

query
sites
6vloA
L
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
L
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
N
L
 
H
T
 
I
G
 
S
R
 
S
V
 
K
R
 
Y
P
 
D
D
 
N
T
 
V
H
 
N
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
Y
D
|
D
A
x
I
F
 
G
T
 
D
Y
 
Y
A
 
C
A
|
A
N
 
S
E
 
V
A
 
E
S
 
N
V
 
V
A
 
E
-
 
W
D
 
N
A
 
N
P
 
R
C
 
T
D
 
K
V
 
L
I
 
I
R
 
K
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
N
P
 
F
G
 
D
V
 
L
L
 
I
D
 
M
E
 
H
I
 
T
L
 
L
A
 
T
G
 
E
F
 
-
G
 
H
P
 
E
D
 
I
D
 
D
A
 
T
I
 
I
V
 
V
H
 
H
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
H
S
|
S
H
 
H
N
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
S
I
 
F
A
 
K
S
 
N
P
 
S
G
 
L
Q
 
A
F
 
F
V
 
T
H
 
E
T
 
T
N
 
N
I
 
V
T
 
F
G
 
G
T
 
T
F
 
H
E
 
V
I
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
C
A
 
S
R
 
R
R
 
M
H
 
Y
-
 
G
D
 
K
V
 
L
R
 
K
L
 
L
H
 
F
-
 
F
H
 
H
V
x
M
S
 
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
L
 
I
P
 
D
L
 
-
G
 
-
T
 
T
P
 
T
E
 
D
A
 
T
F
 
S
T
 
R
E
 
E
D
 
V
T
 
S
A
 
L
Y
 
L
R
 
C
P
 
P
S
 
T
S
 
N
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
S
 
G
A
 
A
D
 
E
M
 
H
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
S
W
 
Y
I
 
F
R
 
L
T
 
S
Y
 
Y
G
 
K
L
 
L
R
 
P
A
 
I
T
 
I
L
 
I
S
 
A
N
 
R
C
 
C
S
 
N
N
|
N
N
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
R
R
 
N
Q
 
Q
H
 
Y
V
 
P
E
 
E
K
|
K
F
x
L
I
 
I
P
 
P
R
x
K
Q
 
F
I
 
I
T
 
C
T
 
S
L
 
L
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
K
R
 
K
P
 
L
R
x
H
L
 
I
Y
x
Q
G
 
G
S
 
T
G
 
G
E
 
N
N
 
S
V
 
R
R
|
R
D
 
N
W
 
F
I
 
I
H
 
H
V
 
A
D
 
I
D
 
D
H
 
V
N
 
A
A
 
D
A
 
A
V
 
V
W
 
D
E
 
L
I
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
N
G
 
G
R
 
V
M
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
V
D
 
T
G
 
N
Q
 
E
A
 
H
S
 
S
N
x
V
R
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
A
R
 
Q
E
 
I
L
 
L
C
 
C
L
 
D
L
 
I
C
 
A
D
 
G
R
 
V
D
 
N
-
 
L
P
 
E
D
 
N
E
 
Q
V
 
L
D
 
E
F
 
Y
V
 
V
T
 
P
D
 
D
R
|
R
P
 
L
G
 
F
H
 
N
D
 
D
R
 
F
R
|
R
Y
 
Y
A
 
N
I
 
I
D
 
T
A
 
N
T
 
D
K
 
K
L
 
I
R
 
-
R
 
K
E
 
S
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
E
P
 
Q
E
 
S
H
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
F
R
 
K
S
 
K
G
 
E
L
 
L
A
 
V
D
 
E
T
 
L
V
 
F
E
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
K
E
 
V
N
 
N
R
 
R
E
 
H
W
 
R
W
 
Y

Query Sequence

>WP_067476622.1 NCBI__GCF_001659785.1:WP_067476622.1
MRLLVTGGAGFIGSNFVRLTGRVRPDTHITVLDAFTYAANEASVADAPCDVIRGDVADPG
VLDEILAGFGPDDAIVHFAAESHNDNSIASPGQFVHTNITGTFEILEAARRHDVRLHHVS
TDEVYGDLPLGTPEAFTEDTAYRPSSPYSASKASADMLVRAWIRTYGLRATLSNCSNNYG
PRQHVEKFIPRQITTLIDGGRPRLYGSGENVRDWIHVDDHNAAVWEILERGRMGETYLIG
ADGQASNREIVRELCLLCDRDPDEVDFVTDRPGHDRRYAIDATKLRRELGWAPEHTDLRS
GLADTVEWYRENREWWEPVKAAVEAKYAEVEEVL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory