SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068004809.1 NCBI__GCF_001623255.1:WP_068004809.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8pf8C Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-72 (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 3:402/402 of 8pf8C

query
sites
8pf8C
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
x
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
x
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

8oqsC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-83 (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 3:402/402 of 8oqsC

query
sites
8oqsC
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
x
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
x
F
L
x
V
L
 
P
V
x
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
x
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
x
G
E
x
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

8oqpC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-76 (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 3:402/402 of 8oqpC

query
sites
8oqpC
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
x
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
x
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
x
T
P
 
P
R
|
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
x
R
V
x
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

4b3iC Crystal structure of mycobacterium tuberculosis fatty acid beta- oxidation complex with coenzymea bound at the hydratase active sites (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 3:402/402 of 4b3iC

query
sites
4b3iC
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
 
F
C
|
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
x
H
Q
x
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
|
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
x
C
G
 
I
A
x
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

8opuC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with sulfamethoxazole (fragment-b-e1) (see paper)
35% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 3:399/399 of 8opuC

query
sites
8opuC
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
x
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
x
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
x
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
x
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

7o4tD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme with coenzyme a bound at the hydratase, thiolase active sites and possible additional binding site (coa(ech/had)) (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 4:403/403 of 7o4tD

query
sites
7o4tD
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
|
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
x
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
x
R
K
 
P
K
 
D
M
x
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
|
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
|
F
A
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
x
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
x
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

O53871 Putative acyltransferase Rv0859; EC 2.3.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 4:403/403 of O53871

query
sites
O53871
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
x
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

8oqmD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-10 (see paper)
35% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 4:399/399 of 8oqmD

query
sites
8oqmD
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
A
 
V
L
 
A
A
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
x
A
R
|
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
|
R
M
 
V

8opyD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-b-dnq (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 4:401/401 of 8opyD

query
sites
8opyD
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
L
P
 
G
Q
 
G
Y
 
F
A
 
D
Q
 
D
V
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
K
-
 
Y
-
 
H
L
 
W
G
 
V
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
x
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
|
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
x
E
R
 
R
M
 
V

8oqoC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-49 (see paper)
35% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 3:398/398 of 8oqoC

query
sites
8oqoC
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
x
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
P
 
-
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
|
V
L
 
-
G
 
-
R
x
E
K
|
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

8oqlC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-1 (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 3:397/397 of 8oqlC

query
sites
8oqlC
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
x
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
x
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
x
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
 
D
H
 
V
R
 
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
V
L
 
A
A
 
L
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
W
V
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
|
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
x
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
I
V
 
L
S
 
G
T
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
D
T
 
E
L
 
L
D
 
E
M
 
R
V
 
R
Q
 
N
G
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
L
S
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
V
A
 
A
M
 
T
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
R
M
 
V

8opxC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with trehalose (fragment-b-tre) (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:380/383 of query aligns to 3:398/398 of 8opxC

query
sites
8opxC
Q
 
E
T
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
P
 
-
E
 
N
G
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
H
A
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
R
D
 
K
R
 
R
V
 
H
G
 
P
Q
 
D
F
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
G
 
S
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
V
 
A
S
 
A
K
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
S
K
 
G
L
 
M
P
 
P
D
 
V
E
 
T
T
 
S
V
 
G
A
 
G
W
 
V
T
 
Q
I
 
L
N
 
N
N
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
T
A
 
A
S
 
A
S
 
Q
M
 
K
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
W
A
 
D
N
 
D
R
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
M
 
S
M
 
M
S
 
S
C
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
G
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
G
H
 
A
Y
 
M
Y
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
P
T
 
A
L
 
T
P
 
N
E
 
Y
R
x
D
H
 
V
R
x
M
Y
 
F
L
 
V
L
 
P
V
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
T
D
 
I
L
 
E
D
 
G
I
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
E
E
 
D
M
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
Q
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
E
G
 
A
D
 
W
D
 
S
N
 
G
G
 
G
K
 
Y
N
 
F
A
 
A
S
 
K
R
 
S
I
 
V
I
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
D
V
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
D
N
 
H
R
 
D
E
 
E
E
 
H
C
 
M
A
 
R
K
 
P
K
 
D
M
 
T
D
 
T
H
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
A
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
F
 
F
A
 
D
A
 
D
L
 
V
A
 
A
P
 
L
Q
 
Q
Y
x
K
A
 
Y
Q
 
H
V
 
W
L
 
V
G
 
-
R
 
E
K
 
K
V
 
I
D
 
N
H
 
H
R
 
V
H
 
H
T
 
T
I
 
G
A
 
G
H
 
N
A
 
S
P
 
S
P
 
G
M
 
I
T
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
T
 
S
Y
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
I
 
Q
D
 
G
A
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
T
V
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
T
A
 
G
G
 
P
F
 
T
A
 
P
A
 
A
M
 
T
D
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
S
 
A
E
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
D
M
 
I
D
 
D
R
 
L
I
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
S
T
 
V
I
 
V
V
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
D
 
D
H
 
L
P
 
N
H
 
I
L
 
P
E
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
L
N
 
N
T
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
M
G