SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068106355.1 NCBI__GCF_001653335.1:WP_068106355.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6x9lA Crystal structure of aldehyde dehydrogenasE C (aldc) mutant (c291a) from pseudomonas syringae in complexed with NAD+ and octanal (see paper)
46% identity, 99% coverage: 2:470/472 of query aligns to 9:477/485 of 6x9lA

query
sites
6x9lA
R
 
H
T
 
T
V
 
A
Q
 
Q
A
 
K
T
 
F
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
H
W
 
W
A
 
S
P
 
A
G
 
P
T
 
L
G
 
S
S
 
P
T
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
A
V
 
V
S
 
V
S
 
N
A
 
P
A
 
A
D
 
T
G
 
E
S
 
E
V
 
V
L
 
V
T
 
A
R
 
H
F
 
V
Q
 
A
G
 
S
A
 
G
G
 
S
A
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
D
R
 
R
A
 
A
C
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
A
A
 
A
W
 
F
P
 
A
G
 
G
W
 
W
A
 
S
A
 
G
T
 
T
P
 
S
V
 
P
T
 
E
D
 
V
R
 
R
A
 
A
D
 
Q
L
 
V
L
 
I
R
 
G
T
 
R
A
 
I
A
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
I
E
 
I
K
 
E
R
 
R
A
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
Q
T
 
A
A
 
I
A
 
S
Q
 
L
E
 
E
V
 
M
G
 
G
T
 
A
P
 
A
I
 
I
R
 
S
M
 
S
A
 
A
P
 
R
I
 
A
V
 
M
H
 
Q
G
 
V
H
 
P
M
 
L
V
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
H
M
 
V
R
 
R
D
 
V
V
 
A
A
 
R
D
 
D
K
 
L
V
 
L
E
 
A
S
 
T
H
 
Y
T
 
R
F
 
F
E
 
Q
E
 
T
R
 
V
V
 
E
G
 
G
S
 
G
S
 
T
L
 
A
V
 
I
L
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
C
A
 
A
A
 
L
I
|
I
T
|
T
A
 
P
W
|
W
N
|
N
Y
x
W
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
L
 
I
A
 
T
T
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
I
 
L
A
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
A
I
 
L
G
 
L
F
 
F
F
 
A
E
 
Q
A
 
L
L
 
V
A
 
H
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
N
G
 
G
T
 
S
G
|
G
A
x
P
E
 
E
A
 
V
G
|
G
E
 
G
P
 
A
L
 
M
V
 
A
T
 
A
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
I
G
 
D
A
 
M
V
 
I
S
 
S
F
 
I
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
N
R
 
R
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
L
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
P
G
 
T
V
 
V
T
 
K
R
 
R
V
 
V
T
 
T
L
 
Q
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
S
 
N
V
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
F
A
 
A
T
 
N
A
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
P
T
 
G
L
 
V
N
 
M
G
 
A
C
 
A
L
 
F
L
 
R
N
 
N
N
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
x
S
C
x
A
A
 
S
A
 
A
L
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
M
I
 
I
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
T
V
 
A
A
 
G
Q
 
T
L
 
I
R
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
Q
D
 
L
P
 
E
D
 
H
T
 
T
A
 
V
V
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
E
A
 
A
Q
 
Q
H
 
F
H
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
Q
Q
 
A
H
 
M
L
 
I
R
 
N
G
 
A
A
 
G
L
 
I
D
 
C
D
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
L
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
P
D
 
G
A
 
R
P
 
V
E
 
Q
G
 
G
V
 
-
P
 
H
A
 
E
G
 
Q
G
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
V
 
T
R
 
R
P
 
P
T
 
T
V
 
V
L
 
F
-
 
S
R
 
E
V
 
V
E
 
D
P
 
S
S
 
S
M
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
Y
D
 
D
S
 
T
E
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
T
D
 
V
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
G
 
A
A
 
H
V
 
V
W
 
Q
S
 
G
A
 
Q
D
 
D
P
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
L
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
S
R
 
R
L
 
I
R
 
R
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
H
V
 
L
N
 
N
G
 
Y
G
 
P
A
 
S
F
 
W
N
 
N
I
 
P
S
 
M
A
 
A
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
Y
G
 
G
R
 
V
F
 
H
G
 
G
L
 
F
D
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
I

P17202 Aminoaldehyde dehydrogenase BADH; 4-trimethylammoniobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Aminobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Betaine aldehyde dehydrogenase; SoBADH; EC 1.2.1.-; EC 1.2.1.47; EC 1.2.1.19; EC 1.2.1.8 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 3 papers)
39% identity, 98% coverage: 8:470/472 of query aligns to 11:482/497 of P17202

query
sites
P17202
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
E
W
 
W
A
 
R
P
 
E
G
 
P
T
 
I
G
 
K
S
 
K
T
 
N
E
 
R
V
 
I
E
 
P
V
 
V
S
x
I
S
 
N
A
 
P
A
 
S
D
 
T
G
 
E
S
 
E
V
 
I
L
 
I
T
 
G
R
 
D
F
 
I
Q
 
P
G
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
E
R
 
V
A
 
A
C
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
R
A
 
A
W
 
F
-
 
R
-
 
R
P
 
N
G
 
N
W
 
W
A
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
S
V
 
G
T
 
A
D
 
H
R
 
R
A
 
A
D
 
T
L
 
Y
L
 
L
R
 
R
T
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
K
V
 
I
E
 
T
K
 
E
R
 
K
A
 
K
D
 
D
E
 
H
L
 
F
G
 
V
A
 
K
T
 
L
A
 
E
A
 
T
Q
 
I
E
x
D
V
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
I
 
F
R
 
D
M
 
E
A
 
A
P
 
-
I
 
V
V
 
L
H
 
D
G
 
I
H
 
D
M
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
S
T
 
C
M
 
F
R
 
E
D
 
Y
V
 
F
A
 
A
D
 
G
K
 
Q
V
 
A
E
 
E
S
 
A
H
 
L
T
 
D
F
 
G
E
 
K
E
 
Q
R
 
K
V
 
A
G
 
P
S
 
V
S
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
K
-
 
S
-
 
H
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
S
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
L
I
 
I
T
x
S
A
x
P
W
|
W
N
 
N
Y
|
Y
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
Q
 
M
L
 
A
A
 
T
T
x
W
K
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
A
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
|
P
S
|
S
E
|
E
I
x
L
A
 
A
P
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
C
I
 
L
G
 
E
F
 
F
F
 
G
E
 
E
A
 
V
L
 
C
A
 
N
E
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
L
V
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
V
G
 
D
A
 
K
V
 
I
S
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
T
x
S
R
x
A
T
|
T
G
 
G
V
 
S
R
 
K
I
 
V
A
 
M
E
 
A
L
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
L
V
|
V
T
 
K
R
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
S
 
I
V
 
V
L
 
V
L
 
F
D
 
E
D
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
V
P
 
E
A
 
W
T
 
T
L
 
I
N
 
F
G
 
G
C
 
C
L
 
F
L
x
W
N
 
T
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
C
 
C
A
 
S
A
 
A
L
 
T
T
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
P
 
H
R
 
E
A
 
S
R
 
I
L
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
F
E
 
V
E
 
D
I
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
K
A
 
W
V
 
T
A
 
K
Q
 
N
L
 
I
R
 
K
V
 
I
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
F
D
 
E
P
 
E
D
 
G
T
 
C
A
 
R
V
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
I
S
 
S
A
 
K
A
 
G
Q
 
Q
H
 
Y
H
 
D
R
 
K
V
 
I
L
 
M
Q
 
K
H
 
F
L
 
I
R
 
S
G
 
T
A
 
A
L
 
K
D
 
S
D
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
L
S
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
-
D
 
S
A
 
R
P
 
P
E
 
E
G
 
H
V
 
L
P
 
-
A
 
K
G
 
K
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
I
R
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
I
L
 
V
R
 
T
-
 
D
V
 
I
E
 
S
P
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
Q
I
 
I
A
 
W
R
 
K
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
I
 
K
A
 
T
V
 
F
D
 
S
S
 
S
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
T
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
 
N
D
 
D
P
 
L
D
 
E
R
 
R
A
 
C
L
 
E
A
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
K
R
 
A
L
 
L
R
 
E
T
 
V
G
 
G
Q
x
A
V
 
V
A
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
C
G
 
S
A
 
Q
-
 
P
F
x
C
N
 
F
I
 
V
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
x
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
I
K
|
K
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
L
G
 
G
R
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
I
D
 
Q
E
 
N
Y
 
Y
L
 
L
E
 
N
T
 
I
K
 
K
A
 
Q
V
 
V

4v37A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from spinach showing a thiohemiacetal with 3-aminopropionaldehyde
39% identity, 98% coverage: 8:470/472 of query aligns to 9:480/495 of 4v37A

query
sites
4v37A
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
E
W
 
W
A
 
R
P
 
E
G
 
P
T
 
I
G
 
K
S
 
K
T
 
N
E
 
R
V
 
I
E
 
P
V
 
V
S
 
I
S
 
N
A
 
P
A
 
S
D
 
T
G
 
E
S
 
E
V
 
I
L
 
I
T
 
G
R
 
D
F
 
I
Q
 
P
G
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
E
R
 
V
A
 
A
C
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
R
A
 
A
W
 
F
-
 
R
-
 
R
P
 
N
G
 
N
W
 
W
A
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
S
V
 
G
T
 
A
D
 
H
R
 
R
A
 
A
D
 
T
L
 
Y
L
 
L
R
 
R
T
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
K
V
 
I
E
 
T
K
 
E
R
 
K
A
 
K
D
 
D
E
 
H
L
 
F
G
 
V
A
 
K
T
 
L
A
 
E
A
 
T
Q
 
I
E
 
D
V
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
I
 
F
R
 
D
M
 
E
A
 
A
P
 
-
I
 
V
V
 
L
H
 
D
G
 
I
H
 
D
M
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
S
T
 
C
M
 
F
R
 
E
D
 
Y
V
 
F
A
 
A
D
 
G
K
 
Q
V
 
A
E
 
E
S
 
A
H
 
L
T
 
D
F
 
G
E
 
K
E
 
Q
R
 
K
V
 
A
G
 
P
S
 
V
S
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
K
-
 
S
-
 
H
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
S
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
L
I
|
I
T
x
S
A
x
P
W
|
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
Q
x
M
L
 
A
A
 
T
T
 
W
K
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
A
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
I
 
L
A
 
A
P
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
C
I
 
L
G
 
E
F
 
F
F
 
G
E
 
E
A
 
V
L
 
C
A
 
N
E
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
L
V
 
T
G
 
G
T
 
L
G
|
G
A
 
P
E
 
D
A
 
A
G
|
G
E
x
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
 
V
G
 
D
A
 
K
V
 
I
S
 
A
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
S
R
 
A
T
|
T
G
 
G
V
 
S
R
 
K
I
 
V
A
 
M
E
 
A
L
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
L
V
 
V
T
 
K
R
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
S
 
I
V
 
V
L
 
V
L
 
F
D
 
E
D
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
V
P
 
E
A
 
W
T
 
T
L
 
I
N
 
F
G
 
G
C
 
C
L
 
F
L
 
W
N
 
T
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
C
x
A
A
 
S
A
 
A
L
 
T
T
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
P
 
H
R
 
E
A
 
S
R
 
I
L
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
F
E
 
V
E
 
D
I
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
K
A
 
W
V
 
T
A
 
K
Q
 
N
L
 
I
R
 
K
V
 
I
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
F
D
 
E
P
 
E
D
 
G
T
 
C
A
 
R
V
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
I
S
 
S
A
 
K
A
 
G
Q
 
Q
H
 
Y
H
 
D
R
 
K
V
 
I
L
 
M
Q
 
K
H
 
F
L
 
I
R
 
S
G
 
T
A
 
A
L
 
K
D
 
S
D
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
L
S
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
-
D
 
S
A
 
R
P
 
P
E
 
E
G
 
H
V
 
L
P
 
-
A
 
K
G
 
K
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
I
R
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
I
L
 
V
R
 
T
-
 
D
V
 
I
E
 
S
P
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
Q
I
 
I
A
 
W
R
 
K
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
I
 
K
A
 
T
V
 
F
D
 
S
S
 
S
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
T
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
 
N
D
 
D
P
 
L
D
 
E
R
 
R
A
 
C
L
 
E
A
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
K
R
 
A
L
 
L
R
 
E
T
 
V
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
A
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
C
G
 
S
A
 
Q
-
 
P
F
x
C
N
 
F
I
 
V
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
x
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
I
K
 
K
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
L
G
 
G
R
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
I
D
 
Q
E
 
N
Y
 
Y
L
 
L
E
 
N
T
 
I
K
 
K
A
 
Q
V
 
V

4o6rA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
39% identity, 98% coverage: 8:470/472 of query aligns to 7:475/489 of 4o6rA

query
sites
4o6rA
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
R
W
 
F
A
 
V
P
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
D
S
 
R
T
 
G
E
 
T
V
 
I
E
 
D
V
 
V
S
 
L
S
 
N
A
 
P
A
 
H
D
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
T
 
T
R
 
K
F
 
I
Q
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
D
R
 
L
A
 
A
C
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
T
R
 
R
A
 
A
W
 
F
P
 
P
G
 
A
W
 
W
A
 
S
A
 
A
T
 
M
P
 
P
V
 
A
T
 
A
D
 
E
R
 
R
A
 
G
D
 
R
L
 
L
L
 
L
R
 
L
T
 
R
A
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
A
R
 
N
A
 
T
D
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
Q
T
 
L
A
 
E
A
 
S
Q
 
L
E
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
H
P
 
P
I
 
I
R
 
R
M
 
D
A
 
S
P
 
R
I
 
A
V
 
L
H
 
D
G
 
V
H
 
P
M
 
R
V
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
C
M
 
F
R
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
D
 
G
V
 
M
A
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
L
E
 
Q
S
 
G
H
 
S
T
 
V
F
 
I
E
 
P
E
 
V
R
 
D
V
 
T
G
 
G
S
 
F
-
 
L
S
 
N
L
 
Y
V
 
V
L
 
Q
R
 
R
E
 
A
S
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
Q
I
|
I
T
x
V
A
 
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
Y
 
M
Q
 
F
L
 
T
A
 
S
T
 
W
K
 
K
L
 
M
V
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
I
 
L
G
 
R
F
 
I
F
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
G
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
V
V
 
P
G
 
G
T
 
Y
G
|
G
A
 
H
E
 
T
A
 
A
G
|
G
E
x
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
I
S
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
R
 
A
T
|
T
G
 
G
V
 
R
R
|
R
I
 
I
A
 
V
E
 
E
L
 
A
A
 
S
A
 
Q
A
 
G
G
 
N
V
 
L
T
 
K
R
 
R
V
 
V
T
 
Q
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
A
S
 
N
V
 
I
L
 
V
L
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
A
 
D
T
 
A
A
 
A
V
 
I
P
 
N
A
 
G
T
 
A
L
 
A
N
 
W
G
 
A
C
 
I
L
 
F
L
 
H
N
 
N
N
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
C
|
C
A
 
I
A
 
A
L
 
G
T
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
V
V
 
L
P
 
-
R
 
H
A
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
D
-
 
A
V
 
F
E
 
L
E
 
E
I
 
R
L
 
F
A
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
S
Q
 
S
L
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
N
T
 
T
A
 
E
V
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
T
S
 
S
A
 
K
A
 
Q
Q
 
H
H
 
L
H
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
H
 
Y
L
 
V
R
 
D
G
 
V
A
 
A
L
 
R
D
 
E
D
 
Q
G
 
G
A
 
G
T
 
R
V
 
V
V
 
L
S
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
S
D
 
A
A
 
P
P
 
Q
E
 
D
G
 
P
V
 
A
P
 
L
A
 
A
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
R
 
R
P
 
P
T
 
T
V
 
I
L
 
V
R
 
E
V
 
A
E
 
K
P
 
H
S
 
A
M
 
T
-
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
F
L
 
V
C
 
T
V
 
V
I
 
L
A
 
R
V
 
F
D
 
G
S
 
S
E
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
A
T
 
T
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
G
 
S
A
 
G
V
 
L
W
 
W
S
 
T
A
 
N
D
 
D
P
 
L
D
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
H
A
 
R
V
 
M
A
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
I
R
 
D
T
 
A
G
 
G
Q
 
M
V
 
C
A
 
W
V
 
I
N
 
N
G
 
C
-
 
Y
G
 
K
A
 
R
F
 
V
N
 
N
I
 
P
S
 
G
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
K
 
G
R
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
M
G
 
G
R
 
F
F
 
E
G
 
A
L
 
M
D
 
H
E
 
D
Y
 
Y
L
 
T
E
 
E
T
 
A
K
 
R
A
 
S
V
 
V

3ty7B Crystal structure of aldehyde dehydrogenase family protein from staphylococcus aureus
38% identity, 100% coverage: 1:470/472 of query aligns to 2:449/454 of 3ty7B

query
sites
3ty7B
M
 
M
R
 
R
T
 
D
V
 
Y
Q
 
T
A
 
K
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
D
 
N
G
 
G
A
 
E
W
 
W
A
 
V
P
 
E
G
 
S
T
 
N
G
 
S
S
 
N
T
 
E
E
 
T
V
 
I
E
 
E
V
 
V
S
x
I
S
 
N
A
 
P
A
 
A
D
 
T
G
 
E
S
 
E
V
 
V
L
 
I
T
 
G
R
 
K
F
 
V
Q
 
A
G
 
K
A
 
G
G
 
N
A
 
K
E
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
D
R
 
K
A
 
A
C
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
D
A
 
V
W
 
Y
P
 
L
G
 
E
W
 
F
A
 
R
A
 
H
T
 
T
P
 
S
V
 
V
T
 
K
D
 
E
R
 
R
A
 
Q
D
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
D
T
 
K
A
 
I
A
 
V
E
 
K
L
 
E
V
 
Y
E
 
E
K
 
N
R
 
R
A
 
K
D
 
D
E
 
D
L
 
I
G
 
V
A
 
Q
T
 
A
A
 
I
A
 
T
Q
 
D
E
 
E
V
 
L
G
 
G
T
 
A
P
 
P
I
 
L
R
 
S
M
 
L
A
 
S
P
 
E
I
 
R
V
 
V
H
 
H
-
 
Y
-
 
Q
-
 
M
-
 
G
-
 
L
G
 
N
H
 
H
M
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
-
M
 
-
R
 
R
D
 
D
V
 
A
A
 
L
D
 
D
K
 
N
V
 
Y
E
 
E
S
 
-
H
 
-
T
 
-
F
 
F
E
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
R
G
 
G
S
 
D
S
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
R
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
S
A
 
G
A
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
L
 
T
Y
 
N
Q
 
Q
L
 
T
A
 
S
T
 
L
K
 
K
L
 
L
V
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
S
T
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
I
x
E
A
 
T
P
 
P
L
 
F
T
 
A
T
 
A
I
 
V
G
 
I
F
 
L
F
 
A
E
 
E
A
 
I
L
 
F
A
 
D
E
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
N
G
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
G
A
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
S
T
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
K
V
 
V
G
 
R
A
 
M
V
 
M
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
G
R
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
S
R
 
K
I
 
I
A
 
M
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
G
 
D
V
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
V
T
 
S
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
K
T
 
E
A
 
A
V
 
A
P
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
T
N
 
G
G
 
K
C
 
V
L
 
V
L
 
N
N
 
N
N
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
C
|
C
A
 
T
A
 
A
L
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
L
V
 
V
P
 
P
R
 
N
-
 
K
-
 
I
-
 
K
-
 
D
A
 
A
R
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
K
E
 
E
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
Q
V
 
F
A
 
S
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
E
P
 
D
D
 
G
T
 
T
A
 
Q
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
I
S
 
S
A
 
K
A
 
K
Q
 
Q
H
 
F
H
 
D
R
 
Q
V
 
V
L
 
Q
Q
 
N
H
 
Y
L
 
I
R
 
N
G
 
K
A
 
G
L
 
I
D
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
L
V
 
F
S
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
P
D
 
G
A
 
K
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
E
A
 
K
G
 
-
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
P
 
P
T
 
T
V
 
I
-
 
F
L
 
I
R
 
N
V
 
V
E
 
D
P
 
N
S
 
Q
M
 
M
R
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
C
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
T
V
 
Y
D
 
N
S
 
D
E
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
V
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
T
D
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
Y
V
 
V
W
 
I
S
 
G
A
 
K
D
 
D
P
 
K
D
 
E
R
 
T
A
 
L
L
 
H
A
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
S
L
 
I
R
 
E
T
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
A
 
E
V
 
I
N
 
N
G
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
N
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
E
G
 
A
G
 
G
R
 
-
F
 
-
G
 
G
L
 
I
D
 
E
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
S
V
 
I

3b4wA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis aldehyde dehydrogenase complexed with NAD+
39% identity, 99% coverage: 8:472/472 of query aligns to 9:477/483 of 3b4wA

query
sites
3b4wA
Y
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
G
A
 
K
W
 
W
A
 
T
P
 
K
G
 
P
T
 
S
G
 
T
S
 
S
T
 
D
E
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
V
S
 
R
S
 
C
A
 
P
A
 
A
D
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
Y
L
 
V
T
 
G
R
 
K
F
 
V
Q
 
P
G
 
M
A
 
A
G
 
A
A
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
D
R
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
A
A
 
A
W
 
F
P
 
D
G
 
N
-
 
G
-
 
P
W
 
W
A
 
P
A
 
S
T
 
T
P
 
P
V
 
P
T
 
H
D
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
A
L
 
V
L
 
I
R
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
M
V
 
L
E
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
K
D
 
D
E
 
L
L
 
F
G
 
T
A
 
K
T
 
L
A
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
V
 
T
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
I
 
P
R
 
T
M
 
I
A
 
I
P
 
E
I
 
T
V
 
M
H
 
H
G
 
W
H
 
M
M
 
G
V
 
S
A
 
M
A
 
G
T
 
A
M
 
M
R
 
N
D
 
Y
V
 
F
A
 
A
D
 
G
K
 
A
V
 
A
E
 
D
S
 
K
H
 
V
T
 
T
F
 
W
E
 
T
E
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
G
R
 
S
V
 
Y
G
 
G
S
 
Q
S
 
S
L
 
I
V
 
V
L
 
S
R
 
R
E
 
E
S
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
A
I
|
I
T
x
V
A
 
A
W
|
W
N
|
N
Y
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
Q
 
L
L
 
A
A
 
V
T
 
N
K
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
I
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
 
A
I
 
E
A
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
T
T
 
A
I
 
N
G
 
A
F
 
L
F
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
L
N
 
S
L
 
V
V
 
V
V
 
P
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
x
I
E
 
E
A
 
T
G
|
G
E
 
Q
P
 
A
L
 
L
V
 
T
T
 
S
D
 
N
P
 
P
R
 
D
V
 
I
G
 
D
A
 
M
V
 
F
S
 
T
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
S
R
 
A
T
x
V
G
 
G
V
 
R
R
x
E
I
 
V
A
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
M
V
 
L
T
 
K
R
 
P
V
 
C
T
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
S
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
E
D
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
A
A
 
A
V
 
I
P
 
P
A
 
M
T
 
M
L
 
V
N
 
F
G
 
S
C
 
G
L
 
V
L
 
M
N
 
N
N
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
G
C
|
C
A
 
V
A
 
N
L
 
Q
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
L
V
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
S
R
 
R
L
 
Y
A
 
D
E
 
E
V
 
I
E
 
V
E
 
A
I
 
A
L
 
V
A
 
T
A
 
N
A
 
F
V
 
V
A
 
T
Q
 
A
L
 
L
R
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
P
P
 
P
R
 
S
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
A
A
 
Q
V
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
I
S
 
S
A
 
E
A
 
K
Q
 
Q
H
 
R
H
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
E
Q
 
G
H
 
Y
L
 
I
R
 
A
G
 
K
A
 
G
L
 
I
D
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
L
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
-
D
 
G
A
 
R
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
L
P
 
-
A
 
D
G
 
N
G
 
G
Y
 
F
Y
 
F
V
 
I
R
 
Q
P
 
P
T
 
T
V
 
V
L
 
F
-
 
A
R
 
D
V
 
V
E
 
D
P
 
N
S
 
K
M
 
M
R
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
P
V
 
Y
D
 
D
S
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
S
D
 
V
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
V
W
 
W
S
 
T
A
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
P
R
 
K
A
 
G
L
 
I
A
 
K
V
 
I
A
 
S
R
 
Q
R
 
Q
L
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
Y
A
 
G
V
 
I
N
 
N
G
 
W
G
 
Y
A
 
A
F
 
F
N
 
D
I
 
P
S
 
G
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
R
 
N
S
 
S
G
 
G
Y
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
N
G
 
G
R
 
P
F
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
E
E
 
H
Y
 
F
L
 
T
E
 
Q
T
 
Q
K
 
K
A
 
S
V
 
V
Q
 
L
L
 
L

4neaA 1.90 angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from staphylococcus aureus in complex with NAD+ and bme-free cys289 (see paper)
37% identity, 99% coverage: 5:470/472 of query aligns to 18:491/505 of 4neaA

query
sites
4neaA
Q
 
Q
A
 
R
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
E
W
 
W
A
 
V
P
 
E
G
 
S
T
 
A
G
 
N
S
 
K
T
 
N
E
 
T
V
 
R
E
 
D
V
 
I
S
 
I
S
 
N
A
 
P
A
 
Y
D
 
N
G
 
Q
S
 
E
V
 
V
L
 
I
T
 
F
R
 
T
F
 
V
Q
 
S
G
 
E
A
 
G
G
 
T
A
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
A
A
 
E
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
R
A
 
A
W
 
F
P
 
E
G
 
S
-
 
G
-
 
E
W
 
W
A
 
S
A
 
Q
T
 
E
P
 
T
V
 
A
T
 
E
D
 
T
R
 
R
A
 
G
D
 
K
L
 
K
L
 
V
R
 
R
T
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
D
L
 
K
V
 
I
E
 
K
K
 
E
R
 
H
A
 
R
D
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
R
T
 
L
A
 
E
A
 
T
Q
 
L
E
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
K
P
 
T
I
 
L
R
 
E
-
 
E
-
 
S
M
 
Y
A
 
A
P
 
D
I
 
M
V
 
D
H
 
D
G
 
I
H
 
H
M
 
N
V
 
V
A
 
F
A
 
M
T
 
Y
M
 
F
R
 
A
D
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
D
E
 
G
S
 
G
H
 
E
T
 
M
F
 
I
E
 
D
E
 
S
R
 
P
V
 
I
-
 
P
-
 
D
G
 
T
S
 
E
S
 
S
L
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
E
 
E
S
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
x
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
Q
 
Q
L
 
A
A
 
S
T
 
W
K
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
T
G
 
G
C
 
C
T
 
S
V
 
L
V
 
V
L
 
M
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
I
 
I
A
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
R
F
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
L
L
 
M
A
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
G
 
K
G
 
G
V
 
T
A
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
A
G
|
G
A
 
S
E
 
E
A
 
V
G
|
G
E
 
D
P
 
V
L
 
M
V
 
S
T
 
G
D
 
H
P
 
K
R
 
E
V
 
V
G
 
D
A
 
L
V
 
V
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
T
 
I
R
 
E
T
|
T
G
 
G
V
 
K
R
x
H
I
|
I
A
 
M
E
 
K
L
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
N
G
 
N
V
 
V
T
 
T
R
 
N
V
 
I
T
 
A
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
N
A
 
P
S
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
F
A
 
E
T
 
L
A
 
A
V
 
V
P
 
D
A
 
Q
T
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
C
 
G
L
 
Y
L
 
F
N
 
H
N
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
C
|
C
A
 
S
A
 
A
L
 
G
T
 
S
R
 
R
L
 
I
I
 
L
V
 
V
P
 
Q
R
 
N
A
 
S
R
 
I
L
 
K
A
 
D
E
 
K
V
 
F
E
 
E
E
 
Q
I
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
D
A
 
R
V
 
V
A
 
K
Q
 
K
L
 
I
R
 
K
V
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
G
R
 
F
D
 
D
P
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
E
V
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
I
S
 
S
A
 
T
A
 
E
Q
 
H
H
 
R
H
 
N
R
 
K
V
 
I
L
 
E
Q
 
S
H
 
Y
L
 
M
R
 
D
G
 
V
A
 
A
L
 
K
D
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
A
S
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
K
D
 
R
A
 
P
P
 
D
E
 
R
G
 
D
V
 
D
P
 
L
A
 
K
G
 
D
G
 
G
Y
 
L
Y
 
F
V
 
F
R
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
V
L
 
I
-
 
T
R
 
N
V
 
C
E
 
D
P
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
V
R
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
C
 
T
V
 
V
I
 
E
A
 
G
V
 
F
D
 
E
S
 
T
E
 
E
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
V
 
L
A
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
S
D
 
I
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
W
 
F
S
 
S
A
 
K
D
 
D
P
 
I
D
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
Q
A
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
N
R
 
K
L
 
L
R
 
K
T
 
L
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
A
 
W
V
 
I
N
 
N
G
 
D
-
 
F
G
 
H
A
 
P
F
 
Y
N
 
F
I
 
A
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
 
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
Y
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
L
G
 
G
R
 
K
F
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
H
V
 
I

4go4A Crystal structure of pnpe in complex with nicotinamide adenine dinucleotide
38% identity, 98% coverage: 8:470/472 of query aligns to 6:473/487 of 4go4A

query
sites
4go4A
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
R
W
 
F
A
 
V
P
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
A
S
 
G
T
 
G
E
 
T
V
 
I
E
 
D
V
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
P
A
 
H
D
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
F
 
I
Q
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
E
A
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
D
R
 
L
A
 
A
C
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
K
R
 
R
A
 
A
W
 
F
P
 
P
G
 
A
W
 
W
A
 
S
A
 
A
T
 
L
P
 
G
V
 
A
T
 
A
D
 
E
R
 
R
A
 
G
D
 
R
L
 
L
L
 
L
R
 
L
T
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
R
V
 
I
E
 
E
K
 
E
R
 
C
A
 
S
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
Q
T
 
L
A
 
E
A
 
S
Q
 
L
E
 
N
V
 
T
G
 
G
T
 
H
P
 
P
I
 
I
R
 
R
M
 
D
A
 
S
P
 
R
I
 
G
V
 
L
H
 
D
G
 
V
H
 
P
M
 
R
V
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
C
M
 
F
R
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
D
 
G
V
 
M
A
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
I
E
 
E
S
 
G
H
 
S
T
 
V
F
 
I
E
 
P
E
 
V
R
 
D
V
 
A
G
 
G
S
 
F
-
 
L
S
 
N
L
 
Y
V
 
V
L
 
Q
R
 
R
E
 
K
S
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
Q
I
|
I
T
x
V
A
 
P
W
|
W
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
Y
 
M
Q
x
F
L
 
T
A
 
S
T
 
W
K
 
K
L
 
M
V
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
V
L
 
I
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
I
 
L
G
 
R
F
 
I
F
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
M
A
 
T
E
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
G
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
V
V
 
V
V
 
P
G
 
G
T
 
Y
G
|
G
A
 
H
E
 
T
A
 
A
G
|
G
E
x
Q
P
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
E
D
 
H
P
 
L
R
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
I
S
 
A
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
R
 
A
T
|
T
G
 
G
V
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
V
E
 
E
L
 
A
A
 
S
A
 
K
A
 
S
G
 
N
V
 
L
T
 
K
R
 
R
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
|
G
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
A
S
 
N
V
 
I
L
 
V
L
 
F
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
E
T
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
N
A
 
G
T
 
A
L
 
A
N
 
W
G
 
A
C
 
I
L
 
F
L
 
H
N
 
N
N
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
C
|
C
A
 
I
A
 
A
L
 
G
T
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
L
P
 
H
R
 
K
A
 
D
R
 
I
L
 
A
A
 
D
E
 
Q
V
 
F
E
 
L
E
 
E
I
 
R
L
 
F
A
 
I
A
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
K
Q
 
S
L
 
I
R
 
R
V
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
M
D
 
D
P
 
P
D
 
E
T
 
T
A
 
E
V
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
T
S
 
S
A
 
A
A
 
L
Q
 
R
H
 
R
H
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
H
 
Y
L
 
I
R
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
I
D
 
E
D
 
Q
G
 
G
A
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
K
D
 
A
A
 
P
P
 
D
E
 
D
G
 
K
V
 
A
P
 
L
A
 
A
G
 
N
G
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
V
L
 
V
R
 
E
V
 
A
E
 
K
P
 
P
S
 
Q
M
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
C
R
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
F
L
 
V
C
 
T
V
 
V
I
 
V
A
 
R
V
 
F
D
 
S
S
 
S
E
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
N
T
 
T
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
G
 
S
A
 
G
V
 
L
W
 
W
S
 
T
A
 
Q
D
 
N
P
 
L
D
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
H
A
 
K
V
 
M
A
 
A
R
 
H
R
 
A
L
 
I
R
 
H
T
 
A
G
 
G
Q
 
M
V
 
C
A
 
W
V
 
I
N
 
N
G
 
C
-
 
Y
G
 
K
A
 
R
F
 
V
N
 
S
I
 
P
S
 
G
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
K
 
G
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
M
G
 
G
R
 
F
F
 
E
G
 
A
L
 
I
D
 
H
E
 
D
Y
 
Y
L
 
T
E
 
E
T
 
A
K
 
R
A
 
S
V
 
V

Q84LK3 Betaine aldehyde dehydrogenase 2; OsBADH2; EC 1.2.1.8 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
42% identity, 88% coverage: 58:470/472 of query aligns to 66:485/503 of Q84LK3

query
sites
Q84LK3
W
 
W
A
 
A
A
 
R
T
 
A
P
 
P
V
 
G
T
 
A
D
 
V
R
 
R
A
 
A
D
 
K
L
 
Y
L
 
L
R
 
R
T
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
K
V
 
I
E
 
I
K
 
E
R
 
R
A
 
K
D
 
S
E
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
R
T
 
L
A
 
E
A
 
T
Q
 
L
E
 
D
V
 
C
G
 
G
T
 
K
P
 
P
I
 
L
R
 
D
M
 
E
A
 
A
P
 
A
I
 
W
V
 
D
H
 
M
G
 
D
H
 
D
M
 
-
V
 
V
A
 
A
A
 
G
T
 
C
M
 
F
R
 
E
D
 
Y
V
 
F
A
 
A
D
 
D
K
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
S
H
 
L
T
 
D
F
 
K
E
 
R
E
 
Q
R
 
N
V
 
A
G
 
P
S
 
V
S
 
S
L
 
L
V
 
P
L
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
K
-
 
C
-
 
Y
-
 
L
-
 
R
R
 
K
E
 
E
S
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
Q
 
M
L
 
A
A
 
T
T
x
W
K
 
K
L
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
I
 
L
A
 
A
P
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
C
I
 
L
G
 
E
F
 
L
F
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
C
A
 
K
E
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
A
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
S
T
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
G
V
 
V
G
 
D
A
 
K
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
Y
R
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
K
R
 
K
I
 
I
A
 
M
E
 
A
L
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
P
G
 
M
V
 
V
T
 
K
R
 
P
V
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
S
 
I
V
 
V
L
 
V
L
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
E
T
 
K
A
 
A
V
 
V
P
 
E
A
 
W
T
 
T
L
 
L
N
 
F
G
 
G
C
 
C
L
 
F
L
 
W
N
 
T
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
C
 
C
A
 
S
A
 
A
L
 
T
T
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
L
P
 
H
R
 
K
A
 
K
R
 
I
L
 
A
A
 
K
E
 
E
V
 
F
E
 
Q
E
 
E
I
 
R
L
 
M
A
 
V
A
 
A
A
 
W
V
 
A
A
 
K
Q
 
N
L
 
I
R
 
K
V
 
V
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
L
D
 
E
P
 
E
D
 
G
T
 
C
A
 
R
V
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
S
 
S
A
 
E
A
 
G
Q
 
Q
H
 
Y
H
 
E
R
 
K
V
 
I
L
 
K
Q
 
Q
H
 
F
L
 
V
R
 
S
G
 
T
A
 
A
L
 
K
D
 
S
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
-
A
 
R
P
 
P
E
 
K
G
 
H
V
 
L
P
 
-
A
 
E
G
 
K
G
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
V
 
I
R
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
I
L
 
I
R
 
T
-
 
D
V
 
V
E
 
D
P
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
Q
I
 
I
A
 
W
R
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
I
 
K
A
 
E
V
 
F
D
 
S
S
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
T
D
 
H
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
W
 
L
S
 
S
A
 
G
D
 
D
P
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
C
L
 
Q
A
 
R
V
 
L
A
 
T
R
 
E
R
 
E
L
 
I
R
 
D
T
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
I
A
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
C
G
 
S
A
 
Q
-
 
P
F
 
C
N
 
F
I
 
C
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
 
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
N
K
 
K
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
L
G
 
G
R
 
E
F
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
E
 
N
Y
 
Y
L
 
L
E
 
S
T
 
V
K
 
K
A
 
Q
V
 
V

O24174 Betaine aldehyde dehydrogenase 1; OsBADH1; EC 1.2.1.8 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 8:470/472 of query aligns to 13:487/505 of O24174

query
sites
O24174
Y
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
G
A
 
G
W
 
W
A
 
R
P
 
E
G
 
P
T
 
S
G
 
L
S
 
G
T
 
R
E
 
R
V
 
L
E
 
P
V
 
V
S
 
V
S
 
N
A
 
P
A
 
A
D
 
T
G
 
E
S
 
A
V
 
T
L
 
I
T
 
G
R
 
D
F
 
I
Q
 
P
G
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
E
R
 
L
A
 
A
C
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
D
A
 
A
W
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
G
P
 
R
G
 
H
W
 
W
A
 
S
A
 
R
T
 
A
P
 
P
V
 
G
T
 
A
D
 
V
R
 
R
A
 
A
D
 
K
L
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
K
V
 
I
E
 
K
K
 
D
R
 
K
A
 
K
D
 
S
E
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
L
T
 
L
A
 
E
A
 
T
Q
 
L
E
 
D
V
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
I
 
L
R
 
D
M
 
E
A
 
A
P
 
-
I
 
-
V
 
-
H
 
A
G
 
G
H
 
D
M
 
M
-
 
E
-
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
C
M
 
F
R
 
E
D
 
Y
V
 
Y
A
 
A
D
 
D
K
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
A
H
 
L
T
 
D
F
 
G
E
 
K
E
 
Q
R
 
R
V
 
A
G
 
P
S
 
I
S
 
S
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
E
-
 
S
-
 
Y
V
 
V
L
 
L
R
 
K
E
 
E
S
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
P
W
 
W
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
Q
 
M
L
 
A
A
 
T
T
x
W
K
 
K
L
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
I
 
L
A
 
A
P
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
C
I
 
L
G
 
E
F
 
L
F
 
G
E
 
G
A
 
I
L
 
C
A
 
A
E
 
E
A
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
A
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
T
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
H
V
 
V
G
 
D
A
 
K
V
 
I
S
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
R
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
M
E
 
I
L
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
V
 
V
T
 
K
R
 
P
V
 
V
T
 
S
L
 
L