SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068107728.1 NCBI__GCF_001653335.1:WP_068107728.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6jixA The cyrstal structure of taurine:2-oxoglutarate aminotransferase from bifidobacterium kashiwanohense, in complex with plp and glutamate (see paper)
41% identity, 98% coverage: 7:450/454 of query aligns to 1:443/447 of 6jixA

query
sites
6jixA
L
 
M
P
 
E
S
 
E
L
 
L
S
 
T
E
 
G
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
R
 
A
R
 
S
D
 
L
D
 
H
R
 
S
A
 
E
H
 
Y
V
 
V
F
 
M
H
 
Q
S
|
S
W
|
W
S
 
H
A
 
K
Q
 
Q
A
 
G
Q
 
-
I
 
-
D
 
G
P
 
P
L
 
V
-
 
K
P
 
P
I
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
D
G
 
G
S
 
I
H
 
Y
F
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
Y
A
 
D
G
 
G
T
 
K
K
 
R
Y
 
Y
L
 
T
D
 
D
F
 
M
S
 
S
S
 
S
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
C
V
 
S
N
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
H
Q
 
E
H
 
L
P
 
P
R
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
E
 
E
Y
 
Q
A
 
A
G
 
D
R
 
N
L
 
M
C
 
C
T
 
F
V
 
M
A
 
A
P
|
P
P
x
A
F
x
Y
A
 
A
N
 
S
D
 
E
M
 
P
R
 
K
S
 
S
E
 
R
A
 
L
A
 
A
R
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
A
-
 
D
P
 
P
G
 
D
T
 
F
L
 
Y
N
 
Q
K
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
N
 
N
G
 
G
G
|
G
A
|
A
D
 
D
A
 
S
N
 
N
E
 
E
H
 
N
A
 
A
V
 
I
R
 
K
M
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
M
H
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
F
A
 
S
A
 
C
Y
 
Y
R
 
R
S
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
A
 
S
T
 
T
A
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
S
T
 
N
M
 
A
T
 
S
G
 
G
D
 
D
P
 
W
R
 
R
R
 
R
W
 
F
G
 
A
A
 
T
E
 
E
P
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
S
L
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
V
H
 
H
F
 
F
W
 
M
G
 
N
P
 
P
Y
 
N
P
 
M
Y
 
Y
R
 
E
S
 
D
A
 
G
F
 
Y
-
 
T
H
 
R
S
 
G
S
 
V
D
 
D
V
 
D
E
 
A
E
 
T
E
 
V
G
 
T
A
 
A
R
 
D
A
 
Y
L
 
L
Q
 
H
H
 
R
L
 
L
R
 
D
D
 
E
T
 
Q
I
 
L
M
 
Q
V
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
D
T
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
L
L
 
M
E
|
E
T
 
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
A
N
 
N
G
 
G
I
 
V
L
 
I
V
 
L
P
 
P
P
 
P
P
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
I
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
K
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
M
V
 
I
A
 
C
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
|
M
S
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
K
W
 
M
F
 
F
A
 
A
V
 
W
D
 
Q
H
 
N
W
 
F
A
 
D
I
 
V
T
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
M
I
 
F
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
V
N
 
T
S
 
C
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
S
D
 
K
T
 
R
V
 
I
A
 
S
A
 
D
T
 
Y
F
 
F
D
 
T
D
 
D
R
 
H
A
 
V
Y
 
L
P
 
Q
G
 
C
G
 
G
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
A
A
 
G
V
 
V
A
 
A
S
 
A
M
 
V
T
 
N
I
 
Y
M
 
Y
R
 
L
E
 
E
E
 
H
G
 
D
I
 
V
V
 
C
E
 
A
H
 
H
A
 
V
R
 
K
D
 
E
L
 
M
G
 
-
T
 
E
D
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
K
P
 
P
A
 
F
L
 
L
A
 
E
K
 
S
L
 
M
A
 
V
E
 
E
N
 
K
H
 
H
P
 
K
S
 
C
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
C
L
 
I
G
 
G
V
 
L
F
 
F
W
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
T
L
 
I
V
 
V
R
 
K
D
 
N
R
 
K
D
 
E
T
 
T
R
 
R
E
 
E
P
 
L
L
 
M
V
 
A
P
 
P
Y
 
Y
N
 
H
A
 
T
S
 
P
G
 
N
S
 
S
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
V
M
 
M
G
 
P
E
 
Q
V
 
I
A
 
M
A
 
A
E
 
K
C
 
L
K
 
M
R
 
D
R
 
L
G
 
G
L
 
F
W
 
S
P
 
T
F
 
F
V
 
G
H
 
R
F
 
E
N
 
T
R
 
N
V
 
I
H
 
N
V
 
I
V
 
C
P
 
P
P
 
P
C
 
L
T
 
I
T
 
I
T
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
Q
V
 
L
L
 
E
E
 
E
G
 
E
I
 
L
E
 
P
V
 
K
L
 
L
D
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
T
V
 
W
A
 
V
D
 
D
R
 
E

6io1B Crystal structure of a novel thermostable (s)-enantioselective omega- transaminase from thermomicrobium roseum (see paper)
38% identity, 93% coverage: 18:438/454 of query aligns to 11:439/448 of 6io1B

query
sites
6io1B
D
 
K
D
 
D
R
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
H
F
 
L
H
 
H
S
 
P
W
x
L
S
 
T
A
 
N
Q
 
L
A
 
Y
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
G
P
 
P
L
 
L
P
 
V
I
 
L
A
 
V
A
 
R
A
 
G
L
 
E
G
 
G
S
 
V
H
 
W
F
 
V
W
 
W
D
 
D
Y
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
K
K
 
R
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
G
S
 
F
S
 
A
Q
 
G
L
 
L
V
 
W
N
 
N
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
Q
 
G
H
 
R
P
 
R
R
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
A
Q
 
R
E
 
E
Y
 
Q
A
 
M
G
 
E
R
 
R
L
 
V
C
 
A
T
 
F
V
 
V
A
 
P
P
 
T
P
 
F
F
 
F
-
 
G
-
 
L
A
 
A
N
 
S
D
 
P
M
 
P
R
 
T
S
 
I
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
P
L
 
L
N
 
D
K
 
H
V
 
F
F
 
Q
F
 
F
T
 
T
N
 
S
G
|
G
G
|
G
A
|
A
D
 
E
A
 
S
N
|
N
E
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
I
R
 
K
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
Y
H
 
Y
-
 
W
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
Q
T
 
P
G
 
E
R
 
R
S
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
R
Y
 
R
R
 
M
S
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
A
 
I
T
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
L
T
 
S
M
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
V
P
 
P
R
 
A
R
 
Y
W
 
W
-
 
E
G
 
G
A
 
F
E
 
G
P
 
P
G
 
R
L
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
H
 
H
F
 
L
W
 
T
G
 
A
P
 
P
Y
 
Y
P
 
K
Y
 
Y
R
 
R
S
 
F
A
 
G
F
 
E
H
 
G
S
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
-
E
 
E
E
 
E
E
 
F
G
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
L
L
 
V
Q
 
Q
H
 
E
L
 
L
R
 
E
D
 
E
T
 
T
I
 
I
M
 
E
V
 
R
E
 
E
G
 
G
P
 
S
G
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
V
 
I
L
 
G
E
 
E
T
 
P
V
 
V
V
 
Q
G
 
G
T
 
A
N
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
V
V
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
W
E
 
P
G
 
A
V
 
I
R
 
A
Q
 
A
I
 
V
C
 
L
D
 
R
E
 
K
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
L
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
x
I
S
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
T
W
 
L
F
 
F
A
 
G
V
 
M
D
 
Q
H
 
Q
W
 
Y
A
 
G
I
 
V
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
V
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
N
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
G
I
 
V
S
 
S
D
 
D
T
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
E
T
 
T
F
 
L
-
 
A
-
 
S
D
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
V
Y
 
F
P
 
M
G
 
H
G
 
G
L
 
F
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
R
S
 
N
M
 
L
T
 
D
I
 
I
M
 
L
R
 
L
E
 
A
E
 
E
G
 
R
I
 
L
V
 
W
E
 
E
H
 
N
A
 
A
R
 
A
D
 
A
L
 
S
G
 
G
T
 
A
D
 
Y
V
 
L
I
 
L
G
 
Q
P
 
E
A
 
-
L
 
-
A
 
L
K
 
K
L
 
R
A
 
L
E
 
E
N
 
E
H
 
R
P
 
P
S
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
K
G
 
G
V
 
L
F
 
M
W
 
L
A
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
K
D
 
A
T
 
S
R
 
K
E
 
E
P
 
K
L
 
F
V
 
P
P
 
P
Y
 
E
N
 
F
A
 
K
S
 
L
G
 
G
S
 
P
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
K
V
 
L
A
 
E
A
 
A
E
 
A
C
 
T
K
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
W
 
I
P
 
V
F
 
R
V
 
C
H
 
T
F
 
P
N
 
D
R
 
G
V
 
I
H
 
V
V
 
M
V
 
A
P
 
P
P
 
P
C
 
L
T
 
T
T
 
I
T
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
E
A
 
C
D
 
D
E
 
V
V
 
L
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V

6s54A Transaminase from pseudomonas fluorescens (see paper)
34% identity, 95% coverage: 15:445/454 of query aligns to 8:448/453 of 6s54A

query
sites
6s54A
V
 
L
R
 
K
R
 
E
D
 
H
D
 
N
R
 
T
A
 
V
H
 
H
V
 
M
F
 
M
H
 
H
S
 
P
W
x
M
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
S
 
K
A
 
A
Q
 
L
A
 
H
Q
 
E
I
 
Q
D
 
R
P
 
P
L
 
L
P
 
I
I
 
I
A
 
Q
A
 
S
A
 
G
L
 
K
G
 
G
S
 
V
H
 
H
F
 
I
W
 
T
D
 
D
Y
 
V
A
 
D
G
 
G
T
 
R
K
 
R
Y
 
F
L
 
I
D
 
D
F
 
C
S
 
Q
S
 
G
Q
 
G
L
 
L
V
 
W
N
 
C
V
 
V
N
 
N
I
 
A
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
G
H
 
R
P
 
R
R
 
E
L
 
I
V
 
I
A
 
D
A
 
A
I
 
V
Q
 
T
E
 
R
Y
 
Q
A
 
M
G
 
E
R
 
E
L
 
L
C
 
A
-
 
Y
-
 
Y
T
 
S
V
 
L
A
 
F
P
 
P
P
 
G
F
 
S
A
 
T
N
 
N
D
 
A
M
 
P
R
 
A
S
 
I
E
 
A
A
 
L
A
 
S
R
 
Q
L
 
K
L
 
L
A
 
T
D
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
A
G
 
E
T
 
E
-
 
G
L
 
M
N
 
V
K
 
K
V
 
A
F
 
S
F
 
F
T
 
G
N
 
L
G
 
G
G
|
G
A
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
V
E
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
L
R
 
K
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
Q
H
 
Y
-
 
W
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
T
 
P
G
 
D
R
 
K
S
 
V
K
 
K
V
 
F
L
 
V
A
 
S
A
 
L
Y
 
Y
R
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
A
 
L
T
 
N
A
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
M
T
 
S
M
 
A
T
 
C
G
 
G
-
 
G
D
 
N
P
 
A
R
 
W
R
 
K
W
 
S
G
 
S
A
 
Y
E
 
E
P
 
P
G
 
L
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
F
H
 
Q
F
 
V
W
 
E
G
 
S
P
 
P
Y
 
H
P
 
L
Y
 
Y
R
 
R
S
 
N
A
 
P
F
 
F
H
 
-
S
 
T
S
 
N
D
 
D
V
 
P
E
 
E
E
 
E
E
 
L
G
 
A
A
 
E
R
 
I
A
 
C
L
 
A
Q
 
Q
H
 
I
L
 
L
R
 
E
D
 
R
T
 
Q
I
 
I
M
 
E
V
 
M
E
 
Q
G
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
 
I
L
 
A
E
|
E
T
 
P
V
 
I
V
 
Q
G
 
G
T
 
A
N
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
A
G
 
S
Y
 
Y
L
 
W
E
 
P
G
 
R
V
 
L
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
K
H
 
Y
G
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
x
I
S
 
T
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
C
 
S
G
 
G
E
 
S
W
 
L
F
 
F
A
 
G
V
 
S
D
 
R
H
 
G
W
 
W
A
 
G
I
 
V
T
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
N
 
S
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
S
G
 
A
V
 
T
L
 
L
I
 
V
S
 
N
D
 
S
T
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
R
T
 
A
F
 
W
D
 
E
D
 
R
R
 
D
A
 
A
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
S
-
 
V
Y
 
Y
P
 
M
G
 
H
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
V
A
 
S
C
 
C
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
S
 
A
M
 
I
T
 
D
I
 
I
M
 
V
R
 
L
E
 
Q
E
 
E
G
 
N
I
 
L
V
 
A
E
 
E
H
 
N
A
 
A
R
 
R
D
 
V
L
 
V
G
 
G
T
 
-
D
 
D
V
 
Y
I
 
F
G
 
L
P
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
L
K
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
D
N
 
K
H
 
H
P
 
R
S
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
K
G
 
G
V
 
L
F
 
M
W
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
K
D
 
E
R
 
R
D
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
E
P
 
P
L
 
F
V
 
G
P
 
P
Y
 
-
N
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
M
 
L
G
 
A
E
 
-
V
 
I
A
 
S
A
 
E
E
 
A
C
 
C
K
 
V
R
 
N
R
 
N
G
 
G
L
 
V
W
 
M
P
 
I
F
 
R
V
 
T
H
 
I
F
 
V
N
 
N
R
 
K
V
 
L
H
 
I
V
 
I
V
 
S
P
 
P
P
 
P
C
 
L
T
 
T
T
 
F
T
 
T
A
 
T
D
 
E
E
 
H
V
 
V
L
 
D
E
 
E
G
 
V
I
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
A
L
 
F

6fyqA The crystal structure of a new transaminase from the marine bacterium virgibacillus (see paper)
32% identity, 94% coverage: 19:445/454 of query aligns to 7:435/443 of 6fyqA

query
sites
6fyqA
D
 
D
R
 
K
A
 
K
H
 
H
V
 
F
F
 
I
H
 
H
S
 
P
W
x
F
S
 
S
A
 
S
-
 
I
-
 
Q
-
 
E
-
 
Q
Q
 
Q
A
 
H
Q
 
K
I
 
G
D
 
A
P
 
K
L
 
V
P
 
I
I
 
M
A
 
K
A
 
E
A
 
G
L
 
D
G
 
G
S
 
I
H
 
Y
F
 
L
W
 
T
D
 
D
Y
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
K
K
 
T
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
G
S
 
V
S
 
S
Q
 
S
L
 
L
V
 
W
N
 
N
V
 
V
N
 
N
I
 
V
G
 
G
Y
 
H
Q
 
G
H
 
R
P
 
V
R
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
A
Q
 
A
E
 
Q
Y
 
Q
A
 
M
G
 
K
R
 
K
L
 
M
C
 
A
-
 
F
-
 
S
T
 
S
V
 
A
A
 
F
P
 
S
P
 
T
F
 
F
A
 
S
N
 
H
D
 
E
M
 
P
R
 
A
S
 
I
E
 
R
A
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
I
A
 
T
P
 
P
G
 
E
T
 
G
L
 
L
N
 
N
K
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
N
 
S
G
 
G
G
|
G
A
x
S
D
 
E
A
 
S
N
 
N
E
 
D
H
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
K
M
 
L
A
 
V
R
 
R
L
 
H
H
 
Y
-
 
W
-
 
K
-
 
I
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
T
 
P
G
 
N
R
 
K
S
 
R
K
 
K
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
L
Y
 
K
R
 
R
S
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
A
 
V
T
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
S
I
 
T
T
 
S
M
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
I
P
 
P
R
 
E
R
 
F
W
 
W
G
 
G
A
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
M
P
 
A
G
 
G
V
 
-
V
 
-
H
 
H
F
 
M
W
 
M
G
 
T
P
 
D
Y
 
F
P
 
L
Y
 
H
R
 
V
S
 
D
A
 
T
F
 
H
H
 
Y
S
 
N
S
 
N
D
 
T
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
H
 
S
L
 
L
R
 
C
D
 
Q
T
 
A
I
 
I
M
 
E
V
 
E
E
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
V
 
F
L
 
A
E
|
E
T
 
P
V
 
V
V
 
Q
G
 
G
T
 
A
N
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
I
V
 
I
P
 
P
P
 
P
P
 
E
G
 
D
Y
 
Y
L
 
F
E
 
L
G
 
R
V
 
I
R
 
R
Q
 
E
I
 
V
C
 
C
D
 
N
E
 
A
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
V
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
x
I
S
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
K
W
 
M
F
 
F
A
 
G
V
 
I
D
 
E
H
 
N
W
 
W
A
 
D
I
 
V
T
 
I
P
 
P
D
 
D
L
 
V
I
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
V
N
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
V
 
F
P
 
P
I
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
S
D
 
D
T
 
P
V
 
I
A
 
H
A
 
E
T
 
V
F
 
L
D
 
K
D
 
E
R
 
K
A
 
S
Y
 
V
P
 
G
G
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
H
G
 
G
L
 
F
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
T
A
 
A
C
 
A
A
 
A
S
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
K
S
 
N
M
 
I
T
 
A
I
 
I
M
 
I
R
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
R
I
 
L
V
 
V
E
 
E
H
 
N
A
 
S
R
 
K
D
 
R
L
 
M
G
 
G
T
 
-
D
 
D
V
 
A
I
 
L
G
 
L
P
 
H
A
 
G
L
 
L
A
 
K
K
 
K
L
 
V
A
 
K
E
 
N
N
 
R
H
 
L
P
 
E
S
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
F
L
 
V
G
 
G
V
 
L
F
 
L
W
 
G
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
M
R
 
Q
D
 
N
R
 
P
D
 
A
T
 
T
R
 
N
E
 
K
P
 
P
L
 
F
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
N
 
-
A
 
S
S
 
S
G
 
N
S
 
L
D
 
Q
A
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
A
M
 
L
G
 
H
E
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
V
E
 
I
C
 
C
K
 
R
R
 
S
R
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
V
P
 
T
F
 
Y
V
 
D
H
 
H
F
 
T
N
 
N
R
 
I
V
 
I
H
 
C
V
 
L
V
 
A
P
 
P
P
 
P
C
 
L
T
 
I
T
 
I
T
 
N
A
 
Q
D
 
K
E
 
Q
V
 
V
L
 
D
E
 
K
G
 
L
I
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I

5g2qA The crystal structure of a s-selective transaminase from arthrobacter sp. With alanine bound (see paper)
34% identity, 83% coverage: 13:388/454 of query aligns to 5:389/461 of 5g2qA

query
sites
5g2qA
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
R
 
E
D
 
W
D
 
D
R
 
R
A
 
K
H
 
Y
V
 
L
F
 
M
H
 
R
S
 
T
W
 
F
S
 
S
A
 
T
Q
 
Q
A
 
N
Q
 
E
I
 
Y
D
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
T
L
 
E
G
 
G
S
 
D
H
 
Y
F
 
L
W
 
I
D
 
T
Y
 
P
A
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
R
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
S
 
F
S
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
C
N
 
C
V
 
V
N
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
H
 
N
P
 
Q
R
 
K
L
 
V
V
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
E
 
E
Y
 
A
A
 
L
G
 
D
R
 
R
L
 
Y
C
 
G
T
 
F
V
 
V
A
 
W
P
 
D
P
 
T
F
 
Y
A
 
A
N
 
T
D
 
D
M
 
Y
R
 
K
S
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
I
L
 
I
A
 
I
D
 
E
L
 
D
A
 
I
P
 
L
G
 
G
T
 
D
L
 
E
N
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
G
K
 
K
V
 
V
F
 
R
F
 
F
T
 
V
N
 
S
G
 
T
G
|
G
A
x
S
D
 
E
A
 
A
N
 
V
E
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
L
R
 
N
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
T
 
T
G
 
N
R
 
R
S
 
P
K
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
T
A
 
R
Y
 
E
R
 
H
S
 
D
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
A
 
W
T
 
T
A
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
A
T
 
T
M
 
V
T
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
F
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
G
G
 
E
D
 
N
P
 
S
R
 
E
R
 
S
W
 
F
G
 
S
A
 
A
E
 
Q
-
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
S
P
 
S
G
 
A
V
 
V
V
 
L
H
 
M
F
 
A
W
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
-
P
 
P
Y
 
S
R
 
S
S
 
N
A
 
T
F
 
F
H
 
Q
S
 
N
S
 
Y
D
 
L
V
 
K
E
 
D
E
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
E
R
 
L
-
 
L
A
 
S
L
 
V
Q
 
K
H
 
Y
L
 
T
R
 
R
D
 
R
T
 
M
I
 
I
M
 
E
V
 
N
E
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
E
T
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
T
E
 
E
T
 
V
V
 
S
V
 
Q
G
 
G
T
x
V
N
 
-
G
 
G
I
 
S
L
 
T
V
 
M
P
 
P
P
 
P
P
 
Y
G
 
E
Y
 
Y
L
 
V
E
 
P
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
I
 
M
C
 
T
D
 
K
E
 
E
H
 
L
G
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
W
V
 
I
A
 
S
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
 
L
S
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
K
W
 
W
F
 
F
A
 
G
V
 
Y
D
 
Q
H
 
H
W
 
Y
A
 
G
I
 
V
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
I
T
 
T
F
 
M
A
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
L
N
 
S
S
 
S
G
 
S
Y
 
S
V
 
L
P
 
P
I
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
S
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
F
F
 
M
D
 
D
D
 
K
R
 
H
A
 
R
Y
 
W
P
 
E
G
 
S
G
x
V
L
 
S
T
|
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
V
A
 
A
C
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
C
A
 
A
S
 
N
M
 
L
T
 
E
I
 
V
M
 
M
R
 
M
E
 
E
E
 
E
G
 
N
I
 
L
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
A
 
A
R
 
K
D
 
N
L
 
S
G
 
G
T
 
-
D
 
E
V
 
Y
I
 
I
G
 
R
P
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
E
K
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
E
N
 
K
H
 
H
P
 
K
S
 
S
V
 
I
G
 
G
D
 
N
V
 
F
R
 
D
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
V
 
L
F
 
L
W
 
W
A
 
I
L
 
V
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
N
D
 
A
R
 
K
D
 
-
T
 
T
R
 
K
E
 
T
P
 
P
L
 
Y
V
 
V

5g09D The crystal structure of a s-selective transaminase from bacillus megaterium bound with r-alpha-methylbenzylamine (see paper)
35% identity, 84% coverage: 7:388/454 of query aligns to 4:401/473 of 5g09D

query
sites
5g09D
L
 
V
P
 
Q
S
 
K
L
 
I
S
 
N
E
 
W
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
R
 
E
D
 
W
D
 
D
R
 
R
A
 
K
H
 
Y
V
 
L
F
 
M
H
 
R
S
 
T
W
 
F
S
 
S
A
 
T
Q
 
Q
A
 
N
Q
 
E
I
 
Y
D
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
T
L
 
E
G
 
G
S
 
D
H
 
Y
F
 
L
W
 
I
D
 
M
Y
 
P
A
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
R
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
S
 
F
S
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
x
Y
N
 
C
V
 
V
N
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
H
 
N
P
 
Q
R
 
K
L
 
V
V
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
E
 
E
Y
 
A
A
 
L
G
 
D
R
 
R
L
 
Y
C
 
G
T
 
F
V
 
V
A
 
W
P
 
D
P
 
T
F
 
Y
A
 
A
N
 
T
D
 
D
M
 
Y
R
 
K
S
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
I
L
 
I
A
 
I
D
 
E
L
 
D
A
 
I
P
 
L
G
 
G
T
 
D
L
 
E
N
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
G
K
 
K
V
 
V
F
 
R
F
 
F
T
 
V
N
 
S
G
 
T
G
|
G
A
x
S
D
 
E
A
 
A
N
 
V
E
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
L
R
 
N
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
T
 
T
G
 
N
R
 
R
S
 
P
K
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
T
A
 
R
Y
 
E
R
 
H
S
 
D
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
A
 
W
T
 
T
A
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
A
T
 
T
M
 
V
T
 
T
G
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
R
R
 
L
W
 
R
G
 
S
A
 
Y
E
 
R
P
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
V
G
 
G
-
 
E
-
 
N
V
 
S
V
 
E
H
 
S
F
 
F
W
 
S
G
 
A
P
 
Q
Y
 
I
P
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
S
Y
 
Y
R
 
N
S
 
S
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
A
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
M
F
 
F
H
 
Q
S
 
D
S
 
S
D
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
L
V
 
L
E
 
K
E
 
D
E
 
E
G
 
N
A
 
G
R
 
E
A
 
L
L
 
L
-
 
S
-
 
V
Q
 
K
H
 
Y
L
 
T
R
 
R
D
 
R
T
 
M
I
 
I
M
 
E
V
 
N
E
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
E
T
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
T
E
|
E
T
 
V
V
 
S
V
 
Q
G
 
G
T
x
A
N
 
-
G
 
G
I
 
S
L
 
A
V
 
M
P
 
P
P
 
P
P
 
Y
G
 
E
Y
 
Y
L
 
I
E
 
P
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
I
 
M
C
 
T
D
 
K
E
 
E
H
 
L
G
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
W
V
 
I
A
 
N
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
 
L
S
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
K
W
 
W
F
 
F
A
 
G
V
 
Y
D
 
Q
H
 
H
W
 
Y
A
 
G
I
 
V
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
I
T
 
T
F
 
M
A
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
L
N
 
S
S
 
S
G
 
S
Y
 
S
V
 
L
P
 
P
I
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
F
F
 
M
D
 
D
D
 
K
R
 
H
A
 
R
Y
 
W
P
 
E
G
 
S
G
 
V
L
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
V
A
 
A
C
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
C
A
 
A
S
 
N
M
 
L
T
 
E
I
 
V
M
 
M
R
 
M
E
 
E
E
 
E
G
 
N
I
 
F
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
A
 
A
R
 
K
D
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
-
D
 
E
V
 
Y
I
 
I
G
 
R
P
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
E
K
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
E
N
 
K
H
 
H
P
 
K
S
 
S
V
 
I
G
 
G
D
 
N
V
 
F
R
 
D
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
V
 
L
F
 
L
W
 
W
A
 
I
L
 
V
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
N
D
 
A
R
 
K
D
 
-
T
 
T
R
 
K
E
 
T
P
 
P
L
 
Y
V
 
V

Q94CE5 Gamma-aminobutyrate transaminase POP2, mitochondrial; AtGABA-T; Gamma-aminobutyric acid aminotransferase 1; Protein HEXENAL RESPONSE 1; Protein POLLEN-PISTIL INCOMPATIBILITY 2; AtPOP2; EC 2.6.1.96 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
31% identity, 94% coverage: 27:453/454 of query aligns to 63:496/504 of Q94CE5

query
sites
Q94CE5
W
 
W
S
 
Q
A
 
S
Q
 
-
A
 
A
Q
 
D
I
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
S
L
 
E
G
 
G
S
 
S
H
 
Y
F
 
V
W
 
Y
D
 
D
Y
 
D
A
 
T
G
 
G
T
 
K
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
S
S
 
L
S
 
A
Q
 
G
L
 
L
V
 
W
N
x
C
V
 
T
N
 
A
I
 
L
G
 
G
Y
x
G
Q
 
N
H
 
E
P
 
P
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
A
Q
 
V
E
 
E
Y
 
Q
A
 
L
G
 
N
R
 
T
L
 
L
C
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
P
F
 
F
A
 
Y
N
 
H
D
 
S
M
 
F
R
 
W
S
 
N
E
 
R
A
 
T
A
 
T
R
 
K
L
 
P
L
 
S
A
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
F
-
 
T
-
 
A
G
 
N
T
 
K
L
 
M
N
 
A
K
 
K
V
 
A
F
 
F
F
 
F
T
 
T
N
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
N
 
N
E
 
D
H
 
T
A
 
Q
V
 
V
R
 
K
M
 
L
A
 
V
R
 
W
L
 
Y
H
 
Y
T
 
N
G
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
E
R
 
K
S
 
K
K
 
K
V
 
F
L
 
I
A
 
A
A
 
R
Y
 
K
R
 
K
S
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
A
 
S
T
 
T
A
 
L
G
 
I
A
 
S
I
 
A
T
 
S
M
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
L
D
 
P
P
 
P
R
 
L
R
 
H
W
 
Q
G
 
N
A
 
F
E
 
D
P
 
L
G
 
P
L
 
A
P
 
P
G
 
F
V
 
V
V
 
L
H
 
H
F
 
T
W
 
D
G
 
C
P
 
P
Y
 
H
P
 
Y
Y
 
W
R
 
R
S
 
F
A
 
H
F
 
L
H
 
P
S
 
G
S
 
E
D
 
T
V
 
E
E
 
E
E
 
E
E
 
F
G
 
S
A
 
T
R
 
R
A
 
L
L
 
A
Q
 
K
H
 
N
L
 
L
R
 
E
D
 
D
T
 
L
I
 
I
M
 
I
V
 
K
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
F
V
 
I
L
 
A
E
 
E
T
 
P
V
 
V
V
 
M
G
 
G
T
 
A
N
x
G
G
 
G
I
 
V
L
 
I
V
 
P
P
 
P
P
 
P
P
 
A
G
 
T
Y
 
Y
L
 
F
E
 
E
G
 
K
V
 
V
R
 
Q
Q
 
A
I
 
V
C
 
V
D
 
K
E
 
K
H
 
Y
G
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
I
S
 
C
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
C
 
L
G
 
G
E
 
T
W
 
M
F
 
F
A
x
G
V
 
C
D
 
D
H
 
K
W
 
Y
A
 
N
I
 
I
T
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
V
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
L
N
 
S
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
V
 
M
P
 
P
I
 
I
G
 
G
G
 
A
V
 
I
L
 
L
I
 
M
S
 
S
D
 
Q
T
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
D
T
 
V
F
 
I
D
 
N
D
 
S
R
 
H
A
 
S
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
V
Y
 
F
P
 
S
G
 
H
G
 
G
L
 
F
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
V
A
 
S
C
 
C
A
 
A
S
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
E
S
 
A
M
 
L
T
 
K
I
 
I
M
 
Y
R
 
K
E
 
E
E
 
R
G
 
N
I
 
I
V
 
P
E
 
E
H
 
Y
A
 
V
R
 
A
D
 
K
L
 
V
G
 
A
T
 
P
D
 
R
V
 
-
I
 
F
G
 
Q
P
 
D
A
 
G
L
 
V
A
 
K
K
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
S
N
 
G
H
 
S
P
 
P
S
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
T
G
 
G
V
 
L
F
 
I
W
 
L
A
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
F
V
 
V
R
 
D
D
 
N
R
 
K
D
 
S
T
 
P
R
 
N
E
 
E
P
 
P
L
 
F
V
 
P
P
 
P
Y
 
E
N
 
W
A
 
G
S
 
V
G
 
G
S
 
A
D
 
F
A
 
-
A
 
-
P
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
F
A
 
G
A
 
A
E
 
E
C
 
C
K
 
Q
R
 
K
R
 
H
G
 
G
L
 
M
W
 
L
P
 
V
F
 
R
V
 
V
H
 
A
F
 
G
N
 
D
R
 
G
V
 
I
H
 
L
V
 
M
V
 
S
P
 
P
P
 
P
C
 
L
T
 
I
T
 
I
T
 
S
A
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
D
E
 
E
G
 
L
I
 
I
E
 
S
V
 
I
L
 
Y
D
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
K
V
 
A
A
 
T
D
 
E
R
 
E
Y
 
K
Y
 
V
R
 
K

5g0aA The crystal structure of a s-selective transaminase from bacillus megaterium (see paper)
35% identity, 83% coverage: 13:388/454 of query aligns to 5:396/468 of 5g0aA

query
sites
5g0aA
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
R
 
E
D
 
W
D
 
D
R
 
R
A
 
K
H
 
Y
V
 
L
F
 
M
H
 
R
S
 
T
W
x
F
S
 
S
A
 
T
Q
 
Q
A
 
N
Q
 
E
I
 
Y
D
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
T
L
 
E
G
 
G
S
 
D
H
 
Y
F
 
L
W
 
I
D
 
M
Y
 
P
A
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
R
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
S
 
F
S
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
Y
N
 
C
V
 
V
N
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
H
 
N
P
 
Q
R
 
K
L
 
V
V
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
E
 
E
Y
 
A
A
 
L
G
 
D
R
 
R
L
 
Y
C
 
G
T
 
F
V
 
V
A
 
W
P
 
D
P
 
T
F
 
Y
A
 
A
N
 
T
D
 
D
M
 
Y
R
 
K
S
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
I
L
 
I
A
 
I
D
 
E
L
 
D
A
 
I
P
 
L
G
 
G
T
 
D
L
 
E
N
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
G
K
 
K
V
 
V
F
 
R
F
 
F
T
 
V
N
 
S
G
 
T
G
|
G
A
x
S
D
 
E
A
 
A
N
 
V
E
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
L
R
 
N
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
T
 
T
G
 
N
R
 
R
S
 
P
K
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
T
A
 
R
Y
 
E
R
 
H
S
 
D
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
A
 
W
T
 
T
A
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
A
T
 
T
M
 
V
T
 
T
G
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
R
R
 
L
W
 
R
G
 
S
A
 
Y
E
 
R
P
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
V
G
 
G
-
 
E
-
 
N
V
 
S
V
 
E
H
 
S
F
 
F
W
 
S
G
 
A
P
 
Q
Y
 
I
P
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
S
Y
 
Y
R
 
N
S
 
S
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
A
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
M
F
 
F
H
 
Q
S
 
D
S
 
S
D
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
L
V
 
L
E
 
K
E
 
D
E
 
E
G
 
N
A
 
G
R
 
E
A
 
L
L
 
L
-
 
S
-
 
V
Q
 
K
H
 
Y
L
 
T
R
 
R
D
 
R
T
 
M
I
 
I
M
 
E
V
 
N
E
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
E
T
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
T
E
|
E
T
 
V
V
 
S
V
 
Q
G
 
G
T
 
A
N
 
-
G
 
G
I
 
S
L
 
A
V
 
M
P
 
P
P
 
P
P
 
Y
G
 
E
Y
 
Y
L
 
I
E
 
P
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
I
 
M
C
 
T
D
 
K
E
 
E
H
 
L
G
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
W
V
 
I
A
 
N
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
x
L
S
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
K
W
 
W
F
 
F
A
 
G
V
 
Y
D
 
Q
H
 
H
W
 
Y
A
 
G
I
 
V
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
I
T
 
T
F
 
M
A
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
L
N
 
S
S
 
S
G
 
S
Y
 
S
V
 
L
P
 
P
I
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
F
F
 
M
D
 
D
D
 
K
R
 
H
A
 
R
Y
 
W
P
 
E
G
 
S
G
 
V
L
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
V
A
 
A
C
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
C
A
 
A
S
 
N
M
 
L
T
 
E
I
 
V
M
 
M
R
 
M
E
 
E
E
 
E
G
 
N
I
 
F
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
A
 
A
R
 
K
D
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
-
D
 
E
V
 
Y
I
 
I
G
 
R
P
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
E
K
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
E
N
 
K
H
 
H
P
 
K
S
 
S
V
 
I
G
 
G
D
 
N
V
 
F
R
 
D
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
V
 
L
F
 
L
W
 
W
A
 
I
L
 
V
E
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
N
D
 
A
R
 
K
D
 
-
T
 
T
R
 
K
E
 
T
P
 
P
L
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1szkA The structure of gamma-aminobutyrate aminotransferase mutant: e211s (see paper)
34% identity, 92% coverage: 32:450/454 of query aligns to 20:425/425 of 1szkA

query
sites
1szkA
Q
 
Q
I
 
I
D
 
H
P
 
P
L
 
I
P
 
F
I
 
A
A
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
E
G
 
N
S
 
C
H
 
R
F
 
V
W
 
W
D
 
D
Y
 
V
A
 
E
G
 
G
T
 
R
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
S
 
A
S
 
G
Q
 
G
L
 
I
V
 
A
N
 
V
V
 
L
N
 
N
I
 
T
G
 
G
Y
 
H
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
Y
 
Q
A
 
L
G
 
K
R
 
K
L
 
L
C
 
S
-
 
H
T
 
T
V
 
C
A
 
F
P
 
Q
P
 
V
F
 
L
A
 
A
N
 
Y
D
 
E
M
 
P
R
 
Y
S
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
C
R
 
E
L
 
I
L
 
M
A
 
N
D
 
Q
L
 
K
A
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
D
L
 
F
-
 
A
N
 
K
K
 
K
V
 
T
F
 
L
F
 
L
T
 
V
N
 
T
G
 
T
G
|
G
A
x
S
D
 
E
A
 
A
N
 
V
E
 
E
H
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
K
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
A
H
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
G
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
F
Y
 
S
R
 
G
S
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
A
 
R
T
 
T
A
 
H
G
 
Y
A
 
T
I
 
L
T
 
A
M
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
K
P
 
V
R
 
N
R
 
P
W
 
Y
G
 
S
A
 
A
E
 
G
P
 
M
G
 
G
L
 
L
-
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
H
V
 
V
H
 
-
F
 
Y
W
 
R
G
 
A
P
 
L
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
-
R
 
-
S
 
C
A
 
P
F
 
L
H
 
H
S
 
G
S
 
-
D
 
-
V
 
I
E
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
D
A
 
A
R
 
I
A
 
A
L
 
S
Q
 
I
H
 
H
L
 
-
R
 
R
D
 
I
T
 
F
I
 
K
M
 
N
V
 
D
E
 
A
G
 
A
P
 
P
G
 
E
T
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
E
|
E
T
 
P
V
 
V
V
 
Q
G
 
G
T
 
S
N
 
G
G
 
G
I
 
F
L
 
Y
V
 
A
P
 
S
P
 
S
P
 
P
G
 
A
Y
 
F
L
 
M
E
 
Q
G
 
R
V
 
L
R
 
R
Q
 
A
I
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
x
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
T
W
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
M
D
 
E
H
 
Q
W
 
M
A
 
G
I
 
V
T
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
S
V
 
I
N
 
A
S
 
G
G
 
G
Y
 
F
V
 
-
P
 
P
I
 
L
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
E
F
 
V
D
 
M
D
 
D
R
 
A
A
 
V
Y
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
-
 
G
-
 
G
T
|
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
V
S
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
E
S
 
V
M
 
L
T
 
K
I
 
V
M
 
F
R
 
E
E
 
Q
E
 
E
G
 
N
I
 
L
V
 
L
E
 
Q
H
 
K
A
 
A
R
 
N
D
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
D
 
K
V
 
L
I
 
K
G
 
D
P
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
K
H
 
H
P
 
P
S
 
E
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
A
F
 
M
W
 
I
A
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
F
R
 
E
D
 
D
R
 
G
D
 
D
T
 
H
R
 
N
E
 
K
P
 
P
L
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
N
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
A
 
A
A
 
K
P
 
L
M
 
T
G
 
A
E
 
E
V
 
I
A
 
V
A
 
A
E
 
R
C
 
A
K
 
R
R
 
D
R
 
K
G
 
G
L
 
L
W
 
I
P
 
L
F
 
L
V
 
S
-
 
C
-
 
G
-
 
P
H
 
Y
F
 
Y
N
 
N
R
 
V
V
 
L
H
x
R
V
 
I
V
 
L
P
 
V
P
 
P
C
 
L
T
 
T
T
 
I
T
 
E
A
 
D
D
 
A
E
 
Q
V
 
I
L
 
R
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
E
V
 
I
L
 
I
D
 
S
E
 
Q
A
 
C
L
 
F
G
 
D
V
 
E
A
 
A
D
 
K
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

P22256 4-aminobutyrate aminotransferase GabT; 5-aminovalerate transaminase; GABA aminotransferase; GABA-AT; Gamma-amino-N-butyrate transaminase; GABA transaminase; Glutamate:succinic semialdehyde transaminase; L-AIBAT; EC 2.6.1.19; EC 2.6.1.48 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
34% identity, 92% coverage: 32:450/454 of query aligns to 21:426/426 of P22256

query
sites
P22256
Q
 
Q
I
 
I
D
 
H
P
 
P
L
 
I
P
 
F
I
 
A
A
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
E
G
 
N
S
 
C
H
 
R
F
 
V
W
 
W
D
 
D
Y
 
V
A
 
E
G
 
G
T
 
R
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
S
 
A
S
 
G
Q
 
G
L
x
I
V
 
A
N
 
V
V
 
L
N
 
N
I
 
T
G
 
G
Y
 
H
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
Y
 
Q
A
 
L
G
 
K
R
 
K
L
 
L
C
 
S
-
 
H
T
 
T
V
 
C
A
 
F
P
 
Q
P
 
V
F
 
L
A
 
A
N
 
Y
D
 
E
M
 
P
R
 
Y
S
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
C
R
 
E
L
 
I
L
 
M
A
 
N
D
 
Q
L
 
K
A
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
D
L
 
F
-
 
A
N
 
K
K
 
K
V
 
T
F
 
L
F
 
L
T
 
V
N
 
T
G
 
T
G
|
G
A
x
S
D
 
E
A
 
A
N
 
V
E
 
E
H
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
K
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
A
H
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
G
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
F
Y
 
S
R
 
G
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
A
 
R
T
 
T
A
 
H
G
 
Y
A
 
T
I
 
L
T
 
A
M
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
K
P
 
V
R
 
N
R
 
P
W
 
Y
G
 
S
A
 
A
E
 
G
P
 
M
G
 
G
L
 
L
-
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
H
V
 
V
H
 
-
F
 
Y
W
 
R
G
 
A
P
 
L
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
-
R
 
-
S
 
C
A
 
P
F
 
L
H
 
H
S
 
G
S
 
-
D
 
-
V
 
I
E
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
D
A
 
A
R
 
I
A
 
A
L
 
S
Q
 
I
H
 
H
L
 
-
R
 
R
D
 
I
T
 
F
I
 
K
M
 
N
V
 
D
E
 
A
G
 
A
P
 
P
G
 
E
T
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
E
 
E
T
 
P
V
 
V
V
 
Q
G
 
G
T
x
E
N
 
G
G
 
G
I
 
F
L
 
Y
V
 
A
P
 
S
P
 
S
P
 
P
G
 
A
Y
 
F
L
 
M
E
 
Q
G
 
R
V
 
L
R
 
R
Q
 
A
I
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
|
V
M
x
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
T
W
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
M
D
 
E
H
 
Q
W
 
M
A
 
G
I
 
V
T
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
S
V
 
I
N
 
A
S
 
G
G
 
G
Y
 
F
V
 
-
P
 
P
I
 
L
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
E
F
 
V
D
 
M
D
 
D
R
 
A
A
 
V
Y
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
-
 
G
-
 
G
T
|
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
V
S
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
E
S
 
V
M
 
L
T
 
K
I
 
V
M
 
F
R
 
E
E
 
Q
E
 
E
G
 
N
I
 
L
V
 
L
E
 
Q
H
 
K
A
 
A
R
 
N
D
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
D
 
K
V
 
L
I
 
K
G
 
D
P
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
K
H
 
H
P
 
P
S
 
E
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
A
F
 
M
W
 
I
A
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
F
R
 
E
D
 
D
R
 
G
D
 
D
T
 
H
R
 
N
E
 
K
P
 
P
L
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
N
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
A
 
A
A
 
K
P
 
L
M
 
T
G
 
A
E
 
E
V
 
I
A
 
V
A
 
A
E
 
R
C
 
A
K
 
R
R
 
D
R
 
K
G
 
G
L
 
L
W
 
I
P
 
L
F
 
L
V
 
S
-
 
C
-
 
G
-
 
P
H
 
Y
F
 
Y
N
 
N
R
 
V
V
 
L
H
 
R
V
 
I
V
 
L
P
 
V
P
 
P
C
 
L
T
 
T
T
 
I
T
 
E
A
 
D
D
 
A
E
 
Q
V
 
I
L
 
R
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
E
V
 
I
L
 
I
D
 
S
E
 
Q
A
 
C
L
 
F
G
 
D
V
 
E
A
 
A
D
 
K
R
 
Q

1sffA Structure of gamma-aminobutyrate aminotransferase complex with aminooxyacetate (see paper)
34% identity, 92% coverage: 32:450/454 of query aligns to 20:425/425 of 1sffA

query
sites
1sffA
Q
 
Q
I
 
I
D
 
H
P
 
P
L
 
I
P
 
F
I
 
A
A
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
E
G
 
N
S
 
C
H
 
R
F
 
V
W
 
W
D
 
D
Y
 
V
A
 
E
G
 
G
T
 
R
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
S
 
A
S
 
G
Q
 
G
L
 
I
V
 
A
N
 
V
V
 
L
N
 
N
I
 
T
G
 
G
Y
 
H
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
E
E
 
A
Y
 
Q
A
 
L
G
 
K
R
 
K
L
 
L
C
 
S
-
 
H
T
 
T
V
 
C
A
 
F
P
x
Q
P
 
V
F
 
L
A
 
A
N
 
Y
D
 
E
M
 
P
R
 
Y
S
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
C
R
 
E
L
 
I
L
 
M
A
 
N
D
 
Q
L
 
K
A
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
D
L
 
F
-
 
A
N
 
K
K
 
K
V
 
T
F
 
L
F
 
L
T
 
V
N
 
T
G
 
T
G
|
G
A
x
S
D
 
E
A
 
A
N
 
V
E
 
E
H
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
K
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
A
H
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
G
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
F
Y
 
S
R
 
G
S
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
A
x
R
T
 
T
A
 
H
G
 
Y
A
 
T
I
 
L
T
 
A
M
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
K
P
 
V
R
x
N
R
 
P
W
 
Y
G
 
S
A
 
A
E
 
G
P
 
M
G
 
G
L
 
L
-
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
H
V
 
V
H
 
-
F
 
Y
W
 
R
G
 
A
P
 
L
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
-
R
 
-
S
 
C
A
 
P
F
 
L
H
 
H
S
 
G
S
 
-
D
 
-
V
 
I
E
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
D
A
 
A
R
 
I
A
 
A
L
 
S
Q
 
I
H
 
H
L
 
-
R
 
R
D
 
I
T
 
F
I
 
K
M
 
N
V
 
D
E
 
A
G
 
A
P
 
P
G
 
E
T
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
I
E
|
E
T
 
P
V
 
V
V
 
Q
G
 
G
T
 
E
N
 
G
G
 
G
I
 
F
L
 
Y
V
 
A
P
 
S
P
 
S
P
 
P
G
 
A
Y
 
F
L
 
M
E
 
Q
G
 
R
V
 
L
R
 
R
Q
 
A
I
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
x
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
T
G
 
G
E
 
T
W
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
M
D
 
E
H
 
Q
W
 
M
A
 
G
I
 
V
T
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
S
V
 
I
N
 
A
S
 
G
G
 
G
Y
 
F
V
 
-
P
 
P
I
 
L
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
E
F
 
V
D
 
M
D
 
D
R
 
A
A