SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068111138.1 NCBI__GCF_001653335.1:WP_068111138.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

A0R2V7 Serine hydroxymethyltransferase; SHMT; Serine methylase; EC 2.1.2.1 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
81% identity, 99% coverage: 4:480/481 of query aligns to 19:490/490 of A0R2V7

query
sites
A0R2V7
D
 
D
L
 
Y
S
 
A
R
 
D
L
 
T
S
 
A
S
 
S
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
S
 
Q
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
E
S
 
S
V
 
V
E
 
E
P
 
P
R
 
R
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
A
 
D
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
 
T
W
 
W
F
 
F
S
 
S
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
C
 
C
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
P
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
H
 
T
R
 
R
V
 
V
E
 
E
G
 
A
P
 
P
W
 
E
L
 
L
E
 
A
K
 
N
A
 
F
Q
 
G
A
 
A
K
 
K
N
 
H
V
 
I
N
 
N
E
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
E
 
E
S
 
T
L
 
L
R
 
R
K
 
N
E
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
F
R
 
R
P
 
P
N
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
K
M
 
M
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
S
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
N
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
F
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
F
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
R
V
 
V
D
 
N
F
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
M
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
K
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
N
 
D
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
H
A
 
A
H
 
H
V
 
V
V
 
T
T
 
T
T
 
T
T
 
T
T
 
T
H
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
S
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
K
G
 
G
C
 
C
P
 
P
M
 
M
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
P
S
 
A
F
 
F
R
 
Q
T
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
F
L
 
V
T
x
K
R
 
R
G
 
D
A
 
A
D
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
I
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
T
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
T
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
T
 
T
N
 
N
R
 
R
N
 
N
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
D
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
S
R
 
R
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
A
D
 
D
E
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
A
N
 
N
T
 
T
Q
 
Q
A
 
-
G
 
-
T
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
P
G
 
E
G
 
G
P
 
T
S
 
S
K
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
V
 
K
L
 
L
G
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
A
D
 
E
R
 
R
V
 
V
K
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
S
E
 
E
M
 
L
L
 
L
D
 
S
K
 
A
H
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
T
L
 
L

1kl2A Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with glycine and 5-formyl tetrahydrofolate (see paper)
49% identity, 87% coverage: 17:436/481 of query aligns to 1:387/405 of 1kl2A

query
sites
1kl2A
L
 
M
E
 
K
V
 
Y
I
 
L
A
 
P
S
 
Q
V
 
Q
E
 
D
P
 
P
R
 
Q
I
 
V
A
 
F
E
 
A
A
 
A
T
 
I
R
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
R
A
 
K
D
 
R
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
S
 
K
L
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
M
M
 
E
T
 
A
M
 
Q
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
T
 
Y
V
 
P
G
 
G
H
 
R
R
 
R
F
x
Y
Y
|
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
I
x
A
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
Y
W
 
F
S
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
E
H
 
H
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
G
Q
 
D
R
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
D
 
S
A
 
H
G
 
G
G
|
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
P
P
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
M
 
Q
F
 
Y
H
 
N
Q
 
F
Q
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
L
F
 
H
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Y
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
I
V
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
F
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
L
F
 
H
T
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
C
T
 
Q
E
 
E
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
P
 
K
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
 
K
G
 
A
C
 
I
-
x
F
P
 
P
M
 
G
V
 
I
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
M
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
Q
D
 
D
S
 
D
F
 
F
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
A
 
A
K
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
S
G
 
A
F
 
L
L
 
Q
T
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
F
D
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
P
Y
 
Q
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
T
T
 
V
N
 
N
R
 
K
N
|
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
G
 
S
A
 
P
W
 
F
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
L
D
 
E
E
 
E
F
 
M
D
 
D
T
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
G
D
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
T
 
V

1kl1A Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with glycine (see paper)
49% identity, 87% coverage: 17:436/481 of query aligns to 1:387/405 of 1kl1A

query
sites
1kl1A
L
 
M
E
 
K
V
 
Y
I
 
L
A
 
P
S
 
Q
V
 
Q
E
 
D
P
 
P
R
 
Q
I
 
V
A
 
F
E
 
A
A
 
A
T
 
I
R
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
R
A
 
K
D
 
R
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
S
 
K
L
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
M
M
 
E
T
 
A
M
 
Q
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
T
 
Y
V
 
P
G
 
G
H
 
R
R
 
R
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
I
x
A
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
Y
W
 
F
S
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
E
H
 
H
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
G
Q
 
D
R
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
D
 
S
A
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
P
P
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
M
 
Q
F
 
Y
H
 
N
Q
 
F
Q
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
L
F
 
H
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Y
x
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
I
V
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
F
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
L
F
 
H
T
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
C
T
 
Q
E
 
E
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
P
 
K
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
 
K
G
 
A
C
 
I
-
 
F
P
 
P
M
 
G
V
 
I
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
M
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
Q
D
 
D
S
 
D
F
 
F
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
A
 
A
K
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
S
G
 
A
F
 
L
L
 
Q
T
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
F
D
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
P
Y
 
Q
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
T
T
 
V
N
 
N
R
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
G
 
S
A
 
P
W
 
F
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
L
D
 
E
E
 
E
F
 
M
D
 
D
T
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
G
D
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
T
 
V

1kkpA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with serine (see paper)
49% identity, 87% coverage: 17:436/481 of query aligns to 1:387/405 of 1kkpA

query
sites
1kkpA
L
 
M
E
 
K
V
 
Y
I
 
L
A
 
P
S
 
Q
V
 
Q
E
 
D
P
 
P
R
 
Q
I
 
V
A
 
F
E
 
A
A
 
A
T
 
I
R
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
R
A
 
K
D
 
R
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
S
 
K
L
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
M
M
 
E
T
 
A
M
 
Q
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
T
 
Y
V
 
P
G
 
G
H
 
R
R
 
R
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
I
x
A
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
Y
W
 
F
S
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
E
H
 
H
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
G
Q
 
D
R
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
D
 
S
A
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
P
P
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
M
 
Q
F
 
Y
H
 
N
Q
 
F
Q
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
L
F
 
H
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Y
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
I
V
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
F
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
L
F
 
H
T
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
C
T
 
Q
E
 
E
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
P
 
K
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
 
K
G
 
A
C
 
I
-
 
F
P
 
P
M
 
G
V
 
I
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
M
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
Q
D
 
D
S
 
D
F
 
F
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
A
 
A
K
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
S
G
 
A
F
 
L
L
 
Q
T
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
F
D
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
P
Y
 
Q
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
T
T
 
V
N
 
N
R
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
G
 
S
A
 
P
W
 
F
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
L
D
 
E
E
 
E
F
 
M
D
 
D
T
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
G
D
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
T
 
V

1kkjA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from b.Stearothermophilus (see paper)
49% identity, 87% coverage: 17:436/481 of query aligns to 1:387/405 of 1kkjA

query
sites
1kkjA
L
 
M
E
 
K
V
 
Y
I
 
L
A
 
P
S
 
Q
V
 
Q
E
 
D
P
 
P
R
 
Q
I
 
V
A
 
F
E
 
A
A
 
A
T
 
I
R
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
R
A
 
K
D
 
R
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
S
 
K
L
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
M
M
 
E
T
 
A
M
 
Q
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
T
 
Y
V
 
P
G
 
G
H
 
R
R
 
R
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
I
x
A
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
Y
W
 
F
S
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
E
H
 
H
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
G
Q
 
D
R
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
D
 
S
A
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
P
P
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
M
 
Q
F
 
Y
H
 
N
Q
 
F
Q
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
L
F
 
H
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Y
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
I
V
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
F
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
L
F
 
H
T
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
C
T
 
Q
E
 
E
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
P
 
K
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
 
K
G
 
A
C
 
I
-
 
F
P
 
P
M
 
G
V
 
I
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
M
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
Q
D
 
D
S
 
D
F
 
F
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
A
 
A
K
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
S
G
 
A
F
 
L
L
 
Q
T
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
F
D
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
P
Y
 
Q
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
T
T
 
V
N
 
N
R
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
G
 
S
A
 
P
W
 
F
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
L
D
 
E
E
 
E
F
 
M
D
 
D
T
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
G
D
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
T
 
V

2vmyA Crystal structure of f351gbsshmt in complex with gly and fthf (see paper)
49% identity, 87% coverage: 17:436/481 of query aligns to 1:387/405 of 2vmyA

query
sites
2vmyA
L
 
M
E
 
K
V
 
Y
I
 
L
A
 
P
S
 
Q
V
 
Q
E
 
D
P
 
P
R
 
Q
I
 
V
A
 
F
E
 
A
A
 
A
T
 
I
R
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
R
A
 
K
D
 
R
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
S
 
K
L
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
M
M
 
E
T
 
A
M
 
Q
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
T
 
Y
V
 
P
G
 
G
H
 
R
R
 
R
F
x
Y
Y
|
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
I
x
A
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
Y
W
 
F
S
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
E
H
 
H
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
G
Q
 
D
R
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
|
L
D
 
S
A
 
H
G
 
G
G
|
G
H
|
H
L
|
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
P
P
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
M
 
Q
F
 
Y
H
 
N
Q
 
F
Q
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
L
F
 
H
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Y
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
I
V
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
F
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
L
F
 
H
T
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
C
T
 
Q
E
 
E
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
P
 
K
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
x
K
G
 
A
C
 
I
-
x
F
P
 
P
M
 
G
V
 
I
L
 
Q
G
 
G
G
|
G
P
 
P
L
 
L
S
 
M
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
Q
D
 
D
S
 
D
F
 
F
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
A
 
A
K
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
S
G
 
A
F
 
L
L
 
Q
T
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
F
D
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
P
Y
 
Q
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
T
T
 
V
N
 
N
R
 
K
N
|
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
G
x
S
A
x
P
W
x
G
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
L
D
 
E
E
 
E
F
 
M
D
 
D
T
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
G
D
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
T
 
V

2vmxA Crystal structure of f351gbsshmt in complex with l-allo-thr (see paper)
49% identity, 87% coverage: 17:436/481 of query aligns to 1:387/405 of 2vmxA

query
sites
2vmxA
L
 
M
E
 
K
V
 
Y
I
 
L
A
 
P
S
 
Q
V
 
Q
E
 
D
P
 
P
R
 
Q
I
 
V
A
 
F
E
 
A
A
 
A
T
 
I
R
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
R
A
 
K
D
 
R
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
S
 
K
L
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
S
 
S
P
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
M
M
 
E
T
 
A
M
 
Q
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
T
 
Y
V
 
P
G
 
G
H
 
R
R
 
R
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
I
x
A
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
Y
W
 
F
S
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
E
H
 
H
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
G
Q
 
D
R
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
L
 
L
D
 
S
A
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
P
P
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
V
M
 
Q
F
 
Y
H
 
N
Q
 
F
Q
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
H
L
 
V
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
L
F
 
H
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
A
Y
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
I
V
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
F
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
L
F
 
H
T
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
F
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
C
T
 
Q
E
 
E
E
 
Q
Y
 
F
A
 
A
P
 
K
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
 
K
G
 
A
C
 
I
-
 
F
P
 
P
M
 
G
V
 
I
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
M
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
Q
D
 
D
S
 
D
F
 
F
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
K
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
A
 
A
K
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
S
G
 
A
F
 
L
L
 
Q
T
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
F
D
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
P
Y
 
Q
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
T
T
 
V
N
 
N
R
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
G
 
S
A
 
P
W
 
G
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
L
D
 
E
E
 
E
F
 
M
D
 
D
T
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
G
D
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
T
 
V

6ymdA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from aphanothece halophytica in the covalent complex with malonate (see paper)
42% identity, 96% coverage: 17:478/481 of query aligns to 4:417/420 of 6ymdA

query
sites
6ymdA
L
 
L
E
 
D
V
 
F
I
 
L
A
 
L
S
 
Q
V
 
T
E
 
D
P
 
P
R
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
G
A
 
M
T
 
M
R
 
Q
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
D
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
S
 
H
L
 
L
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
M
M
 
A
T
 
T
M
 
Q
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
T
 
L
V
 
P
G
 
K
H
 
K
R
 
R
F
 
Y
Y
|
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
F
V
 
I
D
 
D
T
 
E
V
 
I
E
 
E
S
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
I
E
 
D
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
A
Y
 
S
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
I
x
A
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
F
V
 
A
A
 
V
F
 
F
W
 
L
S
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
K
H
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
P
N
 
G
Q
 
D
R
 
K
L
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
D
L
 
L
D
 
S
A
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
P
P
 
A
N
 
N
I
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
K
M
 
W
F
 
F
H
 
E
Q
 
A
Q
 
V
Q
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
S
P
 
Q
T
 
E
T
 
T
G
 
E
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
H
V
 
I
A
 
L
A
 
E
K
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
F
 
E
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
I
A
 
C
G
 
G
Y
|
Y
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
I
V
 
I
D
 
N
F
 
F
A
 
E
K
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
L
V
 
A
D
|
D
M
 
I
A
|
A
H
|
H
F
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
S
G
 
G
V
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
H
D
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
H
A
 
C
H
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
T
T
 
R
E
 
D
-
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
P
 
K
S
 
K
V
 
F
D
 
N
R
 
K
G
 
S
C
 
V
-
 
F
P
 
P
M
 
G
V
 
T
L
 
Q
G
 
G
G
|
G
P
 
P
L
 
L
S
 
E
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
K
D
 
P
S
 
E
F
 
F
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
S
Q
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
I
D
 
A
N
 
N
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
L
 
M
A
 
A
E
 
Q
G
 
Q
F
 
L
L
 
Q
T
 
N
R
 
R
G
 
G
A
 
F
D
 
K
L
 
I
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
S
Y
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
E
 
D
T
 
Q
A
 
L
L
 
V
L
 
S
D
 
D
A
 
V
G
 
N
V
 
I
V
 
T
T
 
A
N
 
N
R
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
E
G
 
S
A
 
P
W
 
F
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
L
R
|
R
L
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
L
G
 
G
H
 
T
D
 
E
E
 
D
F
 
F
D
 
A
T
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
I
I
 
I
V
 
A
D
 
D
V
 
R
L
 
L
S
 
Q
N
 
N
T
 
P
Q
 
E
A
 
D
G
 
E
T
 
Q
T
 
V
K
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
Q
G
 
A
V
 
C
A
 
V
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
A
A
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
M
 
L
L
 
C
D
 
E
K
 
R
H
 
F
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
H
L
 
L

6ymfA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from aphanothece halophytica in the plp-serine external aldimine state (see paper)
42% identity, 96% coverage: 17:478/481 of query aligns to 4:417/418 of 6ymfA

query
sites
6ymfA
L
 
L
E
 
D
V
 
F
I
 
L
A
 
L
S
 
Q
V
 
T
E
 
D
P
 
P
R
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
G
A
 
M
T
 
M
R
 
Q
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
D
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
S
 
H
L
 
L
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
M
M
 
A
T
 
T
M
 
Q
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
T
 
L
V
 
P
G
 
K
H
 
K
R
 
R
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
F
V
 
I
D
 
D
T
 
E
V
 
I
E
 
E
S
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
I
E
 
D
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
A
Y
 
S
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
I
x
A
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
F
V
 
A
A
 
V
F
 
F
W
 
L
S
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
K
H
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
P
N
 
G
Q
 
D
R
 
K
L
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
D
L
 
L
D
 
S
A
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
P
P
 
A
N
 
N
I
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
K
M
 
W
F
 
F
H
 
E
Q
 
A
Q
 
V
Q
 
H
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
S
P
 
Q
T
 
E
T
 
T
G
 
E
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
H
V
 
I
A
 
L
A
 
E
K
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
F
 
E
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
I
A
 
C
G
 
G
Y
 
Y
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
I
V
 
I
D
 
N
F
 
F
A
 
E
K
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
L
V
 
A
D
|
D
M
 
I
A
|
A
H
|
H
F
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
S
G
 
G
V
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
H
D
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
H
 
H
A
 
C
H
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
T
T
 
R
E
 
D
-
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
P
 
K
S
 
K
V
 
F
D
 
N
R
 
K
G
 
S
C
 
V
-
 
F
P
 
P
M
 
G
V
 
T
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
E
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
K
D
 
P
S
 
E
F
 
F
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
S
Q
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
I
D
 
A
N
 
N
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
L
 
M
A
 
A
E
 
Q
G
 
Q
F
 
L
L
 
Q
T
 
N
R
 
R
G
 
G
A
 
F
D
 
K
L
 
I
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
M
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
S
Y
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
E
 
D
T
 
Q
A
 
L
L
 
V
L
 
S
D
 
D
A
 
V
G
 
N
V
 
I
V
 
T
T
 
A
N
 
N
R
 
K
N
 
N
S
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
E
G
 
S
A
 
P
W
 
F
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
L
R
|
R
L
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
P
A
 
A
L
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
L
G
 
G
H
 
T
D
 
E
E
 
D
F
 
F
D
 
A
T
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
I
I
 
I
V
 
A
D
 
D
V
 
R
L
 
L
S
 
Q
N
 
N
T
 
P
Q
 
E
A
 
D
G
 
E
T
 
Q
T
 
V
K
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
Q
G
 
A
V
 
C
A
 
V
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
A
A
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
M
 
L
L
 
C
D
 
E
K
 
R
H
 
F
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
H
L
 
L

8suiB Joint x-ray/neutron structure of thermus thermophilus serine hydroxymethyltransferase (tthshmt) in internal aldimine state with l- ser bound in a pre-michalis complex (see paper)
50% identity, 81% coverage: 38:429/481 of query aligns to 17:376/402 of 8suiB

query
sites
8suiB
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
S
 
G
L
 
L
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
S
 
S
P
 
K
A
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
E
T
 
A
M
 
V
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
Y
V
 
P
G
 
G
H
 
A
R
 
R
F
x
Y
Y
|
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
R
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
A
Y
 
W
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
S
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
Y
W
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
M
A
 
-
H
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
E
L
 
P
G
 
G
N
 
D
Q
 
T
R
 
-
L
 
L
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
R
P
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
M
 
L
F
 
Y
H
 
K
Q
 
V
Q
 
V
Q
 
S
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
G
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
E
V
 
V
A
 
R
A
 
R
K
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
H
K
 
R
P
 
P
L
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
R
 
F
V
 
W
D
 
D
F
 
F
A
 
K
K
 
A
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
L
 
L
M
 
V
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
L
F
 
H
T
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
N
P
 
P
V
 
L
P
 
P
H
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
K
 
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
S
T
 
N
E
 
D
-
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
P
 
K
S
 
R
V
 
I
D
 
D
R
 
K
G
 
L
C
 
I
-
 
F
P
 
P
M
 
G
V
 
I
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
E
H
 
H
V
 
V
M
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
Q
D
 
P
S
 
E
F
 
F
R
 
K
T
 
E
Y
 
Y
A
 
S
Q
 
R
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
D
 
E
N
 
N
A
 
A
K
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
G
 
E
F
 
L
L
 
A
T
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
Y
D
 
R
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
R
K
 
P
Y
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
R
L
 
L
L
 
D
D
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
T
T
 
V
N
 
N
R
 
K
N
 
N
S
 
A
V
 
I
P
 
P
A
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
K
G
 
P
A
 
P
W
 
R
Y
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
F
G
 
T
H
 
P
D
 
E
E
 
E
F
 
M
D
 
P
T
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
I

8ssyA Room-temperature x-ray structure of thermus thermophilus serine hydroxymethyltransferase (shmt) bound with d-ser in a pseudo- michaelis complex (see paper)
50% identity, 81% coverage: 38:429/481 of query aligns to 17:376/402 of 8ssyA

query
sites
8ssyA
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
S
 
G
L
 
L
K
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
S
 
S
P
 
K
A
 
Q
V
 
V
L
 
R
M
 
E
T
 
A
M
 
V
G
 
G
T
 
S
W
 
V
F
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
Y
V
 
P
G
 
G
H
 
A
R
 
R
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
N
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
R
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
A
Y
 
W
A
 
A
Y
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
S
D
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
Y
W
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
M
A
 
-
H
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
E
L
 
P
G
 
G
N
 
D
Q
 
T
R
 
-
L
 
L
L
 
M
G
 
G
M
 
M
S
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
G
F
 
S
R
 
R
P
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
M
 
L
F
 
Y
H
 
K
Q
 
V
Q
 
V
Q
 
S
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
D
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
G
 
E
L
 
L
L
 
I
D