SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068112231.1 NCBI__GCF_001653335.1:WP_068112231.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0DX84 3-methylmercaptopropionyl-CoA ligase; MMPA-CoA ligase; EC 6.2.1.44 from Ruegeria lacuscaerulensis (strain DSM 11314 / KCTC 2953 / ITI-1157) (Silicibacter lacuscaerulensis) (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:543/550 of query aligns to 1:535/539 of P0DX84

query
sites
P0DX84
M
 
M
R
 
L
S
 
G
T
 
Q
M
 
M
Q
 
M
D
 
T
D
 
Q
Q
 
P
L
 
L
T
 
L
I
 
I
G
 
S
A
 
S
I
 
L
R
 
I
R
 
D
H
 
H
V
 
A
V
 
A
E
 
R
V
 
Y
H
 
H
P
 
G
D
 
Q
G
 
T
V
 
E
A
 
I
I
 
V
T
 
S
A
 
V
T
 
E
E
 
T
G
 
D
G
 
G
S
 
T
R
 
V
S
 
T
R
 
R
S
 
T
-
 
N
Y
 
W
S
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
A
R
 
N
T
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
M
A
 
G
N
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
T
G
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
Q
G
 
P
D
 
Q
Q
 
D
R
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
L
Q
 
A
W
 
W
N
 
N
N
 
N
V
 
R
E
 
R
H
 
H
L
 
L
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
S
S
 
G
M
 
A
G
 
G
A
 
F
V
 
V
L
 
C
H
 
H
T
 
T
L
 
I
N
 
N
I
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
F
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
A
 
I
N
 
N
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
F
V
 
F
D
 
D
D
 
A
S
 
T
L
 
F
V
 
L
G
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
P
 
A
H
 
I
L
 
R
G
 
D
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
T
 
E
V
 
V
E
 
K
H
 
H
V
 
F
V
 
V
V
 
L
A
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
R
S
 
N
A
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
-
L
 
L
D
 
Q
A
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
G
T
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
L
H
 
E
L
 
F
Y
 
Y
E
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
E
M
 
T
Q
 
G
P
 
D
T
 
T
T
 
D
F
 
F
D
 
E
W
 
W
P
 
P
E
 
V
L
 
F
D
 
D
E
 
E
R
 
N
D
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
S
M
 
L
C
 
C
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
H
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
S
 
S
A
 
T
Y
 
V
L
 
L
H
 
H
S
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
S
C
 
N
G
 
T
G
 
R
N
 
D
T
 
V
T
 
I
A
 
G
L
 
Y
S
 
S
F
 
A
E
 
M
D
 
D
R
 
V
V
 
V
L
 
M
P
 
P
I
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
N
A
 
A
W
|
W
G
 
G
L
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
G
A
 
C
M
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
L
 
M
C
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
G
R
 
P
W
 
D
L
 
L
Q
 
H
A
 
G
D
 
E
P
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
N
F
 
L
I
 
I
Q
 
D
E
 
T
S
 
Y
R
 
G
P
 
V
T
 
T
L
 
L
S
 
A
G
 
M
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
I
W
 
W
N
 
Q
D
 
G
V
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
L
 
A
D
 
-
A
 
A
H
 
K
P
 
C
E
 
G
V
 
T
A
 
K
L
 
L
D
 
E
S
 
S
L
 
L
R
 
E
L
 
R
V
 
T
L
 
V
C
 
I
G
|
G
G
|
G
S
 
A
A
 
A
V
 
C
P
 
P
V
 
P
S
 
S
L
 
M
Q
 
I
Q
 
A
A
 
T
L
 
F
Q
 
R
E
 
E
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
L
 
D
V
 
T
R
 
V
Q
 
H
A
 
A
W
|
W
G
 
G
M
 
M
T
 
S
E
 
E
T
 
M
S
 
S
P
|
P
V
 
L
A
 
G
S
 
T
A
 
A
G
 
N
L
 
I
P
 
P
P
 
L
V
 
A
G
 
K
C
 
H
S
 
R
E
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
I
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
W
 
H
Q
 
K
Y
 
L
R
 
R
G
 
E
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
P
L
 
P
C
 
F
G
 
G
V
 
V
S
 
E
A
 
L
R
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
D
D
 
D
D
 
D
Q
 
G
T
 
N
V
 
D
L
 
L
P
 
P
H
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
V
S
 
T
V
 
Q
G
 
G
E
 
D
L
 
L
E
 
M
V
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
H
W
 
W
V
 
V
T
 
L
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
R
 
Q
P
 
L
E
 
K
E
 
D
G
 
Q
E
 
E
R
 
L
A
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
L
H
 
Q
D
 
D
G
 
G
W
 
W
L
 
F
R
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
V
 
V
G
 
A
H
 
T
V
 
L
D
 
D
E
 
P
L
 
D
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
S
 
T
L
 
I
T
 
R
D
 
D
R
|
R
A
 
S
K
|
K
D
|
D
V
 
I
I
 
I
K
|
K
S
 
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
W
|
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
I
L
 
A
M
 
V
A
 
A
H
 
H
E
 
P
A
 
K
V
 
L
L
 
A
E
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
H
E
 
P
K
 
K
W
 
W
Q
 
D
E
|
E
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
L
S
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
K
R
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
E
T
 
D
V
 
P
T
 
S
V
 
E
E
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
S
 
D
R
 
G
D
 
K
F
 
I
A
 
A
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
K
W
 
V
A
 
V
F
 
F
I
 
V
D
 
D
E
 
A
V
 
L
P
 
P
R
 
L
T
 
N
S
 
A
V
 
T
G
 
G
K
|
K
F
 
V
D
 
L
K
|
K
K
 
R
V
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
D
R
 
E
F
 
F
A
 
K
D
 
D

6ijbB Structure of 3-methylmercaptopropionate coa ligase mutant k523a in complex with amp and mmpa (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:543/550 of query aligns to 1:535/538 of 6ijbB

query
sites
6ijbB
M
 
M
R
 
L
S
 
G
T
 
Q
M
 
M
Q
 
M
D
 
T
D
 
Q
Q
 
P
L
 
L
T
 
L
I
 
I
G
 
S
A
 
S
I
 
L
R
 
I
R
 
D
H
 
H
V
 
A
V
 
A
E
 
R
V
 
Y
H
 
H
P
 
G
D
 
Q
G
 
T
V
 
E
A
 
I
I
 
V
T
 
S
A
 
V
T
 
E
E
 
T
G
 
D
G
 
G
S
 
T
R
 
V
S
 
T
R
 
R
S
 
T
-
 
N
Y
 
W
S
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
A
R
 
N
T
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
M
A
 
G
N
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
T
G
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
Q
G
 
P
D
 
Q
Q
 
D
R
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
L
Q
 
A
W
 
W
N
 
N
N
 
N
V
 
R
E
 
R
H
 
H
L
 
L
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
S
S
 
G
M
 
A
G
 
G
A
 
F
V
 
V
L
 
C
H
 
H
T
 
T
L
 
I
N
 
N
I
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
F
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
A
 
I
N
 
N
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
F
V
 
F
D
 
D
D
 
A
S
 
T
L
 
F
V
 
L
G
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
P
 
A
H
 
I
L
 
R
G
 
D
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
T
 
E
V
 
V
E
 
K
H
 
H
V
 
F
V
 
V
V
 
L
A
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
R
S
 
N
A
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
-
L
 
L
D
 
Q
A
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
G
T
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
L
H
 
E
L
 
F
Y
 
Y
E
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
E
M
 
T
Q
 
G
P
 
D
T
 
T
T
 
D
F
 
F
D
 
E
W
 
W
P
 
P
E
 
V
L
 
F
D
 
D
E
 
E
R
 
N
D
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
S
M
 
L
C
 
C
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
H
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
S
 
S
A
 
T
Y
 
V
L
 
L
H
|
H
S
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
S
C
 
N
G
 
T
G
 
R
N
 
D
T
 
V
T
 
I
A
 
G
L
 
Y
S
 
S
F
 
A
E
 
M
D
 
D
R
 
V
V
 
V
L
 
M
P
 
P
I
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
N
A
 
A
W
|
W
G
 
G
L
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
G
A
 
C
M
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
L
 
M
C
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
G
R
 
P
W
 
D
L
 
L
Q
 
H
A
 
G
D
 
E
P
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
N
F
 
L
I
 
I
Q
 
D
E
 
T
S
 
Y
R
 
G
P
 
V
T
 
T
L
 
L
S
 
A
G
 
M
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
I
W
 
W
N
 
Q
D
 
G
V
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
L
 
A
D
 
-
A
 
A
H
 
K
P
 
C
E
 
G
V
 
T
A
 
K
L
 
L
D
 
E
S
 
S
L
 
L
R
 
E
L
 
R
V
 
T
L
 
V
C
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
|
A
V
 
C
P
 
P
V
 
P
S
 
S
L
 
M
Q
 
I
Q
 
A
A
 
T
L
 
F
Q
 
R
E
 
E
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
L
 
D
V
 
T
R
 
V
Q
x
H
A
|
A
W
|
W
G
|
G
M
|
M
T
x
S
E
|
E
T
 
M
S
 
S
P
 
P
V
 
L
A
 
G
S
 
T
A
 
A
G
 
N
L
 
I
P
 
P
P
 
L
V
 
A
G
 
K
C
 
H
S
 
R
E
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
I
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
W
 
H
Q
 
K
Y
 
L
R
 
R
G
 
E
T
 
N
Q
|
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
P
L
 
P
C
 
F
G
 
G
V
 
V
S
 
E
A
 
L
R
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
D
D
 
D
D
 
D
Q
 
G
T
 
N
V
 
D
L
 
L
P
 
P
H
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
V
S
 
T
V
 
Q
G
 
G
E
 
D
L
 
L
E
 
M
V
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
H
W
 
W
V
 
V
T
 
L
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
R
 
Q
P
 
L
E
 
K
E
 
D
G
 
Q
E
 
E
R
 
L
A
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
L
H
 
Q
D
 
D
G
 
G
W
 
W
L
 
F
R
 
A
T
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
V
G
 
A
H
 
T
V
 
L
D
 
D
E
 
P
L
 
D
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
S
 
T
L
 
I
T
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
S
K
 
K
D
 
D
V
 
I
I
 
I
K
|
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
|
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
I
L
 
A
M
 
V
A
 
A
H
 
H
E
 
P
A
 
K
V
 
L
L
 
A
E
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
H
E
 
P
K
 
K
W
 
W
Q
 
D
E
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
L
S
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
K
R
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
E
T
 
D
V
 
P
T
 
S
V
 
E
E
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
S
 
D
R
 
G
D
 
K
F
 
I
A
 
A
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
K
W
 
V
A
 
V
F
 
F
I
 
V
D
 
D
E
 
A
V
 
L
P
 
P
R
 
L
T
 
N
S
 
A
V
 
T
G
 
G
K
x
A
F
 
V
D
 
L
K
 
K
K
 
R
V
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
D
R
 
E
F
 
F
A
 
K
D
 
D

Q5SKN9 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase; Long-chain fatty acyl-CoA synthetase; LC-FACS; EC 6.2.1.3 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
45% identity, 98% coverage: 3:543/550 of query aligns to 11:536/541 of Q5SKN9

query
sites
Q5SKN9
S
 
S
T
 
T
M
 
M
Q
 
M
D
 
D
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
T
 
N
I
 
L
G
 
W
A
 
D
I
 
F
R
 
L
R
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
A
V
 
L
H
 
F
P
 
G
D
 
R
G
 
K
V
 
E
A
 
V
I
 
V
T
 
S
A
 
R
T
 
L
E
 
H
G
 
T
G
 
G
S
 
E
R
 
V
S
 
H
R
 
R
S
 
T
-
 
T
Y
 
Y
S
 
A
E
 
E
L
 
V
G
 
Y
E
 
Q
R
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
M
N
 
G
A
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
G
G
 
V
D
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
T
 
T
F
 
L
Q
 
G
W
 
F
N
 
N
N
 
H
V
 
F
E
 
R
H
 
H
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
G
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
T
L
 
A
N
 
N
I
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
S
P
 
P
E
 
K
Q
 
E
L
 
I
V
 
A
Y
 
Y
V
 
I
A
 
L
N
 
N
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
D
 
D
H
 
K
V
 
V
V
 
L
I
 
L
V
 
F
D
 
D
D
 
P
S
 
N
L
 
L
V
 
L
G
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
E
P
 
A
H
 
I
L
 
R
G
 
G
Q
 
E
M
 
L
T
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
H
 
H
V
 
F
V
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
D
P
 
E
D
 
K
S
 
A
A
 
P
D
 
E
A
 
G
D
 
Y
L
 
L
D
 
A
A
 
Y
L
 
E
R
 
E
A
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
E
Q
 
E
V
 
A
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
P
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
D
W
 
P
P
 
V
E
 
R
L
 
V
D
 
P
E
 
E
R
 
R
D
 
A
A
 
A
A
 
C
A
 
G
M
 
M
C
 
A
Y
 
Y
T
|
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
S
 
A
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
A
C
 
S
G
 
L
G
 
V
N
 
D
T
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
E
E
 
K
D
 
D
R
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
H
A
 
V
N
 
N
A
 
A
W
 
W
G
 
C
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
M
 
T
M
 
L
S
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
G
R
 
P
W
 
R
L
 
L
Q
 
D
A
 
P
D
 
A
P
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
E
F
 
L
I
 
F
Q
 
D
E
 
G
S
 
E
R
 
G
P
 
V
T
 
T
L
 
F
S
 
T
G
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
 
L
D
 
A
V
 
L
L
 
A
S
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
E
A
 
S
H
 
T
P
 
G
E
 
H
V
 
-
A
 
R
L
 
L
D
 
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
R
V
 
L
L
 
V
C
 
V
G
 
G
G
|
G
S
 
S
A
 
A
V
 
A
P
 
P
V
 
R
S
 
S
L
 
L
Q
 
I
Q
 
-
A
 
A
L
 
R
Q
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
M
G
 
G
L
 
V
L
 
E
V
 
V
R
 
R
Q
|
Q
A
x
G
W
 
Y
G
 
G
M
 
L
T
|
T
E
|
E
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
V
S
 
V
A
 
Q
G
 
N
L
 
F
P
 
V
P
 
K
V
 
S
-
 
H
-
 
L
-
 
E
G
 
S
C
 
L
S
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
Q
 
K
W
 
L
Q
 
T
Y
 
L
R
 
K
G
 
A
T
 
K
Q
 
T
G
 
G
R
 
L
L
 
P
L
 
I
C
 
P
G
 
L
V
 
V
S
 
R
A
 
L
R
 
R
I
 
V
V
 
A
A
 
D
D
 
E
D
 
E
Q
 
G
T
 
R
V
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
A
V
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
W
 
W
V
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
G
P
 
N
E
 
E
E
 
E
G
 
A
E
 
T
R
 
R
A
 
S
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
A
K
 
L
F
 
T
H
 
P
D
 
D
G
 
G
W
 
F
L
 
F
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
I
G
 
A
H
 
V
V
 
W
D
 
D
E
 
E
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
S
 
E
L
 
I
T
 
K
D
 
D
R
 
R
A
 
L
K
|
K
D
 
D
V
 
L
I
 
I
K
|
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
G
H
 
H
E
 
P
A
 
K
V
 
V
L
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
H
E
 
P
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
P
R
 
R
D
 
-
G
 
G
A
 
E
T
 
K
V
 
P
T
 
T
V
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
N
E
 
E
-
 
H
F
 
L
L
 
L
S
 
K
R
 
A
D
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
W
 
Y
A
 
V
F
 
F
I
 
A
D
 
E
E
 
E
V
 
I
P
 
P
R
 
R
T
 
T
S
 
S
V
 
A
G
 
G
K
 
K
F
 
F
D
 
L
K
 
K
K
 
R
V
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
E
R
 
Q
F
 
Y
A
 
K
D
 
N

6ihkB Structure of mmpa coa ligase in complex with adp (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:543/550 of query aligns to 1:532/533 of 6ihkB

query
sites
6ihkB
M
 
M
R
 
L
S
 
G
T
 
Q
M
 
M
Q
 
M
D
 
T
D
 
Q
Q
 
P
L
 
L
T
 
L
I
 
I
G
 
S
A
 
S
I
 
L
R
 
I
R
 
D
H
 
H
V
 
A
V
 
A
E
 
R
V
 
Y
H
 
H
P
 
G
D
 
Q
G
 
T
V
 
E
A
 
I
I
 
V
T
 
S
A
 
V
T
 
E
E
 
T
G
 
D
G
 
G
S
 
T
R
 
V
S
 
T
R
 
R
S
 
T
-
 
N
Y
 
W
S
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
A
R
 
N
T
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
M
A
 
G
N
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
T
G
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
Q
G
 
P
D
 
Q
Q
 
D
R
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
L
Q
 
A
W
 
W
N
 
N
N
 
N
V
 
R
E
 
R
H
 
H
L
 
L
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
S
S
 
G
M
 
A
G
 
G
A
 
F
V
 
V
L
 
C
H
 
H
T
 
T
L
 
I
N
 
N
I
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
F
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
A
 
I
N
 
N
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
F
V
 
F
D
 
D
D
 
A
S
 
T
L
 
F
V
 
L
G
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
A
P
 
A
H
 
I
L
 
R
G
 
D
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
T
 
E
V
 
V
E
 
K
H
 
H
V
 
F
V
 
V
V
 
L
A
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
R
S
 
N
A
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
-
L
 
L
D
 
Q
A
 
Q
L
 
I
R
 
P
A
 
G
T
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
L
H
 
E
L
 
F
Y
 
Y
E
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
E
M
 
T
Q
 
G
P
 
D
T
 
T
T
 
D
F
 
F
D
 
E
W
 
W
P
 
P
E
 
V
L
 
F
D
 
D
E
 
E
R
 
N
D
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
S
M
 
L
C
 
C
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
-
T
 
-
G
 
-
N
 
H
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
S
 
S
A
 
T
Y
 
V
L
 
L
H
|
H
S
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
S
C
 
N
G
 
T
G
 
R
N
 
D
T
 
V
T
 
I
A
 
G
L
 
Y
S
 
S
F
 
A
E
 
M
D
 
D
R
 
V
V
 
V
L
 
M
P
 
P
I
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
N
A
 
A
W
 
W
G
 
G
L
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
G
A
 
C
M
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
L
 
M
C
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
G
R
 
P
W
 
D
L
 
L
Q
 
H
A
 
G
D
 
E
P
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
N
F
 
L
I
 
I
Q
 
D
E
 
T
S
 
Y
R
 
G
P
 
V
T
 
T
L
 
L
S
 
A
G
 
M
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
I
W
 
W
N
 
Q
D
 
G
V
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
L
 
A
D
 
-
A
 
A
H
 
K
P
 
C
E
 
G
V
 
T
A
 
K
L
 
L
D
 
E
S
 
S
L
 
L
R
 
E
L
 
R
V
 
T
L
 
V
C
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
|
A
V
 
C
P
 
P
V
 
P
S
 
S
L
 
M
Q
 
I
Q
 
A
A
 
T
L
 
F
Q
 
R
E
 
E
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
L
 
D
V
 
T
R
 
V
Q
x
H
A
|
A
W
|
W
G
|
G
M
|
M
T
x
S
E
|
E
T
 
M
S
 
S
P
 
P
V
 
L
A
 
G
S
 
T
A
 
A
G
 
N
L
 
I
P
 
P
P
 
L
V
 
A
G
 
K
C
 
H
S
 
R
E
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
I
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
W
 
H
Q
 
K
Y
 
L
R
 
R
G
 
E
T
 
N
Q
|
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
P
L
 
P
C
 
F
G
 
G
V
 
V
S
 
E
A
 
L
R
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
D
D
 
D
D
 
D
Q
 
G
T
 
N
V
 
D
L
 
L
P
 
P
H
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
V
S
 
T
V
 
Q
G
 
G
E
 
D
L
 
L
E
 
M
V
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
H
W
 
W
V
 
V
T
 
L
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
R
 
Q
P
 
L
E
 
K
E
 
D
G
 
Q
E
 
E
R
 
L
A
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
L
H
 
Q
D
 
D
G
 
G
W
 
W
L
 
F
R
 
A
T
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
V
G
 
A
H
 
T
V
 
L
D
 
D
E
 
P
L
 
D
G
 
G
Y
 
Y
I
 
M
S
 
T
L
 
I
T
 
R
D
 
D
R
|
R
A
 
S
K
 
K
D
 
D
V
 
I
I
 
I
K
|
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
|
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
I
L
 
A
M
 
V
A
 
A
H
 
H
E
 
P
A
 
K
V
 
L
L
 
A
E
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
H
E
 
P
K
 
K
W
 
W
Q
 
D
E
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
L
S
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
K
R
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
E
T
 
D
V
 
P
T
 
S
V
 
E
E
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
S
 
D
R
 
G
D
 
K
F
 
I
A
 
A
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
K
W
 
V
A
 
V
F
 
F
I
 
V
D
 
D
E
 
A
V
 
L
P
 
P
R
 
L
T
 
N
S
 
A
V
 
T
G
 
G
K
|
K
F
 
V
D
 
L
K
 
K
K
 
R
V
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
D
R
 
E
F
 
F
A
 
K
D
 
D

1v26B Crystal structure of tt0168 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
43% identity, 95% coverage: 3:527/550 of query aligns to 4:496/510 of 1v26B

query
sites
1v26B
S
 
S
T
 
T
M
 
M
Q
 
M
D
 
D
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
T
 
N
I
 
L
G
 
W
A
 
D
I
 
F
R
 
L
R
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
A
V
 
L
H
 
F
P
 
G
D
 
R
G
 
K
V
 
E
A
 
V
I
 
V
T
 
S
A
 
R
T
 
L
E
 
H
G
 
T
G
 
G
S
 
E
R
 
V
S
 
H
R
 
R
S
 
T
-
 
T
Y
 
Y
S
 
A
E
 
E
L
 
V
G
 
Y
E
 
Q
R
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
M
N
 
G
A
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
G
G
 
V
D
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
T
 
T
F
 
L
Q
 
G
W
 
F
N
 
N
N
 
H
V
 
F
E
 
R
H
 
H
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
G
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
T
L
 
A
N
 
N
I
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
S
P
 
P
E
 
K
Q
 
E
L
 
I
V
 
A
Y
 
Y
V
 
I
A
 
L
N
 
N
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
D
 
D
H
 
K
V
 
V
V
 
L
I
 
L
V
 
F
D
 
D
D
 
P
S
 
N
L
 
L
V
 
L
G
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
E
P
 
A
H
 
I
L
 
R
G
 
G
Q
 
E
M
 
L
T
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
H
 
H
V
 
F
V
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
D
P
 
E
D
 
K
S
 
A
A
 
P
D
 
E
A
 
G
D
 
Y
L
 
L
D
 
A
A
 
Y
L
 
E
R
 
E
A
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
E
Q
 
E
V
 
A
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
P
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
D
W
 
P
P
 
V
E
 
R
L
 
V
D
 
P
E
 
E
R
 
R
D
 
A
A
 
A
A
 
C
A
 
G
M
 
M
C
 
A
Y
 
Y
T
|
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
S
 
A
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
H
|
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
A
C
 
S
G
 
L
G
 
V
N
 
D
T
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
E
E
 
K
D
 
D
R
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
N
A
 
A
W
 
W
G
 
C
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
M
 
T
M
 
L
S
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
G
R
 
P
W
 
R
L
 
L
Q
 
D
A
 
P
D
 
A
P
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
E
F
 
L
I
 
F
Q
 
D
E
 
G
S
 
E
R
 
G
P
 
V
T
 
T
L
 
F
S
 
T
G
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
 
L
D
 
A
V
 
L
L
 
A
S
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
E
A
 
S
H
 
T
P
 
G
E
 
H
V
 
-
A
 
R
L
 
L
D
 
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
R
V
 
L
L
 
V
C
 
V
G
 
G
G
|
G
S
|
S
A
|
A
V
 
A
P
 
P
V
 
R
S
 
S
L
 
L
Q
 
-
Q
 
I
A
 
A
L
 
R
Q
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
M
G
 
G
L
 
V
L
 
E
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
x
G
W
x
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
E
|
E
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
V
S
 
V
A
 
Q
G
 
N
L
 
F
P
 
V
P
 
K
V
 
S
-
 
H
-
 
L
-
 
E
G
 
S
C
 
L
S
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
Q
 
K
W
 
L
Q
 
T
Y
 
L
R
 
K
G
 
A
T
 
K
Q
 
T
G
 
G
R
 
L
L
 
P
L
 
I
C
 
P
G
 
L
V
 
V
S
 
R
A
 
L
R
 
R
I
 
V
V
 
A
A
 
D
D
 
E
D
 
E
Q
 
G
T
 
R
V
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
A
V
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
W
 
W
V
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
G
P
 
N
E
 
E
E
 
E
G
 
A
E
 
T
R
 
R
A
 
S
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
A
K
 
L
F
 
T
H
 
P
D
 
D
G
 
G
W
 
F
L
 
F
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
I
G
 
A
H
 
V
V
 
W
D
 
D
E
 
E
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
S
 
E
L
 
I
T
 
K
D
 
D
R
 
R
A
 
L
K
|
K
D
 
D
V
 
L
I
 
I
K
|
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
|
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
L
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
H
E
 
P
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
-
V
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
N
E
 
E
-
 
H
F
 
L
L
 
L
S
 
K
R
 
A
D
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
W
 
Y
A
 
V
F
 
F
I
 
A
D
 
E
E
 
E
V
 
I
P
 
P
R
 
R
T
 
T

1v25A Crystal structure of tt0168 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
42% identity, 94% coverage: 3:518/550 of query aligns to 4:475/491 of 1v25A

query
sites
1v25A
S
 
S
T
 
T
M
 
M
Q
 
M
D
 
D
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
T
 
N
I
 
L
G
 
W
A
 
D
I
 
F
R
 
L
R
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
A
V
 
L
H
 
F
P
 
G
D
 
R
G
 
K
V
 
E
A
 
V
I
 
V
T
 
S
A
 
R
T
 
L
E
 
H
G
 
T
G
 
G
S
 
E
R
 
V
S
 
H
R
 
R
S
 
T
-
 
T
Y
 
Y
S
 
A
E
 
E
L
 
V
G
 
Y
E
 
Q
R
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
M
N
 
G
A
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
G
G
 
V
D
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
T
 
T
F
 
L
Q
 
G
W
 
F
N
 
N
N
 
H
V
 
F
E
 
R
H
 
H
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
G
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
T
L
 
A
N
 
N
I
 
P
R
 
R
L
 
L
F
 
S
P
 
P
E
 
K
Q
 
E
L
 
I
V
 
A
Y
 
Y
V
 
I
A
 
L
N
 
N
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
D
 
D
H
 
K
V
 
V
V
 
L
I
 
L
V
 
F
D
 
D
D
 
P
S
 
N
L
 
L
V
 
L
G
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
E
P
 
A
H
 
I
L
 
R
G
 
G
Q
 
E
M
 
L
T
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
H
 
H
V
 
F
V
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
D
P
 
E
D
 
K
S
 
A
A
 
P
D
 
E
A
 
G
D
 
Y
L
 
L
D
 
A
A
 
Y
L
 
E
R
 
E
A
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
E
Q
 
E
V
 
A
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
P
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
D
W
 
P
P
 
V
E
 
R
L
 
V
D
 
P
E
 
E
R
 
R
D
 
A
A
 
A
A
 
C
A
 
G
M
 
M
C
 
A
Y
 
Y
T
|
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
S
 
A
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
H
|
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
A
C
 
S
G
 
L
G
 
V
N
 
D
T
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
E
E
 
K
D
 
D
R
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
x
V
N
 
N
A
 
A
W
 
W
G
 
C
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
M
 
T
M
 
L
S
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
G
R
 
P
W
 
R
L
 
L
Q
 
D
A
 
P
D
 
A
P
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
E
F
 
L
I
 
F
Q
 
D
E
 
G
S
 
E
R
 
G
P
 
V
T
 
T
L
 
F
S
 
T
G
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
 
L
D
 
A
V
 
L
L
 
A
S
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
E
A
 
S
H
 
T
P
 
G
E
 
H
V
 
-
A
 
R
L
 
L
D
 
K
S
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
R
V
 
L
L
 
V
C
 
V
G
 
G
G
|
G
S
|
S
A
|
A
V
 
A
P
 
P
V
 
R
S
 
S
L
 
L
Q
 
-
Q
 
I
A
 
A
L
 
R
Q
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
M
G
 
G
L
 
V
L
 
E
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
 
G
W
x
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
E
|
E
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
V
S
 
V
A
 
Q
G
 
N
L
 
F
P
 
V
P
 
K
V
 
S
-
 
H
-
 
L
-
 
E
G
 
S
C
 
L
S
 
S
E
 
E
E
 
E
E
 
E
Q
 
K
W
 
L
Q
 
T
Y
 
L
R
 
K
G
 
A
T
 
K
Q
 
T
G
 
G
R
 
L
L
 
P
L
 
I
C
 
P
G
 
L
V
 
V
S
 
R
A
 
L
R
 
R
I
 
V
V
 
A
A
 
D
D
 
E
D
 
E
Q
 
G
T
 
R
V
 
P
L
 
V
P
 
P
H
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
A
V
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
W
 
W
V
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
G
P
 
N
E
 
E
E
 
E
G
 
A
E
 
T
R
 
R
A
 
S
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
A
K
 
L
F
 
T
H
 
P
D
 
D
G
 
G
W
 
F
L
 
F
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
I
G
 
A
H
 
V
V
 
W
D
 
D
E
 
E
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
S
 
E
L
x
I
T
 
K
D
 
D
R
 
R
A
 
L
K
 
K
D
 
D
V
 
L
I
 
I
K
|
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
|
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
H
E
 
P
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
V
V
 
V
V
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
W
 
Y

8i8eA Acyl-acp synthetase structure bound to c18:1-acp
37% identity, 97% coverage: 9:539/550 of query aligns to 9:527/530 of 8i8eA

query
sites
8i8eA
Q
 
Q
L
 
L
T
 
L
I
 
I
G
 
K
A
 
N
I
 
L
R
 
L
R
 
F
H
 
S
V
 
P
V
 
V
E
 
A
V
 
F
H
 
N
P
 
P
D
 
E
G
 
Q
V
 
E
A
 
I
I
 
V
T
 
Y
A
 
A
T
 
N
E
 
H
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
R
R
 
H
S
 
S
Y
 
Y
S
 
K
E
 
T
L
 
F
G
 
H
E
 
D
R
 
R
T
 
V
A
 
R
R
 
Q
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
T
G
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
K
G
 
K
D
 
G
Q
 
D
R
 
T
V
 
V
G
 
A
T
 
V
F
 
M
Q
 
D
W
 
Y
N
 
D
N
 
S
V
 
H
E
 
R
H
 
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
C
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
M
M
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
M
L
 
I
N
 
N
I
 
V
R
|
R
L
 
L
F
 
S
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
Y
 
Y
V
 
T
A
 
I
N
 
D
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
D
 
D
H
 
D
V
 
I
V
 
I
I
 
L
V
 
I
D
 
H
D
 
E
S
 
E
L
 
F
V
 
L
G
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
D
P
 
Q
H
 
I
L
 
K
G
 
G
Q
 
R
M
 
I
T
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
T
H
 
R
V
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
R
P
 
D
D
 
D
S
 
E
A
 
E
D
 
C
A
 
E
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
Y
E
 
E
D
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
E
M
 
Q
Q
 
E
P
 
S
T
 
T
T
 
E
F
 
Y
D
 
N
W
 
F
P
 
P
E
 
D
L
 
F
D
 
D
E
 
E
R
 
N
D
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
T
M
 
T
C
 
F
Y
 
Y
T
 
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
F
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
F
Y
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
R
S
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
H
 
H
S
 
T
L
 
M
A
 
G
V
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
T
C
 
I
G
 
G
G
 
T
N
 
N
T
 
A
T
 
S
A
 
Q
-
 
G
-
 
R
L
 
L
S
 
H
F
 
Q
E
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
Y
L
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
T
P
|
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
H
A
 
A
W
 
W
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
S
 
M
A
 
A
M
 
T
M
 
M
S
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
Y
P
 
P
D
 
G
R
 
K
W
 
Y
L
 
V
Q
 
-
A
 
P
D
 
D
P
 
V
L
 
L
V
 
L
R
 
N
F
 
L
I
 
I
Q
 
E
E
 
Q
S
 
E
R
 
K
P
 
V
T
 
T
L
 
F
S
 
S
G
 
H
G
 
C
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
I
W
 
L
N
 
H
D
 
L
V
 
L
L
 
L
S
 
S
H
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
S
H
 
P
P
 
K
E
 
S
V
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
D
-
 
F
S
 
S
L
 
G
R
 
W
L
 
K
V
 
V
L
 
V
C
 
I
G
|
G
G
|
G
S
x
A
A
|
A
V
 
L
P
 
P
V
 
K
S
 
A
L
 
L
Q
 
C
Q
 
K
A
 
S
L
 
A
Q
 
L
E
 
E
R
 
R
H
 
-
G
 
D
L
 
I
L
 
D
V
 
V
R
 
F
Q
 
A
A
x
G
W
x
Y
G
 
G
M
|
M
T
x
S
E
 
E
T
 
T
S
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
L
S
 
S
-
 
I
A
 
V
G
 
Q
L
 
L
P
 
T
P
 
P
-
 
E
-
 
Q
V
 
L
G
 
E
C
 
L
S
 
D
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
Q
 
Q
W
 
A
Q
 
E
Y
 
Y
R
 
R
G
 
S
T
 
K
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
K
L
 
V
C
 
A
G
 
L
V
 
V
S
 
E
A
 
A
R
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
D
D
 
E
D
 
D
Q
 
M
T
 
N
V
 
K
L
 
L
P
 
P
H
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
E
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
E
 
V
V
 
V
R
 
R
G
 
A
P
 
P
W
 
W
V
 
L
T
 
T
A
 
P
A
 
N
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
K
P
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
D
R
 
N
A
 
K
E
 
N
A
 
S
E
 
K
A
 
A
K
 
L
F
 
W
H
 
R
D
 
G
G
 
G
W
 
Y
L
 
L
R
 
H
T
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
V
G
 
A
H
 
H
V
 
I
D
 
D
E
 
D
L
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
S
 
K
L
 
I
T
 
T
D
 
D
R
|
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
M
I
 
I
K
 
K
S
 
I
G
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
I
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
L
D
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
D
A
 
I
L
 
L
M
 
H
A
 
Q
H
 
H
E
 
Q
A
 
S
V
 
V
L
 
S
E
 
E
A
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
I
 
M
P
 
P
D
 
H
E
 
N
K
 
K
W
 
W
Q
 
G
E
 
E
R
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
L
V
 
V
V
 
T
V
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
D
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
T
 
T
V
 
E
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
L
E
 
G
F
 
F
L
 
-
S
 
A
R
 
K
D
 
D
F
 
F
-
 
I
-
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
L
A
 
A
K
 
R
W
 
E
Q
 
A
L
 
L
P
 
L
D
 
L
T
 
K
W
 
V
A
 
K
F
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
I
P
 
A
R
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
V
D
 
D
K
 
K
K
 
K
V
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
K

8i49A Acyl-acp synthetase structure bound to atp
37% identity, 97% coverage: 9:539/550 of query aligns to 9:527/530 of 8i49A

query
sites
8i49A
Q
 
Q
L
 
L
T
 
L
I
 
I
G
 
K
A
 
N
I
 
L
R
 
L
R
 
F
H
 
S
V
 
P
V
 
V
E
 
A
V
 
F
H
 
N
P
 
P
D
 
E
G
 
Q
V
 
E
A
 
I
I
 
V
T
 
Y
A
 
A
T
 
N
E
 
H
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
R
R
 
H
S
 
S
Y
 
Y
S
 
K
E
 
T
L
 
F
G
 
H
E
 
D
R
 
R
T
 
V
A
 
R
R
 
Q
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
T
G
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
K
G
 
K
D
 
G
Q
 
D
R
 
T
V
 
V
G
 
A
T
 
V
F
 
M
Q
 
D
W
 
Y
N
 
D
N
 
S
V
 
H
E
 
R
H
 
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
C
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
M
M
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
M
L
 
I
N
 
N
I
 
V
R
 
R
L
 
L
F
 
S
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
Y
 
Y
V
 
T
A
 
I
N
 
D
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
D
 
D
H
 
D
V
 
I
V
 
I
I
 
L
V
 
I
D
 
H
D
 
E
S
 
E
L
 
F
V
 
L
G
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
D
P
 
Q
H
 
I
L
 
K
G
 
G
Q
 
R
M
 
I
T
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
T
H
 
R
V
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
R
P
 
D
D
 
D
S
 
E
A
 
E
D
 
C
A
 
E
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
Y
E
 
E
D
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
E
M
 
Q
Q
 
E
P
 
S
T
 
T
T
 
E
F
 
Y
D
 
N
W
 
F
P
 
P
E
 
D
L
 
F
D
 
D
E
 
E
R
 
N
D
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
T
M
 
T
C
 
F
Y
 
Y
T
 
T
S
 
T
G
|
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
F
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
F
Y
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
R
S
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
H
 
H
S
 
T
L
 
M
A
 
G
V
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
T
C
 
I
G
 
G
G
 
T
N
 
N
T
 
A
T
 
S
A
 
Q
-
 
G
-
 
R
L
 
L
S
 
H
F
 
Q
E
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
Y
L
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
T
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
H
A
 
V
N
 
H
A
 
A
W
 
W
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
S
 
M
A
 
A
M
 
T
M
 
M
S
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
Y
P
 
P
D
 
G
R
 
K
W
 
Y
L
 
V
Q
 
-
A
 
P
D
 
D
P
 
V
L
 
L
V
 
L
R
 
N
F
 
L
I
 
I
Q
 
E
E
 
Q
S
 
E
R
 
K
P
 
V
T
 
T
L
 
F
S
 
S
G
 
H
G
 
C
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
I
W
 
L
N
 
H
D
 
L
V
 
L
L
 
L
S
 
S
H
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
S
H
 
P
P
 
K
E
 
S
V
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
D
-
 
F
S
 
S
L
 
G
R
 
W
L
 
K
V
 
V
L
 
V
C
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
|
A
V
 
L
P
 
P
V
 
K
S
 
A
L
 
L
Q
 
C
Q
 
K
A
 
S
L
 
A
Q
 
L
E
 
E
R
 
R
H
 
-
G
 
D
L
 
I
L
 
D
V
 
V
R
 
F
Q
 
A
A
 
G
W
x
Y
G
|
G
M
|
M
T
x
S
E
 
E
T
 
T
S
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
L
S
 
S
-
 
I
A
 
V
G
 
Q
L
 
L
P
 
T
P
 
P
-
 
E
-
 
Q
V
 
L
G
 
E
C
 
L
S
 
D
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
Q
 
Q
W
 
A
Q
 
E
Y
 
Y
R
 
R
G
 
S
T
 
K
Q
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
K
L
 
V
C
 
A
G
 
L
V
 
V
S
 
E
A
 
A
R
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
D
D
 
E
D
 
D
Q
 
M
T
 
N
V
 
K
L
 
L
P
 
P
H
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
E
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
E
 
V
V
 
V
R
 
R
G
 
A
P
 
P
W
 
W
V
 
L
T
 
T
A
 
P
A
 
N
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
K
P
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
D
R
 
N
A
 
K
E
 
N
A
 
S
E
 
K
A
 
A
K
 
L
F
 
W
H
 
R
D
 
G
G
 
G
W
 
Y
L
 
L
R
 
H
T
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
V
G
 
A
H
 
H
V
 
I
D
 
D
E
 
D
L
 
E
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
S
 
K
L
 
I
T
 
T
D
 
D
R
|
R
A
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
M
I
 
I
K
 
K
S
 
I
G
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
I
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
L
D
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
D
A
 
I
L
 
L
M
 
H
A
 
Q
H
 
H
E
 
Q
A
 
S
V
 
V
L
 
S
E
 
E
A
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
I
 
M
P
 
P
D
 
H
E
 
N
K
 
K
W
 
W
Q
 
G
E
 
E
R
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
L
V
 
V
V
 
T
V
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
D
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
T
 
T
V
 
E
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
L
E
 
G
F
 
F
L
 
-
S
 
A
R
 
K
D
 
D
F
 
F
-
 
I
-
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
L
A
 
A
K
 
R
W
 
E
Q
 
A
L
 
L
P
 
L
D
 
L
T
 
K
W
 
V
A
 
K
F
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
I
P
 
A
R
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
V
D
 
D
K
 
K
K
 
K
V
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
K

8i22A Acyl-acp synthetase structure bound to pimelic acid monoethyl ester
37% identity, 97% coverage: 9:539/550 of query aligns to 9:527/530 of 8i22A

query
sites
8i22A
Q
 
Q
L
 
L
T
 
L
I
 
I
G
 
K
A
 
N
I
 
L
R
 
L
R
 
F
H
 
S
V
 
P
V
 
V
E
 
A
V
 
F
H
 
N
P
 
P
D
 
E
G
 
Q
V
 
E
A
 
I
I
 
V
T
 
Y
A
 
A
T
 
N
E
 
H
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
R
R
 
H
S
 
S
Y
 
Y
S
 
K
E
 
T
L
 
F
G
 
H
E
 
D
R
 
R
T
 
V
A
 
R
R
 
Q
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
T
G
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
K
G
 
K
D
 
G
Q
 
D
R
 
T
V
 
V
G
 
A
T
 
V
F
 
M
Q
 
D
W
 
Y
N
 
D
N
 
S
V
 
H
E
 
R
H
 
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
C
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
M
M
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
M
L
 
I
N
 
N
I
 
V
R
 
R
L
 
L
F
 
S
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
Y
 
Y
V
 
T
A
 
I
N
 
D
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
D
 
D
H
 
D
V
 
I
V
 
I
I
 
L
V
 
I
D
 
H
D
 
E
S
 
E
L
 
F
V
 
L
G
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
D
P
 
Q
H
 
I
L
 
K
G
 
G
Q
 
R
M
 
I
T
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
T
H
 
R
V
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
R
P
 
D
D
 
D
S
 
E
A
 
E
D
 
C
A
 
E
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
Y
E
 
E
D
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
E
M
 
Q
Q
 
E
P
 
S
T
 
T
T
 
E
F
 
Y
D
 
N
W
 
F
P
 
P
E
 
D
L
 
F
D
 
D
E
 
E
R
 
N
D
 
T
A
 
V
A
 
A
A
 
T
M
 
T
C
 
F
Y
 
Y
T
 
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
F
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
F
Y
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
R
S
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
H
 
H
S
 
T
L
 
M
A
 
G
V
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
T
C
 
I
G
 
G
G
 
T
N
 
N
T
 
A
T
 
S
A
 
Q
-
 
G
-
 
R
L
 
L
S
 
H
F
 
Q
E
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
Y
L
 
M
P
 
P
I
 
I
V
 
T
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
H
A
 
V
N
 
H
A
 
A
W
|
W
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
S
 
M
A
 
A
M
 
T
M
 
M