SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068172852.1 NCBI__GCF_001592305.1:WP_068172852.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 40% coverage: 351:586/589 of query aligns to 14:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
V
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
Q
 
S
I
 
V
Q
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
D
I
 
V
V
 
T
G
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
A
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
V
 
Y
F
 
F
Q
 
E
G
 
N
G
 
K
N
 
D
I
 
I
S
 
T
G
 
N
K
 
K
P
 
E
S
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
Y
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
M
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
P
K
 
Q
M
 
P
I
 
L
P
 
K
D
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
A
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
E
H
 
I
T
 
C
R
 
P
G
 
G
R
 
E
K
 
S
G
 
P
V
 
L
L
 
N
T
 
S
A
 
L
M
 
F
L
 
Y
R
 
K
A
 
K
N
 
W
R
 
I
T
 
P
E
 
K
E
 
E
K
 
E
Q
 
E
L
 
M
F
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
A
Q
 
F
R
 
K
Q
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
F
I
 
L
G
 
K
M
 
L
G
 
S
D
 
H
Y
 
L
L
 
Y
H
 
D
E
 
R
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
E
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
M
R
 
K
L
 
L
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
T
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
A
H
 
P
Q
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
A
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
N
V
 
H
L
 
V
R
 
L
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
I
S
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
Q
 
N
I
 
Y
C
 
I
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
Y
V
 
V
M
 
M
E
 
F
F
 
N
G
 
G
T
 
Q
L
 
I
L
 
I
T
 
A
Q
 
E
G
 
G
P
 
R
P
 
G
A
 
E
Q
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
I
 
V
Q
 
L
Q
 
S
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
R
 
V
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 40% coverage: 351:586/589 of query aligns to 14:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
V
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
Q
 
S
I
 
V
Q
 
C
A
 
K
G
 
G
Q
 
D
I
 
V
V
 
T
G
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
A
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
V
 
Y
F
 
F
Q
 
E
G
 
N
G
 
K
N
 
D
I
 
I
S
 
T
G
 
N
K
 
K
P
 
E
S
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
Y
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
M
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
P
K
 
Q
M
 
P
I
 
L
P
 
K
D
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
A
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
E
H
 
I
T
 
N
R
 
P
G
 
G
R
 
E
K
 
S
G
 
P
V
 
L
L
 
N
T
 
S
A
 
L
M
 
F
L
 
Y
R
 
K
A
 
K
N
 
W
R
 
I
T
 
P
E
 
K
E
 
E
K
 
E
Q
 
E
L
 
M
F
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
A
Q
 
F
R
 
K
Q
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
F
I
 
L
G
 
K
M
 
L
G
 
S
D
 
H
Y
 
L
L
 
Y
H
 
D
E
 
R
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
E
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
M
R
 
K
L
 
L
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
T
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
A
H
 
P
Q
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
A
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
N
V
 
H
L
 
V
R
 
L
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
I
S
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
Q
 
N
I
 
Y
C
 
I
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
Y
V
 
V
M
 
M
E
 
F
F
 
N
G
 
G
T
 
Q
L
 
I
L
 
I
T
 
A
Q
 
E
G
 
G
P
 
R
P
 
G
A
 
E
Q
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
I
 
V
Q
 
L
Q
 
S
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
R
 
V
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
33% identity, 42% coverage: 339:586/589 of query aligns to 4:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
E
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
V
K
 
Q
K
 
S
A
 
L
R
 
H
M
 
V
Q
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
H
A
 
A
V
 
I
N
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
D
F
 
L
Q
 
K
I
 
V
Q
 
P
A
 
R
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
L
N
 
S
L
 
A
I
 
I
T
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
I
V
 
I
F
 
F
Q
 
N
G
 
G
G
 
Q
N
 
D
I
 
I
S
 
T
G
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
A
R
 
H
E
 
V
I
 
I
A
 
N
R
 
R
L
 
M
G
 
G
M
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
V
F
 
P
Q
x
E
H
 
G
V
 
R
K
 
R
M
 
I
I
 
F
P
 
P
D
 
E
M
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
L
A
 
M
L
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
N
R
 
R
G
 
K
R
 
D
K
 
K
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
E
A
 
G
N
 
I
R
 
K
T
 
R
E
 
D
E
 
L
K
 
E
Q
 
W
L
 
I
F
 
F
R
 
S
E
 
L
A
 
F
Q
 
P
R
 
R
Q
 
L
L
 
K
E
 
E
R
 
R
I
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
L
H
 
K
E
 
Q
Q
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
T
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
M
M
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
S
D
 
R
P
 
P
T
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
A
H
 
P
Q
 
I
E
 
L
K
 
V
Q
 
S
A
 
E
L
 
V
A
 
F
G
 
E
V
 
V
L
 
I
R
 
Q
Q
 
K
L
 
I
K
 
N
S
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
T
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
D
 
L
L
 
G
V
 
A
M
 
L
Q
 
K
I
 
V
C
 
A
D
 
H
H
 
Y
L
 
G
V
 
Y
V
 
V
M
 
L
E
 
E
F
 
T
G
 
G
T
 
Q
L
 
I
L
 
V
T
 
L
Q
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
A
A
 
S
Q
 
E
I
 
L
Q
 
L
Q
 
D
D
 
N
P
 
E
K
 
M
V
 
V
R
 
R
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 39% coverage: 357:588/589 of query aligns to 18:237/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
V
 
V
N
 
S
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
Q
I
 
V
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
T
 
S
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
I
T
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
V
R
 
A
A
 
R
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
I
V
 
T
F
 
I
Q
 
D
G
 
D
G
 
N
N
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
I
K
 
L
P
 
P
S
 
M
R
 
H
E
 
S
I
 
R
A
 
S
R
 
R
L
 
M
G
 
G
M
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
H
 
E
V
 
A
K
 
S
M
 
I
I
 
F
P
 
R
D
 
K
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
M
L
 
A
G
 
V
A
 
L
H
 
Q
T
 
T
R
 
R
G
 
E
R
 
E
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
T
A
 
H
M
x
E
L
 
E
R
 
R
A
 
Q
N
x
D
R
 
K
T
 
L
E
 
E
E
 
D
K
 
-
Q
 
-
L
 
L
F
 
L
R
 
E
E
 
E
A
 
F
Q
 
H
R
 
I
Q
 
Q
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
H
L
 
I
H
 
R
E
 
K
Q
 
S
A
 
A
G
 
G
-
 
M
N
 
A
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
E
Q
 
R
R
 
R
L
 
R
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
N
P
 
P
T
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
D
H
 
P
Q
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
A
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
K
V
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
R
S
 
D
E
 
R
G
 
G
M
 
L
S
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
Q
 
D
I
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
K
L
 
A
V
 
Y
V
 
I
M
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
E
G
 
G
P
 
T
P
 
P
A
 
Q
Q
 
D
I
 
V
Q
 
L
Q
 
N
D
 
N
P
 
E
K
 
Q
V
 
V
R
 
K
A
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
E
E
 
Q

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
32% identity, 40% coverage: 351:588/589 of query aligns to 12:237/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
F
 
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
V
 
R
A
 
V
V
 
V
N
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
T
I
 
V
Q
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
R
 
P
A
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
D
G
 
D
N
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
K
 
L
P
 
P
S
 
L
R
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
H
 
E
V
 
A
K
 
S
M
 
I
I
 
F
P
x
R
D
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
M
L
 
A
G
 
V
A
 
L
H
 
Q
T
 
I
R
 
R
G
 
D
R
 
D
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
E
L
 
Q
R
 
R
A
 
E
N
 
D
R
 
R
T
 
A
E
 
N
E
 
E
K
 
-
Q
 
-
L
 
L
F
 
M
R
 
E
E
 
E
A
 
F
Q
 
H
R
 
I
Q
 
E
L
 
H
E
 
L
R
 
R
I
 
D
G
 
S
M
|
M
G
|
G
D
x
Q
Y
 
-
L
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
E
Q
 
R
R
 
R
L
 
R
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
D
H
 
P
Q
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
A
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
R
V
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
R
S
 
D
E
 
S
G
 
G
M
 
L
S
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
Q
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
L
 
A
V
 
Y
V
 
I
M
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
P
 
T
P
 
P
A
 
T
Q
 
E
I
 
I
Q
 
L
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
E
E
 
D

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
32% identity, 40% coverage: 351:588/589 of query aligns to 12:237/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
V
 
R
A
 
V
V
 
V
N
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
T
I
 
V
Q
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
R
 
P
A
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
D
G
 
D
N
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
K
 
L
P
 
P
S
 
L
R
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
H
 
E
V
 
A
K
 
S
M
 
I
I
 
F
P
 
R
D
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
M
L
 
A
G
 
V
A
 
L
H
 
Q
T
 
I
R
 
R
G
 
D
R
 
D
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
E
L
 
Q
R
 
R
A
 
E
N
 
D
R
 
R
T
 
A
E
 
N
E
 
E
K
 
-
Q
 
-
L
 
L
F
 
M
R
 
E
E
 
E
A
 
F
Q
 
H
R
 
I
Q
 
E
L
 
H
E
 
L
R
 
R
I
 
D
G
 
S
M
 
M
G
 
G
D
 
Q
Y
 
-
L
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
N
x
S
L
 
L
A
x
S
M
 
G
G
 
G
P
x
E
Q
 
R
R
 
R
L
 
R
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
D
H
 
P
Q
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
A
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
R
V
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
R
S
 
D
E
 
S
G
 
G
M
 
L
S
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
Q
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
L
 
A
V
 
Y
V
 
I
M
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
P
 
T
P
 
P
A
 
T
Q
 
E
I
 
I
Q
 
L
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
E
E
 
D

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
32% identity, 40% coverage: 351:586/589 of query aligns to 12:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
V
 
R
A
 
V
V
 
V
N
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
T
I
 
V
Q
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
R
 
P
A
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
D
G
 
D
N
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
K
 
L
P
 
P
S
 
L
R
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
H
 
E
V
 
A
K
 
S
M
 
I
I
 
F
P
 
R
D
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
M
L
 
A
G
 
V
A
 
L
H
 
Q
T
 
I
R
 
R
G
 
D
R
 
D
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
E
L
 
Q
R
 
R
A
 
E
N
 
D
R
 
R
T
 
A
E
 
N
E
 
E
K
 
-
Q
 
-
L
 
L
F
 
M
R
 
E
E
 
E
A
 
F
Q
 
H
R
 
I
Q
 
E
L
 
H
E
 
L
R
 
R
I
 
D
G
 
S
M
 
M
G
 
G
D
 
Q
Y
 
-
L
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
N
x
S
L
 
L
A
x
S
M
x
G
G
|
G
P
 
E
Q
 
R
R
 
R
L
 
R
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
|
G
L
 
V
R
 
D
H
 
P
Q
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
A
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
R
V
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
R
S
 
D
E
 
S
G
 
G
M
 
L
S
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
Q
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
L
 
A
V
 
Y
V
 
I
M
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
P
 
T
P
 
P
A
 
T
Q
 
E
I
 
I
Q
 
L
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
29% identity, 38% coverage: 350:574/589 of query aligns to 10:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
Q
 
N
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
D
 
G
I
 
V
S
 
T
F
 
L
Q
 
K
I
 
V
Q
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
I
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
E
A
 
P
T
 
T
R
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
F
F
 
I
Q
 
D
G
 
G
G
 
V
N
 
K
I
 
I
S
 
N
-
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
V
S
 
N
R
 
I
E
 
N
I
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
Q
G
 
K
M
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
F
P
 
P
D
 
H
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
G
 
A
A
 
P
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
V
A
 
K
M
 
V
L
 
K
R
 
K
A
 
M
N
 
N
R
 
K
T
 
K
E
 
E
E
 
A
K
 
E
Q
 
E
L
 
L
F
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
A
Q
 
V
R
 
D
Q
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
L
D
 
D
Y
 
K
L
 
K
H
 
D
E
 
Q
Q
 
Y
A
 
P
G
 
I
N
 
K
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
M
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
M
D
 
Q
P
 
P
T
 
E
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
A
 
L
G
 
N
V
 
V
L
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
S
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
Q
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
H
 
R
L
 
V
V
 
I
V
 
F
M
 
M
E
 
D
F
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
I
L
 
V
T
 
E
Q
 
E
G
 
G
P
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
I

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
31% identity, 40% coverage: 351:588/589 of query aligns to 13:238/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
V
 
R
A
x
V
V
 
V
N
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
T
I
 
V
Q
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
R
 
P
A
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
D
G
 
D
N
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
K
 
L
P
 
P
S
 
L
R
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
H
 
E
V
 
A
K
 
S
M
 
I
I
 
F
P
 
R
D
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
M
L
 
A
G
 
V
A
 
L
H
 
Q
T
 
I
R
 
R
G
 
D
R
 
D
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
E
L
 
Q
R
 
R
A
 
E
N
 
D
R
 
R
T
 
A
E
 
N
E
 
E
K
 
-
Q
 
-
L
 
L
F
 
M
R
 
E
E
 
E
A
 
F
Q
 
H
R
 
I
Q
 
E
L
 
H
E
 
L
R
 
R
I
 
D
G
 
S
M
 
M
G
 
G
D
 
Q
Y
 
-
L
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
E
Q
 
R
R
 
R
L
 
R
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
D
H
 
P
Q
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
A
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
R
V
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
R
S
 
D
E
 
S
G
 
G
M
 
L
S
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
Q
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
L
 
A
V
 
Y
V
 
I
M
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
P
 
T
P
 
P
A
 
T
Q
 
E
I
 
I
Q
 
L
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
E
E
 
D

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
32% identity, 38% coverage: 356:580/589 of query aligns to 20:234/343 of P30750

query
sites
P30750
A
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
H
I
 
V
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
V
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
V
Q
 
D
G
 
G
G
 
Q
N
 
E
I
 
L
S
 
T
G
 
T
K
 
L
P
 
S
S
 
E
R
 
S
E
 
E
I
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
Q
M
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
L
P
 
S
D
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
P
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
E
A
 
L
N
 
D
R
 
N
T
 
T
E
 
P
E
 
K
K
 
D
Q
 
E
L
 
V
F
 
K
R
 
R
E
 
R
A
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
D
 
D
Y
 
K
L
 
H
H
 
D
E
 
S
Q
 
Y
A
 
P
G
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
M
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
S
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
A
E
 
T
K
 
T
Q
 
R
A
 
S
L
 
I
A
 
L
G
 
E
V
 
L
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
I
K
 
N
S
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
K
Q
 
R
I
 
I
C
 
C
D
 
D
H
 
C
L
 
V
V
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
S
F
 
N
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
T
 
E
Q
 
Q
G
 
D
P
 
T
P
 
V
A
 
S
Q
 
E
I
 
V
Q
 
F
Q
 
S
D
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
T

Sites not aligning to the query:

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
31% identity, 40% coverage: 351:585/589 of query aligns to 12:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
V
 
R
A
x
V
V
 
V
N
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
T
I
 
V
Q
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
R
 
P
A
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
D
G
 
D
N
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
K
 
L
P
 
P
S
x
L
R
x
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
x
P
Q
|
Q
H
 
E
V
x
A
K
x
S
M
 
I
I
x
F
P
x
R
D
x
R
M
x
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
M
L
 
A
G
x
V
A
 
L
H
 
Q
T
 
I
R
 
R
G
 
D
R
 
D
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
E
L
 
Q
R
 
R
A
 
E
N
 
D
R
 
R
T
 
A
E
 
N
E
 
E
K
 
-
Q
 
-
L
 
L
F
 
M
R
 
E
E
 
E
A
 
F
Q
 
H
R
 
I
Q
 
E
L
 
H
E
 
L
R
 
R
I
 
D
G
 
S
M
 
M
G
 
G
D
x
Q
Y
 
-
L
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
E
Q
 
R
R
 
R
L
 
R
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
D
H
 
P
Q
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
A
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
R
V
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
R
S
 
D
E
 
S
G
 
G
M
 
L
S
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
Q
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
L
 
A
V
 
Y
V
 
I
M
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
P
 
T
P
 
P
A
 
T
Q
 
E
I
 
I
Q
 
L
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
31% identity, 40% coverage: 351:585/589 of query aligns to 12:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
V
 
R
A
x
V
V
 
V
N
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
T
I
 
V
Q
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
R
 
P
A
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
D
G
 
D
N
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
K
 
L
P
 
P
S
 
L
R
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
H
 
E
V
 
A
K
 
S
M
 
I
I
 
F
P
 
R
D
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
M
L
 
A
G
 
V
A
 
L
H
 
Q
T
 
I
R
 
R
G
 
D
R
 
D
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
E
L
 
Q
R
 
R
A
 
E
N
 
D
R
 
R
T
 
A
E
 
N
E
 
E
K
 
-
Q
 
-
L
 
L
F
 
M
R
 
E
E
 
E
A
 
F
Q
 
H
R
 
I
Q
 
E
L
 
H
E
 
L
R
 
R
I
 
D
G
 
S
M
 
M
G
 
G
D
 
Q
Y
 
-
L
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
E
Q
 
R
R
 
R
L
 
R
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
D
H
 
P
Q
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
A
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
R
V
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
R
S
 
D
E
 
S
G
 
G
M
 
L
S
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
Q
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
L
 
A
V
 
Y
V
 
I
M
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
P
 
T
P
 
P
A
 
T
Q
 
E
I
 
I
Q
 
L
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
A
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
28% identity, 41% coverage: 341:579/589 of query aligns to 3:230/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
V
 
M
L
 
I
D
 
D
V
 
V
K
 
H
K
 
Q
A
 
L
R
 
K
M
 
K
Q
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
N
F
 
V
Q
 
H
I
 
I
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
D
A
 
F
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
G
G
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
K
G
 
A
K
 
K
P
 
D
S
 
T
R
 
N
-
 
L
E
 
N
I
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
E
G
 
E
M
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
F
P
 
P
D
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
A
M
 
P
L
 
M
R
 
K
A
 
V
N
 
R
R
 
K
T
 
W
E
 
P
E
 
R
K
 
E
Q
 
K
L
 
A
F
 
E
R
 
A
E
 
K
A
 
A
Q
 
M
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
K
L
 
A
H
 
H
E
 
A
Q
 
Y
A
 
P
G
 
D
N
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
L
 
R
M
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
M
D
 
E
P
 
P
T
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
G
A
 
E
L
 
V
A
 
L
G
 
S
V
 
V
L
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
S
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
Q
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
H
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
E
 
D
F
 
G
G
 
G
T
 
Y
L
 
I
L
 
I
T
 
E
Q
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
 
D
I
 
L
Q
 
F
Q
 
D
D
 
R
P
 
P
K
 
Q

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
28% identity, 41% coverage: 341:579/589 of query aligns to 3:230/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
V
 
M
L
 
I
D
 
D
V
 
V
K
 
H
K
 
Q
A
 
L
R
 
K
M
 
K
Q
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
N
F
 
V
Q
 
H
I
 
I
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
D
A
 
F
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
G
G
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
K
G
 
A
K
 
K
P
 
D
S
 
T
R
 
N
-
 
L
E
 
N
I
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
E
G
 
E
M
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
F
P
 
P
D
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
A
M
 
P
L
 
M
R
 
K
A
 
V
N
 
R
R
 
K
T
 
W
E
 
P
E
 
R
K
 
E
Q
 
K
L
 
A
F
 
E
R
 
A
E
 
K
A
 
A
Q
 
M
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
K
L
 
A
H
 
H
E
 
A
Q
 
Y
A
 
P
G
 
D
N
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
L
 
R
M
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
M
D
 
E
P
 
P
T
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
G
A
 
E
L
 
V
A
 
L
G
 
S
V
 
V
L
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
S
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
Q
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
H
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
E
 
D
F
 
G
G
 
G
T
 
Y
L
 
I
L
 
I
T
 
E
Q
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
 
D
I
 
L
Q
 
F
Q
 
D
D
 
R
P
 
P
K
 
Q

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
28% identity, 41% coverage: 341:579/589 of query aligns to 3:230/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
V
 
M
L
 
I
D
 
D
V
 
V
K
 
H
K
 
Q
A
 
L
R
 
K
M
 
K
Q
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
N
F
 
V
Q
 
H
I
 
I
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
D
A
 
F
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
G
G
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
K
G
 
A
K
 
K
P
 
D
S
 
T
R
 
N
-
 
L
E
 
N
I
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
E
G
 
E
M
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
F
P
 
P
D
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
A
M
 
P
L
 
M
R
 
K
A
 
V
N
 
R
R
 
K
T
 
W
E
 
P
E
 
R
K
 
E
Q
 
K
L
 
A
F
 
E
R
 
A
E
 
K
A
 
A
Q
 
M
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
K
L
 
A
H
 
H
E
 
A
Q
 
Y
A
 
P
G
 
D
N
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
L
 
R
M
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
M
D
 
E
P
 
P
T
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
G
A
 
E
L
 
V
A
 
L
G
 
S
V
 
V
L
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
S
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
Q
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
H
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
E
 
D
F
 
G
G
 
G
T
 
Y
L
 
I
L
 
I
T
 
E
Q
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
 
D
I
 
L
Q
 
F
Q
 
D
D
 
R
P
 
P
K
 
Q

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
28% identity, 41% coverage: 341:579/589 of query aligns to 3:230/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
V
 
M
L
 
I
D
 
D
V
 
V
K
 
H
K
 
Q
A
 
L
R
 
K
M
 
K
Q
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
N
F
 
V
Q
 
H
I
 
I
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
D
A
 
F
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
I
F
 
I
Q
 
D
G
 
G
G
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
K
G
 
A
K
 
K
P
 
D
S
 
T
R
 
N
-
 
L
E
 
N
I
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
E
G
 
E
M
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
F
P
 
P
D
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
A
M
 
P
L
 
M
R
 
K
A
 
V
N
 
R
R
 
K
T
 
W
E
 
P
E
 
R
K
 
E
Q
 
K
L
 
A
F
 
E
R
 
A
E
 
K
A
 
A
Q
 
M
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
K
L
 
A
H
 
H
E
 
A
Q
 
Y
A
 
P
G
 
D
N
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
L
 
R
M
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
M
D
 
E
P
 
P
T
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
G
A
 
E
L
 
V
A
 
L
G
 
S
V
 
V
L
 
M
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
S
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
Q
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
H
 
R
L
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
E
 
D
F
 
G
G
 
G
T
 
Y
L
 
I
L
 
I
T
 
E
Q
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
 
D
I
 
L
Q
 
F
Q
 
D
D
 
R
P
 
P
K
 
Q

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
31% identity, 38% coverage: 356:580/589 of query aligns to 21:235/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
A
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
H
I
 
V
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
V
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
V
Q
 
D
G
 
G
G
 
Q
N
 
E
I
 
L
S
 
T
G
 
T
K
 
L
P
 
S
S
 
E
R
 
S
E
 
E
I
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
Q
M
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
L
P
 
S
D
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
P
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
E
A
 
L
N
 
D
R
 
N
T
 
T
E
 
P
E
 
K
K
 
D
Q
 
E
L
 
V
F
 
K
R
 
R
E
 
R
A
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
D
 
D
Y
 
K
L
 
H
H
 
D
E
 
S
Q
 
Y
A
 
P
G
 
S
N
|
N
L
 
L
A
x
S
M
 
G
G
 
G
P
x
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
M
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
S
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
A
E
 
T
K
 
T
Q
 
R
A
 
S
L
 
I
A
 
L
G
 
E
V
 
L
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
I
K
 
N
S
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
K
Q
 
R
I
 
I
C
 
C
D
 
D
H
 
C
L
 
V
V
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
S
F
 
N
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
T
 
E
Q
 
Q
G
 
D
P
 
T
P
 
V
A
 
S
Q
 
E
I
 
V
Q
 
F
Q
 
S
D
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
T

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
31% identity, 38% coverage: 356:580/589 of query aligns to 21:235/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
A
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
H
I
 
V
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
V
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
V
Q
 
D
G
 
G
G
 
Q
N
 
E
I
 
L
S
 
T
G
 
T
K
 
L
P
 
S
S
 
E
R
 
S
E
 
E
I
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
Q
M
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
L
P
 
S
D
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
P
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
E
A
 
L
N
 
D
R
 
N
T
 
T
E
 
P
E
 
K
K
 
D
Q
 
E
L
 
V
F
 
K
R
 
R
E
 
R
A
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
D
 
D
Y
 
K
L
 
H
H
 
D
E
 
S
Q
 
Y
A
 
P
G
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
M
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
S
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
A
E
 
T
K
 
T
Q
 
R
A
 
S
L
 
I
A
 
L
G
 
E
V
 
L
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
I
K
 
N
S
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
K
Q
 
R
I
 
I
C
 
C
D
 
D
H
 
C
L
 
V
V
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
S
F
 
N
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
T
 
E
Q
 
Q
G
 
D
P
 
T
P
 
V
A
 
S
Q
 
E
I
 
V
Q
 
F
Q
 
S
D
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
T

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
31% identity, 38% coverage: 356:580/589 of query aligns to 21:235/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
A
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
I
 
V
S
 
S
F
 
L
Q
 
H
I
 
V
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
V
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
V
Q
 
D
G
 
G
G
 
Q
N
 
E
I
 
L
S
 
T
G
 
T
K
 
L
P
 
S
S
 
E
R
 
S
E
 
E
I
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
Q
M
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
K
 
N
M
 
L
I
 
L
P
 
S
D
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
P
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
E
A
 
L
N
 
D
R
 
N
T
 
T
E
 
P
E
 
K
K
 
D
Q
 
E
L
 
V
F
 
K
R
 
R
E
 
R
A
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
D
 
D
Y
 
K
L
 
H
H
 
D
E
 
S
Q
 
Y
A
 
P
G
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
M
 
G
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
M
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
S
D
 
N
P
 
P
T
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
D
H
 
P
Q
 
A
E
 
T
K
 
T
Q
 
R
A
 
S
L
 
I
A
 
L
G
 
E
V
 
L
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
I
K
 
N
S
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
K
Q
 
R
I
 
I
C
 
C
D
 
D
H
 
C
L
 
V
V
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
S
F
 
N
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
T
 
E
Q
 
Q
G
 
D
P
 
T
P
 
V
A
 
S
Q
 
E
I
 
V
Q
 
F
Q
 
S
D
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
T

Sites not aligning to the query:

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
27% identity, 41% coverage: 339:577/589 of query aligns to 2:231/501 of P04983

query
sites
P04983
E
 
E
L
 
A
V
 
L
L
 
L
D
 
Q
V
 
L
K
 
K
K
 
G
A
 
I
R
 
D
M
 
K
Q
 
A
F
 
F
G
 
P
G
 
G
L
 
V
V
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
S
D
 
G
I
 
A
S
 
A
F
 
L
Q
 
N
I
 
V
Q
 
Y
A
 
P
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
V
 
M
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
T
 
M
F
 
M
N
 
K
L
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
I
L
 
Y
R
 
T
A
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
T
V
 
L
V
 
L
F
 
W
Q
 
L
G
 
G
G
 
K
N
 
E
I
 
T
S
 
T
G
 
F
K
 
T
P
 
G
S
 
P
R
 
K
E
 
S
I
 
S
A
 
Q
R
 
E
L
 
A
G
 
G
M
 
I
A
 
G
R
 
I
T
 
I
F
 
H
Q
 
Q
H
 
E
V
 
L
K
 
N
M
 
L
I
 
I
P
 
P
D
 
Q
M
 
L
T
 
T
V
 
I
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
R
H
 
E
T
 
F
R
 
V
G
 
N
R
 
R
K
 
F
G
 
G
V
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
K
T
 
I
E
 
D
E
 
W
K
 
K
Q
 
T
L
 
M
F
 
Y
R
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
D
R
 
K
Q
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
I
 
L
G
 
N
M
 
L
G
 
R
D
 
F
Y
 
K
L
 
S
H
 
D
E
 
K
Q
 
L
A
 
V
G
 
G
N
 
D
L
 
L
A
 
S
M
 
I
G
 
G
P
 
D
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
M
M
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
L
C
 
S
A
 
F
D
 
E
P
 
S
T
 
K
L
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
D
G
 
A
L
 
L
R
 
T
H
 
D
Q
 
T
E
 
E
K
 
T
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
F
G
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
M
 
R
S
 
G
I
 
I
L
 
V
L
 
Y
V
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
D
 
K
L
 
E
V
 
I
M
 
F
Q
 
E
I
 
I
C
 
C
D
 
D
H
 
D
L
 
V
V
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
R
F
 
D
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
L
 
I
T
 
A
Q
 
E
G
 
R
P
 
E
P
 
V
A
 
A
Q
 
S
I
 
L
Q
 
T
Q
 
E
D
 
D

Query Sequence

>WP_068172852.1 NCBI__GCF_001592305.1:WP_068172852.1
MKNLQNMGLLVLAAAIPLIAVLPLPDFWITQLNYIGMYSMTVMGLVLLTGVGGLTSFGQA
AFVGIGAYTTAWLTLNLGVSPWLTLFIGMGLTAASALLVGLITLRMSGHYLPLATIAWGL
SLYYLMGNLDALGKYDGLLGLQSLSIAGFDIGQGRGFFVLTWAILLAFAAALLHLLDSRA
GRAIRSLKGGSQMAEAMGISTFRYKVTIFVLAALFASVAGWLLAHFQRTVNPSAFGLKMG
IEYLFMAVVGGVGHVWGAIVGAGLIRVLEDQLQVLLPRLIGTSGSYEVIVFGIALVVVLK
YLPDGLWSMVGKRVPRQPRVVDWAQAEALPERAKPTAGELVLDVKKARMQFGGLVAVNDI
SFQIQAGQIVGLIGPNGAGKSTTFNLITGVLRATRGEVVFQGGNISGKPSREIARLGMAR
TFQHVKMIPDMTVLENVALGAHTRGRKGVLTAMLRANRTEEKQLFREAQRQLERIGMGDY
LHEQAGNLAMGPQRLMEIARALCADPTLLLLDEPAAGLRHQEKQALAGVLRQLKSEGMSI
LLVEHDMDLVMQICDHLVVMEFGTLLTQGPPAQIQQDPKVRAAYLGTEH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory