SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068333577.1 NCBI__GCF_001650345.1:WP_068333577.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
46% identity, 80% coverage: 1:451/563 of query aligns to 3:452/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
M
 
M
M
 
L
L
 
R
D
 
D
K
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
A
 
E
A
 
V
R
 
R
E
 
N
L
 
Y
V
 
L
K
 
E
N
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
I
F
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
M
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
S
Q
 
E
V
 
I
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
E
H
 
S
I
 
M
A
 
A
A
 
N
E
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
E
H
 
E
A
 
A
E
 
G
P
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
N
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
T
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
A
T
 
N
Q
 
D
V
 
V
H
 
Y
E
 
N
H
 
S
I
 
I
R
 
K
D
 
D
M
 
V
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
R
D
 
R
D
 
D
S
 
E
A
 
E
N
 
N
K
 
R
V
 
V
M
 
W
D
 
E
V
 
I
G
 
A
V
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
T
 
A
A
 
G
L
 
I
V
 
I
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
I
 
V
F
 
I
Y
 
F
K
 
K
T
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
N
 
S
A
 
A
K
 
A
V
 
K
C
 
C
S
 
T
Q
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
I
V
 
M
K
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
G
I
 
L
V
 
I
D
 
S
G
 
C
V
 
I
T
 
T
L
 
Q
L
 
P
T
 
T
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
T
 
T
E
 
N
T
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
H
K
 
K
D
 
L
V
 
T
S
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
x
L
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
V
P
 
P
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
E
 
H
R
 
E
S
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
I
P
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
D
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
Q
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
Y
G
 
G
V
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
A
I
 
L
I
 
L
V
 
V
E
 
D
R
 
E
C
 
S
I
 
I
Y
 
K
D
 
E
Q
 
K
V
 
V
H
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
K
R
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
F
M
 
L
N
 
N
E
 
E
Q
 
E
E
 
E
S
 
K
E
 
Q
K
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
I
L
 
I
L
 
M
R
 
-
P
 
V
N
 
N
G
 
G
M
 
S
I
 
L
N
 
N
P
x
A
E
 
K
M
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
K
C
 
A
A
 
P
L
 
Q
T
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
I
S
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
S
H
 
D
T
 
V
T
 
K
V
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
A
P
 
E
Q
 
E
T
 
T
T
 
E
V
 
V
S
 
G
P
 
K
K
 
E
N
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
S
R
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
F
Y
 
Y
V
 
I
E
 
V
E
 
K
D
 
G
W
 
M
H
 
E
T
 
E
A
 
A
C
 
S
A
 
E
R
 
L
V
 
A
M
 
Q
E
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
E
N
 
V
E
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
V
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
A
Q
 
E
N
 
D
T
 
E
D
 
K
I
 
V
V
 
I
R
 
E
E
 
A
F
 
Y
A
 
T
L
 
I
E
 
D
K
 
K
P
 
P
V
 
A
F
 
G
R
 
R
M
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
G
A
 
T
A
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
T
S
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
K
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
N
G
 
N
S
 
I
S
 
T
S
 
S
D
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
T
P
 
V
M
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
F
N
 
N
V
 
I
R
 
K
K
 
R
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
M

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
46% identity, 80% coverage: 1:451/563 of query aligns to 2:451/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
M
 
M
M
 
L
L
 
R
D
 
D
K
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
A
 
E
A
 
V
R
 
R
E
 
N
L
 
Y
V
 
L
K
 
E
N
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
I
F
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
M
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
S
Q
 
E
V
 
I
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
E
H
 
S
I
 
M
A
 
A
A
 
N
E
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
E
H
 
E
A
 
A
E
 
G
P
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
N
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
T
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
A
T
 
N
Q
 
D
V
 
V
H
 
Y
E
 
N
H
 
S
I
 
I
R
 
K
D
 
D
M
 
V
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
R
D
 
R
D
 
D
S
 
E
A
 
E
N
 
N
K
 
R
V
 
V
M
 
W
D
 
E
V
 
I
G
 
A
V
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
T
 
A
A
 
G
L
 
I
V
 
I
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
I
 
V
F
 
I
Y
 
F
K
 
K
T
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
|
P
N
 
S
A
 
A
K
 
A
V
 
K
C
 
C
S
 
T
Q
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
I
V
 
M
K
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
G
I
 
L
V
 
I
D
 
S
G
 
C
V
 
I
T
 
T
L
 
Q
L
 
P
T
 
T
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
T
 
T
E
 
N
T
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
H
K
 
K
D
 
L
V
 
T
S
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
x
L
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
V
P
 
P
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
E
 
H
R
 
E
S
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
I
P
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
D
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
Q
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
Y
G
 
G
V
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
A
I
 
L
I
 
L
V
 
V
E
 
D
R
 
E
C
 
S
I
 
I
Y
 
K
D
 
E
Q
 
K
V
 
V
H
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
K
R
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
F
M
 
L
N
 
N
E
 
E
Q
 
E
E
 
E
S
 
K
E
 
Q
K
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
I
L
 
I
L
 
M
R
 
-
P
 
V
N
 
N
G
 
G
M
 
S
I
 
L
N
 
N
P
 
A
E
 
K
M
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
K
C
 
A
A
 
P
L
 
Q
T
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
I
S
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
S
H
 
D
T
 
V
T
 
K
V
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
A
P
 
E
Q
 
E
T
 
T
T
 
E
V
 
V
S
 
G
P
 
K
K
 
E
N
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
S
R
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
F
Y
 
Y
V
 
I
E
 
V
E
 
K
D
 
G
W
 
M
H
 
E
T
 
E
A
 
A
C
 
S
A
 
E
R
 
L
V
 
A
M
 
Q
E
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
E
N
 
V
E
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
V
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
A
Q
 
E
N
 
D
T
 
E
D
 
K
I
 
V
V
 
I
R
 
E
E
 
A
F
 
Y
A
 
T
L
 
I
E
 
D
K
 
K
P
 
P
V
 
A
F
 
G
R
 
R
M
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
G
A
 
T
A
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
T
S
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
K
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
N
G
 
N
S
 
I
S
 
T
S
 
S
D
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
T
P
 
V
M
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
F
N
 
N
V
 
I
R
 
K
K
 
R
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
M

7bvpA Adhe spirosome in extended conformation (see paper)
44% identity, 76% coverage: 16:444/563 of query aligns to 12:444/869 of 7bvpA

query
sites
7bvpA
L
 
L
V
 
V
K
 
E
N
 
R
A
 
V
K
 
K
N
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
S
L
 
F
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
A
 
R
H
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
I
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
L
 
H
F
 
F
A
 
A
S
 
S
T
 
E
Q
 
Y
V
 
I
H
 
Y
E
 
N
H
 
A
I
 
Y
R
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
L
A
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
D
A
 
T
N
 
F
K
 
G
V
 
T
M
 
I
D
 
T
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
C
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
|
P
S
x
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
I
 
A
F
 
I
Y
 
F
K
 
K
T
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
P
N
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
D
C
 
A
S
 
T
Q
 
N
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
D
I
 
L
V
 
I
D
 
G
G
 
W
V
 
I
T
 
D
L
 
Q
L
 
P
T
 
S
M
 
V
Q
 
E
A
 
L
T
 
S
E
 
N
T
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
H
S
 
H
K
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
G
M
|
M
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
x
V
G
|
G
P
x
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
N
 
D
V
 
I
P
 
K
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
M
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
|
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
V
R
 
D
C
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
A
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
E
 
R
L
 
F
I
 
A
R
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
N
 
Q
E
 
G
Q
 
K
E
 
E
S
 
L
E
 
K
K
 
A
L
 
V
A
 
Q
A
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
P
 
-
N
 
N
G
 
G
M
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
E
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
C
 
P
A
 
A
L
 
Y
T
 
K
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
E
H
 
N
T
 
T
T
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
G
P
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
V
S
 
D
P
 
E
K
 
S
N
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
|
E
K
 
K
L
|
L
C
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
H
 
E
T
 
D
A
 
A
C
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
A
M
 
E
E
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
M
E
 
G
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
S
V
 
C
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
Q
 
D
N
 
Q
T
 
D
D
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
I
 
R
V
 
V
R
 
S
E
 
Y
F
 
F
A
 
G
L
 
Q
E
 
K
K
 
M
P
 
K
V
 
T
F
 
A
R
 
R
M
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
S
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
L
 
L
T
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
|
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
K
R
 
K
K
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6tqmA Escherichia coli adhe structure in its compact conformation (see paper)
44% identity, 76% coverage: 16:444/563 of query aligns to 12:444/869 of 6tqmA

query
sites
6tqmA
L
 
L
V
 
V
K
 
E
N
 
R
A
 
V
K
 
K
N
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
S
L
 
F
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
A
 
R
H
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
I
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
L
 
H
F
 
F
A
 
A
S
 
S
T
 
E
Q
 
Y
V
 
I
H
 
Y
E
 
N
H
 
A
I
 
Y
R
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
L
A
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
D
A
 
T
N
 
F
K
 
G
V
 
T
M
 
I
D
 
T
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
C
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
I
 
A
F
 
I
Y
 
F
K
 
K
T
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
N
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
D
C
 
A
S
 
T
Q
 
N
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
D
I
 
L
V
 
I
D
 
G
G
 
W
V
 
I
T
 
D
L
 
Q
L
 
P
T
 
S
M
 
V
Q
 
E
A
 
L
T
 
S
E
 
N
T
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
H
S
 
H
K
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
N
 
D
V
 
I
P
 
K
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
M
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
V
R
 
D
C
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
A
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
E
 
R
L
 
F
I
 
A
R
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
N
 
Q
E
 
G
Q
 
K
E
 
E
S
 
L
E
 
K
K
 
A
L
 
V
A
 
Q
A
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
P
 
-
N
 
N
G
 
G
M
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
E
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
C
 
P
A
 
A
L
 
Y
T
 
K
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
E
H
 
N
T
 
T
T
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
G
P
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
V
S
 
D
P
 
E
K
 
S
N
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
H
 
E
T
 
D
A
 
A
C
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
A
M
 
E
E
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
M
E
 
G
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
S
V
 
C
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
Q
 
D
N
 
Q
T
 
D
D
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
I
 
R
V
 
V
R
 
S
E
 
Y
F
 
F
A
 
G
L
 
Q
E
 
K
K
 
M
P
 
K
V
 
T
F
 
A
R
 
R
M
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
S
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
L
 
L
T
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
K
R
 
K
K
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P0A9Q7 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
44% identity, 76% coverage: 16:444/563 of query aligns to 12:444/891 of P0A9Q7

query
sites
P0A9Q7
L
 
L
V
 
V
K
 
E
N
 
R
A
 
V
K
 
K
N
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
S
L
 
F
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
A
 
R
H
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
I
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
L
 
H
F
 
F
A
 
A
S
 
S
T
 
E
Q
 
Y
V
 
I
H
 
Y
E
 
N
H
 
A
I
 
Y
R
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
L
A
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
D
A
 
T
N
 
F
K
 
G
V
 
T
M
 
I
D
 
T
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
C
A
 
G
L
x
I
V
|
V
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
I
 
A
F
 
I
Y
 
F
K
 
K
T
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
N
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
D
C
 
A
S
 
T
Q
 
N
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
D
I
 
L
V
 
I
D
 
G
G
 
W
V
 
I
T
 
D
L
 
Q
L
 
P
T
 
S
M
 
V
Q
 
E
A
 
L
T
 
S
E
 
N
T
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
H
S
 
H
K
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
|
G
E
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
 
V
G
|
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
N
 
D
V
 
I
P
 
K
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
M
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
V
R
 
D
C
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
A
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
E
 
R
L
 
F
I
x
A
R
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
N
 
Q
E
 
G
Q
 
K
E
 
E
S
 
L
E
 
K
K
 
A
L
 
V
A
 
Q
A
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
P
 
-
N
 
N
G
 
G
M
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
E
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
C
 
P
A
 
A
L
 
Y
T
 
K
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
E
H
 
N
T
 
T
T
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
G
P
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
V
S
 
D
P
 
E
K
 
S
N
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
|
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
H
 
E
T
 
D
A
 
A
C
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
A
M
 
E
E
x
K
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
M
E
 
G
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
S
V
 
C
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
Q
 
D
N
 
Q
T
 
D
D
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
I
 
R
V
 
V
R
 
S
E
 
Y
F
 
F
A
 
G
L
 
Q
E
 
K
K
 
M
P
 
K
V
 
T
F
 
A
R
 
R
M
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
S
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
L
 
L
T
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
K
R
 
K
K
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P0A9Q8 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli O157:H7 (see paper)
44% identity, 76% coverage: 16:444/563 of query aligns to 12:444/891 of P0A9Q8

query
sites
P0A9Q8
L
 
L
V
 
V
K
 
E
N
 
R
A
 
V
K
 
K
N
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
S
L
 
F
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
A
 
R
H
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
I
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
L
 
H
F
 
F
A
 
A
S
 
S
T
 
E
Q
 
Y
V
 
I
H
 
Y
E
 
N
H
 
A
I
 
Y
R
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
L
A
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
D
A
 
T
N
 
F
K
 
G
V
 
T
M
 
I
D
 
T
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
C
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
I
 
A
F
 
I
Y
 
F
K
 
K
T
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
N
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
D
C
 
A
S
 
T
Q
 
N
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
D
I
 
L
V
 
I
D
 
G
G
 
W
V
 
I
T
 
D
L
 
Q
L
 
P
T
 
S
M
 
V
Q
 
E
A
 
L
T
 
S
E
 
N
T
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
H
S
 
H
K
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
N
 
D
V
 
I
P
 
K
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
M
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
V
R
 
D
C
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
A
V
 
V
H
 
R
Q
 
E
E
 
R
L
 
F
I
 
A
R
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
N
 
Q
E
 
G
Q
 
K
E
 
E
S
 
L
E
 
K
K
 
A
L
 
V
A
 
Q
A
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
P
 
-
N
 
N
G
 
G
M
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
E
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
C
 
P
A
 
A
L
 
Y
T
 
K
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
K
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
E
H
 
N
T
 
T
T
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
G
P
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
V
S
 
D
P
 
E
K
 
S
N
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
H
 
E
T
 
D
A
 
A
C
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
A
M
 
E
E
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
M
E
 
G
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
S
V
 
C
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
Q
 
D
N
 
Q
T
 
D
D
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
I
 
R
V
 
V
R
 
S
E
 
Y
F
 
F
A
 
G
L
 
Q
E
 
K
K
 
M
P
 
K
V
 
T
F
 
A
R
 
R
M
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
S
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
L
 
L
T
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
K
R
 
K
K
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8cekA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with NADPH (see paper)
37% identity, 77% coverage: 14:446/563 of query aligns to 4:434/449 of 8cekA

query
sites
8cekA
R
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
I
K
 
E
N
 
K
A
 
A
K
 
K
N
 
V
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
K
F
 
L
A
 
E
K
 
A
L
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
V
I
 
L
V
 
V
A
 
K
H
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
K
E
 
V
A
 
V
A
 
Y
R
 
D
H
 
N
A
 
A
E
 
E
P
 
M
L
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
H
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
F
 
M
G
 
G
R
 
V
W
 
Y
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
A
K
 
K
N
 
C
L
 
H
F
 
L
A
 
K
S
 
S
T
 
G
Q
 
A
V
 
I
H
 
W
E
 
N
H
 
H
I
 
I
R
 
K
D
 
D
M
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
K
D
 
E
D
 
E
S
 
P
A
 
E
N
 
R
K
 
A
V
 
L
M
 
V
D
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
K
P
 
P
L
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
T
P
|
P
S
x
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
S
 
V
T
 
T
I
 
P
F
 
M
Y
 
C
K
 
N
T
 
A
L
 
M
I
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
A
 
T
I
 
I
I
 
I
F
 
V
S
 
A
P
 
P
H
|
H
P
|
P
N
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
K
C
 
V
S
 
S
Q
 
A
Q
 
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
V
 
L
V
 
M
K
 
N
R
 
A
A
 
E
A
 
L
Q
 
K
E
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
N
I
 
I
V
 
I
D
 
Q
G
 
I
V
 
V
T
 
E
L
 
A
L
 
P
T
 
S
M
 
R
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
E
 
K
T
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
E
S
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
-
L
 
-
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
A
G
 
G
M
x
R
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
R
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
x
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
S
P
 
Q
A
 
V
F
 
I
I
 
V
E
 
D
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
N
 
D
V
 
Y
P
 
N
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
K
 
R
T
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
I
I
 
I
C
|
C
A
 
S
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
A
E
 
P
R
 
A
C
 
E
I
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
K
V
 
V
H
 
I
Q
 
A
E
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
E
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
L
 
Y
M
 
V
N
 
E
E
 
D
Q
 
E
E
 
E
S
 
T
-
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
S
L
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
K
P
 
-
N
 
D
G
 
G
M
 
K
I
 
I
N
 
N
P
 
S
E
 
K
M
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
K
C
 
S
A
 
V
L
 
Q
T
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
D
K
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
V
S
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
E
H
 
G
T
 
T
T
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
L
P
 
K
Q
 
G
T
 
K
T
 
G
V
 
A
S
 
G
P
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
V
Y
 
L
S
 
C
R
 
K
E
|
E
K
 
K
L
 
M
C
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
V
L
 
A
Y
 
L
V
 
K
E
 
Y
E
 
D
D
 
T
W
 
F
H
 
E
T
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
E
R
 
I
V
 
A
M
 
M
E
 
A
L
 
N
L
 
Y
T
 
M
N
 
Y
E
 
E
G
 
G
M
 
A
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
S
Q
 
D
N
 
N
T
 
D
D
 
E
I
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
Y
F
 
A
A
 
G
L
 
T
E
 
V
K
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
S
R
 
R
M
 
L
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
T
L
 
T
G
 
A
G
 
G
I
 
G
G
 
S
A
 
F
T
 
N
S
 
N
N
 
G
L
 
F
T
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
T
T
 
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
W
G
 
G
G
 
R
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
L
G
 
T
P
 
Y
M
 
E
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
R
 
S
K
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y

8cejC Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
37% identity, 77% coverage: 14:446/563 of query aligns to 4:434/449 of 8cejC

query
sites
8cejC
R
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
I
K
 
E
N
 
K
A
 
A
K
 
K
N
 
V
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
K
F
 
L
A
 
E
K
 
A
L
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
V
I
 
L
V
 
V
A
 
K
H
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
K
E
 
V
A
 
V
A
 
Y
R
 
D
H
 
N
A
 
A
E
 
E
P
 
M
L
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
H
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
F
 
M
G
 
G
R
 
V
W
 
Y
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
A
K
 
K
N
 
C
L
 
H
F
 
L
A
x
K
S
 
S
T
 
G
Q
 
A
V
 
I
H
 
W
E
 
N
H
 
H
I
 
I
R
 
K
D
 
D
M
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
K
D
 
E
D
 
E
S
 
P
A
 
E
N
 
R
K
 
A
V
 
L
M
 
V
D
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
K
P
 
P
L
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
T
P
|
P
S
 
I
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
V
S
 
V
T
 
T
I
 
P
F
 
M
Y
 
C
K
 
N
T
 
A
L
 
M
I
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
A
 
T
I
 
I
I
 
I
F
 
V
S
x
A
P
|
P
H
|
H
P
|
P
N
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
K
C
 
V
S
 
S
Q
 
A
Q
 
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
V
 
L
V
 
M
K
 
N
R
 
A
A
 
E
A
 
L
Q
 
K
E
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
N
I
 
I
V
 
I
D
 
Q
G
 
I
V
 
V
T
 
E
L
 
A
L
 
P
T
 
S
M
x
R
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
E
 
K
T
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
E
S
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
-
L
 
-
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
A
G
|
G
M
x
R
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
R
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
S
P
 
Q
A
 
V
F
 
I
I
 
V
E
 
D
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
N
 
D
V
 
Y
P
 
N
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
K
 
R
T
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
I
I
|
I
C
|
C
A
x
S
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
A
E
 
P
R
 
A
C
 
E
I
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
K
V
 
V
H
 
I
Q
 
A
E
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
E
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
L
 
Y
M
 
V
N
 
E
E
 
D
Q
 
E
E
 
E
S
 
T
-
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
S
L
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
K
P
 
-
N
 
D
G
 
G
M
 
K
I
 
I
N
 
N
P
 
S
E
 
K
M
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
K
C
 
S
A
 
V
L
 
Q
T
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
D
K
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
V
S
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
E
H
 
G
T
 
T
T
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
L
P
 
K
Q
 
G
T
 
K
T
 
G
V
 
A
S
 
G
P
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
V
Y
 
L
S
 
C
R
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
M
C
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
V
L
 
A
Y
 
L
V
 
K
E
 
Y
E
 
D
D
 
T
W
 
F
H
 
E
T
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
E
R
 
I
V
 
A
M
 
M
E
 
A
L
 
N
L
 
Y
T
 
M
N
 
Y
E
 
E
G
 
G
M
 
A
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
S
Q
 
D
N
 
N
T
 
D
D
 
E
I
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
Y
F
 
A
A
 
G
L
 
T
E
 
V
K
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
S
R
 
R
M
 
L
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
x
T
L
 
T
G
 
A
G
|
G
I
 
G
G
 
S
A
 
F
T
 
N
S
 
N
N
 
G
L
 
F
T
 
N
P
 
P
A
 
T
L
x
T
T
 
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
W
G
 
G
G
 
R
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
L
G
 
T
P
 
Y
M
 
E
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
R
 
S
K
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y

8cejA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
37% identity, 77% coverage: 14:446/563 of query aligns to 4:434/449 of 8cejA

query
sites
8cejA
R
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
I
K
 
E
N
 
K
A
 
A
K
 
K
N
 
V
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
K
F
 
L
A
 
E
K
 
A
L
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
V
I
 
L
V
 
V
A
 
K
H
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
K
E
 
V
A
 
V
A
 
Y
R
 
D
H
 
N
A
 
A
E
 
E
P
 
M
L
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
H
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
F
 
M
G
 
G
R
 
V
W
 
Y
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
A
K
 
K
N
 
C
L
 
H
F
 
L
A
x
K
S
 
S
T
 
G
Q
 
A
V
 
I
H
 
W
E
 
N
H
 
H
I
 
I
R
 
K
D
 
D
M
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
K
D
 
E
D
 
E
S
 
P
A
 
E
N
 
R
K
 
A
V
 
L
M
 
V
D
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
K
P
 
P
L
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
T
P
 
P
S
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
S
 
V
T
 
T
I
 
P
F
 
M
Y
 
C
K
 
N
T
 
A
L
 
M
I
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
A
 
T
I
 
I
I
 
I
F
 
V
S
 
A
P
 
P
H
 
H
P
 
P
N
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
K
C
 
V
S
 
S
Q
 
A
Q
 
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
V
 
L
V
 
M
K
 
N
R
 
A
A
 
E
A
 
L
Q
 
K
E
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
N
I
 
I
V
 
I
D
 
Q
G
 
I
V
 
V
T
 
E
L
 
A
L
 
P
T
 
S
M
 
R
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
E
 
K
T
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
E
S
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
-
L
 
-
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
A
G
 
G
M
 
R
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
R
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
S
P
 
Q
A
 
V
F
 
I
I
 
V
E
 
D
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
N
 
D
V
 
Y
P
 
N
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
K
 
R
T
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
I
I
 
I
C
|
C
A
x
S
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
A
E
 
P
R
 
A
C
 
E
I
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
K
V
 
V
H
 
I
Q
 
A
E
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
E
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
L
 
Y
M
 
V
N
 
E
E
 
D
Q
 
E
E
 
E
S
 
T
-
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
S
L
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
K
P
 
-
N
 
D
G
 
G
M
 
K
I
 
I
N
 
N
P
 
S
E
 
K
M
 
I
V
 
I
G
 
G
Q
 
K
C
 
S
A
 
V
L
 
Q
T
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
D
K
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
V
S
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
E
H
 
G
T
 
T
T
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
L
P
 
K
Q
 
G
T
 
K
T
 
G
V
 
A
S
 
G
P
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
V
Y
 
L
S
 
C
R
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
M
C
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
V
L
 
A
Y
 
L
V
 
K
E
 
Y
E
 
D
D
 
T
W
 
F
H
 
E
T
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
E
R
 
I
V
 
A
M
 
M
E
 
A
L
 
N
L
 
Y
T
 
M
N
 
Y
E
 
E
G
 
G
M
 
A
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
S
Q
 
D
N
 
N
T
 
D
D
 
E
I
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
Y
F
 
A
A
 
G
L
 
T
E
 
V
K
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
S
R
 
R
M
 
L
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
T
L
 
T
G
 
A
G
|
G
I
 
G
G
 
S
A
 
F
T
 
N
S
 
N
N
 
G
L
 
F
T
 
N
P
 
P
A
 
T
L
x
T
T
 
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
L
 
W
G
 
G
G
 
R
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
L
G
 
T
P
 
Y
M
 
E
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
R
 
S
K
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y

4c3sA Structure of a propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
31% identity, 72% coverage: 2:405/563 of query aligns to 4:395/435 of 4c3sA

query
sites
4c3sA
M
 
V
L
 
F
D
 
D
K
 
D
D
 
M
L
 
N
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
-
V
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
A
Q
 
Q
R
 
L
Q
 
V
F
 
V
A
 
K
K
 
K
L
 
M
S
 
S
Q
 
M
Q
 
D
Q
 
Q
V
 
R
D
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
I
A
 
S
H
 
A
I
 
I
A
 
R
A
 
K
E
 
K
A
 
T
A
 
I
R
 
E
H
 
H
A
 
A
E
 
E
P
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
N
W
 
V
Q
 
G
D
 
H
K
 
K
V
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
L
 
Q
F
 
L
A
 
V
S
 
A
T
 
E
Q
 
K
V
 
T
H
 
-
E
 
P
H
 
G
I
 
T
R
 
E
D
 
D
M
 
I
K
 
T
T
 
T
V
 
T
G
 
A
I
 
W
I
 
-
A
 
S
D
 
G
D
 
D
S
 
R
A
 
G
N
 
L
K
 
T
V
 
L
M
 
V
D
 
E
V
 
M
G
 
G
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
T
 
G
A
 
A
L
x
I
V
x
T
P
|
P
S
x
C
T
|
T
N
 
N
P
 
P
T
 
S
S
 
E
T
 
T
I
 
I
F
 
I
Y
 
C
K
 
N
T
 
T
L
 
I
I
 
G
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
F
S
 
N
P
 
P
H
|
H
P
 
P
N
 
A
A
 
A
K
 
I
V
 
K
C
 
T
S
 
S
Q
 
N
Q
 
F
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
V
 
L
V
 
I
K
 
N
R
 
E
A
 
A
A
 
S
Q
 
L
E
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
G
P
 
P
A
 
V
G
 
N
I
 
I
V
 
A
D
 
C
G
 
S
V
 
V
T
 
R
L
 
K
L
 
P
T
 
T
M
x
L
Q
 
D
A
 
S
T
 
S
E
 
K
T
 
I
L
 
M
M
 
M
K
 
S
S
 
H
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
A
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
G
M
x
V
V
 
V
R
 
T
A
 
A
A
 
V
Y
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
R
T
 
G
I
 
I
S
 
G
G
x
A
G
|
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
V
F
 
L
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
N
 
D
V
 
I
P
 
R
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
N
S
 
G
K
 
C
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
N
V
 
L
I
 
P
C
|
C
A
 
I
S
 
A
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
I
 
V
I
 
V
V
 
A
E
 
I
R
 
D
C
 
A
I
 
I
Y
 
A
D
 
N
Q
 
E
V
 
L
H
 
M
Q
 
N
E
 
Y
L
 
M
I
 
V
R
 
K
-
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
Y
 
Y
L
 
A
M
 
I
N
 
T
E
 
K
Q
 
E
E
 
Q
S
 
Q
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
T
A
 
N
L
 
L
L
 
V
L
 
I
R
 
T
P
 
P
N
 
K
G
 
G
M
 
L
I
 
-
N
 
N
P
 
R
E
 
N
M
 
C
V
 
V
G
 
G
Q
 
K
C
 
D
A
 
A
L
 
R
T
 
T
V
 
L
A
 
L
Q
 
G
K
 
M
A
 
I
G
 
G
F
 
I
S
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
S
H
 
N
T
 
I
T
 
R
V
 
C
L
 
I
V
 
I
S
 
F
P
 
E
Q
 
G
T
 
E
T
 
K
V
 
E
S
 
H
P
 
P
K
 
L
N
 
-
P
 
-
Y
 
I
S
 
S
R
 
E
E
|
E
K
 
L
L
x
M
C
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
V
 
R
E
 
A
E
 
K
D
 
S
W
 
F
H
 
D
T
 
D
A
 
A
C
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
A
M
 
V
E
 
W
L
 
L
L
 
-
T
 
-
N
 
E
E
 
H
G
 
G
M
 
N
G
 
R
H
|
H
T
 
S
L
 
A
V
 
H
I
 
I
H
 
H
T
 
S
Q
 
K
N
 
N
T
 
V
D
 
D
I
 
R
V
 
I
R
 
T
E
 
T
F
 
Y
A
 
A
L
 
K
E
 
A
K
 
I
P
 
D
V
 
T
F
 
A
R
 
I
M
 
L
L
 
V
V
 
K
N
 
N
T
 
A
P
 
P
-
 
S
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5dbvA Structure of a c269a mutant of propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
31% identity, 72% coverage: 2:405/563 of query aligns to 3:391/431 of 5dbvA

query
sites
5dbvA
M
 
V
L
 
F
D
 
D
K
 
D
D
 
M
L
 
N
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
-
V
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
A
Q
 
Q
R
 
L
Q
 
V
F
 
V
A
 
K
K
 
K
L
 
M
S
 
S
Q
 
M
Q
 
D
Q
 
Q
V
 
R
D
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
I
A
 
S
H
 
A
I
 
I
A
 
R
A
 
K
E
 
K
A
 
T
A
 
I
R
 
E
H
 
H
A
 
A
E
 
E
P
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
R
 
N
W
 
V
Q
 
G
D
 
H
K
 
K
V
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
L
 
Q
F
 
L
A
 
V
S
 
A
T
 
E
Q
 
K
V
 
T
H
 
-
E
 
P
H
 
G
I
 
T
R
 
E
D
 
D
M
 
I
K
 
T
T
 
T
V
 
T
G
 
A
I
 
W
I
 
-
A
 
S
D
 
G
D
 
D
S
 
R
A
 
G
N
 
L
K
 
T
V
 
L
M
 
V
D
 
E
V
 
M
G
 
G
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
T
 
G
A
 
A
L
x
I
V
 
T
P
 
P
S
x
C
T
|
T
N
 
N
P
 
P
T
 
S
S
 
E
T
 
T
I
 
I
F
 
I
Y
 
C
K
 
N
T
 
T
L
 
I
I
 
G
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
F
S
x
N
P
|
P
H
|
H
P
 
P
N
 
A
A
 
A
K
 
I
V
 
K
C
 
T
S
 
S
Q
 
N
Q
 
F
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
V
 
L
V
 
I
K
 
N
R
 
E
A
 
A
A
 
S
Q
 
L
E
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
G
P
 
P
A
 
V
G
 
N
I
 
I
V
 
A
D
 
C
G
 
S
V
 
V
T
 
R
L
 
K
L
 
P
T
 
T
M
 
L
Q
 
D
A
 
S
T
 
S
E
 
K
T
 
I
L
 
M
M
 
M
K
 
S
S
 
H
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
A
A
 
A
T
 
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
G
M
x
V
V
 
V
R
 
T
A
 
A
A
 
V
Y
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
R
T
 
G
I
 
I
S
 
G
G
 
A
G
|
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
V
F
 
L
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
N
 
D
V
 
I
P
 
R
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
N
S
 
G
K
 
C
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
N
V<