SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068747340.1 NCBI__GCF_001601575.1:WP_068747340.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

3abiA Crystal structure of l-lysine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon pyrococcus horikoshii (see paper)
29% identity, 96% coverage: 7:385/393 of query aligns to 6:347/349 of 3abiA

query
sites
3abiA
V
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
N
Q
x
I
G
 
G
T
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
A
Y
 
W
D
 
D
M
 
L
A
 
K
K
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
E
D
 
F
A
 
D
V
 
V
L
 
Y
I
 
I
A
 
G
D
|
D
I
x
V
S
 
N
W
 
N
E
 
E
N
 
N
A
 
L
V
 
E
K
 
K
S
 
V
C
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
K
K
 
E
I
 
F
A
 
A
Q
 
T
P
 
P
F
 
L
K
 
K
L
x
V
D
|
D
V
 
A
T
 
S
D
 
N
R
 
F
N
 
D
S
 
K
L
 
L
L
 
V
N
 
E
F
 
V
L
 
M
N
 
K
E
 
E
V
 
F
D
 
E
S
 
L
F
 
V
L
 
I
S
 
G
A
|
A
V
x
L
P
|
P
Y
 
G
W
 
F
Y
x
L
N
 
G
L
 
F
K
 
K
I
 
S
T
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
K
A
 
S
K
 
K
A
 
V
N
 
D
M
 
M
C
 
V
D
 
D
L
x
V
G
 
-
G
 
-
N
 
-
T
x
S
D
x
F
L
 
M
V
 
P
K
 
E
E
 
N
Q
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
D
 
R
E
 
D
K
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
A
 
T
V
 
I
I
 
V
P
 
F
D
 
D
C
 
A
G
 
G
Q
x
F
V
x
A
P
|
P
G
 
G
M
 
L
G
 
S
T
 
N
S
 
I
L
 
L
A
 
M
V
 
G
Y
 
R
A
 
I
M
 
F
S
 
Q
L
 
E
L
 
L
D
 
D
K
 
L
P
 
-
E
 
K
E
 
E
V
 
G
Y
 
Y
M
 
I
W
 
Y
D
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
L
P
 
P
Q
 
K
N
 
D
P
 
P
I
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
L
N
 
Y
Y
 
Y
I
 
K
L
 
I
T
 
T
F
x
W
N
x
S
I
 
P
A
 
R
G
x
D
L
 
L
T
 
I
N
 
E
E
|
E
Y
 
Y
Y
 
T
G
 
R
T
 
P
A
 
A
K
 
R
F
 
V
L
 
I
K
 
R
D
 
N
Y
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
S
E
 
K
V
 
V
P
 
D
T
 
P
F
 
L
R
 
S
E
 
E
-
 
V
E
 
K
D
 
K
Y
 
V
E
 
K
L
 
I
V
 
G
S
 
K
F
 
F
P
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
E
L
 
F
E
 
E
A
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
L
T
 
R
S
 
S
T
 
M
A
 
L
P
 
E
W
 
T
T
 
I
F
 
N
E
 
S
G
 
E
K
 
R
I
 
L
K
 
E
T
 
E
F
 
W
I
 
-
N
 
-
K
 
-
T
|
T
L
 
L
R
|
R
H
 
W
K
 
P
G
 
G
H
 
H
F
 
L
T
 
E
Q
 
K
W
 
I
K
 
K
T
 
V
L
 
L
M
 
R
D
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
F
E
 
K
E
 
P
E
 
E
P
 
N
I
 
L
E
 
D
I
 
F
R
 
T
G
 
-
V
 
L
R
 
R
I
 
V
S
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
L
L
 
M
K
 
R
A
 
Y
G
 
E
E
 
T
K
 
K
D
 
D
K
 
F
D
 
S
I
 
I
V
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
V
G
 
-
E
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
G
K
 
K
K
 
G
A
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
E
V
 
M
E
 
E
V
 
F
I
 
F
D
 
L
Y
 
Y
Y
 
D
D
 
E
E
 
E
E
 
D
T
 
S
G
 
M
F
 
F
T
 
S
A
 
S
M
|
M
S
 
S
R
 
R
T
 
V
T
|
T
G
 
G
W
 
F
D
 
T
G
 
A
S
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
S
I
 
R
M
 
I
N
 
V
A
 
A
K
 
E
G
 
N
I
 
T
T
 
C
K
 
T
R
 
F
G
 
G
V
 
V
N
 
I
P
 
P
V
 
P
E
 
E
I
 
I
-
 
L
G
 
G
V
 
M
P
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
T
F
 
F
-
 
R
-
 
R
-
 
I
V
 
I
E
 
D
E
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
S
V
 
I

8debA Bacteroides fragilis carboxyspermidine dehydrogenase (see paper)
27% identity, 97% coverage: 1:383/393 of query aligns to 1:385/397 of 8debA

query
sites
8debA
M
 
M
G
 
G
Y
 
R
V
 
V
Y
 
-
A
 
L
V
 
I
L
 
I
G
 
G
G
x
A
G
|
G
R
x
G
Q
x
V
G
 
G
T
 
T
A
 
V
A
 
V
A
 
A
Y
 
H
D
 
K
M
 
V
A
 
A
K
 
Q
F
 
N
G
 
A
D
 
D
A
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
V
I
 
F
A
 
T
D
 
D
I
 
I
S
 
M
W
 
I
E
 
A
N
x
S
A
x
R
V
x
T
K
 
K
S
 
S
-
x
K
C
 
C
D
 
D
R
 
D
V
 
I
N
 
V
A
 
K
L
 
A
L
 
I
N
 
G
K
 
N
K
 
P
I
 
N
A
 
I
Q
 
K
P
 
T
F
 
A
K
 
Q
L
 
V
D
|
D
V
x
A
T
x
D
D
 
N
R
 
V
N
 
D
S
 
E
L
 
L
L
 
V
N
 
A
F
 
L
L
 
F
N
 
N
E
 
D
V
 
F
D
 
K
S
 
P
F
 
E
L
 
M
S
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
V
A
|
A
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
-
Y
x
Q
N
 
D
L
 
L
K
 
T
I
 
I
T
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
V
N
 
N
M
 
Y
C
 
L
D
 
D
L
x
T
G
 
A
G
 
-
N
 
N
T
 
Y
D
 
E
L
 
P
V
 
K
K
 
D
E
 
E
-
 
A
-
 
H
-
 
F
-
 
E
-
 
Y
-
 
S
-
 
W
Q
 
Q
L
 
W
K
 
A
L
 
Y
D
 
H
E
 
E
K
 
R
A
 
F
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
T
V
 
A
I
 
I
P
 
L
D
 
G
C
 
C
G
 
G
Q
 
F
V
x
D
P
|
P
G
 
G
M
 
V
-
 
S
G
 
G
T
 
I
S
 
Y
L
 
T
A
 
A
V
 
Y
Y
 
A
A
 
A
M
 
K
S
 
H
L
 
Y
L
 
F
D
 
D
K
 
E
P
 
I
E
 
Q
E
 
Y
V
 
L
Y
 
D
M
 
I
W
 
V
D
 
D
G
 
C
G
 
N
I
 
-
P
 
A
Q
 
G
N
 
N
P
 
H
I
 
H
P
 
K
P
 
A
F
 
F
-
 
A
-
 
T
N
 
N
Y
x
F
I
x
N
L
 
P
T
 
E
F
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
R
G
 
E
L
 
I
T
 
T
N
 
Q
-
 
N
-
 
G
E
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
E
T
 
N
A
 
G
K
 
Q
F
 
W
-
 
V
-
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
P
L
 
L
K
 
E
D
 
I
Y
 
H
K
 
K
V
 
D
V
 
L
E
 
T
V
 
Y
P
 
P
T
 
N
F
 
I
R
 
G
E
 
P
E
 
R
D
 
D
Y
 
S
E
 
Y
L
 
L
V
 
L
S
 
Y
F
 
H
P
 
E
E
 
E
P
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
S
F
 
L
V
 
V
T
 
K
S
 
N
G
 
F
G
 
P
T
 
T
-
 
I
-
 
K
S
 
R
T
 
A
A
 
R
P
 
F
W
 
W
T
 
M
F
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
T
 
T
F
 
F
I
 
G
N
 
Q
K
 
E
T
 
Y
L
 
L
R
 
T
H
 
H
K
 
-
G
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
Q
 
-
W
 
L
K
 
R
T
 
V
L
 
I
M
 
Q
D
 
N
F
 
I
G
 
G
F
 
M
L
 
A
E
 
R
E
 
I
E
 
D
P
 
E
I
 
I
E
 
D
I
 
Y
R
 
N
G
 
G
V
 
Q
R
 
K
I
 
I
S
 
V
P
 
P
R
 
L
E
 
Q
V
 
F
L
 
L
H
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
L
E
 
P
P
 
N
K
 
P
L
 
Q
K
 
D
A
 
L
G
 
G
E
 
E
K
 
N
D
 
Y
K
 
E
D
 
G
I
 
E
V
 
T
I
 
S
V
 
I
R
 
G
V
 
C
K
 
R
V
 
I
L
 
R
G
 
G
E
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
E
A
 
R
E
 
T
A
 
Y
L
 
Y
V
 
V
E
 
Y
V
 
N
I
 
N
D
 
C
Y
 
S
Y
 
H
D
 
E
E
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
K
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
T
 
Q
A
 
G
M
 
V
S
 
S
R
 
Y
T
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
V
D
 
P
G
 
A
S
 
M
I
 
I
V
 
G
A
 
A
I
 
M
M
 
M
N
 
F
A
 
F
K
 
K
G
 
G
I
 
E
T
 
W
K
 
K
R
 
R
-
 
P
G
 
G
V
 
V
N
 
N
P
 
N
V
 
V
E
 
E
I
 
E
G
 
F
V
 
N
P
 
P
A
 
-
D
 
D
V
 
P
F
 
F
V
 
M
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
K
 
N
K
 
K
R
 
Q
G
 
G
I
 
L

5o1oA Crystal structure of human aminoadipate semialdehyde synthase, saccharopine dehydrogenase domain with proline bound.
24% identity, 79% coverage: 45:356/393 of query aligns to 35:402/439 of 5o1oA

query
sites
5o1oA
D
 
N
R
 
Q
V
 
I
N
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
G
N
 
K
K
 
K
K
 
Y
I
 
N
A
 
I
Q
 
N
P
 
P
F
 
V
K
 
S
L
 
M
D
 
D
V
 
I
T
 
C
D
 
K
R
 
Q
N
 
E
S
 
E
L
 
K
L
 
L
N
 
G
F
 
F
L
 
L
-
 
V
N
 
A
E
 
K
V
 
Q
D
 
D
S
 
L
F
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
L
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
V
Y
 
L
N
 
H
L
 
P
K
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
C
I
 
I
E
 
T
A
 
N
K
 
K
A
 
V
N
 
N
M
 
M
C
 
V
D
 
T
L
 
A
G
 
S
G
 
Y
N
 
I
T
 
T
D
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
K
K
 
S
A
 
V
R
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
I
I
 
I
P
 
G
D
 
E
C
 
L
G
 
G
Q
 
L
V
x
D
P
 
P
G
 
G
M
 
L
G
 
D
T
 
H
S
 
M
L
 
L
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
A
M
 
M
S
 
E
L
 
S
L
 
I
D
 
D
K
 
K
P
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
I
-
 
E
-
 
S
Y
 
Y
M
 
I
-
 
S
W
 
Y
D
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
L
-
 
P
-
 
A
P
 
P
Q
 
E
N
 
H
P
 
S
I
 
N
P
 
N
P
 
P
F
 
L
N
 
R
Y
 
Y
I
 
K
L
 
F
T
 
S
F
 
W
N
 
S
I
 
P
A
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
L
N
 
M
E
 
N
Y
 
V
Y
 
M
G
 
Q
T
 
S
A
 
A
K
 
T
F
 
Y
L
 
L
K
 
L
D
 
D
Y
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
N
V
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
I
T
 
S
F
 
F
R
 
L
E
 
D
E
 
A
D
 
V
Y
 
T
E
 
S
L
 
M
V
 
D
S
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
G
P
 
L
I
 
-
G
 
-
E
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
G
F
 
Y
V
 
P
T
 
N
S
 
R
G
 
D
G
 
S
T
 
T
S
 
K
T
 
Y
A
 
A
P
 
E
W
 
I
T
 
Y
F
 
G
E
 
I
G
 
S
K
 
S
I
 
A
K
 
H
T
 
T
F
 
L
I
 
L
N
 
R
K
 
G
T
 
T
L
 
L
R
|
R
H
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
F
 
M
T
 
K
Q
 
A
W
 
L
K
 
N
T
 
G
L
 
F
M
 
V
D
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
L
L
 
I
E
 
N
E
 
R
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
N
P
 
P
I
 
L
E
 
T
I
 
W
R
 
K
G
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
C
-
 
D
-
 
L
V
 
V
R
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
R
 
E
E
 
S
V
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
K
P
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
M
K
 
K
L
 
L
K
 
S
A
 
Y
G
 
G
E
 
P
K
 
E
D
 
E
K
 
K
D
 
D
I
 
M
V
 
I
I
 
V
V
 
M
R
 
R
V
 
D
K
 
S
V
 
F
-
 
G
L
 
I
G
 
R
E
 
H
K
 
P
D
 
S
G
 
G
K
 
H
K
 
L
A
 
E
E
 
H
A
 
K
L
 
T
V
 
I
E
 
D
V
 
L
I
 
V
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
G
D
 
D
E
 
-
E
 
I
T
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
A
R
 
K
T
 
T
T
 
V
G
 
G
W
 
L
D
 
P
G
 
T
S
 
A
I
 
M
V
 
A
A
 
A
I
 
K
M
 
M
N
 
L
A
 
L
K
 
D
G
 
G

5l78A Crystal structure of human aminoadipate semialdehyde synthase, saccharopine dehydrogenase domain (in NAD+ bound form)
23% identity, 79% coverage: 45:356/393 of query aligns to 35:400/436 of 5l78A

query
sites
5l78A
D
 
N
R
x
Q
V
 
I
N
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
G
N
 
K
K
 
K
K
 
Y
I
 
N
A
 
I
Q
 
N
P
 
P
F
 
V
K
 
S
L
 
M
D
 
D
V
x
I
T
 
C
D
 
K
R
 
Q
N
 
E
S
 
E
L
 
K
L
 
L
N
 
G
F
 
F
L
 
L
-
 
V
N
 
A
E
 
K
V
 
Q
D
 
D
S
 
L
F
 
V
L
 
I
S
 
S
A
x
L
V
x
L
P
|
P
Y
 
Y
W
 
V
Y
x
L
N
 
H
L
 
P
K
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
C
I
 
I
E
 
T
A
 
N
K
 
K
A
 
V
N
 
N
M
 
M
C
 
V
D
 
T
L
x
A
G
x
S
G
 
Y
N
 
I
T
 
T
D
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
K
K
 
S
A
 
V
R
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
I
I
 
I
P
 
G
D
 
E
C
 
L
G
 
G
Q
x
L
V
x
D
P
|
P
G
 
G
M
 
L
G
 
D
T
 
H
S
 
M
L
 
L
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
A
M
 
M
S
 
E
L
 
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
P
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
I
-
 
E
-
 
S
Y
 
Y
M
 
I
-
 
S
W
 
Y
D
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
L
-
 
P
-
 
A
P
 
P
Q
 
E
N
 
H
P
 
S
I
 
N
P
 
N
P
 
P
F
 
L
N
 
R
Y
 
Y
I
 
K
L
 
F
T
 
S
F
x
W
N
 
S
I
 
P
A
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
L
N
 
M
E
 
N
Y
 
V
Y
 
M
G
 
Q
T
 
S
A
 
A
K
 
T
F
 
Y
L
 
L
K
 
L
D
 
D
Y
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
N
V
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
I
T
 
S
F
 
F
R
 
L
E
 
D
E
 
A
D
 
V
Y
 
T
E
 
S
L
 
M
V
 
D
S
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
G
P
 
L
I
 
-
G
 
-
E
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
G
F
 
Y
V
 
P
T
 
N
S
 
R
G
 
D
G
 
S
T
 
T
S
 
K
T
 
Y
A
 
A
P
 
E
W
 
I
T
 
Y
F
 
G
E
 
I
G
 
S
K
 
S
I
 
A
K
 
H
T
 
T
F
 
L
I
 
L
N
 
R
K
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
F
 
M
T
 
K
Q
 
A
W
 
L
K
 
N
T
 
G
L
 
F
M
 
V
D
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
L
L
 
I
E
 
N
E
 
R
E
 
E
P
 
A
I
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
W
-
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
C
E
 
D
I
 
L
R
 
V
G
 
G
V
 
S
R
 
P
I
 
S
S
 
S
P
 
E
R
 
H
E
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
L
-
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
K
P
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
M
K
 
K
L
 
L
K
 
S
A
 
Y
G
 
G
E
 
P
K
 
E
D
 
E
K
 
K
D
 
D
I
 
M
V
 
I
I
 
V
V
 
M
R
 
R
V
 
D
K
 
S
V
 
F
-
 
G
L
 
I
G
 
R
E
 
H
K
 
P
D
 
S
G
 
G
K
 
H
K
 
L
A
 
E
E
 
H
A
 
K
L
 
T
V
 
I
E
 
D
V
 
L
I
 
V
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
G
D
 
D
E
 
-
E
 
I
T
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
S
A
 
A
M
 
M
S
 
A
R
 
K
T
 
T
T
x
V
G
 
G
W
 
L
D
 
P
G
 
T
S
 
A
I
 
M
V
 
A
A
 
A
I
 
K
M
 
M
N
 
L
A
 
L
K
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5o1nA Crystal structure of human aminoadipate semialdehyde synthase, saccharopine dehydrogenase domain with n-[(2s)-2-pyrrolidinylmethyl]- trifluoromethanesulfonamide bound
23% identity, 79% coverage: 45:356/393 of query aligns to 35:404/442 of 5o1nA

query
sites
5o1nA
D
 
N
R
 
Q
V
 
I
N
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
G
N
 
K
K
 
K
K
 
Y
I
 
N
A
 
I
Q
 
N
P
 
P
F
 
V
K
 
S
L
 
M
D
 
D
V
 
I
T
 
C
D
 
K
R
 
Q
N
 
E
S
 
E
L
 
K
L
 
L
N
 
G
F
 
F
L
 
L
-
 
V
N
 
A
E
 
K
V
 
Q
D
 
D
S
 
L
F
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
L
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
V
Y
 
L
N
 
H
L
 
P
K
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
C
I
 
I
E
 
T
A
 
N
K
 
K
A
 
V
N
 
N
M
 
M
C
 
V
D
 
T
L
 
A
G
 
S
G
 
Y
N
 
I
T
 
T
D
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
K
K
 
S
A
 
V
R
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
I
I
 
I
P
 
G
D
 
E
C
 
L
G
 
G
Q
 
L
V
x
D
P
 
P
G
 
G
M
 
L
G
 
D
T
 
H
S
 
M
L
 
L
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
A
M
 
M
S
 
E
L
 
S
L
 
I
D
 
D
K
 
K
P
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
I
-
 
E
-
 
S
Y
 
Y
M
 
I
-
 
S
W
 
Y
D
 
C
G
 
G
G
|
G
I
 
L
-
 
P
-
 
A
P
 
P
Q
 
E
N
 
H
P
 
S
I
 
N
P
 
N
P
 
P
F
 
L
N
 
R
Y
 
Y
I
 
K
L
 
F
T
 
S
F
 
W
N
 
S
I
 
P
A
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
L
N
 
M
E
 
N
Y
 
V
Y
 
M
G
 
Q
T
 
S
A
 
A
K
 
T
F
 
Y
L
 
L
K
 
L
D
 
D
Y
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
N
V
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
I
T
 
S
F
 
F
R
 
L
E
 
D
E
 
A
D
 
V
Y
 
T
E
 
S
L
 
M
V
 
D
S
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
G
P
 
L
I
 
-
G
 
-
E
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
G
F
 
Y
V
 
P
T
 
N
S
 
R
G
 
D
G
 
S
T
 
T
S
 
K
T
 
Y
A
 
A
P
 
E
W
 
I
T
 
Y
F
 
G
E
 
I
G
 
S
K
 
S
I
 
A
K
 
H
T
 
T
F
 
L
I
 
L
N
 
R
K
 
G
T
|
T
L
 
L
R
|
R
H
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
F
 
M
T
 
K
Q
 
A
W
 
L
K
 
N
T
 
G
L
 
F
M
 
V
D
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
L
L
 
I
E
 
N
E
 
R
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
N
P
 
P
I
 
L
E
 
T
I
 
W
R
 
K
G
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
C
-
 
D
-
 
L
V
 
V
R
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
R
 
E
E
 
S
V
 
I
L
 
L
H
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
K
P
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
M
K
 
K
L
 
L
K
 
S
A
 
Y
G
 
G
E
 
P
K
 
E
D
 
E
K
 
K
D
 
D
I
 
M
V
 
I
I
 
V
V
 
M
R
 
R
V
 
D
K
 
S
V
 
F
-
 
G
L
 
I
G
 
R
E
 
H
K
 
P
D
 
S
G
 
G
K
 
H
K
 
L
A
 
E
E
 
H
A
 
K
L
 
T
V
 
I
E
 
D
V
 
L
I
 
V
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
G
D
 
D
E
 
-
E
 
I
T
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
S
A
 
A
M
|
M
S
 
A
R
 
K
T
 
T
T
 
V
G
 
G
W
 
L
D
 
P
G
 
T
S
 
A
I
 
M
V
 
A
A
 
A
I
 
K
M
 
M
N
 
L
A
 
L
K
 
D
G
 
G

Q9UDR5 Alpha-aminoadipic semialdehyde synthase, mitochondrial; LKR/SDH; EC 1.5.1.8; EC 1.5.1.9 from Homo sapiens (Human)
26% identity, 58% coverage: 45:273/393 of query aligns to 515:748/926 of Q9UDR5

query
sites
Q9UDR5
D
 
N
R
x
Q
V
 
I
N
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
G
N
 
K
K
 
K
K
 
Y
I
 
N
A
 
I
Q
 
N
P
 
P
F
 
V
K
 
S
L
 
M
D
 
D
V
x
I
T
 
C
D
 
K
R
 
Q
N
 
E
S
 
E
L
 
K
L
 
L
N
 
G
F
 
F
L
 
L
-
 
V
N
 
A
E
 
K
V
 
Q
D
 
D
S
 
L
F
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
L
V
x
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
V
Y
 
L
N
 
H
L
 
P
K
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
C
I
 
I
E
 
T
A
 
N
K
 
K
A
 
V
N
 
N
M
 
M
C
 
V
D
 
T
L
x
A
G
x
S
G
 
Y
N
 
I
T
 
T
D
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
K
K
 
S
A
 
V
R
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
I
I
 
I
P
 
G
D
 
E
C
 
L
G
 
G
Q
x
L
V
x
D
P
|
P
G
 
G
M
 
L
G
 
D
T
 
H
S
 
M
L
 
L
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
A
M
 
M
S
 
E
L
 
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
P
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
I
-
 
E
-
 
S
Y
 
Y
M
 
I
-
 
S
W
 
Y
D
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
L
-
 
P
-
 
A
P
 
P
Q
 
E
N
 
H
P
 
S
I
 
N
P
 
N
P
 
P
F
 
L
N
 
R
Y
 
Y
I
 
K
L
 
F
T
 
S
F
 
W
N
 
S
I
 
P
A
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
L
N
 
M
E
 
N
Y
 
V
Y
 
M
G
 
Q
T
 
S
A
 
A
K
 
T
F
 
Y
L
 
L
K
 
L
D
 
D
Y
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
N
V
 
V
P
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
I
T
 
S
F
 
F
R
 
L
E
 
D
E
 
A
D
 
V
Y
 
T
E
 
S
L
 
M
V
 
D
S
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
G
P
 
L
I
 
-
G
 
-
E
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
G
F
 
Y
V
 
P
T
 
N
S
 
R
G
 
D
G
 
S
T
 
T
S
 
K
T
 
Y
A
 
A
P
 
E
W
 
I
T
 
Y
F
 
G
E
 
I
G
 
S
K
 
S
I
 
A
K
 
H
T
 
T
F
 
L
I
 
L
N
 
R
K
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
F
 
M
T
 
K
Q
 
A
W
 
L
K
 
N
T
 
G
L
 
F
M
 
V
D
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
L
L
 
I
E
 
N
E
 
R
E
 
E
P
 
A
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9P4R4 Saccharopine dehydrogenase [NADP(+), L-glutamate-forming]; Saccharopine reductase; EC 1.5.1.10 from Pyricularia oryzae (strain 70-15 / ATCC MYA-4617 / FGSC 8958) (Rice blast fungus) (Magnaporthe oryzae) (see paper)
27% identity, 55% coverage: 56:272/393 of query aligns to 49:270/450 of Q9P4R4

query
sites
Q9P4R4
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
F
 
I
K
 
S
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
N
D
 
D
R
 
D
N
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
D
N
 
A
F
 
E
L
 
V
N
 
A
E
 
K
V
 
H
D
 
D
S
 
L
F
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
L
V
x
I
P
 
P
Y
 
Y
W
 
T
Y
 
F
N
 
H
L
 
A
K
 
T
I
 
V
T
 
I
E
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
R
A
 
Q
K
 
K
A
 
K
N
 
H
M
 
V
C
 
V
D
 
T
L
 
-
G
 
-
G
 
-
N
x
T
T
x
S
D
x
Y
L
 
V
V
 
S
K
 
P
E
 
A
Q
 
M
L
 
M
K
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
K
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
V
I
 
M
P
 
N
D
 
E
C
 
I
G
 
G
Q
x
L
V
x
D
P
|
P
G
 
G
M
 
I
G
 
D
T
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
H
V
 
L
Y
 
Y
A
 
A
M
 
I
S
 
K
L
 
T
L
 
I
D
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Y
 
H
M
 
A
W
 
A
D
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
A
P
 
P
Q
 
E
N
 
S
P
 
S
I
 
D
P
 
N
P
 
P
F
 
L
N
 
G
Y
 
Y
I
 
K
L
 
F
T
 
S
F
 
W
N
x
S
I
 
S
A
 
R
G
 
G
L
 
V
T
 
L
N
 
L
E
 
A
Y
 
L
Y
 
R
G
 
N
T
 
A
A
 
A
K
 
S
F
 
F
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
Y
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
T
E
 
N
V
 
V
P
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
A
D
 
G
Y
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
M
S
 
A
F
 
T
P
 
A
E
 
K
P
 
P
-
 
Y
-
 
F
I
 
I
G
 
Y
E
 
P
L
 
G
E
 
F
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
A
S
 
Y
G
 
P
G
 
N
T
x
R
S
 
D
T
 
S
A
 
T
P
 
P
W
 
Y
T
 
K
F
 
E
E
 
R
G
 
Y
K
 
Q
I
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
A
K
 
D
T
 
N
F
 
I
I
 
V
N
 
R
K
 
G
T
|
T
L
|
L
R
|
R
H
 
Y
K
 
Q
G
 
G
H
 
F
F
 
P
T
 
Q
Q
 
F
W
 
I
K
 
K
T
 
V
L
 
L
M
 
V
D
 
D
F
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
-
 
S
-
 
D
E
 
E
E
 
E
E
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1e5qA Ternary complex of saccharopine reductase from magnaporthe grisea, NADPH and saccharopine (see paper)
27% identity, 55% coverage: 56:272/393 of query aligns to 48:269/449 of 1e5qA

query
sites
1e5qA
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
F
 
I
K
 
S
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
N
D
 
D
R
 
D
N
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
D
N
 
A
F
 
E
L
 
V
N
 
A
E
 
K
V
 
H
D
 
D
S
 
L
F
 
V
L
 
I
S
 
S
A
x
L
V
x
I
P
|
P
Y
|
Y
W
 
T
Y
x
F
N
 
H
L
 
A
K
 
T
I
 
V
T
 
I
E
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
R
A
 
Q
K
 
K
A
 
K
N
 
H
M
 
V
C
 
V
D
 
T
L
 
-
G
 
-
G
 
-
N
x
T
T
x
S
D
x
Y
L
 
V
V
 
S
K
 
P
E
 
A
Q
 
M
L
 
M
K
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
K
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
V
I
 
M
P
 
N
D
 
E
C
 
I
G
 
G
Q
x
L
V
x
D
P
|
P
G
 
G
M
 
I
G
 
D
T
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
H
V
 
L
Y
 
Y
A
 
A
M
 
I
S
 
K
L
 
T
L
 
I
D
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Y
 
H
M
 
A
W
 
A
D
 
G
G
 
G
G
 
K
I
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
x
C
-
x
G
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
A
P
 
P
Q
 
E
N
 
S
P
 
S
I
 
D
P
 
N
P
 
P
F
 
L
N
 
G
Y
 
Y
I
 
K
L
 
F
T
 
S
F
x
W
N
x
S
I
 
S
A
 
R
G
 
G
L
 
V
T
 
L
N
 
L
E
 
A
Y
 
L
Y
 
R
G
 
N
T
 
A
A
 
A
K
 
S
F
 
F
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
Y
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
T
E
 
N
V
 
V
P
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
A
D
 
G
Y
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
M
S
 
A
F
 
T
P
 
A
E
 
K
P
 
P
-
 
Y
-
 
F
I
 
I
G
 
Y
E
 
P
L
 
G
E
 
F
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
A
S
 
Y
G
 
P
G
 
N
T
x
R
S
 
D
T
 
S
A
 
T
P
 
P
W
 
Y
T
 
K
F
 
E
E
 
R
G
 
Y
K
 
Q
I
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
A
K
 
D
T
 
N
F
 
I
I
 
V
N
 
R
K
 
G
T
|
T
L
 
L
R
|
R
H
 
Y
K
 
Q
G
 
G
H
 
F
F
 
P
T
 
Q
Q
 
F
W
 
I
K
 
K
T
 
V
L
 
L
M
 
V
D
 
D
F
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
-
 
S
-
 
D
E
 
E
E
 
E
E
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q9SMZ4 Alpha-aminoadipic semialdehyde synthase; cAt-LKR/SDH; LKR/SDH; EC 1.5.1.8; EC 1.5.1.9 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 67% coverage: 60:323/393 of query aligns to 657:934/1064 of Q9SMZ4

query
sites
Q9SMZ4
K
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
R
 
S
N
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
K
F
 
Y
L
 
V
N
 
S
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
V
F
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
L
V
 
L
P
 
P
Y
 
A
W
 
S
Y
 
C
N
 
H
L
 
A
K
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
K
A
 
T
A
 
C
I
 
I
E
 
E
A
 
L
K
 
K
A
 
K
N
 
H
M
 
L
C
 
V
D
 
T
L
 
A
G
 
S
G
 
Y
N
 
V
T
 
D
D
 
D
L
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
E
Q
 
T
L
 
S
K
 
M
L
 
L
D
 
H
E
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
I
I
 
L
P
 
G
D
 
E
C
 
M
G
 
G
Q
 
L
V
 
D
P
 
P
G
 
G
M
 
I
G
 
D
T
 
H
S
 
M
L
 
M
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
A
M
 
M
S
 
K
L
 
M
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
A
-
 
H
-
 
I
-
 
K
-
 
K
-
 
G
K
 
K
P
 
V
E
 
K
E
 
S
V
 
F
Y
 
T
M
 
S
W
 
Y
D
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
L
P
 
P
Q
 
S
N
 
P
P
 
A
I
 
A
P
 
A
-
 
N
-
 
N
P
 
P
F
 
L
N
 
A
Y
 
Y
I
 
K
L
 
F
T
 
S
F
 
W
N
 
N
I
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
I
N
 
R
E
 
A
Y
 
G
Y
 
Q
G
 
N
T
 
P
A
 
A
K
 
K
F
 
Y
L
 
K
K
 
S
D
 
N
Y
 
G
K
 
D
V
 
I
V
 
I
E
 
H
V
 
V
P
 
D
T
 
G
F
 
K
R
 
N
E
 
L
E
 
Y
D
 
D
Y
 
S
E
 
A
L
 
A
-
 
R
V
 
F
S
 
R
F
 
V
P
 
P
E
 
N
-
 
L
P
 
P
I
 
A
G
 
F
E
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
C
F
 
F
V
 
P
T
 
N
S
 
R
G
 
D
G
 
S
T
 
L
S
 
V
T
 
Y
A
 
G
-
 
E
P
 
H
W
 
Y
T
 
G
F
 
I
E
 
E
G
 
S
K
 
E
I
 
A
K
 
T
T
 
T
F
 
I
I
 
F
N
 
R
K
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
Y
K
 
E
G
 
G
H
 
F
F
 
S
T
 
M
Q
 
I
W
 
M
K
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
S
D
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
F
E
 
D
E
 
S
E
 
E
P
 
A
I
 
N
E
 
Q
I
 
V
-
 
L
-
 
S
R
 
T
G
 
G
V
 
K
R
 
R
I
 
I
S
 
T
P
 
F
R
 
G
E
 
A
V
 
L
L
 
L
H
 
S
A
 
N
L
 
I
A
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
N
E
 
E
P
 
S
K
 
E
L
 
P
K
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
K
 
E
D
 
E
K
 
I
D
 
S
I
 
K
V
 
R
I
 
I
V
 
I
R
 
K
V
 
L
K
 
G
V
 
H
L
 
S
G
 
K
E
 
E
K
 
T
D
 
A
G
 
A
K
 
K
K
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
T
L
 
I
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_068747340.1 NCBI__GCF_001601575.1:WP_068747340.1
MGYVYAVLGGGRQGTAAAYDMAKFGDADAVLIADISWENAVKSCDRVNALLNKKIAQPFK
LDVTDRNSLLNFLNEVDSFLSAVPYWYNLKITEAAIEAKANMCDLGGNTDLVKEQLKLDE
KAREAGIAVIPDCGQVPGMGTSLAVYAMSLLDKPEEVYMWDGGIPQNPIPPFNYILTFNI
AGLTNEYYGTAKFLKDYKVVEVPTFREEDYELVSFPEPIGELEAFVTSGGTSTAPWTFEG
KIKTFINKTLRHKGHFTQWKTLMDFGFLEEEPIEIRGVRISPREVLHALAEPKLKAGEKD
KDIVIVRVKVLGEKDGKKAEALVEVIDYYDEETGFTAMSRTTGWDGSIVAIMNAKGITKR
GVNPVEIGVPADVFVEELKKRGINVTEKVSCLT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory