SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068748198.1 NCBI__GCF_001601575.1:WP_068748198.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7ovgA The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound acetamide (see paper)
38% identity, 80% coverage: 9:242/294 of query aligns to 8:231/263 of 7ovgA

query
sites
7ovgA
V
 
I
Q
 
Q
I
 
M
A
 
E
P
 
P
K
 
K
P
 
I
N
 
L
D
 
E
I
 
L
S
 
D
Y
 
K
N
 
N
V
 
Y
G
 
S
K
 
K
I
 
A
K
 
E
E
 
K
W
 
L
A
 
I
K
 
K
K
 
E
A
 
A
K
 
S
K
 
K
L
 
-
H
 
E
N
 
G
P
 
A
D
 
K
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
S
 
L
A
 
F
T
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
N
P
 
F
N
 
E
M
 
S
P
 
R
I
 
-
S
 
E
E
 
E
F
 
V
Y
 
F
N
 
D
L
 
V
I
 
A
D
 
Q
P
 
Q
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
F
M
 
L
E
 
M
K
 
E
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
D
 
G
A
 
L
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
V
 
A
P
 
G
M
 
T
Y
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
-
E
 
-
Q
 
S
P
 
G
N
 
N
V
 
Y
V
 
L
Y
 
Y
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
R
E
 
-
G
 
G
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
P
 
Y
T
 
R
E
 
E
R
 
K
L
 
V
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
F
S
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
L
A
 
G
-
 
F
P
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
D
L
 
I
P
 
G
F
 
F
C
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
I
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
G
 
W
D
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
I
V
 
A
R
 
H
P
 
P
S
 
A
A
x
N
L
 
L
L
 
V
R
 
M
S
 
P
F
 
Y
D
 
A
I
 
P
W
 
R
E
 
A
L
 
M
T
 
P
N
 
-
K
 
-
A
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
H
 
R
V
 
V
Y
 
Y
F
 
T
V
 
I
A
 
T
V
 
A
N
 
D
A
 
R
V
 
V
G
 
G
P
 
E
D
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
L
N
 
K
F
 
F
Y
 
-
F
 
I
G
 
G
H
 
K
S
 
S
M
 
L
I
 
I
I
 
A
N
 
S
P
 
P
I
 
K
A
 
A
Q
 
E
K
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
E
I
 
I

6ypaB The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound glutaramide
38% identity, 80% coverage: 9:242/294 of query aligns to 14:237/269 of 6ypaB

query
sites
6ypaB
V
 
I
Q
 
Q
I
 
M
A
 
E
P
 
P
K
 
K
P
 
I
N
 
L
D
 
E
I
 
L
S
 
D
Y
 
K
N
 
N
V
 
Y
G
 
S
K
 
K
I
 
A
K
 
E
E
 
K
W
 
L
A
 
I
K
 
K
K
 
E
A
 
A
K
 
S
K
 
K
L
 
-
H
 
E
N
 
G
P
 
A
D
 
K
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
S
 
L
A
 
F
T
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
N
P
 
F
N
 
E
M
 
S
P
 
R
I
 
-
S
 
E
E
 
E
F
 
V
Y
 
F
N
 
D
L
 
V
I
 
A
D
 
Q
P
 
Q
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
F
M
 
L
E
 
M
K
 
E
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
D
 
G
A
 
L
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
V
 
A
P
 
G
M
 
T
Y
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
-
E
 
-
Q
 
S
P
 
G
N
 
N
V
 
Y
V
 
L
Y
 
Y
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
R
E
 
-
G
 
G
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
P
 
Y
T
 
R
E
|
E
R
 
K
L
 
V
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
F
S
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
L
A
 
G
-
 
F
P
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
D
L
 
I
P
 
G
F
 
F
C
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
I
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
G
x
W
D
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
I
V
 
A
R
 
H
P
 
P
S
 
A
A
x
N
L
|
L
L
x
V
R
x
M
S
 
P
F
 
Y
D
 
A
I
 
P
W
 
R
E
 
A
L
 
M
T
 
P
N
 
-
K
 
-
A
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
H
 
R
V
 
V
Y
 
Y
F
 
T
V
 
I
A
 
T
V
 
A
N
 
D
A
 
R
V
 
V
G
 
G
P
 
E
D
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
L
N
 
K
F
 
F
Y
 
-
F
 
I
G
 
G
H
 
K
S
 
S
M
 
L
I
 
I
I
 
A
N
 
S
P
 
P
I
 
K
A
 
A
Q
 
E
K
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
R
 
S
G
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
E
I
 
I

3klcB Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
38% identity, 80% coverage: 6:240/294 of query aligns to 3:227/261 of 3klcB

query
sites
3klcB
V
 
V
C
 
A
G
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
I
 
M
A
 
N
P
 
P
K
 
Q
P
 
I
N
 
L
D
 
E
I
 
P
S
 
D
Y
 
K
N
 
N
V
 
Y
G
 
S
K
 
K
I
 
A
K
 
E
E
 
K
W
 
L
A
 
I
K
 
K
K
 
E
A
 
A
K
 
S
K
 
K
L
 
-
H
 
Q
N
 
G
P
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
S
 
L
A
 
F
T
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
N
P
 
F
N
 
E
M
 
T
P
 
R
I
 
-
S
 
E
E
 
E
F
 
V
Y
 
F
N
 
E
L
 
I
I
 
A
D
 
Q
P
 
K
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
F
M
 
L
E
 
M
K
 
D
L
 
V
S
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
T
D
 
G
A
 
V
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
V
 
A
P
 
G
M
 
T
Y
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
P
 
G
N
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
N
|
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
-
E
 
R
G
 
G
I
x
F
I
 
I
G
 
G
I
x
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
Y
T
 
R
E
|
E
R
 
K
L
 
F
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
F
S
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
L
A
 
G
-
 
F
P
 
R
V
 
V
F
 
F
E
 
D
L
 
L
P
 
G
F
 
F
C
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
G
 
W
D
 
F
F
 
F
P
 
P
E
|
E
L
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
A
R
 
H
P
 
P
S
 
A
A
x
N
L
|
L
L
 
V
R
x
M
S
 
P
F
 
Y
D
 
A
I
 
P
W
 
R
E
 
A
L
 
M
T
 
P
N
 
-
K
 
-
A
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
H
 
K
V
 
V
Y
 
Y
F
 
T
V
 
V
A
 
T
V
 
A
N
 
D
A
 
R
V
 
V
G
 
G
P
 
E
D
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
L
N
 
K
F
 
F
Y
 
-
F
 
I
G
 
G
H
 
K
S
 
S
M
 
L
I
 
I
I
 
A
N
 
S
P
 
P
I
 
K
A
 
A
Q
 
E
K
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
R
 
S
G
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3klcA Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
38% identity, 80% coverage: 6:240/294 of query aligns to 3:227/261 of 3klcA

query
sites
3klcA
V
 
V
C
 
A
G
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
I
 
M
A
 
N
P
 
P
K
 
Q
P
 
I
N
 
L
D
x
E
I
 
P
S
x
D
Y
x
K
N
 
N
V
 
Y
G
 
S
K
 
K
I
 
A
K
 
E
E
 
K
W
 
L
A
 
I
K
 
K
K
 
E
A
 
A
K
 
S
K
 
K
L
 
-
H
 
Q
N
 
G
P
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
S
 
L
A
 
F
T
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
N
P
 
F
N
 
E
M
 
T
P
 
R
I
 
-
S
 
E
E
 
E
F
 
V
Y
 
F
N
 
E
L
 
I
I
 
A
D
 
Q
P
 
K
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
F
M
 
L
E
 
M
K
 
D
L
 
V
S
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
T
D
 
G
A
 
V
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
V
 
A
P
 
G
M
 
T
Y
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
P
 
G
N
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
N
|
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
|
G
P
|
P
S
 
-
E
x
R
G
 
G
I
x
F
I
|
I
G
|
G
I
x
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
Y
T
 
R
E
|
E
R
 
K
L
 
F
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
F
S
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
L
A
 
G
-
 
F
P
 
R
V
 
V
F
 
F
E
 
D
L
 
L
P
 
G
F
 
F
C
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
G
 
W
D
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
A
R
 
H
P
 
P
S
 
A
A
x
N
L
|
L
L
 
V
R
x
M
S
 
P
F
 
Y
D
 
A
I
 
P
W
 
R
E
 
A
L
 
M
T
 
P
N
 
-
K
 
-
A
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
H
 
K
V
 
V
Y
 
Y
F
 
T
V
 
V
A
 
T
V
 
A
N
 
D
A
 
R
V
 
V
G
 
G
P
 
E
D
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
L
N
 
K
F
 
F
Y
 
-
F
 
I
G
 
G
H
 
K
S
 
S
M
 
L
I
 
I
I
 
A
N
 
S
P
 
P
I
 
K
A
 
A
Q
 
E
K
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
R
 
S
G
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
E

Q9UYV8 Nitrilase; PaNit; EC 3.5.5.1 from Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) (see paper)
38% identity, 80% coverage: 6:240/294 of query aligns to 4:228/262 of Q9UYV8

query
sites
Q9UYV8
V
 
V
C
 
A
G
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
I
 
M
A
 
N
P
 
P
K
 
Q
P
 
I
N
 
L
D
 
E
I
 
P
S
 
D
Y
 
K
N
 
N
V
 
Y
G
 
S
K
 
K
I
 
A
K
 
E
E
 
K
W
 
L
A
 
I
K
 
K
K
 
E
A
 
A
K
 
S
K
 
K
L
 
-
H
 
Q
N
 
G
P
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
L
A
 
F
T
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
N
P
 
F
N
 
E
M
 
T
P
 
R
I
 
-
S
 
E
E
 
E
F
 
V
Y
 
F
N
 
E
L
 
I
I
 
A
D
 
Q
P
 
K
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
K
 
E
V
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
F
M
 
L
E
 
M
K
 
D
L
 
V
S
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
T
D
 
G
A
 
V
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
V
 
A
P
 
G
M
 
T
Y
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
P
 
G
N
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
R
E
 
-
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
Y
T
 
R
E
 
E
R
 
K
L
 
F
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
F
S
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
L
A
 
G
-
 
F
P
 
R
V
 
V
F
 
F
E
 
D
L
 
L
P
 
G
F
 
F
C
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
G
 
W
D
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
A
R
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
N
L
 
L
L
 
V
R
 
M
S
 
P
F
 
Y
D
 
A
I
 
P
W
 
R
E
 
A
L
 
M
T
 
P
N
 
-
K
 
-
A
 
I
R
 
R
A
 
A
Y
 
L
D
 
E
N
 
N
H
 
K
V
 
V
Y
 
Y
F
 
T
V
 
V
A
 
T
V
 
A
N
 
D
A
 
R
V
 
V
G
 
G
P
 
E
D
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
L
N
 
K
F
 
F
Y
 
-
F
 
I
G
 
G
H
 
K
S
 
S
M
 
L
I
 
I
I
 
A
N
 
S
P
 
P
I
 
K
A
 
A
Q
 
E
K
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
R
 
S
G
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
E

Q9NQR4 Omega-amidase NIT2; Nitrilase homolog 2; EC 3.5.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
28% identity, 84% coverage: 1:247/294 of query aligns to 1:247/276 of Q9NQR4

query
sites
Q9NQR4
M
 
M
K
 
T
E
 
S
F
 
F
T
 
R
V
 
L
C
 
A
G
 
L
V
 
I
Q
 
Q
I
 
L
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
A
 
S
P
 
I
K
 
K
P
 
S
N
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
T
Y
 
R
N
 
A
V
 
C
G
 
S
K
 
F
I
 
I
K
 
R
E
 
E
W
 
A
A
 
A
K
 
T
K
 
Q
A
 
G
K
 
A
K
 
K
L
 
I
H
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
V
V
 
S
F
 
L
P
 
P
E
|
E
S
 
C
A
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
F
T
 
N
P
 
S
N
 
P
M
 
Y
P
 
G
I
 
A
S
 
K
E
 
Y
F
 
F
Y
 
P
N
 
E
L
 
Y
I
 
A
D
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
E
V
 
S
T
 
T
E
 
Q
E
 
K
M
 
L
E
 
S
K
 
E
L
 
V
S
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
C
D
 
S
A
 
I
Y
 
Y
L
 
L
V
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
S
V
 
I
P
 
P
M
 
E
Y
 
E
E
 
D
K
 
A
G
 
G
E
 
K
Q
 
-
P
 
-
N
 
-
V
 
-
V
 
L
Y
 
Y
N
 
N
S
 
T
A
 
C
V
 
A
V
 
V
I
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
D
E
 
G
G
 
T
I
 
L
I
 
L
G
 
A
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
P
x
D
T
x
I
E
x
D
-
x
V
-
x
P
-
x
G
-
x
K
-
x
I
R
x
T
L
x
F
S
x
Q
A
x
E
G
 
S
G
 
K
W
 
T
S
 
L
T
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
S
A
 
F
P
 
S
V
 
T
F
 
F
E
 
D
L
 
T
P
 
P
F
 
Y
C
 
C
K
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
L
M
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
G
 
M
D
 
R
F
 
F
P
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
I
L
 
Y
V
 
A
V
 
Q
K
 
R
G
 
G
A
 
C
E
 
Q
V
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
Y
P
 
P
S
 
G
A
 
A
-
 
F
-
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
T
S
 
G
F
 
P
D
 
A
I
 
H
W
 
W
E
 
E
L
 
L
T
 
L
N
 
Q
K
 
R
A
 
S
R
 
R
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
H
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
F
 
V
V
 
A
A
 
T
V
 
A
N
 
S
A
 
P
V
 
A
G
 
R
P
 
D
D
 
D
A
 
K
G
 
A
N
 
S
N
 
Y
F
 
V
Y
 
A
F
 
W
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
T
I
 
V
I
 
V
N
 
N
P
 
P
I
 
W
A
 
G
Q
 
E
K
x
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
R
 
G
G
 
T
T
 
E
E
 
E
E
 
A
I
 
I
I
 
V
Y
 
Y
A
 
S
K
 
D
L
 
I
D
 
D

O25836 Formamidase; Formamide amidohydrolase; EC 3.5.1.49 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
36% identity, 84% coverage: 1:248/294 of query aligns to 11:260/334 of O25836

query
sites
O25836
M
 
I
K
 
E
E
 
G
F
 
F
T
 
L
V
 
V
C
 
A
G
 
A
V
 
I
Q
 
Q
-
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
P
I
 
I
A
 
V
P
 
N
K
 
S
P
 
R
N
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
D
Y
 
H
N
 
N
V
 
I
G
 
E
K
 
S
I
 
I
K
 
I
E
 
R
W
 
T
A
 
L
K
 
H
K
 
A
A
 
T
K
 
K
K
 
A
L
 
G
H
 
Y
-
 
P
N
 
G
P
 
V
D
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
I
F
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
Y
A
 
S
T
 
T
T
 
Q
G
 
G
F
 
L
T
 
N
P
 
T
N
 
A
M
 
K
P
 
W
I
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
E
Y
 
F
N
 
-
L
 
L
I
 
L
D
 
D
P
 
-
I
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
L
M
 
Y
E
 
A
K
 
K
L
 
A
S
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
A
D
 
K
A
 
V
Y
 
Y
L
 
G
V
 
V
V
 
F
P
 
S
M
 
I
Y
 
M
E
 
E
K
 
R
G
 
N
E
 
P
Q
 
D
P
 
S
N
 
N
V
 
K
V
 
N
-
 
P
Y
 
Y
N
 
N
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
D
P
 
P
S
 
Q
E
 
G
G
 
E
I
 
I
I
 
I
G
 
L
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
T
 
-
H
 
-
L
 
L
F
 
F
P
 
P
T
 
W
E
 
N
R
 
P
L
 
I
S
 
E
A
 
P
G
 
-
G
 
-
W
 
W
S
 
Y
T
 
P
P
 
G
G
 
D
K
 
L
E
 
G
A
 
M
P
 
P
V
 
V
F
 
C
E
 
E
L
 
G
P
 
P
F
 
G
-
 
G
C
 
S
K
 
K
L
 
L
G
 
A
V
 
V
M
 
C
I
 
I
C
|
C
Y
 
H
D
|
D
G
 
G
D
 
M
F
 
I
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
A
V
 
A
V
 
Y
K
 
K
G
 
G
A
 
C
E
 
N
V
 
V
I
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
I
S
 
S
A
 
G
L
 
Y
L
 
S
R
 
T
S
 
Q
F
 
V
-
 
N
D
 
D
I
 
Q
W
 
W
E
 
I
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
R
A
 
S
R
 
N
A
 
A
Y
 
W
D
 
H
N
 
N
H
 
L
V
 
M
Y
 
Y
F
 
T
V
 
V
A
 
S
V
 
V
N
 
N
A
 
L
V
 
A
G
 
G
P
 
Y
D
 
D
A
 
-
G
 
-
N
 
N
N
 
V
F
 
F
-
 
Y
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
H
 
E
S
 
G
M
 
Q
I
 
I
I
 
C
N
 
N
P
 
F
I
 
D
A
 
G
Q
 
T
K
 
T
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
A
 
G
-
 
H
R
 
R
G
 
N
T
 
P
E
 
W
E
 
E
I
 
I
I
 
V
Y
 
T
A
 
G
K
 
E
L
 
I
D
 
Y
P
 
P

2e2lA Helicobacter pylori formamidase amif contains a fine-tuned cysteine- glutamate-lysine catalytic triad (see paper)
35% identity, 83% coverage: 4:248/294 of query aligns to 2:243/317 of 2e2lA

query
sites
2e2lA
F
 
F
T
 
L
V
 
V
C
 
A
G
 
A
V
 
I
Q
 
Q
-
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
P
I
 
I
A
 
V
P
 
N
K
 
S
P
 
R
N
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
D
Y
 
H
N
 
N
V
 
I
G
 
E
K
 
S
I
 
I
K
 
I
E
 
R
W
 
T
A
 
L
K
 
H
K
 
A
A
 
T
K
 
K
K
 
A
L
 
G
H
 
Y
-
 
P
N
 
G
P
 
V
D
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
I
F
 
F
P
 
P
E
|
E
S
 
Y
A
 
S
T
 
T
T
 
Q
G
 
G
F
 
L
T
 
N
P
 
T
N
 
A
M
 
K
P
 
W
I
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
E
Y
 
F
N
 
-
L
 
L
I
 
L
D
 
D
P
 
-
I
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
L
M
 
Y
E
 
A
K
 
K
L
 
A
S
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
A
D
 
K
A
 
V
Y
 
Y
L
 
G
V
 
V
V
 
F
P
 
S
M
 
I
Y
 
M
E
 
E
K
 
R
G
 
N
E
 
P
Q
 
D
P
 
S
N
 
N
V
 
K
V
 
N
-
 
P
Y
 
Y
N
|
N
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
x
D
P
 
P
S
 
Q
E
 
G
G
 
E
I
 
I
I
 
I
G
 
L
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
-
H
 
-
L
 
L
F
 
F
P
 
P
T
x
W
E
 
N
R
x
P
L
 
I
S
x
E
A
 
P
G
 
-
G
 
-
W
 
W
S
 
Y
T
 
P
P
 
G
G
 
D
K
 
L
E
 
G
A
 
M
P
 
P
V
 
V
F
 
C
E
 
E
L
 
G
P
 
P
F
 
G
-
 
G
C
 
S
K
 
K
L
 
L
G
 
A
V
 
V
M
 
C
I
 
I
C
x
S
Y
x
H
D
 
D
G
 
G
D
 
M
F
 
I
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
A
V
 
A
V
 
Y
K
 
K
G
 
G
A
 
C
E
 
N
V
 
V
I
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
I
S
 
S
A
 
G
L
x
Y
L
 
S
R
 
T
S
 
Q
F
 
V
-
 
N
D
 
D
I
 
Q
W
 
W
E
 
I
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
R
A
 
S
R
 
N
A
 
A
Y
 
W
D
 
H
N
 
N
H
 
L
V
 
M
Y
 
Y
F
 
T
V
 
V
A
 
S
V
 
V
N
 
N
A
 
L
V
 
A
G
 
G
P
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
Y
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
H
 
E
S
 
G
M
 
Q
I
 
I
I
 
C
N
 
N
P
 
F
I
 
D
A
 
G
Q
 
T
K
 
T
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
A
 
G
-
 
H
R
 
R
G
 
N
T
 
P
E
 
W
E
 
E
I
 
I
I
 
V
Y
 
T
A
 
G
K
 
E
L
 
I
D
 
Y
P
 
P

5h8jB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with cadaverine (see paper)
27% identity, 95% coverage: 2:279/294 of query aligns to 3:288/297 of 5h8jB

query
sites
5h8jB
K
 
R
E
 
K
F
 
V
T
 
V
V
 
V
C
 
S
G
 
A
V
 
L
Q
 
Q
I
 
F
A
 
A
P
 
C
K
 
-
P
 
T
N
 
D
D
 
D
I
 
V
S
 
S
Y
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
T
K
 
T
I
 
A
K
 
E
E
 
R
W
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
A
A
 
A
K
 
H
K
 
K
L
 
-
H
 
Q
N
 
G
P
 
A
D
 
N
L
 
I
I
 
V
V
 
L
F
 
I
P
 
Q
E
|
E
S
 
L
A
 
F
T
 
E
T
 
G
G
 
Y
F
 
Y
T
 
F
P
 
C
N
 
Q
M
 
A
P
 
Q
I
 
R
S
 
E
E
 
D
F
 
F
Y
 
I
N
 
Q
L
 
R
I
 
A
D
 
K
P
 
P
I
 
Y
P
 
K
G
 
D
K
 
H
V
 
P
T
 
T
-
 
I
E
 
M
E
 
R
M
 
L
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
G
A
 
V
Y
 
V
L
 
I
V
 
P
V
 
V
P
 
S
M
 
F
Y
 
F
E
 
E
K
 
-
G
 
-
E
 
E
Q
 
A
P
 
N
N
 
N
V
 
A
V
 
H
Y
 
Y
N
|
N
S
 
S
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
D
P
 
A
S
 
D
E
 
G
G
 
T
I
 
D
I
 
L
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
S
H
 
H
L
 
I
F
 
P
P
 
D
T
 
G
E
 
P
R
 
G
L
x
Y
S
 
E
A
 
E
G
 
K
G
 
F
W
 
Y
S
 
F
T
 
N
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
T
A
 
G
-
 
F
P
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
Q
L
 
T
P
 
K
F
 
Y
C
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
M
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
 
W
D
 
D
G
 
Q
D
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
M
V
 
A
V
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
L
V
 
F
R
 
Y
P
 
P
S
 
T
A
|
A
L
 
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Q
-
 
S
L
 
I
R
 
D
S
 
S
F
 
R
D
 
D
I
 
H
W
 
W
E
 
K
L
 
R
T
 
V
N
 
M
K
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
A
Y
 
G
D
 
A
N
 
N
H
 
L
V
 
V
Y
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
S
N
 
N
A
 
R
V
 
I
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
P
 
T
D
 
E
A
 
H
G
 
G
N
 
K
N
 
S
-
 
E
-
 
I
F
 
K
Y
 
F
F
 
Y
G
 
G
H
 
N
S
 
S
M
 
F
I
 
I
I
 
A
N
 
G
P
 
P
I
 
T
A
 
G
Q
 
E
K
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
D
T
 
K
E
 
E
E
 
E
-
 
A
I
 
V
I
 
L
Y
 
I
A
 
A
K
 
E
L
 
F
D
 
N
P
 
L
D
 
D
P
 
K
I
 
I
K
 
K
Y
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
S
T
 
M
P
 
R
M
 
H
I
 
C
F
 
W
D
 
G
H
 
V
V
 
F
E
 
R
D
 
D
R
 
R
N
 
R
L
 
P
E
 
D
V
 
L
Y
 
Y
K
 
K
N
 
V
I
 
L
M
 
L

5h8iC Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with n-(dihydroxymethyl)putrescine (see paper)
27% identity, 95% coverage: 2:279/294 of query aligns to 7:292/301 of 5h8iC

query
sites
5h8iC
K
 
R
E
 
K
F
 
V
T
 
V
V
 
V
C
 
S
G
 
A
V
 
L
Q
 
Q
I
 
F
A
 
A
P
 
C
K
 
-
P
 
T
N
 
D
D
 
D
I
 
V
S
 
S
Y
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
T
K
 
T
I
 
A
K
 
E
E
 
R
W
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
A
A
 
A
K
 
H
K
 
K
L
 
-
H
 
Q
N
 
G
P
 
A
D
 
N
L
 
I
I
 
V
V
 
L
F
 
I
P
 
Q
E
|
E
S
 
L
A
 
F
T
 
E
T
 
G
G
 
Y
F
 
Y
T
 
F
P
 
C
N
 
Q
M
 
A
P
 
Q
I
 
R
S
 
E
E
 
D
F
 
F
Y
 
I
N
 
Q
L
 
R
I
 
A
D
 
K
P
 
P
I
 
Y
P
 
K
G
 
D
K
 
H
V
 
P
T
 
T
-
 
I
E
 
M
E
 
R
M
 
L
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
G
A
 
V
Y
 
V
L
 
I
V
 
P
V
 
V
P
 
S
M
 
F
Y
 
F
E
 
E
K
 
-
G
 
-
E
 
E
Q
 
A
P
 
N
N
 
N
V
 
A
V
 
H
Y
 
Y
N
|
N
S
 
S
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
D
P
 
A
S
 
D
E
 
G
G
 
T
I
 
D
I
 
L
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
S
H
 
H
L
 
I
F
x
P
P
 
D
T
 
G
E
 
P
R
 
G
L
x
Y
S
 
E
A
x
E
G
 
K
G
 
F
W
 
Y
S
 
F
T
 
N
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
T
A
 
G
-
 
F
P
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
Q
L
 
T
P
 
K
F
 
Y
C
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
M
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
x
W
D
 
D
G
 
Q
D
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
M
V
 
A
V
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
L
V
 
F
R
 
Y
P
 
P
S
 
T
A
|
A
L
 
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Q
-
 
S
L
 
I
R
 
D
S
 
S
F
 
R
D
 
D
I
 
H
W
 
W
E
 
K
L
 
R
T
 
V
N
 
M
K
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
A
Y
 
G
D
 
A
N
 
N
H
 
L
V
 
V
Y
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
S
N
 
N
A
 
R
V
 
I
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
P
 
T
D
 
E
A
 
H
G
 
G
N
 
K
N
 
S
-
 
E
-
 
I
F
 
K
Y
 
F
F
 
Y
G
 
G
H
 
N
S
 
S
M
 
F
I
 
I
I
 
A
N
 
G
P
 
P
I
 
T
A
 
G
Q
 
E
K
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
D
T
 
K
E
 
E
E
 
E
-
 
A
I
 
V
I
 
L
Y
 
I
A
 
A
K
 
E
L
 
F
D
 
N
P
 
L
D
 
D
P
 
K
I
 
I
K
 
K
Y
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
S
T
 
M
P
 
R
M
 
H
I
 
C
F
 
W
D
 
G
H
 
V
V
 
F
E
 
R
D
 
D
R
 
R
N
 
R
L
 
P
E
 
D
V
 
L
Y
 
Y
K
 
K
N
 
V
I
 
L
M
 
L

4gylA The e142l mutant of the amidase from geobacillus pallidus showing the result of michael addition of acrylamide at the active site cysteine (see paper)
35% identity, 73% coverage: 39:252/294 of query aligns to 53:264/340 of 4gylA

query
sites
4gylA
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
S
x
Y
A
 
S
T
 
T
T
 
M
G
 
G
F
 
I
T
 
M
P
 
Y
N
 
D
M
 
Q
P
 
-
I
 
-
S
 
D
E
 
E
F
 
M
Y
 
F
N
 
A
L
 
T
I
 
A
D
 
A
P
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
E
V
 
E
T
 
T
E
 
A
E
 
I
M
 
F
E
 
A
K
 
E
L
 
A
S
 
C
K
 
K
E
 
K
L
 
A
D
 
D
A
 
T
Y
 
W
L
 
G
V
 
V
V
 
F
P
 
S
M
 
L
Y
 
T
-
 
G
E
 
E
K
 
K
G
 
H
E
 
E
-
 
D
Q
 
H
P
 
P
N
 
N
V
 
K
V
 
A
-
 
P
Y
 
Y
N
|
N
S
 
T
A
 
L
V
 
V
V
 
L
I
 
I
G
 
N
P
 
N
S
 
K
E
x
G
G
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
Q
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
-
H
 
-
L
 
I
F
 
I
P
|
P
T
x
W
E
 
C
R
 
P
L
 
I
S
 
L
A
 
-
G
 
-
G
 
G
W
|
W
S
 
Y
T
 
-
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
T
A
 
T
P
 
Y
V
 
V
F
 
T
E
 
E
L
 
G
P
 
P
-
 
K
F
 
G
C
 
L
K
 
K
L
 
I
G
 
S
V
 
L
M
 
I
I
 
V
C
|
C
Y
x
D
D
 
D
G
 
G
D
 
N
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
R
E
 
D
L
 
C
V
 
A
V
 
M
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
P
 
C
S
 
Q
A
x
G
L
x
Y
L
x
M
R
 
Y
S
 
P
F
 
A
D
 
K
I
 
E
W
 
Q
E
 
Q
-
 
I
L
 
M
T
 
M
N
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
M
A
 
A
Y
 
W
D
 
A
N
 
N
H
 
N
V
 
T
Y
 
Y
F
 
V
V
 
A
A
 
V
V
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
T
G
 
G
P
 
F
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
V
N
 
Y
F
 
S
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
G
P
 
F
I
 
D
A
 
G
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
C
R
 
-
G
 
G
T
 
T
E
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
G
I
 
I
I
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
E
L
 
V
D
 
S
P
 
I
D
 
S
P
 
Q
I
 
I
K
 
R

P11436 Aliphatic amidase; Acylamide amidohydrolase; EC 3.5.1.4 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
34% identity, 79% coverage: 21:252/294 of query aligns to 34:264/346 of P11436

query
sites
P11436
N
 
N
V
 
A
G
 
R
K
 
K
I
 
I
K
 
A
E
 
E
W
 
M
A
 
I
K
 
V
K
 
G
A
 
M
K
 
K
K
 
Q
-
 
G
L
 
L
H
 
P
N
 
G
P
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
S
 
Y
A
 
S
T
 
L
T
 
Q
G
 
G
-
 
I
-
 
M
F
 
Y
T
 
D
P
 
P
N
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
S
 
A
E
 
E
F
 
M
Y
 
M
N
 
E
L
 
T
I
 
A
D
 
V
P
 
A
I
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
E
V
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
I
M
 
F
E
 
S
K
 
R
L
 
A
S
 
C
K
 
R
E
 
K
L
 
A
D
 
N
A
 
V
Y
 
W
L
 
G
V
 
V
V
 
F
P
 
S
M
 
L
Y
 
T
-
 
G
-
 
E
E
 
R
K
 
H
G
 
E
E
 
E
Q
 
H
P
 
P
N
 
R
V
 
K
V
 
A
-
 
P
Y
 
Y
N
 
N
S
 
T
A
 
L
V
 
V
V
 
L
I
 
I
G
 
D
P
 
N
S
 
N
E
 
G
G
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
Q
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
I
-
 
P
L
 
W
F
 
C
P
 
P
T
 
I
E
 
E
R
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
W
 
W
S
 
-
T
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
G
E
 
Q
A
 
T
P
 
Y
V
 
V
F
 
S
E
 
E
L
 
G
P
 
P
-
 
K
F
 
G
C
 
M
K
 
K
L
 
I
G
 
S
V
 
L
M
 
I
I
 
I
C
|
C
Y
 
D
D
 
D
G
 
G
D
 
N
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
R
E
 
D
L
 
C
V
 
A
V
 
M
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
P
 
C
S
 
Q
A
 
G
L
 
Y
L
 
M
R
 
Y
-
 
P
S
 
A
F
 
K
D
 
D
I
 
Q
W
 
Q
E
 
V
L
 
M
T
 
M
N
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
M
A
 
A
Y
 
W
D
 
A
N
 
N
H
 
N
V
 
C
Y
 
Y
F
 
V
V
 
A
A
 
V
V
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
A
G
 
G
P
 
F
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
V
N
 
Y
F
 
S
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
G
P
 
F
I
 
D
A
 
G
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
C
R
 
-
G
 
G
T
 
E
E
 
E
E
 
E
-
 
M
-
 
G
I
 
I
I
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
D
 
S
P
 
L
D
 
S
P
 
Q
I
 
I
K
 
R

5h8lB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) c158s mutant in complex with putrescine (see paper)
26% identity, 95% coverage: 2:279/294 of query aligns to 4:289/298 of 5h8lB

query
sites
5h8lB
K
 
R
E
 
K
F
 
V
T
 
V
V
 
V
C
 
S
G
 
A
V
 
L
Q
 
Q
I
 
F
A
 
A
P
 
C
K
 
-
P
 
T
N
 
D
D
 
D
I
 
V
S
 
S
Y
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
T
K
 
T
I
 
A
K
 
E
E
 
R
W
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
A
A
 
A
K
 
H
K
 
K
L
 
-
H
 
Q
N
 
G
P
 
A
D
 
N
L
 
I
I
 
V
V
 
L
F
 
I
P
 
Q
E
|
E
S
 
L
A
 
F
T
 
E
T
 
G
G
 
Y
F
 
Y
T
 
F
P
 
C
N
 
Q
M
 
A
P
 
Q
I
 
R
S
 
E
E
 
D
F
 
F
Y
 
I
N
 
Q
L
 
R
I
 
A
D
 
K
P
 
P
I
 
Y
P
 
K
G
 
D
K
 
H
V
 
P
T
 
T
-
 
I
E
 
M
E
 
R
M
 
L
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
G
A
 
V
Y
 
V
L
 
I
V
 
P
V
 
V
P
 
S
M
 
F
Y
 
F
E
 
E
K
 
-
G
 
-
E
 
E
Q
 
A
P
 
N
N
 
N
V
 
A
V
 
H
Y
 
Y
N
|
N
S
 
S
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
D
P
 
A
S
 
D
E
 
G
G
 
T
I
 
D
I
 
L
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
S
H
 
H
L
 
I
F
 
P
P
 
D
T
 
G
E
 
P
R
 
G
L
x
Y
S
 
E
A
x
E
G
 
K
G
 
F
W
 
Y
S
 
F
T
 
N
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
T
A
 
G
-
 
F
P
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
Q
L
 
T
P
 
K
F
 
Y
C
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
M
 
A
I
 
I
C
x
S
Y
 
W
D
 
D
G
 
Q
D
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
M
V
 
A
V
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
L
V
 
F
R
 
Y
P
 
P
S
 
T
A
|
A
L
 
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Q
-
 
S
L
 
I
R
 
D
S
 
S
F
 
R
D
 
D
I
 
H
W
 
W
E
 
K
L
 
R
T
 
V
N
 
M
K
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
A
Y
 
G
D
 
A
N
 
N
H
 
L
V
 
V
Y
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
S
N
 
N
A
 
R
V
 
I
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
P
 
T
D
 
E
A
 
H
G
 
G
N
 
K
N
 
S
-
 
E
-
 
I
F
 
K
Y
 
F
F
 
Y
G
 
G
H
 
N
S
 
S
M
 
F
I
 
I
I
 
A
N
 
G
P
 
P
I
 
T
A
 
G
Q
 
E
K
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
R
 
D
G
 
D
T
 
K
E
 
E
E
 
E
-
 
A
I
 
V
I
 
L
Y
 
I
A
 
A
K
 
E
L
 
F
D
 
N
P
 
L
D
 
D
P
 
K
I
 
I
K
 
K
Y
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
S
T
 
M
P
 
R
M
 
H
I
 
C
F
 
W
D
 
G
H
 
V
V
 
F
E
 
R
D
 
D
R
 
R
N
 
R
L
 
P
E
 
D
V
 
L
Y
 
Y
K
 
K
N
 
V
I
 
L
M
 
L

Q9RQ17 Aliphatic amidase; Acylamide amidohydrolase; Wide spectrum amidase; EC 3.5.1.4 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
30% identity, 85% coverage: 39:287/294 of query aligns to 53:303/348 of Q9RQ17

query
sites
Q9RQ17
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
I
F
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
Y
A
 
S
T
 
T
T
 
M
G
 
G
F
 
I
T
 
M
P
 
Y
N
 
D
M
 
R
P
 
-
I
 
-
S
 
K
E
 
E
F
 
M
Y
 
F
N
 
E
L
 
T
I
 
A
D
 
T
P
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
P
V
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
I
M
 
F
E
 
A
K
 
E
L
 
A
S
 
C
K
 
R
E
 
K
L
 
A
D
 
N
A
 
T
Y
 
W
L
 
G
V
 
V
V
 
F
P
 
S
M
 
L
Y
 
T
-
 
G
-
 
E
E
 
Q
K
 
H
G
 
E
E
 
E
Q
 
H
P
 
P
N
 
H
V
 
K
V
 
N
-
 
P
Y
 
Y
N
 
N
S
 
T
A
 
L
V
 
V
V
 
L
I
 
I
G
 
N
P
 
N
S
 
K
E
 
G
G
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
Q
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
T
 
I
H
 
I
-
 
P
L
 
W
F
 
C
P
 
P
T
 
I
E
 
E
R
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
W
 
W
S
 
Y
T
 
-
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
T
A
 
T
P
 
Y
V
 
V
F
 
T
E
 
E
L
 
G
P
 
P
-
 
K
F
 
G
C
 
I
K
 
K
L
 
I
G
 
S
V
 
L
M
 
I
I
 
I
C
 
C
Y
 
D
D
 
D
G
 
G
D
 
N
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
R
E
 
D
L
 
C
V
 
A
V
 
M
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
P
 
C
S
 
Q
A
 
G
L
 
Y
L
 
M
R
 
Y
S
 
P
F
 
A
D
 
K
I
 
E
W
 
Q
E
 
Q
-
 
I
L
 
M
T
 
M
N
 
A
K
 
K
A
 
T
R
 
M
A
 
A
Y
 
W
D
 
A
N
 
N
H
 
N
V
 
V
Y
 
Y
F
 
V
V
 
A
A
 
V
V
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
T
G
 
G
P
 
F
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
V
N
 
Y
F
 
S
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
G
P
 
F
I
 
D
A
 
G
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
C
R
 
-
G
 
G
T
 
E
E
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
G
I
 
I
I
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
E
L
 
I
D
 
S
P
 
L
D
 
S
P
 
Q
I
 
I
K
 
R
Y
 
D
V
 
F
T
 
R
Y
 
Q
G
 
N
A
 
A
S
 
Q
T
 
S
P
 
Q
M
 
-
I
 
-
F
 
-
D
 
N
H
 
H
V
 
L
E
 
F
D
 
K
R
 
L
N
 
L
L
 
H
E
 
R
V
 
G
Y
 
Y
K
 
T
N
 
G
I
 
I
M
 
I
K
 
Q
K
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
G
-
 
V
S
 
A
K
 
E
C
 
C
P
 
P
F
 
F
E
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9UBR1 Beta-ureidopropionase; BUP-1; Beta-alanine synthase; N-carbamoyl-beta-alanine amidohydrolase; EC 3.5.1.6 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
27% identity, 74% coverage: 39:255/294 of query aligns to 113:351/384 of Q9UBR1

query
sites
Q9UBR1
D
 
N
L
 
I
I
 
I
V
 
C
F
 
F
P
 
Q
E
 
E
S
 
A
A
 
W
T
 
T
T
 
M
G
 
P
F
 
F
T
 
A
-
 
F
-
 
C
-
 
T
-
x
R
P
 
E
N
x
K
M
 
L
P
 
P
I
 
W
S
 
T
E
 
E
F
 
F
Y
 
A
N
 
E
L
 
S
I
 
A
D
 
E
P
 
D
I
 
-
P
 
-
G
 
G
K
 
P
V
 
T
T
 
T
E
 
R
E
 
F
M
 
C
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
K
 
K
E
 
N
L
 
H
D
 
D
A
 
M
Y
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
S
P
 
P
M
 
I
Y
 
L
E
 
E
K
 
R
-
 
D
G
 
S
E
 
E
Q
 
H
P
 
G
N
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
N
 
N
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
S
P
 
N
S
 
S
E
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
L
G
 
G
I
 
K
Y
 
T
R
 
R
K
 
K
T
 
N
H
 
H
L
 
I
F
 
P
P
 
R
T
 
V
E
 
G
R
 
D
L
 
F
S
 
N
A
 
E
G
x
S
G
 
T
W
 
Y
S
 
Y
T
 
M
P
 
E
G
 
G
K
 
N
E
 
L
A
 
G
-
 
H
P
 
P
V
 
V
F
 
F
E
 
Q
L
 
T
P
 
Q
F
 
F
C
 
G
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
V
M
 
N
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
x
G
G
x
R
D
 
H
F
 
H
P
 
P
E
 
L
L
 
N
A
 
W
R
 
L
E
 
M
L
 
Y
V
 
S
V
 
I
K
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
I
V
 
F
R
 
N
P
 
P
S
 
S
A
 
A
L
 
T
L
 
I
R
 
G
S
 
A
F
 
L
-
x
S
-
 
E
D
 
S
I
 
L
W
 
W
E
 
P
L
 
I
T
x
E
N
 
A
K
 
R
A
 
N
R
 
A
A
 
A
Y
 
I
D
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
C
Y
 
F
F
 
T
V
 
C
A
 
A
V
x
I
N
 
N
A
 
R
V
 
V
G
 
G
P
 
T
D
 
E
A
 
H
G
 
F
N
 
P
N
 
N
-
 
E
-
 
F
-
x
T
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
Q
-
 
D
-
 
F
-
 
G
F
 
Y
Y
 
F
F
 
Y
G
 
G
H
 
S
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
I
 
A
N
 
A
P
 
P
I
 
D
A
 
S
Q
 
S
K
x
R
L
 
T
-
 
P
A
 
G
Q
 
L
A
 
S
R
 
R
G
 
S
T
 
R
E
 
D
E
 
G
I
 
L
I
 
L
Y
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
D
 
D
P
 
L
D
 
N
P
 
L
I
 
C
K
 
Q
Y
 
Q
V
 
V
T
 
N

Sites not aligning to the query:

O25067 Aliphatic amidase; Acylamide amidohydrolase; EC 3.5.1.4 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
30% identity, 85% coverage: 39:287/294 of query aligns to 53:302/339 of O25067

query
sites
O25067
D
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
I
F
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
Y
A
 
S
T
 
T
T
 
H
G
 
G
F
 
I
T
 
M
P
 
Y
N
 
D
M
 
R
P
 
-
I
 
-
S
 
Q
E
 
E
F
 
M
Y
 
F
N
 
D
L
 
T
I
 
A
D
 
A
P
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
E
V
 
E
T
 
T
E
 
A
E
 
I
M
 
F
E
 
A
K
 
E
L
 
A
S
 
C
K
 
K
E
 
K
L
 
N
D
 
K
A
 
V
Y
 
W
L
 
G
V
 
V
V
 
F
P
 
S
M
 
L
Y
 
T
-
 
G
E
 
E
K
 
K
G
 
H
E
 
E
Q
 
Q
P
 
A
N
 
K
V
 
K
V
 
N
-
 
P
Y
 
Y
N
 
N
S
 
T
A
 
L
V
 
I
V
 
L
I
 
V
G
 
N
P
 
D
S
 
K
E
 
G
G
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
Q
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
T
 
-
H
 
-
L
 
I
F
 
L
P
 
P
T
 
W
E
 
C
R
 
P
L
 
I
S
 
E
A
 
C
G
 
-
G
 
-
W
 
W
S
 
-
T
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
D
E
 
K
A
 
T
P
 
Y
V
 
V
F
 
V
E
 
D
L
 
G
P
 
P
-
 
K
F
 
G
C
 
L
K
 
K
L
 
V
G
 
S
V
 
L
M
 
I
I
 
I
C
|
C
Y
 
D
D
|
D
G
 
G
D
 
N
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
R
E
 
D
L
 
C
V
 
A
V
 
M
K
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
P
 
C
S
 
Q
A
 
G
L
 
Y
L
 
M
R
 
Y
S
 
P
F
 
A
D
 
K
I
 
E
W
 
Q
E
 
Q
L
 
I
T
 
A
-
 
I
N
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
M
A
 
A
Y
 
W
D
 
A
N
 
N
H
 
Q
V
 
C
Y
 
Y
F
 
V
V
 
A
A
 
V
V
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
T
G
 
G
P
 
F
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
V
N
 
Y
F
 
S
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
G
P
 
F
I
 
D
A
 
G
Q
 
H
K
 
T
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
C
R
 
-
G
 
G
T
 
E
E
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
G
I
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
D
 
S
P
 
V
D
 
Q
P
 
Q
I
 
I
K
 
R
Y
 
D
V
 
A
-
 
R
T
 
K
Y
 
Y
G
 
D
A
 
Q
S
 
S
T
 
Q
P
 
N
M
 
Q
I
 
L
F
 
F
D
 
K
H
 
L
V
 
L
E
 
H
D
 
R
R
 
G
N
 
Y
L
 
S
E
 
G
V
 
V
Y
 
F
K
 
A
N
 
S
I
 
G
M
 
D
K
 
G
K
 
D
-
 
K
-
 
G
-
 
V
S
 
A
K
 
E
C
 
C
P
 
P
F
 
F
E
 
E

Q94JV5 Deaminated glutathione amidase, chloroplastic/cytosolic; dGSH amidase; Nitrilase-like protein 2; Protein nitrilase 1 homolog; AtNit1; Protein Nit1 homolog; EC 3.5.1.128 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 81% coverage: 16:254/294 of query aligns to 48:292/307 of Q94JV5

query
sites
Q94JV5
N
 
N
D
 
D
I
 
L
S
 
M
Y
 
T
N
 
N
V
 
F
G
 
A
K
 
T
I
 
C
K
 
S
E
 
R
W
 
L
A
 
V
K
 
Q
K
 
E
A
 
A
K
 
A
K
 
-
L
 
L
H
 
A
N
 
G
P
 
A
D
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
C
F
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
N
A
 
F
T
 
S
T
 
-
G
 
-
F
 
F
T
 
V
P
 
G
N
 
D
M
 
K
P
 
E
I
 
-
S
 
G
E
 
E
F
 
S
Y
 
V
N
 
K
L
 
I
I
 
A
D
 
E
P
 
P
I
 
L
P
 
D
G
 
G
K
 
P
V
 
V
T
 
M
E
 
E
E
 
R
M
 
Y
E
 
C
K
 
S
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
S
D
 
N
A
 
I
Y
 
W
L
 
L
V
 
S
V
 
L
P
 
G
M
 
G
Y
 
F
E
 
Q
K
 
E
G
 
R
E
 
F
Q
 
D
P
 
D
N
 
T
V
 
H
V
 
L
Y
 
C
N
 
N
S
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
D
P
 
D
S
 
A
E
 
G
G
 
M
I
 
I
I
 
R
G
 
D
I
 
T
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
K
T
 
M
H
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
D
T
 
V
E
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
S
R
 
S
L
 
Y
S
 
K
A
 
E
G
 
S
G
 
S
W
 
F
S
 
T
T
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
T
E
 
K
A
 
I
P
 
V
V
 
S
F
 
V
E
 
D
L
 
S
P
 
P
F
 
V
C
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
M
 
T
I
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
G
 
L
D
 
R
F
 
F
P
 
P
E
 
K
L
 
I
A
 
Y
R
 
Q
E
 
Q
L
 
L
V
 
R
V
 
F
-
 
E
K
 
Q
G
 
K
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
V
 
L
R
 
V
P
 
P
S
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
T
R
 
K
S
 
V
F
 
T
D
 
G
-
 
E
-
 
A
I
 
H
W
 
W
E
 
E
L
 
I
T
 
L
N
 
L
K
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
I
D
 
E
N
 
T
H
 
Q
V
 
C
Y
 
Y
F
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
A
N
 
A
A
 
Q
V
 
A
G
 
G
P
 
K
D
 
H
A
 
N
G
 
E
N
 
K
N
 
R
F
 
E
Y
 
S
F
 
Y
G
 
G
H
 
D
S
 
T
M
 
L
I
 
I
I
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
W
A
 
G
Q
 
T
K
 
V
L
 
V
A
 
G
Q
 
R
A
 
L
-
 
P
-
 
D
R
 
R
G
 
V
T
 
S
E
 
T
E
 
G
I
 
I
I
 
V
Y
 
V
A
 
A
K
 
D
L
 
I
D
 
D
P
 
F
D
 
S
P
 
L
I
 
I
K
 
D
Y
 
S
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P47016 Deaminated glutathione amidase; dGSH amidase; Nitrilase homolog 1; EC 3.5.1.128 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
27% identity, 81% coverage: 17:254/294 of query aligns to 18:291/307 of P47016

query
sites
P47016
D
 
D
I
 
L
S
 
T
Y
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
K
K
 
V
I
 
V
K
 
K
E
 
E
W
 
L
A
 
I
K
 
S
K
 
E
A
 
A
K
 
I
K
 
Q
L
 
-
H
 
K
N
 
K
P
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
V
V
 
F
F
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
A
A
 
-
T
 
-
T
 
S
G
 
D
F
 
Y
T
 
L
P
 
S
N
 
Q
M
 
N
P
 
P
I
 
L
S
 
H
E
 
S
F
 
R
Y
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
P
N
 
K
L
 
F
I
 
I
D
 
R
P
 
Q
I
 
L
P
 
Q
G
 
S
K
 
S
V
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
L
M
 
V
E
 
R
K
 
D
L
 
N
S
 
S
K
 
R
E
 
N
L
 
I
D
 
D
A
 
V
Y
 
S
L
 
I
V
 
G
V
 
V
-
 
H
-
 
L
P
 
P
M
 
P
Y
 
S
E
 
E
K
 
Q
G
 
D
-
 
L
-
 
L
E
 
E
Q
 
G
P
 
N
N
 
D
V
 
R
V
 
V
Y
 
R
N
 
N
S
 
V
A
 
L
V
 
L
V
 
Y
I
 
I
G
 
D
P
 
H
S
 
E
E
 
G
G
 
K
I
 
I
I
 
L
G
 
Q
I
 
E
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
K
T
 
L
H
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
D
T
 
V
E
 
D
R
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
I
L
 
L
S
 
K
A
 
E
G
 
S
G
 
K
W
 
S
S
 
V
T
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
E
 
A
A
 
I
P
 
P
-
 
D
V
 
I
F
 
I
E
 
E
L
 
S
P
 
P
F
 
L
C
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
S
M
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
G
 
I
D
x
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
A
 
S
R
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
R
V
 
S
K
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
L
V
 
C
R
 
F
P
 
P
S
 
S
A
 
A
L
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
F
 
F
D
 
T
I
 
I
-
 
K
-
x
T
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
H
W
 
W
E
 
E
L
 
L
T
 
L
N
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
N
 
T
H
 
Q
V
 
C
Y
 
Y
F
 
V
V
 
L
A
 
M
V
 
P
N
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
G
-
 
M
-
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
L
P
 
E
D
 
K
A
 
S
G
 
S
N
 
R
N
 
R
F
 
E
Y
 
S
F
 
W
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
M
I
 
V
I
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
W
A
 
G
Q
 
K
K
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
R
 
D
G
 
P
T
 
S
E
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
P
E
 
Q
I
 
L
I
 
I
Y
 
L
A
 
A
K
 
D
L
 
L
D
 
D
P
 
R
D
 
E
P
 
L
I
 
L
K
 
Q
Y
 
E
V
 
I

4hg5A Structural insights into yeast nit2: wild-type yeast nit2 in complex with oxaloacetate (see paper)
27% identity, 81% coverage: 17:254/294 of query aligns to 15:288/304 of 4hg5A

query
sites
4hg5A
D
 
D
I
 
L
S
 
T
Y
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
K
K
 
V
I
 
V
K
 
K
E
 
E
W
 
L
A
 
I
K
 
S
K
 
E
A
 
A
K
 
I
K
 
Q
L
 
-
H
 
K
N
 
K
P
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
V
V
 
F
F
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
A
A
 
-
T
 
-
T
 
S
G
 
D
F
 
Y
T
 
L
P
 
S
N
 
Q
M
 
N
P
 
P
I
 
L
S
 
H
E
 
S
F
 
R
Y
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
P
N
 
K
L
 
F
I
 
I
D
 
R
P
 
Q
I
 
L
P
 
Q
G
 
S
K
 
S
V
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
L
M
 
V
E
 
R
K
 
D
L
 
N
S
 
S
K
 
R
E
 
N
L
 
I
D
 
D
A
 
V
Y
 
S
L
 
I
V
 
G
V
 
V
-
 
H
-
 
L
P
 
P
M
 
P
Y
 
S
E
 
E
K
 
Q
G
 
D
-
 
L
-
 
L
E
 
E
Q
 
G
P
 
N
N
 
D
V
 
R
V
 
V
Y
 
R
N
|
N
S
 
V
A
 
L
V
 
L
V
 
Y
I
 
I
G
 
D
P
 
H
S
 
E
E
 
G
G
 
K
I
 
I
I
 
L
G
 
Q
I
 
E
Y
 
Y
R
 
Q
K
|
K
T
 
L
H
 
H
L
 
L
F
|
F
P
 
D
T
 
V
E
 
D
R
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
I
L
 
L
S
 
K
A
x
E
G
 
S
G
 
K
W
 
S
S
 
V
T
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
E
 
A
A
 
I
P
 
P
-
 
D
V
 
I
F
 
I
E
 
E
L
 
S
P
 
P
F
 
L
C
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
S
M
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
G
 
I
D
x
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
A
 
S
R
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
R
V
 
S
K
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
L
V
 
C
R
 
F
P
 
P
S
 
S
A
 
A
L
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
F
|
F
D
x
T
I
 
I
-
 
K
-
x
T
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
H
W
 
W
E
 
E
L
 
L
T
 
L
N
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
N
 
T
H
 
Q
V
 
C
Y
 
Y
F
 
V
V
 
L
A
 
M
V
 
P
N
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
G
-
 
M
-
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
L
P
 
E
D
 
K
A
 
S
G
 
S
N
 
R
N
 
R
F
 
E
Y
 
S
F
 
W
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
M
I
 
V
I
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
W
A
 
G
Q
 
K
K
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
R
 
D
G
 
P
T
 
S
E
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
P
E
 
Q
I
 
L
I
 
I
Y
 
L
A
 
A
K
 
D
L
 
L
D
 
D
P
 
R
D
 
E
P
 
L
I
 
L
K
 
Q
Y
 
E
V
 
I

4hg3A Structural insights into yeast nit2: wild-type yeast nit2 in complex with alpha-ketoglutarate (see paper)
27% identity, 81% coverage: 17:254/294 of query aligns to 15:288/304 of 4hg3A

query
sites
4hg3A
D
 
D
I
 
L
S
 
T
Y
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
K
K
 
V
I
 
V
K
 
K
E
 
E
W
 
L
A
 
I
K
 
S
K
 
E
A
 
A
K
 
I
K
 
Q
L
 
-
H
 
K
N
 
K
P
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
V
V
 
F
F
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
A
A
 
-
T
 
-
T
 
S
G
 
D
F
 
Y
T
 
L
P
 
S
N
 
Q
M
 
N
P
 
P
I
 
L
S
 
H
E
 
S
F
 
R
Y
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
P
N
 
K
L
 
F
I
 
I
D
 
R
P
 
Q
I
 
L
P
 
Q
G
 
S
K
 
S
V
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
L
M
 
V
E
 
R
K
 
D
L
 
N
S
 
S
K
 
R
E
 
N
L
 
I
D
 
D
A
 
V
Y
 
S
L
 
I
V
 
G
V
 
V
-
 
H
-
 
L
P
 
P
M
 
P
Y
 
S
E
 
E
K
 
Q
G
 
D
-
 
L
-
 
L
E
 
E
Q
 
G
P
 
N
N
 
D
V
 
R
V
 
V
Y
 
R
N
|
N
S
 
V
A
 
L
V
 
L
V
 
Y
I
 
I
G
 
D
P
 
H
S
 
E
E
 
G
G
 
K
I
 
I
I
 
L
G
 
Q
I
 
E
Y
 
Y
R
 
Q
K
|
K
T
 
L
H
 
H
L
 
L
F
|
F
P
 
D
T
 
V
E
 
D
R
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
I
L
 
L
S
 
K
A
x
E
G
 
S
G
 
K
W
 
S
S
 
V
T
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
E
 
A
A
 
I
P
 
P
-
 
D
V
 
I
F
 
I
E
 
E
L
 
S
P
 
P
F
 
L
C
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
S
M
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
G
 
I
D
x
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
A
 
S
R
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
R
V
 
S
K
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
L
V
 
C
R
 
F
P
 
P
S
 
S
A
 
A
L
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
F
|
F
D
x
T
I
 
I
-
 
K
-
x
T
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
H
W
 
W
E
 
E
L
 
L
T
 
L
N
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
N
 
T
H
 
Q
V
 
C
Y
 
Y
F
 
V
V
 
L
A
 
M
V
 
P
N
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
G
-
 
M
-
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
L
P
 
E
D
 
K
A
 
S
G
 
S
N
 
R
N
 
R
F
 
E
Y
 
S
F
 
W
G
 
G
H
 
H
S
 
S
M
 
M
I
 
V
I
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
W
A
 
G
Q
 
K
K
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
R
 
D
G
 
P
T
 
S
E
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
P
E
 
Q
I
 
L
I
 
I
Y
 
L
A
 
A
K
 
D
L
 
L
D
 
D
P
 
R
D
 
E
P
 
L
I
 
L
K
 
Q
Y
 
E
V
 
I

Query Sequence

>WP_068748198.1 NCBI__GCF_001601575.1:WP_068748198.1
MKEFTVCGVQIAPKPNDISYNVGKIKEWAKKAKKLHNPDLIVFPESATTGFTPNMPISEF
YNLIDPIPGKVTEEMEKLSKELDAYLVVPMYEKGEQPNVVYNSAVVIGPSEGIIGIYRKT
HLFPTERLSAGGWSTPGKEAPVFELPFCKLGVMICYDGDFPELARELVVKGAEVIVRPSA
LLRSFDIWELTNKARAYDNHVYFVAVNAVGPDAGNNFYFGHSMIINPIAQKLAQARGTEE
IIYAKLDPDPIKYVTYGASTPMIFDHVEDRNLEVYKNIMKKSKCPFEPAKRIPY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory