SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_068862398.1 NCBI__GCF_001677335.1:WP_068862398.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 5 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9Y7Q9 Probable metabolite transporter C2H8.02 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
26% identity, 40% coverage: 13:229/543 of query aligns to 35:262/583 of Q9Y7Q9

query
sites
Q9Y7Q9
S
 
T
E
 
K
K
 
K
E
 
E
I
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
-
I
 
L
G
 
A
A
 
I
S
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
D
W
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
L
F
 
F
I
 
I
Y
 
I
G
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
P
T
 
I
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
L
 
Y
K
 
W
D
 
G
A
 
G
F
 
L
Y
 
T
A
 
G
T
 
H
D
 
Q
N
 
D
E
 
Y
T
 
P
L
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
R
-
 
G
L
 
V
V
 
V
W
 
N
S
 
A
T
 
A
F
 
T
A
 
N
V
 
I
G
 
G
F
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
N
P
 
I
L
 
M
G
 
G
A
 
Q
I
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
Y
 
F
T
 
V
F
 
Y
L
 
G
V
 
K
T
 
E
V
 
M
T
 
M
L
 
V
M
 
V
G
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
I
G
 
L
V
 
I
G
 
I
L
 
C
I
 
L
P
 
P
T
 
D
V
 
R
D
 
I
T
 
P
I
 
T
G
 
P
M
 
T
A
 
A
A
 
K
P
 
M
I
 
M
I
 
W
V
 
L
I
 
F
L
 
A
L
 
F
R
 
R
I
 
V
I
 
M
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
Y
 
Y
G
 
P
G
 
M
A
 
S
A
 
A
I
 
S
Y
 
I
V
 
T
A
 
S
E
 
E
H
 
Q
A
 
S
P
 
L
P
 
I
E
 
N
K
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
A
Y
 
L
T
 
L
S
 
A
Y
 
W
I
 
I
Q
 
F
A
 
S
S
 
N
V
 
Q
A
 
G
G
 
W
G
 
G
F
 
T
V
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
C
L
 
V
S
 
A
I
 
T
I
 
L
V
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
C
 
C
R
 
-
F
 
F
L
 
E
I
 
K
P
 
P
A
 
L
D
 
N
A
 
D
F
 
R
A
 
G
A
 
E
W
 
Y
G
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
V
 
I
P
 
Q
F
 
F
L
 
G
L
 
I
S
 
A
L
 
L
I
 
F
L
 
P
L
 
A
A
 
V
I
 
I
S
 
V
L
 
L
W
 
I
M
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
M
S
 
Q
E
 
E
S
 
S
P
 
E
V
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
S
Q
 
K
A
 
N
M
 
M
K
 
K
A
 
S
A
 
P
G
 
G
E
 
E

Sites not aligning to the query:

O42885 Putative inorganic phosphate transporter C8E4.01c from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
29% identity, 29% coverage: 75:233/543 of query aligns to 108:273/572 of O42885

query
sites
O42885
L
 
F
G
 
G
A
 
Q
I
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
Y
 
F
T
 
V
F
 
Y
L
 
G
V
 
K
T
 
E
V
 
M
T
 
V
L
 
I
M
 
V
G
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
V
G
 
L
V
 
V
G
 
I
L
 
A
I
 
M
P
 
P
T
 
K
V
 
S
D
 
I
T
 
H
I
 
S
G
 
P
M
 
L
A
 
S
A
 
K
P
 
M
I
 
M
I
 
W
V
 
V
I
 
F
L
 
C
L
 
W
R
 
R
I
 
W
I
 
L
Q
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
Y
 
Y
G
 
P
G
 
M
A
 
S
A
 
A
I
 
A
Y
 
I
V
 
T
A
 
S
E
 
E
H
 
R
A
 
S
P
 
K
P
 
I
E
 
K
K
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
T
Y
 
L
T
 
I
S
 
S
Y
 
L
I
 
I
Q
 
F
A
 
A
-
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
-
 
G
S
 
T
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
I
V
 
V
L
 
-
S
 
-
I
 
T
I
 
I
V
 
I
V
 
L
L
 
L
A
 
G
C
 
C
R
 
-
F
 
F
L
 
E
I
 
H
P
 
P
A
 
L
D
 
N
A
 
R
F
 
E
A
 
G
A
 
H
W
 
Y
G
 
H
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
V
 
L
P
 
Q
F
 
F
L
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
P
L
 
A
A
 
I
I
 
G
S
 
V
L
 
L
W
 
I
M
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
I
L
 
M
S
 
K
E
 
E
S
 
S
P
 
K
V
 
S
F
 
Y
Q
 
E
A
 
N
M
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
N
E
 
S
T
 
A
S
 
E
G
 
G
N
 
K

Sites not aligning to the query:

Q8NLB7 Gentisate transporter from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) (see paper)
30% identity, 36% coverage: 29:226/543 of query aligns to 52:228/444 of Q8NLB7

query
sites
Q8NLB7
I
 
I
F
 
F
E
x
D
W
 
G
Y
 
Y
D
|
D
F
 
L
F
 
I
I
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
V
A
 
Q
Y
 
S
I
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
K
A
 
E
F
 
-
Y
 
W
A
 
N
T
 
L
D
 
S
N
 
S
E
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
T
L
 
-
L
 
-
V
 
I
W
 
G
S
 
S
T
 
T
F
 
A
A
 
F
V
 
F
G
 
G
F
 
M
A
 
A
F
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
L
 
F
F
 
I
G
 
G
F
 
R
L
 
L
G
 
S
D
 
D
R
|
R
L
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
Y
 
A
T
 
A
F
 
V
L
 
I
V
 
G
T
 
S
V
 
V
T
 
L
L
 
I
M
 
L
G
 
S
I
 
V
A
 
F
T
 
T
A
 
M
G
 
L
V
 
C
G
 
A
L
 
F
I
 
A
P
 
P
T
 
N
V
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
W
I
 
V
V
 
F
I
 
G
L
 
A
L
 
F
R
 
R
I
 
F
I
 
I
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
L
Y
 
V
G
 
P
G
 
S
A
 
V
A
 
N
I
 
A
Y
 
M
V
 
T
A
 
S
E
 
D
H
 
L
A
 
V
P
 
P
P
 
R
E
 
K
K
 
T
R
 
M
G
 
S
Y
 
A
Y
 
W
T
 
A
S
 
T
Y
 
V
I
 
M
Q
 
M
A
 
S
S
 
G
V
 
V
-
 
P
A
 
I
G
 
G
G
 
G
F
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
S
I
 
I
I
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
L
I
 
V
P
 
V
A
 
V
D
 
P
A
 
S
F
 
S
A
 
E
A
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
F
P
 
M
F
 
F
L
 
L
L
 
I
S
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
P
L
 
L
A
 
V
I
 
V
S
 
G
L
 
L
W
 
P
M
 
I
R
 
A
L
 
M
K
 
K
L
 
V
S
 
-
E
 
-
S
 
I
P
 
P
V
 
S
F
 
D
Q
 
K
A
 
A
M
 
I
K
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P36035 Carboxylic acid transporter protein homolog from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
29% identity, 28% coverage: 73:226/543 of query aligns to 188:328/616 of P36035

query
sites
P36035
R
 
R
P
 
S
L
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
F
 
L
L
 
W
G
 
T
D
 
D
R
 
K
L
 
S
G
 
S
R
 
R
K
 
K
Y
 
W
T
 
P
F
 
Y
L
 
I
V
 
T
T
 
C
V
 
L
T
 
F
L
 
L
M
 
F
G
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
Q
A
 
L
G
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
C
I
 
T
P
 
P
T
 
W
V
 
C
D
 
D
T
 
T
I
 
Y
G
 
E
M
 
K
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
F
I
 
L
L
 
G
L
 
V
R
 
R
I
 
W
I
 
I
Q
 
T
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
E
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
C
A
 
A
A
 
S
I
 
A
Y
 
T
V
 
A
A
 
I
E
 
E
H
 
D
A
 
A
P
 
P
P
 
V
E
 
K
K
 
A
R
 
R
G
 
S
Y
 
F
Y
 
L
T
 
S
S
 
G
Y
 
L
I
 
F
Q
 
F
A
 
S
S
 
A
V
 
Y
A
 
A
G
 
M
G
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
S
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
F
V
 
Y
L
 
R
A
 
A
C
 
F
R
 
G
F
 
Y
L
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
F
A
 
R
A
 
D
W
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
K
V
 
I
P
 
L
F
 
F
L
 
W
L
 
F
S
 
S
L
 
I
I
 
F
L
 
L
L
 
P
A
 
I
I
 
L
S
 
L
L
 
I
W
 
F
M
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
L
L
 
W
S
 
P
E
 
E
S
 
T
P
 
K
V
 
Y
F
 
F
-
 
T
Q
 
K
A
 
V
M
 
L
K
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q09852 Putative inorganic phosphate transporter C23D3.12 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
27% identity, 41% coverage: 13:233/543 of query aligns to 39:268/559 of Q09852

query
sites
Q09852
S
 
T
E
 
K
K
 
R
E
 
E
I
 
F
R
 
K
L
 
L
V
 
-
I
 
M
G
 
G
A
 
F
S
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
F
I
 
F
F
 
L
E
 
D
W
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
L
F
 
F
I
 
I
Y
 
I
G
 
N
T
 
L
L
 
V
A
 
S
Y
 
P
I
 
I
L
 
Y
K
 
E
D
 
Y
A
 
L
F
 
Y
Y
 
W
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
G
A
 
K
T
 
K
D
 
P
N
 
H
E
 
Y
T
 
P
L
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
H
-
 
G
L
 
L
V
 
V
W
 
N
S
 
A
T
 
A
F
 
A
A
 
N
V
 
I
G
 
G
F
 
N
A
 
V
F
 
F
R
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
L
 
L
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
Y
 
F
T
 
V
F
 
Y
L
 
G
V
 
K
T
 
E
V
 
M
T
 
I
L
 
V
M
 
V
G
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
V
G
 
L
V
 
V
G
 
I
L
 
A
I
 
L
P
 
P
T
 
K
V
 
S
D
 
I
T
 
P
I
 
T
G
 
P
M
 
L
A
 
G
A
 
K
P
 
M
I
 
M
I
 
W
V
 
I
I
 
F
L
 
A
L
 
W
R
 
R
I
 
W
I
 
L
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
Y
 
Y
G
 
P
G
 
M
A
 
S
A
 
A
I
 
T
Y
 
I
V
 
T
A
 
S
E
 
E
H
 
R
A
 
S
P
 
L
P
 
L
E
 
S
K
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
T
Y
 
L
T
 
L
S
 
S
Y
 
I
I
 
V
Q
 
F
A
 
S
-
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
-
 
G
S
 
T
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
I
V
 
V
L
 
-
S
 
-
I
 
T
I
 
I
V
 
I
V
 
L
L
 
L
A
 
A
C
 
C
R
 
-
F
 
F
L
 
E
I
 
K
P
 
P
A
 
L
D
 
N
A
 
Q
F
 
R
A
 
G
A
 
E
W
 
Y
G
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
V
 
L
P
 
Q
F
 
M
L
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
P
L
 
A
A
 
L
I
 
L
S
 
V
L
 
L
W
 
I
M
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
T
L
 
M
S
 
K
E
 
E
S
 
S
P
 
K
V
 
S
F
 
Y
Q
 
E
A
 
Q
M
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
N
E
 
K
T
 
Y
S
 
T
G
 
D
N
 
N

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_068862398.1 NCBI__GCF_001677335.1:WP_068862398.1
MAQAQAPGTREPSEKEIRLVIGASSAGTIFEWYDFFIYGTLAYILKDAFYATDNETLGLL
LVWSTFAVGFAFRPLGAILFGFLGDRLGRKYTFLVTVTLMGIATAGVGLIPTVDTIGMAA
PIIVILLRIIQGLALGGEYGGAAIYVAEHAPPEKRGYYTSYIQASVAGGFVLSIIVVLAC
RFLIPADAFAAWGWRVPFLLSLILLAISLWMRLKLSESPVFQAMKAAGETSGNPFIESFT
YPGNPKRIFVALFGITGILTTIWYTAFFSGMSFLRGPMHVDDRTVEWVLLVSGLIVMSFY
VIVGKWSDRIGRKKPIIIGAALTLALLFPLFWAMGSLANPGLAKAAERTPIVVSGPACVT
DPFAELFQREQTDCGKILETLTASGVPYTLRMDSALSLTAGGEPIAIDPAWFADGATRRA
GIHAALAPYGFDFAKQQPSIANILGIIGVLLALGMLSALTYGSVAALLSEMFPPKIRYSS
MSIPYHIGAGYLGGFLPLIAGVIVASTGNIYSGLWYTWGVVAFGLVVAWWGIPDGPPKDF
ADE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory