SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_069332196.1 NCBI__GCF_003046325.1:WP_069332196.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ywhA Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z (asuc_0499, target efi-511068) with bound d-xylose
42% identity, 91% coverage: 22:331/341 of query aligns to 2:310/310 of 4ywhA

query
sites
4ywhA
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
M
S
 
S
W
 
I
S
 
D
N
 
D
F
 
L
Q
 
R
E
x
L
E
 
E
R
|
R
W
 
W
K
 
Q
T
 
K
D
 
D
E
 
R
A
 
D
A
 
I
I
 
F
K
 
V
E
 
K
A
 
K
L
 
A
E
 
E
A
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
Y
 
V
V
 
L
S
 
V
A
 
Q
D
 
S
A
 
A
Q
 
N
S
 
G
S
 
D
S
 
D
A
 
S
K
 
A
Q
 
Q
L
 
I
S
 
S
D
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
N
L
 
M
I
 
L
S
 
N
Q
 
K
G
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
I
A
 
P
Q
 
H
D
 
N
A
 
G
D
 
D
A
 
V
I
 
L
G
 
S
P
 
N
A
 
V
V
 
I
Q
 
S
A
 
E
A
 
A
A
 
K
D
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
V
P
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
|
R
L
 
L
I
 
I
E
 
N
D
 
N
-
 
A
N
 
D
R
 
L
A
 
D
F
 
F
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
E
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
D
A
 
A
V
 
I
F
 
I
E
 
K
Q
 
E
A
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
V
 
F
M
 
L
I
 
M
K
 
G
G
 
G
N
 
S
A
 
P
A
 
V
D
|
D
P
 
N
N
|
N
A
 
A
D
 
K
F
 
L
L
 
F
R
 
R
G
 
K
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
M
E
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
K
 
P
A
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
I
T
 
K
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
Y
 
W
T
 
V
D
 
D
S
 
S
W
|
W
L
 
L
P
 
A
A
 
E
N
 
K
A
 
A
Q
 
L
R
 
Q
N
 
I
M
 
M
E
 
E
Q
 
N
I
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
D
 
K
N
 
N
K
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
S
N
|
N
D
 
D
G
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
M
 
L
Q
 
S
G
 
G
-
 
K
I
 
V
P
 
A
V
 
I
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
N
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
V
K
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
V
 
M
S
 
T
V
 
V
W
 
Y
K
|
K
D
 
P
S
 
I
R
 
T
E
 
N
L
 
L
G
 
A
K
 
D
A
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
S
V
 
V
S
 
A
M
 
L
A
 
G
K
 
K
G
 
E
T
 
E
E
 
K
M
 
L
E
 
E
G
 
-
V
 
-
E
 
P
G
 
N
A
 
A
Q
 
K
K
 
L
W
 
N
T
 
N
S
 
G
P
 
L
K
 
K
G
 
-
T
 
-
E
 
E
M
 
V
N
 
D
A
 
A
V
 
Y
F
 
L
L
 
L
E
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
I
-
 
D
S
 
S
V
 
T
V
 
V
V
 
I
D
 
K
A
 
D
G
 
G
W
 
F
I
 
H
G
 
S
K
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
V
C
 
Y
Q
 
K

3ma0A Closed liganded crystal structure of xylose binding protein from escherichia coli (see paper)
41% identity, 87% coverage: 22:316/341 of query aligns to 1:293/313 of 3ma0A

query
sites
3ma0A
Q
 
K
D
 
E
L
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
M
S
 
A
W
 
I
S
 
D
N
 
D
F
 
L
Q
 
R
E
x
L
E
 
E
R
|
R
W
 
W
K
 
Q
T
 
K
D
 
D
E
 
R
A
 
D
A
 
I
I
 
F
K
 
V
E
 
K
A
 
K
L
 
A
E
 
E
A
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
Y
 
V
V
 
F
S
 
V
A
 
Q
D
 
S
A
 
A
Q
 
N
S
 
G
S
 
N
S
 
E
A
 
E
K
 
T
Q
 
Q
L
 
M
S
 
S
D
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
N
L
 
M
I
 
I
S
 
N
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
I
A
 
P
Q
 
Y
D
 
N
A
 
G
D
 
Q
A
 
V
I
 
L
G
 
S
P
 
N
A
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
K
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
|
R
L
 
M
I
 
I
E
 
N
D
 
D
-
 
A
N
 
D
R
 
I
A
 
D
F
 
F
Y
 
Y
L
 
I
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
E
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
L
F
 
V
E
 
D
Q
 
I
A
 
V
P
 
P
K
 
Q
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
V
 
F
M
 
L
I
 
M
K
 
G
G
 
G
N
 
S
A
 
P
A
 
V
D
|
D
P
 
N
N
|
N
A
 
A
D
 
K
F
 
L
L
 
F
R
 
R
G
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
M
E
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
K
 
P
A
 
Y
I
 
V
D
 
D
A
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
I
T
 
K
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
Y
 
W
T
 
V
D
 
D
S
 
G
W
|
W
L
 
L
P
 
P
A
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
L
R
 
K
N
 
I
M
 
M
E
 
E
Q
 
N
I
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
N
 
N
D
 
N
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
S
N
|
N
D
 
D
G
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
M
 
L
Q
 
S
G
 
G
-
 
K
I
 
V
P
 
A
V
 
I
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
I
N
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
A
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
V
 
M
S
 
T
V
 
V
W
 
Y
K
|
K
D
 
P
S
 
I
R
 
T
E
 
L
L
 
L
G
 
A
K
 
N
A
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
S
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
N
G
 
G
T
 
Q
E
 
E
M
 
P
E
 
K
G
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
A
Q
 
D
K
 
T
W
 
T
T
 
L
S
 
N
P
 
N
K
 
G
G
 
L
T
 
K
E
 
D
M
 
V
N
 
P
A
 
S
V
 
R
F
 
L
L
 
L
E
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
D
I
 
V
T
 
N
K
 
K
D
 
N
N
 
N
L
 
I
S
 
K

3uugA Crystal structure of the periplasmic sugar binding protein chve (see paper)
32% identity, 89% coverage: 25:329/341 of query aligns to 4:328/329 of 3uugA

query
sites
3uugA
T
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
A
W
 
M
S
 
P
N
 
T
F
 
K
Q
 
S
E
 
S
E
 
A
R
|
R
W
 
W
K
 
I
T
 
D
D
 
D
E
 
G
A
 
N
A
 
N
I
 
I
K
 
V
E
 
K
A
 
Q
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
T
 
K
Y
 
T
V
 
D
S
 
L
A
 
Q
D
 
Y
A
 
A
Q
 
D
S
 
D
S
 
D
S
 
I
A
 
P
K
 
N
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
N
L
 
M
I
 
V
S
 
T
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
A
A
 
S
Q
 
I
D
 
D
A
 
G
D
 
T
A
 
T
I
 
L
G
 
S
P
 
D
A
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
Q
A
 
A
A
 
G
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
|
R
L
 
L
I
 
I
E
 
R
D
 
N
-
 
S
-
 
G
N
 
D
R
 
V
A
 
S
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
F
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
V
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
T
A
 
S
V
 
I
F
 
T
E
 
D
Q
 
K
A
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
D
P
 
G
K
 
K
G
 
G
-
 
P
-
 
F
N
 
N
Y
 
I
V
 
E
M
 
L
I
 
F
K
 
G
G
 
G
N
 
S
A
 
P
A
 
D
D
|
D
P
 
N
N
|
N
A
 
A
D
 
F
F
 
F
L
 
F
R
 
Y
G
 
D
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
E
 
S
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
K
 
P
A
 
Y
I
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
L
T
 
V
I
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
M
-
 
G
V
 
M
G
 
D
E
 
K
A
 
V
Y
 
G
T
 
T
D
 
L
S
 
R
W
|
W
L
 
D
P
 
P
A
 
A
N
 
T
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
N
 
R
M
 
M
E
 
D
Q
 
N
I
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
A
-
 
Y
-
 
Y
N
 
T
D
 
D
N
 
A
K
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
S
S
 
P
N
x
Y
D
 
D
G
 
G
T
 
L
A
 
S
G
 
I
G
 
G
A
 
I
I
 
I
A
 
S
A
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
G
Q
 
V
G
 
G
M
 
Y
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
D
Q
 
Q
G
 
P
I
 
L
P
 
P
-
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
A
D
 
E
H
 
V
A
 
P
A
 
S
L
 
V
N
 
K
R
 
S
I
 
I
A
 
I
K
 
A
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
T
 
Y
V
 
S
S
 
T
V
 
I
W
 
F
K
|
K
D
 
D
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
K
A
 
V
A
 
T
A
 
V
E
 
N
I
 
M
A
 
V
V
 
N
S
 
A
M
 
V
A
 
M
K
 
E
G
 
G
T
 
K
E
 
E
M
 
P
E
 
E
G
 
-
V
 
V
E
 
N
G
 
D
A
 
T
Q
 
K
K
 
T
W
 
Y
T
 
E
S
 
N
P
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
V
E
 
K
-
 
V
M
 
V
N
 
P
A
 
S
V
 
Y
F
 
L
L
 
L
E
 
K
P
 
P
I
 
V
A
 
A
I
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
E
N
 
N
L
 
Y
S
 
K
-
 
Q
V
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
Y
I
 
Y
G
 
K
K
 
E
D
 
D
A
 
Q
L
 
L

3urmA Crystal structure of the periplasmic sugar binding protein chve (see paper)
32% identity, 89% coverage: 25:329/341 of query aligns to 4:328/329 of 3urmA

query
sites
3urmA
T
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
A
W
 
M
S
 
P
N
 
T
F
 
K
Q
 
S
E
 
S
E
 
A
R
|
R
W
 
W
K
 
I
T
 
D
D
 
D
E
 
G
A
 
N
A
 
N
I
 
I
K
 
V
E
 
K
A
 
Q
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
T
 
K
Y
 
T
V
 
D
S
 
L
A
 
Q
D
 
Y
A
 
A
Q
 
D
S
 
D
S
 
D
S
 
I
A
 
P
K
 
N
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
N
L
 
M
I
 
V
S
 
T
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
A
A
 
S
Q
 
I
D
 
D
A
 
G
D
 
T
A
 
T
I
 
L
G
 
S
P
 
D
A
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
Q
A
 
A
A
 
G
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
|
R
L
 
L
I
 
I
E
 
R
D
 
N
-
 
S
-
 
G
N
 
D
R
 
V
A
 
S
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
F
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
V
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
T
A
 
S
V
 
I
F
 
T
E
 
D
Q
 
K
A
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
D
P
 
G
K
 
K
G
 
G
-
 
P
-
 
F
N
 
N
Y
 
I
V
 
E
M
 
L
I
 
F
K
 
G
G
 
G
N
 
S
A
 
P
A
 
D
D
|
D
P
 
N
N
|
N
A
 
A
D
 
F
F
 
F
L
 
F
R
 
Y
G
 
D
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
E
 
S
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
K
 
P
A
 
Y
I
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
L
T
 
V
I
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
M
-
 
G
V
 
M
G
 
D
E
 
K
A
 
V
Y
 
G
T
 
T
D
 
L
S
 
R
W
|
W
L
 
D
P
 
P
A
 
A
N
 
T
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
N
 
R
M
 
M
E
 
D
Q
 
N
I
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
A
-
 
Y
-
 
Y
N
 
T
D
 
D
N
 
A
K
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
S
S
 
P
N
 
Y
D
 
D
G
 
G
T
 
L
A
 
S
G
 
I
G
 
G
A
 
I
I
 
I
A
 
S
A
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
G
Q
 
V
G
 
G
M
 
Y
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
D
Q
 
Q
G
 
P
I
 
L
P
 
P
-
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
A
D
 
E
H
 
V
A
 
P
A
 
S
L
 
V
N
 
K
R
 
S
I
 
I
A
 
I
K
 
A
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
T
 
Y
V
 
S
S
 
T
V
 
I
W
 
F
K
|
K
D
 
D
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
K
A
 
V
A
 
T
A
 
V
E
 
N
I
 
M
A
 
V
V
 
N
S
 
A
M
 
V
A
 
M
K
 
E
G
 
G
T
 
K
E
 
E
M
 
P
E
 
E
G
 
-
V
 
V
E
 
N
G
 
D
A
 
T
Q
 
K
K
 
T
W
 
Y
T
 
E
S
 
N
P
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
V
E
 
K
-
 
V
M
 
V
N
 
P
A
 
S
V
 
Y
F
 
L
L
 
L
E
 
K
P
 
P
I
 
V
A
 
A
I
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
E
N
 
N
L
 
Y
S
 
K
-
 
Q
V
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
W
 
Y
I
 
Y
G
 
K
K
 
E
D
 
D
A
 
Q
L
 
L

4ys6A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from clostridium phytofermentans (cphy_1585, target efi- 511156) with bound beta-d-glucose
32% identity, 89% coverage: 26:329/341 of query aligns to 3:323/324 of 4ys6A

query
sites
4ys6A
V
 
V
G
 
G
V
 
V
S
 
A
W
 
M
S
 
P
N
 
T
F
 
K
Q
 
D
E
 
L
E
 
Q
R
|
R
W
|
W
K
 
N
T
 
Q
D
 
D
E
 
G
A
 
S
A
 
N
I
 
M
K
 
E
E
 
K
A
 
Q
L
 
L
E
 
K
A
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
D
-
 
L
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
A
 
N
D
 
D
A
 
V
Q
 
Q
S
 
T
S
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
Q
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
N
L
 
M
I
 
I
S
 
S
Q
 
N
G
 
G
V
 
C
D
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
A
A
 
S
Q
 
I
D
 
E
A
 
G
D
 
D
A
 
S
I
 
L
G
 
G
P
 
T
A
 
V
V
 
L
Q
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
K
D
 
K
E
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
|
R
L
 
L
I
 
I
-
 
M
-
 
N
E
 
S
D
 
D
N
 
A
R
 
V
A
 
S
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
Y
E
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
T
M
 
K
Q
 
Q
A
 
G
R
 
E
A
 
Y
V
 
I
F
 
K
E
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
L
Q
 
E
A
 
T
P
 
A
K
 
K
G
 
G
-
 
P
-
 
F
N
 
N
Y
 
L
V
 
E
M
 
I
I
 
F
K
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
P
A
 
G
D
|
D
P
 
N
N
|
N
A
 
A
D
 
R
F
 
F
L
 
F
R
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
E
 
D
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
K
 
P
A
 
Y
I
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
D
 
V
I
 
L
T
 
V
I
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
A
V
 
F
G
 
E
E
 
K
A
 
V
Y
 
A
T
 
T
D
 
A
S
 
G
W
|
W
L
 
S
P
 
T
A
 
E
N
 
T
A
 
A
Q
 
Q
R
 
N
N
 
R
M
 
M
E
 
D
Q
 
A
I
 
I
L
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
T
 
Y
A
 
A
N
 
D
D
 
G
N
 
T
K
 
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
C
S
 
S
N
|
N
D
 
D
G
 
S
T
 
T
A
 
A
G
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
G
 
Y
M
 
K
Q
 
G
G
 
E
I
 
W
P
 
P
-
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
C
D
 
D
H
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
V
N
 
K
R
 
N
I
 
M
A
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
K
Q
 
Q
T
 
S
V
 
M
S
 
S
V
 
I
W
 
F
K
|
K
D
 
D
S
 
T
R
 
R
E
 
T
L
 
L
G
 
A
K
 
S
A
 
Q
A
 
V
A
 
V
E
 
K
I
 
M
A
 
V
V
 
D
S
 
A
M
 
I
A
 
M
K
 
K
G
 
G
T
 
G
E
 
E
M
 
A
E
 
P
G
 
-
V
 
V
E
 
N
G
 
D
A
 
T
Q
 
K
K
 
S
W
 
Y
T
 
D
S
 
N
P
 
G
K
 
N
G
 
G
T
 
I
E
 
-
M
 
V
N
 
P
A
 
S
V
 
Y
F
 
L
L
 
C
E
 
E
P
 
P
I
 
V
A
 
F
I
 
A
T
 
D
K
 
A
D
 
T
N
 
N
L
 
Y
S
 
K
-
 
E
V
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
G
W
 
Y
I
 
Y
G
 
T
K
 
E
D
 
D
A
 
Q
L
 
L

4wwhA Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from mycobacterium smegmatis (msmeg_1704, target efi- 510967) with bound d-galactose
32% identity, 88% coverage: 25:323/341 of query aligns to 4:322/329 of 4wwhA

query
sites
4wwhA
T
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
A
W
 
M
S
 
P
N
 
T
F
 
K
Q
 
S
E
 
S
E
 
E
R
|
R
W
 
W
K
 
V
T
 
A
D
 
D
E
 
G
A
 
Q
A
 
N
I
 
M
K
 
V
E
 
D
A
 
Q
L
 
F
E
 
K
A
 
A
A
 
F
G
 
G
A
 
Y
T
 
D
Y
 
T
V
 
D
S
 
L
A
 
Q
D
 
Y
A
 
G
Q
 
D
S
 
D
S
 
V
S
 
V
A
 
Q
K
 
N
Q
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
N
L
 
M
I
 
I
S
 
T
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
A
A
 
P
Q
 
I
D
 
D
A
 
G
D
 
S
A
 
S
I
 
L
G
 
T
P
 
N
A
 
T
V
 
L
Q
 
Q
A
 
H
A
 
A
A
 
A
D
 
D
E
 
L
G
 
K
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
S
Y
 
Y
D
|
D
R
|
R
L
 
L
I
 
I
E
 
K
-
 
G
-
 
T
D
 
P
N
 
N
R
 
V
A
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
T
E
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
V
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
N
A
 
Y
V
 
I
F
 
V
E
 
D
Q
 
T
A
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
D
P
 
G
K
 
K
G
 
G
-
 
P
-
 
F
N
 
N
Y
 
L
V
 
E
M
 
L
I
 
F
K
 
A
G
 
G
N
 
S
A
 
P
A
 
D
D
|
D
P
 
N
N
|
N
A
 
A
D
 
T
F
 
Y
L
 
F
R
 
F
G
 
Q
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
E
 
S
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
K
 
P
A
 
Y
I
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
I
 
T
V
 
F
G
 
D
E
 
Q
A
 
I
Y
 
A
T
 
T
D
 
L
S
 
R
W
|
W
L
 
D
P
 
G
A
 
G
N
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
S
N
 
R
M
 
M
E
 
D
Q
 
N
I
 
L
L
 
L
T
 
S
-
 
Q
-
 
A
A
 
Y
N
 
T
D
 
S
N
 
G
K
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
S
S
 
P
N
 
Y
D
 
D
G
 
G
T
 
I
A
 
S
G
 
R
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
S
Q
 
A
G
 
G
M
 
Y
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
A
Q
 
K
G
 
P
I
 
L
P
 
P
-
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
V
N
 
K
R
 
S
I
 
I
A
 
V
K
 
A
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
T
 
T
V
 
Q
S
 
T
V
 
V
W
 
F
K
|
K
D
 
D
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
I
 
E
A
 
A
V
 
D
S
 
A
M
 
V
A
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
G
E
 
T
M
 
P
E
 
Q
G
 
-
V
 
V
E
 
N
G
 
D
A
 
T
Q
 
E
K
 
T
W
 
Y
T
 
D
S
 
N
P
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
V
E
 
K
-
 
V
M
 
V
N
 
P
A
 
S
V
 
Y
F
 
L
L
 
L
E
 
D
P
 
P
I
 
V
A
 
S
I
 
V
T
 
D
K
 
K
D
 
S
N
 
N
L
 
Y
-
 
K
S
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
G
W
 
Y

4rxuA Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein caur_1924 from chloroflexus aurantiacus, target efi-511158, in complex with d-glucose
32% identity, 89% coverage: 22:323/341 of query aligns to 2:330/340 of 4rxuA

query
sites
4rxuA
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
T
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
V
W
 
L
S
 
P
N
 
T
F
 
K
Q
 
D
E
|
E
E
 
P
R
|
R
W
 
W
K
 
I
T
 
Q
D
 
D
E
 
E
A
 
T
A
 
R
I
 
F
K
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
T
 
Q
Y
 
V
V
 
E
S
 
I
A
 
L
D
 
F
A
 
S
Q
 
Q
S
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
K
S
 
E
D
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
I
I
 
I
L
 
C
A
 
P
Q
 
H
D
 
D
A
 
G
D
 
T
A
 
A
I
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
R
D
 
A
E
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
S
Y
 
Y
D
|
D
R
|
R
L
 
L
I
 
I
E
 
R
D
 
E
N
 
T
R
 
D
A
 
A
-
 
V
-
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
S
V
 
I
E
 
A
V
 
V
G
 
G
R
 
A
M
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
R
 
Q
A
 
Y
V
 
L
F
 
V
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
P
 
S
-
 
G
K
 
T
G
 
G
N
 
N
-
 
P
Y
 
L
V
 
Y
M
 
L
I
 
Y
K
 
A
G
 
G
N
 
A
A
 
A
A
 
S
D
|
D
P
 
N
N
|
N
A
 
A
D
 
F
F
 
L
L
 
F
R
 
F
G
 
E
G
 
G
Q
 
A
Q
 
W
E
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
K
 
P
A
 
K
I
 
I
D
 
A
A
 
D
G
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
N
-
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
T
-
 
R
-
 
D
-
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
K
I
 
I
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
V
Y
 
-
T
 
T
D
 
T
S
 
N
W
|
W
L
 
D
P
 
F
A
 
N
N
 
T
A
 
A
Q
 
K
R
 
N
N
 
L
M
 
A
E
 
E
Q
 
A
I
 
N
L
 
L
T
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
A
A
 
A
N
 
D
D
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
V
D
 
-
A
 
Y
V
 
I
V
 
L
A
 
A
S
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
G
T
 
T
-
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
I
A
 
A
I
 
D
A
 
A
A
 
F
L
 
A
T
 
A
A
 
D
Q
 
K
G
 
D
M
 
V
Q
 
T
G
 
E
I
 
Y
P
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
A
D
 
E
H
 
K
A
 
A
A
 
S
L
 
V
N
 
Q
R
 
Y
I
 
I
A
 
I
K
 
D
G
 
G
T
 
R
Q
 
Q
T
 
S
V
 
M
S
 
T
V
 
V
W
 
F
K
|
K
D
 
D
S
 
V
R
 
R
E
 
T
L
 
L
G
 
V
K
 
Q
A
 
D
A
 
A
A
 
I
E
 
K
I
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
A
M
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
Q
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
A
 
A
K
 
R
G
 
G
T
 
T
E
 
Y
M
 
N
E
 
N
G
 
G
V
 
K
E
 
K
G
 
D
A
 
V
Q
 
P
K
 
A
W
 
I
T
 
Q
S
 
S
P
 
P
K
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
V
I
 
V
A
 
T
I
 
V
T
 
T
K
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
-
 
R
S
 
A
V
 
A
V
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
G
W
 
Y

P23905 D-galactose/methyl-galactoside binding periplasmic protein MglB; D-galactose-binding periplasmic protein; GBP; D-galactose/D-glucose-binding protein; GGBP from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
29% identity, 91% coverage: 6:316/341 of query aligns to 8:327/332 of P23905

query
sites
P23905
L
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
T
 
S
A
 
L
G
 
L
F
 
F
S
 
G
S
 
A
A
 
H
A
 
A
L
 
H
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
L
 
T
T
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
T
W
 
I
S
 
Y
N
 
K
F
 
Y
Q
 
D
E
x
D
E
 
N
R
 
F
W
 
M
K
 
S
T
 
V
D
 
V
E
 
R
A
 
K
A
 
A
I
 
I
-
 
E
K
 
K
E
 
D
A
 
G
L
 
K
E
 
S
A
 
A
A
 
P
G
 
D
A
 
V
T
 
Q
Y
 
L
V
 
L
S
 
M
A
 
N
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
Q
A
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
N
S
 
D
D
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
I
 
I
L
 
N
A
 
L
Q
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
R
D
 
G
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
F
Y
 
F
D
x
N
R
 
K
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
A
L
 
L
I
 
D
E
 
S
D
 
Y
N
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
T
 
G
F
 
T
D
 
D
N
 
S
V
 
K
E
 
E
V
 
S
G
 
G
R
 
V
M
 
I
Q
 
Q
A
 
G
R
 
D
A
 
L
V
 
I
F
 
A
E
 
K
-
 
H
-
 
W
Q
 
Q
A
 
A
P
 
N
K
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
x
D
-
 
L
-
x
N
-
 
K
-
x
D
-
 
G
-
x
K
-
 
I
N
x
Q
Y
 
Y
V
 
V
M
 
L
I
 
L
K
 
K
G
 
G
N
 
E
A
 
P
A
 
G
D
x
H
P
 
P
N
x
D
A
 
A
D
 
E
F
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
A
G
x
R
Q
 
T
Q
 
T
E
 
Y
V
 
V
L
 
V
Q
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
N
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
I
I
 
Q
T
 
T
I
 
E
V
 
Q
G
 
L
E
 
A
A
 
L
Y
 
D
T
 
T
D
 
A
S
 
M
W
 
W
L
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
Q
A
 
A
Q
 
K
R
 
D
N
 
K
M
 
M
E
 
D
Q
 
A
I
 
W
L
 
L
T
 
S
A
 
G
-
 
P
N
 
N
D
 
A
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
x
E
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
N
N
|
N
D
 
D
G
 
A
T
 
M
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
A
Q
 
H
G
 
N
M
 
K
Q
 
S
G
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
F
G
 
G
Q
 
V
D
|
D
G
 
A
D
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
A
R
 
L
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
M
T
 
A
V
 
G
S
 
T
V
 
V
W
 
L
K
x
N
D
 
D
S
 
A
R
 
N
E
 
N
L
 
Q
G
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
F
E
 
D
I
 
L
A
 
A
V
 
K
S
 
N
M
 
L
A
 
A
K
 
E
G
 
G
T
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
K
 
D
W
 
G
T
 
T
S
 
S
P
 
W
K
 
K
G
 
-
T
 
I
E
 
E
M
 
N
N
 
K
A
 
I
V
 
V
F
 
R
L
 
V
E
 
P
P
 
Y
I
 
V
A
 
G
I
 
V
T
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
S

6ruxA P46, an immunodominant surface protein from mycoplasma hyopneumoniae (see paper)
27% identity, 85% coverage: 25:315/341 of query aligns to 12:369/373 of 6ruxA

query
sites
6ruxA
T
 
S
V
 
I
G
 
R
V
 
I
S
 
A
W
 
L
S
 
T
N
 
D
F
 
P
Q
 
D
E
 
N
E
 
P
R
 
R
W
 
W
-
 
I
-
 
S
-
 
A
K
 
Q
T
 
K
D
 
D
E
 
I
A
 
I
A
 
S
I
 
Y
K
 
V
E
 
D
A
 
E
L
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
S
T
 
T
Y
 
I
V
 
T
-
 
K
S
 
N
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
N
S
 
N
S
 
W
A
 
L
K
 
T
Q
 
Q
L
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
Q
A
 
A
L
 
N
I
 
L
S
 
S
Q
 
P
G
 
A
V
 
P
D
 
K
A
 
G
L
 
F
I
 
I
I
 
I
L
 
A
A
 
P
Q
 
E
D
 
N
A
 
G
D
 
S
A
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
T
A
 
A
V
 
V
Q
 
N
A
 
T
A
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
I
 
I
-
 
T
-
 
G
E
 
S
D
 
D
N
 
K
R
 
Y
A
 
D
F
 
W
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
E
M
 
L
Q
 
Q
A
 
G
R
 
L
A
 
S
V
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
A
F
 
F
E
 
D
Q
 
S
A
 
I
P
 
D
K
 
Q
G
 
M
N
 
N
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
S
Y
 
F
V
 
Y
M
 
T
I
 
I
K
 
A
G
 
G
N
 
S
A
 
Q
A
 
D
D
|
D
P
 
N
N
 
N
A
 
S
D
 
Q
F
 
Y
L
 
F
R
 
Y
G
 
N
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
E
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
M
D
 
K
A
 
N
G
 
S
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
I
-
 
I
D
 
D
I
 
L
T
 
S
I
 
P
V
 
E
G
 
G
E
 
E
-
 
N
-
 
A
A
 
V
Y
 
Y
T
 
V
D
 
P
S
 
G
W
|
W
L
 
N
P
 
Y
A
 
G
N
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
Q
N
 
R
M
 
I
E
 
Q
Q
 
S
I
 
F
L
 
L
T
 
T
A
 
I
N
 
N
D
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
G
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
 
K
A
 
A
V
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
F
V
 
L
A
 
A
S
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
G
T
 
M
A
 
A
G
 
E
G
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
K
L
 
L
T
 
K
A
 
L
Q
 
E
G
 
G
M
 
F
-
 
D
-
 
T
Q
 
Q
G
 
K
I
 
I
P
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
Y
D
 
N
H
 
D
A
 
K
A
 
A
L
 
K
N
 
T
R
 
F
I
 
I
A
 
K
K
 
D
G
 
G
T
 
D
Q
 
Q
T
 
N
V
 
M
S
 
T
V
 
I
W
 
Y
K
 
K
D
 
P
S
 
D
R
 
K
E
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
V
E
 
E
I
 
V
-
 
L
A
 
R
V
 
V
S
 
L
M
 
I
A
 
A
K
 
K
G
 
K
T
 
N
E
 
K
-
 
A
-
 
S
M
 
R
E
 
S
G
 
E
V
 
V
E
 
E
G
 
N
A
 
E
Q
 
L
K
 
K
W
 
A
T
 
K
S
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
N
-
 
Q
-
 
T
-
 
Y
-
 
K
-
 
V
K
 
Q
G
 
G
T
 
K
E
 
N
M
 
I
N
 
N
A
 
T
V
 
I
F
 
L
L
 
V
E
 
S
P
 
P
I
 
V
A
 
I
I
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
A
N
 
N
L
 
V

6s3tA P46, an immunodominant surface protein from mycoplasma hyopneumoniae (see paper)
27% identity, 85% coverage: 25:315/341 of query aligns to 14:371/374 of 6s3tA

query
sites
6s3tA
T
 
S
V
 
I
G
 
R
V
 
I
S
 
A
W
 
L
S
 
T
N
x
D
F
 
P
Q
 
D
E
 
N
E
 
P
R
 
R
W
|
W
-
 
I
-
 
S
-
 
A
K
 
Q
T
 
K
D
 
D
E
 
I
A
 
I
A
 
S
I
 
Y
K
 
V
E
 
D
A
 
E
L
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
S
T
 
T
Y
 
I
V
 
T
-
 
K
S
 
N
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
N
S
 
N
S
 
W
A
 
L
K
 
T
Q
 
Q
L
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
Q
A
 
A
L
 
N
I
 
L
S
 
S
Q
 
P
G
 
A
V
 
P
D
 
K
A
 
G
L
 
F
I
 
I
I
 
I
L
 
A
A
 
P
Q
 
E
D
 
N
A
 
G
D
 
S
A
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
T
A
 
A
V
 
V
Q
 
N
A
 
T
A
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
R
|
R
L
 
L
I
 
I
-
 
T
-
 
G
E
 
S
D
 
D
N
 
K
R
 
Y
A
 
D
F
 
W
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
E
M
 
L
Q
 
Q
A
 
G
R
 
L
A
 
S
V
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
A
F
 
F
E
 
D
Q
 
S
A
 
I
P
 
D
K
 
Q
G
 
M
N
 
N
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
S
Y
 
F
V
 
Y
M
 
T
I
 
I
K
 
A
G
 
G
N
 
S
A
 
Q
A
 
D
D
|
D
P
 
N
N
 
N
A
 
S
D
 
Q
F
 
Y
L
 
F
R
 
Y
G
 
N
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
E
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
M
D
 
K
A
 
N
G
 
S
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
I
-
 
I
D
 
D
I
 
L
T
 
S
I
 
P
V
 
E
G
 
G
E
 
E
-
 
N
-
 
A
A
 
V
Y
 
Y
T
 
V
D
 
P
S
 
G
W
 
W
L
 
N
P
 
Y
A
 
G
N
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
Q
N
 
R
M
 
I
E
 
Q
Q
 
S
I
 
F
L
 
L
T
 
T
A
 
I
N
 
N
D
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
G
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
 
K
A
 
A
V
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
F
V
 
L
A
 
A
S
 
P
N
 
N
D
 
D
G
 
G
T
 
M
A
 
A
G
 
E
G
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
K
L
 
L
T
 
K
A
 
L
Q
 
E
G
 
G
M
 
F
-
 
D
-
 
T
Q
 
Q
G
 
K
I
 
I
P
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
D
|
D
G
 
Y
D
 
N
H
 
D
A
 
K
A
 
A
L
 
K
N
 
T
R
 
F
I
 
I
A
 
K
K
 
D
G
 
G
T
 
D
Q
 
Q
T
 
N
V
 
M
S
 
T
V
 
I
W
 
Y
K
|
K
D
 
P
S
 
D
R
 
K
E
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
V
E
 
E
I
 
V
-
 
L
A
 
R
V
 
V
S
 
L
M
 
I
A
 
A
K
 
K
G
 
K
T
 
N
E
 
K
-
 
A
-
 
S
M
 
R
E
 
S
G
 
E
V
 
V
E
 
E
G
 
N
A
 
E
Q
 
L
K
 
K
W
 
A
T
 
K
S
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
N
-
 
Q
-
 
T
-
 
Y
-
 
K
-
 
V
K
 
Q
G
 
G
T
 
K
E
 
N
M
 
I
N
 
N
A
 
T
V
 
I
F
 
L
L
 
V
E
 
S
P
 
P
I
 
V
A
 
I
I
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
A
N
 
N
L
 
V

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
33% identity, 76% coverage: 25:283/341 of query aligns to 2:257/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
T
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
V
W
 
I
S
 
S
N
 
T
F
 
L
Q
 
N
E
x
N
E
 
P
R
x
F
W
x
F
K
 
V
T
 
T
D
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
G
I
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
K
L
 
A
E
 
K
A
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
K
Y
 
I
V
 
I
S
 
V
A
 
E
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
S
A
 
S
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
D
L
 
L
I
 
I
S
 
Q
Q
 
Q
G
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
I
 
I
L
 
N
A
 
P
Q
 
V
D
 
D
A
 
S
D
 
D
A
 
A
I
 
V
G
 
V
P
 
T
A
 
A
V
 
I
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
N
D
 
S
E
 
K
G
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
T
Y
 
I
D
|
D
R
|
R
L
 
S
I
 
A
E
 
N
-
 
G
D
 
G
N
 
D
R
 
V
A
 
V
F
 
C
Y
 
H
L
 
I
T
 
A
F
 
S
D
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
K
V
 
G
G
 
G
R
 
E
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
F
V
 
I
F
 
A
E
 
K
Q
 
A
A
 
L
P
 
K
-
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
Y
 
V
V
 
V
M
 
E
I
 
L
K
 
E
G
 
G
N
 
I
A
 
P
A
 
G
D
 
A
P
 
S
N
x
A
A
 
A
D
 
R
F
 
D
L
x
R
R
 
G
G
 
K
G
 
G
Q
 
F
Q
 
D
E
 
E
V
 
A
L
 
I
Q
 
A
K
 
K
A
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
Y
G
 
P
D
 
D
I
 
I
T
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
A
E
 
K
A
 
Q
Y
 
A
T
 
A
D
 
D
S
 
-
W
x
F
L
 
D
P
 
R
A
 
S
N
 
K
A
 
G
Q
 
L
R
 
S
N
 
V
M
 
M
E
 
E
Q
 
N
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
A
 
A
N
 
Q
D
 
P
N
 
-
K
 
K
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
F
A
 
A
S
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
E
T
 
M
A
 
A
G
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
E
A
 
A
Q
 
A
G
 
N
M
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
I
V
 
V
S
 
V
G
 
G
Q
 
F
D
|
D
G
 
G
D
 
T
H
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
K
R
 
A
I
 
I
A
 
K
K
 
E
G
 
G
T
 
K
Q
 
M
T
 
A
V
 
A
S
 
T
V
 
I
W
 
A
K
x
Q
D
 
Q
S
 
P
R
 
A
E
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
S
A
 
L
A
 
G
A
 
V
E
 
E
I
 
M
A
 
A
V
 
D
S
 
K
M
 
Y
A
 
L
K
 
K
G
 
G
T
 
E
E
 
K
M
 
I

P0AEE5 D-galactose/methyl-galactoside binding periplasmic protein MglB; D-galactose-binding periplasmic protein; GBP; D-galactose/D-glucose-binding protein; GGBP from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
28% identity, 91% coverage: 6:316/341 of query aligns to 8:327/332 of P0AEE5

query
sites
P0AEE5
L
|
L
A
x
S
A
|
A
V
|
V
V
x
M
A
|
A
T
x
S
A
x
M
G
x
L
F
|
F
S
x
G
S
x
A
A
|
A
A
|
A
L
x
H
A
|
A
Q
 
A
D
 
D
L
 
T
T
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
T
W
 
I
S
 
Y
N
 
K
F
 
Y
Q
 
D
E
x
D
E
 
N
R
 
F
W
 
M
K
 
S
T
 
V
D
 
V
E
 
R
A
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
E
E
 
Q
A
 
D
L
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
P
G
 
D
A
 
V
T
 
Q
Y
 
L
V
 
L
S
 
M
A
 
N
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
Q
A
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
N
S
 
D
D
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
I
 
I
L
 
N
A
 
L
Q
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
R
D
 
G
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
F
Y
 
F
D
x
N
R
 
K
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
A
L
 
L
I
 
D
E
 
S
D
 
Y
N
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
T
 
G
F
 
T
D
 
D
N
 
S
V
 
K
E
 
E
V
 
S
G
 
G
R
 
I
M
 
I
Q
 
Q
A
 
G
R
 
D
A
 
L
V
 
I
F
 
A
E
 
K
Q
 
H
-
 
W
-
 
A
A
 
A
P
 
N
K
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
x
D
-
 
L
-
x
N
-
 
K
-
x
D
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
N
x
Q
Y
 
F
V
 
V
M
 
L
I
 
L
K
 
K
G
 
G
N
 
E
A
 
P
A
 
G
D
x
H
P
 
P
N
x
D
A
 
A
D
 
E
F
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
A
G
x
R
Q
 
T
Q
 
T
E
 
Y
V
 
V
L
 
I
Q
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
N
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
I
I
 
K
T
 
T
I
 
E
V
 
Q
G
 
L
E
 
Q
A
 
L
Y
 
D
T
 
T
D
 
A
S
 
M
W
 
W
L
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
Q
A
 
A
Q
 
K
R
 
D
N
 
K
M
 
M
E
 
D
Q
 
A
I
 
W
L
 
L
T
 
S
A
 
G
-
 
P
N
 
N
D
 
A
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
x
E
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
N
N
|
N
D
 
D
G
 
A
T
 
M
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
A
Q
 
H
G
 
N
M
 
K
Q
 
S
G
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
F
G
 
G
Q
 
V
D
|
D
G
 
A
D
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
A
R
 
L
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
L
T
 
A
V
 
G
S
 
T
V
 
V
W
 
L
K
x
N
D
 
D
S
 
A
R
 
N
E
 
N
L
 
Q
G
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
F
E
 
D
I
 
L
A
 
A
V
 
K
S
 
N
M
 
L
A
 
A
K
 
D
G
 
G
T
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
A
G
 
D
A
 
G
Q
 
T
K
 
N
W
 
W
T
 
K
S
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
I
E
 
D
M
 
N
N
 
K
A
 
V
V
 
V
F
 
R
L
 
V
E
 
P
P
 
Y
I
 
V
A
 
G
I
 
V
T
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4yo7A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi- 511484) with bound myo-inositol
28% identity, 80% coverage: 26:299/341 of query aligns to 9:281/287 of 4yo7A

query
sites
4yo7A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
S
W
 
I
S
 
S
N
 
N
F
 
L
Q
x
D
E
 
E
E
 
F
R
 
L
W
 
T
K
 
Y
T
 
M
D
 
Q
E
 
D
A
 
A
A
 
M
I
 
K
K
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
A
E
 
N
A
 
Y
A
 
P
G
 
D
A
 
F
T
 
E
Y
 
F
V
 
I
S
 
F
A
 
S
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
S
A
 
T
K
 
Q
Q
 
Q
L
 
M
S
 
A
D
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
N
L
 
F
I
 
I
S
 
S
Q
 
R
G
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
I
I
 
V
L
 
N
A
 
P
Q
 
V
D
 
D
A
 
T
D
 
T
A
 
S
I
 
A
G
 
V
P
 
D
A
 
I
V
 
V
Q
 
N
A
 
M
A
 
V
A
 
N
D
 
D
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
I
Y
 
A
D
x
N
R
|
R
L
 
T
I
 
F
E
 
D
-
 
G
-
 
V
D
 
D
N
 
Q
R
 
A
A
 
T
F
 
A
Y
 
F
L
 
V
T
 
G
F
 
S
D
 
E
N
 
S
V
 
I
E
 
Q
V
 
S
G
 
G
R
 
L
M
 
L
Q
 
Q
A
 
M
R
 
E
A
 
E
V
 
V
F
 
A
E
 
K
Q
 
L
A
 
L
-
 
N
P
 
N
K
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
I
V
 
A
M
 
I
I
 
M
K
 
D
G
 
G
N
 
E
A
 
L
A
 
G
D
 
H
P
 
E
N
 
A
A
 
Q
D
 
I
F
 
M
L
x
R
R
 
T
G
 
E
G
 
G
Q
 
N
Q
 
K
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
Q
 
E
K
 
E
A
 
H
I
 
-
D
 
D
A
 
G
G
 
L
D
 
E
I
 
V
T
 
V
I
 
L
V
 
Q
G
 
G
E
 
T
A
 
A
Y
 
K
T
 
F
D
 
D
S
 
R
W
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
S
N
 
E
A
 
G
Q
 
M
R
 
R
N
 
L
M
 
M
E
 
E
Q
 
N
I
 
W
L
 
L
T
 
N
A
 
S
N
 
G
D
 
-
N
 
T
K
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
N
N
|
N
D
 
D
G
 
E
T
 
M
A
 
A
G
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
E
A
 
A
Q
 
V
G
 
G
-
 
K
M
x
L
Q
 
D
G
 
D
I
x
V
P
 
I
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Q
 
I
D
|
D
G
 
A
D
 
T
H
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
E
R
 
A
I
 
M
A
 
K
K
 
E
G
 
G
T
 
K
Q
 
L
T
 
D
V
 
V
S
 
T
V
 
V
W
 
F
K
x
Q
D
 
D
S
 
A
R
 
K
E
 
G
L
 
Q
G
 
G
K
 
A
A
 
T
A
 
S
A
 
V
E
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
Q
M
 
A
A
 
A
K
 
N
G
 
G
T
 
E
E
 
D
M
 
V
E
 
E
G
 
D
V
 
A
E
 
M
G
 
I
A
 
P
Q
 
Y
K
 
E
W
 
L
T
 
V
S
 
T
P
 
P
K
 
E
G
 
N
T
 
V
E
 
E

1gcaA The 1.7 angstroms refined x-ray structure of the periplasmic glucose(slash)galactose receptor from salmonella typhimurium (see paper)
29% identity, 86% coverage: 23:316/341 of query aligns to 2:304/309 of 1gcaA

query
sites
1gcaA
D
 
D
L
 
T
T
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
T
W
 
I
S
 
Y
N
 
K
F
 
Y
Q
 
D
E
x
D
E
 
N
R
x
F
W
 
M
K
 
S
T
 
V
D
 
V
E
 
R
A
 
K
A
 
A
I
 
I
-
 
E
K
 
K
E
 
D
A
 
G
L
 
K
E
 
S
A
 
A
A
 
P
G
 
D
A
 
V
T
 
Q
Y
 
L
V
 
L
S
 
M
A
 
N
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
Q
A
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
N
S
 
D
D
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
I
 
I
L
 
N
A
 
L
Q
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
R
D
 
G
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
F
Y
 
F
D
x
N
R
x
K
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
A
L
 
L
I
 
D
E
 
S
D
 
Y
N
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
T
 
G
F
 
T
D
 
D
N
 
S
V
 
K
E
 
E
V
 
S
G
 
G
R
 
V
M
 
I
Q
 
Q
A
 
G
R
 
D
A
 
L
V
 
I
F
 
A
E
 
K
-
 
H
-
 
W
Q
 
Q
A
 
A
P
 
N
K
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
x
D
-
 
L
-
x
N
-
 
K
-
x
D
-
 
G
-
x
K
-
 
I
N
x
Q
Y
 
Y
V
 
V
M
 
L
I
 
L
K
 
K
G
 
G
N
 
E
A
 
P
A
 
G
D
x
H
P
 
P
N
x
D
A
 
A
D
 
E
F
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
A
G
x
R
Q
 
T
Q
 
T
E
 
Y
V
 
V
L
 
V
Q
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
N
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
I
I
 
Q
T
 
T
I
 
E
V
 
Q
G
 
L
E
 
A
A
 
L
Y
 
D
T
 
T
D
 
A
S
 
M
W
 
W
L
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
Q
A
 
A
Q
 
K
R
 
D
N
 
K
M
 
M
E
 
D
Q
 
A
I
 
W
L
 
L
T
 
S
A
 
G
-
 
P
N
 
N
D
 
A
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
x
E
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
N
N
|
N
D
 
D
G
 
A
T
 
M
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
A
Q
 
H
G
 
N
M
 
K
Q
 
S
G
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
F
G
 
G
Q
 
V
D
|
D
G
 
A
D
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
A
R
 
L
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
M
T
 
A
V
 
G
S
 
T
V
 
V
W
 
L
K
x
N
D
 
D
S
 
A
R
 
N
E
 
N
L
 
Q
G
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
F
E
 
D
I
 
L
A
 
A
V
 
K
S
 
N
M
 
L
A
 
A
K
 
E
G
 
G
T
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
K
 
D
W
 
G
T
 
T
S
 
S
P
 
W
K
 
K
G
 
-
T
 
I
E
 
E
M
 
N
N
 
K
A
 
I
V
 
V
F
 
R
L
 
V
E
 
P
P
 
Y
I
 
V
A
 
G
I
 
V
T
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
S

3ga5A X-ray structure of glucose/galactose receptor from salmonella typhimurium in complex with (2r)-glyceryl-beta-d-galactopyranoside (see paper)
29% identity, 80% coverage: 43:316/341 of query aligns to 16:302/305 of 3ga5A

query
sites
3ga5A
A
 
S
A
 
V
I
 
V
K
 
R
E
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
K
T
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
Q
Y
 
L
V
 
L
S
 
M
A
 
N
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
Q
A
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
N
S
 
D
D
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
I
 
I
L
 
N
A
 
L
Q
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
R
D
 
G
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
F
Y
 
F
D
x
N
R
x
K
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
A
L
 
L
I
 
D
E
 
S
D
 
Y
N
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
T
 
G
F
x
T
D
 
D
N
 
S
V
 
K
E
 
E
V
 
S
G
 
G
R
 
V
M
 
I
Q
 
Q
A
 
G
R
 
D
A
 
L
V
 
I
F
 
A
E
 
K
-
 
H
-
 
W
Q
 
Q
A
 
A
P
 
N
K
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
x
D
-
 
L
-
x
N
-
 
K
-
x
D
-
 
G
-
x
K
-
 
I
N
x
Q
Y
 
Y
V
 
V
M
 
L
I
 
L
K
 
K
G
 
G
N
 
E
A
 
P
A
 
G
D
x
H
P
 
P
N
x
D
A
 
A
D
 
E
F
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
A
G
x
R
Q
 
T
Q
 
T
E
 
Y
V
 
V
L
 
V
Q
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
N
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
I
I
 
Q
T
 
T
I
 
E
V
 
Q
G
 
L
E
 
A
A
 
L
Y
 
D
T
 
T
D
 
A
S
 
M
W
|
W
L
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
Q
A
 
A
Q
 
K
R
 
D
N
 
K
M
 
M
E
 
D
Q
 
A
I
 
W
L
 
L
T
 
S
A
 
G
-
 
P
N
 
N
D
 
A
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
x
E
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
N
N
|
N
D
 
D
G
 
A
T
 
M
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
A
Q
 
H
G
 
N
M
 
K
Q
 
S
G
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
F
G
 
G
Q
 
V
D
|
D
G
 
A
D
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
A
R
 
L
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
M
T
 
A
V
 
G
S
 
T
V
 
V
W
 
L
K
x
N
D
 
D
S
 
A
R
 
N
E
 
N
L
x
Q
G
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
F
E
 
D
I
 
L
A
 
A
V
 
K
S
 
N
M
 
L
A
 
A
K
 
E
G
 
G
T
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
K
 
D
W
 
G
T
 
T
S
 
S
P
 
W
K
 
K
G
 
-
T
 
I
E
 
E
M
 
N
N
 
K
A
 
I
V
 
V
F
 
R
L
 
V
E
 
P
P
 
Y
I
 
V
A
 
G
I
 
V
T
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

A0QYB3 Xylitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
31% identity, 76% coverage: 61:320/341 of query aligns to 71:312/349 of A0QYB3

query
sites
A0QYB3
A
 
A
Q
 
N
S
 
N
S
 
D
S
 
V
A
 
S
K
 
T
Q
 
Q
L
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
A
 
S
L
 
L
I
 
I
S
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
I
I
 
V
L
 
V
A
 
P
Q
 
V
D
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
I
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
K
D
 
S
E
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
L
A
 
A
Y
 
V
D
x
N
R
 
A
L
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
T
-
 
P
N
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
L
 
V
T
 
Q
F
 
P
D
 
D
N
 
D
V
 
V
E
 
A
V
 
A
G
 
G
R
 
A
M
 
Q
Q
 
E
A
 
M
R
 
Q
A
 
M
V
 
M
F
 
A
E
 
D
Q
 
R
-
 
L
A
 
G
P
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
Y
 
I
V
 
V
M
 
I
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
N
 
P
A
 
L
A
 
G
D
 
G
P
 
-
N
 
S
A
 
G
D
 
E
F
 
I
L
 
N
R
|
R
G
 
G
-
 
K
G
 
G
Q
 
I
Q
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
A
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
Y
G
 
P
D
 
D
I
 
I
T
 
K
I
 
V
V
 
L
G
 
A
E
 
K
A
 
D
Y
 
-
T
 
T
D
 
A
S
 
N
W
 
W
L
 
K
P
 
R
A
 
D
N
 
E
A
 
A
Q
 
V
R
 
N
N
 
K
M
 
M
E
 
K
Q
 
N
I
 
W
L
 
I
T
 
S
A
 
S
N
 
F
D
 
G
N
 
P
K
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
D
T
 
M
A
 
G
G
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
M
 
R
Q
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
S
 
V
G
 
G
Q
 
I
D
|
D
G
 
G
D
 
I
H
 
E
A
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
N
R
 
A
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
D
Q
 
F
T
 
I
-
 
G
V
 
T
S
 
S
V
 
L
W
x
Q
K
 
N
D
 
G
S
 
T
R
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
-
K
 
S
A
 
A
A
 
G
A
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
D
S
 
A
M
 
L
A
 
V
K
 
K
G
 
G
T
 
E
E
 
D
M
 
V
E
 
K
G
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
K
 
-
W
 
-
T
 
T
S
 
D
P
 
P
K
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
V
F
 
Y
L
 
V
E
 
M
P
 
P
I
 
-
A
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
D
V
 
V
V
 
A
V
 
I
D
 
E

Sites not aligning to the query:

2gbpA Sugar and signal-transducer binding sites of the escherichia coli galactose chemoreceptor protein (see paper)
27% identity, 86% coverage: 23:316/341 of query aligns to 2:304/309 of 2gbpA

query
sites
2gbpA
D
 
D
L
 
T
T
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
T
W
 
I
S
 
Y
N
 
K
F
 
Y
Q
 
D
E
x
D
E
 
N
R
 
F
W
 
M
K
 
S
T
 
V
D
 
V
E
 
R
A
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
E
E
 
Q
A
 
D
L
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
P
G
 
D
A
 
V
T
 
Q
Y
 
L
V
 
L
S
 
M
A
 
N
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
Q
A
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
N
S
 
D
D
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
I
 
I
L
 
N
A
 
L
Q
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
R
D
 
G
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
F
Y
 
F
D
x
N
R
x
K
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
A
L
 
L
I
 
D
E
 
S
D
 
Y
N
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
T
 
G
F
 
T
D
 
D
N
 
S
V
 
K
E
 
E
V
 
S
G
 
G
R
 
I
M
 
I
Q
 
Q
A
 
G
R
 
D
A
 
L
V
 
I
F
 
A
E
 
K
Q
 
H
-
 
W
-
 
A
A
 
A
P
 
N
K
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
x
D
-
 
L
-
x
N
-
 
K
-
x
D
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
N
x
Q
Y
 
F
V
 
V
M
 
L
I
 
L
K
 
K
G
 
G
N
 
E
A
 
P
A
 
G
D
x
H
P
 
P
N
x
D
A
 
A
D
 
E
F
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
A
G
x
R
Q
 
T
Q
 
T
E
 
Y
V
 
V
L
 
I
Q
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
N
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
I
I
 
K
T
 
T
I
 
E
V
 
Q
G
 
L
E
 
Q
A
 
L
Y
 
D
T
 
T
D
 
A
S
 
M
W
|
W
L
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
Q
A
 
A
Q
 
K
R
 
D
N
 
K
M
 
M
E
 
D
Q
 
A
I
 
W
L
 
L
T
 
S
A
 
G
-
 
P
N
 
N
D
 
A
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
x
E
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
N
N
|
N
D
 
D
G
 
A
T
 
M
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
A
Q
 
H
G
 
N
M
 
K
Q
 
S
G
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
F
G
 
G
Q
 
V
D
|
D
G
 
A
D
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
A
R
 
L
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
L
T
 
A
V
 
G
S
 
T
V
 
V
W
 
L
K
x
N
D
 
D
S
 
A
R
 
N
E
 
N
L
 
Q
G
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
F
E
 
D
I
 
L
A
 
A
V
 
K
S
 
N
M
 
L
A
 
A
K
 
D
G
 
G
T
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
A
G
 
D
A
 
G
Q
 
T
K
 
N
W
 
W
T
 
K
S
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
I
E
 
D
M
 
N
N
 
K
A
 
V
V
 
V
F
 
R
L
 
V
E
 
P
P
 
Y
I
 
V
A
 
G
I
 
V
T
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
A

2qw1A Glucose/galactose binding protein bound to 3-o-methyl d-glucose (see paper)
27% identity, 86% coverage: 23:316/341 of query aligns to 1:303/305 of 2qw1A

query
sites
2qw1A
D
 
D
L
 
T
T
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
T
W
 
I
S
 
Y
N
 
K
F
 
Y
Q
 
D
E
 
D
E
 
N
R
 
F
W
 
M
K
 
S
T
 
V
D
 
V
E
 
R
A
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
E
E
 
Q
A
 
D
L
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
P
G
 
D
A
 
V
T
 
Q
Y
 
L
V
 
L
S
 
M
A
 
N
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
Q
A
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
N
S
 
D
D
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
I
 
I
L
 
N
A
 
L
Q
 
V
D
 
D
A
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
R
D
 
G
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
F
Y
 
F
D
 
N
R
 
K
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
A
L
 
L
I
 
D
E
 
S
D
 
Y
N
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
T
 
G
F
 
T
D
 
D
N
 
S
V
 
K
E
 
E
V
 
S
G
 
G
R
 
I
M
 
I
Q
 
Q
A
 
G
R
 
D
A
 
L
V
 
I
F
 
A
E
 
K
Q
 
H
-
 
W
-
 
A
A
 
A
P
 
N
K
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
x
D
-
 
L
-
x
N
-
 
K
-
x
D
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
N
x
Q
Y
 
F
V
 
V
M
 
L
I
 
L
K
 
K
G
 
G
N
 
E
A
 
P
A
 
G
D
x
H
P
 
P
N
 
D
A
 
A
D
 
E
F
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
A
G
 
R
Q
 
T
Q
 
T
E
 
Y
V
 
V
L
 
I
Q
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
N
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
I
I
 
K
T
 
T
I
 
E
V
 
Q
G
 
L
E
 
Q
A
 
L
Y
 
D
T
 
T
D
 
A
S
 
M
W
|
W
L
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
Q
A
 
A
Q
 
K
R
 
D
N
 
K
M
 
M
E
 
D
Q
 
A
I
 
W
L
 
L
T
 
S
A
 
G
-
 
P
N
 
N
D
 
A
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
x
E
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
N
N
|
N
D
 
D
G
 
A
T
 
M
A
 
A
G
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
A
Q
 
H
G
 
N
M
 
K
Q
 
S
G
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
F
G
 
G
Q
 
V
D
|
D
G
 
A
D
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
A
R
 
L
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
L
T
 
A
V
 
G
S
 
T
V
 
V
W
 
L
K
 
N
D
 
D
S
 
A
R
 
N
E
 
N
L
 
Q
G
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
F
E
 
D
I
 
L
A
 
A
V
 
K
S
 
N
M
 
L
A
 
A
K
 
D
G
 
G
T
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
A
G
 
D
A
 
G
Q
 
T
K
 
N
W
 
W
T
 
K
S
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
I
E
 
D
M
 
N
N
 
K
A
 
V
V
 
V
F
 
R
L
 
V
E
 
P
P
 
Y
I
 
V
A
 
G
I
 
V
T
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
A

4rs3A Crystal structure of carbohydrate transporter a0qyb3 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510969, in complex with xylitol (see paper)
31% identity, 76% coverage: 61:320/341 of query aligns to 38:279/315 of 4rs3A

query
sites
4rs3A
A
 
A
Q
 
N
S
 
N
S
 
D
S
 
V
A
 
S
K
 
T
Q
 
Q
L
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
A
 
S
L
 
L
I
 
I
S
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
I
I
 
V
L
 
V
A
 
P
Q
 
V
D
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
I
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
K
D
 
S
E
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
L
A
 
A
Y
 
V
D
x
N
R
 
A
L
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
T
-
 
P
N
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
L
 
V
T
 
Q
F
 
P
D
 
D
N
 
D
V
 
V
E
 
A
V
 
A
G
 
G
R
 
A
M
 
Q
Q
 
E
A
 
M
R
 
Q
A
 
M
V
 
M
F
 
A
E
 
D
Q
 
R
-
 
L
A
 
G
P
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
Y
 
I
V
 
V
M
 
I
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
N
 
P
A
 
L
A
 
G
D
 
G
P
 
-
N
 
S
A
 
G
D
 
E
F
 
I
L
 
N
R
|
R
G
 
G
-
 
K
G
 
G
Q
 
I
Q
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
A
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
Y
G
 
P
D
 
D
I
 
I
T
 
K
I
 
V
V
 
L
G
 
A
E
 
K
A
 
D
Y
 
-
T
 
T
D
 
A
S
 
N
W
|
W
L
 
K
P
 
R
A
 
D
N
 
E
A
 
A
Q
 
V
R
 
N
N
 
K
M
 
M
E
 
K
Q
 
N
I
 
W
L
 
I
T
 
S
A
 
S
N
 
F
D
 
G
N
 
P
K
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
D
T
 
M
A
 
G
G
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
M
 
R
Q
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
S
 
V
G
 
G
Q
 
I
D
|
D
G
 
G
D
 
I
H
x
E
A
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
N
R
 
A
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
D
Q
 
F
T
 
I
-
 
G
V
 
T
S
 
S
V
 
L
W
x
Q
K
 
N
D
 
G
S
 
T
R
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
-
K
 
S
A
 
A
A
 
G
A
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
D
S
 
A
M
 
L
A
 
V
K
 
K
G
 
G
T
 
E
E
 
D
M
 
V
E
 
K
G
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
K
 
-
W
 
-
T
 
T
S
 
D
P
 
P
K
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
V
F
 
Y
L
 
V
E
 
M
P
 
P
I
 
-
A
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
D
V
 
V
V
 
A
V
 
I
D
 
E

Sites not aligning to the query:

5hkoA Crystal structure of abc transporter solute binding protein msmeg_3598 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510969, in complex with l-sorbitol
31% identity, 76% coverage: 61:320/341 of query aligns to 38:279/314 of 5hkoA

query
sites
5hkoA
A
 
A
Q
 
N
S
 
N
S
x
D
S
 
V
A
x
S
K
 
T
Q
 
Q
L
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
A
 
S
L
 
L
I
 
I
S
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
I
I
 
V
L
 
V
A
 
P
Q
 
V
D
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
I
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
K
D
 
S
E
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
L
A
 
A
Y
 
V
D
x
N
R
x
A
L
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
T
-
 
P
N
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
L
 
V
T
 
Q
F
 
P
D
 
D
N
 
D
V
 
V
E
 
A
V
 
A
G
 
G
R
 
A
M
 
Q
Q
 
E
A
 
M
R
 
Q
A
 
M
V
 
M
F
 
A
E
 
D
Q
 
R
-
 
L
A
 
G
P
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
Y
 
I
V
 
V
M
 
I
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
N
 
P
A
 
L
A
 
G
D
 
G
P
 
-
N
 
S
A
 
G
D
 
E
F
 
I
L
 
N
R
|
R
G
 
G
-
 
K
G
 
G
Q
 
I
Q
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
A
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
Y
G
 
P
D
 
D
I
 
I
T
 
K
I
 
V
V
 
L
G
 
A
E
 
K
A
 
D
Y
 
-
T
 
T
D
 
A
S
 
N
W
|
W
L
 
K
P
 
R
A
 
D
N
 
E
A
 
A
Q
 
V
R
 
N
N
 
K
M
 
M
E
 
K
Q
 
N
I
 
W
L
 
I
T
 
S
A
 
S
N
 
F
D
 
G
N
 
P
K
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
D
T
 
M
A
 
G
G
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
M
 
R
Q
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
I
S
 
V
G
 
G
Q
 
I
D
|
D
G
 
G
D
 
I
H
x
E
A
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
N
R
 
A
I
 
V
A
 
K
K
 
S
G
 
G
T
 
D
Q
 
F
T
 
I
-
 
G
V
 
T
S
 
S
V
 
L
W
x
Q
K
 
N
D
 
G
S
 
T
R
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
-
K
 
S
A
 
A
A
 
G
A
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
D
S
 
A
M
 
L
A
 
V
K
 
K
G
 
G
T
 
E
E
 
D
M
 
V
E
 
K
G
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
K
 
-
W
 
-
T
 
T
S
 
D
P
 
P
K
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
V
F
 
Y
L
 
V
E
 
M
P
 
P
I
 
-
A
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
D
V
 
V
V
 
A
V
 
I
D
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_069332196.1 NCBI__GCF_003046325.1:WP_069332196.1
MHKALLAAVVATAGFSSAALAQDLTVGVSWSNFQEERWKTDEAAIKEALEAAGATYVSAD
AQSSSAKQLSDVEALISQGVDALIILAQDADAIGPAVQAAADEGIPVVAYDRLIEDNRAF
YLTFDNVEVGRMQARAVFEQAPKGNYVMIKGNAADPNADFLRGGQQEVLQKAIDAGDITI
VGEAYTDSWLPANAQRNMEQILTANDNKVDAVVASNDGTAGGAIAALTAQGMQGIPVSGQ
DGDHAALNRIAKGTQTVSVWKDSRELGKAAAEIAVSMAKGTEMEGVEGAQKWTSPKGTEM
NAVFLEPIAITKDNLSVVVDAGWIGKDALCQGVSNGPAPCN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory