SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_073036231.1 NCBI__GCF_900129305.1:WP_073036231.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4gcmB Crystal structure of a thioredoxine reductase (trxb) from staphylococcus aureus subsp. Aureus mu50 at 1.80 a resolution
41% identity, 55% coverage: 227:523/538 of query aligns to 2:301/309 of 4gcmB

query
sites
4gcmB
E
 
E
V
 
I
E
 
D
T
 
F
D
 
D
L
 
I
V
 
A
I
 
I
V
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
M
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
V
 
S
R
 
R
S
 
A
G
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
T
A
 
V
V
 
M
V
 
I
E
|
E
R
|
R
G
 
G
N
 
I
L
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
M
A
 
A
T
 
N
T
|
T
P
 
E
M
 
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
E
R
 
M
V
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
D
L
 
L
V
 
S
D
 
T
I
 
K
M
 
M
V
 
F
S
 
E
H
 
H
A
 
A
L
 
K
E
 
K
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
V
F
 
Y
P
 
Q
N
 
Y
E
 
G
E
x
D
V
x
I
V
 
K
E
 
S
V
 
V
R
 
E
P
 
D
N
 
K
G
 
G
R
 
E
L
 
Y
E
 
K
V
 
V
V
 
I
T
 
N
-
 
F
T
 
G
R
 
N
R
 
K
R
 
E
F
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
S
 
E
Y
 
Y
R
 
K
R
 
K
L
x
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
Q
R
 
E
L
 
L
A
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
C
|
C
S
 
A
T
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
A
L
 
F
Y
 
F
R
 
K
G
 
N
K
 
K
K
 
R
A
 
L
V
 
F
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
N
x
D
S
|
S
A
 
A
V
 
V
T
x
E
E
 
E
A
 
G
L
 
T
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
K
I
 
F
G
 
A
V
 
D
E
 
K
V
 
V
A
 
T
L
 
I
V
 
V
H
 
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
S
 
E
L
 
L
R
|
R
A
 
A
Q
|
Q
E
 
R
H
 
I
L
 
L
V
 
Q
-
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
K
G
 
N
A
 
D
E
 
K
I
 
I
P
 
D
V
 
F
L
 
I
W
 
W
N
 
S
T
 
H
E
 
T
V
 
L
Q
 
K
E
 
S
I
 
I
-
 
N
-
 
E
V
 
K
G
 
D
G
 
G
R
 
K
F
 
-
V
 
V
E
 
G
A
 
S
V
 
V
L
 
T
L
 
L
K
 
T
N
 
S
N
 
T
K
 
K
T
 
D
G
 
G
E
 
S
T
 
E
F
 
E
T
 
T
R
 
H
E
 
E
T
 
A
D
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
Y
I
|
I
G
 
G
Y
 
M
V
 
K
A
 
P
E
 
L
T
 
T
T
 
A
L
 
P
A
 
F
K
 
K
K
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
-
P
 
-
L
 
I
T
 
T
P
 
N
D
 
D
-
 
V
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
R
 
V
H
 
T
D
 
K
G
 
D
S
 
D
H
 
M
R
 
T
T
 
T
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
-
 
R
E
 
D
G
 
K
G
 
G
Y
 
L
R
 
R
Q
|
Q
I
|
I
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
G
A
 
D
G
 
G
A
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
T
 
S
I
 
A
F
 
A
E
 
E

7aawA Thioredoxin reductase from bacillus cereus (see paper)
41% identity, 55% coverage: 225:520/538 of query aligns to 2:300/315 of 7aawA

query
sites
7aawA
A
 
S
E
 
E
E
 
E
V
 
K
E
 
I
T
 
Y
D
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
M
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
T
V
 
S
R
|
R
S
 
A
G
 
N
L
 
L
R
 
S
A
 
T
A
 
L
V
 
M
V
 
L
E
|
E
R
|
R
G
 
G
N
 
I
L
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
M
A
 
A
T
 
N
T
|
T
P
 
E
M
x
D
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
S
 
E
R
 
S
V
 
I
P
 
L
G
 
G
K
 
P
T
 
D
L
 
L
V
 
S
D
 
N
I
 
K
M
 
M
V
 
F
S
 
E
H
 
H
A
 
A
L
 
K
E
x
K
Y
x
F
V
 
G
E
 
A
I
 
E
F
 
Y
P
 
A
N
 
Y
E
x
G
E
 
D
V
|
V
V
 
K
E
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
D
N
 
G
G
 
K
R
 
E
L
 
Y
E
 
K
-
 
T
V
 
I
V
 
I
T
 
A
T
 
G
R
 
K
R
 
K
R
 
E
F
 
Y
T
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
V
A
|
A
T
x
S
G
|
G
A
 
A
S
 
E
Y
 
Y
R
 
K
R
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
P
|
P
G
|
G
E
 
E
D
 
T
R
x
E
L
 
L
A
 
G
G
|
G
R
 
R
G
|
G
V
|
V
S
 
S
Y
 
Y
C
 
C
S
 
A
T
 
V
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
A
L
 
F
Y
x
F
R
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
E
A
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
V
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
S
E
 
K
V
 
V
A
 
T
L
 
I
V
 
V
H
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
S
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
H
 
I
L
 
L
V
 
Q
-
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
Q
G
 
N
A
 
E
E
 
K
I
 
V
P
 
D
V
 
F
L
 
I
W
 
W
N
 
N
T
 
H
E
 
T
V
 
I
Q
 
K
E
|
E
I
 
I
-
x
N
-
 
E
V
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
K
F
 
-
V
 
V
E
 
G
A
 
S
V
 
V
L
 
T
L
 
L
K
 
V
N
 
D
N
 
V
K
 
N
T
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
K
T
 
E
R
 
V
E
 
K
T
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
G
 
G
Y
 
M
V
 
L
A
 
P
E
 
L
T
 
S
T
 
K
L
 
P
A
 
F
K
 
V
K
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
T
L
 
-
T
 
N
P
 
E
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
L
R
 
E
H
 
T
D
 
N
G
 
E
S
 
R
H
 
M
R
 
E
T
 
T
A
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
-
 
R
E
 
E
G
 
K
G
 
M
Y
 
L
R
 
R
Q
|
Q
I
|
I
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
G
A
 
D
G
 
G
A
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
T
 
S

7aawB Thioredoxin reductase from bacillus cereus (see paper)
41% identity, 54% coverage: 231:520/538 of query aligns to 5:297/311 of 7aawB

query
sites
7aawB
D
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
M
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
T
V
 
S
R
 
R
S
 
A
G
 
N
L
 
L
R
 
S
A
 
T
A
 
L
V
 
M
V
 
L
E
|
E
R
|
R
G
 
G
N
 
I
L
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
M
A
 
A
T
 
N
T
|
T
P
 
E
M
x
D
V
 
V
E
|
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
S
 
E
R
 
S
V
 
I
P
 
L
G
 
G
K
 
P
T
 
D
L
 
L
V
 
S
D
 
N
I
 
K
M
 
M
V
 
F
S
 
E
H
 
H
A
 
A
L
 
K
E
 
K
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
E
F
 
Y
P
 
A
N
 
Y
E
x
G
E
x
D
V
|
V
V
 
K
E
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
D
N
 
G
G
 
K
R
 
E
L
 
Y
E
 
K
-
 
T
V
 
I
V
 
I
T
 
A
T
 
G
R
 
K
R
 
K
R
 
E
F
 
Y
T
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
V
A
 
A
T
x
S
G
|
G
A
 
A
S
 
E
Y
|
Y
R
 
K
R
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
T
R
 
E
L
 
L
A
 
G
G
|
G
R
 
R
G
|
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
C
 
C
S
 
A
T
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
x
A
L
x
F
Y
x
F
R
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
E
A
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
N
x
D
S
|
S
A
 
A
V
 
V
T
x
E
E
 
E
A
 
G
L
 
V
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
S
E
 
K
V
 
V
A
 
T
L
 
I
V
 
V
H
|
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
S
 
T
L
 
L
R
|
R
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
H
 
I
L
 
L
V
 
Q
-
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
Q
G
 
N
A
 
E
E
 
K
I
 
V
P
 
D
V
 
F
L
 
I
W
 
W
N
 
N
T
 
H
E
 
T
V
 
I
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
-
 
N
-
 
E
V
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
K
F
 
-
V
 
V
E
 
G
A
 
S
V
 
V
L
 
T
L
 
L
K
 
V
N
 
D
N
 
V
K
 
N
T
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
K
T
 
E
R
 
V
E
 
K
T
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
Y
I
|
I
G
 
G
Y
 
M
V
 
L
A
 
P
E
 
L
T
 
S
T
 
K
L
 
P
A
 
F
K
 
V
K
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
T
L
 
-
T
 
N
P
 
E
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
L
R
 
E
H
 
T
D
 
N
G
 
E
S
 
R
H
 
M
R
 
E
T
 
T
A
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
-
 
R
E
 
E
G
 
K
G
 
M
Y
 
L
R
 
R
Q
|
Q
I
|
I
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
G
A
 
D
G
 
G
A
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
T
 
S

2q7vA Crystal structure of deinococcus radiodurans thioredoxin reductase (see paper)
42% identity, 54% coverage: 229:519/538 of query aligns to 7:304/313 of 2q7vA

query
sites
2q7vA
E
 
D
T
 
Y
D
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
T
V
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
S
A
 
T
A
 
L
V
 
I
V
 
L
E
|
E
R
x
K
G
 
G
N
 
M
L
x
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
x
I
A
 
A
T
 
W
T
 
S
P
 
E
M
x
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
P
R
 
E
-
 
P
V
 
I
P
 
A
G
 
G
K
 
M
T
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
Q
I
 
R
M
 
M
V
 
H
S
 
Q
H
 
Q
A
 
A
L
 
E
E
 
K
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
K
F
 
V
P
 
E
N
 
M
E
 
D
E
|
E
V
|
V
V
 
Q
E
 
G
V
 
V
R
 
Q
P
 
H
N
 
D
G
 
A
R
 
T
-
 
S
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
L
 
F
E
 
T
V
 
V
V
 
R
T
 
G
T
 
Y
R
 
N
R
 
G
R
 
E
F
 
Y
T
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
S
 
D
Y
 
P
R
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
D
R
 
N
L
 
F
A
 
W
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
T
C
|
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
A
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
M
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
K
I
 
F
G
 
A
V
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
T
L
 
V
V
 
I
H
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
S
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
N
E
 
K
-
 
V
H
 
A
L
 
Q
V
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
A
G
 
N
A
 
P
E
 
K
I
 
M
P
 
K
V
 
F
L
 
I
W
 
W
N
 
D
T
 
T
E
 
A
V
 
V
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
Q
G
 
G
G
 
A
R
 
D
F
 
S
V
 
V
E
 
S
A
 
G
V
 
V
L
 
K
L
 
L
K
 
R
N
 
N
N
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
V
F
 
S
T
 
E
R
 
L
E
 
A
T
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
V
A
 
P
E
 
N
T
 
T
T
 
A
L
 
F
A
 
V
K
 
K
K
 
D
L
 
T
G
 
-
L
 
V
P
 
S
L
 
L
T
 
R
P
 
D
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
R
 
D
H
 
V
D
 
R
G
 
D
S
 
E
H
 
I
R
 
Y
T
 
T
A
 
N
I
 
I
P
 
P
G
 
M
V
 
L
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
E
 
S
G
 
D
G
 
Y
-
 
I
Y
 
Y
R
 
R
Q
|
Q
I
x
L
V
 
A
T
 
T
A
x
S
T
 
V
A
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
M

5uwyA The crystal structure of thioredoxin reductase from streptococcus pyogenes mgas5005
39% identity, 55% coverage: 231:527/538 of query aligns to 6:305/306 of 5uwyA

query
sites
5uwyA
D
 
D
L
 
T
V
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
M
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
N
L
 
L
R
 
S
A
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
E
|
E
R
x
Q
G
 
G
N
 
A
L
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
M
A
 
N
T
 
N
T
|
T
P
 
F
M
 
D
V
 
I
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
S
 
D
R
 
H
V
 
I
P
 
S
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
M
I
 
K
M
 
M
V
 
-
S
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
Y
E
 
E
Y
 
P
V
 
L
E
 
E
I
 
K
F
 
F
P
 
N
N
 
V
E
 
E
E
 
N
V
 
I
V
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
x
V
-
 
Q
E
 
K
V
 
I
R
 
E
P
 
N
N
 
F
G
 
G
R
 
D
L
 
Y
E
 
K
V
 
C
V
 
V
T
 
L
T
 
T
R
 
E
R
 
D
-
 
A
R
 
S
F
 
Y
T
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
S
 
K
Y
|
Y
R
 
R
R
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
E
R
 
Y
L
 
Y
A
 
T
G
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
C
 
C
S
 
A
T
 
V
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
A
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
D
K
 
Q
K
 
D
A
 
L
V
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
H
 
Y
L
 
L
H
 
T
H
 
Q
I
 
F
G
 
A
V
 
K
E
 
K
V
 
V
A
 
T
L
 
V
V
 
V
H
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
S
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
H
 
I
L
 
L
V
 
Q
-
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
A
G
 
N
A
 
D
E
 
K
I
 
V
P
 
D
V
 
F
L
 
I
W
 
W
N
 
D
T
 
S
E
 
V
V
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
V
 
Q
G
 
G
G
 
N
R
 
D
F
 
I
-
 
K
V
 
V
E
 
S
A
 
N
V
 
V
L
 
L
L
 
I
K
 
E
N
 
N
N
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
V
F
 
T
T
 
D
R
 
H
E
 
A
T
 
F
D
 
G
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
Y
I
 
V
G
 
G
Y
 
M
V
 
N
A
 
P
E
x
V
T
 
T
T
 
G
L
 
M
A
 
V
K
 
K
K
 
D
L
 
L
G
 
E
L
 
I
P
 
T
L
 
-
T
 
D
P
 
S
D
 
E
G
 
G
F
 
W
V
 
I
R
 
I
H
 
T
D
 
D
G
 
D
S
 
H
H
 
M
R
 
R
T
 
T
A
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
T
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
-
 
R
E
 
Q
G
 
K
G
 
D
Y
 
L
R
 
R
Q
|
Q
I
|
I
V
 
T
T
 
T
A
 
A
T
 
V
A
 
G
A
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
Q
T
 
G
I
 
V
F
 
Y
E
 
H
D
 
Y
L
 
L
S
 
E
N
 
S

3ctyB Crystal structure of t. Acidophilum thioredoxin reductase (see paper)
37% identity, 56% coverage: 226:524/538 of query aligns to 1:302/305 of 3ctyB

query
sites
3ctyB
E
 
K
E
 
E
V
 
R
E
 
D
T
 
F
D
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
|
V
G
|
G
G
 
A
G
 
G
P
 
A
A
|
A
G
 
G
L
 
F
T
 
S
A
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
F
R
 
S
A
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
L
E
x
D
R
x
K
G
 
A
N
 
V
L
x
A
G
 
G
G
|
G
Q
x
L
V
x
T
A
 
A
T
 
E
T
x
A
P
|
P
M
x
L
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
L
G
 
G
L
 
F
S
 
K
R
 
S
V
 
I
P
 
V
G
 
G
K
 
S
T
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
K
I
 
L
M
 
F
V
 
A
S
 
D
H
 
H
A
 
A
L
 
A
E
 
N
Y
 
Y
V
 
A
E
 
K
I
 
I
F
 
R
P
 
E
N
 
G
E
 
V
E
 
E
V
|
V
V
 
R
E
 
S
V
 
I
R
 
K
P
 
K
-
 
T
N
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
E
 
D
V
 
I
V
 
E
T
 
T
T
 
N
R
 
D
R
 
D
R
 
T
F
 
Y
T
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
Y
V
 
V
L
 
I
L
 
I
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
 
T
S
 
T
Y
 
H
R
 
K
R
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
S
R
 
E
L
 
Y
A
 
F
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
T
S
 
S
Y
 
Y
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
Y
 
F
R
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
R
A
 
V
V
 
V
V
 
T
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
S
|
S
A
 
G
V
 
A
T
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
I
H
 
S
L
 
M
H
 
S
H
 
E
I
 
Y
G
 
V
V
 
K
E
 
N
V
 
V
A
 
T
L
 
I
V
 
I
H
 
E
R
 
Y
R
 
M
D
 
P
S
 
K
L
 
Y
R
 
M
A
 
C
Q
 
E
E
 
N
H
 
A
L
 
Y
V
 
V
K
 
Q
A
 
E
L
 
I
E
 
K
G
 
K
A
 
R
E
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
Y
L
 
I
W
 
M
N
 
N
T
 
A
E
 
Q
V
 
V
Q
 
T
E
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
-
 
D
G
 
G
R
 
K
F
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
K
L
 
Y
K
 
K
N
 
D
N
 
R
K
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
K
T
 
L
R
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
Y
I
 
V
G
 
G
Y
 
L
V
 
I
A
 
P
E
x
Q
T
 
T
T
 
S
L
 
F
A
 
L
K
 
K
K
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
V
P
 
K
L
 
L
T
 
D
P
 
E
D
 
R
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
R
 
V
H
 
V
D
 
D
G
 
S
S
 
R
H
 
Q
R
 
R
T
 
T
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
-
 
T
E
 
S
G
 
G
G
 
N
Y
 
F
R
x
A
Q
|
Q
I
|
I
V
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
V
A
 
G
A
 
D
G
 
G
A
 
C
A
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
S
I
 
L
F
 
Y
E
 
S
D
 
D

5mh4A Crystal structure of lactococcus lactis thioredoxin reductase (fr conformation) (see paper)
37% identity, 54% coverage: 231:523/538 of query aligns to 3:298/303 of 5mh4A

query
sites
5mh4A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
M
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
M
Y
 
Y
A
 
T
V
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
E
L
 
M
R
 
K
A
 
T
A
 
L
V
 
L
V
 
L
E
|
E
R
|
R
G
 
G
N
x
V
L
x
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
x
M
A
 
N
T
 
N
T
|
T
P
 
A
M
x
E
V
 
I
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
S
 
E
R
 
T
V
 
I
P
 
M
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
-
D
 
S
I
 
M
M
 
K
V
 
M
S
 
A
H
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
E
Y
 
G
V
 
L
E
 
G
I
 
V
F
 
E
P
 
N
N
 
A
E
 
Y
E
x
G
V
 
F
V
|
V
E
 
T
-
 
G
V
 
I
R
 
E
P
 
D
N
 
H
G
 
G
R
 
D
L
 
Y
E
 
K
-
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
T
T
 
E
R
 
D
R
 
D
R
 
E
F
 
F
T
 
I
A
 
T
R
 
K
A
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
S
 
N
Y
 
H
R
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
E
R
 
E
L
 
Y
A
 
G
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
C
|
C
S
 
A
T
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
A
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
N
K
 
Q
K
 
E
A
 
I
V
 
L
V
 
V
V
x
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
N
x
D
S
|
S
A
 
A
V
 
V
T
x
E
E
|
E
A
 
A
L
 
L
H
 
Y
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
G
V
 
Q
E
 
S
V
 
V
A
 
T
L
 
I
V
 
M
H
|
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
S
 
K
L
 
L
R
|
R
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
H
 
I
L
 
I
-
 
Q
V
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
K
G
 
E
A
 
E
E
 
K
I
 
I
P
 
N
V
 
F
L
 
I
W
 
W
N
 
D
T
 
S
E
 
V
V
 
P
Q
 
M
E
 
E
I
 
I
V
 
K
G
 
G
-
 
D
G
 
D
R
 
K
F
 
K
V
 
I
E
 
Q
A
 
S
V
 
V
L
 
V
L
 
Y
K
 
K
N
 
N
N
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
V
F
 
T
T
 
E
R
 
K
E
 
A
T
 
F
D
 
G
A
 
G
V
 
I
F
 
F
V
 
I
A
 
Y
I
x
V
G
|
G
Y
 
L
V
 
D
A
 
P
E
x
V
T
 
A
T
 
E
L
x
F
A
 
V
K
 
S
K
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
T
L
 
-
T
 
D
P
 
E
D
 
A
G
 
G
F
 
W
V
 
I
R
 
I
H
 
T
D
 
D
G
 
D
S
 
H
H
 
M
R
 
R
T
 
T
A
 
N
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
T
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
V
-
 
R
E
 
Q
G
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
|
R
Q
|
Q
I
|
I
V
 
T
T
 
T
A
 
A
T
 
V
A
 
G
A
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
T
 
E
I
 
A
F
 
Y
E
 
K

8ccmA Crystal structure of mycobacterium smegmatis thioredoxin reductase in complex with compound 2-06
42% identity, 54% coverage: 231:519/538 of query aligns to 4:296/305 of 8ccmA

query
sites
8ccmA
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
V
x
I
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
K
A
 
P
A
 
L
V
 
V
V
 
F
E
|
E
R
x
G
G
 
T
N
x
Q
L
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
x
A
V
x
L
A
 
M
T
 
T
T
|
T
P
 
T
M
 
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
R
R
 
E
-
 
G
V
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
M
D
 
D
I
 
Q
M
 
M
V
 
R
S
 
E
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
R
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
D
F
 
L
P
 
R
N
 
M
E
 
E
E
x
D
V
|
V
V
 
D
E
 
A
V
 
V
R
 
Q
P
 
L
N
 
E
G
 
G
R
 
P
L
 
V
E
 
K
-
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
G
R
 
D
R
 
E
R
 
T
F
 
H
T
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
x
M
G
|
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
A
R
|
R
R
x
H
L
|
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
x
T
C
 
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
D
K
 
Q
K
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
A
 
A
V
 
M
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
T
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
R
E
 
S
V
 
V
A
 
T
L
 
L
V
 
I
H
 
H
R
|
R
R
 
R
D
 
D
S
 
E
L
 
F
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
-
 
I
H
 
M
L
 
L
V
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
R
E
 
A
G
 
N
A
 
E
E
 
K
I
 
I
P
 
T
V
 
F
L
 
L
W
 
T
N
 
N
T
 
T
E
|
E
V
x
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
V
 
E
G
 
G
G
 
D
R
 
P
F
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
S
T
 
K
R
 
L
E
 
D
T
 
V
D
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
|
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
D
A
 
P
E
 
R
T
 
S
T
 
E
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
G
L
 
Q
G
 
-
L
 
V
P
 
E
L
 
L
T
 
D
P
 
D
D
 
E
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
R
 
K
H
 
V
D
 
Q
G
 
G
-
 
R
S
 
T
H
 
T
R
 
Y
T
 
T
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
-
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
H
G
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
 
I
T
 
T
A
|
A
T
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
I

8cclA Crystal structure of mycobacterium smegmatis thioredoxin reductase in complex with fragment f2x-entry a09
42% identity, 54% coverage: 231:519/538 of query aligns to 4:296/305 of 8cclA

query
sites
8cclA
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
V
x
I
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
K
A
 
P
A
 
L
V
 
V
V
 
F
E
|
E
R
x
G
G
 
T
N
x
Q
L
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
x
A
V
x
L
A
 
M
T
 
T
T
|
T
P
 
T
M
 
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
R
R
 
E
-
 
G
V
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
M
D
 
D
I
 
Q
M
 
M
V
 
R
S
 
E
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
R
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
D
F
 
L
P
 
R
N
 
M
E
 
E
E
x
D
V
|
V
V
 
D
E
 
A
V
 
V
R
 
Q
P
 
L
N
 
E
G
 
G
R
 
P
L
 
V
E
 
K
-
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
G
R
 
D
R
 
E
R
 
T
F
 
H
T
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
x
M
G
|
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
A
R
 
R
R
 
H
L
|
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
x
T
C
 
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
D
K
 
Q
K
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
A
 
A
V
 
M
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
T
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
R
E
 
S
V
 
V
A
 
T
L
 
L
V
 
I
H
 
H
R
|
R
R
 
R
D
 
D
S
 
E
L
 
F
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
-
 
I
H
 
M
L
 
L
V
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
R
E
 
A
G
 
N
A
 
E
E
 
K
I
 
I
P
 
T
V
 
F
L
 
L
W
 
T
N
 
N
T
 
T
E
|
E
V
x
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
V
 
E
G
 
G
G
 
D
R
 
P
F
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
S
T
 
K
R
 
L
E
 
D
T
 
V
D
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
D
A
 
P
E
 
R
T
 
S
T
 
E
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
G
L
 
Q
G
 
-
L
 
V
P
 
E
L
 
L
T
 
D
P
 
D
D
 
E
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
R
 
K
H
 
V
D
 
Q
G
 
G
-
 
R
S
 
T
H
 
T
R
 
Y
T
 
T
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
-
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
H
G
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
 
I
T
 
T
A
|
A
T
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
I

8cckA Crystal structure of mycobacterium smegmatis thioredoxin reductase in complex with fragment f2x-entry h07
42% identity, 54% coverage: 231:519/538 of query aligns to 4:296/305 of 8cckA

query
sites
8cckA
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
V
 
I
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
K
A
 
P
A
 
L
V
 
V
V
 
F
E
|
E
R
x
G
G
 
T
N
x
Q
L
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
x
A
V
x
L
A
 
M
T
 
T
T
|
T
P
 
T
M
 
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
R
R
 
E
-
 
G
V
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
M
D
 
D
I
 
Q
M
 
M
V
 
R
S
 
E
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
R
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
D
F
 
L
P
 
R
N
 
M
E
 
E
E
x
D
V
|
V
V
 
D
E
 
A
V
 
V
R
 
Q
P
 
L
N
 
E
G
 
G
R
 
P
L
 
V
E
 
K
-
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
G
R
 
D
R
 
E
R
 
T
F
 
H
T
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
x
M
G
|
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
A
R
|
R
R
x
H
L
|
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
x
T
C
 
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
D
K
 
Q
K
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
V
|
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
A
 
A
V
 
M
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
T
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
R
E
 
S
V
 
V
A
 
T
L
 
L
V
 
I
H
 
H
R
|
R
R
 
R
D
 
D
S
 
E
L
 
F
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
-
 
I
H
 
M
L
 
L
V
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
R
E
 
A
G
 
N
A
 
E
E
 
K
I
 
I
P
 
T
V
 
F
L
 
L
W
 
T
N
 
N
T
 
T
E
|
E
V
x
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
V
 
E
G
 
G
G
 
D
R
 
P
F
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
S
T
 
K
R
 
L
E
 
D
T
 
V
D
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
D
A
 
P
E
 
R
T
 
S
T
 
E
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
G
L
 
Q
G
 
-
L
 
V
P
 
E
L
 
L
T
 
D
P
 
D
D
 
E
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
R
 
K
H
 
V
D
 
Q
G
 
G
-
 
R
S
 
T
H
 
T
R
 
Y
T
 
T
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
-
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
H
G
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
 
I
T
 
T
A
|
A
T
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
I

8ccjA Crystal structure of mycobacterium smegmatis thioredoxin reductase in complex with NADPH
42% identity, 54% coverage: 231:519/538 of query aligns to 4:296/305 of 8ccjA

query
sites
8ccjA
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
V
x
I
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
K
A
 
P
A
 
L
V
 
V
V
 
F
E
|
E
R
x
G
G
 
T
N
x
Q
L
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
x
A
V
x
L
A
 
M
T
 
T
T
|
T
P
 
T
M
 
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
R
R
 
E
-
 
G
V
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
M
D
 
D
I
 
Q
M
 
M
V
 
R
S
 
E
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
R
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
D
F
 
L
P
 
R
N
 
M
E
 
E
E
x
D
V
|
V
V
 
D
E
 
A
V
 
V
R
 
Q
P
 
L
N
 
E
G
 
G
R
 
P
L
 
V
E
 
K
-
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
G
R
 
D
R
 
E
R
 
T
F
 
H
T
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
x
M
G
|
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
x
T
C
 
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
D
K
 
Q
K
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
N
x
D
S
|
S
A
 
A
V
 
M
T
x
E
E
 
E
A
 
A
L
 
T
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
R
E
 
S
V
 
V
A
 
T
L
 
L
V
 
I
H
|
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
S
 
E
L
 
F
R
|
R
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
-
 
I
H
 
M
L
 
L
V
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
R
E
 
A
G
 
N
A
 
E
E
 
K
I
 
I
P
 
T
V
 
F
L
 
L
W
 
T
N
 
N
T
 
T
E
 
E
V
 
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
V
 
E
G
 
G
G
 
D
R
 
P
F
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
S
T
 
K
R
 
L
E
 
D
T
 
V
D
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
|
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
D
A
 
P
E
 
R
T
 
S
T
 
E
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
G
L
 
Q
G
 
-
L
 
V
P
 
E
L
 
L
T
 
D
P
 
D
D
 
E
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
R
 
K
H
 
V
D
 
Q
G
 
G
-
 
R
S
 
T
H
 
T
R
 
Y
T
 
T
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
-
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
H
G
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
 
I
T
 
T
A
|
A
T
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
I

5uthA Crystal structure of thioredoxin reductase from mycobacterium smegmatis in complex with fad
42% identity, 54% coverage: 231:519/538 of query aligns to 5:297/306 of 5uthA

query
sites
5uthA
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
V
x
I
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
K
A
 
P
A
 
L
V
 
V
V
x
F
E
|
E
R
x
G
G
 
T
N
x
Q
L
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
x
A
V
x
L
A
 
M
T
 
T
T
 
T
P
 
T
M
 
E
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
R
R
 
E
-
 
G
V
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
M
D
 
D
I
 
Q
M
 
M
V
 
R
S
 
E
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
R
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
D
F
 
L
P
 
R
N
 
M
E
 
E
E
x
D
V
|
V
V
 
D
E
 
A
V
 
V
R
 
Q
P
 
L
N
 
E
G
 
G
R
 
P
L
 
V
E
 
K
-
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
G
R
 
D
R
 
E
R
 
T
F
 
H
T
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
x
M
G
|
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
T
C
|
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
D
K
 
Q
K
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
A
 
A
V
 
M
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
T
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
R
E
 
S
V
 
V
A
 
T
L
 
L
V
 
I
H
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
S
 
E
L
 
F
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
-
 
I
H
 
M
L
 
L
V
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
R
E
 
A
G
 
N
A
 
E
E
 
K
I
 
I
P
 
T
V
 
F
L
 
L
W
 
T
N
 
N
T
 
T
E
 
E
V
 
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
V
 
E
G
 
G
G
 
D
R
 
P
F
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
S
T
 
K
R
 
L
E
 
D
T
 
V
D
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
D
A
 
P
E
 
R
T
 
S
T
 
E
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
G
L
 
Q
G
 
-
L
 
V
P
 
E
L
 
L
T
 
D
P
 
D
D
 
E
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
R
 
K
H
 
V
D
 
Q
G
 
G
-
 
R
S
 
T
H
 
T
R
 
Y
T
 
T
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
-
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
H
G
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
 
I
T
 
T
A
|
A
T
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
I

3f8rA Crystal structure of sulfolobus solfataricus thioredoxin reductase b3 in complex with two NADP molecules (see paper)
37% identity, 54% coverage: 231:522/538 of query aligns to 8:302/308 of 3f8rA

query
sites
3f8rA
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
V
|
V
G
|
G
G
x
L
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
A
L
 
Y
T
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
Y
 
Y
A
 
S
V
 
A
R
 
R
S
 
Y
G
 
M
L
 
L
R
 
K
A
 
T
A
 
L
V
 
V
V
 
I
E
 
G
R
x
E
G
 
-
N
x
T
L
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
L
A
 
T
T
 
E
T
 
A
P
 
G
M
 
I
V
 
V
E
 
D
N
 
D
Y
 
Y
P
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
I
R
 
E
V
 
I
P
 
Q
G
 
A
K
 
S
T
 
D
L
 
M
V
 
I
D
 
K
I
 
V
M
 
F
V
 
N
S
 
K
H
 
H
A
 
I
L
 
E
E
 
K
Y
 
Y
V
 
-
E
 
E
I
 
V
F
 
P
P
 
V
N
 
L
E
 
L
E
 
D
V
x
I
V
|
V
E
 
E
V
 
K
R
 
I
P
 
E
N
 
N
G
 
-
R
 
R
L
 
E
E
 
F
V
 
V
V
 
V
T
 
K
T
 
T
R
 
K
R
 
R
R
 
K
-
 
G
-
 
E
F
 
F
T
 
K
A
 
A
R
 
D
A
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
x
G
T
x
I
G
|
G
A
 
V
S
 
K
Y
 
R
R
|
R
R
 
K
L
|
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
Q
R
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
C
|
C
S
 
S
T
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
R
 
K
G
 
N
K
 
R
K
 
V
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
x
D
S
|
S
A
 
A
V
 
L
T
x
E
E
 
G
A
 
A
L
 
E
H
 
I
L
 
L
H
 
S
H
 
S
I
 
Y
G
 
S
V
 
T
E
 
K
V
 
V
A
 
Y
L
 
L
V
 
I
H
 
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
S
 
T
L
 
F
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
E
 
P
H
 
I
L
x
Y
V
 
V
K
 
E
A
 
T
L
 
V
E
 
K
G
 
K
A
 
K
-
 
P
E
 
N
I
 
V
P
 
E
V
 
F
L
 
V
W
 
L
N
 
N
T
 
S
E
 
V
V
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
V
 
K
G
 
G
G
 
D
R
 
K
F
 
V
V
 
V
E
 
K
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
L
 
V
K
 
E
N
 
N
N
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
I
F
 
K
T
 
E
R
 
L
E
 
N
T
 
V
D
 
N
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
E
I
|
I
G
 
G
Y
 
F
V
 
D
A
 
P
E
 
P
T
 
T
T
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
K
K
 
S
L
 
N
G
 
G
L
 
I
P
 
E
L
 
T
T
 
D
P
 
T
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
R
 
K
H
 
V
D
 
D
G
 
E
S
 
W
H
 
M
R
 
R
T
 
T
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
E
 
T
G
 
S
-
 
A
-
 
W
-
x
L
G
|
G
Y
 
F
R
|
R
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
T
T
 
S
I
 
A
F
 
Y

3f8pD Structure of sulfolobus solfataricus trxr-b3 (see paper)
37% identity, 54% coverage: 231:522/538 of query aligns to 8:304/310 of 3f8pD

query
sites
3f8pD
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
V
|
V
G
|
G
G
x
L
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
A
L
 
Y
T
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
Y
 
Y
A
 
S
V
 
A
R
 
R
S
 
Y
G
 
M
L
 
L
R
 
K
A
 
T
A
 
L
V
 
V
V
 
I
E
x
G
R
 
E
G
 
-
N
x
T
L
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
L
A
 
T
T
 
E
T
 
A
P
 
G
M
 
I
V
 
V
E
 
D
N
 
D
Y
 
Y
P
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
I
R
 
E
V
 
I
P
 
Q
G
 
A
K
 
S
T
 
D
L
 
M
V
 
I
D
 
K
I
 
V
M
 
F
V
 
N
S
 
K
H
 
H
A
 
I
L
 
E
E
 
K
Y
 
Y
V
 
-
E
 
E
I
 
V
F
 
P
P
 
V
N
 
L
E
 
L
E
 
D
V
x
I
V
|
V
E
 
E
-
 
K
V
 
I
R
 
E
P
 
N
N
 
R
G
 
G
R
 
D
L
 
E
E
 
F
V
 
V
V
 
V
T
 
K
T
 
T
R
 
K
R
 
R
R
 
K
-
 
G
-
 
E
F
 
F
T
 
K
A
 
A
R
 
D
A
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
x
G
T
x
I
G
|
G
A
 
V
S
 
K
Y
 
R
R
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
Q
R
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
C
|
C
S
 
S
T
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
R
 
K
G
 
N
K
 
R
K
 
V
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
A
 
A
V
 
L
T
 
E
E
 
G
A
 
A
L
 
E
H
 
I
L
 
L
H
 
S
H
 
S
I
 
Y
G
 
S
V
 
T
E
 
K
V
 
V
A
 
Y
L
 
L
V
 
I
H
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
S
 
T
L
 
F
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
E
 
P
H
 
I
L
 
Y
V
 
V
K
 
E
A
 
T
L
 
V
E
 
K
G
 
K
A
 
K
-
 
P
E
 
N
I
 
V
P
 
E
V
 
F
L
 
V
W
 
L
N
 
N
T
 
S
E
 
V
V
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
V
 
K
G
 
G
G
 
D
R
 
K
F
 
V
V
 
V
E
 
K
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
L
 
V
K
 
E
N
 
N
N
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
I
F
 
K
T
 
E
R
 
L
E
 
N
T
 
V
D
 
N
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
V
 
D
A
 
P
E
 
P
T
 
T
T
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
K
K
 
S
L
 
N
G
 
G
L
 
I
P
 
E
L
 
T
T
 
D
P
 
T
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
R
 
K
H
 
V
D
 
D
G
 
E
S
 
W
H
 
M
R
 
R
T
 
T
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
E
 
T
G
 
S
-
 
A
-
 
W
-
 
L
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
T
T
 
S
I
 
A
F
 
Y

P9WHH1 Thioredoxin reductase; TR; TRXR; EC 1.8.1.9 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
40% identity, 57% coverage: 231:538/538 of query aligns to 16:322/335 of P9WHH1

query
sites
P9WHH1
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
V
V
 
I
G
 
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
L
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
P
A
 
L
V
 
V
V
 
F
E
|
E
R
x
G
G
x
T
N
x
S
L
x
F
G
|
G
G
|
G
Q
x
A
V
 
L
A
 
M
T
 
T
T
 
T
P
 
T
M
 
D
V
 
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
R
R
 
N
-
 
G
V
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
M
D
 
D
I
 
E
M
 
M
V
 
R
S
 
E
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
R
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
D
F
 
L
P
 
R
N
 
M
E
 
E
E
 
D
V
|
V
V
 
E
E
 
S
V
 
V
R
 
S
P
 
L
N
 
H
G
 
G
R
 
P
L
 
L
E
 
K
V
 
S
V
 
V
T
 
V
T
 
T
R
 
A
R
 
D
R
 
G
F
 
Q
T
 
T
-
 
H
-
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
A
R
 
R
R
 
Y
L
 
L
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
Q
R
 
E
L
 
L
A
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
S
C
|
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
D
K
 
Q
K
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
|
S
A
 
A
V
 
M
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
T
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
R
E
 
S
V
 
V
A
 
T
L
 
L
V
 
V
H
|
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
S
 
E
L
 
F
R
|
R
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
H
 
I
L
 
M
V
 
L
-
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
R
E
 
N
G
 
N
A
 
D
E
 
K
I
 
I
P
 
R
V
 
F
L
 
L
W
 
T
N
 
N
T
 
H
E
 
T
V
 
V
Q
 
V
E
 
A
I
 
V
V
 
D
G
 
G
G
 
D
R
 
T
F
 
T
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
L
L
 
R
L
 
V
K
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
E
F
 
T
T
 
T
R
 
L
E
 
P
T
 
V
D
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
|
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
E
A
 
P
E
 
R
T
 
S
T
 
G
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
E
L
 
-
G
 
A
L
 
I
P
 
D
L
 
V
T
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
G
F
x
Y
V
 
V
R
 
L
H
 
V
D
 
Q
G
 
G
-
 
R
S
 
T
H
 
T
R
 
S
T
 
T
A
 
S
I
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
 
G
D
|
D
-
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
R
G
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
|
V
T
 
T
A
 
A
T
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
I
S
 
D
N
 
A
P
 
E
Y
 
R
W
 
W
T
 
L
R
 
A
E
 
E
H
 
H
S
 
A
A
 
A
A
 
T
G
 
G

2a87A Crystal structure of m. Tuberculosis thioredoxin reductase (see paper)
40% identity, 57% coverage: 231:538/538 of query aligns to 7:313/313 of 2a87A

query
sites
2a87A
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
V
V
 
I
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
P
A
 
L
V
 
V
V
x
F
E
|
E
R
x
G
G
 
T
N
 
S
L
x
F
G
|
G
G
|
G
Q
x
A
V
x
L
A
 
M
T
 
T
T
|
T
P
 
T
M
x
D
V
|
V
E
 
E
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
R
R
 
N
-
 
G
V
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
M
D
 
D
I
 
E
M
 
M
V
 
R
S
 
E
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
R
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
D
F
 
L
P
 
R
N
 
M
E
 
E
E
x
D
V
|
V
V
 
E
E
 
S
V
 
V
R
 
S
P
 
L
N
 
H
G
 
G
R
 
P
L
 
L
E
 
K
V
 
S
V
 
V
T
 
V
T
 
T
R
 
A
R
 
D
R
 
G
F
 
Q
T
 
T
-
 
H
-
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
x
M
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
A
R
 
R
R
 
Y
L
|
L
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
Q
R
 
E
L
 
L
A
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
S
C
|
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
D
K
 
Q
K
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
N
x
D
S
|
S
A
 
A
V
 
M
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
T
H
 
F
L
 
L
H
 
T
H
 
R
I
 
F
G
 
A
V
 
R
E
 
S
V
 
V
A
 
T
L
 
L
V
 
V
H
|
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
S
 
E
L
 
F
R
|
R
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
H
 
I
L
 
M
V
 
L
-
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
R
E
 
N
G
 
N
A
 
D
E
 
K
I
 
I
P
 
R
V
 
F
L
 
L
W
 
T
N
 
N
T
 
H
E
 
T
V
 
V
Q
 
V
E
 
A
I
 
V
V
 
D
G
 
G
G
 
D
R
 
T
F
 
T
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
L
L
 
R
L
 
V
K
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
E
F
 
T
T
 
T
R
 
L
E
 
P
T
 
V
D
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
|
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
E
A
 
P
E
 
R
T
 
S
T
 
G
L
 
L
A
 
V
K
 
R
K
 
E
L
 
-
G
 
A
L
 
I
P
 
D
L
 
V
T
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
G
F
x
Y
V
 
V
R
 
L
H
 
V
D
 
Q
G
 
G
-
 
R
S
 
T
H
 
T
R
 
S
T
 
T
A
 
S
I
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
-
 
L
V
 
V
E
 
D
G
x
R
G
 
T
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
|
V
T
 
T
A
 
A
T
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
I
S
 
D
N
 
A
P
 
E
Y
 
R
W
 
W
T
 
L
R
 
A
E
 
E
H
 
H
S
 
A
A
 
A
A
 
T
G
 
G

3f8dA Structure of sulfolobus solfataricus thioredoxin reductase mutant c147a (see paper)
37% identity, 54% coverage: 231:522/538 of query aligns to 8:302/308 of 3f8dA

query
sites
3f8dA
D
 
D
L
 
V
V
 
I
I
 
I
V
|
V
G
|
G
G
x
L
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
A
L
 
Y
T
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
Y
 
Y
A
 
S
V
 
A
R
 
R
S
 
Y
G
 
M
L
 
L
R
 
K
A
 
T
A
 
L
V
 
V
V
 
I
E
x
G
R
x
E
G
 
-
N
x
T
L
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
L
A
 
T
T
x
E
T
x
A
P
 
G
M
 
I
V
|
V
E
 
D
N
x
D
Y
 
Y
P
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
I
R
 
E
V
 
I
P
 
Q
G
 
A
K
 
S
T
 
D
L
 
M
V
 
I
D
 
K
I
 
V
M
 
F
V
 
N
S
 
K
H
 
H
A
 
I
L
 
E
E
 
K
Y
 
Y
V
 
-
E
 
E
I
 
V
F
 
P
P
 
V
N
 
L
E
 
L
E
 
D
V
x
I
V
|
V
E
 
E
V
 
K
R
 
I
P
 
E
N
 
N
G
 
-
R
 
R
L
 
E
E
 
F
V
 
V
V
 
V
T
 
K
T
 
T
R
 
K
R
 
R
R
 
K
-
 
G
-
 
E
F
 
F
T
 
K
A
 
A
R
 
D
A
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
x
G
T
x
I
G
|
G
A
 
V
S
 
K
Y
 
R
R
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
Q
R
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
C
|
C
S
 
S
T
 
V
C
x
A
D
|
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
R
 
K
G
 
N
K
 
R
K
 
V
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
A
 
A
V
 
L
T
 
E
E
 
G
A
 
A
L
 
E
H
 
I
L
 
L
H
 
S
H
 
S
I
 
Y
G
 
S
V
 
T
E
 
K
V
 
V
A
 
Y
L
 
L
V
 
I
H
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
S
 
T
L
 
F
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
E
 
P
H
 
I
L
 
Y
V
 
V
K
 
E
A
 
T
L
 
V
E
 
K
G
 
K
A
 
K
-
 
P
E
 
N
I
 
V
P
 
E
V
 
F
L
 
V
W
 
L
N
 
N
T
 
S
E
 
V
V
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
V
 
K
G
 
G
G
 
D
R
 
K
F
 
V
V
 
V
E
 
K
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
L
 
V
K
 
E
N
 
N
N
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
I
F
 
K
T
 
E
R
 
L
E
 
N
T
 
V
D
 
N
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
V
 
D
A
 
P
E
 
P
T
 
T
T
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
K
K
 
S
L
 
N
G
 
G
L
 
I
P
 
E
L
 
T
T
 
D
P
 
T
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
R
 
K
H
 
V
D
 
D
G
 
E
S
 
W
H
 
M
R
 
R
T
 
T
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
E
 
T
G
 
S
-
 
A
-
 
W
-
 
L
G
 
G
Y
 
F
R
|
R
Q
|
Q
I
x
V
V
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
T
T
 
S
I
 
A
F
 
Y

7jypA Structure of thioredoxin reductase from the thermophilic eubacterium thermosipho africanus tcf52b
41% identity, 53% coverage: 231:517/538 of query aligns to 7:296/305 of 7jypA

query
sites
7jypA
D
 
D
L
 
I
V
 
L
I
 
I
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
x
F
E
|
E
R
x
K
G
 
A
N
 
L
L
 
E
G
 
G
G
|
G
Q
x
A
V
 
V
A
 
T
T
 
Q
T
 
T
P
 
H
M
 
V
V
 
V
E
 
E
N
 
N
Y
 
W
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
E
G
 
G
K
 
S
T
 
E
L
 
L
V
 
G
D
 
E
I
 
K
M
 
F
V
 
A
S
 
E
H
 
H
A
 
A
L
 
K
E
 
A
Y
 
F
V
 
G
E
 
A
I
 
E
F
 
I
P
 
I
N
 
T
E
 
A
E
 
E
V
|
V
V
 
L
E
 
K
V
 
I
R
 
S
P
 
Y
N
 
D
G
 
N
R
 
E
L
 
Y
E
 
K
V
 
Y
V
 
V
-
 
E
-
 
L
T
 
D
T
 
N
R
 
G
R
 
K
R
 
K
F
 
V
T
 
K
A
 
G
R
 
K
A
 
V
V
 
L
L
 
I
L
 
Y
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
S
 
V
Y
 
P
R
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
D
 
E
R
 
E
L
 
F
A
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
T
Y
 
Y
C
 
C
S
 
A
T
 
A
C
 
C
D
 
D
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
Y
 
F
R
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
N
 
D
S
|
S
A
 
A
V
 
C
T
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
H
H
 
F
L
 
L
H
 
A
H
 
K
I
 
M
G
 
V
V
 
K
E
 
S
V
 
I
A
 
T
L
 
M
V
 
V
H
x
Q
R
x
N
R
 
L
D
 
P
S
 
Y
L
 
L
R
x
T
A
 
A
Q
 
A
E
 
K
H
 
V
L
 
L
V
 
Q
-
 
D
K
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
N
A
 
K
E
 
N
I
 
V
P
 
K
V
 
V
L
 
I
W
 
L
N
 
N
T
 
S
E
 
L
V
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
V
 
R
G
 
G
G
 
K
R
 
D
F
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
V
L
 
V
K
 
V
N
 
N
N
 
N
K
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
E
F
 
T
T
 
V
R
 
I
E
 
K
T
 
A
D
 
E
A
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
A
 
Y
I
x
V
G
 
G
Y
 
L
V
 
V
A
 
P
E
 
K
T
 
S
T
 
D
L
 
L
A
 
L
K
 
K
K
 
G
L
 
I
G
 
-
L
 
V
P
 
D
L
 
I
T
 
N
P
 
E
D
 
Y
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
R
 
K
H
 
T
D
 
D
G
 
E
S
 
N
H
 
M
R
 
E
T
 
T
A
 
N
I
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
T
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
V
-
 
R
E
 
E
G
 
K
G
 
N
Y
 
L
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
I
A
 
A

P0A9P4 Thioredoxin reductase; TRXR; EC 1.8.1.9 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 54% coverage: 230:519/538 of query aligns to 7:308/321 of P0A9P4

query
sites
P0A9P4
T
 
S
D
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
I
V
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
N
L
 
L
R
 
Q
A
 
P
A
 
V
V
 
L
V
 
I
E
x
T
R
x
G
G
x
M
N
x
E
L
x
K
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
L
A
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
T
M
 
E
V
 
V
E
 
E
N
 
N
Y
 
W
P
 
P
G
 
G
L
 
D
-
 
P
S
 
N
R
 
D
V
 
L
P
 
T
G
 
G
K
 
P
T
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
E
I
 
R
M
 
M
V
 
H
S
 
E
H
 
H
A
 
A
L
 
T
E
 
K
Y
 
F
V
 
E
E
 
T
-
 
E
-
 
I
I
 
I
F
 
F
P
 
D
N
 
H
E
 
I
E
 
N
V
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
L
R
 
Q
P
 
-
N
 
N
G
 
R
R
 
P
L
 
F
E
 
R
V
 
L
V
 
N
T
 
G
T
 
D
R
 
N
R
 
G
R
 
E
F
 
Y
T
 
T
A
 
C
R
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
I
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
A
R
 
R
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
G
 
S
E
 
E
D
 
E
R
 
A
L
 
F
A
 
K
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
A
C
|
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
N
K
 
Q
K
 
K
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
H
 
Y
L
 
L
H
 
S
H
 
N
I
 
I
G
 
A
V
 
S
E
 
E
V
 
V
A
 
H
L
 
L
V
 
I
H
 
H
R
 
R
R
 
R
D
 
D
S
 
G
L
 
F
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
H
 
I
L
 
L
V
 
I
K
 
K
A
 
R
L
 
L
-
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
V
E
 
E
G
 
N
A
 
G
E
 
N
I
 
I
P
 
I
V
 
L
L
 
H
W
 
T
N
 
N
T
 
R
E
 
T
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
V
 
T
G
 
G
G
 
D
R
 
Q
F
 
M
-
 
G
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
D
N
 
T
K
 
Q
T
 
N
G
 
S
E
 
D
T
 
N
F
 
I
-
 
E
T
 
S
R
 
L
E
 
D
T
 
V
D
 
A
A
 
G
V
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
V
 
S
A
 
P
E
 
N
T
 
T
T
 
A
L
 
I
A
 
F
K
 
E
K
 
-
L
 
-
G
 
G
L
 
Q
P
 
L
L
 
E
T
 
L
P
 
E
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
R
 
K
-
 
V
-
 
Q
-
 
S
-
 
G
-
 
I
H
 
H
D
 
G
G
 
N
S
 
A
H
 
T
R
 
Q
T
 
T
A
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
 
G
D
|
D
V
|
V
-
x
M
E
x
D
G
x
H
G
x
I
Y
|
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
 
I
T
 
T
A
 
S
T
 
A
A
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
C
A
 
M
A
 
A
A
 
A
M
 
L

Sites not aligning to the query:

5u63B Crystal structure of putative thioredoxin reductase from haemophilus influenzae
38% identity, 54% coverage: 232:519/538 of query aligns to 12:310/319 of 5u63B

query
sites
5u63B
L
 
L
V
 
L
I
 
I
V
 
L
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
P
A
 
V
V
 
L
V
 
V
E
x
T
R
x
G
G
 
L
N
x
Q
L
 
Q
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
x
L
A
 
T
T
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
E
V
 
I
E
 
E
N
|
N
Y
 
W
P
 
P
G
 
G
-
 
D
L
 
F
S
 
E
R
 
M
V
 
T
P
 
T
G
 
G
K
 
S
T
 
G
L
 
L
V
 
M
D
 
Q
I
 
R
M
 
M
V
 
L
S
 
Q
H
 
H
A
 
A
L
 
E
E
 
K
Y
 
F
V
 
E
E
 
T
I
 
E
F
 
I
P
 
V
N
 
F
E
 
D
E
x
H
V
x
I
V
 
N
E
 
R
V
 
V
R
 
D
P
 
L
N
 
S
G
 
S
R
 
R
-
 
P
L
 
F
E
 
K
V
 
L
V
 
F
T
 
G
T
 
D
R
 
V
R
 
Q
R
 
N
F
 
F
T
 
T
A
 
C
R
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
I
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
A
R
|
R
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
V
 
L
P
 
P
G
 
S
E
 
E
D
 
E
R
 
N
L
 
Y
A
 
K
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
A
C
|
C
S
 
A
T
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
N
K
 
K
K
 
P
A
 
V
V
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
N
 
N
S
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
H
 
Y
L
 
L
H
 
A
H
 
N
I
 
I
G
 
A
V
 
S
E
 
T
V
 
V
A
 
H
L
 
L
V
 
I
H
|
H
R
|
R
R
|
R
D
 
D
S
 
S
L
 
F
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
H
 
I
L
 
L
V
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
K
 
K
A
 
K
L
 
V
E
 
E
G
 
E
A
 
G
E
 
K
I
 
I
P
 
V
V
 
L
L
 
H
W
 
T
N
 
D
T
 
R
E
 
T
V
 
L
Q
 
D
E
 
E
I
 
V
V
 
L
G
 
G
G
 
D
R
 
N
F
 
M
-
 
G
V
 
V
E
 
T
A
 
G
V
 
L
L
 
R
L
 
L
K
 
A
N
 
N
N
 
T
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
K
F
 
E
T
 
E
R
 
L
E
 
K
T
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
A
I
|
I
G
|
G
Y
x
H
V
 
S
A
 
P
E
 
N
T
 
T
T
 
E
L
 
I
A
 
F
K
 
Q
K
 
G
L
 
Q
G
 
-
L
 
L
P
 
E
L
 
L
T
 
N
P
 
N
D
 
G
G
 
Y
F
 
I
V
 
V
R
 
V
H
 
K
D
 
S
G
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
N
S
 
A
H
 
T
R
 
A
T
 
T
A
 
S
I
 
V
P
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
-
 
M
E
 
D
G
 
H
G
 
N
Y
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
I
x
A
V
 
I
T
 
T
A
x
S
T
 
A
A
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
C
A
 
M
A
 
A
A
 
A
M
 
L

Query Sequence

>WP_073036231.1 NCBI__GCF_900129305.1:WP_073036231.1
MARKGGSLPKDVAEHLKNLFDKLPYEVAIHAFSDRRHPEMREAVETFVSMFKDLSRKVRV
MHRDVADPEAAHFHVDRTPMLLFCPDRYRVRYLGLPLGEEGRTLVETILHMGTATDGLSD
QSRKVLSRLEGERRIKVFVSATCPYCPQQAVNAVKAAVARPQAVSVDIVDIEFNPDLADA
YEAFSVPQVVANEVLIAQGAQPEELFMASLVKLEPQTIFIPDSDAEEVETDLVIVGGGPA
GLTAGIYAVRSGLRAAVVERGNLGGQVATTPMVENYPGLSRVPGKTLVDIMVSHALEYVE
IFPNEEVVEVRPNGRLEVVTTRRRFTARAVLLATGASYRRLGVPGEDRLAGRGVSYCSTC
DGPLYRGKKAVVVGGGNSAVTEALHLHHIGVEVALVHRRDSLRAQEHLVKALEGAEIPVL
WNTEVQEIVGGRFVEAVLLKNNKTGETFTRETDAVFVAIGYVAETTLAKKLGLPLTPDGF
VRHDGSHRTAIPGVYTAGDVEGGYRQIVTATAAGAAAAMTIFEDLSNPYWTREHSAAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory