SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_075858469.1 NCBI__GCF_001950255.1:WP_075858469.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 61% coverage: 6:248/399 of query aligns to 16:260/265 of P07821

query
sites
P07821
N
 
N
L
 
I
V
 
S
F
 
F
G
 
R
Y
 
V
G
 
P
S
 
G
A
 
R
K
 
T
L
 
L
F
 
L
A
 
H
G
 
P
I
 
L
N
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
F
L
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
K
F
 
V
S
 
T
V
 
G
I
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
I
 
M
L
 
L
A
 
G
G
 
R
F
 
H
L
 
Q
K
 
P
P
 
P
K
 
S
N
 
E
G
 
G
T
 
E
V
 
I
E
 
L
I
 
L
K
 
D
G
 
A
K
 
Q
E
 
P
I
 
L
L
 
E
K
 
S
L
 
W
P
 
S
A
 
S
K
 
K
A
 
A
R
 
F
A
 
A
K
 
R
L
 
K
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
Q
P
 
L
E
 
P
T
 
P
L
 
A
R
 
E
D
 
G
Y
 
M
T
 
T
V
 
V
W
 
R
D
 
E
T
 
L
V
 
V
M
 
A
M
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
W
Q
 
H
G
 
G
V
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
R
E
 
F
T
 
G
K
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
R
K
 
E
A
 
K
V
 
V
K
 
E
K
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
G
 
P
Y
 
L
E
 
A
E
 
H
R
 
R
T
 
L
L
 
V
L
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
A
Y
 
W
I
 
I
A
 
A
R
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
S
D
 
R
Y
 
C
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
A
Y
 
H
Q
 
Q
V
 
V
K
 
D
I
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
L
L
 
V
K
 
H
N
 
R
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
Q
 
E
-
 
R
G
 
G
I
 
L
A
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
M
A
 
A
S
 
A
F
 
R
F
 
Y
A
 
C
D
 
D
K
 
Y
L
 
L
Y
 
V
L
 
A
F
 
L
S
 
R
E
 
G
G
 
G
K
 
E
L
 
M
I
 
I
T
 
A
-
 
Q
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
M
T
 
R
F
 
G
E
 
E
N
 
T
I
 
L
Y
 
E
K
 
M
A
 
I
Y
 
Y
S
 
G
E
 
I
P
 
P
A
 
M
L
 
G
V
 
I
V
 
L
N
 
P
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
G
G
 
A
I
 
A
P
 
P

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
31% identity, 58% coverage: 1:233/399 of query aligns to 2:233/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
M
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
A
I
 
Q
N
 
H
L
 
L
V
 
A
F
 
K
G
 
S
Y
 
Y
G
 
K
S
 
K
A
 
R
K
 
K
L
 
V
F
 
V
A
 
S
G
 
D
I
 
V
N
 
S
I
 
L
E
 
Q
V
 
V
L
 
E
P
 
S
G
 
G
T
 
Q
F
 
I
S
 
V
V
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
S
L
 
F
K
 
Y
I
 
M
L
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
V
K
 
A
P
 
R
K
 
D
N
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
I
E
 
T
I
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
N
E
 
D
I
 
I
L
 
S
K
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
M
K
 
H
A
 
S
R
 
R
A
 
S
K
 
R
L
 
M
-
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
E
 
S
T
 
I
L
 
F
R
 
R
D
 
K
Y
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
E
D
 
D
T
 
N
V
 
I
M
 
M
M
 
-
G
 
A
R
 
V
Y
 
L
P
 
Q
Y
 
T
Q
 
R
G
 
E
V
 
E
L
 
L
G
 
T
L
 
H
E
|
E
T
 
E
K
 
R
A
 
Q
D
|
D
F
 
-
K
 
-
A
 
K
V
 
L
K
 
E
K
 
D
A
 
L
I
 
L
E
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
S
 
Q
G
 
H
Y
 
I
E
 
R
E
 
K
R
 
S
T
 
A
L
 
G
L
 
M
T
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
Q
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
S
Q
 
V
V
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
K
S
 
K
L
 
I
L
 
I
K
 
E
N
 
H
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
R
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
D
F
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
K
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
I
T
 
A
-
 
E
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
N
F
 
N
E
 
E
N
 
Q
I
 
V
Y
 
K
K
 
Q
A
 
V
Y
 
Y

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
34% identity, 51% coverage: 20:223/399 of query aligns to 23:225/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
I
 
I
N
 
N
I
 
V
E
 
K
V
 
I
L
 
D
P
 
K
G
 
G
T
 
E
F
 
F
S
 
V
V
 
F
I
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
A
F
 
A
L
 
E
K
 
T
P
 
P
K
 
T
N
 
S
G
 
G
T
 
D
V
 
V
E
 
R
I
 
V
K
 
S
G
 
K
K
 
F
E
 
H
I
 
V
L
 
N
K
 
K
L
 
L
P
 
R
A
 
G
K
 
R
A
 
H
R
 
V
A
 
P
K
 
K
L
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
L
 
I
A
 
G
Y
 
C
V
 
V
P
 
F
Q
 
Q
E
 
D
P
 
F
E
 
R
T
 
L
L
 
L
R
 
Q
D
 
Q
Y
 
K
T
 
T
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
F
G
 
A
R
 
L
Y
 
E
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
K
E
 
R
T
 
T
K
 
D
A
 
A
D
 
I
F
 
N
K
 
R
A
 
V
V
 
V
K
 
P
K
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
E
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Y
 
K
E
 
A
E
 
N
R
 
R
T
 
L
L
 
P
L
 
D
T
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
Q
 
N
E
 
R
A
 
P
D
 
L
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
P
F
 
E
Y
 
T
Q
 
S
V
 
R
K
 
D
I
 
I
L
 
M
S
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
E
N
 
R
L
 
I
A
 
N
A
 
R
Q
 
T
G
 
G
I
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
M
V
 
A
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
H
N
 
H
L
 
I
A
 
V
S
 
D
F
 
S
F
 
M
A
 
R
D
 
Q
K
 
R
L
 
V
Y
 
V
L
 
E
F
 
L
S
 
S
E
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
T
 
R
G
 
D
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
E
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
34% identity, 51% coverage: 20:223/399 of query aligns to 23:225/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
I
 
I
N
 
N
I
 
V
E
 
K
V
 
I
L
 
D
P
 
K
G
 
G
T
 
E
F
 
F
S
 
V
V
 
F
I
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
S
G
 
G
K
|
K
T
x
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
A
F
 
A
L
 
E
K
 
T
P
 
P
K
 
T
N
 
S
G
 
G
T
 
D
V
 
V
E
 
R
I
 
V
K
 
S
G
 
K
K
 
F
E
 
H
I
 
V
L
 
N
K
 
K
L
 
L
P
 
R
A
 
G
K
 
R
A
 
H
R
 
V
A
 
P
K
 
K
L
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
L
 
I
A
 
G
Y
 
C
V
 
V
P
 
F
Q
 
Q
E
 
D
P
 
F
E
 
R
T
 
L
L
 
L
R
 
Q
D
 
Q
Y
 
K
T
 
T
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
F
G
 
A
R
 
L
Y
 
E
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
K
E
 
R
T
 
T
K
 
D
A
 
A
D
 
I
F
 
N
K
 
R
A
 
V
V
 
V
K
 
P
K
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
E
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Y
 
K
E
 
A
E
 
N
R
 
R
T
 
L
L
 
P
L
 
D
T
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
Q
 
N
E
 
R
A
 
P
D
 
L
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
P
F
 
E
Y
 
T
Q
 
S
V
 
R
K
 
D
I
 
I
L
 
M
S
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
E
N
 
R
L
 
I
A
 
N
A
 
R
Q
 
T
G
 
G
I
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
M
V
 
A
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
H
N
 
H
L
 
I
A
 
V
S
 
D
F
 
S
F
 
M
A
 
R
D
 
Q
K
 
R
L
 
V
Y
 
V
L
 
E
F
 
L
S
 
S
E
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
T
 
R
G
 
D
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
E
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

A5U7B7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) (see 2 papers)
34% identity, 51% coverage: 20:223/399 of query aligns to 22:224/229 of A5U7B7

query
sites
A5U7B7
I
 
I
N
 
N
I
 
V
E
 
K
V
 
I
L
 
D
P
 
K
G
 
G
T
 
E
F
 
F
S
 
V
V
 
F
I
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
A
F
 
A
L
 
E
K
 
T
P
 
P
K
 
T
N
 
S
G
 
G
T
 
D
V
 
V
E
 
R
I
 
V
K
 
S
G
 
K
K
 
F
E
 
H
I
 
V
L
 
N
K
 
K
L
 
L
P
 
R
A
 
G
K
 
R
A
 
H
R
 
V
A
 
P
K
 
K
L
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
L
 
I
A
 
G
Y
x
C
V
 
V
P
 
F
Q
 
Q
E
 
D
P
 
F
E
 
R
T
 
L
L
 
L
R
 
Q
D
 
Q
Y
 
K
T
 
T
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
F
G
 
A
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
L
G
 
E
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
K
E
 
R
T
 
T
K
 
D
A
 
A
D
 
I
F
 
N
K
 
R
A
 
V
V
 
V
K
 
P
K
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
E
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Y
 
K
E
 
A
E
 
N
R
 
R
T
 
L
L
 
P
L
 
D
T
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
Q
 
N
E
 
R
A
 
P
D
 
L
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
P
F
 
E
Y
 
T
Q
 
S
V
 
R
K
 
D
I
 
I
L
 
M
S
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
E
N
 
R
L
 
I
A
 
N
A
 
R
Q
 
T
G
 
G
I
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
M
V
 
A
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
H
N
 
H
L
 
I
A
 
V
S
 
D
F
 
S
F
 
M
A
 
R
D
 
Q
K
 
R
L
 
V
Y
 
V
L
 
E
F
 
L
S
 
S
E
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
T
 
R
G
 
D
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
E
 
G
V
 
V

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
33% identity, 59% coverage: 12:245/399 of query aligns to 16:250/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
G
 
G
S
 
G
A
x
V
K
 
K
L
x
A
F
 
L
A
 
D
G
 
D
I
 
L
N
 
S
I
 
L
E
 
A
V
 
V
L
 
P
P
 
K
G
 
G
T
 
E
F
 
S
S
 
L
V
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
L
I
 
H
L
 
L
A
 
N
G
 
G
F
 
T
L
 
L
K
 
R
P
 
P
K
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
R
V
 
V
E
 
L
I
 
L
K
 
G
G
 
G
K
 
T
E
 
A
I
 
T
L
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
G
K
 
H
A
 
S
R
 
R
A
 
K
K
 
D
L
 
L
L
 
T
A
 
G
Y
 
W
V
 
R
P
 
R
Q
 
R
E
 
V
P
 
G
E
 
L
T
 
V
L
 
L
R
x
Q
D
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
F
-
 
A
Y
 
T
T
 
T
V
 
V
W
 
F
D
 
E
T
 
D
V
 
V
M
 
S
M
 
F
G
 
G
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
Y
 
L
Q
 
N
G
 
-
V
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
S
T
 
E
K
 
A
A
 
E
D
 
A
F
 
R
K
 
A
A
 
R
V
 
V
K
 
E
K
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
T
 
A
V
 
L
G
 
S
L
 
I
S
 
S
G
 
D
Y
 
L
E
 
R
E
 
D
R
 
R
T
 
P
L
 
T
L
x
H
T
x
M
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
M
E
 
R
A
 
P
D
 
E
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
N
 
A
H
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
A
Y
 
G
Q
 
T
V
 
E
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
S
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
N
 
G
L
 
L
A
 
R
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
T
V
 
L
L
 
V
A
 
F
V
 
S
L
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
V
N
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
A
F
 
A
F
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
V
Y
 
A
L
 
L
F
 
F
S
 
R
E
 
T
G
 
G
K
 
R
L
 
V
I
 
L
T
 
A
-
 
E
G
 
G
E
 
A
A
 
A
K
 
E
E
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
S
F
 
D
E
 
R
-
 
A
N
 
T
I
 
L
Y
 
A
K
 
K
A
 
V
Y
 
A
S
 
L
E
 
R
P
 
P
A
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
N
 
D
H
 
L
P
 
A
V
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
32% identity, 58% coverage: 2:233/399 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
K
 
T
G
 
A
I
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
F
 
K
G
 
A
Y
|
Y
G
 
K
S
 
G
A
x
R
K
 
R
L
x
V
F
 
V
A
 
E
G
 
D
I
 
V
N
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
N
P
 
S
G
 
G
T
 
E
F
 
I
S
 
V
V
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
K
 
Y
I
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
V
K
 
P
P
 
R
K
 
D
N
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
I
E
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
D
E
 
D
I
 
I
L
 
S
K
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
K
 
H
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
E
 
S
T
 
I
L
x
F
R
|
R
D
x
R
Y
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
-
M
 
L
M
 
M
G
 
A
R
 
V
Y
 
L
P
 
Q
Y
 
I
Q
 
R
G
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
A
E
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
E
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
A
K
 
N
K
 
E
A
 
L
I
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
S
 
E
G
 
H
Y
 
L
E
 
R
E
 
D
R
 
S
T
 
M
L
 
G
L
 
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
K
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
S
Q
 
V
V
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
K
S
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
N
 
H
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
I
T
 
A
-
 
H
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
F
 
D
E
 
E
N
 
H
I
 
V
Y
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
32% identity, 58% coverage: 2:233/399 of query aligns to 3:233/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
K
 
T
G
 
A
I
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
F
 
K
G
 
A
Y
 
Y
G
 
K
S
 
G
A
 
R
K
 
R
L
 
V
F
 
V
A
 
E
G
 
D
I
 
V
N
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
N
P
 
S
G
 
G
T
 
E
F
 
I
S
 
V
V
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
T
L
 
F
K
 
Y
I
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
V
K
 
P
P
 
R
K
 
D
N
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
I
E
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
D
E
 
D
I
 
I
L
 
S
K
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
K
 
H
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
E
 
S
T
 
I
L
 
F
R
|
R
D
 
R
Y
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
-
M
 
L
M
 
M
G
 
A
R
 
V
Y
 
L
P
 
Q
Y
 
I
Q
 
R
G
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
A
E
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
E
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
A
K
 
N
K
 
E
A
 
L
I
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
S
 
E
G
 
H
Y
 
L
E
 
R
E
 
D
R
 
S
T
x
M
L
x
G
L
x
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
K
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
S
Q
 
V
V
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
K
S
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
N
 
H
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
I
T
 
A
-
 
H
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
F
 
D
E
 
E
N
 
H
I
 
V
Y
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
32% identity, 58% coverage: 2:233/399 of query aligns to 3:233/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
K
 
T
G
 
A
I
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
F
 
K
G
 
A
Y
|
Y
G
 
K
S
 
G
A
x
R
K
 
R
L
 
V
F
 
V
A
 
E
G
 
D
I
 
V
N
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
N
P
 
S
G
 
G
T
 
E
F
 
I
S
 
V
V
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
K
 
Y
I
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
V
K
 
P
P
 
R
K
 
D
N
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
I
E
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
D
E
 
D
I
 
I
L
 
S
K
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
K
 
H
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
Q
|
Q
E
 
E
P
 
A
E
 
S
T
 
I
L
 
F
R
 
R
D
 
R
Y
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
-
M
 
L
M
 
M
G
 
A
R
 
V
Y
 
L
P
 
Q
Y
 
I
Q
 
R
G
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
A
E
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
E
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
A
K
 
N
K
 
E
A
 
L
I
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
S
 
E
G
 
H
Y
 
L
E
 
R
E
 
D
R
 
S
T
 
M
L
 
G
L
 
Q
T
x
S
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
K
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
S
Q
 
V
V
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
K
S
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
N
 
H
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
I
T
 
A
-
 
H
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
F
 
D
E
 
E
N
 
H
I
 
V
Y
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
32% identity, 58% coverage: 2:233/399 of query aligns to 3:233/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
K
 
T
G
 
A
I
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
F
 
K
G
 
A
Y
|
Y
G
 
K
S
 
G
A
x
R
K
 
R
L
x
V
F
 
V
A
 
E
G
 
D
I
 
V
N
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
N
P
 
S
G
 
G
T
 
E
F
 
I
S
 
V
V
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
K
 
Y
I
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
V
K
 
P
P
 
R
K
 
D
N
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
I
E
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
D
E
 
D
I
 
I
L
 
S
K
 
L
L
 
L
P
 
P
A
x
L
K
x
H
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
P
|
P
Q
|
Q
E
 
E
P
x
A
E
x
S
T
 
I
L
x
F
R
|
R
D
x
R
Y
x
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
-
M
 
L
M
 
M
G
 
A
R
x
V
Y
 
L
P
 
Q
Y
 
I
Q
 
R
G
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
A
E
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
E
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
A
K
 
N
K
 
E
A
 
L
I
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
S
 
E
G
 
H
Y
 
L
E
 
R
E
 
D
R
 
S
T
 
M
L
 
G
L
x
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
K
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
S
Q
 
V
V
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
K
S
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
N
 
H
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
I
T
 
A
-
 
H
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
F
 
D
E
 
E
N
 
H
I
 
V
Y
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
32% identity, 58% coverage: 2:233/399 of query aligns to 3:233/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
K
 
T
G
 
A
I
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
F
 
K
G
 
A
Y
|
Y
G
 
K
S
 
G
A
x
R
K
 
R
L
x
V
F
 
V
A
 
E
G
 
D
I
 
V
N
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
N
P
 
S
G
 
G
T
 
E
F
 
I
S
 
V
V
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
K
 
Y
I
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
V
K
 
P
P
 
R
K
 
D
N
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
I
E
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
D
E
 
D
I
 
I
L
 
S
K
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
K
 
H
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
Q
|
Q
E
 
E
P
 
A
E
 
S
T
 
I
L
 
F
R
 
R
D
 
R
Y
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
-
M
 
L
M
 
M
G
 
A
R
 
V
Y
 
L
P
 
Q
Y
 
I
Q
 
R
G
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
A
E
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
E
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
A
K
 
N
K
 
E
A
 
L
I
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
S
 
E
G
 
H
Y
 
L
E
 
R
E
 
D
R
 
S
T
 
M
L
 
G
L
 
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
K
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
S
Q
 
V
V
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
K
S
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
N
 
H
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
I
T
 
A
-
 
H
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
F
 
D
E
 
E
N
 
H
I
 
V
Y
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
32% identity, 58% coverage: 2:233/399 of query aligns to 3:233/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
K
 
T
G
 
A
I
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
F
 
K
G
 
A
Y
|
Y
G
 
K
S
 
G
A
 
R
K
 
R
L
 
V
F
 
V
A
 
E
G
 
D
I
 
V
N
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
N
P
 
S
G
 
G
T
 
E
F
 
I
S
 
V
V
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
K
 
Y
I
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
V
K
 
P
P
 
R
K
 
D
N
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
I
E
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
D
E
 
D
I
 
I
L
 
S
K
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
K
 
H
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
Q
|
Q
E
 
E
P
 
A
E
 
S
T
 
I
L
 
F
R
 
R
D
 
R
Y
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
-
M
 
L
M
 
M
G
 
A
R
 
V
Y
 
L
P
 
Q
Y
 
I
Q
 
R
G
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
A
E
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
E
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
A
K
 
N
K
 
E
A
 
L
I
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
S
 
E
G
 
H
Y
 
L
E
 
R
E
 
D
R
 
S
T
 
M
L
 
G
L
 
Q
T
x
S
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
K
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
x
G
L
 
V
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
S
Q
 
V
V
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
K
S
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
N
 
H
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
T
L
 
D
H
|
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
I
T
 
A
-
 
H
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
F
 
D
E
 
E
N
 
H
I
 
V
Y
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
31% identity, 58% coverage: 2:233/399 of query aligns to 4:234/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
K
 
T
G
 
A
I
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
F
 
K
G
 
A
Y
|
Y
G
 
K
S
 
G
A
x
R
K
 
R
L
x
V
F
 
V
A
 
E
G
 
D
I
 
V
N
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
N
P
 
S
G
 
G
T
 
E
F
 
I
S
 
V
V
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
K
 
Y
I
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
V
K
 
P
P
 
R
K
 
D
N
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
I
E
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
D
E
 
D
I
 
I
L
 
S
K
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
K
 
H
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
E
 
S
T
 
I
L
 
F
R
 
R
D
 
R
Y
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
-
M
 
L
M
 
M
G
 
A
R
 
V
Y
 
L
P
 
Q
Y
 
I
Q
 
R
G
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
A
E
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
E
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
R
V
 
A
K
 
N
K
 
E
A
 
L
I
 
M
E
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
S
 
E
G
 
H
Y
 
L
E
 
R
E
 
D
R
 
S
T
 
M
L
 
G
L
 
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
K
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
S
Q
 
V
V
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
K
S
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
N
 
H
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
T
L
 
D
H
|
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
I
T
 
A
-
 
H
G
 
G
E
 
T
A
 
P
K
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
F
 
D
E
 
E
N
 
H
I
 
V
Y
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
32% identity, 53% coverage: 12:222/399 of query aligns to 13:222/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
G
 
G
S
 
G
A
 
R
K
 
Q
L
 
A
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
N
 
T
I
 
F
E
 
H
V
 
M
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
T
 
E
F
 
M
S
 
A
V
 
F
I
 
L
L
 
T
G
 
G
P
 
H
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
I
 
L
L
 
I
A
x
C
G
 
G
F
 
I
L
 
E
K
 
R
P
 
P
K
 
S
N
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
I
E
 
W
I
 
F
K
 
S
G
 
G
K
 
H
E
 
D
I
 
I
L
 
T
K
 
R
L
 
L
P
 
K
A
 
N
K
 
R
A
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
F
R
 
L
A
 
R
K
 
R
L
 
Q
L
 
I
A
 
G
Y
 
M
V
 
I
P
 
F
Q
 
Q
E
 
D
P
 
H
E
 
H
T
 
L
L
 
L
R
 
M
D
 
D
Y
 
R
T
 
T
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
I
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
Y
 
L
-
 
I
-
 
I
Q
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
D
E
 
D
T
 
I
K
 
R
A
 
-
D
 
-
F
 
-
K
 
R
A
 
R
V
 
V
K
 
S
K
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
G
 
D
Y
 
K
E
 
A
E
 
K
R
 
N
T
 
F
L
 
P
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
A
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
D
F
 
A
Y
 
L
Q
 
S
V
 
E
K
 
G
I
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
E
N
 
E
L
 
F
A
 
N
A
 
R
Q
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
M
V
 
A
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
I
S
 
S
F
 
R
F
 
R
A
 
S
D
 
Y
K
 
R
L
 
M
Y
 
L
L
 
T
F
 
L
S
 
S
E
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
H
T
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
G
K
 
H
E
 
E

7w78A Heme exporter hrtba in complex with mg-amppnp (see paper)
35% identity, 53% coverage: 4:214/399 of query aligns to 17:214/218 of 7w78A

query
sites
7w78A
G
 
G
I
 
I
N
 
S
L
 
T
V
 
V
F
 
T
G
 
A
Y
 
L
G
 
D
S
 
S
A
 
A
K
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
N
I
 
V
E
 
E
V
 
I
L
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
E
F
 
L
S
 
V
V
 
A
I
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
E
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
S
I
 
I
L
 
-
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
-
 
E
P
 
P
K
 
T
N
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
T
I
 
L
K
 
H
G
 
G
K
 
A
E
 
E
I
 
G
L
 
L
K
 
D
L
 
-
P
 
A
A
 
T
K
 
S
A
 
T
R
 
R
A
 
R
K
 
E
L
 
H
L
 
I
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
P
 
F
Q
|
Q
E
 
Q
P
 
P
E
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
G
D
 
S
Y
 
L
T
 
T
V
 
A
W
 
R
D
 
E
T
 
Q
V
 
L
M
 
L
M
 
I
G
 
T
R
 
D
Y
 
H
P
 
-
Y
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
K
G
 
P
L
 
R
E
 
K
T
 
D
K
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
E
A
 
L
I
 
L
E
 
A
T
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
G
 
G
Y
 
L
E
 
G
E
 
G
R
 
R
T
 
R
L
 
V
L
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
N
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
G
E
 
N
A
 
P
D
 
Q
Y
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
A
F
 
R
Y
 
L
Q
 
S
V
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
V
S
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
R
N
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
K
Q
 
E
-
 
F
G
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
T
L
 
L
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
R
N
 
S
L
 
Q
A
 
L
S
 
A
F
 
-
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
F
Y
 
V
L
 
E
F
 
M
S
 
A
E
 
D
G
 
G
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7w79A Heme exporter hrtba in complex with mn-amppnp (see paper)
35% identity, 53% coverage: 4:214/399 of query aligns to 17:214/216 of 7w79A

query
sites
7w79A
G
 
G
I
 
I
N
 
S
L
 
T
V
 
V
F
 
T
G
 
A
Y
 
L
G
 
D
S
 
S
A
 
A
K
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
N
I
 
V
E
|
E
V
 
I
L
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
E
F
 
L
S
 
V
V
 
A
I
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
S
I
 
I
L
 
-
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
-
 
E
P
 
P
K
 
T
N
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
T
I
 
L
K
 
H
G
 
G
K
 
A
E
 
E
I
 
G
L
 
L
K
 
D
L
 
-
P
 
A
A
 
T
K
 
S
A
 
T
R
 
R
A
 
R
K
 
E
L
 
H
L
 
I
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
P
 
F
Q
|
Q
E
 
Q
P
 
P
E
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
G
D
 
S
Y
 
L
T
 
T
V
 
A
W
 
R
D
 
E
T
 
Q
V
 
L
M
 
L
M
 
I
G
 
T
R
 
D
Y
 
H
P
 
-
Y
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
K
G
 
P
L
 
R
E
 
K
T
 
D
K
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
E
A
 
L
I
 
L
E
 
A
T
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
G
 
G
Y
 
L
E
 
G
E
 
G
R
 
R
T
 
R
L
 
V
L
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
N
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
G
E
 
N
A
 
P
D
 
Q
Y
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
A
F
 
R
Y
 
L
Q
 
S
V
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
V
S
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
R
N
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
K
Q
 
E
-
 
F
G
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
T
L
 
L
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
R
N
 
S
L
 
Q
A
 
L
S
 
A
F
 
-
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
F
Y
 
V
L
 
E
F
 
M
S
 
A
E
 
D
G
 
G
K
 
K

Sites not aligning to the query:

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
32% identity, 52% coverage: 12:218/399 of query aligns to 13:218/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
G
 
G
S
 
G
A
 
R
K
 
Q
L
 
A
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
N
 
T
I
 
F
E
 
H
V
 
M
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
T
 
E
F
 
M
S
 
A
V
 
F
I
 
L
L
 
T
G
 
G
P
 
H
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
I
 
L
L
 
I
A
 
C
G
 
G
F
 
I
L
 
E
K
 
R
P
 
P
K
 
S
N
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
I
E
 
W
I
 
F
K
 
S
G
 
G
K
 
H
E
 
D
I
 
I
L
 
T
K
 
R
L
 
L
P
 
K
A
 
N
K
 
R
A
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
F
R
 
L
A
 
R
K
 
R
L
 
Q
L
 
I
A
 
G
Y
 
M
V
 
I
P
 
F
Q
|
Q
E
 
D
P
 
H
E
 
H
T
 
L
L
 
L
R
 
M
D
 
D
Y
 
R
T
 
T
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
I
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
Y
 
L
-
 
I
-
 
I
Q
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
D
E
 
D
T
 
I
K
 
R
A
 
-
D
 
-
F
 
-
K
 
R
A
 
R
V
 
V
K
 
S
K
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
G
 
D
Y
x
K
E
 
A
E
 
K
R
 
N
T
 
F
L
 
P
L
 
I
T
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
A
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
D
F
 
A
Y
 
L
Q
 
S
V
 
E
K
 
G
I
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
E
N
 
E
L
 
F
A
 
N
A
 
R
Q
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
M
V
 
A
L
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
I
S
 
S
F
 
R
F
 
R
A
 
S
D
 
Y
K
 
R
L
 
M
Y
 
L
L
 
T
F
 
L
S
 
S
E
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
H
T
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
32% identity, 52% coverage: 12:218/399 of query aligns to 13:218/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
G
 
G
S
 
G
A
x
R
K
 
Q
L
x
A
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
N
 
T
I
 
F
E
 
H
V
 
M
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
T
 
E
F
 
M
S
 
A
V
 
F
I
 
L
L
 
T
G
 
G
P
 
H
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
I
 
L
L
 
I
A
 
C
G
 
G
F
 
I
L
 
E
K
 
R
P
 
P
K
 
S
N
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
I
E
 
W
I
 
F
K
 
S
G
 
G
K
 
H
E
 
D
I
 
I
L
 
T
K
 
R
L
 
L
P
 
K
A
 
N
K
 
R
A
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
F
R
 
L
A
 
R
K
 
R
L
 
Q
L
 
I
A
 
G
Y
 
M
V
 
I
P
 
F
Q
 
Q
E
 
D
P
 
H
E
 
H
T
 
L
L
 
L
R
 
M
D
 
D
Y
 
R
T
 
T
V
 
V
W
 
Y
D
 
D
T
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
I
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
Y
 
L
-
 
I
-
 
I
Q
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
D
E
 
D
T
 
I
K
 
R
A
 
-
D
 
-
F
 
-
K
 
R
A
 
R
V
 
V
K
 
S
K
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
G
 
D
Y
 
K
E
 
A
E
 
K
R
 
N
T
 
F
L
 
P
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
A
Y
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
N
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
D
F
 
A
Y
 
L
Q
 
S
V
 
E
K
 
G
I
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
E
N
 
E
L
 
F
A
 
N
A
 
R
Q
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
M
V
 
A
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
I
S
 
S
F
 
R
F
 
R
A
 
S
D
 
Y
K
 
R
L
 
M
Y
 
L
L
 
T
F
 
L
S
 
S
E
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L
I
 
H
T
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
32% identity, 58% coverage: 6:236/399 of query aligns to 7:232/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
N
 
N
L
 
L
V
 
S
F
 
F
G
 
N
Y
x
R
G
 
G
S
 
E
A
 
R
K
 
V
L
 
I
F
 
Y
A
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
S
I
 
L
E
 
N
V
 
I
L
 
R
P
 
R
G
 
G
T
 
Q
F
 
I
S
 
T
V
 
A
I
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
I
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
G
F
 
Q
L
 
L
K
 
V
P
 
P
K
 
D
N
 
Q
G
 
G
T
 
E
V
 
V
E
 
L
I
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
I
 
I
L
 
A
K
 
Q
L
 
M
P
 
S
A
 
R
K
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
-
L
 
M
A
 
G
Y
 
M
V
 
L
P
 
F
Q
|
Q
E
 
S
P
 
G
E
 
A
T
 
L
L
 
F
R
 
T
D
 
D
Y
 
M
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
E
T
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
P
 
P
Y
 
I
Q
 
R
G
 
A
V
 
H
L
 
T
G
 
K
L
 
L
E
 
S
T
 
E
K
 
N
A
 
L
D
 
I
F
 
A
K
 
E
A
 
L
V
 
V
K
 
A
K
 
L
A
 
K
I
 
L
E
 
E
T
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
R
G
 
G
Y
 
T
E
 
E
E
 
Q
R
 
L
T
 
M
L
 
P
L
 
T
T
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
N
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
P
D
 
D
Y
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
Q
D
 
D
L
 
P
F
 
I
Y
 
V
Q
 
K
V
 
G
K
 
V
I
 
L
L
 
T
S
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
R
N
 
S
L
 
L
-
 
R
A
 
E
A
 
A
Q
 
L
G
 
D
I
 
L
A
 
T
V
 
T
L
 
I
A
 
I
V
 
V
L
 
S
H
|
H
D
 
D
L
 
V
N
 
P
L
 
E
A
 
T
S
 
L
F
 
S
F
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
L
 
V
F
 
V
S
 
A
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
-
I
 
I
T
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
G
K
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
T
F
 
P
E
 
E
N
 
E
I
 
L
Y
 
-
K
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
E
 
S
P
 
P

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
32% identity, 58% coverage: 6:236/399 of query aligns to 9:234/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
N
 
N
L
 
L
V
 
S
F
 
F
G
 
N
Y
 
R
G
 
G
S
 
E
A
 
R
K
 
V
L
 
I
F
 
Y
A
 
D
G
 
N
I
 
I
N
 
S
I
 
L
E
 
N
V
 
I
L
 
R
P
 
R
G
 
G
T
 
Q
F
 
I
S
 
T
V
 
A
I
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
I
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
G
F
 
Q
L
 
L
K
 
V
P
 
P
K
 
D
N
 
Q
G
 
G
T
 
E
V
 
V
E
 
L
I
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
I
 
I
L
 
A
K
 
Q
L
 
M
P
 
S
A
 
R
K
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
L
 
-
L
 
M
A
 
G
Y
 
M
V
 
L
P
 
F
Q
 
Q
E
 
S
P
 
G
E
 
A
T
 
L
L
 
F
R
 
T
D
 
D
Y
 
M
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
D
 
E
T
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
P
 
P
Y
 
I
Q
 
R
G
 
A
V
 
H
L
 
T
G
 
K
L
 
L
E
 
S
T
 
E
K
 
N
A
 
L
D
 
I
F
 
A
K
 
E
A
 
L
V
 
V
K
 
A
K
 
L
A
 
K
I
 
L
E
 
E
T
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
&