SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_076477021.1 NCBI__GCF_900156495.1:WP_076477021.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6io1B Crystal structure of a novel thermostable (s)-enantioselective omega- transaminase from thermomicrobium roseum (see paper)
42% identity, 89% coverage: 36:443/460 of query aligns to 33:433/448 of 6io1B

query
sites
6io1B
V
 
V
I
 
L
A
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
W
I
 
V
F
 
W
D
 
D
D
 
A
R
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
R
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
 
N
V
 
V
Q
 
N
A
 
I
G
 
G
H
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
E
Q
 
Q
A
 
M
S
 
E
T
 
R
L
 
V
A
 
A
F
 
F
F
 
V
P
 
P
-
 
T
L
 
F
W
 
F
S
 
G
Y
 
L
A
 
A
T
 
S
P
 
P
P
 
P
A
 
T
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
E
H
 
L
A
 
F
P
 
P
G
 
G
D
 
P
L
 
L
N
 
D
R
 
H
V
 
F
F
 
Q
F
 
F
T
 
T
T
 
S
G
|
G
G
|
G
G
x
A
E
 
E
A
 
S
V
x
N
E
 
E
S
 
T
A
 
A
W
 
I
K
 
K
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Q
 
Y
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
W
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
E
K
 
R
H
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
R
V
 
M
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
I
P
 
A
Q
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
I
 
A
T
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
E
 
A
L
 
Y
K
 
W
Q
 
E
D
 
G
F
 
F
E
 
G
P
 
P
L
 
R
T
 
P
P
 
P
G
 
G
A
 
F
F
 
I
R
 
H
V
 
L
P
 
T
N
 
A
T
 
P
N
 
Y
I
 
K
Y
 
Y
R
 
R
A
 
F
P
 
G
E
 
E
G
 
G
H
 
L
G
 
T
D
 
D
D
 
E
P
 
-
K
 
-
A
 
E
F
 
F
G
 
V
R
 
A
W
 
R
A
 
L
A
 
V
D
 
Q
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
T
I
 
I
E
 
E
F
 
R
E
 
E
G
 
G
P
 
S
D
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
V
P
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
D
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
E
 
P
R
 
A
V
 
I
R
 
A
Q
 
A
I
 
V
C
 
L
D
 
R
E
 
K
Y
 
Y
D
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
L
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
T
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
T
M
 
L
F
 
F
A
 
G
C
 
M
S
 
Q
D
 
Q
F
 
Y
G
 
G
Y
 
V
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
V
T
 
T
C
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
G
A
 
V
S
 
S
D
 
D
R
 
E
L
 
I
F
 
A
E
 
E
P
 
T
F
 
L
D
 
A
D
 
S
G
 
A
R
 
D
T
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
M
H
 
H
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
R
N
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
L
E
 
L
R
 
A
E
 
E
G
 
R
L
 
L
N
 
W
D
 
E
R
 
N
V
 
A
K
 
A
Q
 
A
N
 
S
A
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
L
R
 
L
S
 
Q
T
 
E
L
 
L
E
 
K
K
 
R
L
 
L
Y
 
E
D
 
E
L
 
R
P
 
P
I
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
K
G
 
G
Y
 
L
F
 
M
Y
 
L
G
 
L
I
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
V
K
 
R
D
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
S
K
 
K
E
 
E
T
 
K
F
 
F
T
 
P
P
 
P
D
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
F
V
 
K
L
 
L
R
 
G
G
 
P
F
 
K
L
 
L
S
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
T
F
 
R
D
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
I
Y
 
I
C
 
V
R
 
R
A
 
C
D
 
T
D
 
P
R
 
D
G
 
G
D
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
I
Q
 
V
L
 
M
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
T
C
 
I
G
 
S
Q
 
R
S
 
A
E
 
E
F
 
C
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5kr6B Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
38% identity, 93% coverage: 24:450/460 of query aligns to 23:450/460 of 5kr6B

query
sites
5kr6B
H
 
H
F
 
L
S
 
R
R
 
D
H
 
H
G
 
A
A
 
S
G
 
G
-
 
E
I
 
L
V
 
P
A
 
G
P
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
Q
D
 
D
D
 
S
R
 
E
G
 
G
R
 
R
S
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
A
L
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
T
E
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
A
A
 
I
A
 
Y
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
S
 
K
T
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
F
 
Y
P
 
H
L
 
T
W
 
Y
-
 
V
S
 
G
Y
 
H
A
 
S
T
 
N
P
 
E
P
 
P
A
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
I
V
 
R
H
 
E
-
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
G
L
 
M
N
 
S
R
 
K
V
 
V
F
 
Y
F
 
Y
T
 
G
T
 
M
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
D
A
 
A
V
 
N
E
 
E
S
 
T
A
 
Q
W
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
V
K
 
W
Q
 
Y
Y
 
Y
Y
 
N
K
 
N
L
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
I
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
Q
V
 
R
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
T
 
S
P
 
G
Q
 
I
G
 
M
A
 
T
L
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
P
E
 
A
L
 
F
K
 
H
Q
 
N
D
 
H
F
 
F
E
 
D
-
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
E
P
 
P
G
 
-
A
 
I
F
 
R
R
 
H
V
 
T
P
 
T
N
 
C
T
 
P
N
 
H
I
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
P
 
P
E
 
A
G
 
G
H
 
M
G
 
S
D
 
E
D
 
-
P
 
-
K
 
A
A
 
E
F
 
F
G
 
S
R
 
R
W
 
H
A
 
C
A
 
A
D
 
D
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
M
I
 
I
E
 
L
F
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
N
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
I
F
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
P
P
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
E
 
E
R
 
A
V
 
I
R
 
Q
Q
 
A
I
 
V
C
 
L
D
 
N
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
S
M
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
H
D
 
H
F
 
Y
G
 
G
Y
 
M
V
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
I
T
 
T
C
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
L
G
 
S
A
 
G
M
 
V
I
 
I
A
 
V
S
 
G
D
 
E
R
 
K
L
 
V
F
 
W
E
 
K
P
 
V
F
 
L
D
 
E
D
 
Q
G
 
G
R
 
S
T
 
D
A
 
Q
F
 
Y
-
 
G
-
 
P
-
 
I
A
 
G
H
 
H
G
 
G
Y
 
W
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
C
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
I
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
T
D
 
G
R
 
N
V
 
A
K
 
A
Q
 
D
N
 
T
A
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
F
R
 
Q
S
 
Q
T
 
R
L
 
M
E
 
R
K
 
E
L
 
T
Y
 
F
-
 
G
D
 
D
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
V
G
 
G
Y
 
L
F
 
M
Y
 
A
G
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
V
K
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
D
T
 
K
K
 
R
E
 
T
T
 
R
F
 
F
T
 
D
P
 
P
D
 
S
E
 
L
A
 
K
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
V
R
 
G
G
 
P
F
 
R
L
 
V
S
 
S
T
 
A
A
 
A
L
 
C
F
 
L
D
 
E
A
 
D
G
 
G
L
 
M
Y
 
I
C
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
M
D
 
P
R
 
H
G
 
G
D
 
D
P
 
-
V
 
I
V
 
L
Q
 
G
L
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
C
 
I
G
 
T
Q
 
R
S
 
A
E
 
E
F
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
V
Q
 
D
I
 
I
L
 
A
R
 
K

6fyqA The crystal structure of a new transaminase from the marine bacterium virgibacillus (see paper)
39% identity, 90% coverage: 36:449/460 of query aligns to 29:431/443 of 6fyqA

query
sites
6fyqA
V
 
I
I
 
M
A
 
K
R
 
E
G
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
I
 
L
F
 
T
D
 
D
D
 
V
R
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
T
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
V
S
 
S
G
 
S
L
 
L
F
 
W
V
 
N
V
 
V
Q
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
M
S
 
K
T
 
K
L
 
M
A
 
A
F
 
F
F
 
S
P
 
S
L
 
A
W
 
F
S
 
S
-
 
T
Y
 
F
A
 
S
T
 
H
P
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
S
H
 
I
A
 
T
P
 
P
G
 
E
D
 
G
L
 
L
N
 
N
R
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
S
G
 
G
G
|
G
G
x
S
E
 
E
A
 
S
V
 
N
E
 
D
S
 
S
A
 
A
W
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
V
K
 
R
Q
 
H
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
K
L
 
I
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
N
K
 
K
H
 
R
K
 
K
V
 
I
I
 
I
S
 
S
R
 
L
S
 
K
V
 
R
A
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
T
 
V
P
 
A
Q
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
T
A
 
S
I
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
P
E
 
E
L
 
F
K
 
W
Q
 
G
D
 
M
F
 
A
E
 
G
P
 
H
L
 
M
T
 
M
P
 
T
G
 
D
A
 
F
F
 
L
R
 
H
V
 
V
P
 
-
N
 
D
T
 
T
N
 
H
I
 
Y
Y
 
N
R
 
N
A
 
T
P
 
T
E
 
E
G
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
W
 
Q
A
 
A
A
 
V
D
 
Q
R
 
S
I
 
L
A
 
C
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
E
 
E
F
 
E
E
 
A
G
 
G
P
 
P
D
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
F
L
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
I
P
 
P
P
 
P
P
 
E
G
 
D
Y
 
Y
F
 
F
E
 
L
R
 
R
V
 
I
R
 
R
Q
 
E
I
 
V
C
 
C
D
 
N
E
 
A
Y
 
Y
D
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
V
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
T
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
K
M
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
I
S
 
E
D
 
N
F
 
W
G
 
D
Y
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
D
I
 
V
I
 
M
T
 
T
C
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
F
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
V
A
 
V
S
 
S
D
 
D
R
 
P
L
 
I
F
 
H
E
 
E
P
 
V
F
 
L
D
 
K
D
 
E
G
 
K
R
 
S
T
 
V
-
 
G
A
 
T
F
 
L
A
 
F
H
 
H
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
T
S
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
I
D
 
A
L
 
I
F
 
I
E
 
K
R
 
E
E
 
E
G
 
R
L
 
L
N
 
V
D
 
E
R
 
N
V
 
S
K
 
K
Q
 
R
N
 
M
A
 
G
P
 
D
A
 
A
F
 
L
R
 
L
S
 
H
T
 
G
L
 
L
E
 
K
K
 
K
L
 
V
Y
 
K
D
 
N
-
 
R
L
 
L
P
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
F
E
 
V
G
 
G
Y
 
L
F
 
L
Y
 
G
G
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
M
K
 
Q
D
 
N
K
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
N
E
 
K
T
 
P
F
 
F
T
 
S
P
 
S
D
 
N
-
 
L
-
 
Q
E
 
V
A
 
A
E
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
I
R
 
E
G
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
L
F
 
H
D
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
C
 
C
R
 
R
A
 
S
D
 
V
D
 
T
R
 
Y
G
 
D
D
 
H
P
 
T
-
 
N
V
 
I
V
 
I
Q
 
C
L
 
L
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
I
G
 
N
Q
 
Q
S
 
K
E
 
Q
F
 
V
D
 
D
E
 
K
I
 
L
E
 
V
Q
 
E
I
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6gwiB The crystal structure of halomonas elongata amino-transferase (see paper)
39% identity, 92% coverage: 36:460/460 of query aligns to 31:449/450 of 6gwiB

query
sites
6gwiB
V
 
V
I
 
V
A
 
T
R
 
H
G
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
I
 
I
F
 
H
D
 
D
D
 
S
R
 
E
G
 
G
R
 
N
S
 
R
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
L
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
S
 
E
T
 
Q
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
F
 
Y
P
 
N
L
 
T
W
 
F
S
 
F
Y
 
K
A
 
T
T
 
T
-
 
H
P
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
C
V
 
D
H
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
H
L
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
G
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
V
W
 
L
K
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
R
Q
 
R
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
A
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
D
K
 
K
H
 
Q
K
 
W
V
 
I
I
 
I
S
 
G
R
 
R
S
 
E
V
 
N
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
T
 
S
P
 
T
Q
 
L
G
 
A
A
 
G
L
 
M
A
 
S
I
 
L
T
 
G
G
 
G
I
 
M
P
 
A
E
 
P
L
 
M
K
 
H
Q
 
A
D
 
Q
F
 
G
E
 
G
P
 
P
L
 
C
T
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
I
F
 
A
R
 
H
V
 
I
P
 
R
N
 
Q
T
 
P
N
 
-
I
 
-
Y
 
Y
R
 
W
A
 
F
P
 
G
E
 
E
G
 
G
H
 
R
G
 
D
D
 
M
D
 
S
P
 
P
K
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
Q
W
 
T
A
 
C
A
 
A
D
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
K
I
 
I
E
 
L
F
 
E
E
 
L
G
 
G
P
 
E
D
 
E
T
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
A
F
 
I
P
 
M
P
 
P
P
 
P
P
 
E
G
 
S
Y
 
Y
F
 
W
E
 
P
R
 
A
V
 
V
R
 
K
Q
 
K
I
 
V
C
 
L
D
 
A
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
E
M
 
W
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
Q
D
 
H
F
 
Y
G
 
G
Y
 
L
V
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
M
T
 
P
C
 
I
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
L
A
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
A
E
 
E
P
 
T
F
 
L
D
 
I
D
 
E
G
 
E
R
 
G
T
 
G
A
 
E
F
 
F
A
 
F
H
 
H
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
T
S
 
C
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
L
D
 
E
L
 
L
F
 
L
E
 
E
R
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
V
N
 
V
D
 
D
R
 
R
V
 
V
K
 
R
Q
 
D
N
 
D
-
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
R
 
A
S
 
E
T
 
R
L
 
W
E
 
A
K
 
S
L
 
L
Y
 
V
D
 
D
L
 
H
P
 
P
I
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
S
E
 
L
G
 
G
Y
 
L
F
 
M
Y
 
G
G
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
T
T
 
T
K
 
G
E
 
Q
T
 
R
F
 
F
T
 
D
P
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
K
R
 
S
V
 
L
L
 
G
R
 
A
G
 
G
F
 
N
L
 
L
S
 
C
T
 
R
A
 
D
L
 
L
-
 
C
F
 
F
D
 
A
A
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
C
 
M
R
 
R
A
 
S
D
 
-
D
 
-
R
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
T
V
 
M
V
 
I
Q
 
-
L
 
I
A
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
C
 
I
G
 
R
Q
 
R
S
 
E
E
 
E
F
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
L
E
 
V
Q
 
E
I
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
R
V
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
R
R
 
Q
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7ypmA Crystal structure of transaminase cc1012 complexed with plp and l- alanine (see paper)
38% identity, 92% coverage: 36:456/460 of query aligns to 32:447/454 of 7ypmA

query
sites
7ypmA
V
 
I
I
 
I
A
 
T
R
 
R
G
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
I
 
I
F
 
H
D
 
D
D
 
G
R
 
E
G
 
G
R
 
H
S
 
Q
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
x
W
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
Y
A
 
D
Q
 
Q
A
 
M
S
 
L
T
 
E
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
F
 
Y
-
 
N
P
 
T
L
 
F
W
 
F
S
 
K
Y
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
A
 
P
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
Q
H
 
K
A
 
M
P
 
G
G
 
G
D
 
H
L
 
L
N
 
S
R
 
H
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
T
 
N
T
 
S
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
V
W
 
F
K
 
R
L
 
L
A
 
V
K
 
R
Q
 
H
Y
 
F
Y
 
W
K
 
K
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
S
K
 
R
H
 
T
K
 
V
V
 
F
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
W
V
 
N
A
 
A
Y
|
Y
H
 
H
G
|
G
T
 
S
P
 
T
Q
 
V
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
S
I
 
L
T
 
G
G
 
G
I
 
M
P
 
K
E
 
H
L
 
M
K
 
H
Q
 
K
D
 
Q
F
 
G
E
 
D
P
 
L
L
 
P
T
 
I
P
 
A
G
 
G
A
 
V
F
 
E
R
 
H
V
 
V
P
 
M
N
 
Q
T
 
P
N
 
-
I
 
-
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
F
P
 
G
E
 
D
G
 
G
H
 
F
G
 
G
D
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
R
R
 
D
W
 
R
A
 
A
A
 
V
D
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
K
I
 
I
E
 
L
F
 
E
E
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
E
T
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
I
P
 
P
P
 
P
P
 
D
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
E
 
P
R
 
A
V
 
V
R
 
E
Q
 
A
I
 
L
C
 
C
D
 
R
E
 
K
Y
 
Y
D
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
C
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
Q
M
 
W
F
 
F
A
 
G
C
 
H
S
 
Q
D
 
H
F
 
Y
G
 
G
Y
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
I
T
 
A
C
 
M
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
S
A
 
A
M
 
V
I
 
G
A
 
V
S
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
I
F
 
V
E
 
A
P
 
E
F
 
L
D
 
R
D
 
E
G
 
K
R
 
G
T
 
G
A
 
D
F
 
F
A
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
T
S
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
I
D
 
E
L
 
I
F
 
M
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
T
K
 
R
-
 
D
Q
 
E
N
 
T
A
 
G
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
R
 
A
S
 
Q
T
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
L
Y
 
N
D
 
D
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
S
E
 
L
G
 
G
Y
 
L
F
 
I
Y
 
G
G
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
V
K
 
R
D
 
E
K
 
K
A
 
G
T
 
T
K
 
N
E
 
H
T
 
R
F
 
F
T
 
L
P
 
D
D
 
K
E
 
E
A
 
G
E
 
E
R
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
C
V
 
I
L
 
K
R
 
N
G
 
G
F
 
L
L
 
M
S
 
V
T
 
R
A
 
A
L
 
I
F
 
R
D
 
D
A
 
S
G
 
I
L
 
V
Y
 
C
C
 
C
R
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
I
G
 
T
Q
 
K
S
 
A
E
 
Q
F
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
L
E
 
V
Q
 
G
I
 
I
L
 
I
R
 
R
G
 
K
V
 
S
L
 
L
T
 
D
E
 
E
A
 
A

7ypnD Crystal structure of transaminase cc1012 mutant m9 complexed with plp (see paper)
38% identity, 92% coverage: 36:456/460 of query aligns to 32:447/455 of 7ypnD

query
sites
7ypnD
V
 
I
I
 
I
A
 
T
R
 
R
G
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
I
 
I
F
 
H
D
 
D
D
 
G
R
 
E
G
 
G
R
 
H
S
 
Q
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
W
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
Y
A
 
D
Q
 
Q
A
 
M
S
 
L
T
 
E
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
F
 
Y
-
 
N
P
 
T
L
 
F
W
 
F
S
 
K
Y
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
A
 
P
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
Q
H
 
K
A
 
M
P
 
G
G
 
G
D
 
H
L
 
L
N
 
S
R
 
H
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
T
 
N
T
 
S
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
V
W
 
F
K
 
R
L
 
L
A
 
V
K
 
R
Q
 
H
Y
 
F
Y
 
W
K
 
K
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
S
K
 
R
H
 
T
K
 
V
V
 
F
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
W
V
 
N
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
T
 
S
P
 
T
Q
 
V
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
S
I
 
L
T
 
G
G
 
G
I
 
M
P
 
K
E
 
H
L
 
M
K
 
H
Q
 
K
D
 
Q
F
 
G
E
 
D
P
 
L
L
 
P
T
 
I
P
 
A
G
 
G
A
 
V
F
 
E
R
 
H
V
 
V
P
 
M
N
 
Q
T
 
P
N
 
-
I
 
-
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
F
P
 
G
E
 
D
G
 
G
H
 
F
G
 
G
D
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
R
R
 
D
W
 
R
A
 
A
A
 
V
D
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
K
I
 
I
E
 
L
F
 
E
E
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
E
T
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
I
P
 
P
P
 
P
P
 
D
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
E
 
P
R
 
A
V
 
V
R
 
E
Q
 
A
I
 
L
C
 
C
D
 
R
E
 
K
Y
 
Y
D
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
C
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
A
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
Q
M
 
W
F
 
F
A
 
G
C
 
H
S
 
Q
D
 
H
F
 
Y
G
 
G
Y
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
I
T
 
A
C
 
M
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
S
A
 
A
M
 
V
I
 
G
A
 
V
S
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
I
F
 
V
E
 
A
P
 
E
F
 
L
D
 
R
D
 
E
G
 
K
R
 
G
T
 
G
A
 
D
F
 
F
A
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
x
F
T
|
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
T
S
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
I
D
 
E
L
 
I
F
 
M
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
T
K
 
R
-
 
D
Q
 
E
N
 
T
A
 
G
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
R
 
A
S
 
Q
T
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
L
Y
 
N
D
 
D
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
S
E
 
L
G
 
G
Y
 
L
F
 
I
Y
 
G
G
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
V
K
 
R
D
 
E
K
 
K
A
 
G
T
 
T
K
 
N
E
 
H
T
 
R
F
 
F
T
 
L
P
 
D
D
 
K
E
 
E
A
 
G
E
 
E
R
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
C
V
 
I
L
 
K
R
 
N
G
 
G
F
 
L
L
 
M
S
 
V
T
 
R
A
 
A
L
 
I
F
 
R
D
 
D
A
 
S
G
 
I
L
 
V
Y
 
C
C
 
C
R
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
I
G
 
T
Q
 
K
S
 
A
E
 
Q
F
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
L
E
 
V
Q
 
G
I
 
I
L
 
I
R
 
R
G
 
K
V
 
S
L
 
L
T
 
D
E
 
E
A
 
A

5kquC Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
37% identity, 94% coverage: 24:455/460 of query aligns to 21:453/459 of 5kquC

query
sites
5kquC
H
 
H
F
 
A
S
 
H
R
 
D
H
 
H
G
 
A
A
 
S
G
 
G
I
 
A
V
 
L
-
 
P
A
 
G
P
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
T
R
 
G
G
 
A
E
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
R
D
 
D
D
 
H
R
 
E
G
 
G
R
 
R
S
 
E
Y
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
A
L
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
I
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
T
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
A
A
 
I
A
 
Y
A
 
K
Q
 
Q
A
 
A
S
 
K
T
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
F
 
Y
P
 
H
L
 
T
W
 
Y
-
 
V
S
 
G
Y
 
H
A
 
S
T
 
T
P
 
E
P
 
A
A
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
S
R
 
R
L
 
I
A
 
I
V
 
R
H
 
D
-
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
G
L
 
M
N
 
K
R
 
K
V
 
V
F
 
Y
F
 
Y
T
 
G
T
 
L
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
D
A
 
A
V
 
N
E
 
E
S
 
T
A
 
Q
W
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
V
K
 
R
Q
 
Y
Y
 
Y
Y
 
N
K
 
N
L
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
I
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
Q
V
 
R
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
S
P
 
G
Q
 
I
G
 
M
A
 
T
L
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
P
E
 
S
L
 
F
K
 
H
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
E
 
D
P
 
L
L
 
P
T
 
V
P
 
E
G
 
G
A
 
I
F
 
K
R
 
H
V
 
T
P
 
V
N
 
C
T
 
P
N
 
H
I
 
W
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
A
G
 
G
H
 
M
G
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
E
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
V
R
 
R
W
 
Y
A
 
C
A
 
A
D
 
D
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
L
I
 
I
E
 
L
F
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
N
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
I
F
 
I
P
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
E
 
E
R
 
A
V
 
I
R
 
Q
Q
 
A
I
 
V
C
 
L
D
 
N
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
C
 
C
A
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
S
M
 
K
F
 
M
A
 
G
C
 
S
S
 
Q
D
 
R
F
 
Y
G
 
G
Y
 
M
V
 
R
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
I
T
 
T
C
 
T
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
L
G
 
S
A
 
A
M
 
V
I
 
I
A
 
V
S
 
G
D
 
E
R
 
K
L
 
V
F
 
W
E
 
D
P
 
V
F
 
I
D
 
E
D
 
K
G
 
A
R
 
S
T
 
Q
-
 
K
-
 
E
-
 
G
A
 
A
F
 
M
A
 
G
H
 
H
G
 
G
Y
x
W
T
|
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
C
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
L
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
T
D
 
A
R
 
N
V
 
A
K
 
A
Q
 
D
N
 
V
A
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
L
R
 
N
S
 
Q
T
 
R
L
 
L
E
 
R
K
 
E
L
 
T
Y
 
F
D
 
E
-
 
G
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
G
 
G
Y
 
M
F
 
L
Y
 
A
G
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
M
K
 
A
D
 
D
K
 
R
A
 
E
T
 
A
K
 
R
E
 
T
T
 
P
F
 
F
T
 
D
P
 
P
D
 
-
E
 
-
A
 
A
E
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
-
R
 
G
G
 
P
F
 
K
L
 
V
S
 
S
T
 
A
A
 
A
L
 
C
F
 
L
D
 
E
A
 
D
G
 
G
L
 
M
Y
 
I
C
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
M
D
 
P
R
 
H
G
 
G
D
 
D
P
 
-
V
 
I
V
 
L
Q
 
G
L
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
C
 
L
G
 
T
Q
 
R
S
 
A
E
 
E
F
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
V
Q
 
G
I
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
V
 
A
L
 
V
T
 
D
E
 
E

6s54A Transaminase from pseudomonas fluorescens (see paper)
39% identity, 90% coverage: 36:449/460 of query aligns to 33:444/453 of 6s54A

query
sites
6s54A
V
 
I
I
 
I
A
 
Q
R
 
S
G
 
G
E
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
H
I
 
I
F
 
T
D
 
D
D
 
V
R
 
D
G
 
G
R
 
R
S
 
R
Y
 
F
L
 
I
D
 
D
G
 
C
L
 
Q
S
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
A
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
R
E
 
E
L
 
I
A
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
V
A
 
T
A
 
R
Q
 
Q
A
 
M
S
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
F
 
Y
P
 
S
L
 
L
W
 
F
S
 
P
Y
 
G
A
 
S
T
 
T
-
 
N
P
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
A
 
T
-
 
E
V
 
V
H
 
A
A
 
A
P
 
E
G
 
E
D
 
G
L
 
M
N
 
V
R
 
K
V
 
A
F
 
S
F
 
F
T
 
G
T
 
L
G
 
G
G
|
G
G
x
S
E
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
T
A
 
A
W
 
L
K
 
K
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
K
L
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
D
K
 
K
H
 
V
K
 
K
V
 
F
I
 
V
S
 
S
R
 
L
S
 
Y
V
 
N
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
T
 
L
P
 
N
Q
 
F
G
 
G
A
 
G
L
 
M
A
 
S
I
 
A
T
 
C
G
 
G
I
 
G
P
 
N
E
 
A
L
 
W
K
 
K
Q
 
S
D
 
S
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
L
T
 
M
P
 
P
G
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
Q
V
 
V
P
 
E
N
 
S
T
 
P
N
 
H
I
 
L
Y
 
Y
R
 
R
A
 
N
P
 
P
E
 
-
G
 
-
H
 
F
G
 
T
D
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
E
A
 
E
F
 
L
G
 
A
R
 
E
W
 
I
A
 
C
A
 
A
D
 
Q
R
 
I
I
 
L
A
 
E
E
 
R
A
 
Q
I
 
I
E
 
E
F
 
M
E
 
Q
G
 
A
P
 
P
D
 
G
T
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
I
L
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
A
G
 
S
Y
 
Y
F
 
W
E
 
P
R
 
R
V
 
L
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
T
A
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
S
G
 
G
S
 
S
M
 
L
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
R
D
 
G
F
 
W
G
 
G
Y
 
V
V
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
T
 
C
C
 
L
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
I
T
 
S
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
S
A
 
A
M
 
T
I
 
L
A
 
V
S
 
N
D
 
S
R
 
R
L
 
V
F
 
A
E
 
R
P
 
A
F
 
W
-
 
E
-
 
R
D
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
F
T
 
T
A
 
S
-
 
V
F
 
Y
A
 
M
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
C
A
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
A
L
 
I
D
 
D
L
 
I
F
 
V
E
 
L
R
 
Q
E
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
A
D
 
E
R
 
N
V
 
A
K
 
R
Q
 
V
N
 
V
A
 
G
P
 
D
A
 
Y
F
 
F
R
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
Y
 
L
D
 
I
L
 
L
P
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
H
-
 
R
I
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
K
G
 
G
Y
 
L
F
 
M
Y
 
L
G
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
K
D
 
E
K
 
R
A
 
A
T
 
T
K
 
K
E
 
E
T
 
P
F
 
F
T
 
G
P
 
P
D
 
A
E
 
D
A
 
A
E
 
Y
R
 
P
V
 
L
L
 
A
R
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
I
S
 
S
T
 
E
A
 
A
L
 
C
F
 
V
D
 
N
A
 
N
G
 
G
L
 
V
Y
 
M
C
 
I
R
 
R
A
 
T
D
 
I
D
 
V
R
 
N
G
 
K
D
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
L
Q
 
I
L
 
I
A
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
T
C
 
F
G
 
T
Q
 
T
S
 
E
E
 
H
F
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
I
Q
 
E
I
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5kr5A Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
37% identity, 94% coverage: 24:455/460 of query aligns to 19:451/455 of 5kr5A

query
sites
5kr5A
H
 
H
F
 
A
S
 
Y
R
 
D
H
 
H
G
 
A
A
 
S
G
 
G
I
 
A
V
 
L
-
 
P
A
 
G
P
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
E
D
 
D
D
 
H
R
 
E
G
 
G
R
 
R
S
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
A
L
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
I
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
x
E
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
x
D
A
 
A
A
 
I
A
 
Y
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
S
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
F
 
Y
P
 
H
L
 
T
W
 
Y
-
 
V
S
 
G
Y
 
H
A
 
S
T
 
N
P
 
D
P
 
P
A
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
S
R
 
R
L
 
I
A
 
I
V
 
E
H
 
D
-
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
G
L
 
M
N
 
K
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
T
 
G
T
 
M
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
D
A
 
A
V
 
N
E
 
E
S
 
T
A
 
Q
W
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
V
K
 
W
Q
 
Y
Y
 
Y
Y
 
N
K
 
N
L
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
A
 
N
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
I
I
 
I
S
 
A
R
 
R
S
 
E
V
 
R
A
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
T
 
S
P
 
G
Q
 
I
G
 
V
A
 
T
L
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
P
E
 
S
L
 
F
K
 
H
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
E
 
D
-
 
L
P
 
P
L
 
I
T
 
D
P
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
R
V
 
V
P
 
K
N
 
H
T
 
T
-
 
V
-
 
C
-
 
P
N
 
H
I
 
W
Y
 
Y
R
 
N
A
 
A
P
 
P
E
 
P
G
 
G
H
 
M
G
 
S
D
 
E
D
 
-
P
 
-
K
 
A
A
 
Q
F
 
F
G
 
V
R
 
A
W
 
Y
A
 
C
A
 
V
D
 
E
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
L
I
 
I
E
 
A
F
 
R
E
 
E
G
 
G
P
 
A
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
N
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
I
F
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
P
P
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
E
 
E
R
 
A
V
 
I
R
 
Q
Q
 
A
I
 
V
C
 
L
D
 
R
E
 
K
Y
 
H
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
S
M
 
K
F
 
T
A
 
G
C
 
S
S
 
E
D
 
H
F
 
Y
G
 
G
Y
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
I
T
 
T
C
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
L
G
 
S
A
 
A
M
 
V
I
 
I
A
 
V
S
 
S
D
 
E
R
 
K
L
 
V
F
 
W
E
 
D
P
 
V
F
 
I
D
 
E
D
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
E
R
 
H
T
 
G
A
 
V
F
 
M
A
 
G
H
 
H
G
 
G
Y
x
W
T
|
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
C
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
L
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
T
D
 
G
R
 
N
V
 
A
K
 
A
Q
 
D
N
 
V
A
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
L
R
 
Q
S
 
Q
T
 
R
L
 
L
E
 
H
K
 
E
L
 
A
Y
 
F
D
 
G
L
 
A
-
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
V
G
 
G
Y
 
M
F
 
L
Y
 
A
G
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
M
K
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
G
T
 
A
K
 
R
E
 
T
T
 
P
F
 
F
T
 
D
P
 
P
D
 
-
E
 
-
A
 
A
E
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
S
R
 
Q
G
 
K
F
 
V
L
 
A
S
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
E
D
|
D
A
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
C
 
V
R
 
R
A
 
A
D
 
L
D
 
P
R
 
H
G
 
G
D
 
D
P
 
-
V
 
I
V
 
L
Q
 
G
L
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
C
 
T
G
 
T
Q
 
R
S
 
A
E
 
E
F
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
V
Q
 
A
I
 
I
L
 
A
R
 
K
G
x
E
V
 
A
L
 
F
T
 
D
E
 
E

6g4dB Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with plp (see paper)
37% identity, 89% coverage: 36:445/460 of query aligns to 28:434/453 of 6g4dB

query
sites
6g4dB
V
 
I
I
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
I
 
V
F
 
Y
D
 
D
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
R
 
K
S
 
G
Y
 
Y
L
 
I
D
 
E
G
 
A
L
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
 
S
V
 
A
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
H
 
F
G
 
S
R
 
N
D
 
Q
E
 
R
L
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
F
S
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
P
F
 
F
F
 
Y
P
 
H
L
 
L
W
 
F
S
 
S
Y
 
H
A
 
K
T
 
S
P
 
H
-
 
R
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
I
V
 
E
H
 
M
A
 
A
P
 
P
G
 
V
D
 
P
L
 
M
N
 
S
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
N
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
V
W
 
V
K
 
K
L
 
M
A
 
V
K
 
W
Q
 
Y
Y
 
L
Y
 
N
K
 
N
L
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
A
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
F
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
V
V
 
N
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
I
P
 
T
Q
 
V
G
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
S
I
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
P
E
 
G
L
 
N
K
 
Q
Q
 
R
D
 
G
F
 
F
E
 
D
P
 
L
L
 
P
T
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
F
F
 
L
R
 
H
V
 
V
P
 
G
N
 
C
T
 
P
N
 
H
I
 
H
Y
 
Y
R
 
R
A
 
F
P
 
A
E
 
L
G
 
A
H
 
-
G
 
G
D
 
E
D
 
S
P
 
E
K
 
E
A
 
H
F
 
F
G
 
A
R
 
D
W
 
R
A
 
L
A
 
A
D
 
V
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
Q
A
 
K
I
 
I
E
 
L
F
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
L
Q
 
M
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
R
G
 
T
Y
 
Y
F
 
W
E
 
E
R
 
K
V
 
I
R
 
Q
Q
 
K
I
 
V
C
 
C
D
 
R
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
Q
M
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
Q
D
 
T
F
 
F
G
 
G
Y
 
I
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
T
 
V
C
 
L
A
 
S
K
|
K
G
 
Q
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
S
Y
 
Y
S
 
Q
P
 
P
I
 
I
G
 
A
A
 
A
M
 
I
I
 
L
A
 
I
S
 
N
D
 
A
R
 
P
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
 
G
F
 
I
D
 
A
D
 
D
G
 
Q
R
 
S
T
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
G
A
 
A
F
 
L
A
 
G
H
 
H
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
G
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
K
L
 
I
F
 
I
E
 
E
R
 
E
E
 
E
G
 
S
L
 
L
N
 
V
D
 
E
R
 
H
V
 
A
K
 
A
Q
 
Q
N
 
M
A
 
G
P
 
Q
A
 
L
F
 
L
R
 
R
S
 
S
T
 
G
L
 
L
E
 
Q
K
 
H
L
 
F
Y
 
I
D
 
D
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
C
G
 
G
Y
 
L
F
 
I
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
G
D
 
D
K
 
R
A
 
V
T
 
S
K
 
K
E
 
-
T
 
-
F
 
-
T
 
A
P
 
P
D
 
Y
E
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
G
G
 
R
F
 
Y
L
 
M
S
 
A
T
 
G
A
 
R
L
 
A
F
 
Q
D
 
E
A
 
H
G
 
G
L
 
M
Y
 
I
C
 
T
R
 
R
A
 
A
D
 
-
D
 
-
R
 
M
G
 
G
D
 
D
P
 
A
V
 
V
V
 
A
Q
 
-
L
 
F
A
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
V
G
 
N
Q
 
E
S
 
Q
E
 
E
F
 
V
D
 
G
E
 
M
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6g4fA Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with pmp (see paper)
37% identity, 92% coverage: 36:459/460 of query aligns to 28:440/451 of 6g4fA

query
sites
6g4fA
V
 
I
I
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
I
 
V
F
 
Y
D
 
D
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
R
 
K
S
 
G
Y
 
Y
L
 
I
D
 
E
G
 
A
L
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
 
S
V
 
A
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
H
 
F
G
 
S
R
 
N
D
 
Q
E
 
R
L
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
F
S
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
P
F
 
F
F
 
Y
P
 
H
L
 
L
W
 
F
S
 
S
Y
 
H
A
 
K
T
 
S
P
 
H
-
 
R
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
I
V
 
E
H
 
M
A
 
A
P
 
P
G
 
V
D
 
P
L
 
M
N
 
S
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
N
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
V
W
 
V
K
 
K
L
 
M
A
 
V
K
 
W
Q
 
Y
Y
 
L
Y
 
N
K
 
N
L
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
A
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
F
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
V
V
 
N
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
I
P
 
T
Q
 
V
G
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
S
I
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
P
E
 
G
L
 
N
K
 
Q
Q
 
R
D
 
G
F
 
F
E
 
D
P
 
L
L
 
P
T
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
F
F
 
L
R
 
H
V
 
V
P
 
G
N
 
C
T
 
P
N
 
H
I
 
H
Y
 
Y
R
 
R
A
 
F
P
 
A
E
 
L
G
 
A
H
 
-
G
 
G
D
 
E
D
 
S
P
 
E
K
 
E
A
 
H
F
 
F
G
 
A
R
 
D
W
 
R
A
 
L
A
 
A
D
 
V
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
Q
A
 
K
I
 
I
E
 
L
F
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
L
Q
 
M
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
R
G
 
T
Y
 
Y
F
 
W
E
 
E
R
 
K
V
 
I
R
 
Q
Q
 
K
I
 
V
C
 
C
D
 
R
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
Q
M
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
Q
D
 
T
F
 
F
G
 
G
Y
 
I
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
T
 
V
C
 
L
A
 
S
K
|
K
G
 
Q
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
S
Y
 
Y
S
 
Q
P
 
P
I
 
I
G
 
A
A
 
A
M
 
I
I
 
L
A
 
I
S
 
N
D
 
A
R
 
P
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
 
G
F
 
I
D
 
A
D
 
D
G
 
Q
R
 
S
T
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
G
A
 
A
F
 
L
A
 
G
H
 
H
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
G
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
K
L
 
I
F
 
I
E
 
E
R
 
E
E
 
E
G
 
S
L
 
L
N
 
V
D
 
E
R
 
H
V
 
A
K
 
A
Q
 
Q
N
 
M
A
 
G
P
 
Q
A
 
L
F
 
L
R
 
R
S
 
S
T
 
G
L
 
L
E
 
Q
K
 
H
L
 
F
Y
 
I
D
 
D
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
C
G
 
G
Y
 
L
F
 
I
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
G
D
 
D
K
 
R
A
 
V
T
 
S
K
 
K
E
 
-
T
 
-
F
 
-
T
 
A
P
 
P
D
 
Y
E
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
G
G
 
R
F
 
Y
L
 
M
S
 
A
T
 
G
A
 
R
L
 
A
F
 
Q
D
 
E
A
 
H
G
 
G
L
 
M
Y
 
I
C
 
T
R
 
R
A
 
A
D
 
-
D
 
-
R
 
M
G
 
G
D
 
D
P
 
A
V
 
V
V
 
A
Q
 
-
L
 
F
A
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
V
G
 
N
Q
 
E
S
 
Q
E
 
E
F
 
V
D
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
M
L
 
I
T
 
V
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
T
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6g4eA Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with plp and 6-aminohexanoate (6-aca) (see paper)
37% identity, 92% coverage: 36:459/460 of query aligns to 28:440/451 of 6g4eA

query
sites
6g4eA
V
 
I
I
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
I
 
V
F
 
Y
D
 
D
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
R
 
K
S
 
G
Y
 
Y
L
 
I
D
 
E
G
 
A
L
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
 
S
V
 
A
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
H
 
F
G
 
S
R
 
N
D
 
Q
E
 
R
L
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
F
S
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
P
F
 
F
F
 
Y
P
 
H
L
 
L
W
 
F
S
 
S
Y
 
H
A
 
K
T
 
S
P
 
H
-
 
R
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
I
V
 
E
H
 
M
A
 
A
P
 
P
G
 
V
D
 
P
L
 
M
N
 
S
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
N
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
V
W
 
V
K
 
K
L
 
M
A
 
V
K
 
W
Q
 
Y
Y
 
L
Y
 
N
K
 
N
L
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
A
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
F
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
V
V
 
N
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
I
P
 
T
Q
 
V
G
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
S
I
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
P
E
 
G
L
 
N
K
 
Q
Q
 
R
D
 
G
F
 
F
E
 
D
P
 
L
L
 
P
T
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
F
F
 
L
R
 
H
V
 
V
P
 
G
N
 
C
T
 
P
N
 
H
I
 
H
Y
 
Y
R
 
R
A
 
F
P
 
A
E
 
L
G
 
A
H
 
-
G
 
G
D
 
E
D
 
S
P
 
E
K
 
E
A
 
H
F
 
F
G
 
A
R
 
D
W
 
R
A
 
L
A
 
A
D
 
V
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
Q
A
 
K
I
 
I
E
 
L
F
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
L
Q
 
M
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
R
G
 
T
Y
 
Y
F
 
W
E
 
E
R
 
K
V
 
I
R
 
Q
Q
 
K
I
 
V
C
 
C
D
 
R
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
Q
M
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
Q
D
 
T
F
 
F
G
 
G
Y
 
I
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
T
 
V
C
 
L
A
 
S
K
|
K
G
 
Q
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
S
Y
 
Y
S
 
Q
P
 
P
I
 
I
G
 
A
A
 
A
M
 
I
I
 
L
A
 
I
S
 
N
D
 
A
R
 
P
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
 
G
F
 
I
D
 
A
D
 
D
G
 
Q
R
 
S
T
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
G
A
 
A
F
 
L
A
 
G
H
 
H
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
G
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
K
L
 
I
F
 
I
E
 
E
R
 
E
E
 
E
G
 
S
L
 
L
N
 
V
D
 
E
R
 
H
V
 
A
K
 
A
Q
 
Q
N
 
M
A
 
G
P
 
Q
A
 
L
F
 
L
R
 
R
S
 
S
T
 
G
L
 
L
E
 
Q
K
 
H
L
 
F
Y
 
I
D
 
D
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
C
G
 
G
Y
 
L
F
 
I
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
G
D
 
D
K
 
R
A
 
V
T
 
S
K
 
K
E
 
-
T
 
-
F
 
-
T
 
A
P
 
P
D
 
Y
E
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
G
G
 
R
F
 
Y
L
 
M
S
 
A
T
 
G
A
 
R
L
 
A
F
 
Q
D
 
E
A
 
H
G
 
G
L
 
M
Y
 
I
C
 
T
R
|
R
A
 
A
D
 
-
D
 
-
R
x
M
G
 
G
D
 
D
P
 
A
V
 
V
V
 
A
Q
 
-
L
 
F
A
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
V
G
 
N
Q
 
E
S
 
Q
E
 
E
F
 
V
D
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
M
L
 
I
T
 
V
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
T
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q94CE5 Gamma-aminobutyrate transaminase POP2, mitochondrial; AtGABA-T; Gamma-aminobutyric acid aminotransferase 1; Protein HEXENAL RESPONSE 1; Protein POLLEN-PISTIL INCOMPATIBILITY 2; AtPOP2; EC 2.6.1.96 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
35% identity, 90% coverage: 36:448/460 of query aligns to 72:483/504 of Q94CE5

query
sites
Q94CE5
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
S
R
 
Y
I
 
V
F
 
Y
D
 
D
D
 
D
R
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
S
L
 
L
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
x
C
V
 
T
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
H
x
G
G
 
N
R
 
E
D
 
P
E
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
E
Q
 
Q
A
 
L
S
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
P
F
 
F
F
 
Y
-
 
H
P
 
S
L
 
F
W
 
W
S
 
N
Y
 
R
A
 
T
T
 
T
P
 
K
P
 
P
A
 
S
I
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
K
-
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
E
V
 
M
H
 
F
A
 
T
P
 
A
G
 
N
D
 
K
L
 
M
N
 
A
R
 
K
V
 
A
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
S
E
 
D
A
 
A
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
Q
W
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
V
K
 
W
Q
 
Y
Y
 
Y
Y
 
N
K
 
N
L
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
A
 
E
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
F
I
 
I
S
 
A
R
 
R
S
 
K
V
 
K
A
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
T
 
S
P
 
T
Q
 
L
G
 
I
A
 
S
L
 
A
A
 
S
I
 
L
T
 
S
G
 
G
I
 
L
P
 
P
E
 
P
L
 
L
K
 
H
Q
 
Q
D
 
N
F
 
F
E
 
D
P
 
L
L
 
P
T
 
A
P
 
P
G
 
F
A
 
V
F
 
L
R
 
H
V
 
T
P
 
D
N
 
C
T
 
P
N
 
H
I
 
Y
Y
 
W
R
 
R
A
 
F
P
 
-
E
 
H
G
 
L
H
 
P
G
 
G
D
 
E
D
 
T
P
 
E
K
 
E
A
 
E
F
 
F
G
 
S
R
 
T
W
 
R
A
 
L
A
 
A
D
 
K
R
 
N
I
 
L
A
 
E
E
 
D
A
 
L
I
 
I
E
 
I
F
 
K
E
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
N
 
G
A
 
A
G
|
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
P
P
 
P
P
 
P
P
 
A
G
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
R
 
K
V
 
V
R
 
Q
Q
 
A
I
 
V
C
 
V
D
 
K
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
I
S
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
T
M
 
M
F
 
F
A
x
G
C
 
C
S
 
D
D
 
K
F
 
Y
G
 
N
Y
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
V
T
 
T
C
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
A
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
S
 
M
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
I
I
 
L
A
 
M
S
 
S
D
 
Q
R
 
E
L
 
V
F
 
A
E
 
D
P
 
V
F
 
I
D
 
N
D
 
S
G
 
H
R
 
S
T
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
G
A
 
V
F
 
F
A
 
S
H
 
H
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
E
N
 
A
L
 
L
D
 
K
L
 
I
F
 
Y
E
 
K
R
 
E
E
 
R
G
 
N
L
 
I
N
 
P
D
 
E
R
 
Y
V
 
V
K
 
A
Q
 
K
N
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
R
F
 
F
R
 
Q
S
 
D
T
 
G
L
 
V
E
 
K
K
 
A
L
 
F
Y
 
A
D
 
S
-
 
G
L
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
T
R
 
R
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Y
 
L
F
 
I
Y
 
L
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
F
V
 
V
K
 
D
D
 
N
K
 
K
A
 
S
T
 
P
K
 
N
E
 
E
T
 
P
F
 
F
T
 
P
P
 
P
D
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
W
V
 
G
L
 
V
R
 
G
G
 
A
F
 
F
L
 
F
S
 
G
T
 
A
A
 
E
L
 
C
F
 
Q
D
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
Y
 
L
C
 
V
R
 
R
A
 
V
D
 
A
D
 
G
R
 
D
G
 
G
D
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
I
Q
 
L
L
 
M
A
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
I
G
 
S
Q
 
P
S
 
E
E
 
E
F
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
L
E
 
I
Q
 
S
I
 
I

5kr3A Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
36% identity, 94% coverage: 24:455/460 of query aligns to 22:452/458 of 5kr3A

query
sites
5kr3A
H
 
H
F
 
A
S
 
H
R
 
D
H
 
H
G
 
A
A
 
S
G
 
G
I
 
A
V
 
L
-
 
P
A
 
G
P
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
E
D
 
D
D
 
H
R
 
E
G
 
G
R
 
R
S
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
A
L
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
I
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
T
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
A
A
 
I
A
 
Y
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
S
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
F
 
Y
P
 
H
L
 
T
W
 
Y
-
 
V
S
 
G
Y
 
H
A
 
S
T
 
T
P
 
D
P
 
A
A
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
S
R
 
R
L
 
I
A
 
I
V
 
R
H
 
D
-
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
G
L
 
M
N
 
K
R
 
K
V
 
V
F
 
Y
F
 
Y
T
 
G
T
 
M
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
D
A
 
A
V
 
N
E
 
E
S
 
T
A
 
Q
W
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
V
K
 
W
Q
 
Y
Y
 
Y
Y
 
N
K
 
N
L
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
A
 
N
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
I
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
E
V
 
R
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
S
P
 
G
Q
 
I
G
 
V
A
 
T
L
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
P
E
 
S
L
 
F
K
 
H
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
E
 
D
-
 
L
P
 
P
L
 
I
T
 
D
P
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
R
V
 
V
P
 
K
N
 
H
T
 
T
-
 
V
-
 
C
-
 
P
N
 
H
I
 
W
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
P
 
P
E
 
M
G
 
S
H
 
E
G
 
A
D
 
Q
D
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
F
G
 
V
R
 
A
W
 
Y
A
 
C
A
 
V
D
 
E
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
L
I
 
I
E
 
A
F
 
R
E
 
E
G
 
G
P
 
A
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
N
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
I
F
 
I
P
 
P
P
 
P
P
 
P
P
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
E
 
E
R
 
A
V
 
I
R
 
Q
Q
 
A
I
 
V
C
 
L
D
 
R
E
 
K
Y
 
H
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
S
M
 
K
F
 
M
A
 
G
C
 
S
S
 
Q
D
 
H
F
 
Y
G
 
G
Y
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
I
T
 
T
C
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
L
G
 
S
A
 
G
M
 
V
I
 
I
A
 
V
S
 
G
D
 
E
R
 
K
L
 
V
F
 
W
E
 
D
P
 
V
F
 
I
D
 
E
D
 
K
G
 
G
R
 
S
T
 
Q
A
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
P
F
 
M
A
 
G
H
 
H
G
 
G
Y
 
W
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
C
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
L
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
T
D
 
G
R
 
N
V
 
A
K
 
A
Q
 
D
N
 
V
A
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
L
R
 
Q
S
 
Q
T
 
R
L
 
L
E
 
H
K
 
E
L
 
A
Y
 
F
D
 
G
L
 
A
-
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
V
G
 
G
Y
 
M
F
 
L
Y
 
A
G
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
M
K
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
D
T
 
A
K
 
R
E
 
T
T
 
P
F
 
F
T
 
D
P
 
P
D
 
-
E
 
-
A
 
A
E
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
G
R
 
P
G
 
K
F
 
V
L
 
S
S
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
E
D
 
D
A
 
-
G
 
G
L
 
M
Y
 
I
C
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
M
D
 
P
R
 
H
G
 
G
D
 
D
P
 
-
V
 
I
V
 
L
Q
 
G
L
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
C
 
T
G
 
T
Q
 
R
S
 
A
E
 
E
F
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
V
Q
 
G
I
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
Q
V
 
A
L
 
V
T
 
D
E
 
E

3i5tA Crystal structure of aminotransferase prk07036 from rhodobacter sphaeroides kd131
38% identity, 92% coverage: 35:455/460 of query aligns to 26:436/444 of 3i5tA

query
sites
3i5tA
P
 
P
V
 
V
I
 
L
A
 
T
R
 
H
G
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
I
 
V
F
 
H
D
 
T
D
 
E
R
 
D
G
 
G
R
 
R
S
 
R
Y
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
P
S
 
A
G
 
G
L
 
M
F
 
W
V
 
C
V
 
A
Q
 
Q
A
 
V
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
R
E
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
H
Q
 
Q
A
 
A
S
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
F
 
A
P
 
S
L
 
P
W
 
W
S
 
Y
Y
 
M
A
 
A
T
 
T
P
 
S
P
 
P
A
 
A
I
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
T
H
 
L
A
 
T
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
N
 
N
R
 
R
V
 
I
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
G
|
G
G
x
S
E
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
D
S
 
S
A
 
A
W
 
L
K
 
R
L
 
F
A
 
S
K
 
E
Q
 
F
Y
 
Y
Y
 
N
K
 
N
L
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
H
 
K
K
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
V
R
 
R
S
 
Y
V
 
D
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
S
P
 
T
Q
 
A
G
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
A
I
 
C
T
 
T
G
 
G
I
 
R
P
 
T
E
 
G
L
 
N
K
 
W
Q
 
P
D
 
N
F
 
F
E
 
D
P
 
I
L
 
A
T
 
Q
P
 
D
G
 
R
A
 
I
F
 
S
R
 
F
V
 
L
P
 
S
N
 
S
T
 
P
N
 
N
I
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
P
E
 
R
G
 
H
H
 
A
G
 
G
D
 
N
-
 
R
D
 
S
P
 
Q
K
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
L
R
 
D
W
 
D
A
 
L
A
 
V
D
 
Q
R
 
E
I
 
F
A
 
E
E
 
D
A
 
R
I
 
I
E
 
E
F
 
S
E
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
L
L
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
L
N
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
I
P
 
P
P
 
P
P
 
A
G
 
G
Y
 
Y
F
 
H
E
 
A
R
 
R
V
 
F
R
 
K
Q
 
A
I
 
I
C
 
C
D
 
E
E
 
K
Y
 
H
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
S
 
S
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
x
V
C
 
T
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
C
G
 
G
S
 
E
M
 
W
F
 
F
A
 
A
C
 
S
S
 
E
D
 
K
-
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
C
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
G
M
 
L
I
 
A
A
 
I
S
 
S
D
 
E
R
 
A
L
 
V
F
 
L
E
 
A
P
 
R
F
 
I
D
 
-
D
 
S
G
 
G
R
 
E
T
 
N
A
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
W
F
 
F
A
 
T
H
 
N
G
 
G
Y
|
Y
T
|
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
N
H
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
C
A
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
I
D
 
E
L
 
L
F
 
M
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
I
N
 
V
D
 
D
R
 
Q
V
 
A
K
 
R
Q
 
E
N
 
M
A
 
A
P
 
D
A
 
Y
F
 
F
R
 
A
S
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
L
Y
 
R
D
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
G
V
 
V
G
 
A
D
 
E
V
 
T
R
 
R
G
 
S
E
 
V
G
 
G
Y
 
L
F
 
V
Y
 
G
G
 
C
I
 
V
E
 
Q
L
 
C
V
 
L
K
 
L
D
 
D
-
 
G
K
 
T
A
 
A
T
 
E
K
 
D
E
 
K
T
 
A
F
 
F
T
 
T
P
 
L
D
 
K
E
 
I
A
 
D
E
 
E
R
 
R
V
 
C
L
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
D
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
C
 
V
R
 
R
A
 
P
D
 
-
D
 
-
R
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
L
V
 
C
V
|
V
Q
 
-
L
 
I
A
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
I
G
 
S
Q
 
R
S
 
A
E
 
Q
F
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
M
E
 
V
Q
 
A
I
 
I
L
 
M
R
 
R
G
 
Q
V
 
A
L
 
I
T
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8wqjA Crystal structure of transaminase from shimia marina
37% identity, 91% coverage: 34:452/460 of query aligns to 35:447/472 of 8wqjA

query
sites
8wqjA
A
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
T
R
 
Q
G
 
A
E
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
L
F
 
T
D
 
D
D
 
S
R
 
E
G
 
G
R
 
A
S
 
Q
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
A
L
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
I
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
A
 
M
S
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
F
 
Y
P
 
N
L
 
T
W
 
F
S
 
F
Y
 
K
A
 
T
T
 
T
P
 
H
-
 
V
P
 
P
A
 
V
I
 
I
E
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
E
H
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
N
 
N
R
 
H
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
T
 
A
T
 
G
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
N
W
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
V
K
 
R
Q
 
H
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
S
L
 
A
T
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
S
K
 
K
H
 
T
K
 
I
V
 
F
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
K
V
 
N
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
T
 
S
P
 
T
Q
 
M
G
 
A
A
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
L
T
 
G
G
 
G
I
 
M
P
 
V
E
 
P
L
 
M
K
 
H
Q
 
Q
D
 
Q
F
 
G
E
 
S
P
 
L
L
 
P
T
 
I
P
 
P
G
 
D
A
 
V
F
 
H
R
 
H
V
 
I
P
 
N
N
 
Q
T
 
P
N
 
N
I
 
W
Y
 
W
R
 
-
A
 
-
P
 
A
E
 
E
G
 
G
H
 
G
G
 
D
D
 
M
D
 
S
P
 
P
K
 
E
A
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
L
W
 
Q
A
 
R
A
 
A
D
 
Q
R
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
L
F
 
E
E
 
L
G
 
G
P
 
E
D
 
D
T
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
E
G
 
T
Y
 
Y
F
 
W
E
 
P
R
 
E
V
 
I
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
K
Y
 
Y
D
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
N
M
 
W
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
Q
D
 
T
F
 
V
G
 
G
Y
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
H
I
 
I
I
 
M
T
 
S
C
 
I
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
G
M
 
S
I
 
I
A
 
V
S
 
C
D
 
D
R
 
E
L
 
V
F
 
A
E
 
E
P
 
V
F
 
V
D
 
-
D
 
-
G
 
A
R
 
A
T
 
T
A
 
E
F
 
F
A
 
N
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
T
|
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
R
L
 
I
F
 
I
E
 
E
R
 
E
E
 
E
G
 
N
L
 
I
N
 
I
D
 
G
R
 
H
V
 
V
K
 
R
Q
 
D
N
 
D
-
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
R
 
K
S
 
E
T
 
K
L
 
W
E
 
E
K
 
A
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
A
R
 
K
G
 
I
E
 
V
G
 
G
Y
 
M
F
 
M
Y
 
G
G
 
S
I
 
I
E
 
A
L
 
L
V
 
T
K
 
P
D
 
N
K
 
K
A
 
E
T
 
T
K
 
R
E
 
A
T
 
P
F
 
F
T
 
A
P
 
A
D
 
D
E
 
T
A
 
G
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
Y
 
K
C
 
C
R
 
R
A
 
E
D
 
H
D
 
C
R
 
F
G
 
G
D
 
N
P
 
N
V
 
L
V
 
V
Q
 
M
-
 
R
-
 
H
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
M
-
 
I
L
 
I
A
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
C
 
M
G
 
T
Q
 
R
S
 
D
E
 
E
F
 
V
D
 
D
E
 
T
-
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
I
 
A
L
 
T
R
 
R
G
 
A
V
 
L

7qx3A Structure of the transaminase tr2e2 with eos (see paper)
37% identity, 92% coverage: 36:460/460 of query aligns to 3:421/422 of 7qx3A

query
sites
7qx3A
V
 
I
I
 
I
A
 
T
R
 
R
G
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
C
R
 
Y
I
 
L
F
 
W
D
 
D
D
 
S
R
 
D
G
 
G
R
 
N
S
 
Q
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
W
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
I
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
R
Q
 
Q
A
 
M
S
 
Q
T
 
E
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
F
 
Y
P
 
N
-
 
N
L
 
F
W
 
F
S
 
Q
Y
 
C
A
 
S
T
 
H
P
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
R
R
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
E
H
 
V
A
 
T
P
 
P
G
 
K
D
 
H
L
 
M
N
 
N
R
 
H
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
G
G
 
S
G
 
G
G
 
S
E
 
D
A
 
S
V
 
N
E
 
D
S
 
T
A
 
I
W
 
L
K
 
R
L
 
M
A
 
V
K
 
R
Q
 
Y
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
K
L
 
L
T
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
K
 
K
H
 
K
K
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
E
V
 
N
A
 
A
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
T
 
S
P
 
T
Q
 
V
G
 
A
A
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
L
T
 
S
G
 
G
I
 
M
P
 
K
E
 
A
L
 
M
K
 
H
Q
 
S
D
 
H
F
 
G
E
 
D
P
 
L
L
 
P
T
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
I
F
 
E
R
 
H
V
 
I
P
 
E
N
 
Q
T
 
P
N
 
Y
I
 
H
Y
 
F
-
 
G
R
 
R
A
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
M
D
 
D
P
 
P
K
 
A
A
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
R
 
A
I
 
L
A
 
E
E
 
R
A
 
K
I
 
I
E
 
D
F
 
E
E
 
I
G
 
G
P
 
E
D
 
C
T
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
N
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
I
P
 
I
P
 
P
P
 
P
P
 
D
G
 
S
Y
 
Y
F
 
W
E
 
P
R
 
E
V
 
I
R
 
K
Q
 
R
I
 
I
C
 
C
D
 
A
E
 
E
Y
 
R
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
C
 
T
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
T
M
 
W
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
Q
D
 
Y
F
 
Y
G
 
D
Y
 
L
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
M
T
 
P
C
 
I
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
S
 
M
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
G
M
 
V
I
 
M
A
 
V
S
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
A
E
 
K
P
 
V
F
 
V
D
 
I
D
 
E
G
 
E
R
 
G
T
 
G
A
 
E
F
 
F
A
 
F
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
A
A
 
E
N
 
N
L
 
I
D
 
R
L
 
I
F
 
M
E
 
R
R
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
I
N
 
I
D
 
E
R
 
R
V
 
A
-
 
G
K
 
A
Q
 
E
N
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
R
 
Q
S
 
A
T
 
R
L
 
W
E
 
R
K
 
E
L
 
L
Y
 
G
D
 
E
L
 
H
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
V
G
 
G
Y
 
M
F
 
V
Y
 
A
G
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
K
D
 
S
K
 
K
A
 
Q
T
 
P
K
 
L
E
 
E
T
 
R
F
 
F
T
 
-
P
 
-
D
 
E
E
 
E
A
 
P
E
 
G
R
 
K
V
 
V
L
 
-
R
 
-
G
 
G
F
 
S
L
 
L
S
 
C
T
 
R
A
 
D
L
 
L
-
 
S
F
 
V
D
 
K
A
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
C
 
M
R
 
R
A
 
A
D
 
-
D
 
-
R
 
V
G
 
G
D
 
G
P
 
T
V
 
M
V
 
I
Q
 
-
L
 
I
A
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
C
 
L
G
 
S
Q
 
R
S
 
E
E
 
Q
F
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
L
E
 
I
Q
 
D
I
 
K
L
 
A
R
 
R
G
 
R
V
 
T
L
 
L
T
 
D
E
 
E
A
 
T
Y
 
H
T
 
K
R
 
A
I
 
I

3gjuA Crystal structure of a putative aminotransferase (mll7127) from mesorhizobium loti maff303099 at 1.55 a resolution
35% identity, 89% coverage: 36:445/460 of query aligns to 36:445/458 of 3gjuA

query
sites
3gjuA
V
 
I
I
 
M
A
 
A
R
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
V
F
 
W
D
 
D
D
 
N
R
 
N
G
 
G
R
 
R
S
 
K
Y
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
A
L
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
V
 
C
V
 
V
Q
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
Q
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
S
 
K
T
 
N
L
 
L
A
 
A
F
 
Y
F
 
Y
P
 
H
L
 
A
W
 
Y
-
 
V
S
 
G
Y
 
H
A
 
G
T
 
T
P
 
E
P
 
A
A
 
S
I
 
I
E
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
M
L
 
I
A
 
I
V
 
D
H
 
R
A
 
A
P
 
P
G
 
K
D
 
G
L
 
M
N
 
S
R
 
R
V
 
V
F
 
Y
F
 
F
T
 
G
T
 
L
G
x
S
G
|
G
G
x
S
E
 
D
A
 
A
V
 
N
E
 
E
S
 
T
A
 
N
W
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
I
K
 
W
Q
 
Y
Y
 
Y
Y
 
N
K
 
N
L
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
A
 
E
K
 
K
H
 
K
K
 
K
V
 
I
I
 
I
S
 
S
R
 
R
S
 
W
V
 
R
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
S
P
 
G
Q
 
V
G
 
M
A
 
T
L
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
D
E
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
L
T
 
F
P
 
H
G
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
D
V
 
L
P
 
P
N
 
-
T
 
-
N
 
-
I
 
-
Y
 
-
R
 
R
A
 
A
P
 
P
E
 
V
G
 
L
H
 
H
G
 
T
D
 
E
D
 
A
P
 
P
-
 
Y
-
 
Y
-
 
F
-
 
R
-
 
R
-
 
T
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
M
-
 
S
-
 
E
K
 
E
A
 
Q
F
 
F
G
 
S
R
 
Q
W
 
H
A
 
C
A
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
M
I
 
I
E
 
L
F
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
F
F
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
L
N
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
I
F
 
V
P
 
P
P
 
P
P
 
P
P
 
A
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
E
 
E
R
 
K
V
 
I
R
 
Q
Q
 
A
I
 
V
C
 
L
D
 
K
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
x
V
C
 
T
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
S
 
D
D
 
H
F
 
Y
G
 
G
Y
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
I
T
 
T
C
 
I
A
 
A
K
|
K
G
 
G
M
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
S
 
A
P
 
P
I
 
L
G
 
S
A
 
G
M
 
V
I
 
I
A
 
V
S
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
W
E
 
Q
P
 
V
F
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
G
D
 
S
D
 
D
G
 
K
R
 
L
T
 
G
A
 
S
F
 
L
A
 
G
H
 
H
G
 
G
Y
 
W
T
|
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
A
H
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
C
A
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
E
L
 
L
F
 
I
E
 
D
R
 
E
E
 
M
G
 
D
L
 
L
N
 
V
D
 
T
R
 
N
V
 
A
K
 
G
Q
 
E
N
 
T
A
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
F
R
 
R
S
 
A
T
 
E
L
 
L
E
 
A
K
 
K
-
 
A
L
 
V
Y
 
G
D
 
G
L
 
H
P
 
K
I
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
G
 
G
Y
 
M
F
 
L
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
F
V
 
V
K
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
D
T
 
D
K
 
R
E
 
V
T
 
F
F
 
F
T
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
D
A
 
A
E
 
S
R
 
Q
V
 
K
L
 
I
R
 
G
G
 
P
F
 
Q
L
 
V
S
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
F
 
A
D
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
C
 
G
R
 
R
A
 
A
D
 
M
D
 
P
R
 
Q
G
 
G
D
 
D
P
 
-
V
 
I
V
 
L
Q
x
G
L
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
C
C
 
L
G
 
T
Q
 
R
S
 
E
E
 
Q
F
 
A
D
 
D
E
 
I
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3du4A Crystal structure of 7-keto-8-aminopelargonic acid bound 7,8- diaminopelargonic acid synthase in bacillus subtilis (see paper)
35% identity, 96% coverage: 16:456/460 of query aligns to 8:443/448 of 3du4A

query
sites
3du4A
R
 
K
T
 
S
T
 
K
R
 
K
H
 
H
L
 
L
W
 
W
G
 
L
H
 
P
F
|
F
S
 
T
R
 
Q
H
 
M
G
 
K
A
 
D
G
 
Y
I
 
D
V
 
E
A
 
N
P
 
P
-
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
K
I
 
V
F
 
K
D
 
D
D
 
I
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
E
Y
 
Y
L
 
Y
D
 
D
G
 
G
L
 
F
S
 
S
G
 
S
L
 
V
F
 
W
V
 
L
V
 
N
Q
 
V
A
 
H
G
 
G
H
 
H
G
 
R
R
 
K
D
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
D
A
 
A
A
 
I
A
 
K
A
 
K
Q
 
Q
A
 
L
S
 
G
T
 
K
L
 
I
A
 
A
F
 
H
F
 
S
P
 
T
L
 
L
W
x
L
S
 
G
Y
 
M
A
 
T
T
 
N
P
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
T
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
I
V
 
D
H
 
I
A
 
S
P
 
P
G
 
K
D
 
K
L
 
L
N
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
T
 
S
T
 
D
G
x
S
G
|
G
G
x
A
E
 
E
A
 
A
V
 
M
E
 
E
S
 
I
A
 
A
W
 
L
K
 
K
L
 
M
A
 
A
K
 
F
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
K
L
 
N
T
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
K
 
K
H
 
Q
K
 
K
V
 
F
I
 
I
S
 
A
R
 
M
S
 
K
V
 
N
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
T
 
D
P
 
T
Q
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
S
I
 
V
T
 
G
G
 
S
I
 
I
P
 
E
E
 
L
L
 
F
K
 
H
Q
 
H
D
 
V
F
 
Y
E
 
G
P
 
P
L
 
L
T
 
M
P
 
F
G
 
E
A
 
S
F
 
Y
R
 
K
V
 
A
P
 
P
N
 
I
T
 
P
N
 
Y
I
 
V
Y
 
Y
R
 
R
A
 
S
P
 
E
E
 
S
G
 
G
H
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
K
 
D
A
 
E
F
 
C
G
 
R
R
 
D
W
 
Q
A
 
C
A
 
L
D
 
R
R
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
L
I
 
L
E
 
E
F
 
-
E
 
E
G
 
H
P
 
H
D
 
E
T
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
S
L
 
I
E
|
E
P
 
S
-
 
M
V
 
V
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
C
 
M
F
 
I
P
 
V
P
 
M
P
 
P
P
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
L
E
 
A
R
 
G
V
 
V
R
 
R
Q
 
E
I
 
L
C
 
C
D
 
T
E
 
T
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
M
V
 
I
S
 
V
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
x
A
C
 
T
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
K
M
 
M
F
 
F
A
 
A
C
 
C
S
 
E
D
 
H
F
 
E
G
 
N
Y
 
V
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
M
T
 
A
C
 
A
A
 
G
K
|
K
G
 
G
M
 
I
T
 
T
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
A
A
 
V
M
 
T
I
 
F
A
 
A
S
 
T
D
 
E
R
 
D
L
 
I
F
 
Y
E
 
K
P
 
A
F
 
F
D
 
Y
D
 
D
-
 
D
-
 
Y
-
 
E
G
 
N
R
 
L
T
 
K
A
 
T
F
 
F
A
 
F
H
 
H
G
|
G
Y
x
H
T
x
S
F
 
Y
G
 
T
G
 
G
H
 
N
P
 
Q
V
 
L
S
 
G
A
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
R
 
S
E
 
E
G
 
N
L
 
I
N
 
V
D
 
E
R
 
Q
V
 
V
K
 
A
Q
 
E
N
 
K
A
 
S
P
 
K
A
 
K
F
 
L
R
 
H
S
 
F
T
 
L
L
 
L
E
 
Q
K
 
D
L
 
L
Y
 
H
D
 
A
L
 
L
P
 
P
I
 
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
I
R
 
R
G
 
Q
E
 
L
G
 
G
Y
 
F
F
 
M
Y
 
C
G
 
G
I
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
R
D
 
S
K
 
K
A
 
E
T
 
T
K
 
K
E
 
E
T
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
P
D
 
Y
E
 
P
A
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
R
L
 
I
R
 
G
G
 
Y
F
 
K
L
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
K
L
 
M
F
 
R
D
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
M
Y
 
L
C
 
T
R
|
R
A
 
P
D
 
-
D
 
-
R
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
-
V
 
V
V
 
I
Q
x
A
L
 
F
A
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
A
C
 
S
G
 
T
Q
 
A
S
 
E
E
 
E
F
 
L
D
 
S
E
 
E
I
 
M
E
 
V
Q
 
A
I
 
I
L
 
M
R
 
K
G
 
Q
V
 
A
L
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
V

P53555 L-Lysine--8-amino-7-oxononanoate transaminase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; Diaminopelargonic acid synthase; L-Lysine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; EC 2.6.1.105 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
35% identity, 96% coverage: 16:456/460 of query aligns to 8:443/448 of P53555

query
sites
P53555
R
 
K
T
 
S
T
 
K
R
 
K
H
 
H
L
 
L
W
 
W
G
 
L
H
 
P
F
 
F
S
 
T
R
 
Q
H
 
M
G
 
K
A
 
D
G
 
Y
I
 
D
V
 
E
A
 
N
P
 
P
-
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
K
I
 
V
F
 
K
D
 
D
D
 
I
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
E
Y
 
Y
L
 
Y
D
 
D
G
 
G
L
 
F
S
 
S
G
 
S
L
 
V
F
 
W
V
 
L
V
 
N
Q
 
V
A
 
H
G
 
G
H
 
H
G
 
R
R
 
K
D
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
D
A
 
A
A
 
I
A
 
K
A
 
K
Q
 
Q
A
 
L
S
 
G
T
 
K
L
 
I
A
 
A
F
 
H
F
 
S
P
 
T
L
 
L
W
 
L
S
 
G
Y
 
M
A
 
T
T
 
N
P
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
T
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
I
V
 
D
H
 
I
A
 
S
P
 
P
G
 
K
D
 
K
L
 
L
N
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
T
 
S
T
 
D
G
 
S
G
|
G
G
x
A
E
 
E
A
 
A
V
 
M
E
 
E
S
 
I
A
 
A
W
 
L
K
 
K
L
 
M
A
 
A
K
 
F
Q
 
Q
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
K
L
 
N
T
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
K
 
K
H
 
Q
K
 
K
V
 
F
I
 
I
S
 
A
R
 
M
S
 
K
V
 
N
A
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
T
 
D
P
 
T
Q
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
S
I
 
V
T
 
G
G
 
S
I
 
I
P
 
E
E
 
L
L
 
F
K
 
H
Q
 
H
D
 
V
F
 
Y
E
 
G
P
 
P
L
 
L
T
 
M
P
 
F
G
 
E
A
 
S
F
 
Y
R
 
K
V
 
A
P
 
P
N
 
I
T
 
P
N
 
Y
I
 
V
Y
 
Y
R
 
R
A
 
S
P
 
E
E
 
S
G
 
G
H
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
P
K
 
D
A
 
E
F
 
C
G
 
R
R
 
D
W
 
Q
A
 
C
A
 
L
D
 
R
R
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
L
I
 
L
E
 
E
F
 
-
E
 
E
G
 
H
P
 
H
D
 
E
T
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
S
L
 
I
E
 
E
P
 
S
-
 
M
V
 
V
Q
 
Q
N
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
C
 
M
F
 
I
P
 
V
P
 
M
P
 
P
P
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
L
E
 
A
R
 
G
V
 
V
R
 
R
Q
 
E
I
 
L
C
 
C
D
 
T
E
 
T
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
M
V
 
I
S
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
A
C
 
T
A
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
K
M
 
M
F
 
F
A
 
A
C
 
C
S
 
E
D
 
H
F
 
E
G
 
N
Y
 
V
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
L
I
 
M
T
 
A
C
 
A
A
 
G
K
|
K
G
 
G
M
 
I
T
 
T
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
L
P
 
P
I
 
I
G
 
A
A
 
V
M
 
T
I
 
F
A
 
A
S
 
T
D
 
E
R
 
D
L
 
I
F
 
Y
E
 
K
P
 
A
F
 
F
D
 
Y
D
 
D
-
 
D
-
 
Y
-
 
E
G
 
N
R
 
L
T
 
K
A
 
T
F
 
F
A
 
F
H
 
H
G
|
G
Y
x
H
T
x
S
F
 
Y
G
 
T
G
 
G
H
 
N
P
 
Q
V
 
L
S
 
G
A
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
R
 
S
E
 
E
G
 
N
L
 
I
N
 
V
D
 
E
R
 
Q
V
 
V
K
 
A
Q
 
E
N
 
K
A
 
S
P
 
K
A
 
K
F
 
L
R
 
H
S
 
F
T
 
L
L
 
L
E
 
Q
K
 
D
L
 
L
Y
 
H
D
 
A
L
 
L
P
 
P
I
 
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
I
R
 
R
G
 
Q
E
 
L
G
 
G
Y
 
F
F
 
M
Y
 
C
G
 
G
I
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
R
D
 
S
K
 
K
A
 
E
T
 
T
K
 
K
E
 
E
T
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
P
D
 
Y
E
 
P
A
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
R
L
 
I
R
 
G
G
 
Y
F
 
K
L
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
K
L
 
M
F
 
R
D
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
M
Y
 
L
C
 
T
R
|
R
A
 
P
D
 
-
D
 
-
R
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
-
V
 
V
V
 
I
Q
 
A
L
 
F
A
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
A
C
 
S
G
 
T
Q
 
A
S
 
E
E
 
E
F
 
L
D
 
S
E
 
E
I
 
M
E
 
V
Q
 
A
I
 
I
L
 
M
R
 
K
G
 
Q
V
 
A
L
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
V

Query Sequence

>WP_076477021.1 NCBI__GCF_900156495.1:WP_076477021.1
MTSTDTRPATSSSDGRTTRHLWGHFSRHGAGIVAPVIARGEGVRIFDDRGRSYLDGLSGL
FVVQAGHGRDELAAAAAAQASTLAFFPLWSYATPPAIELAERLAVHAPGDLNRVFFTTGG
GEAVESAWKLAKQYYKLTGKPAKHKVISRSVAYHGTPQGALAITGIPELKQDFEPLTPGA
FRVPNTNIYRAPEGHGDDPKAFGRWAADRIAEAIEFEGPDTVAAVFLEPVQNAGGCFPPP
PGYFERVRQICDEYDVLLVSDEVICAFGRIGSMFACSDFGYVPDIITCAKGMTSGYSPIG
AMIASDRLFEPFDDGRTAFAHGYTFGGHPVSAAVALANLDLFEREGLNDRVKQNAPAFRS
TLEKLYDLPIVGDVRGEGYFYGIELVKDKATKETFTPDEAERVLRGFLSTALFDAGLYCR
ADDRGDPVVQLAPPLICGQSEFDEIEQILRGVLTEAYTRI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory