SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_076477601.1 NCBI__GCF_900156495.1:WP_076477601.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
28% identity, 67% coverage: 59:299/358 of query aligns to 3:213/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
R
 
R
G
 
G
S
 
T
V
 
L
I
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
K
x
E
Y
 
A
D
 
T
Q
x
F
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
 
G
L
 
F
R
 
K
E
 
D
P
 
E
N
 
N
N
 
G
T
 
K
F
 
L
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
I
G
 
D
V
 
L
S
 
A
T
 
K
F
 
A
V
 
I
V
 
A
N
 
K
N
 
K
I
 
L
A
 
G
D
 
V
R
 
K
L
 
V
K
 
E
V
 
F
K
 
K
H
 
-
P
 
P
K
 
M
I
 
D
T
x
F
W
 
D
R
 
G
E
 
I
T
 
I
P
 
P
S
 
A
A
 
L
Q
 
Q
R
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
-
N
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
I
D
 
D
M
 
V
I
 
V
A
 
I
A
 
A
T
x
G
Y
x
M
S
x
T
I
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
K
K
 
K
K
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
V
 
E
N
 
A
Y
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
I
L
 
V
V
 
V
R
 
K
E
 
K
D
 
G
D
 
N
N
 
D
S
 
S
I
 
I
S
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
-
K
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
V
C
 
G
S
 
V
V
 
Q
T
 
L
G
 
G
S
|
S
T
|
T
S
 
S
A
 
E
Q
 
Q
N
 
H
V
 
V
K
 
K
N
 
K
Q
 
V
L
 
A
S
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
L
 
V
Q
 
K
E
 
K
Y
 
F
D
 
D
S
 
N
Y
 
F
S
 
S
S
 
E
C
 
A
V
 
F
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
R
 
K
L
 
S
K
 
G
K
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
V
T
 
T
D
|
D
E
 
N
V
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
L
G
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
S
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
N
 
-
K
 
-
F
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
P
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
A
C
 
Y
V
 
V
T
 
K
A
 
Q
S
 
N
G
 
P
K
 
N
K
 
A
S
 
G
L
 
V
K
 
K
K
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
E
P
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
G
E
 
E
R
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
V
A
 
R
Q
 
K
Q
 
G
F
 
N
P
 
S
Q
 
E
A
 
L
V
 
L
D
 
E
E
 
K
V
 
I
N
 
N
T
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
M
 
M
L
 
K
T
 
K
P
 
D
G
 
G

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
28% identity, 67% coverage: 59:299/358 of query aligns to 3:215/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
R
 
R
G
 
G
S
 
T
V
 
L
I
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
K
x
E
Y
 
A
D
 
T
Q
x
F
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
 
G
L
 
F
R
 
K
E
 
D
P
 
E
N
 
N
N
 
G
T
 
K
F
 
L
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
I
G
 
D
V
 
L
S
 
A
T
 
K
F
 
A
V
 
I
V
 
A
N
 
K
N
 
K
I
 
L
A
 
G
D
 
V
R
 
K
L
 
V
K
 
E
V
 
F
K
 
K
H
 
-
P
 
P
K
 
M
I
 
D
T
x
F
W
 
D
R
 
G
E
 
I
T
 
I
P
 
P
S
 
A
A
 
L
Q
 
Q
R
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
-
N
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
I
D
 
D
M
 
V
I
 
V
A
 
I
A
|
A
T
x
G
Y
x
M
S
x
T
I
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
K
K
 
K
K
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
V
 
E
N
 
A
Y
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
I
L
 
V
V
 
V
R
 
K
E
 
K
D
 
G
D
 
N
N
 
D
S
 
S
I
 
I
S
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
-
K
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
V
C
 
G
S
 
V
V
x
Q
T
 
L
G
 
G
S
|
S
T
|
T
S
 
S
A
 
E
Q
 
Q
N
 
H
V
 
V
K
 
K
N
 
K
-
 
V
-
 
A
Q
 
K
L
 
D
S
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
L
 
V
Q
 
K
E
 
K
Y
 
F
D
 
D
S
 
N
Y
 
F
S
 
S
S
 
E
C
 
A
V
 
F
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
R
 
K
L
 
S
K
 
G
K
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
V
T
 
T
D
|
D
E
 
N
V
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
L
G
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
S
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
N
 
-
K
 
-
F
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
P
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
A
C
 
Y
V
 
V
T
 
K
A
 
Q
S
 
N
G
 
P
K
 
N
K
 
A
S
 
G
L
 
V
K
 
K
K
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
E
P
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
G
E
 
E
R
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
V
A
 
R
Q
 
K
Q
 
G
F
 
N
P
 
S
Q
 
E
A
 
L
V
 
L
D
 
E
E
 
K
V
 
I
N
 
N
T
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
M
 
M
L
 
K
T
 
K
P
 
D
G
 
G

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
30% identity, 67% coverage: 61:299/358 of query aligns to 14:224/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
S
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
W
G
 
G
T
 
V
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
T
P
 
R
G
 
L
L
 
F
G
 
G
L
 
M
R
 
M
E
 
D
-
 
I
P
 
E
N
 
S
N
 
R
T
 
T
F
 
V
T
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
D
V
 
I
S
 
A
T
 
K
F
 
A
V
 
I
V
 
T
N
 
K
N
 
K
I
 
I
A
 
L
D
 
G
R
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
D
H
 
N
P
 
G
K
 
K
I
 
T
T
 
E
W
 
F
R
 
V
E
 
E
T
 
V
P
 
T
S
|
S
A
 
K
Q
 
T
R
|
R
E
 
I
T
 
P
L
 
L
I
 
L
D
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
N
V
 
I
D
 
D
M
 
A
I
 
I
A
 
I
A
 
A
T
|
T
Y
x
M
S
x
T
I
 
I
T
 
T
A
 
D
A
 
E
R
|
R
A
 
K
K
 
K
K
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
D
P
 
V
Y
 
Y
L
 
F
V
 
D
N
 
A
Y
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
K
D
 
G
D
 
-
N
 
S
S
 
Q
I
 
I
S
 
K
T
 
S
L
 
V
T
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
N
K
 
A
G
 
S
K
 
T
K
 
T
L
 
V
C
 
L
S
 
A
V
 
V
T
 
K
G
 
G
S
|
S
T
|
T
S
 
S
A
 
A
Q
 
A
N
 
N
V
 
I
K
 
R
N
 
Q
Q
 
H
L
 
A
S
 
P
G
 
D
V
 
A
Q
 
K
L
 
I
Q
 
L
E
 
E
Y
 
L
D
 
E
S
 
N
Y
|
Y
S
 
A
S
 
E
C
 
A
V
 
F
E
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
S
K
 
G
K
 
Q
V
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
M
T
 
T
T
 
T
D
|
D
E
 
N
V
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
F
 
I
A
 
A
D
 
D
F
 
E
S
 
N
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
N
 
-
K
 
-
F
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
P
 
P
K
 
E
N
 
Y
A
 
E
C
 
L
V
 
V
T
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
G
P
 
T
F
 
F
S
 
T
T
 
N
E
 
E
R
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
I
A
 
N
Q
 
K
Q
 
G
F
 
Q
P
 
E
Q
 
N
A
 
F
V
 
L
D
 
K
E
 
A
V
 
V
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
M
 
M
L
 
H
T
 
A
P
 
D
G
 
G

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 50% coverage: 59:236/358 of query aligns to 51:223/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
R
 
R
G
 
G
S
 
R
V
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
G
T
 
L
K
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
S
P
 
N
G
 
L
L
 
F
G
 
S
L
 
F
R
 
R
E
 
D
P
 
P
-
 
I
N
 
T
N
 
G
T
 
E
F
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
D
V
 
I
S
 
A
T
 
G
F
 
E
V
 
V
V
 
A
N
 
R
N
 
D
I
 
I
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
F
K
 
G
V
 
V
K
 
P
H
 
S
P
 
-
K
 
H
I
 
V
T
 
E
W
 
Y
R
 
R
E
 
I
T
 
L
P
 
S
S
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
|
R
E
 
V
T
 
T
L
 
A
I
 
L
D
 
Q
N
 
K
G
 
S
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
M
 
I
I
 
V
A
 
V
A
 
K
T
|
T
Y
 
M
S
|
S
I
 
I
T
 
T
A
 
C
A
 
E
R
|
R
A
 
R
K
 
K
K
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
A
 
S
G
 
T
P
 
V
Y
 
Y
L
 
L
V
 
D
N
 
A
Y
 
N
Q
 
Q
G
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
R
 
P
E
 
R
D
 
D
D
 
-
N
 
S
S
 
P
I
 
I
S
 
T
T
 
K
L
 
V
T
 
S
D
 
D
L
 
L
D
 
-
K
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
V
C
 
C
S
 
V
V
 
A
T
 
R
G
 
G
S
x
T
T
|
T
S
 
S
A
 
L
Q
 
R
N
 
R
V
 
I
K
 
R
N
 
E
Q
 
I
L
 
A
S
 
P
G
 
P
V
 
P
Q
 
V
L
 
I
Q
 
V
E
 
S
Y
 
V
D
 
V
S
 
N
Y
x
W
S
 
A
S
 
D
C
 
C
V
 
L
E
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
Q
K
 
R
K
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
S
T
 
T
D
|
D
E
 
D
V
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
V
D
 
E
F
 
E
S
 
D
L
 
P
Y
 
Y

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 50% coverage: 59:236/358 of query aligns to 50:222/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
R
 
R
G
 
G
S
 
R
V
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
G
T
 
L
K
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
S
P
 
N
G
 
L
L
 
F
G
 
S
L
 
F
R
 
R
E
 
D
P
 
P
-
 
I
N
 
T
N
 
G
T
 
E
F
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
D
V
 
I
S
 
A
T
 
G
F
 
E
V
 
V
V
 
A
N
 
R
N
 
D
I
 
I
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
F
K
 
G
V
 
V
K
 
P
H
 
S
P
 
-
K
 
H
I
 
V
T
 
E
W
 
Y
R
 
R
E
 
I
T
 
L
P
 
S
S
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
|
R
E
 
V
T
 
T
L
 
A
I
 
L
D
 
Q
N
 
K
G
 
S
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
M
 
I
I
 
V
A
 
V
A
 
K
T
|
T
Y
 
M
S
|
S
I
 
I
T
 
T
A
 
C
A
 
E
R
|
R
A
 
R
K
 
K
K
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
A
 
S
G
 
T
P
 
V
Y
 
Y
L
 
L
V
 
D
N
 
A
Y
 
N
Q
 
Q
G
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
R
 
P
E
 
R
D
 
D
D
 
-
N
 
S
S
 
P
I
 
I
S
 
T
T
 
K
L
 
V
T
 
S
D
 
D
L
 
L
D
 
-
K
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
V
C
 
C
S
 
V
V
 
A
T
 
R
G
 
G
S
x
T
T
|
T
S
 
S
A
 
L
Q
 
R
N
 
R
V
 
I
K
 
R
N
 
E
Q
 
I
L
 
A
S
 
P
G
 
P
V
 
P
Q
 
V
L
 
I
Q
 
V
E
 
S
Y
 
V
D
 
V
S
 
N
Y
x
W
S
 
A
S
 
D
C
 
C
V
 
L
E
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
Q
K
 
R
K
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
S
T
 
T
D
|
D
E
 
D
V
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
V
D
 
E
F
 
E
S
 
D
L
 
P
Y
 
Y

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 50% coverage: 59:236/358 of query aligns to 50:222/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
R
 
R
G
 
G
S
 
R
V
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
G
T
 
L
K
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
S
P
 
N
G
 
L
L
 
F
G
 
S
L
 
F
R
 
R
E
 
D
P
 
P
-
 
I
N
 
T
N
 
G
T
 
E
F
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
D
V
 
I
S
 
A
T
 
G
F
 
E
V
 
V
V
 
A
N
 
R
N
 
D
I
 
I
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
F
K
 
G
V
 
V
K
 
P
H
 
S
P
 
-
K
 
H
I
 
V
T
 
E
W
 
Y
R
 
R
E
 
I
T
 
L
P
 
S
S
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
|
R
E
 
V
T
 
T
L
 
A
I
 
L
D
 
Q
N
 
K
G
 
S
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
M
 
I
I
 
V
A
 
V
A
 
K
T
|
T
Y
 
M
S
|
S
I
 
I
T
 
T
A
 
C
A
 
E
R
|
R
A
 
R
K
 
K
K
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
A
 
S
G
 
T
P
 
V
Y
 
Y
L
 
L
V
 
D
N
 
A
Y
 
N
Q
 
Q
G
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
R
 
P
E
 
R
D
 
D
D
 
-
N
 
S
S
 
P
I
 
I
S
 
T
T
 
K
L
 
V
T
 
S
D
 
D
L
 
L
D
 
-
K
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
V
C
 
C
S
 
V
V
 
A
T
 
R
G
 
G
S
x
T
T
|
T
S
 
S
A
 
L
Q
 
R
N
 
R
V
 
I
K
 
R
N
 
E
Q
 
I
L
 
A
S
 
P
G
 
P
V
 
P
Q
 
V
L
 
I
Q
 
V
E
 
S
Y
 
V
D
 
V
S
 
N
Y
x
W
S
 
A
S
 
D
C
 
C
V
 
L
E
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
Q
K
 
R
K
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
S
T
 
T
D
|
D
E
 
D
V
 
T
I
|
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
V
D
 
E
F
 
E
S
 
D
L
 
P
Y
 
Y

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
24% identity, 69% coverage: 53:299/358 of query aligns to 3:218/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
L
 
L
I
 
D
D
 
E
S
 
I
I
 
M
K
 
K
R
 
R
G
 
G
S
 
T
V
 
L
I
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
K
x
D
Y
 
A
D
 
D
Q
x
Y
P
 
K
G
 
P
L
 
F
G
 
S
L
 
F
R
 
K
E
 
D
P
 
K
N
 
N
N
 
G
T
 
Q
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
I
G
 
D
V
 
L
S
 
A
T
 
K
F
 
A
V
 
L
V
 
A
N
 
K
N
 
E
I
 
L
A
 
G
D
 
-
R
 
-
L
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
E
H
 
F
P
 
V
K
 
P
I
 
T
T
 
T
W
|
W
R
 
D
E
 
G
T
 
I
P
 
I
S
 
P
A
 
A
Q
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
L
D
 
Q
N
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
F
D
 
D
M
 
I
I
 
V
A
 
M
A
x
S
T
x
G
Y
x
M
S
x
T
I
 
I
T
 
T
A
 
P
A
 
E
R
|
R
A
 
K
K
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
V
 
T
N
 
A
Y
 
G
Q
 
Q
G
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
K
D
 
D
D
 
N
-
 
A
N
 
D
S
 
K
I
 
I
S
 
K
T
 
S
L
 
F
T
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
N
K
 
K
G
 
P
K
 
D
-
 
V
K
 
K
L
 
V
C
 
A
S
 
V
V
x
Q
T
 
L
G
 
G
S
x
T
T
|
T
S
 
S
A
 
E
Q
 
Q
N
 
A
V
 
A
K
 
K
N
 
E
Q
 
F
L
 
L
S
 
P
G
 
K
V
 
A
Q
 
K
L
 
I
Q
 
R
E
 
T
Y
 
F
D
 
E
S
 
N
Y
 
N
S
 
A
S
 
E
C
 
A
V
 
F
E
 
Q
A
 
E
L
 
V
R
 
V
L
 
S
K
 
G
K
 
R
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
M
T
 
V
T
 
T
D
|
D
E
 
S
V
 
P
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
Y
F
 
Y
A
 
A
D
 
K
F
 
L
S
 
A
L
 
V
Y
 
V
R
 
-
N
 
-
K
 
-
F
 
-
K
 
-
I
 
V
V
 
V
D
 
D
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
P
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
C
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
E
P
 
P
F
 
F
S
 
T
T
 
H
E
 
E
R
 
P
Y
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
A
M
 
I
A
 
R
Q
 
K
Q
 
G
F
 
D
P
 
P
Q
 
E
A
 
L
V
 
L
D
 
N
E
 
W
V
 
V
N
 
N
T
 
N
A
 
W
L
 
L
D
 
K
A
 
Q
M
 
M
L
 
K
T
 
K
P
 
D
G
 
G

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
31% identity, 50% coverage: 54:232/358 of query aligns to 3:181/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
I
 
L
D
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
-
 
S
R
 
K
G
 
G
S
 
Q
V
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
G
T
 
V
K
|
K
Y
 
N
D
 
D
Q
 
V
P
 
P
G
 
H
L
 
Y
G
 
A
L
 
L
-
 
L
R
 
D
E
 
Q
P
 
A
N
 
T
N
 
G
T
 
E
F
 
I
T
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
E
V
 
V
G
 
D
V
 
V
S
 
A
T
 
K
F
 
L
V
 
L
V
 
A
N
 
K
N
 
S
I
 
I
A
 
L
D
 
G
R
 
D
L
 
D
K
 
K
V
 
-
K
 
-
H
 
-
P
 
-
K
 
K
I
 
I
T
 
K
W
 
L
R
 
V
E
 
A
T
 
V
P
 
N
S
 
A
A
 
K
Q
 
T
R
|
R
E
 
G
T
 
P
L
 
L
I
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
M
 
A
I
 
V
A
 
I
A
 
A
T
|
T
Y
 
F
S
x
T
I
 
I
T
 
T
A
 
P
A
 
E
R
|
R
A
 
K
K
 
R
K
 
I
V
 
Y
A
 
N
F
 
F
A
 
S
G
 
E
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
N
 
D
Y
 
A
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
 
L
E
 
K
D
 
-
D
 
E
N
 
K
S
 
K
I
 
Y
S
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
A
D
 
D
L
 
M
D
 
-
K
 
K
G
 
G
K
 
A
K
 
N
L
 
I
C
 
G
S
 
V
V
 
A
T
 
Q
G
 
A
S
x
A
T
|
T
S
 
T
A
 
K
Q
 
K
N
 
A
V
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
A
K
 
K
N
 
K
Q
 
I
L
 
G
S
 
I
G
 
D
V
 
V
Q
 
K
L
 
F
Q
 
S
E
 
E
Y
 
F
D
 
P
S
 
D
Y
|
Y
S
 
P
S
 
S
C
 
I
V
 
K
E
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
D
L
 
A
K
 
K
K
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
F
T
 
S
T
 
V
D
|
D
E
 
K
V
 
S
I
|
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
A
 
V
D
 
D

1xt8B Crystal structure of cysteine-binding protein from campylobacter jejuni at 2.0 a resolution (see paper)
27% identity, 66% coverage: 52:287/358 of query aligns to 5:232/251 of 1xt8B

query
sites
1xt8B
N
 
N
L
 
S
I
 
L
D
 
D
S
 
K
I
 
I
K
 
K
R
 
Q
G
 
N
S
 
G
V
 
V
I
 
V
-
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
V
K
x
F
Y
 
G
D
 
D
Q
x
K
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
 
G
L
 
Y
R
 
V
E
 
D
P
 
E
N
 
K
N
 
G
T
 
N
F
 
N
T
 
Q
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
V
 
I
G
 
A
V
 
L
S
 
A
T
 
K
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
-
N
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
K
R
 
E
L
 
L
K
 
F
V
 
G
K
 
D
H
 
E
P
 
N
K
 
K
I
 
V
T
 
Q
W
 
F
R
 
V
E
 
L
T
 
V
P
 
E
S
 
A
A
 
A
Q
 
N
R
|
R
E
 
V
T
 
E
L
 
F
I
 
L
D
 
K
N
 
S
G
 
N
E
 
K
V
 
V
D
 
D
M
 
I
I
 
I
A
 
L
A
 
A
T
x
N
Y
 
F
S
x
T
I
 
Q
T
 
T
A
 
P
A
 
Q
R
|
R
A
 
A
K
 
E
K
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
C
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
V
 
K
N
 
V
Y
 
A
Q
 
L
G
 
G
L
 
V
L
 
A
V
 
V
R
 
P
E
 
K
D
 
D
D
 
S
N
 
N
S
 
-
I
 
I
S
 
T
T
 
S
L
 
V
T
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
-
K
 
K
G
 
D
K
 
K
K
 
T
L
 
L
C
 
L
S
 
L
V
 
N
T
 
K
G
 
G
S
x
T
T
|
T
S
 
A
A
 
D
Q
 
A
N
 
Y
V
 
F
K
 
T
N
 
Q
Q
 
N
L
 
Y
S
 
P
G
 
N
V
 
I
Q
 
K
L
 
T
Q
 
L
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
S
 
Q
Y
 
N
S
 
T
S
 
E
C
 
T
V
 
F
E
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
M
L
 
D
K
 
K
K
 
R
V
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
S
T
x
H
D
|
D
E
 
N
V
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
F
G
 
A
F
 
W
A
 
V
-
 
K
-
 
D
-
 
H
-
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
K
L
 
M
Y
 
G
R
 
I
N
 
K
K
 
E
F
 
L
K
 
G
I
 
N
V
 
K
D
 
D
M
 
V
T
 
I
Y
 
A
P
 
P
K
 
-
N
 
-
A
 
-
C
 
-
V
 
A
T
 
V
A
 
K
S
 
K
G
 
G
K
 
D
K
 
K
S
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
E
A
 
F
G
 
I
A
 
D
P
 
N
F
 
L
S
 
I
T
 
I
E
 
K
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
L
G
 
G
M
 
Q
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
F
F
 
F
P
 
H
Q
 
K
A
 
A
V
 
Y
D
 
D
E
 
E

4ohnA Crystal structure of an abc uptake transporter substrate binding protein from streptococcus pneumoniae with bound histidine
24% identity, 59% coverage: 73:283/358 of query aligns to 26:236/246 of 4ohnA

query
sites
4ohnA
L
 
M
G
 
G
L
 
F
R
 
A
E
 
Q
P
 
K
N
 
D
N
 
G
T
 
S
F
 
Y
T
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
I
G
 
D
V
 
L
S
 
A
T
 
T
F
 
A
V
 
V
V
 
F
N
 
E
N
 
K
I
 
Y
A
 
G
D
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
H
 
-
P
 
I
K
 
T
I
 
V
T
 
N
W
 
W
R
 
Q
E
 
P
T
 
I
P
 
D
S
x
W
A
 
D
Q
 
L
R
 
K
E
 
E
T
 
A
L
 
E
I
 
L
D
 
T
N
 
K
G
 
G
E
 
T
V
 
I
D
 
D
M
 
L
I
 
I
A
 
W
A
x
N
T
x
G
Y
 
Y
S
|
S
I
 
A
T
 
T
A
 
D
A
 
E
R
|
R
A
 
R
K
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
S
G
 
N
P
 
S
Y
 
Y
L
 
M
V
 
K
N
 
N
Y
 
E
Q
 
Q
G
 
-
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
T
E
 
K
D
 
K
D
 
S
N
 
S
S
 
G
I
 
I
S
 
T
T
 
T
L
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
M
D
 
-
K
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
L
C
 
G
S
 
A
V
x
Q
T
 
A
G
 
G
S
|
S
T
x
S
S
 
G
A
 
Y
Q
 
A
N
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
I
V
 
L
K
 
K
N
 
N
Q
 
I
L
 
V
S
 
A
G
 
N
V
 
K
Q
 
E
L
 
A
Q
 
N
E
 
Q
Y
 
Y
D
 
Q
S
 
T
Y
 
F
S
 
N
S
 
E
C
 
A
V
 
L
E
 
I
A
 
D
L
 
L
R
 
K
L
 
N
K
 
D
K
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
I
D
|
D
E
 
R
V
 
V
I
 
Y
L
 
A
A
 
N
G
 
Y
F
 
Y
A
 
L
D
 
E
F
 
A
S
 
E
L
 
G
Y
 
V
R
 
L
N
 
N
K
 
D
F
 
Y
K
 
N
I
 
V
V
 
F
D
 
T
M
 
V
T
 
G
Y
 
L
P
 
E
K
 
T
N
 
E
A
 
A
C
 
F
V
 
A
T
 
V
A
 
G
S
 
S
G
 
R
K
 
K
K
 
E
S
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
L
L
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
I
G
 
N
A
 
E
P
 
A
F
 
F
S
 
S
T
 
S
E
 
-
R
 
L
Y
 
Y
G
 
K
I
 
D
G
 
G
M
 
K
A
 
F
Q
 
Q
Q
 
E
F
 
I
P
 
S
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

2yjpA Crystal structure of the solute receptors for l-cysteine of neisseria gonorrhoeae (see paper)
27% identity, 49% coverage: 58:231/358 of query aligns to 9:176/247 of 2yjpA

query
sites
2yjpA
K
 
E
R
 
K
G
 
G
S
 
V
V
 
I
I
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
V
K
x
F
Y
 
G
D
 
D
Q
x
K
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
 
G
L
 
Y
R
 
V
E
 
D
P
 
A
N
 
N
N
 
G
T
 
K
F
 
N
T
 
Q
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
E
V
 
I
S
 
A
T
 
-
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
K
N
 
D
I
 
L
A
 
A
D
 
K
R
 
D
L
 
L
K
 
L
V
 
G
K
 
S
H
 
P
P
 
D
K
 
K
I
 
V
T
 
E
W
 
F
R
 
V
E
 
L
T
 
T
P
x
E
S
 
A
A
 
A
Q
 
N
R
|
R
E
 
V
T
 
E
L
 
Y
I
 
V
D
 
R
N
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
V
D
 
D
M
 
L
I
 
I
A
 
L
A
 
A
T
x
N
Y
x
F
S
x
T
I
 
Q
T
 
T
A
 
P
A
 
E
R
|
R
A
 
A
K
 
E
K
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
V
 
K
N
 
V
Y
 
A
Q
 
L
G
 
G
L
 
-
L
 
V
V
 
V
R
 
S
E
 
P
D
 
K
D
 
N
N
 
K
S
 
P
I
 
I
S
 
T
T
 
D
L
 
M
T
 
A
D
 
Q
L
 
L
D
 
-
K
 
K
G
 
D
K
 
Q
K
 
T
L
 
L
C
 
L
S
 
V
V
 
N
T
 
K
G
 
G
S
x
T
T
|
T
S
 
A
A
 
D
Q
 
A
N
 
F
V
 
F
K
 
T
N
 
K
Q
 
S
L
x
H
S
 
P
G
x
E
V
 
V
Q
 
K
L
 
L
Q
 
L
E
 
K
Y
 
F
D
|
D
S
 
Q
Y
 
N
S
 
T
S
 
E
C
 
T
V
 
F
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
K
L
 
D
K
 
G
K
 
R
V
 
G
D
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
A
T
x
H
D
|
D
E
 
N
V
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
W
G
 
A
F
 
W
A
 
A

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
26% identity, 69% coverage: 54:299/358 of query aligns to 3:217/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
I
 
I
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
K
-
 
S
R
 
R
G
 
G
S
 
Y
V
 
L
I
 
L
L
 
V
G
 
G
T
 
L
K
 
S
Y
 
A
D
 
D
Q
x
F
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
 
E
L
 
F
R
 
V
E
 
D
P
 
E
N
 
N
N
 
G
T
 
N
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
D
V
 
L
S
 
A
T
 
-
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
K
N
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
E
H
 
L
P
 
K
K
 
I
I
 
V
T
 
D
W
 
M
R
 
-
E
 
-
T
 
T
P
x
F
S
 
D
A
 
G
Q
 
L
R
 
I
E
 
P
T
 
S
L
 
L
I
 
L
D
 
-
N
 
T
G
 
K
E
 
K
V
 
I
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
I
A
x
S
T
x
G
Y
x
M
S
x
T
I
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
K
K
 
K
K
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
S
G
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
V
 
D
N
 
A
Y
 
G
Q
 
Q
G
 
V
L
 
I
L
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
K
D
 
D
-
 
S
D
 
D
N
 
F
S
 
R
I
 
P
S
 
K
T
 
T
L
 
Y
T
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
-
K
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
V
C
 
A
S
 
V
V
x
Q
T
 
I
G
 
G
S
x
T
T
|
T
S
 
G
A
 
D
Q
 
I
N
 
E
V
 
V
K
 
-
N
 
S
Q
 
K
L
 
Y
S
 
D
G
 
G
V
 
I
Q
 
K
L
 
V
Q
 
V
E
 
R
Y
 
F
D
 
D
S
 
K
Y
 
F
S
 
T
S
 
D
C
 
A
V
 
F
E
 
L
A
 
E
L
 
L
R
 
K
L
 
R
K
 
G
K
 
R
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
V
T
 
L
D
|
D
E
 
S
V
 
A
I
 
T
L
 
A
A
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
V
D
 
-
F
 
-
S
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
N
 
-
K
 
-
F
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
P
 
A
K
 
K
N
 
N
A
 
P
-
 
D
C
 
L
V
 
V
T
 
I
A
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
V
F
 
L
S
 
S
T
 
S
E
 
E
R
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
V
A
 
R
Q
 
K
Q
 
E
F
 
D
P
 
T
Q
 
D
A
 
L
V
 
L
D
 
E
E
 
F
V
 
I
N
 
N
T
 
S
A
 
V
L
 
L
D
 
R
A
 
E
M
 
L
L
 
K
T
 
K
P
 
S
G
 
G

5l9oB Crystal structure of agrobacterium tumefaciens c58 strain pbp soca in complex with glucopine (see paper)
28% identity, 49% coverage: 49:223/358 of query aligns to 3:167/243 of 5l9oB

query
sites
5l9oB
D
 
N
P
 
P
R
 
L
N
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
P
I
 
T
K
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
T
V
 
I
I
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
K
 
M
Y
 
G
D
 
D
Q
 
A
P
 
K
G
 
P
L
 
Y
G
 
A
L
 
F
R
 
T
E
 
T
P
 
A
N
 
D
N
 
G
T
x
N
F
|
F
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
I
G
 
E
V
 
L
S
 
F
T
 
L
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
-
N
 
N
I
 
V
A
 
A
D
 
G
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
F
K
 
K
H
 
K
P
 
E
K
 
Q
I
 
V
T
 
V
W
 
F
R
 
T
E
 
G
T
 
Q
P
 
E
S
x
F
A
 
S
Q
 
A
R
 
L
E
 
M
T
 
P
L
 
S
I
 
V
D
 
A
N
 
N
G
 
G
E
 
R
V
 
F
D
 
D
M
 
V
I
 
A
A
 
A
A
|
A
T
x
A
Y
 
I
S
x
G
I
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
K
R
|
R
A
 
K
K
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
D
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
V
x
A
N
x
G
Y
 
F
Q
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
L
V
 
T
R
 
S
E
 
E
D
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
S
 
A
T
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
A
D
 
A
-
 
G
-
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
L
C
 
G
S
 
V
V
 
V
T
 
Q
G
 
G
S
x
T
T
x
L
S
x
Q
A
 
E
Q
 
I
N
 
Y
V
 
A
K
 
E
N
 
K
Q
 
N
L
 
F
S
 
A
G
 
G
V
 
T
Q
 
D
L
 
L
Q
 
V
E
 
K
Y
 
F
D
 
P
S
 
D
Y
 
N
S
 
N
S
 
S
C
 
A
V
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
N
K
 
G
K
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
H
T
 
F
T
 
L
D
|
D

Sites not aligning to the query:

5lomB Crystal structure of the pbp soca from agrobacterium tumefaciens c58 in complex with dfg at 1.5 a resolution (see paper)
28% identity, 49% coverage: 49:223/358 of query aligns to 4:168/250 of 5lomB

query
sites
5lomB
D
 
N
P
 
P
R
 
L
N
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
P
I
 
T
K
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
T
V
 
I
I
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
K
 
M
Y
 
G
D
 
D
Q
 
A
P
 
K
G
 
P
L
 
Y
G
 
A
L
 
F
R
 
T
E
 
T
P
 
A
N
 
D
N
 
G
T
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
I
G
 
E
V
 
L
S
 
F
T
 
L
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
-
N
 
N
I
 
V
A
 
A
D
 
G
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
F
K
 
K
H
 
K
P
 
E
K
 
Q
I
 
V
T
 
V
W
 
F
R
 
T
E
 
G
T
 
Q
P
 
E
S
x
F
A
 
S
Q
 
A
R
 
L
E
 
M
T
 
P
L
 
S
I
 
V
D
 
A
N
 
N
G
 
G
E
 
R
V
 
F
D
 
D
M
 
V
I
 
A
A
 
A
A
|
A
T
x
A
Y
 
I
S
x
G
I
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
K
R
|
R
A
 
K
K
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
D
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
V
x
A
N
x
G
Y
 
F
Q
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
L
V
 
T
R
 
S
E
 
E
D
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
S
 
A
T
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
A
D
 
A
-
 
G
-
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
L
C
 
G
S
 
V
V
 
V
T
 
Q
G
 
G
S
x
T
T
x
L
S
x
Q
A
 
E
Q
 
I
N
 
Y
V
 
A
K
 
E
N
 
K
Q
 
N
L
 
F
S
 
A
G
 
G
V
 
T
Q
 
D
L
 
L
Q
 
V
E
 
K
Y
 
F
D
 
P
S
 
D
Y
 
N
S
 
N
S
 
S
C
 
A
V
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
N
K
 
G
K
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
H
T
 
F
T
 
L
D
|
D

Sites not aligning to the query:

5l9oA Crystal structure of agrobacterium tumefaciens c58 strain pbp soca in complex with glucopine (see paper)
28% identity, 49% coverage: 49:223/358 of query aligns to 2:166/241 of 5l9oA

query
sites
5l9oA
D
 
N
P
 
P
R
 
L
N
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
P
I
 
T
K
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
T
V
 
I
I
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
K
 
M
Y
 
G
D
 
D
Q
 
A
P
 
K
G
 
P
L
 
Y
G
 
A
L
 
F
R
 
T
E
 
T
P
 
A
N
 
D
N
 
G
T
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
I
G
 
E
V
 
L
S
 
F
T
 
L
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
-
N
 
N
I
 
V
A
 
A
D
 
G
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
F
K
 
K
H
 
K
P
 
E
K
 
Q
I
 
V
T
 
V
W
 
F
R
 
T
E
 
G
T
 
Q
P
 
E
S
x
F
A
 
S
Q
 
A
R
 
L
E
 
M
T
 
P
L
 
S
I
 
V
D
 
A
N
 
N
G
 
G
E
 
R
V
 
F
D
 
D
M
 
V
I
 
A
A
 
A
A
|
A
T
x
A
Y
 
I
S
x
G
I
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
K
R
|
R
A
 
K
K
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
D
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
V
x
A
N
x
G
Y
 
F
Q
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
L
V
 
T
R
 
S
E
 
E
D
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
S
 
A
T
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
A
D
 
A
-
 
G
-
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
L
C
 
G
S
 
V
V
 
V
T
 
Q
G
 
G
S
x
T
T
x
L
S
x
Q
A
 
E
Q
 
I
N
 
Y
V
 
A
K
 
E
N
 
K
Q
 
N
L
 
F
S
 
A
G
 
G
V
 
T
Q
 
D
L
 
L
Q
 
V
E
 
K
Y
 
F
D
 
P
S
 
D
Y
 
N
S
 
N
S
 
S
C
 
A
V
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
N
K
 
G
K
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
H
T
 
F
T
 
L
D
|
D

Sites not aligning to the query:

3vvfA Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine (see paper)
24% identity, 58% coverage: 54:261/358 of query aligns to 10:209/241 of 3vvfA

query
sites
3vvfA
I
 
F
D
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
-
 
S
G
 
G
S
 
E
V
 
I
I
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
K
x
E
Y
 
G
D
 
A
Q
x
F
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
 
N
L
 
Y
R
 
F
E
 
D
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
Q
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
E
V
 
V
G
 
D
V
 
L
S
 
G
T
 
-
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
N
N
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
L
K
 
K
H
 
-
P
 
P
K
 
R
I
 
-
T
 
-
W
 
W
R
 
I
E
 
A
T
 
Q
P
 
S
S
x
F
A
 
D
Q
 
T
R
 
L
E
 
L
T
 
I
L
 
Q
I
 
L
D
 
N
N
 
Q
G
 
G
E
 
R
V
 
F
D
 
D
M
 
F
I
 
V
A
 
I
A
|
A
T
x
S
Y
x
H
S
x
G
I
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
A
K
 
R
K
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
T
G
 
N
P
 
P
Y
 
H
L
 
Y
V
 
C
N
 
T
Y
 
-
Q
 
-
G
 
G
L
 
G
L
 
V
V
 
I
R
 
V
E
 
S
D
 
R
D
 
K
N
 
G
S
 
G
I
 
P
S
 
R
T
 
T
L
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
K
 
-
G
 
-
K
 
G
K
 
K
L
 
V
C
 
V
S
 
G
V
 
V
T
x
Q
G
 
V
S
 
G
T
|
T
S
x
T
A
x
Y
Q
 
M
N
 
E
V
 
A
K
 
A
N
 
Q
Q
 
K
L
 
I
S
 
P
G
 
G
V
 
I
-
 
K
Q
 
E
L
 
V
Q
 
R
E
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
S
 
R
Y
 
D
S
 
P
S
 
D
C
 
A
V
 
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
R
 
L
L
 
A
K
 
G
K
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
T
L
 
W
T
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
L
 
A
A
 
K
G
 
E
F
 
A
A
 
I
D
 
K
F
 
E
S
 
R
L
 
K
Y
 
L
R
 
E
N
 
N
K
 
T
F
 
L
K
 
Q
I
 
V
V
 
G
D
 
E
M
 
L
T
 
V
Y
 
F
P
 
Q
K
x
E
N
 
R
-
 
V
A
 
A
C
 
M
V
 
A
T
 
V
A
 
A
S
 
K
G
 
G
K
 
N
K
 
K
S
 
S
L
 
L

3vveA Crystal structure of ttc0807 complexed with lysine (see paper)
24% identity, 58% coverage: 54:261/358 of query aligns to 10:209/241 of 3vveA

query
sites
3vveA
I
 
F
D
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
-
 
S
G
 
G
S
 
E
V
 
I
I
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
K
x
E
Y
 
G
D
 
A
Q
x
F
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
 
N
L
 
Y
R
 
F
E
 
D
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
Q
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
E
V
 
V
G
 
D
V
 
L
S
 
G
T
 
-
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
N
N
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
L
K
 
K
H
 
-
P
 
P
K
 
R
I
 
-
T
 
-
W
 
W
R
 
I
E
 
A
T
 
Q
P
 
S
S
x
F
A
 
D
Q
 
T
R
 
L
E
 
L
T
 
I
L
 
Q
I
 
L
D
 
N
N
 
Q
G
 
G
E
 
R
V
 
F
D
 
D
M
 
F
I
 
V
A
 
I
A
 
A
T
x
S
Y
x
H
S
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
A
K
 
R
K
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
T
G
 
N
P
 
P
Y
 
H
L
 
Y
V
 
C
N
 
T
Y
 
-
Q
 
-
G
 
G
L
 
G
L
 
V
V
 
I
R
 
V
E
 
S
D
 
R
D
 
K
N
 
G
S
 
G
I
 
P
S
 
R
T
 
T
L
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
K
 
-
G
 
-
K
 
G
K
 
K
L
 
V
C
 
V
S
 
G
V
 
V
T
x
Q
G
 
V
S
 
G
T
|
T
S
x
T
A
x
Y
Q
 
M
N
 
E
V
 
A
K
 
A
N
 
Q
Q
 
K
L
 
I
S
 
P
G
 
G
V
 
I
-
 
K
Q
 
E
L
 
V
Q
 
R
E
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
S
 
R
Y
 
D
S
 
P
S
 
D
C
 
A
V
 
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
R
 
L
L
 
A
K
 
G
K
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
T
L
 
W
T
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
L
 
A
A
 
K
G
 
E
F
 
A
A
 
I
D
 
K
F
 
E
S
 
R
L
 
K
Y
 
L
R
 
E
N
 
N
K
 
T
F
 
L
K
 
Q
I
 
V
V
 
G
D
 
E
M
 
L
T
 
V
Y
 
F
P
 
Q
K
x
E
N
 
R
-
 
V
A
 
A
C
 
M
V
 
A
T
 
V
A
 
A
S
 
K
G
 
G
K
 
N
K
 
K
S
 
S
L
 
L

3vvdA Crystal structure of ttc0807 complexed with ornithine (see paper)
24% identity, 58% coverage: 54:261/358 of query aligns to 10:209/241 of 3vvdA

query
sites
3vvdA
I
 
F
D
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
-
 
S
G
 
G
S
 
E
V
 
I
I
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
K
x
E
Y
 
G
D
 
A
Q
 
F
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
 
N
L
 
Y
R
 
F
E
 
D
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
Q
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
E
V
 
V
G
 
D
V
 
L
S
 
G
T
 
-
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
N
N
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
L
K
 
K
H
 
-
P
 
P
K
 
R
I
 
-
T
 
-
W
 
W
R
 
I
E
 
A
T
 
Q
P
 
S
S
x
F
A
 
D
Q
 
T
R
 
L
E
 
L
T
 
I
L
 
Q
I
 
L
D
 
N
N
 
Q
G
 
G
E
 
R
V
 
F
D
 
D
M
 
F
I
 
V
A
 
I
A
 
A
T
x
S
Y
x
H
S
x
G
I
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
A
K
 
R
K
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
T
G
 
N
P
 
P
Y
 
H
L
 
Y
V
 
C
N
 
T
Y
 
-
Q
 
-
G
 
G
L
 
G
L
 
V
V
 
I
R
 
V
E
 
S
D
 
R
D
 
K
N
 
G
S
 
G
I
 
P
S
 
R
T
 
T
L
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
K
 
-
G
 
-
K
 
G
K
 
K
L
 
V
C
 
V
S
 
G
V
 
V
T
x
Q
G
 
V
S
 
G
T
|
T
S
x
T
A
x
Y
Q
 
M
N
 
E
V
 
A
K
 
A
N
 
Q
Q
 
K
L
 
I
S
 
P
G
 
G
V
 
I
-
 
K
Q
 
E
L
 
V
Q
 
R
E
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
S
 
R
Y
 
D
S
 
P
S
 
D
C
 
A
V
 
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
R
 
L
L
 
A
K
 
G
K
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
T
L
 
W
T
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
L
 
A
A
 
K
G
 
E
F
 
A
A
 
I
D
 
K
F
 
E
S
 
R
L
 
K
Y
 
L
R
 
E
N
 
N
K
 
T
F
 
L
K
 
Q
I
 
V
V
 
G
D
 
E
M
 
L
T
 
V
Y
 
F
P
 
Q
K
x
E
N
 
R
-
 
V
A
 
A
C
 
M
V
 
A
T
 
V
A
 
A
S
 
K
G
 
G
K
 
N
K
 
K
S
 
S
L
 
L

6detA The crystal structure of tv2483 bound to l-arginine (see paper)
30% identity, 27% coverage: 59:153/358 of query aligns to 12:99/243 of 6detA

query
sites
6detA
R
 
K
G
 
S
S
 
A
V
 
L
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
V
K
x
S
Y
 
D
D
 
F
Q
x
V
P
 
P
G
 
I
L
 
L
G
 
S
L
 
F
R
 
R
E
 
N
P
 
E
N
 
K
N
 
N
T
 
E
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
V
 
I
G
 
D
V
 
I
S
 
F
T
 
T
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
-
N
 
E
I
 
L
A
 
C
D
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
I
K
 
-
H
 
H
P
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
Y
K
 
P
I
 
I
T
 
Q
W
|
W
R
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
T
 
I
L
 
L
I
 
L
D
 
N
N
 
T
G
 
G
E
 
V
V
 
I
D
 
D
M
 
C
I
 
I
A
 
A
A
x
S
T
x
G
Y
x
F
S
|
S
I
 
V
T
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
K
K
 
Q
K
 
H
V
 
Y
A
 
R
F
 
M
A
 
C
G
 
T
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
V
 
Q
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3vv5A Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l- cysteine (aec) (see paper)
24% identity, 58% coverage: 54:261/358 of query aligns to 6:205/237 of 3vv5A

query
sites
3vv5A
I
 
F
D
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
-
 
S
G
 
G
S
 
E
V
 
I
I
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
K
x
E
Y
 
G
D
 
A
Q
x
F
P
 
P
G
 
P
L
 
F
G
x
N
L
 
Y
R
 
F
E
 
D
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
Q
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
E
V
 
V
G
 
D
V
 
L
S
 
G
T
 
-
F
 
-
V
 
-
V
 
-
N
 
N
N
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
G
V
 
L
K
 
K
H
 
-
P
 
P
K
 
R
I
 
-
T
 
-
W
 
W
R
 
I
E
 
A
T
 
Q
P
 
S
S
x
F
A
 
D
Q
 
T
R
 
L
E
 
L
T
 
I
L
 
Q
I
 
L
D
 
N
N
 
Q
G
 
G
E
 
R
V
 
F
D
 
D
M
 
F
I
 
V
A
 
I
A
|
A
T
x
S
Y
 
H
S
x
G
I
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
A
K
 
R
K
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
T
G
 
N
P
 
P
Y
 
H
L
 
Y
V
 
C
N
 
T
Y
 
-
Q
 
-
G
 
G
L
 
G
L
 
V
V
 
I
R
 
V
E
 
S
D
 
R
D
 
K
N
 
G
S
 
G
I
 
P
S
 
R
T
 
T
L
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
K
 
-
G
 
-
K
 
G
K
 
K
L
 
V
C
 
V
S
 
G
V
 
V
T
 
Q
G
 
V
S
 
G
T
|
T
S
x
T
A
x
Y
Q
 
M
N
 
E
V
 
A
K
 
A
N
 
Q
Q
 
K
L
 
I
S
 
P
G
 
G
V
 
I
-
 
K
Q
 
E
L
 
V
Q
 
R
E
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
S
 
R
Y
 
D
S
 
P
S
 
D
C
 
A
V
 
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
R
 
L
L
 
A
K
 
G
K
 
R
V
 
I
D
 
D
A
 
T
L
 
W
T
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
L
 
A
A
 
K
G
 
E
F
 
A
A
 
I
D
 
K
F
 
E
S
 
R
L
 
K
Y
 
L
R
 
E
N
 
N
K
 
T
F
 
L
K
 
Q
I
 
V
V
 
G
D
 
E
M
 
L
T
 
V
Y
 
F
P
 
Q
K
 
E
N
 
R
-
 
V
A
 
A
C
 
M
V
 
A
T
 
V
A
 
A
S
 
K
G
 
G
K
 
N
K
 
K
S
 
S
L
 
L

Query Sequence

>WP_076477601.1 NCBI__GCF_900156495.1:WP_076477601.1
MAVRASLAGPDGRDRTGRLRPGRGLRIGLALLLTMTVTGLGIAACGNTDPRNLIDSIKRG
SVILGTKYDQPGLGLREPNNTFTGFDVGVSTFVVNNIADRLKVKHPKITWRETPSAQRET
LIDNGEVDMIAATYSITAARAKKVAFAGPYLVNYQGLLVREDDNSISTLTDLDKGKKLCS
VTGSTSAQNVKNQLSGVQLQEYDSYSSCVEALRLKKVDALTTDEVILAGFADFSLYRNKF
KIVDMTYPKNACVTASGKKSLKKAGAPFSTERYGIGMAQQFPQAVDEVNTALDAMLTPGP
DGGESAWERTLRENIGDGEVDKLKARASAPESQYSLVPTPGDQAFLDATSTPCPADQS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory