SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_076478390.1 NCBI__GCF_900156495.1:WP_076478390.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P9WNP7 3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase; Beta-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase; BHBD; EC 1.1.1.157 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
72% identity, 99% coverage: 3:287/288 of query aligns to 2:286/286 of P9WNP7

query
sites
P9WNP7
S
 
S
E
 
D
K
 
A
I
 
I
S
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
C
 
S
A
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
G
T
 
V
D
 
E
V
 
V
L
 
T
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
T
 
P
T
 
A
R
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
N
R
 
R
I
 
I
L
 
V
R
 
K
S
 
S
L
 
L
D
 
E
R
 
R
G
 
A
V
 
V
S
 
S
S
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
V
T
 
T
E
 
E
R
 
R
E
 
E
R
 
R
E
 
D
Q
 
R
A
 
A
S
 
L
W
 
G
R
 
L
L
 
L
R
 
T
F
 
F
T
 
T
S
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
N
D
 
D
F
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
T
 
S
E
 
E
I
 
I
F
 
F
K
 
A
S
 
E
L
 
L
D
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
P
 
P
N
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
I
P
 
P
I
 
I
M
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
A
M
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
K
H
 
Q
A
 
P
E
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
L
G
 
G
M
 
L
H
 
H
F
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
R
T
 
T
L
 
L
M
 
V
T
 
T
S
 
D
P
 
E
E
 
A
V
 
A
T
 
A
E
 
A
R
 
R
A
 
T
E
 
E
H
 
E
F
 
F
A
 
A
G
 
S
E
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
C
A
 
S
D
 
D
R
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
V
 
V
E
 
E
S
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
K
 
V
E
 
E
D
 
D
I
 
V
D
 
D
K
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
L
 
A
G
 
G
T
 
L
A
 
S
H
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
R
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
K
A
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
K
M
 
M
Y
 
F
E
 
E
E
 
E
F
 
F
K
 
K
E
 
E
P
 
P
L
 
H
Y
 
Y
S
 
G
P
 
P
P
 
P
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
T
Y
 
Y

4kugA Crystal structure of 3-hydroxybutylryl-coa dehydrogenase with NAD from clostridium butyricum
44% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 1:280/282 of 4kugA

query
sites
4kugA
I
 
M
S
 
K
R
 
K
V
 
V
G
 
F
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
T
M
|
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
V
E
 
Q
V
 
A
C
 
F
A
 
A
R
 
A
A
 
K
H
 
G
T
 
C
D
 
E
V
 
V
L
 
I
V
 
V
Y
x
R
E
x
D
T
 
I
T
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
A
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
G
R
 
I
S
 
A
R
 
T
I
 
I
L
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
L
D
 
S
R
 
K
G
 
L
V
 
V
S
 
A
S
 
K
G
 
E
K
 
K
L
 
I
T
 
T
E
 
E
R
 
A
E
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
E
A
 
I
S
 
L
W
 
S
R
 
R
L
 
I
R
 
S
F
 
G
T
 
T
S
 
T
D
 
D
L
 
M
G
 
K
D
 
L
F
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
C
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
C
 
V
E
 
E
A
|
A
A
|
A
V
 
I
E
|
E
D
 
N
E
 
M
A
 
K
I
 
I
K
 
K
T
 
K
E
 
E
I
 
I
F
 
F
K
 
A
S
 
E
L
 
L
D
 
D
K
 
G
V
 
I
V
 
C
T
 
K
D
 
-
P
 
P
N
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
|
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
 
S
I
 
I
M
 
T
K
 
E
L
 
V
G
 
A
M
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
K
H
 
R
A
 
A
E
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
M
H
|
H
F
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
P
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
V
E
|
E
L
 
V
V
 
I
T
 
R
T
 
G
L
 
A
M
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
Q
E
 
E
V
 
T
T
 
F
E
 
D
R
 
A
A
 
V
E
 
K
H
 
E
F
 
M
A
 
S
G
 
-
E
 
E
V
 
S
L
 
I
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
V
 
P
V
 
V
R
 
E
S
 
V
A
 
A
D
 
E
R
 
A
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
V
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
M
L
 
I
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
F
M
 
I
V
 
L
E
 
Q
S
 
E
G
 
G
F
 
V
A
 
A
T
 
K
K
 
E
E
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
A
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
N
H
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
A
L
 
L
S
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
V
V
 
C
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
M
D
 
D
K
 
V
M
 
L
Y
 
Y
E
 
N
E
 
E
F
 
T
K
 
G
E
 
D
P
 
T
L
 
K
Y
 
Y
S
 
R
P
 
A
P
 
S
P
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
R
R
 
K
M
 
Y
V
 
V
E
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
W
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
K
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
D
Y
 
Y

4kuhA Crystal structure of 3-hydroxybutylryl-coa dehydrogenase with acetoacetyl-coa from clostridium butyricum
44% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 1:280/280 of 4kuhA

query
sites
4kuhA
I
 
M
S
 
K
R
 
K
V
 
V
G
 
F
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
V
E
 
Q
V
 
A
C
 
F
A
 
A
R
 
A
A
 
K
H
 
G
T
 
C
D
 
E
V
 
V
L
 
I
V
 
V
Y
 
R
E
 
D
T
 
I
T
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
A
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
G
R
 
I
S
 
A
R
 
T
I
 
I
L
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
L
D
 
S
R
x
K
G
 
L
V
 
V
S
 
A
S
x
K
G
 
E
K
|
K
L
 
I
T
 
T
E
 
E
R
 
A
E
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
E
A
 
I
S
 
L
W
 
S
R
 
R
L
 
I
R
 
S
F
 
G
T
 
T
S
 
T
D
 
D
L
 
M
G
 
K
D
 
L
F
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
C
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
C
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
E
D
 
N
E
 
M
A
 
K
I
 
I
K
 
K
T
 
K
E
 
E
I
 
I
F
 
F
K
 
A
S
 
E
L
 
L
D
 
D
K
 
G
V
 
I
V
 
C
T
 
K
D
 
-
P
 
P
N
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
 
S
I
 
I
M
 
T
K
 
E
L
 
V
G
 
A
M
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
K
H
 
R
A
 
A
E
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
M
H
|
H
F
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
P
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
V
E
|
E
L
 
V
V
 
I
T
 
R
T
 
G
L
 
A
M
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
Q
E
 
E
V
 
T
T
 
F
E
 
D
R
 
A
A
 
V
E
 
K
H
 
E
F
 
M
A
 
S
G
 
-
E
 
E
V
 
S
L
 
I
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
V
 
P
V
 
V
R
 
E
S
 
V
A
 
A
D
 
E
R
 
A
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
V
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
M
L
 
I
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
F
M
 
I
V
 
L
E
 
Q
S
 
E
G
 
G
F
 
V
A
 
A
T
 
K
K
 
E
E
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
A
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
N
H
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
A
L
 
L
S
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
V
V
 
C
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
M
D
 
D
K
 
V
M
 
L
Y
 
Y
E
 
N
E
 
E
F
 
T
K
 
G
E
 
D
P
 
T
L
 
K
Y
 
Y
S
 
R
P
 
A
P
 
S
P
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
R
R
 
K
M
 
Y
V
 
V
E
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
W
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
K
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
D
Y
 
Y

4pzeA Crystal structure of (s)-3-hydroxybutyryl-coa dehydrogenase paah1 in complex with acetoacetyl-coa (see paper)
42% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 2:281/283 of 4pzeA

query
sites
4pzeA
I
 
I
S
 
R
R
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
V
A
 
V
H
 
G
T
 
L
D
 
N
V
 
V
L
 
V
V
 
M
Y
 
V
E
 
D
T
 
I
T
 
S
R
 
D
E
 
A
L
 
A
A
 
V
A
 
Q
A
 
K
G
 
G
R
 
V
S
 
A
R
 
T
I
 
V
L
 
A
R
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
D
R
 
R
G
 
L
V
 
I
S
 
K
S
 
K
G
 
E
K
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
A
E
 
D
R
 
K
E
 
A
Q
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
A
R
 
R
L
 
I
R
 
K
F
 
G
T
 
S
S
 
T
D
 
S
L
 
Y
G
 
D
D
 
D
F
 
L
A
 
K
D
 
A
R
 
T
Q
 
D
L
 
I
V
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
D
 
N
E
 
Y
A
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
V
E
 
K
I
 
I
F
 
L
K
 
K
S
 
Q
L
 
I
D
 
D
K
 
G
V
 
I
V
 
V
T
 
G
D
 
E
P
 
-
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
I
P
 
S
I
 
I
M
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
A
M
 
A
A
 
V
T
 
T
Q
 
S
H
 
R
A
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
M
H
|
H
F
 
F
F
|
F
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
M
P
 
A
L
 
L
V
 
V
E
|
E
L
 
L
V
 
I
T
 
R
T
 
G
L
 
L
M
 
Q
T
 
T
S
 
S
P
 
-
E
 
D
V
 
T
T
 
T
E
 
H
R
 
A
A
 
A
E
 
V
H
 
E
F
 
A
A
 
L
G
 
S
E
 
K
V
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
Y
V
 
P
V
 
I
R
 
T
S
 
V
A
 
K
D
 
N
R
 
S
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
V
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
C
P
 
P
Y
 
M
L
 
I
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
C
M
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
E
G
 
G
F
 
L
A
 
A
T
 
S
K
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
D
 
D
K
 
E
A
 
G
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
C
A
 
N
H
 
H
P
 
P
M
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
M
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
M
D
 
E
K
 
V
M
 
L
Y
 
Y
E
 
T
E
 
E
F
 
F
K
 
A
E
 
D
P
 
P
L
 
K
Y
 
Y
S
 
R
P
 
P
P
 
A
P
 
M
L
 
L
L
 
M
L
 
R
R
 
E
M
 
M
V
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
R
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
Q
 
V
Y
 
Y

4pzdA Crystal structure of (s)-3-hydroxybutyryl-coa dehydrogenase paah1 in complex with NAD+ (see paper)
42% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 2:281/283 of 4pzdA

query
sites
4pzdA
I
 
I
S
 
R
R
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
T
M
|
M
G
 
G
A
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
V
A
 
V
H
 
G
T
 
L
D
 
N
V
 
V
L
 
V
V
 
M
Y
 
V
E
x
D
T
 
I
T
 
S
R
 
D
E
 
A
L
 
A
A
 
V
A
 
Q
A
 
K
G
 
G
R
 
V
S
 
A
R
 
T
I
 
V
L
 
A
R
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
D
R
 
R
G
 
L
V
 
I
S
 
K
S
 
K
G
 
E
K
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
A
E
 
D
R
 
K
E
 
A
Q
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
A
R
 
R
L
 
I
R
 
K
F
 
G
T
 
S
S
 
T
D
 
S
L
 
Y
G
 
D
D
 
D
F
 
L
A
 
K
D
 
A
R
 
T
Q
 
D
L
 
I
V
 
V
C
 
I
E
 
E
A
|
A
A
|
A
V
x
T
E
|
E
D
 
N
E
 
Y
A
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
V
E
 
K
I
|
I
F
 
L
K
 
K
S
 
Q
L
 
I
D
 
D
K
 
G
V
 
I
V
 
V
T
 
G
D
 
E
P
 
-
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
S
N
|
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
I
P
 
S
I
 
I
M
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
A
M
 
A
A
 
V
T
 
T
Q
 
S
H
 
R
A
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
M
H
|
H
F
 
F
F
 
F
N
|
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
M
P
 
A
L
 
L
V
 
V
E
|
E
L
 
L
V
 
I
T
 
R
T
 
G
L
 
L
M
 
Q
T
 
T
S
 
S
P
 
-
E
 
D
V
 
T
T
 
T
E
 
H
R
 
A
A
 
A
E
 
V
H
 
E
F
 
A
A
 
L
G
 
S
E
 
K
V
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
Y
V
 
P
V
 
I
R
 
T
S
 
V
A
 
K
D
 
N
R
 
S
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
V
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
C
P
 
P
Y
 
M
L
 
I
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
C
M
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
E
G
 
G
F
 
L
A
 
A
T
 
S
K
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
D
 
D
K
 
E
A
 
G
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
C
A
 
N
H
 
H
P
 
P
M
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
M
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
M
D
 
E
K
 
V
M
 
L
Y
 
Y
E
 
T
E
 
E
F
 
F
K
 
A
E
 
D
P
 
P
L
 
K
Y
 
Y
S
 
R
P
 
P
P
 
A
P
 
M
L
 
L
L
 
M
L
 
R
R
 
E
M
 
M
V
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
R
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
Q
 
V
Y
 
Y

1f0yA L-3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase complexed with acetoacetyl-coa and NAD+ (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 4:290/291 of 1f0yA

query
sites
1f0yA
I
 
V
S
 
K
R
 
H
V
 
V
G
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
|
G
Q
x
L
M
|
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
H
 
G
T
 
H
D
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
 
V
E
x
D
T
x
Q
T
 
T
R
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
S
R
 
K
S
 
K
R
 
G
I
 
I
L
 
E
R
 
E
S
|
S
L
 
L
D
 
-
R
 
R
G
 
K
V
 
V
S
 
A
S
 
K
G
x
K
K
 
K
L
 
F
T
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
P
R
 
K
E
 
A
Q
 
G
A
 
D
S
 
E
W
 
F
R
 
V
L
 
E
R
 
K
F
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
T
L
 
I
G
 
A
D
 
T
F
 
S
A
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
H
-
 
S
R
 
T
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
C
 
V
E
 
E
A
|
A
A
x
I
V
 
V
E
|
E
D
 
N
E
 
L
A
 
K
I
 
V
K
|
K
T
 
N
E
 
E
I
 
L
F
 
F
K
 
K
S
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
F
V
 
A
T
 
A
D
 
E
P
 
-
N
 
H
A
 
T
V
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
S
N
|
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
 
Q
I
 
I
M
 
T
K
 
S
L
 
I
G
 
A
M
 
N
A
 
A
T
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
Q
E
 
D
R
 
R
V
 
F
V
 
A
G
 
G
M
 
L
H
|
H
F
 
F
F
|
F
N
|
N
P
|
P
V
 
V
P
|
P
V
|
V
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
V
E
|
E
L
 
V
V
 
I
T
 
K
T
 
T
L
 
P
M
 
M
T
 
T
S
 
S
P
 
Q
E
 
K
V
 
T
T
 
F
E
 
E
R
 
S
A
 
L
E
 
V
H
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
-
E
 
K
V
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
H
V
 
P
V
 
V
R
 
S
S
 
C
A
 
K
D
 
D
R
 
T
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
S
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
L
V
 
Y
E
 
E
S
 
R
G
 
G
F
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
H
 
Y
P
|
P
M
|
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
K
 
E
L
|
L
S
 
L
D
 
D
L
 
Y
V
|
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
|
T
V
 
T
K
 
K
A
 
F
I
 
I
A
 
V
D
 
D
K
 
G
M
 
W
Y
 
H
E
 
E
-
 
M
E
 
D
F
 
A
K
 
E
E
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
H
S
 
Q
P
 
P
P
 
S
P
 
P
L
 
S
L
 
L
L
 
N
R
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
N
R
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
K
|
K
V
 
T
G
 
G
H
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
Y

P00348 Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial; HCDH; L-3-hydroxyacyl CoA dehydrogenase; Medium and short-chain L-3-hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase; Short-chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase; EC 1.1.1.35 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 27:313/314 of P00348

query
sites
P00348
I
 
V
S
 
K
R
 
H
V
 
V
G
 
T
V
 
V
V
 
I
G
|
G
A
x
G
G
|
G
Q
x
L
M
|
M
G
|
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
H
 
G
T
 
H
D
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
 
V
E
x
D
T
 
Q
T
 
T
R
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
S
R
 
K
S
 
K
R
 
G
I
 
I
L
 
E
R
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
-
R
 
R
G
 
K
V
 
V
S
 
A
S
 
K
G
 
K
K
 
K
L
 
F
T
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
P
R
 
K
E
 
A
Q
 
G
A
 
D
S
 
E
W
 
F
R
 
V
L
 
E
R
 
K
F
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
S
L
 
I
G
 
S
D
 
T
F
 
S
A
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
H
-
 
S
R
 
T
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
C
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
I
V
 
V
E
|
E
D
 
N
E
 
L
A
 
K
I
 
V
K
|
K
T
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
K
 
K
S
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
F
V
 
A
T
 
A
D
 
E
P
 
-
N
 
H
A
 
T
V
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
 
Q
I
 
I
M
 
T
K
 
S
L
 
L
G
 
A
M
 
N
A
 
A
T
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
Q
E
 
D
R
 
R
V
 
F
V
 
A
G
 
G
M
 
L
H
 
H
F
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
V
T
 
K
T
 
T
L
 
P
M
 
M
T
 
T
S
 
S
P
 
Q
E
 
K
V
 
T
T
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
L
E
 
V
H
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
-
E
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
H
V
 
P
V
 
V
R
 
S
S
 
C
A
 
K
D
 
D
R
 
T
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
V
 
V
N
 
N
A
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
R
M
 
L
V
 
Y
E
 
E
S
 
R
G
 
G
F
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
H
 
Y
P
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
K
 
E
L
 
L
S
 
L
D
 
D
L
 
Y
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
K
 
K
A
 
F
I
 
I
A
 
I
D
 
D
K
 
G
M
 
W
Y
 
H
E
 
E
-
 
M
E
 
D
F
 
S
K
 
Q
E
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
S
 
Q
P
 
P
P
 
S
P
 
P
L
 
A
L
 
M
L
 
N
R
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
N
R
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
Y

6aa8E Crystal structure of (s)-3-hydroxybutyryl-coenzymea dehydrogenase from clostridium acetobutylicum complexed with NAD+ (see paper)
43% identity, 97% coverage: 8:287/288 of query aligns to 2:279/281 of 6aa8E

query
sites
6aa8E
R
 
K
V
 
V
G
 
C
V
 
V
V
x
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
T
M
|
M
G
 
G
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
A
C
 
F
A
 
A
R
 
A
A
 
K
H
 
G
T
 
F
D
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
x
R
E
x
D
T
x
I
T
 
K
R
 
D
E
 
E
L
 
F
A
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
G
R
 
L
S
 
D
R
 
F
I
 
I
L
 
N
R
 
K
S
 
N
L
 
L
D
 
S
R
 
K
G
 
L
V
 
V
S
 
K
S
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
I
T
 
E
E
 
E
R
 
A
E
 
T
R
 
K
E
 
V
Q
 
E
A
 
I
S
 
L
W
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
S
F
 
G
T
 
T
S
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
N
D
 
M
F
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
C
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
C
 
I
E
 
E
A
|
A
A
|
A
V
 
V
E
|
E
D
 
R
E
 
M
A
 
D
I
 
I
K
|
K
T
 
K
E
 
Q
I
 
I
F
 
F
K
 
A
S
 
D
L
 
L
D
 
D
K
 
N
V
 
I
V
 
C
T
 
K
D
 
-
P
 
P
N
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
|
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
 
S
I
 
I
M
 
T
K
 
E
L
 
V
G
 
A
M
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
K
H
 
R
A
 
P
E
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
M
H
|
H
F
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
P
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
V
E
|
E
L
 
V
V
 
I
T
 
R
T
 
G
L
 
I
M
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
Q
E
 
E
V
 
T
T
 
F
E
 
D
R
 
A
A
 
V
E
 
K
H
 
E
F
 
-
A
 
T
G
 
S
E
 
I
V
 
A
L
 
I
G
 
G
K
 
K
Q
 
D
V
 
P
V
 
V
R
 
E
S
 
V
A
 
A
D
 
E
R
 
A
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
V
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
M
L
 
I
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
G
M
 
I
V
 
L
E
 
A
S
 
E
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
S
K
 
V
E
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
N
H
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
G
D
 
D
L
 
F
V
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
I
V
 
C
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
M
D
 
D
K
 
V
M
 
L
Y
 
Y
E
 
S
E
 
E
F
 
T
K
 
G
E
 
D
P
 
S
L
 
K
Y
 
Y
S
 
R
P
 
P
P
 
H
P
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
K
R
 
K
M
 
Y
V
 
V
E
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
W
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
K
V
 
S
G
 
G
H
 
K
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
D
Y
 
Y

Q16836 Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial; HCDH; Medium and short-chain L-3-hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase; Short-chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase; EC 1.1.1.35 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
43% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 27:313/314 of Q16836

query
sites
Q16836
I
 
V
S
 
K
R
 
H
V
 
V
G
 
T
V
 
V
V
 
I
G
|
G
A
x
G
G
|
G
Q
x
L
M
|
M
G
|
G
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
H
 
G
T
 
H
D
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
 
V
E
x
D
T
 
Q
T
 
T
R
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
S
R
 
K
S
 
K
R
 
G
I
 
I
L
 
E
R
 
E
S
|
S
L
 
L
D
 
-
R
 
R
G
 
K
V
 
V
S
 
A
S
 
K
G
x
K
K
 
K
L
 
F
T
 
A
E
 
E
R
 
N
E
x
L
R
 
K
E
 
A
Q
 
G
A
 
D
S
 
E
W
 
F
R
 
V
L
 
E
R
 
K
F
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
T
L
 
I
G
 
A
D
 
T
F
 
S
A
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
H
-
 
S
R
 
T
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
C
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
I
V
 
V
E
|
E
D
 
N
E
 
L
A
 
K
I
 
V
K
|
K
T
 
N
E
 
E
I
 
L
F
 
F
K
 
K
S
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
F
V
 
A
T
 
A
D
 
E
P
 
-
N
 
H
A
 
T
V
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
x
Q
I
 
I
M
 
T
K
 
S
L
 
I
G
 
A
M
 
N
A
 
A
T
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
Q
E
 
D
R
 
R
V
 
F
V
 
A
G
 
G
M
 
L
H
 
H
F
 
F
F
 
F
N
|
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
I
T
 
K
T
 
T
L
 
P
M
 
M
T
 
T
S
 
S
P
 
Q
E
 
K
V
 
T
T
 
F
E
 
E
R
 
S
A
 
L
E
 
V
H
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
-
E
 
K
V
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
H
V
 
P
V
 
V
R
 
S
S
 
C
A
 
K
D
 
D
R
 
T
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
V
 
V
N
 
N
A
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
L
 
M
S
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
L
V
 
Y
E
 
E
S
 
R
G
 
G
F
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
H
 
Y
P
 
P
M
 
M
G
 
G
P
|
P
L
 
F
K
 
E
L
 
L
S
 
L
D
 
D
L
 
Y
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
K
 
K
A
 
F
I
 
I
A
 
V
D
 
D
K
 
G
M
 
W
Y
 
H
E
 
E
-
 
M
E
 
D
F
 
A
K
 
E
E
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
H
S
 
Q
P
 
P
P
 
S
P
 
P
L
 
S
L
 
L
L
 
N
R
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
N
R
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
K
|
K
V
 
T
G
 
G
H
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
Y

1f17A L-3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase complexed with nadh (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 4:290/293 of 1f17A

query
sites
1f17A
I
 
V
S
 
K
R
 
H
V
 
V
G
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
|
G
Q
x
L
M
|
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
H
 
G
T
 
H
D
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
 
V
E
x
D
T
x
Q
T
 
T
R
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
S
R
 
K
S
 
K
R
 
G
I
 
I
L
 
E
R
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
-
R
 
R
G
 
K
V
 
V
S
 
A
S
 
K
G
 
K
K
 
K
L
 
F
T
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
P
R
 
K
E
 
A
Q
 
G
A
 
D
S
 
E
W
 
C
R
 
V
L
 
E
R
 
K
F
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
T
L
 
I
G
 
A
D
 
T
F
 
S
A
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
H
-
 
S
R
 
T
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
C
 
V
E
 
E
A
|
A
A
x
I
V
 
V
E
|
E
D
 
N
E
 
L
A
 
K
I
 
V
K
|
K
T
 
N
E
 
E
I
 
L
F
 
F
K
 
K
S
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
F
V
 
A
T
 
A
D
 
E
P
 
-
N
 
H
A
 
T
V
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
S
N
|
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
 
Q
I
 
I
M
 
T
K
 
S
L
 
I
G
 
A
M
 
N
A
 
A
T
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
Q
E
 
D
R
 
R
V
 
F
V
 
A
G
 
G
M
 
L
H
|
H
F
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
V
E
|
E
L
 
V
V
 
I
T
 
K
T
 
T
L
 
P
M
 
M
T
 
T
S
 
S
P
 
Q
E
 
K
V
 
T
T
 
F
E
 
E
R
 
S
A
 
L
E
 
V
H
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
-
E
 
K
V
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
H
V
 
P
V
 
V
R
 
S
S
 
C
A
 
K
D
 
D
R
 
T
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
S
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
L
V
 
Y
E
 
E
S
 
R
G
 
G
F
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
H
 
Y
P
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
K
 
E
L
 
L
S
 
L
D
 
D
L
 
Y
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
K
 
K
A
 
F
I
 
I
A
 
V
D
 
D
K
 
G
M
 
W
Y
 
H
E
 
E
-
 
M
E
 
D
F
 
A
K
 
E
E
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
H
S
 
Q
P
 
P
P
 
S
P
 
P
L
 
S
L
 
L
L
 
N
R
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
N
R
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
Y

1f12A L-3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase complexed with 3-hydroxybutyryl-coa (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 4:290/293 of 1f12A

query
sites
1f12A
I
 
V
S
 
K
R
 
H
V
 
V
G
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Q
 
L
M
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
H
 
G
T
 
H
D
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
 
V
E
 
D
T
 
Q
T
 
T
R
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
S
R
 
K
S
 
K
R
 
G
I
 
I
L
 
E
R
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
-
R
 
R
G
 
K
V
 
V
S
 
A
S
 
K
G
x
K
K
 
K
L
 
F
T
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
P
R
 
K
E
 
A
Q
 
G
A
 
D
S
 
E
W
 
C
R
 
V
L
 
E
R
 
K
F
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
T
L
 
I
G
 
A
D
 
T
F
 
S
A
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
H
-
 
S
R
 
T
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
C
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
I
V
 
V
E
 
E
D
 
N
E
 
L
A
 
K
I
 
V
K
 
K
T
 
N
E
 
E
I
 
L
F
 
F
K
 
K
S
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
F
V
 
A
T
 
A
D
 
E
P
 
-
N
 
H
A
 
T
V
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
 
Q
I
 
I
M
 
T
K
 
S
L
 
I
G
 
A
M
 
N
A
 
A
T
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
Q
E
 
D
R
 
R
V
 
F
V
 
A
G
 
G
M
 
L
H
|
H
F
 
F
F
|
F
N
|
N
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
x
M
P
 
K
L
 
L
V
 
V
E
|
E
L
 
V
V
 
I
T
 
K
T
 
T
L
 
P
M
 
M
T
 
T
S
 
S
P
 
Q
E
 
K
V
 
T
T
 
F
E
 
E
R
 
S
A
 
L
E
 
V
H
 
D
F
 
F
A
 
S
G
 
-
E
 
K
V
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
H
V
 
P
V
 
V
R
 
S
S
 
C
A
 
K
D
 
D
R
 
T
S
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
L
L
|
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
S
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
L
V
 
Y
E
 
E
S
 
R
G
 
G
F
 
D
A
 
A
T
 
S
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
H
 
Y
P
|
P
M
|
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
K
 
E
L
|
L
S
 
L
D
 
D
L
 
Y
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
K
 
K
A
 
F
I
 
I
A
 
V
D
 
D
K
 
G
M
 
W
Y
 
H
E
 
E
-
 
M
E
 
D
F
 
A
K
 
E
E
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
H
S
 
Q
P
 
P
P
 
S
P
 
P
L
 
S
L
 
L
L
 
N
R
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
N
R
 
K
L
 
F
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
Y

9jheA 3-hydroxybutyryl-coa dehydrogenase with NAD (see paper)
36% identity, 97% coverage: 8:287/288 of query aligns to 2:278/289 of 9jheA

query
sites
9jheA
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
T
M
|
M
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
K
V
 
A
C
 
F
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
H
 
E
T
 
G
D
 
N
-
 
T
V
 
V
L
 
A
V
 
L
Y
 
C
E
x
D
T
x
I
T
 
K
R
 
Q
E
 
E
L
 
W
A
 
A
A
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
L
S
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
K
R
 
K
S
 
G
L
 
Y
D
 
E
R
 
K
G
 
L
V
 
V
S
 
A
S
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
I
T
 
P
E
 
Q
R
 
E
E
 
K
R
 
A
E
 
D
Q
 
A
A
 
I
S
 
V
W
 
A
R
 
A
L
 
I
R
 
T
F
 
P
T
 
G
S
 
L
D
x
K
L
 
E
G
 
N
D
 
L
F
 
C
A
 
A
D
 
D
R
 
C
Q
 
D
L
 
L
V
 
I
C
 
V
E
 
E
A
|
A
A
|
A
V
x
F
E
|
E
D
 
D
E
 
M
A
 
K
I
 
V
K
 
K
T
 
Q
E
 
T
I
 
T
F
 
F
K
 
G
S
 
E
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
I
V
 
C
T
 
K
D
 
-
P
 
P
N
 
E
A
 
C
V
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
S
N
|
N
T
 
T
S
|
S
S
 
S
I
 
L
P
 
S
I
 
I
M
 
T
K
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
K
A
 
G
T
 
L
Q
 
S
H
 
R
A
 
P
E
 
-
R
 
-
V
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
H
|
H
F
 
F
F
 
F
N
 
N
P
 
P
V
 
A
P
 
D
V
 
R
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
E
L
 
V
V
 
I
T
 
A
T
 
G
L
 
C
M
 
N
T
 
T
S
 
P
P
 
A
E
 
E
V
 
T
T
 
V
E
 
E
R
 
K
A
 
I
E
 
K
H
 
E
F
 
I
A
 
S
G
 
-
E
 
V
V
 
A
L
 
I
G
 
G
K
 
K
Q
 
N
V
 
P
V
 
V
R
 
Q
S
 
V
A
 
N
D
 
E
R
 
A
S
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
M
L
 
I
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
A
R
 
F
M
 
I
V
 
K
E
 
M
S
 
E
G
 
G
F
 
V
A
 
S
T
 
D
K
 
I
E
 
A
D
 
G
I
 
I
D
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
N
H
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
G
D
 
D
L
 
F
V
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
I
V
 
C
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
M
D
 
D
K
 
V
M
 
L
Y
 
Y
E
 
H
E
 
E
F
 
T
K
 
G
E
 
D
P
 
S
L
 
K
Y
 
Y
S
 
R
P
 
A
P
 
C
P
 
P
L
 
L
L
 
I
L
 
R
R
 
K
M
 
M
V
 
V
E
 
R
A
 
G
G
 
G
R
 
N
L
 
L
G
 
G
K
 
C
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
K
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
Y
 
Y

9jhyB 3-hydroxybutyryl-coa dehydrogenase mutant (s117a) with acetoacetyl coa (see paper)
36% identity, 97% coverage: 8:287/288 of query aligns to 2:274/285 of 9jhyB

query
sites
9jhyB
R
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
K
V
 
A
C
 
F
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
H
 
E
T
 
G
D
 
N
-
 
T
V
 
V
L
 
A
V
 
L
Y
 
C
E
 
D
T
 
I
T
 
K
R
 
Q
E
 
E
L
 
W
A
 
A
A
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
L
S
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
K
R
 
K
S
 
G
L
 
Y
D
 
E
R
 
K
G
x
L
V
 
V
S
 
A
S
x
K
G
 
G
K
|
K
L
x
I
T
 
P
E
 
Q
R
 
E
E
 
K
R
 
A
E
 
D
Q
 
A
A
 
I
S
 
V
W
 
A
R
 
A
L
 
I
R
 
T
F
 
-
T
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
P
G
 
G
D
 
L
F
 
C
A
 
A
D
 
D
R
 
C
Q
 
D
L
 
L
V
 
I
C
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
D
 
D
E
 
M
A
 
K
I
 
V
K
 
K
T
 
Q
E
 
T
I
 
T
F
 
F
K
 
G
S
 
E
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
I
V
 
C
T
 
K
D
 
-
P
 
P
N
 
E
A
 
C
V
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
 
A
S
 
S
I
 
L
P
 
S
I
 
I
M
 
T
K
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
K
A
 
G
T
 
L
Q
 
S
H
 
R
A
 
P
E
 
-
R
 
-
V
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
H
|
H
F
 
F
F
|
F
N
|
N
P
 
P
V
 
A
P
 
D
V
x
R
L
 
M
P
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
E
L
 
V
V
 
I
T
 
A
T
 
G
L
 
C
M
 
N
T
 
T
S
 
P
P
 
A
E
 
E
V
 
T
T
 
V
E
 
E
R
 
K
A
 
I
E
 
K
H
 
E
F
 
I
A
 
S
G
 
-
E
 
V
V
 
A
L
 
I
G
 
G
K
 
K
Q
 
N
V
 
P
V
 
V
R
 
Q
S
 
V
A
 
N
D
 
E
R
 
A
S
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
V
 
V
N
|
N
A
 
R
L
 
I
L
|
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
M
L
 
I
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
A
R
 
F
M
 
I
V
 
K
E
 
M
S
 
E
G
 
G
F
 
V
A
 
S
T
 
D
K
 
I
E
 
A
D
 
G
I
 
I
D
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
N
H
 
H
P
 
P
M
|
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
G
D
 
D
L
 
F
V
x
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
I
V
 
C
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
M
D
 
D
K
 
V
M
 
L
Y
 
Y
E
 
H
E
 
E
F
 
T
K
 
G
E
 
D
P
 
S
L
 
K
Y
 
Y
S
 
R
P
 
A
P
 
C
P
 
P
L
 
L
L
 
I
L
 
R
R
 
K
M
 
M
V
 
V
E
 
R
A
 
G
G
 
G
R
 
N
L
 
L
G
 
G
K
 
C
K
 
K
V
 
T
G
 
G
H
 
K
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
V
Y
 
Y

8oqoA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-49 (see paper)
33% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 333:615/727 of 8oqoA

query
sites
8oqoA
I
 
I
S
 
K
R
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Y
V
 
V
C
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
A
H
 
G
T
 
Y
D
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
 
K
E
 
D
T
 
V
T
 
S
R
 
L
E
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
K
S
 
G
R
 
Y
I
 
S
L
 
E
R
 
K
S
 
L
L
 
E
D
 
A
R
 
K
G
 
A
V
 
L
S
 
E
S
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
T
T
 
T
E
 
Q
R
 
E
E
 
R
R
 
S
E
 
D
Q
 
A
A
 
L
S
 
L
W
 
A
R
 
R
L
 
I
R
 
T
F
 
P
T
 
T
S
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
K
D
 
G
R
 
V
Q
 
D
L
 
F
V
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
F
E
 
E
D
 
N
E
 
Q
A
 
E
I
 
L
K
 
K
T
 
H
E
 
K
I
 
V
F
 
F
K
 
G
S
 
E
L
 
I
D
 
E
K
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
-
D
 
E
P
 
P
N
 
N
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
G
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
 
S
S
 
T
I
 
L
P
 
P
I
 
I
M
 
T
K
 
G
L
 
L
G
 
A
M
 
T
A
 
G
T
 
V
Q
 
K
H
 
R
A
 
Q
E
 
E
R
 
D
V
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
I
H
 
H
F
 
F
F
 
F
N
 
S
P
 
P
V
 
V
P
 
D
V
 
K
L
 
M
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
I
T
 
K
T
 
G
L
 
E
M
 
K
T
 
T
S
 
S
P
 
D
E
 
E
V
 
A
T
 
L
E
 
A
R
 
R
A
 
V
E
 
F
H
 
D
F
 
Y
A
 
T
G
 
-
E
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
V
 
P
V
 
I
R
 
V
S
 
V
A
 
N
D
 
D
R
 
S
S
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
F
V
 
T
N
 
S
A
 
R
L
 
V
L
 
I
V
 
G
P
 
T
Y
 
F
L
 
V
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
A
M
 
M
V
 
L
E
 
G
S
 
E
G
 
G
F
 
V
A
 
-
T
 
E
K
 
P
E
 
A
D
 
S
I
 
I
D
 
E
K
 
Q
A
 
A
M
 
G
V
 
S
L
 
Q
G
 
-
T
 
A
A
 
G
H
 
Y
P
 
P
M
 
A
G
 
P
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
E
V
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
E
T
 
L
V
 
M
K
 
H
-
 
K
-
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
T
K
 
R
M
 
K
Y
 
G
E
 
V
E
 
E
F
 
D
K
 
A
E
 
G
P
 
G
L
 
T
Y
 
Y
S
 
Q
P
 
P
P
 
H
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
L
 
V
L
 
V
L
 
E
R
 
K
M
 
M
V
 
I
E
 
E
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
R
K
 
L
V
 
K
G
 
G
H
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

8oqlA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-1 (see paper)
33% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 333:615/728 of 8oqlA

query
sites
8oqlA
I
 
I
S
 
K
R
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Y
V
 
V
C
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
A
H
 
G
T
 
Y
D
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
x
K
E
x
D
T
x
V
T
 
S
R
 
L
E
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
K
S
 
G
R
 
Y
I
 
S
L
 
E
R
 
K
S
 
L
L
 
E
D
 
A
R
 
K
G
 
A
V
 
L
S
 
E
S
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
T
T
 
T
E
 
Q
R
 
E
E
 
R
R
 
S
E
 
D
Q
 
A
A
 
L
S
 
L
W
 
A
R
 
R
L
 
I
R
 
T
F
 
P
T
 
T
S
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
K
D
 
G
R
 
V
Q
 
D
L
 
F
V
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
F
E
 
E
D
 
N
E
 
Q
A
 
E
I
 
L
K
 
K
T
 
H
E
 
K
I
x
V
F
 
F
K
 
G
S
 
E
L
 
I
D
 
E
K
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
-
D
 
E
P
 
P
N
 
N
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
G
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
 
S
S
 
T
I
 
L
P
 
P
I
 
I
M
 
T
K
 
G
L
 
L
G
 
A
M
 
T
A
 
G
T
 
V
Q
 
K
H
 
R
A
 
Q
E
 
E
R
 
D
V
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
I
H
 
H
F
 
F
F
 
F
N
 
S
P
 
P
V
 
V
P
x
D
V
x
K
L
x
M
P
|
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
I
T
 
K
T
 
G
L
 
E
M
 
K
T
 
T
S
 
S
P
 
D
E
 
E
V
 
A
T
 
L
E
 
A
R
 
R
A
 
V
E
 
F
H
 
D
F
 
Y
A
 
T
G
 
-
E
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
G
K
|
K
Q
 
T
V
 
P
V
 
I
R
 
V
S
 
V
A
 
N
D
 
D
R
 
S
S
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
F
V
 
T
N
 
S
A
 
R
L
 
V
L
 
I
V
 
G
P
 
T
Y
 
F
L
 
V
L
 
N
S
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
A
M
 
M
V
 
L
E
 
G
S
 
E
G
 
G
F
 
V
A
 
-
T
 
E
K
 
P
E
 
A
D
 
S
I
 
I
D
 
E
K
 
Q
A
 
A
M
 
G
V
 
S
L
 
Q
G
 
-
T
 
A
A
 
G
H
 
Y
P
 
P
M
 
A
G
 
P
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
E
V
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
E
T
 
L
V
 
M
K
 
H
-
 
K
-
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
T
K
 
R
M
 
K
Y
 
G
E
 
V
E
 
E
F
 
D
K
 
A
E
 
G
P
 
G
L
 
T
Y
 
Y
S
 
Q
P
 
P
P
 
H
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
L
 
V
L
 
V
L
 
E
R
 
K
M
 
M
V
 
I
E
 
E
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
R
K
 
L
V
 
K
G
 
G
H
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

8oqvA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-109 (see paper)
33% identity, 98% coverage: 6:287/288 of query aligns to 332:614/726 of 8oqvA

query
sites
8oqvA
I
 
I
S
 
K
R
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Y
V
 
V
C
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
A
H
 
G
T
 
Y
D
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
L
Y
 
K
E
 
D
T
 
V
T
 
S
R
 
L
E
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
K
S
 
G
R
 
Y
I
 
S
L
 
E
R
 
K
S
 
L
L
 
E
D
 
A
R
 
K
G
 
A
V
 
L
S
 
E
S
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
T
T
 
T
E
 
Q
R
 
E
E
 
R
R
 
S
E
 
D
Q
 
A
A
 
L
S
 
L
W
 
A
R
 
R
L
 
I
R
 
T
F
 
P
T
 
T
S
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
K
D
 
G
R
 
V
Q
 
D
L
 
F
V
 
V
C
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
F
E
 
E
D
 
N
E
 
Q
A
 
E
I
 
L
K
 
K
T
 
H
E
 
K
I
 
V
F
 
F
K
 
G
S
 
E