SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_076583323.1 NCBI__GCF_001971705.1:WP_076583323.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
38% identity, 85% coverage: 1:239/280 of query aligns to 1:229/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
L
 
I
T
 
F
A
 
V
Q
 
N
N
 
D
I
 
V
S
 
Y
K
 
K
T
 
N
Y
x
F
P
 
-
G
 
G
G
 
S
E
 
L
E
 
E
A
x
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
T
F
 
L
D
 
K
V
 
V
T
 
N
G
 
K
D
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
E
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
R
 
F
L
 
I
D
 
D
D
 
G
V
 
V
T
 
K
V
 
I
T
 
N
A
 
N
L
 
-
S
 
G
D
 
K
R
 
V
Q
 
N
L
 
I
R
 
N
R
 
K
T
 
V
R
 
R
R
 
Q
D
 
K
I
 
V
A
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
F
E
 
P
R
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
M
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
L
 
T
S
 
L
G
 
A
R
 
P
L
 
V
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
-
A
 
K
F
 
V
R
 
K
R
 
K
K
 
M
F
 
N
P
 
K
A
 
K
E
 
E
D
 
A
I
 
E
E
 
E
F
 
L
A
 
A
R
 
V
E
 
D
T
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
G
 
D
H
 
K
E
 
K
R
 
D
D
 
Q
R
 
Y
A
 
P
D
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
M
R
 
Q
P
 
P
K
 
E
I
 
V
M
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
S
 
V
H
 
K
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
N
L
 
V
L
 
M
T
 
K
E
 
Q
I
 
L
A
 
-
A
 
A
D
 
N
E
 
E
R
 
G
I
 
M
P
 
T
V
 
M
L
 
V
I
 
V
N
 
V
I
 
T
H
|
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
F
L
 
M
A
 
D
D
 
D
G
 
G
E
 
V
L
 
I
V
 
V
F
 
E
D
 
E
G
 
G
P
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
I
D
 
F
E
 
Y
T
 
R
A
 
A
K
 
K
D
 
N

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
41% identity, 85% coverage: 1:239/280 of query aligns to 2:229/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
M
 
I
L
 
I
T
 
R
A
 
I
Q
 
R
N
 
N
I
 
L
S
 
H
K
 
K
T
 
W
Y
x
F
P
 
-
G
 
G
G
 
P
E
 
L
E
 
H
A
x
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
H
F
 
L
D
 
E
V
 
V
T
 
A
G
 
P
D
 
G
E
 
E
V
 
K
V
 
L
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
E
 
R
C
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
L
T
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
Q
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
R
 
V
L
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
L
T
 
S
V
 
V
T
 
K
A
 
-
L
 
-
S
 
D
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
E
T
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
F
E
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
M
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
T
W
 
L
N
 
A
A
 
P
F
 
M
R
 
R
-
 
V
R
 
R
K
 
R
F
 
W
P
 
P
A
 
R
E
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
F
 
K
-
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
L
G
 
D
H
 
Q
E
 
A
R
 
R
D
 
K
R
 
Y
A
 
P
D
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
S
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
D
L
 
V
L
 
M
T
 
R
E
 
D
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
D
 
G
E
 
G
R
 
M
I
 
T
P
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
T
I
 
-
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
V
G
 
F
L
 
M
A
 
D
D
 
G
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
V
 
V
F
 
E
D
 
E
G
 
G
P
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
I
D
 
F
E
 
T
T
 
R
A
 
P
K
 
K
D
 
E

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
38% identity, 83% coverage: 1:233/280 of query aligns to 3:225/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
M
L
 
I
T
 
D
A
 
V
Q
 
H
N
 
Q
I
 
L
S
 
K
K
 
K
T
 
S
Y
x
F
P
 
-
G
 
G
G
 
S
E
 
L
E
 
E
A
x
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
F
 
V
D
 
H
V
 
I
T
 
R
G
 
E
D
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
E
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
L
T
 
K
A
 
A
L
 
-
S
 
K
D
 
D
R
 
T
Q
 
N
L
 
L
R
 
N
R
 
K
T
 
V
R
 
R
R
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
F
E
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
M
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
T
S
 
L
G
 
A
R
 
P
L
 
M
G
 
K
Y
 
V
L
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
F
 
W
P
 
P
A
 
R
E
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
F
 
A
-
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
G
 
D
H
 
K
E
 
A
R
 
H
D
 
A
R
 
Y
A
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
S
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
T
 
K
E
 
Q
I
 
L
A
 
-
A
 
A
D
 
N
E
 
E
R
 
G
I
 
M
P
 
T
V
 
M
L
 
V
I
 
V
N
 
V
I
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
F
L
 
M
A
 
D
D
 
G
G
 
G
E
 
Y
L
 
I
V
 
I
F
 
E
D
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
L
 
L

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
38% identity, 83% coverage: 1:233/280 of query aligns to 3:225/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
M
L
 
I
T
 
D
A
 
V
Q
 
H
N
 
Q
I
 
L
S
 
K
K
 
K
T
 
S
Y
x
F
P
 
-
G
 
G
G
 
S
E
 
L
E
 
E
A
x
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
F
 
V
D
 
H
V
 
I
T
 
R
G
 
E
D
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
E
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
L
T
 
K
A
 
A
L
 
-
S
 
K
D
 
D
R
 
T
Q
 
N
L
 
L
R
 
N
R
 
K
T
 
V
R
 
R
R
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
F
E
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
M
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
T
S
 
L
G
 
A
R
 
P
L
 
M
G
 
K
Y
 
V
L
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
F
 
W
P
 
P
A
 
R
E
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
F
 
A
-
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
G
 
D
H
 
K
E
 
A
R
 
H
D
 
A
R
 
Y
A
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
S
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
T
 
K
E
 
Q
I
 
L
A
 
-
A
 
A
D
 
N
E
 
E
R
 
G
I
 
M
P
 
T
V
 
M
L
 
V
I
 
V
N
 
V
I
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
F
L
 
M
A
 
D
D
 
G
G
 
G
E
 
Y
L
 
I
V
 
I
F
 
E
D
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
L
 
L

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
38% identity, 83% coverage: 1:233/280 of query aligns to 3:225/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
M
L
 
I
T
 
D
A
 
V
Q
 
H
N
 
Q
I
 
L
S
 
K
K
 
K
T
 
S
Y
x
F
P
 
-
G
 
G
G
 
S
E
 
L
E
 
E
A
x
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
F
 
V
D
 
H
V
 
I
T
 
R
G
 
E
D
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
E
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
L
T
 
K
A
 
A
L
 
-
S
 
K
D
 
D
R
 
T
Q
 
N
L
 
L
R
 
N
R
 
K
T
 
V
R
 
R
R
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
F
E
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
M
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
T
S
 
L
G
 
A
R
 
P
L
 
M
G
 
K
Y
 
V
L
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
F
 
W
P
 
P
A
 
R
E
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
F
 
A
-
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
G
 
D
H
 
K
E
 
A
R
 
H
D
 
A
R
 
Y
A
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
S
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
T
 
K
E
 
Q
I
 
L
A
 
-
A
 
A
D
 
N
E
 
E
R
 
G
I
 
M
P
 
T
V
 
M
L
 
V
I
 
V
N
 
V
I
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
F
L
 
M
A
 
D
D
 
G
G
 
G
E
 
Y
L
 
I
V
 
I
F
 
E
D
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
L
 
L

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
38% identity, 83% coverage: 1:233/280 of query aligns to 3:225/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
M
L
 
I
T
 
D
A
 
V
Q
 
H
N
 
Q
I
 
L
S
 
K
K
 
K
T
 
S
Y
x
F
P
 
-
G
 
G
G
 
S
E
 
L
E
 
E
A
x
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
F
 
V
D
 
H
V
 
I
T
 
R
G
 
E
D
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
E
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
L
T
 
K
A
 
A
L
 
-
S
 
K
D
 
D
R
 
T
Q
 
N
L
 
L
R
 
N
R
 
K
T
 
V
R
 
R
R
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
R
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
F
E
 
P
R
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
M
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
T
S
 
L
G
 
A
R
 
P
L
 
M
G
 
K
Y
 
V
L
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
R
K
 
K
F
 
W
P
 
P
A
 
R
E
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
F
 
A
-
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
G
 
D
H
 
K
E
 
A
R
 
H
D
 
A
R
 
Y
A
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
S
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
T
 
K
E
 
Q
I
 
L
A
 
-
A
 
A
D
 
N
E
 
E
R
 
G
I
 
M
P
 
T
V
 
M
L
 
V
I
 
V
N
 
V
I
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
F
L
 
M
A
 
D
D
 
G
G
 
G
E
 
Y
L
 
I
V
 
I
F
 
E
D
 
E
G
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
L
 
L

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
40% identity, 80% coverage: 1:224/280 of query aligns to 1:223/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
M
 
M
L
 
I
T
 
K
A
 
L
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
T
K
 
K
T
 
T
Y
|
Y
P
 
K
G
 
M
G
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
N
V
 
V
S
 
N
F
 
L
D
 
N
V
 
I
T
 
K
G
 
E
D
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
I
 
L
E
 
N
C
 
I
I
 
I
N
 
G
R
 
C
L
 
L
T
 
D
E
 
K
P
 
P
T
 
T
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
R
 
Y
L
 
I
D
 
D
D
 
N
V
 
I
T
 
K
V
 
T
T
 
N
A
 
D
L
 
L
S
 
D
D
 
D
R
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
T
R
 
K
T
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
D
-
 
K
I
 
I
A
 
G
M
 
F
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
P
R
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
A
M
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
-
 
E
L
 
L
S
 
P
G
 
L
R
 
I
L
 
F
G
 
K
Y
 
Y
L
 
R
S
 
G
T
 
A
W
 
M
N
 
S
A
 
G
F
 
E
-
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
K
F
 
R
P
 
A
A
 
L
E
 
E
D
 
C
I
 
L
E
 
K
F
 
M
A
 
A
R
 
-
E
 
E
T
 
L
L
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
-
G
 
-
L
 
F
G
 
A
G
 
N
H
 
H
E
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
K
A
 
P
D
 
N
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
N
R
 
N
P
 
P
K
 
P
I
 
I
M
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
K
T
 
T
S
 
G
H
 
E
A
 
K
V
 
I
M
 
M
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
N
A
 
E
D
 
E
E
 
D
R
 
G
I
 
K
P
 
T
V
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
V
I
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
I
E
 
N
L
 
V
A
 
A
V
 
-
E
 
R
Y
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
R
I
 
I
I
 
I
G
 
Y
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
V

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
40% identity, 80% coverage: 1:224/280 of query aligns to 1:223/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
M
 
M
L
 
I
T
 
K
A
 
L
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
T
K
 
K
T
 
T
Y
|
Y
P
 
K
G
 
M
G
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
N
V
 
V
S
 
N
F
 
L
D
 
N
V
 
I
T
 
K
G
 
E
D
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
I
 
L
E
 
N
C
 
I
I
 
I
N
 
G
R
 
C
L
 
L
T
 
D
E
 
K
P
 
P
T
 
T
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
R
 
Y
L
 
I
D
 
D
D
 
N
V
 
I
T
 
K
V
 
T
T
 
N
A
 
D
L
 
L
S
 
D
D
 
D
R
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
T
R
 
K
T
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
D
-
 
K
I
 
I
A
 
G
M
 
F
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
P
R
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
A
M
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
-
 
E
L
 
L
S
 
P
G
 
L
R
 
I
L
 
F
G
 
K
Y
 
Y
L
 
R
S
 
G
T
 
A
W
 
M
N
 
S
A
 
G
F
 
E
-
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
K
F
 
R
P
 
A
A
 
L
E
 
E
D
 
C
I
 
L
E
 
K
F
 
M
A
 
A
R
 
-
E
 
E
T
 
L
L
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
-
G
 
-
L
x
F
G
 
A
G
 
N
H
 
H
E
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
K
A
 
P
D
 
N
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
N
R
 
N
P
 
P
K
 
P
I
 
I
M
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
K
T
 
T
S
 
G
H
 
E
A
 
K
V
 
I
M
 
M
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
N
A
 
E
D
 
E
E
 
D
R
 
G
I
 
K
P
 
T
V
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
V
I
 
T
H
|
H
E
 
D
V
 
I
E
 
N
L
 
V
A
 
A
V
 
-
E
 
R
Y
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
R
I
 
I
I
 
I
G
 
Y
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
V

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
39% identity, 80% coverage: 1:225/280 of query aligns to 1:220/343 of P30750

query
sites
P30750
M
 
M
L
 
I
T
 
K
A
 
L
Q
 
S
N
 
N
I
 
I
S
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
 
F
P
 
H
G
 
Q
G
 
G
E
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
H
V
 
V
T
 
P
G
 
A
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
E
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
D
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
R
 
L
L
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
Q
T
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
R
 
T
R
 
K
T
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
E
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
L
E
 
S
R
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
-
 
A
L
 
L
S
 
P
G
 
L
R
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
N
L
 
T
S
 
P
T
 
K
W
 
D
N
 
E
A
 
V
F
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
K
E
 
H
R
 
D
D
 
S
R
 
Y
A
 
P
D
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
S
R
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
T
 
T
S
 
T
H
 
R
A
 
S
V
 
I
M
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
N
A
 
R
D
 
R
E
 
L
R
 
G
I
 
L
P
 
T
V
 
I
L
 
L
I
 
L
N
 
I
I
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
K
E
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
I
 
A
G
 
V
L
 
I
A
 
S
D
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
38% identity, 80% coverage: 1:225/280 of query aligns to 2:221/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
M
 
M
L
 
I
T
 
K
A
 
L
Q
 
S
N
 
N
I
 
I
S
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
P
 
H
G
x
Q
G
 
G
E
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
H
V
 
V
T
 
P
G
 
A
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
E
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
D
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
R
 
L
L
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
Q
T
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
R
 
T
R
 
K
T
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
E
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
L
E
 
S
R
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
-
 
A
L
 
L
S
 
P
G
 
L
R
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
N
L
 
T
S
 
P
T
 
K
W
 
D
N
 
E
A
 
V
F
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
K
E
 
H
R
 
D
D
 
S
R
 
Y
A
 
P
D
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
S
R
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
T
 
T
S
 
T
H
 
R
A
 
S
V
 
I
M
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
N
A
 
R
D
 
R
E
 
L
R
 
G
I
 
L
P
 
T
V
 
I
L
 
L
I
 
L
N
 
I
I
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
K
E
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
I
 
A
G
 
V
L
 
I
A
 
S
D
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
38% identity, 80% coverage: 1:225/280 of query aligns to 2:221/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
M
 
M
L
 
I
T
 
K
A
 
L
Q
 
S
N
 
N
I
 
I
S
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
P
 
H
G
 
Q
G
 
G
E
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
H
V
 
V
T
 
P
G
 
A
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
E
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
D
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
R
 
L
L
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
Q
T
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
R
 
T
R
 
K
T
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
E
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
L
E
 
S
R
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
-
 
A
L
 
L
S
 
P
G
 
L
R
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
N
L
 
T
S
 
P
T
 
K
W
 
D
N
 
E
A
 
V
F
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
K
E
 
H
R
 
D
D
 
S
R
 
Y
A
 
P
D
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
S
R
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
T
 
T
S
 
T
H
 
R
A
 
S
V
 
I
M
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
N
A
 
R
D
 
R
E
 
L
R
 
G
I
 
L
P
 
T
V
 
I
L
 
L
I
 
L
N
 
I
I
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
K
E
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
I
 
A
G
 
V
L
 
I
A
 
S
D
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
I

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
38% identity, 80% coverage: 1:225/280 of query aligns to 2:221/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
M
 
M
L
 
I
T
 
K
A
 
L
Q
 
S
N
 
N
I
 
I
S
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
P
 
H
G
x
Q
G
 
G
E
 
T
-
 
R
-
 
T
-
x
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
H
V
 
V
T
 
P
G
 
A
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
E
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
D
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
R
 
L
L
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
Q
T
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
R
 
T
R
 
K
T
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
E
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
L
E
 
S
R
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
-
 
A
L
 
L
S
 
P
G
 
L
R
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
N
L
 
T
S
 
P
T
 
K
W
 
D
N
 
E
A
 
V
F
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
K
E
 
H
R
 
D
D
 
S
R
 
Y
A
 
P
D
 
S
E
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
Q
 
S
R
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
T
 
T
S
 
T
H
 
R
A
 
S
V
 
I
M
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
N
A
 
R
D
 
R
E
 
L
R
 
G
I
 
L
P
 
T
V
 
I
L
 
L
I
 
L
N
 
I
I
 
T
H
|
H
E
 
E
V
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
K
E
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
I
 
A
G
 
V
L
 
I
A
 
S
D
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
I

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
38% identity, 81% coverage: 1:227/280 of query aligns to 3:223/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
M
 
L
L
 
I
T
 
S
A
 
L
Q
 
K
N
 
N
I
 
I
S
 
F
K
 
R
T
 
S
Y
 
Y
P
 
R
G
 
N
G
 
G
E
 
D
E
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
Q
A
 
V
L
 
L
R
 
K
G
 
N
V
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
E
V
 
V
T
 
N
G
 
E
D
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
I
 
M
E
 
N
C
 
T
I
 
I
N
 
G
R
 
M
L
 
L
T
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
D
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
R
 
Y
L
 
L
D
 
E
D
 
G
V
 
Q
T
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
R
 
A
R
 
K
T
 
V
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
M
 
F
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
Y
 
F
N
 
F
L
 
L
V
 
L
E
 
S
R
 
K
L
 
L
T
 
N
V
 
A
M
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
L
 
-
S
 
E
G
 
L
R
 
P
L
 
L
G
 
I
Y
 
Y
L
 
A
S
 
G
T
 
V
W
 
S
N
 
S
A
 
S
F
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
K
F
 
L
P
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
A
R
 
E
E
 
E
T
 
Y
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
E
L
 
L
G
 
T
G
 
E
H
 
R
E
 
S
R
 
H
D
 
H
R
 
L
A
 
P
D
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
Q
 
N
R
 
N
P
 
P
K
 
S
I
 
I
M
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
E
 
K
T
 
T
S
 
G
H
 
N
A
 
Q
V
 
I
M
 
M
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
V
E
 
D
I
 
L
A
 
N
A
 
K
D
 
E
E
 
G
R
 
K
I
 
T
P
 
I
V
 
I
L
 
M
I
 
V
N
 
T
I
 
-
H
 
H
E
 
E
V
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
A
E
 
-
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
R
 
R
I
 
Q
I
 
I
G
 
V
L
 
I
A
 
R
D
 
D
G
 
G
E
 
V
L
 
I
V
 
S
F
 
S
D
 
D

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
37% identity, 80% coverage: 1:224/280 of query aligns to 1:215/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
M
 
M
L
 
I
T
 
R
A
 
F
Q
 
E
N
 
H
I
 
V
S
 
S
K
 
K
T
 
A
Y
 
Y
P
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
R
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
F
 
F
D
 
H
V
 
M
T
 
Q
G
 
P
D
 
G
E
 
E
V
 
M
V
 
A
A
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
K
C
 
L
I
 
I
N
x
C
R
 
G
L
 
I
T
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
S
D
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
R
 
W
L
 
F
D
 
S
D
 
G
V
 
H
T
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
R
L
 
L
S
 
K
D
 
N
R
 
R
Q
 
E
L
 
V
R
 
P
R
 
F
T
 
L
R
 
R
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
H
N
 
H
L
 
L
V
 
L
E
 
M
R
 
D
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
A
S
 
I
G
 
P
R
 
L
L
 
I
G
 
I
Y
 
A
L
 
G
S
 
A
T
 
S
W
 
G
N
 
D
A
 
D
F
 
I
R
 
R
R
 
R
K
 
R
F
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
G
 
D
H
 
K
E
 
A
R
 
K
D
 
N
R
 
F
A
 
P
D
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
Q
 
N
R
 
K
P
 
P
K
 
A
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
E
 
A
T
 
L
S
 
S
H
 
E
A
 
G
V
 
I
M
 
L
E
 
R
L
 
L
L
 
F
T
 
E
E
 
E
I
 
F
A
 
-
A
 
N
D
 
R
E
 
V
R
 
G
I
 
V
P
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
M
N
 
A
I
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
I
E
 
N
L
 
L
A
 
I
V
 
S
E
 
R
Y
 
R
A
 
S
D
 
Y
R
 
R
I
 
M
I
 
L
G
 
T
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
L

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
37% identity, 80% coverage: 1:224/280 of query aligns to 1:215/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
M
 
M
L
 
I
T
 
R
A
 
F
Q
 
E
N
 
H
I
 
V
S
 
S
K
 
K
T
 
A
Y
|
Y
P
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
R
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
F
 
F
D
 
H
V
 
M
T
 
Q
G
 
P
D
 
G
E
 
E
V
 
M
V
 
A
A
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
E
 
K
C
 
L
I
 
I
N
 
C
R
 
G
L
 
I
T
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
S
D
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
R
 
W
L
 
F
D
 
S
D
 
G
V
 
H
T
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
R
L
 
L
S
 
K
D
 
N
R
 
R
Q
 
E
L
 
V
R
 
P
R
 
F
T
 
L
R
 
R
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
|
Q
E
 
D
Y
 
H
N
 
H
L
 
L
V
 
L
E
 
M
R
 
D
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
A
S
 
I
G
 
P
R
 
L
L
 
I
G
 
I
Y
 
A
L
 
G
S
 
A
T
 
S
W
 
G
N
 
D
A
 
D
F
 
I
R
 
R
R
 
R
K
 
R
F
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
G
 
D
H
x
K
E
 
A
R
 
K
D
 
N
R
 
F
A
 
P
D
 
I
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
x
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
Q
 
N
R
 
K
P
 
P
K
 
A
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
E
 
A
T
 
L
S
 
S
H
 
E
A
 
G
V
 
I
M
 
L
E
 
R
L
 
L
L
 
F
T
 
E
E
 
E
I
 
F
A
 
-
A
 
N
D
 
R
E
 
V
R
 
G
I
 
V
P
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
M
N
 
A
I
 
T
H
|
H
E
 
D
V
 
I
E
 
N
L
 
L
A
 
I
V
 
S
E
 
R
Y
 
R
A
 
S
D
 
Y
R
 
R
I
 
M
I
 
L
G
 
T
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
L

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
36% identity, 80% coverage: 1:224/280 of query aligns to 1:215/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
M
 
M
L
 
I
T
 
R
A
 
F
Q
 
E
N
 
H
I
 
V
S
 
S
K
 
K
T
 
A
Y
|
Y
P
 
L
G
 
G
G
 
G
E
x
R
E
 
Q
A
|
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
F
 
F
D
 
H
V
 
M
T
 
Q
G
 
P
D
 
G
E
 
E
V
 
M
V
 
A
A
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
E
 
K
C
 
L
I
 
I
N
 
C
R
 
G
L
 
I
T
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
S
D
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
R
 
W
L
 
F
D
 
S
D
 
G
V
 
H
T
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
R
L
 
L
S
 
K
D
 
N
R
 
R
Q
 
E
L
 
V
R
 
P
R
 
F
T
 
L
R
 
R
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
A
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
H
N
 
H
L
 
L
V
 
L
E
 
M
R
 
D
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
A
S
 
I
G
 
P
R
 
L
L
 
I
G
 
I
Y
 
A
L
 
G
S
 
A
T
 
S
W
 
G
N
 
D
A
 
D
F
 
I
R
 
R
R
 
R
K
 
R
F
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
G
 
D
H
 
K
E
 
A
R
 
K
D
 
N
R
 
F
A
 
P
D
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
Q
 
N
R
 
K
P
 
P
K
 
A
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
E
 
A
T
 
L
S
 
S
H
 
E
A
 
G
V
 
I
M
 
L
E
 
R
L
 
L
L
 
F
T
 
E
E
 
E
I
 
F
A
 
-
A
 
N
D
 
R
E
 
V
R
 
G
I
 
V
P
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
M
N
 
A
I
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
I
E
 
N
L
 
L
A
 
I
V
 
S
E
 
R
Y
 
R
A
 
S
D
 
Y
R
 
R
I
 
M
I
 
L
G
 
T
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
L

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
37% identity, 81% coverage: 1:227/280 of query aligns to 2:220/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
M
 
M
L
 
I
T
 
T
A
 
L
Q
 
D
N
 
H
I
 
V
S
 
T
K
 
K
T
 
Q
Y
|
Y
P
 
K
G
 
S
-
 
S
G
 
A
E
 
R
E
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
D
G
 
D
V
 
I
S
 
N
F
 
V
D
 
K
V
 
I
T
 
D
G
 
K
D
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
A
x
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
I
 
M
E
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
L
R
 
A
L
 
A
T
 
E
E
 
T
P
 
P
T
 
T
D
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
R
L
 
V
D
 
S
D
 
K
V
 
F
T
 
H
V
 
V
T
 
N
A
 
K
L
 
L
S
 
R
D
 
G
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
R
 
P
R
 
K
T
 
L
R
 
R
R
 
Q
D
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
C
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
F
N
 
R
L
 
L
V
 
L
E
 
Q
R
 
Q
L
 
K
T
 
T
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
A
S
 
F
G
 
A
R
 
L
L
 
E
G
 
V
Y
 
I
L
 
G
S
 
K
T
 
R
W
 
T
N
 
D
A
 
A
F
 
I
R
 
N
R
 
R
K
 
V
F
 
V
P
 
P
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
K
E
 
A
R
 
N
D
 
R
R
 
L
A
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
V
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
L
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
T
S
 
S
H
 
R
A
 
D
V
 
I
M
 
M
E
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
R
I
 
I
A
 
N
A
 
R
D
 
T
E
 
G
R
 
-
I
 
T
P
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
M
N
 
A
I
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
H
E
 
H
L
 
I
A
 
V
V
 
D
E
 
S
Y
 
M
A
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
V
I
 
V
G
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
L
G
 
G
E
 
R
L
 
L
V
 
V
F
 
R
D
 
D

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
37% identity, 81% coverage: 1:227/280 of query aligns to 2:220/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
M
 
M
L
 
I
T
 
T
A
 
L
Q
 
D
N
 
H
I
 
V
S
 
T
K
 
K
T
 
Q
Y
|
Y
-
 
K
P
 
S
G
 
S
G
 
A
E
 
R
E
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
D
G
 
D
V
 
I
S
 
N
F
 
V
D
 
K
V
 
I
T
 
D
G
 
K
D
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
I
 
M
E
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
L
R
 
A
L
 
A
T
 
E
E
 
T
P
 
P
T
 
T
D
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
R
L
 
V
D
 
S
D
 
K
V
 
F
T
 
H
V
 
V
T
 
N
A
 
K
L
 
L
S
 
R
D
 
G
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
R
 
P
R
 
K
T
 
L
R
 
R
R
 
Q
D
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
C
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
F
N
 
R
L
 
L
V
 
L
E
 
Q
R
 
Q
L
 
K
T
 
T
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
A
S
 
F
G
 
A
R
 
L
L
 
E
G
 
V
Y
 
I
L
 
G
S
 
K
T
 
R
W
 
T
N
 
D
A
 
A
F
 
I
R
 
N
R
 
R
K
 
V
F
 
V
P
 
P
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
K
E
 
A
R
 
N
D
 
R
R
 
L
A
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
V
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
L
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
T
S
 
S
H
 
R
A
 
D
V
 
I
M
 
M
E
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
R
I
 
I
A
 
N
A
 
R
D
 
T
E
 
G
R
 
-
I
 
T
P
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
M
N
 
A
I
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
H
E
 
H
L
 
I
A
 
V
V
 
D
E
 
S
Y
 
M
A
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
V
I
 
V
G
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
L
G
 
G
E
 
R
L
 
L
V
 
V
F
 
R
D
 
D

A5U7B7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) (see 2 papers)
37% identity, 81% coverage: 1:227/280 of query aligns to 1:219/229 of A5U7B7

query
sites
A5U7B7
M
 
M
L
 
I
T
 
T
A
 
L
Q
 
D
N
 
H
I
 
V
S
 
T
K
 
K
T
 
Q
Y
 
Y
P
 
K
G
 
S
-
 
S
G
 
A
E
 
R
E
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
D
G
 
D
V
 
I
S
 
N
F
 
V
D
 
K
V
 
I
T
 
D
G
 
K
D
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
I
 
M
E
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
L
R
 
A
L
 
A
T
 
E
E
 
T
P
 
P
T
 
T
D
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
R
L
 
V
D
 
S
D
 
K
V
 
F
T
 
H
V
 
V
T
 
N
A
 
K
L
 
L
S
 
R
D
 
G
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
R
 
P
R
 
K
T
 
L
R
 
R
R
 
Q
D
 
V
I
 
I
A
 
G
M
x
C
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
F
N
 
R
L
 
L
V
 
L
E
 
Q
R
 
Q
L
 
K
T
 
T
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
A
S
 
F
G
 
A
R
 
L
L
 
E
G
 
V
Y
 
I
L
 
G
S
 
K
T
 
R
W
 
T
N
 
D
A
 
A
F
 
I
R
 
N
R
 
R
K
 
V
F
 
V
P
 
P
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
K
E
 
A
R
 
N
D
 
R
R
 
L
A
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
V
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
L
I
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
T
S
 
S
H
 
R
A
 
D
V
 
I
M
 
M
E
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
R
I
 
I
A
 
N
A
 
R
D
 
T
E
 
G
R
 
-
I
 
T
P
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
M
N
 
A
I
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
H
E
 
H
L
 
I
A
 
V
V
 
D
E
 
S
Y
 
M
A
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
V
I
 
V
G
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
L
G
 
G
E
 
R
L
 
L
V
 
V
F
 
R
D
 
D

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
33% identity, 81% coverage: 1:227/280 of query aligns to 3:220/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
M
 
I
L
 
I
T
 
E
A
 
M
Q
 
R
N
 
D
I
 
V
S
 
V
K
 
K
T
 
K
Y
|
Y
P
 
D
G
 
N
G
 
G
E
x
T
E
 
T
A
|
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
V
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
G
 
P
D
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
A
A
 
Y
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
E
 
R
C
 
S
I
 
L
N
 
Y
R
 
R
L
 
E
T
 
V
E
 
K
P
 
I
T
 
D
D
 
K
G
 
G
E
 
S
I
 
L
R
 
S
L
 
V
D
 
A
D
 
G
V
 
F
T
 
N
V
 
L
T
 
V
A
 
K
L
 
I
S
 
K
D
 
K
R
 
K
Q
 
D
L
 
V
R
 
P
R
 
L
T
 
L
R
 
R
R
 
R
D
 
S
I
 
V
A
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
Y
N
 
K
L
 
L
V
 
L
E
 
P
R
 
K
L
 
K
T
 
T
V
 
V
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
I
L
 
A
S
 
Y
G
 
A
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
M
S
 
E
T
 
V
W
 
I
N
 
G
A
 
E
F
 
N
R
 
R
R