SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_077276299.1 NCBI__GCF_001998885.1:WP_077276299.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 98% coverage: 1:254/259 of query aligns to 2:250/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
I
M
 
M
D
 
N
I
 
L
R
 
T
N
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
V
L
 
Q
K
 
A
F
 
F
A
 
L
E
 
G
L
 
Q
G
 
Q
A
 
A
V
 
N
V
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
D
E
 
E
Q
 
A
G
 
Q
L
 
G
D
 
E
D
 
A
I
 
M
V
 
V
K
 
R
E
 
K
I
 
-
Y
 
-
R
 
E
H
 
N
N
 
N
G
 
D
E
 
R
A
 
L
Y
 
H
Y
 
F
E
 
V
V
 
Q
V
x
T
D
 
D
V
x
I
M
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
A
L
 
C
M
 
Q
E
 
H
G
 
A
I
 
V
A
 
E
Q
 
S
L
 
A
A
 
V
N
 
H
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
I
C
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
N
 
E
G
 
-
T
 
I
W
 
V
A
 
A
P
 
P
I
 
I
E
 
H
T
 
E
L
 
M
K
 
E
I
 
L
E
 
S
D
 
D
W
 
W
H
 
N
R
 
K
T
 
V
I
 
L
D
 
Q
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
G
T
 
M
F
 
F
V
 
L
S
 
M
L
 
S
K
 
K
A
 
H
A
 
A
I
 
L
P
 
K
L
 
H
M
 
M
K
 
L
D
 
A
D
 
A
G
 
G
-
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
I
 
N
T
|
T
S
 
C
S
|
S
I
 
V
N
 
G
G
 
G
N
 
L
R
 
V
I
 
A
Y
 
W
N
 
P
N
 
D
F
 
I
G
 
-
A
 
-
S
 
P
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
V
 
L
S
 
Q
L
 
L
M
 
T
K
 
K
M
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
R
 
K
C
 
H
N
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
A
x
I
I
|
I
E
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
L
N
 
N
S
 
E
K
 
K
T
 
S
I
 
F
I
 
L
E
 
E
-
 
N
K
 
N
E
 
E
T
 
G
E
 
T
E
 
L
V
 
E
Q
 
E
I
 
I
K
 
K
V
 
K
E
 
E
F
 
K
P
 
A
E
 
K
G
 
V
D
 
N
R
 
P
P
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
-
D
 
-
T
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
D
Q
 
L
S
 
S
G
 
S
N
 
Y
V
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
S
E
 
A
V
 
I
Y
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
33% identity, 97% coverage: 6:257/259 of query aligns to 4:255/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
N
 
D
K
 
R
R
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
R
F
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
V
D
|
D
I
x
V
N
 
S
E
 
S
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
E
D
 
A
I
 
S
V
 
K
K
 
A
E
 
A
I
 
V
Y
 
L
R
 
E
-
 
T
-
 
A
H
 
P
N
 
D
G
 
A
E
 
E
A
 
V
Y
 
L
Y
 
T
E
 
T
V
 
V
V
x
A
D
|
D
V
|
V
M
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
Q
L
 
V
M
 
E
E
 
A
G
 
Y
I
 
V
A
 
T
Q
 
A
L
 
T
A
 
T
N
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
V
 
F
C
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
N
 
E
G
 
G
T
 
K
W
 
Q
A
 
N
P
 
P
I
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
F
K
 
T
I
 
A
E
 
A
D
 
E
W
 
F
H
 
D
R
 
K
T
 
V
I
 
V
D
 
S
T
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
S
 
G
T
 
V
F
 
F
V
 
L
S
 
G
L
 
L
K
 
E
A
 
K
A
 
V
I
 
L
P
 
K
L
 
I
M
 
M
K
 
R
D
 
E
D
 
Q
G
 
G
-
 
S
G
 
G
S
 
M
I
 
V
V
 
V
I
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
I
 
V
N
 
G
G
 
G
N
 
I
R
 
R
I
 
G
Y
 
I
N
 
G
N
 
N
F
 
-
G
 
-
A
x
Q
S
 
S
A
 
G
Y
|
Y
S
 
A
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
R
M
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
C
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
A
I
 
I
E
 
W
T
|
T
P
|
P
I
x
M
N
 
V
S
 
E
K
 
N
T
 
S
I
 
M
I
 
K
E
 
Q
K
 
L
E
 
D
T
 
P
E
 
E
E
 
N
V
 
P
Q
 
R
I
 
K
K
 
A
V
 
A
E
 
E
F
 
E
P
 
F
E
 
I
G
 
Q
D
 
V
R
 
N
P
 
P
L
 
S
K
 
K
A
 
-
D
 
R
T
 
Y
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
E
 
P
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
L
S
 
S
S
 
D
Q
 
D
S
 
A
G
 
S
N
 
Y
V
 
V
S
 
N
G
 
A
T
 
T
E
 
V
V
 
V
Y
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
S
 
S

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
33% identity, 97% coverage: 6:257/259 of query aligns to 13:264/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
N
 
D
K
 
R
R
 
V
V
 
V
V
x
L
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
T
|
T
A
|
A
L
x
V
K
x
R
F
x
L
A
|
A
E
x
A
L
x
E
G
|
G
A
|
A
V
x
K
V
x
L
G
x
S
L
|
L
I
 
V
D
 
D
I
 
V
N
 
S
E
 
S
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
E
D
 
A
I
 
S
V
 
K
K
 
A
E
 
A
I
 
V
Y
 
L
R
 
E
-
 
T
-
 
A
H
 
P
N
 
D
G
 
A
E
 
E
A
 
V
Y
 
L
Y
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
A
D
 
D
V
 
V
M
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
Q
L
 
V
M
 
E
E
 
A
G
 
Y
I
 
V
A
 
T
Q
 
A
L
 
T
A
 
T
N
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
V
 
F
C
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
x
E
G
 
G
T
 
K
W
 
Q
A
 
N
P
 
P
I
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
F
K
 
T
I
 
A
E
 
A
D
 
E
W
 
F
H
 
D
R
 
K
T
 
V
I
 
V
D
 
S
T
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
S
 
G
T
 
V
F
 
F
V
 
L
S
 
G
L
 
L
K
 
E
A
 
K
A
 
V
I
 
L
P
 
K
L
 
I
M
 
M
K
 
R
D
 
E
D
 
Q
G
 
G
-
 
S
G
 
G
S
 
M
I
 
V
V
 
V
I
 
N
T
 
T
S
 
A
S
 
S
I
 
V
N
 
G
G
 
G
N
 
I
R
 
R
I
 
G
Y
 
I
N
 
G
N
 
N
F
 
-
G
 
-
A
 
Q
S
 
S
A
 
G
Y
 
Y
S
 
A
T
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
R
M
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
C
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
W
T
 
T
P
 
P
I
 
M
N
 
V
S
 
E
K
 
N
T
 
S
I
 
M
I
 
K
E
 
Q
K
 
L
E
 
D
T
 
P
E
 
E
E
 
N
V
 
P
Q
 
R
I
 
K
K
 
A
V
 
A
E
 
E
F
 
E
P
 
F
E
 
I
G
 
Q
D
 
V
R
 
N
P
 
P
L
 
S
K
 
K
A
 
-
D
 
R
T
 
Y
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
E
 
P
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
L
S
 
S
S
 
D
Q
 
D
S
 
A
G
 
S
N
 
Y
V
 
V
S
 
N
G
 
A
T
 
T
E
 
V
V
 
V
Y
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
S
 
S

3toxA Crystal structure of a short chain dehydrogenase in complex with NAD(p) from sinorhizobium meliloti 1021
38% identity, 98% coverage: 4:258/259 of query aligns to 3:252/254 of 3toxA

query
sites
3toxA
I
 
L
R
 
E
N
 
G
K
 
K
R
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
R
L
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
T
D
x
A
I
x
R
N
|
N
E
 
G
Q
 
N
G
 
A
L
 
L
D
 
A
D
 
E
I
 
L
V
 
T
K
 
D
E
 
E
I
 
I
Y
 
A
R
 
G
H
 
G
N
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
Y
 
A
Y
 
A
E
 
L
V
 
A
V
 
G
D
 
D
V
|
V
M
 
G
D
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
-
L
 
L
M
 
H
E
 
E
G
 
A
I
 
L
A
 
V
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
-
 
V
N
 
R
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
T
L
 
A
V
 
F
C
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
A
N
 
L
G
 
G
T
 
A
W
 
M
A
 
G
P
 
E
I
 
I
E
 
S
T
 
S
L
 
L
K
 
S
I
 
V
E
 
E
D
 
G
W
 
W
H
 
R
R
 
E
T
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
A
F
 
F
V
 
L
S
 
A
L
 
A
K
 
K
A
 
Y
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
M
 
I
K
 
A
D
 
A
-
 
L
D
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
L
V
 
T
I
 
F
T
|
T
S
 
S
S
|
S
I
 
F
N
 
V
G
 
G
N
 
H
R
 
-
I
 
T
Y
 
A
N
 
G
N
 
F
F
 
A
G
 
G
A
x
V
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
S
 
G
L
 
L
M
 
V
K
 
Q
M
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
A
C
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
C
 
L
P
|
P
G
 
G
A
x
G
I
x
T
E
 
D
T
|
T
P
 
P
I
 
A
N
 
N
S
 
F
K
 
A
T
 
N
I
 
L
I
 
P
E
 
G
K
 
A
E
 
A
T
 
P
E
 
E
E
 
T
V
 
R
Q
 
G
I
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
F
 
F
P
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
L
R
 
H
P
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
-
D
 
R
T
 
I
G
 
A
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
E
V
 
A
I
 
A
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
D
Q
 
G
S
 
A
G
 
S
N
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
A
E
 
A
V
 
L
Y
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
E
 
A
S
 
S
L
 
V

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:258/259 of query aligns to 4:247/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
D
 
D
I
 
L
R
 
R
N
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
 
M
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
R
F
 
F
A
 
V
E
 
D
L
 
E
G
 
G
A
 
S
V
 
K
V
 
V
G
 
I
L
 
D
I
 
L
D
 
S
I
 
I
N
 
H
E
 
D
Q
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
-
Y
 
-
R
 
-
H
 
-
N
 
-
G
 
G
E
 
E
A
 
A
Y
 
K
Y
 
Y
E
 
D
V
 
H
V
 
I
-
 
E
-
 
C
D
 
D
V
 
V
M
 
T
D
 
N
E
 
P
E
 
D
R
 
Q
L
 
V
M
 
K
E
 
A
G
 
S
I
 
I
A
 
D
Q
 
H
L
 
I
A
 
F
N
 
K
Q
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
S
G
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
E
G
 
-
T
 
S
W
 
Y
A
 
G
P
 
K
I
 
I
E
 
E
T
 
S
L
 
M
K
 
S
I
 
M
E
 
G
D
 
E
W
 
W
H
 
R
R
 
R
T
 
I
I
 
I
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
F
S
 
G
T
 
Y
F
 
Y
V
 
Y
S
 
A
L
 
S
K
 
K
A
 
F
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
-
 
I
K
 
R
D
 
S
D
 
R
G
 
D
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
N
T
 
I
S
 
S
S
|
S
I
x
V
N
x
Q
G
 
A
N
 
S
R
 
I
I
 
I
Y
 
T
N
 
K
N
 
N
F
 
-
G
 
-
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
T
 
T
S
|
S
K
|
K
A
 
H
G
 
A
Q
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
M
 
S
A
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
R
 
P
C
 
L
N
 
-
I
 
L
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
A
A
x
T
I
 
I
E
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
L
N
 
V
S
 
R
K
 
K
T
 
A
I
 
A
-
 
E
I
 
L
E
 
E
K
 
V
E
 
G
T
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
M
Q
 
R
I
 
I
K
 
E
V
 
K
E
 
K
F
 
I
P
 
S
E
 
E
-
 
W
-
 
G
G
 
H
D
 
E
R
 
H
P
 
P
L
 
M
K
 
Q
A
 
-
D
 
R
T
 
I
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
Q
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
S
V
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
R
Q
 
E
S
 
A
G
 
S
N
 
F
V
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
T
E
 
C
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
G
E
 
L
S
 
S
L
 
I

2dteA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with nadh (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:258/259 of query aligns to 4:247/255 of 2dteA

query
sites
2dteA
D
 
D
I
 
L
R
 
R
N
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
M
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
R
F
 
F
A
 
V
E
 
D
L
 
E
G
 
G
A
 
S
V
 
K
V
 
V
G
 
I
L
 
D
I
 
L
D
x
S
I
|
I
N
 
H
E
 
D
Q
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
-
Y
 
-
R
 
-
H
 
-
N
 
-
G
 
G
E
 
E
A
 
A
Y
 
K
Y
 
Y
E
 
D
V
 
H
V
 
I
-
 
E
-
x
C
D
|
D
V
|
V
M
 
T
D
 
N
E
 
P
E
 
D
R
 
Q
L
 
V
M
 
K
E
 
A
G
 
S
I
 
I
A
 
D
Q
 
H
L
 
I
A
 
F
N
 
K
Q
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
S
G
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
N
 
E
G
 
-
T
 
S
W
 
Y
A
 
G
P
 
K
I
 
I
E
 
E
T
 
S
L
 
M
K
 
S
I
 
M
E
 
G
D
 
E
W
 
W
H
 
R
R
 
R
T
 
I
I
 
I
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
F
S
 
G
T
 
Y
F
 
Y
V
 
Y
S
 
A
L
 
S
K
 
K
A
 
F
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
-
 
I
K
 
R
D
 
S
D
 
R
G
 
D
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
N
T
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
Q
G
 
A
N
 
S
R
 
I
I
 
I
Y
 
T
N
 
K
N
 
N
F
 
-
G
 
-
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
T
 
T
S
|
S
K
|
K
A
 
H
G
 
A
Q
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
M
 
S
A
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
R
 
P
C
 
L
N
 
-
I
 
L
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
x
A
A
x
T
I
|
I
E
 
D
T
|
T
P
|
P
I
x
L
N
x
V
S
 
R
K
 
K
T
 
A
I
 
A
-
 
E
I
 
L
E
 
E
K
 
V
E
 
G
T
 
S
E
 
D
E
 
P
V
 
M
Q
 
R
I
 
I
K
 
E
V
 
K
E
 
K
F
 
I
P
 
S
E
 
E
-
 
W
-
 
G
G
 
H
D
 
E
R
 
H
P
 
P
L
 
M
K
 
Q
A
 
-
D
 
R
T
 
I
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
Q
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
S
V
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
R
Q
 
E
S
 
A
G
 
S
N
 
F
V
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
T
E
 
C
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
G
E
 
L
S
 
S
L
 
I

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
35% identity, 98% coverage: 1:254/259 of query aligns to 1:244/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
M
 
M
M
 
Y
D
 
R
I
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
N
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
K
K
 
R
F
 
F
A
 
V
E
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
L
 
I
I
 
V
D
 
G
I
x
R
N
x
R
E
 
R
Q
 
K
G
 
E
L
 
L
D
 
E
D
 
Q
I
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
E
I
 
I
Y
 
G
R
 
R
H
 
N
N
 
V
G
 
T
E
 
A
A
 
V
Y
 
K
Y
x
A
E
x
D
V
|
V
V
 
T
D
 
K
V
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
L
M
 
Y
E
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
A
Q
 
I
L
 
V
A
 
R
N
 
E
Q
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
F
C
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
A
N
 
I
G
 
-
T
 
E
W
 
Q
A
 
K
P
 
T
I
 
L
E
 
E
T
 
E
L
 
I
K
 
T
I
 
P
E
 
E
D
 
H
W
 
Y
H
 
D
R
 
R
T
 
T
I
 
F
D
 
D
T
x
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
S
 
G
T
 
L
F
 
I
V
 
F
S
 
T
L
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
L
K
 
R
D
 
-
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
I
I
 
L
T
 
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
A
G
 
G
N
 
-
R
 
-
I
 
V
Y
 
L
N
 
G
N
 
L
F
 
Q
G
 
A
A
x
H
S
 
D
A
 
T
Y
|
Y
S
 
S
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
V
V
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
A
K
 
R
M
 
T
A
 
W
A
 
T
L
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
K
R
 
G
C
 
R
N
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
S
P
 
P
G
|
G
A
 
A
I
|
I
E
 
D
T
|
T
P
 
P
I
|
I
N
 
I
S
 
E
K
 
N
T
 
Q
I
 
V
I
 
S
E
 
T
K
x
Q
E
 
E
T
 
-
E
 
E
E
 
A
V
 
D
Q
 
E
I
 
L
K
 
R
V
 
A
E
 
K
F
 
F
P
 
A
E
 
A
G
 
A
D
 
T
R
 
-
P
 
P
L
 
L
K
 
-
A
 
G
D
 
R
T
 
V
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
D
Q
 
D
S
 
S
G
 
S
N
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
T
 
I
E
 
E
V
 
L
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 98% coverage: 1:254/259 of query aligns to 2:240/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
M
 
S
D
 
R
I
 
L
R
 
Q
N
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
R
K
 
V
F
 
F
A
 
M
E
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
V
L
 
I
I
 
A
D
|
D
I
x
F
N
 
N
E
 
E
Q
 
A
G
 
A
L
 
G
D
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
K
E
 
E
I
 
A
Y
 
V
R
 
E
H
 
A
N
 
N
G
 
P
E
 
G
A
 
V
Y
 
V
Y
 
F
E
 
I
V
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
M
 
S
D
 
D
E
 
R
E
 
E
R
 
S
L
 
V
M
 
H
E
 
R
G
 
L
I
 
V
A
 
E
Q
 
N
L
 
V
A
 
A
N
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
C
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
G
 
R
T
x
D
W
 
-
A
 
S
P
 
M
I
 
L
E
 
S
T
x
K
L
 
M
K
 
T
I
 
V
E
 
D
D
 
Q
W
 
F
H
 
Q
R
 
Q
T
 
V
I
 
I
D
 
N
T
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
S
 
G
T
 
V
F
 
F
V
 
H
S
 
C
L
 
T
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
L
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
K
 
A
D
 
E
D
 
Q
G
 
G
-
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
I
 
N
T
|
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
T
G
 
G
N
 
T
R
 
-
I
 
-
Y
 
Y
N
 
G
N
|
N
F
x
V
G
 
G
A
x
Q
S
 
T
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
M
M
 
T
K
 
K
M
 
T
A
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
C
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
A
x
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
P
 
A
I
x
M
N
 
V
S
 
A
K
 
E
T
 
-
I
 
V
I
 
P
E
 
E
K
 
K
E
 
V
T
 
I
E
 
E
E
 
-
V
 
-
Q
x
K
I
 
M
K
 
K
V
 
A
E
 
Q
F
 
V
P
 
P
E
 
M
G
 
G
D
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
R
T
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
I
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
H
Q
 
E
S
 
S
G
 
D
N
 
Y
V
 
V
S
 
N
G
 
G
T
 
H
E
 
V
V
 
L
Y
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
35% identity, 97% coverage: 4:254/259 of query aligns to 2:255/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
I
 
L
R
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
x
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
M
A
 
A
L
 
T
K
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
D
V
 
V
G
 
V
L
 
I
I
 
N
D
 
G
I
x
F
N
 
G
E
 
Q
Q
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
E
K
 
R
E
 
E
I
 
R
Y
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
S
R
 
K
H
 
F
N
 
G
G
 
V
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
L
V
 
N
V
 
A
D
|
D
V
x
L
M
 
S
D
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
A
L
 
T
M
 
R
E
 
D
G
 
F
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
N
 
E
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
N
x
Q
G
 
H
T
 
T
W
 
-
A
 
A
P
 
P
I
 
I
E
 
E
T
 
E
L
 
F
K
 
P
I
 
V
E
 
D
D
 
K
W
 
W
H
 
N
R
 
A
T
 
I
I
 
I
D
 
A
T
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
T
 
V
F
 
F
V
 
H
S
 
G
L
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
Q
D
 
K
D
 
Q
G
 
G
-
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
I
 
N
T
x
I
S
 
A
S
|
S
I
 
A
N
x
H
G
 
G
N
 
-
R
 
-
I
 
L
Y
 
V
N
 
A
N
 
S
F
 
V
G
 
N
A
x
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
M
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
A
R
 
G
C
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
A
x
W
I
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
I
 
-
N
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
-
I
x
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
E
x
Q
T
 
I
E
 
E
E
 
A
V
x
I
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
K
K
 
G
V
 
I
E
 
D
F
 
I
P
 
E
E
 
A
G
 
A
D
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
E
T
 
K
G
 
Q
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
-
 
F
-
 
V
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
G
N
 
G
V
 
A
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
I
 
S
S
 
S
S
 
A
Q
 
A
S
 
A
G
 
D
N
 
Q
V
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
T
E
 
T
V
 
L
Y
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
35% identity, 97% coverage: 4:254/259 of query aligns to 2:255/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
I
 
L
R
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
M
A
 
A
L
 
T
K
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
D
V
 
V
G
 
V
L
 
I
I
 
N
D
 
G
I
x
F
N
 
G
E
 
Q
Q
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
E
K
 
R
E
 
E
I
 
R
Y
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
S
R
 
K
H
 
F
N
 
G
G
 
V
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
L
V
 
N
V
x
A
D
|
D
V
x
L
M
 
S
D
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
A
L
 
T
M
 
R
E
 
D
G
 
F
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
N
 
E
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
N
x
Q
G
 
H
T
 
T
W
 
-
A
 
A
P
 
P
I
 
I
E
 
E
T
 
E
L
 
F
K
 
P
I
 
V
E
 
D
D
 
K
W
 
W
H
 
N
R
 
A
T
 
I
I
 
I
D
 
A
T
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
T
 
V
F
 
F
V
 
H
S
 
G
L
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
Q
D
 
K
D
 
Q
G
 
G
-
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
I
 
N
T
 
I
S
 
A
S
|
S
I
 
A
N
x
H
G
 
G
N
 
-
R
 
-
I
 
L
Y
 
V
N
 
A
N
 
S
F
 
V
G
 
N
A
x
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
M
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
A
R
 
G
C
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
A
x
W
I
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
I
 
-
N
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
-
I
x
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
E
x
Q
T
 
I
E
 
E
E
 
A
V
x
I
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
K
K
 
G
V
 
I
E
 
D
F
 
I
P
 
E
E
 
A
G
 
A
D
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
E
T
 
K
G
 
Q
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
-
 
F
-
 
V
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
G
N
 
G
V
 
A
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
I
 
S
S
 
S
S
 
A
Q
 
A
S
 
A
G
 
D
N
 
Q
V
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
T
E
 
T
V
 
L
Y
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
35% identity, 97% coverage: 4:254/259 of query aligns to 2:255/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
I
 
L
R
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
x
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
M
A
 
A
L
 
T
K
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
D
V
 
V
G
 
V
L
 
I
I
 
N
D
 
G
I
x
F
N
 
G
E
 
Q
Q
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
E
K
 
R
E
 
E
I
 
R
Y
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
S
R
 
K
H
 
F
N
 
G
G
 
V
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
L
V
 
N
V
 
A
D
|
D
V
x
L
M
 
S
D
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
A
L
 
T
M
 
R
E
 
D
G
 
F
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
N
 
E
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
N
x
Q
G
 
H
T
 
T
W
 
-
A
 
A
P
 
P
I
 
I
E
 
E
T
 
E
L
 
F
K
 
P
I
 
V
E
 
D
D
 
K
W
 
W
H
 
N
R
 
A
T
 
I
I
 
I
D
 
A
T
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
T
 
V
F
 
F
V
 
H
S
 
G
L
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
Q
D
 
K
D
 
Q
G
 
G
-
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
I
 
N
T
 
I
S
 
A
S
|
S
I
 
A
N
x
H
G
 
G
N
 
-
R
 
-
I
 
L
Y
 
V
N
 
A
N
 
S
F
 
V
G
 
N
A
x
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
M
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
A
R
 
G
C
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
A
x
W
I
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
I
 
-
N
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
-
I
x
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
E
x
Q
T
 
I
E
 
E
E
 
A
V
x
I
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
K
K
 
G
V
 
I
E
 
D
F
 
I
P
 
E
E
 
A
G
 
A
D
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
E
T
 
K
G
 
Q
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
-
 
F
-
 
V
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
G
N
 
G
V
 
A
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
I
 
S
S
 
S
S
 
A
Q
 
A
S
 
A
G
 
D
N
 
Q
V
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
T
E
 
T
V
 
L
Y
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
35% identity, 97% coverage: 4:254/259 of query aligns to 2:255/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
I
 
L
R
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
M
A
 
A
L
 
T
K
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
D
V
 
V
G
 
V
L
 
I
I
 
N
D
 
G
I
x
F
N
 
G
E
 
Q
Q
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
E
K
 
R
E
 
E
I
 
R
Y
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
S
R
 
K
H
 
F
N
 
G
G
 
V
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
L
V
 
N
V
 
A
D
|
D
V
x
L
M
 
S
D
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
A
L
 
T
M
 
R
E
 
D
G
 
F
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
N
 
E
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
N
x
Q
G
 
H
T
 
T
W
 
-
A
 
A
P
 
P
I
 
I
E
 
E
T
 
E
L
 
F
K
 
P
I
 
V
E
 
D
D
 
K
W
 
W
H
 
N
R
 
A
T
 
I
I
 
I
D
 
A
T
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
T
 
V
F
 
F
V
 
H
S
 
G
L
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
Q
D
 
K
D
 
Q
G
 
G
-
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
I
 
N
T
x
I
S
 
A
S
|
S
I
 
A
N
x
H
G
 
G
N
 
-
R
 
-
I
 
L
Y
 
V
N
 
A
N
 
S
F
 
V
G
 
N
A
x
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
M
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
A
R
 
G
C
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
A
x
W
I
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
I
 
-
N
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
-
I
x
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
E
x
Q
T
 
I
E
 
E
E
 
A
V
x
I
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
K
K
 
G
V
 
I
E
 
D
F
 
I
P
 
E
E
 
A
G
 
A
D
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
E
T
 
K
G
 
Q
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
-
 
F
-
 
V
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
G
N
 
G
V
 
A
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
I
 
S
S
 
S
S
 
A
Q
 
A
S
 
A
G
 
D
N
 
Q
V
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
T
E
 
T
V
 
L
Y
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
35% identity, 98% coverage: 1:254/259 of query aligns to 1:244/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
M
 
M
M
 
Y
D
 
R
I
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
K
K
 
R
F
 
F
A
 
V
E
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
V
G
 
F
L
 
I
I
 
V
D
 
G
I
x
R
N
x
R
E
 
R
Q
 
K
G
 
E
L
 
L
D
 
E
D
 
Q
I
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
E
I
 
I
Y
 
G
R
 
R
H
 
N
N
 
V
G
 
T
E
 
A
A
 
V
Y
 
K
Y
 
A
E
x
D
V
|
V
V
 
T
D
 
K
V
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
L
M
 
Y
E
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
A
Q
 
I
L
 
V
A
 
R
N
 
E
Q
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
F
C
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
A
N
 
V
G
 
-
T
 
E
W
 
Q
A
 
K
P
 
T
I
 
L
E
 
E
T
 
E
L
 
I
K
 
T
I
 
P
E
 
E
D
 
H
W
 
Y
H
 
D
R
 
R
T
 
T
I
 
F
D
 
D
T
x
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
S
 
G
T
 
L
F
 
I
V
 
F
S
 
T
L
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
L
K
 
R
D
 
-
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
I
I
 
L
T
|
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
A
G
 
G
N
 
-
R
 
-
I
 
V
Y
 
L
N
 
G
N
 
L
F
 
Q
G
 
A
A
x
H
S
 
D
A
 
T
Y
|
Y
S
 
S
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
V
V
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
A
K
 
R
M
 
T
A
 
W
A
 
T
L
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
K
R
 
G
C
 
R
N
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
S
P
|
P
G
|
G
A
|
A
I
|
I
E
 
D
T
|
T
P
 
P
-
x
S
I
x
L
N
 
E
S
 
N
K
 
N
T
 
V
I
 
S
I
 
T
E
 
Q
K
 
E
E
 
E
T
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
I
 
A
K
 
K
V
 
A
E
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
A
G
 
A
D
 
A
R
 
T
P
 
P
L
 
L
K
 
-
A
 
G
D
 
R
T
 
V
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
D
Q
 
D
S
 
S
G
 
S
N
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
T
 
I
E
 
E
V
 
L
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
35% identity, 96% coverage: 7:254/259 of query aligns to 6:234/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
K
 
K
R
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
Q
K
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
R
L
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
G
 
A
L
 
L
I
 
C
D
|
D
I
x
L
N
x
R
E
 
P
Q
 
E
G
 
G
L
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
K
E
 
E
I
 
V
Y
 
A
R
 
E
H
 
A
N
 
I
G
 
G
E
 
G
A
 
A
Y
 
F
Y
 
F
E
 
Q
V
|
V
V
 
-
D
|
D
V
x
L
M
 
E
D
 
D
E
 
E
E
 
R
R
 
E
L
 
R
M
 
V
E
 
R
G
 
F
I
 
V
A
 
E
Q
 
E
L
 
A
A
 
A
N
 
Y
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
N
 
A
G
 
A
T
 
P
W
 
G
A
 
S
P
 
A
I
 
L
E
 
-
T
 
T
L
 
V
K
 
R
I
 
L
E
 
P
D
 
E
W
 
W
H
 
R
R
 
R
T
 
V
I
 
L
D
 
E
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
A
T
 
P
F
 
M
-
 
H
V
 
L
S
 
S
L
 
A
K
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
R
P
 
E
L
 
M
M
 
R
K
 
K
D
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
N
T
x
V
S
 
A
S
|
S
I
 
V
N
 
Q
G
 
G
N
 
-
R
 
-
I
 
L
Y
 
F
N
 
A
N
 
E
F
 
Q
G
 
E
A
x
N
S
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
Q
 
L
V
 
V
S
 
N
L
 
L
M
 
T
K
 
R
M
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
C
 
L
N
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
A
I
|
I
E
 
A
T
|
T
P
 
E
I
x
A
N
x
V
S
 
L
K
 
E
T
 
A
I
 
I
I
 
A
E
 
R
K
 
R
E
 
D
T
 
W
E
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
H
I
 
A
K
 
L
V
 
R
E
 
R
F
 
L
P
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
E
V
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
E
Q
 
K
S
 
A
G
 
S
N
 
F
V
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
A
E
 
I
V
 
L
Y
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
34% identity, 97% coverage: 3:254/259 of query aligns to 10:254/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
D
 
D
I
 
L
R
 
K
N
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
M
A
 
A
L
 
V
K
 
R
F
 
F
A
 
G
-
 
Q
-
 
E
E
 
E
L
 
A
G
 
K
A
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
N
L
 
Y
I
x
Y
D
 
N
I
 
N
N
 
E
E
 
E
Q
 
E
G
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
-
I
 
A
V
 
K
K
 
K
E
 
E
I
 
V
Y
 
E
R
 
E
H
 
A
N
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
Y
 
I
Y
 
I
E
 
V
V
 
Q
V
 
G
D
|
D
V
|
V
M
 
T
D
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
D
L
 
V
M
 
V
E
 
N
G
 
L
I
 
V
A
 
Q
Q
 
T
L
 
A
A
 
I
N
 
K
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
M
V
 
I
C
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
N
x
E
G
 
N
T
 
P
W
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
S
E
 
H
T
 
E
L
 
L
K
 
S
I
 
L
E
 
D
D
 
N
W
 
W
H
 
N
R
 
K
T
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
G
T
 
A
F
 
F
V
 
L
S
 
G
L
 
S
K
 
R
A
 
E
A
 
A
I
 
I
P
 
K
L
 
Y
M
 
F
-
 
V
-
 
E
K
 
N
D
 
D
D
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
V
 
I
I
 
N
T
x
M
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
x
H
G
 
E
N
 
M
R
 
I
I
 
P
Y
x
W
N
 
P
N
 
L
F
 
F
G
 
-
A
 
-
S
 
V
A
 
H
Y
|
Y
S
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
Q
 
M
V
 
K
S
 
L
L
 
M
M
 
T
K
 
E
M
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
R
 
P
C
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
C
 
G
P
|
P
G
|
G
A
 
A
I
x
M
E
 
N
T
|
T
P
|
P
I
|
I
N
|
N
S
 
A
K
 
E
T
x
K
I
 
F
I
 
A
E
 
D
K
 
P
E
 
-
T
 
V
E
 
Q
E
 
R
V
 
A
Q
 
D
I
 
V
K
 
E
V
 
S
E
 
M
F
 
I
P
 
P
E
 
M
G
 
G
D
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
Y
T
 
I
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
A
V
 
V
I
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
S
 
A
G
 
S
N
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
I
E
 
T
V
 
L
Y
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G

6zzpA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
35% identity, 79% coverage: 3:206/259 of query aligns to 7:209/265 of 6zzpA

query
sites
6zzpA
D
 
D
I
 
L
R
 
T
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
T
F
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
N
E
 
L
Q
 
E
G
 
A
L
 
A
D
 
Q
D
 
K
I
 
T
V
 
V
K
 
D
E
 
A
I
 
I
Y
 
E
R
 
A
H
 
A
N
 
G
G
 
G
E
 
R
A
 
A
Y
 
L
Y
 
A
E
 
I
V
 
A
V
x
M
D
|
D
V
|
V
M
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
A
R
 
A
L
 
V
M
 
N
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
V
N
 
D
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
N
x
Q
G
 
-
T
 
I
W
 
I
A
 
D
P
 
P
I
 
I
E
 
H
T
 
K
L
 
M
K
 
A
I
 
F
E
 
E
D
 
D
W
 
W
H
 
K
R
 
K
T
 
M
I
 
L
D
 
A
T
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
D
S
 
G
T
 
A
F
 
F
V
 
L
S
 
T
L
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
Q
L
 
H
M
 
M
-
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
D
-
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
T
I
 
V
V
 
I
I
 
Y
T
x
M
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
x
H
G
 
S
N
 
H
R
 
E
I
 
-
Y
 
-
N
 
A
N
 
S
F
 
L
G
 
F
A
x
K
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
V
T
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
L
S
 
G
L
 
L
M
 
C
K
 
R
M
 
V
A
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
V
C
 
H
N
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
S
N
 
H
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
A
x
F
I
x
V
E
 
K
T
|
T
P
 
P
I
x
L
N
x
V
S
 
E
K
 
K
T
x
Q
I
 
I
I
 
P
E
 
Q
K
 
Q
E
 
A
T
 
A
E
 
E
E
 
K

6zzoC Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
35% identity, 79% coverage: 3:206/259 of query aligns to 7:209/265 of 6zzoC

query
sites
6zzoC
D
 
D
I
 
L
R
 
T
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
T
F
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
N
E
 
L
Q
 
E
G
 
A
L
 
A
D
 
Q
D
 
K
I
 
T
V
 
V
K
 
D
E
 
A
I
 
I
Y
 
E
R
 
A
H
 
A
N
 
G
G
 
G
E
 
R
A
 
A
Y
 
L
Y
 
A
E
 
I
V
 
A
V
x
M
D
|
D
V
|
V
M
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
A
R
 
A
L
 
V
M
 
N
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
V
N
 
D
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
N
x
Q
G
 
-
T
 
I
W
 
I
A
 
D
P
 
P
I
 
I
E
 
H
T
 
K
L
 
M
K
 
A
I
 
F
E
 
E
D
 
D
W
 
W
H
 
K
R
 
K
T
 
M
I
 
L
D
 
A
T
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
D
S
 
G
T
 
A
F
 
F
V
 
L
S
 
T
L
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
Q
L
 
H
M
 
M
-
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
D
-
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
T
I
 
V
V
 
I
I
 
Y
T
x
M
S
 
G
S
 
S
I
 
V
N
x
H
G
 
S
N
 
H
R
 
E
I
 
-
Y
 
-
N
 
A
N
 
S
F
 
L
G
 
F
A
x
K
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
V
T
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
L
S
 
G
L
 
L
M
 
C
K
 
R
M
 
V
A
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
V
C
 
H
N
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
S
N
 
H
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
A
x
F
I
x
V
E
 
K
T
|
T
P
 
P
I
x
L
N
x
V
S
 
E
K
 
K
T
x
Q
I
 
I
I
 
P
E
 
Q
K
 
Q
E
 
A
T
 
A
E
 
E
E
 
K

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
33% identity, 99% coverage: 4:259/259 of query aligns to 5:254/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
I
 
L
R
 
K
N
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
L
L
 
N
G
 
D
A
 
S
V
 
I
V
 
V
G
 
V
L
 
A
I
 
V
D
x
E
I
x
L
N
 
L
E
 
E
Q
 
D
G
x
R
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
E
 
E
I
 
L
Y
 
R
R
 
G
H
 
M
N
 
G
G
 
K
E
 
E
A
 
V
Y
 
L
Y
 
G
E
 
V
V
 
K
V
x
A
D
|
D
V
|
V
M
 
S
D
 
K
E
 
K
E
 
K
R
 
D
L
 
V
M
 
E
E
 
E
G
 
F
I
 
V
A
 
R
Q
 
R
L
 
T
A
 
F
N
 
E
Q
 
T
L
 
Y
G
 
S
G
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
C
C
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
N
 
M
G
 
D
T
 
G
W
 
V
A
 
T
P
 
P
I
 
V
E
 
A
T
 
E
L
 
V
K
 
S
I
 
D
E
 
E
D
 
L
W
 
W
H
 
E
R
 
R
T
 
V
I
 
L
D
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
Y
S
 
S
T
 
A
F
 
F
V
 
Y
S
 
S
L
 
S
K
 
R
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
L
D
 
K
D
 
Q
G
 
G
-
 
K
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
I
 
I
N
 
A
G
 
G
N
 
I
R
 
R
I
 
-
Y
 
-
N
 
G
N
 
G
F
 
F
G
 
A
A
 
G
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
T
 
V
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
S
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
R
M
 
S
A
 
I
A
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
Y
A
 
G
R
 
D
C
 
Q
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
A
N
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
 
G
A
 
T
I
x
V
E
 
K
T
|
T
P
x
N
I
|
I
N
 
G
S
 
L
K
 
G
T
 
S
I
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
S
E
 
K
E
 
P
V
x
S
Q
 
E
I
 
L
K
 
G
V
 
M
E
 
R
F
 
T
P
 
L
E
 
T
G
 
K
D
 
L
R
 
M
P
 
S
L
 
L
K
 
S
A
 
S
D
 
R
T
 
L
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
S
S
 
D
Q
 
E
S
 
A
G
 
S
N
 
F
V
 
V
S
 
N
G
 
G
T
 
D
E
 
A
V
 
V
Y
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
G
E
 
L
S
 
T
L
 
V
L
 
L

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
34% identity, 98% coverage: 2:254/259 of query aligns to 3:240/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
M
 
F
D
 
E
I
 
F
R
 
E
N
 
N
K
 
R
R
 
T
V
 
L
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
x
N
S
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
N
V
 
L
G
 
V
L
 
L
I
 
T
D
|
D
I
x
L
N
 
D
E
 
R
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
A
I
 
F
V
 
A
K
 
A
E
 
S
I
 
L
Y
 
G
R
 
S
H
 
P
N
 
E
G
 
R
E
 
I
A
 
A
Y
 
T
Y
 
I
E
 
K
V
 
-
V
 
A
D
|
D
V
x
A
M
 
S
D
 
S
E
 
A
E
 
D
R
 
D
L
 
A
M
 
E
E
 
K
G
 
T
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
L
 
A
A
 
M
N
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
F
L
 
L
V
 
V
C
 
P
N
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
Y
G
 
Q
T
 
A
W
 
-
A
 
K
P
 
P
I
 
F
E
 
A
T
 
E
L
 
M
K
 
S
I
 
D
E
 
A
D
 
D
W
 
W
H
 
H
R
 
R
T
 
T
I
 
I
D
 
S
T
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
S
 
G
T
 
V
F
 
F
V
 
Y
S
 
L
L
 
C
K
 
K
A
 
R
A
 
A
I
 
L
P
 
P
L
 
A
M
 
L
K
 
K
D
 
E
D
 
D
G
 
-
G
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
T
T
 
L
S
 
A
S
|
S
I
 
L
N
 
A
G
 
A
N
 
Y
R
 
R
-
 
G
I
 
A
Y
 
Y
N
 
V
N
|
N
F
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
H
Y
|
Y
S
 
G
T
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
Q
 
M
V
 
V
S
 
S
L
 
M
M
 
T
K
 
R
M
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
-
C
 
P
N
 
K
I
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
C
 
S
P
|
P
G
 
G
A
 
I
I
|
I
E
 
E
T
|
T
P
 
P
I
x
M
N
 
T
S
 
S
K
 
E
T
 
-
I
 
L
I
 
L
E
 
K
K
 
T
E
 
R
T
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
T
Q
 
M
I
 
T
K
 
Q
V
 
T
E
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
L
 
L
K
 
K
A
 
-
D
 
R
T
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
S
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
C
S
 
S
S
 
P
Q
 
A
S
 
A
G
 
S
N
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
E
E
 
T
V
 
I
Y
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
33% identity, 100% coverage: 2:259/259 of query aligns to 1:246/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
D
 
G
I
 
I
R
 
Q
N
 
N
K
 
R
R
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
V
L
 
I
I
 
N
D
|
D
I
 
I
N
 
D
E
 
A
Q
 
E
G
 
K
L
 
V
D
 
R
D
 
A
I
 
T
V
 
V
K
 
D
E
 
E
I
 
F
Y
 
S
R
 
A
H
 
R
N
 
G
G
 
H
E
 
R
A
 
V
Y
 
L
Y
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
A
D
|
D
V
x
I
M
 
G
D
 
N
E
 
K
E
 
A
R
 
A
L
 
V
M
 
D
E
 
G
G
 
M
I
 
V
A
 
K
Q
 
Q
L
 
T
A
 
I
N
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
N
 
E
G
 
R
T
 
A
W
 
G
A
 
A
P
 
-
I
 
L
E
 
R
T
 
K
L
 
L
K
 
S
I
 
E
E
 
A
D
 
D
W
 
W
H
 
D
R
 
V
T
 
T
I
 
I
D
 
N
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
S
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
L
S
 
C
L
 
T
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
H
P
 
G
L
 
H
M
 
M
-
 
V
K
 
E
D
 
N
D
 
K
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
-
T
 
-
S
 
-
S
 
N
I
 
I
N
 
A
G
 
S
N
 
R
R
 
A
I
 
W
Y
 
L
N
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
A
 
Q
S
 
T
A
 
P
Y
|
Y
S
 
S
T
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
M
M
 
T
K
 
R
M
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
C
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
T
P
 
P
I
 
M
N
 
W
S
 
D
K
 
-
T
 
-
I
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
I
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
E
F
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
K
D
 
D
-
 
Q
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
S
R
 
R
P
 
Q
L
 
P
K
 
T
A
 
G
D
 
K
T
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
T
I
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
I
 
A
S
 
D
S
 
D
Q
 
D
S
 
S
G
 
G
N
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
E
 
V
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
A
 
G
E
 
R
S
 
S
L
 
L
L
 
F

Query Sequence

>WP_077276299.1 NCBI__GCF_001998885.1:WP_077276299.1
MMDIRNKRVVITGAGSGIGRATALKFAELGAVVGLIDINEQGLDDIVKEIYRHNGEAYYE
VVDVMDEERLMEGIAQLANQLGGLDGLVCNAGINGTWAPIETLKIEDWHRTIDTNLTSTF
VSLKAAIPLMKDDGGSIVITSSINGNRIYNNFGASAYSTSKAGQVSLMKMAALELARCNI
RVNAVCPGAIETPINSKTIIEKETEEVQIKVEFPEGDRPLKADTGQPEQVANVIAFLISS
QSGNVSGTEVYVDGAESLL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory