SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_077277352.1 NCBI__GCF_002000365.1:WP_077277352.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 3:280/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
|
G
K
x
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
 
Y
G
x
D
R
x
P
E
x
I
G
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
A
 
P
L
 
L
N
x
L
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 2:279/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
x
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
x
I
G
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
A
x
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 4:281/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
|
C
V
 
C
R
 
R
T
x
K
L
x
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
x
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
|
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
|
G
Y
 
L
G
 
G
K
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
x
I
G
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
A
x
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
S
x
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
|
G

Sites not aligning to the query:

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 3:280/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
x
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
 
I
G
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
A
x
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 3:280/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
x
L
G
|
G
Y
x
L
G
|
G
K
x
R
I
|
I
G
|
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
 
Y
G
x
D
R
 
P
E
 
I
G
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
A
x
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 3:280/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
|
G
K
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
x
I
G
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
A
x
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 2:279/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
x
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
|
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
x
I
G
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
A
x
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
S
x
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
|
G

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 4:281/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
 
I
G
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
x
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
A
x
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
34% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 8:285/533 of O43175

query
sites
O43175
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
x
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
x
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
 
Y
G
x
D
R
 
P
E
 
I
G
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
P
S
 
-
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
A
 
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
S
x
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
|
D
V
|
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
|
L
G
|
G

Sites not aligning to the query:

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
34% identity, 88% coverage: 3:283/319 of query aligns to 1:277/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
V
N
 
E
D
 
K
T
 
Q
V
 
N
R
 
L
D
 
S
V
 
K
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
|
G
K
 
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
x
I
G
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
A
 
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
33% identity, 88% coverage: 38:319/319 of query aligns to 37:327/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
E
R
 
K
F
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
-
 
T
L
x
M
I
x
L
R
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
-
P
 
-
I
 
I
T
 
D
D
 
Q
E
 
E
L
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
R
L
 
I
I
 
V
S
 
A
Q
 
N
T
x
Y
G
x
A
K
x
V
G
|
G
I
 
Y
A
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
E
A
 
E
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
Y
V
 
V
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
T
G
 
N
A
 
T
P
 
P
-
 
D
-
 
V
-
x
L
-
 
T
F
 
N
A
 
A
A
x
T
A
 
A
E
 
D
L
 
H
T
 
A
W
 
F
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
T
M
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
V
P
 
V
A
 
K
E
 
G
V
 
D
A
 
K
A
 
F
M
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
Q
 
K
T
 
R
R
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
G
 
E
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
V
G
 
G
Y
x
F
G
|
G
K
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
Q
L
 
A
V
 
I
A
 
A
H
 
R
Y
 
R
G
 
A
R
 
K
A
 
G
F
 
F
A
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
Y
W
 
Y
G
x
S
R
|
R
E
 
T
G
 
R
S
 
K
L
 
S
E
 
Q
R
 
A
A
 
E
A
 
K
M
 
E
V
 
L
G
 
G
F
 
A
D
 
E
T
 
Y
A
 
-
K
 
R
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
V
F
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
L
x
V
A
x
P
L
 
L
N
 
T
E
 
K
G
 
E
T
|
T
R
 
M
G
 
Y
I
 
M
V
 
I
T
 
N
A
 
E
D
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
I
S
x
A
R
|
R
A
 
G
E
 
K
L
 
V
I
 
V
A
 
D
E
 
T
G
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
W
P
 
I
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
V
 
Y
R
 
Y
D
 
N
H
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
H
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
V
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
F
 
S
V
 
A
E
 
T
R
 
F
D
 
E
G
 
A
Y
 
R
E
 
E
L
 
A
Y
 
M
F
 
A
G
 
E
A
 
L
A
 
V
F
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
K
D
 
R
G
 
G
S
 
E
-
 
I
P
 
P
R
 
P
N
 
T
L
 
L
A
 
V
N
 
N
P
 
K
E
 
E
T
 
V
V
 
I
S
 
K

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
33% identity, 88% coverage: 2:283/319 of query aligns to 2:271/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
K
 
K
I
 
V
V
 
L
I
 
I
P
 
S
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
Q
 
D
D
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
T
 
K
L
 
I
A
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
V
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
V
R
 
E
D
 
K
V
 
Q
E
 
N
T
 
L
L
 
L
A
 
I
E
 
A
R
 
E
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
A
P
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
G
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
M
-
 
N
V
 
T
G
 
P
T
 
N
G
 
G
A
 
N
P
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
M
A
 
C
A
 
L
M
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
E
T
 
R
R
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
x
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
T
Y
 
R
G
 
M
R
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
V
 
G
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
 
I
G
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
S
V
 
F
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
T
 
Q
A
 
L
K
 
-
S
 
P
Q
x
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
A
x
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
G
x
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
V
 
L
T
 
N
A
 
D
D
 
N
H
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
L
 
I
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
C
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
P
R
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
H
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
33% identity, 88% coverage: 38:319/319 of query aligns to 36:326/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
E
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
L
E
 
E
R
 
K
F
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
-
 
T
L
 
M
I
 
L
R
 
S
E
 
E
R
 
K
T
 
-
P
 
-
I
 
I
T
 
D
D
 
R
E
 
E
L
 
V
L
 
F
E
 
D
R
 
A
L
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
R
L
 
I
I
 
V
S
 
A
Q
 
N
T
 
Y
G
 
A
K
x
V
G
 
G
I
 
Y
A
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
E
 
E
A
 
E
C
 
A
T
 
T
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
Y
V
 
V
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
T
G
 
N
A
 
T
P
 
P
F
 
D
A
 
V
A
x
L
A
 
T
E
 
D
L
 
A
T
|
T
W
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
A
I
 
W
A
 
A
A
 
L
M
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
V
P
 
V
A
 
K
E
 
G
V
 
D
A
 
K
A
 
F
M
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
Q
 
K
T
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
F
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
G
 
D
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
V
G
|
G
Y
x
F
G
|
G
K
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
Q
L
 
A
V
 
I
A
 
A
H
 
K
Y
 
R
G
 
A
R
 
K
A
 
G
F
 
F
A
 
G
M
 
M
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
Y
W
 
T
G
x
A
R
|
R
E
x
S
G
 
R
S
x
K
L
 
P
E
 
E
R
 
A
A
 
E
A
 
K
M
 
E
V
 
L
G
 
G
F
 
A
D
 
E
T
 
F
A
 
-
K
 
K
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
R
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
S
 
V
L
 
L
H
 
A
L
x
V
A
x
P
L
 
L
N
 
T
E
 
K
G
x
E
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
I
 
M
V
 
I
T
 
N
A
 
E
D
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
V
S
x
A
R
|
R
A
 
G
E
 
K
L
 
V
I
 
V
A
 
D
E
 
T
G
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
W
P
 
I
G
 
A
M
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
V
 
Y
R
 
Y
D
 
D
H
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
H
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
V
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
F
 
S
V
 
A
E
 
T
R
 
F
D
 
G
G
 
A
Y
 
R
E
 
E
L
 
G
Y
 
M
F
 
A
G
 
E
A
 
L
A
 
V
F
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
L
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
E
-
 
V
P
 
P
R
 
P
N
 
T
L
 
L
A
 
V
N
 
N
P
 
R
E
 
E
T
 
V
V
 
L
S
 
K

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
36% identity, 82% coverage: 22:283/319 of query aligns to 17:280/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
L
 
L
A
 
K
D
 
D
H
 
A
E
 
G
V
 
L
T
 
E
V
 
V
Y
 
I
N
 
Y
D
 
E
T
 
E
V
 
Y
R
 
P
D
 
D
V
 
E
E
 
D
T
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
L
F
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
I
L
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
K
T
 
P
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
R
E
 
R
L
 
V
L
 
I
E
 
E
R
 
S
L
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
V
I
 
I
S
 
A
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
A
T
 
K
R
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
E
V
 
V
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
V
G
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
A
A
 
A
A
x
S
-
 
S
-
 
R
-
 
S
-
x
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
M
I
 
F
A
 
S
A
 
V
M
 
A
R
 
R
H
 
K
I
 
I
P
 
A
A
 
F
E
 
A
V
 
D
A
 
R
A
 
K
M
 
M
K
 
R
A
 
E
G
 
G
K
 
V
W
 
W
Q
 
A
T
 
K
R
 
K
-
 
E
-
 
A
L
 
M
G
 
G
T
 
I
G
 
E
L
 
L
R
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
|
G
Y
x
F
G
|
G
K
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
Y
L
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
K
Y
 
I
G
 
A
R
 
N
A
 
A
F
 
L
A
 
G
M
 
M
R
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
L
W
x
Y
G
x
D
R
x
P
E
 
Y
G
 
P
S
 
N
L
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
K
M
 
E
V
 
V
G
 
N
F
 
G
D
 
K
T
 
F
A
 
V
K
 
-
S
 
D
Q
 
L
E
 
E
D
 
T
L
 
L
F
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
L
x
V
A
x
P
L
 
L
N
 
V
E
 
E
G
 
S
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
I
 
L
V
 
I
T
 
N
A
 
E
D
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
|
T
S
|
S
R
|
R
A
 
G
E
 
P
L
 
V
I
 
V
A
 
D
E
 
T
G
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
W
P
 
I
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
V
 
L
-
 
P
R
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
T
H
 
K
L
 
F
D
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
V
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G

2eklA Structure of st1218 protein from sulfolobus tokodaii
32% identity, 79% coverage: 50:302/319 of query aligns to 48:303/312 of 2eklA

query
sites
2eklA
L
 
I
V
 
I
L
 
V
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
R
T
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
T
D
 
K
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
E
R
 
K
L
 
G
P
 
K
R
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
I
I
 
I
S
 
A
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
x
I
G
 
G
I
 
L
A
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
T
E
 
E
A
 
E
C
 
A
T
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
N
V
 
I
A
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
Y
G
 
A
T
 
P
G
 
G
A
 
A
P
x
S
F
 
T
-
 
D
A
 
S
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
M
I
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
A
R
 
R
H
 
K
I
 
M
P
 
Y
A
 
T
E
 
S
V
 
M
A
 
A
A
 
L
M
 
A
K
 
K
A
 
S
G
 
G
K
 
I
W
 
F
Q
 
K
T
 
K
R
 
I
L
 
E
G
 
G
T
 
L
G
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
V
G
|
G
Y
 
F
G
|
G
K
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
T
L
 
K
V
 
V
A
 
G
H
 
I
Y
 
I
G
 
A
R
 
N
A
 
A
F
 
M
A
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
A
W
x
Y
G
x
D
R
x
I
E
x
L
G
 
D
S
 
I
L
 
R
E
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
E
M
 
K
V
 
I
G
 
N
F
 
A
D
 
K
T
 
-
A
 
A
K
 
V
S
 
S
Q
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
K
R
 
N
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
L
H
|
H
L
x
V
A
x
T
L
 
V
N
 
S
E
 
K
G
 
D
T
 
A
R
 
K
G
 
P
I
|
I
V
 
I
T
 
D
A
 
Y
D
 
P
H
 
Q
L
 
F
A
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
D
T
 
N
A
 
V
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
S
|
S
R
|
R
A
 
A
E
 
V
L
 
A
I
 
V
A
 
N
E
 
G
G
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
Y
L
 
I
K
 
K
A
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
V
G
 
Y
M
 
A
A
 
Y
A
 
A
V
 
T
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
W
N
 
N
E
|
E
P
 
P
V
 
P
R
 
K
D
 
E
H
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
L
P
 
E
L
 
L
L
 
L
H
 
K
L
 
H
D
 
E
N
 
R
A
 
V
L
 
I
C
 
V
T
 
T
P
 
T
H
|
H
L
 
I
G
|
G
F
 
A
V
 
Q
E
 
T
R
 
K
D
 
E
G
 
A
Y
 
Q
E
 
K
L
 
R
Y
 
V
F
 
A
G
 
E
A
 
M
A
 
T
F
 
T
D
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 82% coverage: 21:283/319 of query aligns to 10:280/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
P
H
 
S
E
 
T
V
 
V
T
 
A
V
 
A
Y
 
L
N
 
G
D
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
-
 
V
-
 
R
-
 
W
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
P
D
 
D
V
 
R
E
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
A
R
 
A
F
 
V
R
 
P
D
 
E
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
-
L
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
T
I
 
V
T
 
D
D
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
A
R
 
A
L
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
I
I
 
V
S
 
A
Q
x
R
T
 
A
G
 
G
K
x
V
G
 
G
I
 
L
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
V
E
 
D
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
V
V
 
V
A
 
N
V
 
A
G
 
P
T
 
T
G
 
S
A
x
N
P
 
I
F
 
H
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
A
W
 
L
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
S
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
A
V
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
H
K
 
T
W
 
W
Q
 
K
-
 
R
-
 
S
T
 
S
R
 
F
L
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
I
R
 
F
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
F
 
V
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
Q
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
Q
Y
 
R
G
 
I
R
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
G
M
 
A
R
 
Y
V
 
V
L
 
V
V
 
A
W
 
Y
G
 
D
R
 
P
E
 
Y
G
 
V
S
 
S
L
 
P
E
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
V
 
L
G
 
G
F
 
I
D
 
E
T
 
L
A
 
L
K
 
-
S
 
S
Q
 
L
E
 
D
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
A
 
P
L
 
K
N
 
T
E
 
P
G
 
E
T
 
T
R
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
I
T
 
D
A
 
K
D
 
E
H
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
T
 
G
A
 
V
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
S
 
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
K
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
H
P
 
V
G
 
R
M
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
C
R
 
T
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
H
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
A
 
V
L
 
V
C
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 82% coverage: 21:283/319 of query aligns to 9:279/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
P
H
 
S
E
 
T
V
 
V
T
 
A
V
 
A
Y
 
L
N
 
G
D
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
-
 
V
-
 
R
-
 
W
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
P
D
 
D
V
 
R
E
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
A
R
 
A
F
 
V
R
 
P
D
 
E
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
-
L
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
P
 
T
I
 
V
T
 
D
D
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
A
R
 
A
L
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
I
I
 
V
S
 
A
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
K
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
V
E
 
D
A
 
A
C
 
A
T
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
V
V
 
V
A
 
N
V
 
A
G
 
P
T
 
T
G
 
S
A
x
N
P
 
I
F
 
H
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
A
W
 
L
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
S
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
A
V
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
H
K
 
T
W
 
W
Q
 
K
-
 
R
-
 
S
T
 
S
R
 
F
L
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
E
L
 
I
R
 
F
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
F
 
V
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
Q
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
Q
Y
 
R
G
 
I
R
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
G
M
 
A
R
 
Y
V
 
V
L
 
V
V
 
A
W
 
Y
G
 
D
R
 
P
E
 
Y
G
 
V
S
 
S
L
 
P
E
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
V
 
L
G
 
G
F
 
I
D
 
E
T
 
L
A
 
L
K
 
-
S
 
S
Q
 
L
E
 
D
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
A
 
P
L
 
K
N
 
T
E
 
P
G
 
E
T
 
T
R
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
I
T
 
D
A
 
K
D
 
E
H
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
T
 
G
A
 
V
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
S
 
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
K
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
H
P
 
V
G
 
R
M
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
C
R
 
T
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
H
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
A
 
V
L
 
V
C
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
33% identity, 80% coverage: 36:291/319 of query aligns to 39:298/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
D
 
D
V
 
D
E
 
E
T
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
S
F
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
H
A
 
-
L
 
F
V
 
I
L
 
G
I
 
L
R
 
R
E
 
S
R
 
R
T
 
T
P
 
H
I
 
L
T
 
T
D
 
E
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
V
L
 
A
I
 
I
S
 
G
Q
 
A
T
 
F
G
 
A
K
 
I
G
 
G
I
 
T
A
 
N
H
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
C
 
A
T
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
F
G
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
S
-
x
N
-
 
T
-
 
R
-
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
W
 
I
G
 
G
L
 
E
I
 
L
I
 
L
A
 
L
A
 
L
M
 
L
R
 
R
H
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
A
V
 
N
A
 
A
A
 
K
M
 
A
K
 
H
A
 
R
G
 
G
K
 
V
W
 
W
Q
 
-
T
 
N
R
 
K
L
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
E
L
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
|
G
K
x
H
I
|
I
G
 
G
S
 
T
L
 
Q
V
 
L
A
 
G
H
 
I
Y
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
S
F
 
L
A
 
G
M
 
M
R
 
Y
V
 
V
L
 
Y
V
 
F
W
x
Y
G
x
D
R
x
I
E
 
E
G
 
N
S
 
K
L
 
L
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
P
M
 
L
V
 
G
G
 
N
F
 
A
D
 
T
T
 
Q
A
 
V
K
 
Q
S
 
H
Q
 
L
E
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
N
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
L
x
V
A
x
P
L
 
E
N
 
N
E
 
P
G
x
S
T
 
T
R
 
K
G
 
N
I
 
M
V
 
M
T
 
G
A
 
A
D
 
K
H
 
E
L
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
A
S
|
S
R
|
R
A
 
G
E
 
T
L
 
V
I
 
V
A
 
D
E
 
I
G
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
K
R
 
H
P
 
L
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
P
N
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
A
R
 
T
D
 
N
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
H
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
A
H
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
F
 
G
V
 
S
E
 
T
R
 
Q
D
 
E
G
 
A
Y
 
Q
E
 
E

P0A9T0 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
33% identity, 80% coverage: 36:291/319 of query aligns to 43:302/410 of P0A9T0

query
sites
P0A9T0
D
 
D
V
 
D
E
 
E
T
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
S
F
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
H
A
 
-
L
 
F
V
 
I
L
 
G
I
 
L
R
 
R
E
 
S
R
 
R
T
 
T
P
 
H
I
 
L
T
 
T
D
 
E
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
V
L
 
A
I
 
I
S
 
G
Q
 
C
T
 
F
G
 
C
K
 
I
G
 
G
I
 
T
A
 
N
H
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
C
 
A
T
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
F
G
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
S
-
 
N
-
 
T
-
 
R
-
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
W
 
I
G
 
G
L
 
E
I
 
L
I
 
L
A
 
L
A
 
L
M
 
L
R
 
R
H
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
A
V
 
N
A
 
A
A
 
K
M
 
A
K
 
H
A
 
R
G
 
G
K
 
V
W
 
W
Q
 
-
T
 
N
R
 
K
L
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
E
L
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
K
x
H
I
|
I
G
 
G
S
 
T
L
 
Q
V
 
L
A
 
G
H
 
I
Y
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
S
F
 
L
A
 
G
M
 
M
R
 
Y
V
 
V
L
 
Y
V
 
F
W
 
Y
G
x
D
R
 
I
E
 
E
G
 
N
S
 
K
L
 
L
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
P
M
 
L
V
 
G
G
 
N
F
 
A
D
 
T
T
 
Q
A
 
V
K
 
Q
S
 
H
Q
 
L
E
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
N
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
L
 
V
A
 
P
L
 
E
N
 
N
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
K
G
 
N
I
 
M
V
 
M
T
 
G
A
 
A
D
 
K
H
 
E
L
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
A
S
|
S
R
|
R
A
 
G
E
 
T
L
 
V
I
 
V
A
 
D
E
 
I
G
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
K
R
 
H
P
 
L
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
P
N
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
A
R
 
T
D
 
N
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
H
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
C
H
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
x
I
G
|
G
F
x
G
V
 
S
E
 
T
R
 
Q
D
 
E
G
 
A
Y
 
Q
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1ybaA The active form of phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
33% identity, 80% coverage: 36:291/319 of query aligns to 39:298/406 of 1ybaA

query
sites
1ybaA
D
 
D
V
 
D
E
 
E
T
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
S
F
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
H
A
 
-
L
 
F
V
 
I
L
 
G
I
 
L
R
|
R
E
x
S
R
 
R
T
 
T
P
 
H
I
 
L
T
 
T
D
 
E
E
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
V
L
 
A
I
 
I
S
 
G
Q
 
C
T
 
F
G
x
C
K
x
I
G
|
G
I
 
T
A
x
N
H
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
C
 
A
T
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
F
G
 
N
A
 
A
P
 
P
F
|
F
A
 
S
-
x
N
-
 
T
-
 
R
-
 
S
A
x
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
W
 
I
G
 
G
L
 
E
I
 
L
I
 
L
A
 
L
A
 
L
M
 
L
R
 
R
H
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
A
V
 
N
A
 
A
A
 
K
M
 
A
K
 
H
A
 
R
G
 
G
K
 
V
W
 
W
Q
 
-
T
 
N
R
 
K
L
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
E
L
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
F
 
I
G
|
G
Y
 
Y
G
|
G
K
x
H
I
|
I
G
 
G
S
 
T
L
 
Q
V
 
L
A
 
G
H
 
I
Y
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
S
F
 
L
A
 
G
M
 
M
R
 
Y
V
 
V
L
 
Y
V
 
F
W
x
Y
G
x
D
R
x
I
E
 
E
G
 
N
S
x
K
L
 
L
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
P
M
 
L
V
 
G
G
 
N
F
 
A
D
 
T
T
 
Q
A
 
V
K
 
Q
S
 
H
Q
 
L
E
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
N
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
L
x
V
A
x
P
L
 
E
N
 
N
E
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
K
G
 
N
I
 
M
V
 
M
T
 
G
A
 
A
D
 
K
H
 
E
L
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
A
S
|
S
R
|
R
A
 
G
E
 
T
L
 
V
I
 
V
A
 
D
E
 
I
G
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
K
R
 
H
P
 
L
G
 
A
M
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
P
N
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
A
R
 
T
D
 
N
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
H
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
C
H
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
F
 
G
V
 
S
E
 
T
R
 
Q
D
 
E
G
 
A
Y
 
Q
E
 
E

Query Sequence

>WP_077277352.1 NCBI__GCF_002000365.1:WP_077277352.1
MKIVIPDDYQDCVRTLACFARLADHEVTVYNDTVRDVETLAERFRDAEALVLIRERTPIT
DELLERLPRLRLISQTGKGIAHVDLEACTRRGVAVAVGTGAPFAAAELTWGLIIAAMRHI
PAEVAAMKAGKWQTRLGTGLRGRTLGIFGYGKIGSLVAHYGRAFAMRVLVWGREGSLERA
AMVGFDTAKSQEDLFARSDVLSLHLALNEGTRGIVTADHLAAMKPTALLVNTSRAELIAE
GALVDALKAGRPGMAAVDVYENEPVRDHPLLHLDNALCTPHLGFVERDGYELYFGAAFDN
LLAFADGSPRNLANPETVS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory