SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_078212859.1 NCBI__GCF_002017945.1:WP_078212859.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

5ur2B Crystal structure of proline utilization a (puta) from bdellovibrio bacteriovorus inactivated by n-propargylglycine (see paper)
28% identity, 53% coverage: 161:367/391 of query aligns to 196:401/959 of 5ur2B

query
sites
5ur2B
E
 
D
R
 
R
F
 
L
D
 
R
T
 
P
V
 
V
C
 
F
K
 
R
E
 
L
A
 
G
Y
 
M
I
 
E
K
 
K
D
 
G
V
 
V
A
 
F
L
 
V
L
 
N
I
 
L
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
Q
S
 
Y
W
 
S
M
 
V
Q
 
K
D
 
H
V
 
L
A
 
T
D
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
F
T
 
T
T
 
E
M
 
L
M
 
I
R
 
N
K
 
E
Y
 
P
N
 
E
K
 
F
E
 
K
K
 
N
A
 
Y
I
 
K
I
 
F
F
 
F
N
 
G
-
 
I
T
 
V
L
 
I
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
L
W
 
R
D
 
D
R
 
S
L
 
F
D
 
E
Y
 
D
L
 
V
K
 
K
K
 
S
L
 
L
H
 
T
E
 
E
E
 
F
A
 
A
K
 
Q
R
 
K
D
 
R
Q
 
G
F
 
T
F
 
P
I
 
F
G
 
W
M
 
V
K
 
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
Y
E
 
E
N
 
T
L
 
I
R
 
E
A
 
A
Q
 
E
E
 
Q
M
 
R
N
 
G
Y
 
W
P
 
P
T
 
V
P
 
P
I
 
V
C
x
Y
A
x
T
S
x
N
K
|
K
E
 
A
A
 
E
T
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
D
 
E
A
 
L
A
 
C
V
 
A
T
 
K
Y
 
Y
M
 
L
M
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
I
E
 
K
F
 
F
M
 
I
S
 
R
I
 
P
F
 
A
A
 
F
G
x
A
T
x
S
H
|
H
N
|
N
E
 
V
L
 
R
S
 
T
T
 
L
Y
 
A
K
 
A
L
 
C
M
 
M
D
 
L
L
 
Y
M
 
A
E
 
E
K
 
K
N
 
L
G
 
N
V
 
I
K
 
P
N
 
K
N
 
E
D
 
-
P
 
-
R
 
A
I
 
L
Y
 
E
F
 
F
G
x
Q
Q
x
M
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
S
 
A
D
 
E
N
 
P
I
 
I
S
 
K
Y
 
K
N
 
T
L
 
I
A
 
V
E
 
D
N
 
M
G
 
G
Y
 
Y
N
 
R
V
 
M
A
 
R
K
 
E
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
E
V
 
L
K
 
I
D
 
P
V
 
G
M
 
M
P
 
A
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S

Sites not aligning to the query:

4nmaA Crystal structure of proline utilization a (puta) from geobacter sulfurreducens pca in complex with l-tetrahydro-2-furoic acid (see paper)
25% identity, 53% coverage: 159:367/391 of query aligns to 205:410/977 of 4nmaA

query
sites
4nmaA
I
 
I
V
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
M
D
 
R
T
 
R
V
 
I
C
 
F
K
 
K
E
 
K
A
 
V
Y
 
M
I
 
E
K
 
L
D
 
N
V
 
G
A
 
F
L
 
L
L
 
C
I
 
I
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
S
S
 
Y
W
 
R
M
 
H
Q
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
F
T
 
R
T
 
R
M
 
L
M
 
K
R
 
L
K
 
E
Y
 
Y
N
 
-
K
 
R
E
 
D
K
 
Y
A
 
P
I
 
H
I
 
L
F
 
G
N
 
I
T
 
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
L
W
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
D
D
 
K
Y
 
D
L
 
L
K
 
D
K
 
D
L
 
L
H
 
L
E
 
A
E
 
W
A
 
A
K
 
K
R
 
E
D
 
H
Q
 
K
F
 
V
F
 
Q
I
 
I
G
 
S
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
Y
E
 
E
N
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
M
 
N
N
 
D
Y
 
W
P
 
E
T
 
V
P
 
P
I
 
V
C
x
W
A
x
T
S
x
I
K
|
K
E
 
A
A
 
E
T
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
Y
 
Y
D
 
E
A
 
R
A
 
Q
V
 
A
T
 
R
Y
 
K
M
 
I
M
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
H
E
 
Q
F
 
I
M
 
C
S
 
H
I
 
F
F
 
A
A
 
C
G
x
A
T
x
S
H
|
H
N
|
N
E
 
I
L
 
R
S
 
T
T
 
I
Y
 
S
K
 
A
L
 
V
M
 
M
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
P
N
 
E
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
R
I
 
Y
Y
 
E
F
 
F
G
x
Q
Q
 
V
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
S
 
A
D
 
E
N
 
P
I
 
V
S
 
R
Y
 
K
N
 
G
L
 
I
A
 
L
E
 
K
N
 
V
G
 
A
Y
 
G
N
 
R
V
 
I
A
 
R
K
 
L
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
N
V
 
M
K
 
V
D
 
P
V
 
G
M
 
M
P
 
G
Y
|
Y
L
 
L
I
 
V
R
|
R
R
|
R
A
 
L
E
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4nmfA Crystal structure of proline utilization a (puta) from geobacter sulfurreducens pca inactivated by n-propargylglycine and complexed with menadione bisulfite (see paper)
25% identity, 53% coverage: 159:367/391 of query aligns to 201:406/973 of 4nmfA

query
sites
4nmfA
I
 
I
V
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
M
D
 
R
T
 
R
V
 
I
C
 
F
K
 
K
E
 
K
A
 
V
Y
 
M
I
 
E
K
 
L
D
 
N
V
 
G
A
 
F
L
 
L
L
 
C
I
 
I
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
S
S
 
Y
W
 
R
M
 
H
Q
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
F
T
 
R
T
 
R
M
 
L
M
 
K
R
 
L
K
 
E
Y
 
Y
N
 
-
K
 
R
E
 
D
K
 
Y
A
 
P
I
 
H
I
 
L
F
 
G
N
 
I
T
x
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
L
W
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
D
D
 
K
Y
 
D
L
 
L
K
 
D
K
 
D
L
 
L
H
 
L
E
 
A
E
 
W
A
 
A
K
 
K
R
 
E
D
 
H
Q
 
K
F
 
V
F
 
Q
I
 
I
G
 
S
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
Y
E
 
E
N
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
M
 
N
N
 
D
Y
 
W
P
 
E
T
 
V
P
 
P
I
 
V
C
x
W
A
x
T
S
x
I
K
|
K
E
 
A
A
 
E
T
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
Y
 
Y
D
 
E
A
 
R
A
 
Q
V
 
A
T
 
R
Y
 
K
M
 
I
M
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
H
E
 
Q
F
 
I
M
 
C
S
 
H
I
 
F
F
 
A
A
 
C
G
x
A
T
x
S
H
|
H
N
|
N
E
 
I
L
 
R
S
 
T
T
 
I
Y
 
S
K
 
A
L
 
V
M
 
M
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
P
N
 
E
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
R
I
 
Y
Y
 
E
F
 
F
G
x
Q
Q
x
V
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
S
 
A
D
 
E
N
 
P
I
 
V
S
 
R
Y
 
K
N
 
G
L
 
I
A
 
L
E
 
K
N
 
V
G
 
A
Y
 
G
N
 
R
V
 
I
A
 
R
K
 
L
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
N
V
 
M
K
 
V
D
 
P
V
 
G
M
 
M
P
 
G
Y
|
Y
L
 
L
I
 
V
R
|
R
R
|
R
A
 
L
E
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4nmdA Crystal structure of proline utilization a (puta) from geobacter sulfurreducens pca reduced with dithionite (see paper)
25% identity, 53% coverage: 159:367/391 of query aligns to 205:410/979 of 4nmdA

query
sites
4nmdA
I
 
I
V
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
M
D
 
R
T
 
R
V
 
I
C
 
F
K
 
K
E
 
K
A
 
V
Y
 
M
I
 
E
K
 
L
D
 
N
V
 
G
A
 
F
L
 
L
L
 
C
I
 
I
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
S
S
 
Y
W
 
R
M
 
H
Q
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
F
T
 
R
T
 
R
M
 
L
M
 
K
R
 
L
K
 
E
Y
 
Y
N
 
-
K
 
R
E
 
D
K
 
Y
A
 
P
I
 
H
I
 
L
F
 
G
N
 
I
T
x
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
L
W
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
D
D
 
K
Y
 
D
L
 
L
K
 
D
K
 
D
L
 
L
H
 
L
E
 
A
E
 
W
A
 
A
K
 
K
R
 
E
D
 
H
Q
 
K
F
 
V
F
 
Q
I
 
I
G
 
S
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
Y
E
 
E
N
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
M
 
N
N
 
D
Y
 
W
P
 
E
T
 
V
P
 
P
I
 
V
C
x
W
A
x
T
S
x
I
K
|
K
E
 
A
A
 
E
T
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
Y
 
Y
D
 
E
A
 
R
A
 
Q
V
 
A
T
 
R
Y
 
K
M
 
I
M
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
H
E
 
Q
F
 
I
M
 
C
S
 
H
I
 
F
F
 
A
A
 
C
G
x
A
T
x
S
H
|
H
N
|
N
E
 
I
L
 
R
S
 
T
T
 
I
Y
 
S
K
 
A
L
 
V
M
 
M
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
P
N
 
E
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
R
I
 
Y
Y
 
E
F
 
F
G
x
Q
Q
x
V
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
S
 
A
D
 
E
N
 
P
I
 
V
S
 
R
Y
 
K
N
 
G
L
 
I
A
 
L
E
 
K
N
 
V
G
 
A
Y
 
G
N
 
R
V
 
I
A
 
R
K
 
L
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
N
V
 
M
K
 
V
D
 
P
V
 
G
M
 
M
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4nmfB Crystal structure of proline utilization a (puta) from geobacter sulfurreducens pca inactivated by n-propargylglycine and complexed with menadione bisulfite (see paper)
25% identity, 53% coverage: 159:367/391 of query aligns to 204:409/979 of 4nmfB

query
sites
4nmfB
I
 
I
V
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
M
D
 
R
T
 
R
V
 
I
C
 
F
K
 
K
E
 
K
A
 
V
Y
 
M
I
 
E
K
 
L
D
 
N
V
 
G
A
 
F
L
 
L
L
 
C
I
 
I
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
S
S
 
Y
W
 
R
M
 
H
Q
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
F
T
 
R
T
 
R
M
 
L
M
 
K
R
 
L
K
 
E
Y
 
Y
N
 
-
K
 
R
E
 
D
K
 
Y
A
 
P
I
 
H
I
 
L
F
 
G
N
 
I
T
x
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
L
W
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
D
D
 
K
Y
 
D
L
 
L
K
 
D
K
 
D
L
 
L
H
 
L
E
 
A
E
 
W
A
 
A
K
 
K
R
 
E
D
 
H
Q
 
K
F
 
V
F
 
Q
I
 
I
G
 
S
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
Y
E
 
E
N
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
M
 
N
N
 
D
Y
 
W
P
 
E
T
 
V
P
 
P
I
 
V
C
x
W
A
x
T
S
x
I
K
|
K
E
 
A
A
 
E
T
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
Y
 
Y
D
 
E
A
 
R
A
 
Q
V
 
A
T
 
R
Y
 
K
M
 
I
M
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
H
E
 
Q
F
 
I
M
 
C
S
 
H
I
 
F
F
 
A
A
 
C
G
x
A
T
x
S
H
|
H
N
|
N
E
 
I
L
 
R
S
 
T
T
 
I
Y
 
S
K
 
A
L
 
V
M
 
M
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
P
N
 
E
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
R
I
 
Y
Y
 
E
F
 
F
G
x
Q
Q
 
V
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
S
 
A
D
 
E
N
 
P
I
 
V
S
 
R
Y
 
K
N
 
G
L
 
I
A
 
L
E
 
K
N
 
V
G
 
A
Y
 
G
N
 
R
V
 
I
A
 
R
K
 
L
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
N
V
 
M
K
 
V
D
 
P
V
 
G
M
 
M
P
 
G
Y
|
Y
L
 
L
I
 
V
R
|
R
R
|
R
A
 
L
E
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7na0A Structure of geobacter sulfurreducens proline utilization a (puta) variant a206w (see paper)
25% identity, 53% coverage: 159:367/391 of query aligns to 205:410/981 of 7na0A

query
sites
7na0A
I
 
I
V
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
M
D
 
R
T
 
R
V
 
I
C
 
F
K
 
K
E
 
K
A
 
V
Y
 
M
I
 
E
K
 
L
D
 
N
V
 
G
A
 
F
L
 
L
L
 
C
I
 
I
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
S
S
 
Y
W
 
R
M
 
H
Q
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
F
T
 
R
T
 
R
M
 
L
M
 
K
R
 
L
K
 
E
Y
 
Y
N
 
-
K
 
R
E
 
D
K
 
Y
A
 
P
I
 
H
I
 
L
F
 
G
N
 
I
T
x
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
L
W
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
D
D
 
K
Y
 
D
L
 
L
K
 
D
K
 
D
L
 
L
H
 
L
E
 
A
E
 
W
A
 
A
K
 
K
R
 
E
D
 
H
Q
 
K
F
 
V
F
 
Q
I
 
I
G
 
S
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
Y
E
 
E
N
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
M
 
N
N
 
D
Y
 
W
P
 
E
T
 
V
P
 
P
I
 
V
C
x
W
A
x
T
S
x
I
K
|
K
E
 
A
A
 
E
T
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
Y
 
Y
D
 
E
A
 
R
A
 
Q
V
 
A
T
 
R
Y
 
K
M
 
I
M
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
H
E
 
Q
F
 
I
M
 
C
S
 
H
I
 
F
F
 
A
A
 
C
G
x
A
T
x
S
H
|
H
N
|
N
E
 
I
L
 
R
S
 
T
T
 
I
Y
 
S
K
 
A
L
 
V
M
 
M
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
P
N
 
E
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
R
I
 
Y
Y
 
E
F
 
F
G
 
Q
Q
 
V
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
S
 
A
D
 
E
N
 
P
I
 
V
S
 
R
Y
 
K
N
 
G
L
 
I
A
 
L
E
 
K
N
 
V
G
 
A
Y
 
G
N
 
R
V
 
I
A
 
R
K
 
L
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
N
V
 
M
K
 
V
D
 
P
V
 
G
M
 
M
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

6bsnA Structure of proline utilization a (puta) with proline bound in remote sites (see paper)
25% identity, 54% coverage: 158:367/391 of query aligns to 247:454/973 of 6bsnA

query
sites
6bsnA
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
P
R
 
Q
F
 
L
D
 
L
T
 
D
V
 
L
C
 
A
K
 
Q
E
 
R
A
 
A
Y
 
K
I
 
A
K
 
H
D
 
D
V
 
L
A
 
N
L
 
F
L
 
T
I
 
V
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
S
 
A
W
 
D
M
 
R
Q
 
L
D
 
E
V
 
L
A
 
S
D
 
L
E
 
D
L
 
V
V
 
I
T
 
A
T
 
A
M
 
T
M
 
L
R
 
A
K
 
D
Y
 
P
N
 
S
K
 
L
E
 
K
K
 
G
A
 
W
I
 
D
I
 
G
F
 
F
N
 
G
-
 
L
T
 
A
L
 
I
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
V
W
 
I
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
D
 
D
Y
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
R
L
 
A
H
 
H
E
 
D
E
 
R
A
 
K
K
 
-
R
 
-
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
F
 
-
I
 
L
G
 
M
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
T
E
 
E
N
 
I
L
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
R
N
 
G
Y
 
L
P
 
D
T
 
G
-
 
Y
P
 
P
I
 
V
C
x
F
A
x
T
S
x
R
K
|
K
E
 
A
A
 
M
T
|
T
D
 
D
A
 
L
N
 
N
Y
 
Y
D
 
V
A
 
A
A
 
C
V
 
A
T
 
S
Y
 
K
M
 
L
M
 
L
E
 
A
-
 
L
H
 
R
L
 
P
E
 
R
F
 
I
M
 
F
S
 
P
I
 
Q
F
 
F
A
|
A
G
 
-
T
|
T
H
|
H
N
|
N
E
 
A
L
 
L
S
 
T
T
 
V
Y
 
A
K
 
T
L
 
V
M
 
L
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
E
K
 
G
N
 
S
G
 
S
V
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
G
I
 
F
Y
 
E
F
 
F
G
 
Q
Q
 
R
L
 
L
Y
 
H
G
 
G
M
 
M
S
 
G
D
 
E
N
 
A
I
 
L
S
 
Y
Y
 
E
N
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
K
N
 
D
G
 
H
Y
 
A
N
 
D
V
 
I
A
 
A
-
 
Y
-
 
R
K
 
T
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
S
V
 
H
K
 
R
D
 
D
V
 
L
M
 
L
P
 
A
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
G
S
 
A

Sites not aligning to the query:

3hazA Crystal structure of bifunctional proline utilization a (puta) protein (see paper)
25% identity, 54% coverage: 158:367/391 of query aligns to 250:457/983 of 3hazA

query
sites
3hazA
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
P
R
 
Q
F
 
L
D
 
L
T
 
D
V
 
L
C
 
A
K
 
Q
E
 
R
A
 
A
Y
 
K
I
 
A
K
 
H
D
 
D
V
 
L
A
 
N
L
 
F
L
 
T
I
 
V
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
S
 
A
W
 
D
M
 
R
Q
 
L
D
 
E
V
 
L
A
 
S
D
 
L
E
 
D
L
 
V
V
 
I
T
 
A
T
 
A
M
 
T
M
 
L
R
 
A
K
 
D
Y
 
P
N
 
S
K
 
L
E
 
K
K
 
G
A
 
W
I
 
D
I
 
G
F
 
F
N
 
G
-
 
L
T
 
A
L
 
I
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
V
W
 
I
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
D
 
D
Y
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
R
L
 
A
H
 
H
E
 
D
E
 
R
A
 
K
K
 
-
R
 
-
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
F
 
-
I
 
L
G
 
M
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
T
E
 
E
N
 
I
L
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
R
N
 
G
Y
 
L
P
 
D
T
 
G
-
 
Y
P
 
P
I
 
V
C
x
F
A
x
T
S
x
R
K
|
K
E
 
A
A
 
M
T
|
T
D
 
D
A
 
L
N
 
N
Y
 
Y
D
 
V
A
 
A
A
 
C
V
 
A
T
 
S
Y
 
K
M
 
L
M
 
L
E
 
A
-
 
L
H
 
R
L
 
P
E
 
R
F
 
I
M
 
F
S
 
P
I
 
Q
F
 
F
A
|
A
G
 
-
T
|
T
H
|
H
N
|
N
E
 
A
L
 
L
S
 
T
T
 
V
Y
 
A
K
 
T
L
 
V
M
 
L
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
E
K
 
G
N
 
S
G
 
S
V
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
G
I
 
F
Y
 
E
F
 
F
G
 
Q
Q
 
R
L
 
L
Y
 
H
G
 
G
M
 
M
S
 
G
D
 
E
N
 
A
I
 
L
S
 
Y
Y
 
E
N
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
K
N
 
D
G
 
H
Y
 
A
N
 
D
V
 
I
A
 
A
-
 
Y
-
 
R
K
 
T
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
S
V
 
H
K
 
R
D
 
D
V
 
L
M
 
L
P
 
A
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
G
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4nmeA Crystal structure of proline utilization a (puta) from geobacter sulfurreducens pca inactivated by n-propargylglycine (see paper)
25% identity, 53% coverage: 159:367/391 of query aligns to 203:405/972 of 4nmeA

query
sites
4nmeA
I
 
I
V
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
M
D
 
R
T
 
R
V
 
I
C
 
F
K
 
K
E
 
K
A
 
V
Y
 
M
I
 
E
K
 
L
D
 
N
V
 
G
A
 
F
L
 
L
L
 
C
I
 
I
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
S
S
 
Y
W
 
R
M
 
H
Q
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
F
T
 
R
T
 
R
M
 
L
M
 
K
R
 
L
K
 
E
Y
 
Y
N
 
-
K
 
R
E
 
D
K
 
Y
A
 
P
I
 
H
I
 
L
F
 
G
N
 
I
T
x
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
L
W
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
D
D
 
K
Y
 
D
L
 
L
K
 
D
K
 
D
L
 
L
H
 
L
E
 
A
E
 
W
A
 
A
K
 
K
R
 
E
D
 
H
Q
 
K
F
 
V
F
 
Q
I
 
I
G
 
S
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
Y
E
 
E
N
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
M
 
N
N
 
D
Y
 
W
P
 
E
T
 
V
P
 
P
I
 
V
C
x
W
A
x
T
S
x
I
K
|
K
E
 
A
A
 
E
T
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
Y
 
Y
D
 
E
A
 
R
A
 
Q
V
 
A
T
 
R
Y
 
K
M
 
I
M
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
H
E
 
Q
F
 
I
M
 
C
S
 
H
I
 
F
F
 
A
A
 
C
G
x
A
T
x
S
H
|
H
N
|
N
E
 
I
L
 
R
S
 
T
T
 
I
Y
 
S
K
 
A
L
 
V
M
 
M
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
P
N
 
E
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
R
I
 
Y
Y
 
E
F
 
F
G
x
Q
Q
 
V
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
S
 
-
D
 
-
N
 
-
I
 
V
S
 
R
Y
 
K
N
 
G
L
 
I
A
 
L
E
 
K
N
 
V
G
 
A
Y
 
G
N
 
R
V
 
I
A
 
R
K
 
L
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
N
V
 
M
K
 
V
D
 
P
V
 
G
M
 
M
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
L
E
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4nmcA Crystal structure of oxidized proline utilization a (puta) from geobacter sulfurreducens pca complexed with zwittergent 3-12 (see paper)
24% identity, 53% coverage: 159:364/391 of query aligns to 194:396/941 of 4nmcA

query
sites
4nmcA
I
 
I
V
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
M
D
 
R
T
 
R
V
 
I
C
 
F
K
 
K
E
 
K
A
 
V
Y
 
M
I
 
E
K
 
L
D
 
N
V
 
G
A
 
F
L
 
L
L
 
C
I
 
I
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
S
S
 
Y
W
 
R
M
 
H
Q
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
F
T
 
R
T
 
R
M
 
L
M
 
K
R
 
L
K
 
E
Y
 
Y
N
 
-
K
 
R
E
 
D
K
 
Y
A
 
P
I
 
H
I
 
L
F
 
G
N
 
I
T
x
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
A
Y
 
Y
R
 
L
W
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
D
D
 
K
Y
 
D
L
 
L
K
 
D
K
 
D
L
 
L
H
 
L
E
 
A
E
 
W
A
 
A
K
 
K
R
 
E
D
 
H
Q
 
K
F
 
V
F
 
Q
I
 
I
G
 
S
M
 
V
K
x
R
L
 
L
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
M
x
W
E
 
D
K
 
Y
E
 
E
N
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
M
 
N
N
 
D
Y
 
W
P
 
E
T
 
V
P
 
P
I
 
V
C
x
W
A
x
T
S
x
I
K
|
K
E
 
A
A
 
E
T
x
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
Y
 
Y
D
 
E
A
 
R
A
 
Q
V
 
A
T
 
R
Y
 
K
M
 
I
M
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
H
E
 
Q
F
 
I
M
 
C
S
 
H
I
 
F
F
 
A
A
 
C
G
x
A
T
x
S
H
|
H
N
|
N
E
 
I
L
 
R
S
 
T
T
 
I
Y
 
S
K
 
A
L
 
V
M
 
M
D
 
E
L
 
M
M
 
A
E
 
R
K
 
E
N
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
P
N
 
E
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
R
I
 
Y
Y
 
E
F
 
F
G
 
Q
Q
 
V
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
S
 
A
D
 
E
N
 
P
I
 
V
S
 
R
Y
 
K
N
 
G
L
 
I
A
 
L
E
 
K
N
 
V
G
 
A
Y
 
G
N
 
R
V
 
I
A
 
R
K
 
L
Y
|
Y
L
 
A
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
N
V
 
M
K
 
V
D
 
P
V
 
G
M
 
M
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
I
 
E
R
 
R
R
 
L
A
 
L
E
 
E
E
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9RW55 Proline dehydrogenase; PRODH; DrPRODH; Proline oxidase; EC 1.5.5.2 from Deinococcus radiodurans (strain ATCC 13939 / DSM 20539 / JCM 16871 / CCUG 27074 / LMG 4051 / NBRC 15346 / NCIMB 9279 / VKM B-1422 / R1) (see paper)
24% identity, 80% coverage: 53:365/391 of query aligns to 19:296/310 of Q9RW55

query
sites
Q9RW55
V
 
V
E
 
E
S
 
Q
L
 
L
I
 
A
R
 
R
A
 
Q
T
 
K
V
 
M
F
 
W
-
 
N
-
 
L
-
 
A
D
 
E
H
 
R
F
 
F
C
 
V
G
 
A
G
 
G
I
 
E
N
 
S
E
 
I
N
 
E
D
 
S
C
 
A
L
 
I
S
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
 
Q
K
 
A
M
 
L
F
 
E
T
 
R
K
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
A
S
 
G
V
 
N
L
 
L
D
 
D
Y
 
L
S
 
L
V
x
G
E
|
E
G
 
F
K
 
I
E
 
D
E
 
S
E
 
P
A
 
A
Q
 
K
F
 
C
D
 
T
A
 
E
A
 
F
L
 
A
K
 
D
M
 
D
T
 
V
L
 
I
K
 
K
T
 
L
I
 
I
E
 
E
F
 
A
A
 
A
K
 
H
E
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
I
I
 
K
P
 
P
F
 
Y
A
 
V
V
 
S
F
 
I
K
|
K
P
 
L
T
 
S
G
 
S
L
 
V
G
 
G
R
 
Q
L
 
G
A
 
K
L
 
-
Y
 
-
E
 
D
K
 
E
L
 
N
G
 
G
E
 
E
K
 
D
K
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
N
E
 
A
E
 
R
T
 
R
I
 
I
E
 
-
W
 
I
N
 
A
K
 
K
I
 
A
V
 
K
E
 
E
R
 
Y
F
 
G
D
 
G
T
 
F
V
 
I
C
 
C
K
 
-
E
 
-
A
 
-
Y
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
L
D
 
D
A
x
M
E
 
E
E
 
D
S
 
H
W
 
T
M
 
R
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
T
D
 
L
E
 
E
L
 
Q
V
 
F
T
 
R
T
 
T
M
 
L
M
 
V
R
 
G
K
 
E
Y
 
F
N
 
G
K
 
A
E
 
E
K
 
H
A
 
-
I
 
-
I
 
V
F
 
G
N
 
T
T
 
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
S
Y
 
Y
R
 
L
W
 
Y
D
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
K
 
R
K
 
S
L
 
L
H
 
G
E
 
D
E
 
R
A
 
A
K
 
S
R
 
L
D
 
D
Q
 
D
F
 
L
F
 
R
I
 
P
G
 
N
M
 
I
K
x
R
L
x
M
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
M
 
L
E
 
E
K
 
P
E
 
A
N
 
T
L
 
V
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
-
P
 
-
I
 
-
C
 
-
A
 
-
S
 
D
K
 
K
E
 
A
A
 
D
T
 
V
D
 
D
A
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
D
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
-
M
 
-
M
 
-
E
 
R
H
 
R
L
 
L
E
 
V
F
 
F
M
 
Q
S
 
H
I
 
L
F
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
N
H
 
Y
N
 
T
E
 
N
L
 
V
S
 
A
T
|
T
Y
x
H
-
 
D
-
 
E
K
 
R
L
 
I
M
 
I
D
 
D
L
 
D
M
 
V
E
 
K
K
 
R
-
 
F
-
 
V
-
 
L
-
 
A
N
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
G
N
 
K
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
A
I
 
F
Y
 
E
F
 
F
G
 
Q
Q
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
M
 
I
S
 
R
D
 
R
N
 
D
I
 
L
S
 
Q
Y
 
K
N
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
A
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
N
 
R
V
 
V
A
 
R
K
 
V
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
-
V
 
-
K
 
R
D
 
D
V
 
W
M
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
R
|
R
R
|
R
A
x
I
E
x
A
E
|
E
N
 
T

4h6qA Structure of oxidized deinococcus radiodurans proline dehydrogenase complexed with l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
24% identity, 80% coverage: 53:365/391 of query aligns to 3:280/281 of 4h6qA

query
sites
4h6qA
V
 
V
E
 
E
S
 
Q
L
 
L
I
 
A
R
 
R
A
 
Q
T
 
K
V
 
M
F
 
W
-
 
N
-
 
L
-
 
A
D
 
E
H
 
R
F
 
F
C
 
V
G
 
A
G
 
G
I
 
E
N
 
S
E
 
I
N
 
E
D
 
S
C
 
A
L
 
I
S
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
 
Q
K
 
A
M
 
L
F
 
E
T
 
R
K
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
A
S
 
G
V
 
N
L
 
L
D
 
D
Y
 
L
S
 
L
V
 
G
E
 
E
G
 
F
K
 
I
E
 
D
E
 
S
E
 
P
A
 
A
Q
 
K
F
 
C
D
 
T
A
 
E
A
 
F
L
 
A
K
 
D
M
 
D
T
 
V
L
 
I
K
 
K
T
 
L
I
 
I
E
 
E
F
 
A
A
 
A
K
 
H
E
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
I
I
 
K
P
 
P
F
 
Y
A
 
V
V
 
S
F
 
I
K
|
K
P
 
L
T
 
S
G
 
S
L
 
V
G
 
G
R
 
Q
L
 
G
A
 
K
L
 
-
Y
 
-
E
 
D
K
 
E
L
 
N
G
 
G
E
 
E
K
 
D
K
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
N
E
 
A
E
 
R
T
 
R
I
 
I
E
 
-
W
 
I
N
 
A
K
 
K
I
 
A
V
 
K
E
 
E
R
 
Y
F
 
G
D
 
G
T
 
F
V
 
I
C
 
C
K
 
-
E
 
-
A
 
-
Y
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
L
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
D
S
 
H
W
 
T
M
 
R
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
T
D
 
L
E
 
E
L
 
Q
V
 
F
T
 
R
T
 
T
M
 
L
M
 
V
R
 
G
K
 
E
Y
 
F
N
 
G
K
 
A
E
 
E
K
 
H
A
 
-
I
 
-
I
 
V
F
 
G
N
 
T
T
 
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
S
Y
 
Y
R
 
L
W
 
Y
D
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
K
 
R
K
 
S
L
 
L
H
 
G
E
 
D
E
 
R
A
 
A
K
 
S
R
 
L
D
 
D
Q
 
D
F
 
L
F
 
R
I
 
P
G
 
N
M
 
I
K
x
R
L
 
M
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
M
 
L
E
 
E
K
 
P
E
 
A
N
 
T
L
 
V
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
-
P
 
-
I
 
-
C
 
-
A
 
-
S
 
D
K
 
K
E
 
A
A
 
D
T
 
V
D
 
D
A
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
D
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
-
M
 
-
M
 
-
E
 
R
H
 
R
L
 
L
E
 
V
F
 
F
M
 
Q
S
 
H
I
 
L
F
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
N
H
 
Y
N
 
T
E
 
N
L
 
V
S
x
A
T
|
T
Y
x
H
-
 
D
-
 
E
K
 
R
L
 
I
M
 
I
D
 
D
L
 
D
M
 
V
E
 
K
K
 
R
-
 
F
-
 
V
-
 
L
-
 
A
N
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
G
N
 
K
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
A
I
 
F
Y
 
E
F
 
F
G
 
Q
Q
x
M
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
x
I
S
 
R
D
 
R
N
 
D
I
 
L
S
 
Q
Y
 
K
N
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
A
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
N
 
R
V
 
V
A
 
R
K
 
V
Y
|
Y
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
-
V
 
-
K
 
R
D
 
D
V
 
W
M
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
R
|
R
R
|
R
A
 
I
E
 
A
E
|
E
N
 
T

Sites not aligning to the query:

4h6rA Structure of reduced deinococcus radiodurans proline dehydrogenase (see paper)
23% identity, 77% coverage: 63:365/391 of query aligns to 7:271/272 of 4h6rA

query
sites
4h6rA
D
 
E
H
 
R
F
 
F
C
 
V
G
 
A
G
 
G
I
 
E
N
 
S
E
 
I
N
 
E
D
 
S
C
 
A
L
 
I
S
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
 
Q
K
 
A
M
 
L
F
 
E
T
 
R
K
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
A
S
 
G
V
 
N
L
 
L
D
 
D
Y
 
L
S
 
L
V
 
G
E
 
E
G
 
F
K
 
I
E
 
D
E
 
S
E
 
P
A
 
A
Q
 
K
F
 
C
D
 
T
A
 
E
A
 
F
L
 
A
K
 
D
M
 
D
T
 
V
L
 
I
K
 
K
T
 
L
I
 
I
E
 
E
F
 
A
A
 
A
K
 
H
E
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
I
I
 
K
P
 
P
F
 
Y
A
 
V
V
 
S
F
 
I
K
 
K
P
 
L
T
 
S
G
 
S
L
 
V
G
 
G
R
 
Q
L
 
G
A
 
K
L
 
-
Y
 
-
E
 
D
K
 
E
L
 
N
G
 
G
E
 
E
K
 
D
K
 
L
E
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
N
E
 
A
E
 
R
T
 
R
I
 
I
E
 
-
W
 
I
N
 
A
K
 
K
I
 
A
V
 
K
E
 
E
R
 
Y
F
 
G
D
 
G
T
 
F
V
 
I
C
 
C
K
 
-
E
 
-
A
 
-
Y
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
L
D
|
D
A
x
M
E
 
E
E
 
D
S
 
H
W
 
T
M
 
R
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
T
D
 
L
E
 
E
L
 
Q
V
 
F
T
 
R
T
 
T
M
 
L
M
 
V
R
 
G
K
 
E
Y
 
F
N
 
G
K
 
A
E
 
E
K
 
H
A
 
-
I
 
-
I
 
V
F
 
G
N
 
T
T
x
V
L
 
L
Q
|
Q
M
 
S
Y
 
Y
R
 
L
W
 
Y
D
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
K
 
R
K
 
S
L
 
L
H
 
G
E
 
D
E
 
R
A
 
A
K
 
S
R
 
L
D
 
D
Q
 
D
F
 
L
F
 
R
I
 
P
G
 
N
M
 
I
K
x
R
L
 
M
V
|
V
R
x
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
M
 
L
E
 
E
K
 
P
E
 
A
N
 
T
L
 
V
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
-
P
 
-
I
 
-
C
 
-
A
 
-
S
 
D
K
 
K
E
 
A
A
 
D
T
 
V
D
 
D
A
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
D
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
-
M
 
-
M
 
-
E
 
R
H
 
R
L
 
L
E
 
V
F
 
F
M
 
Q
S
 
H
I
 
L
F
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
N
H
 
Y
N
 
T
E
 
N
L
 
V
S
x
A
T
|
T
Y
x
H
-
 
D
-
 
E
K
 
R
L
 
I
M
 
I
D
 
D
L
 
D
M
 
V
E
 
K
K
 
R
-
 
F
-
 
V
-
 
L
-
 
A
N
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
G
N
 
K
N
 
D
D
 
-
P
 
-
R
 
A
I
 
F
Y
 
E
F
 
F
G
x
Q
Q
 
M
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
M
x
I
S
 
R
D
 
R
N
 
D
I
 
L
S
 
Q
Y
 
K
N
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
A
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
N
 
R
V
 
V
A
 
R
K
 
V
Y
|
Y
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
P
 
-
V
 
-
K
 
R
D
 
D
V
 
W
M
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
R
 
R
R
|
R
A
 
I
E
 
A
E
|
E
N
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_078212859.1 NCBI__GCF_002017945.1:WP_078212859.1
MNNLFNNTQVAFALKSDTELDRAYFLFKMIASEPLVRIGTAVTNFAIKANLPVESLIRAT
VFDHFCGGINENDCLSVVDKMFTKGVSSVLDYSVEGKEEEAQFDAALKMTLKTIEFAKER
LAIPFAVFKPTGLGRLALYEKLGEKKELTAEETIEWNKIVERFDTVCKEAYIKDVALLID
AEESWMQDVADELVTTMMRKYNKEKAIIFNTLQMYRWDRLDYLKKLHEEAKRDQFFIGMK
LVRGAYMEKENLRAQEMNYPTPICASKEATDANYDAAVTYMMEHLEFMSIFAGTHNELST
YKLMDLMEKNGVKNNDPRIYFGQLYGMSDNISYNLAENGYNVAKYLPFGPVKDVMPYLIR
RAEENTSVAGQTSRELLLIKTERKRRKEKNA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory