SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_078429041.1 NCBI__GCF_002019605.1:WP_078429041.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/256 of query aligns to 4:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
I
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
T
E
 
E
N
 
N
V
 
I
S
 
V
L
 
K
Q
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
I
H
 
S
I
 
V
K
 
N
E
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
F
 
T
S
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
Y
 
L
R
 
K
P
 
A
S
 
D
Y
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
R
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
K
 
K
E
 
D
I
 
I
L
 
T
N
 
N
M
 
K
K
 
E
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
L
T
 
Y
T
 
H
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
A
 
K
H
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
T
 
C
L
 
P
M
 
G
K
 
E
S
 
S
G
 
P
L
 
L
L
 
-
K
 
-
G
 
N
G
 
S
L
 
L
Y
 
F
W
 
Y
G
 
K
S
 
K
A
 
W
Q
 
I
K
 
P
E
 
K
E
 
E
V
 
E
E
 
E
H
 
M
R
 
V
R
 
E
A
 
K
V
 
A
E
 
F
E
 
K
V
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
Q
 
K
L
 
L
Q
 
S
D
 
H
Y
 
L
R
 
Y
H
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
T
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
S
 
P
S
 
G
E
 
L
K
 
A
E
 
H
D
 
D
M
 
I
S
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
E
M
 
L
H
 
-
E
 
K
L
 
A
K
 
K
N
 
G
M
 
I
T
 
T
V
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
L
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
H
I
 
L
A
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
F
 
N
G
 
G
K
 
Q
Q
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
E
G
 
G
T
 
R
-
 
G
P
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
N
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
K
 
E
A
 
I
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
E
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
34% identity, 97% coverage: 4:252/256 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
I
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
T
E
 
E
N
 
N
V
 
I
S
 
V
L
 
K
Q
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
I
H
 
S
I
 
V
K
 
C
E
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
F
 
T
S
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
Y
 
L
R
 
K
P
 
A
S
 
D
Y
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
R
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
K
 
K
E
 
D
I
 
I
L
 
T
N
 
N
M
 
K
K
 
E
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
L
T
 
Y
T
 
H
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
A
 
K
H
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
T
 
N
L
 
P
M
 
G
K
 
E
S
 
S
G
 
P
L
 
L
L
 
-
K
 
-
G
 
N
G
 
S
L
 
L
Y
 
F
W
 
Y
G
 
K
S
 
K
A
 
W
Q
 
I
K
 
P
E
 
K
E
 
E
V
 
E
E
 
E
H
 
M
R
 
V
R
 
E
A
 
K
V
 
A
E
 
F
E
 
K
V
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
Q
 
K
L
 
L
Q
 
S
D
 
H
Y
 
L
R
 
Y
H
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
T
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
S
 
P
S
 
G
E
 
L
K
 
A
E
 
H
D
 
D
M
 
I
S
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
E
M
 
L
H
 
-
E
 
K
L
 
A
K
 
K
N
 
G
M
 
I
T
 
T
V
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
L
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
H
I
 
L
A
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
F
 
N
G
 
G
K
 
Q
Q
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
E
G
 
G
T
 
R
-
 
G
P
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
N
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
K
 
E
A
 
I
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
32% identity, 95% coverage: 1:242/256 of query aligns to 1:225/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
M
 
M
G
 
E
A
 
D
I
 
I
L
 
I
E
 
V
V
 
V
E
 
E
N
 
N
V
 
L
S
 
V
L
 
K
Q
 
K
F
|
F
G
 
G
G
 
D
V
x
F
K
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
D
 
G
V
 
V
S
 
S
Y
 
F
H
 
S
I
 
V
K
 
K
E
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
L
 
I
N
 
H
C
 
M
I
 
L
S
 
T
G
 
T
L
 
L
Y
 
L
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
A
R
 
W
F
 
V
K
 
A
G
 
G
K
 
H
E
 
D
I
 
V
L
 
L
N
 
K
M
 
E
K
 
P
P
 
R
Y
 
E
K
 
V
R
 
R
T
 
R
T
 
K
L
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
-
A
 
-
F
 
F
Q
 
Q
N
 
D
I
 
Q
A
 
S
L
 
L
F
 
D
A
 
R
H
 
E
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
Y
L
 
I
K
 
H
G
 
G
G
 
K
L
 
I
Y
 
Y
W
 
G
G
 
Y
S
 
G
A
 
G
Q
 
E
K
 
K
E
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
H
 
L
R
 
K
R
 
K
A
 
R
V
 
I
E
 
L
E
 
E
V
 
L
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
V
Q
 
E
L
 
L
Q
 
L
D
 
E
Y
 
F
R
 
K
H
 
D
T
 
K
P
 
P
V
 
V
G
 
K
T
|
T
L
x
F
S
|
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
L
E
 
E
V
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
H
E
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
L
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
I
G
 
G
M
 
L
N
 
D
S
 
P
S
 
H
E
 
T
K
 
R
E
 
A
D
 
H
M
 
M
S
 
W
R
 
E
F
 
Y
I
 
I
L
 
S
D
 
K
M
 
M
H
 
K
E
 
K
L
 
E
K
 
H
N
 
N
M
 
M
T
 
T
V
 
I
V
 
F
L
 
L
I
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
Y
L
 
M
G
 
D
V
 
E
V
 
A
M
 
E
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
I
D
 
D
F
 
H
G
 
G
K
 
K
Q
 
I
I
 
I
G
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
E
 
E
I
 
L
Q
 
K
N
 
R

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
31% identity, 95% coverage: 3:244/256 of query aligns to 1:224/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
A
 
A
I
 
S
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
K
Q
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
N
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
N
Y
 
L
H
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
K
 
G
G
 
E
K
 
K
E
 
R
I
 
M
L
 
N
N
 
D
M
 
T
K
 
P
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
D
 
H
Y
 
L
R
 
L
H
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
S
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
A
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
R
K
 
L
N
 
G
M
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
V
I
 
A
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
Y
N
 
H
N
 
Y
P
 
P

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
31% identity, 95% coverage: 3:244/256 of query aligns to 2:225/371 of P68187

query
sites
P68187
A
 
A
I
 
S
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
K
Q
 
A
F
 
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
N
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
N
Y
 
L
H
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
K
 
G
G
 
E
K
 
K
E
 
R
I
 
M
L
 
N
N
 
D
M
 
T
K
 
P
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
|
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
x
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
|
V
E
 
N
E
 
Q
V
|
V
I
 
A
D
x
E
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
x
A
D
 
H
Y
 
L
R
 
L
H
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
|
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
S
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
A
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
R
K
 
L
N
 
G
M
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
V
I
 
A
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
Y
N
 
H
N
 
Y
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
31% identity, 95% coverage: 3:244/256 of query aligns to 1:224/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
A
 
A
I
 
S
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
K
Q
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
N
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
N
Y
 
L
H
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
K
 
G
G
 
E
K
 
K
E
 
R
I
 
M
L
 
N
N
 
D
M
 
T
K
 
P
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
D
 
H
Y
 
L
R
 
L
H
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
T
x
A
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
S
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
A
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
R
K
 
L
N
 
G
M
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
V
I
 
A
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
Y
N
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
31% identity, 95% coverage: 3:244/256 of query aligns to 1:224/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
A
 
A
I
 
S
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
K
Q
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
N
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
N
Y
 
L
H
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
K
 
G
G
 
E
K
 
K
E
 
R
I
 
M
L
 
N
N
 
D
M
 
T
K
 
P
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
D
 
H
Y
 
L
R
 
L
H
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
T
 
A
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
S
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
A
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
R
K
 
L
N
 
G
M
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
V
I
 
A
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
Y
N
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
31% identity, 95% coverage: 3:244/256 of query aligns to 1:224/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
A
 
A
I
 
S
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
K
Q
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
N
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
N
Y
 
L
H
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
K
 
G
G
 
E
K
 
K
E
 
R
I
 
M
L
 
N
N
 
D
M
 
T
K
 
P
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
D
 
H
Y
 
L
R
 
L
H
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
T
x
A
L
 
L
S
|
S
Y
x
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
S
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
A
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
R
K
 
L
N
 
G
M
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
V
I
 
A
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
Y
N
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puvA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4 (see paper)
31% identity, 95% coverage: 3:244/256 of query aligns to 1:224/371 of 3puvA

query
sites
3puvA
A
 
A
I
 
S
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
K
Q
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
N
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
N
Y
 
L
H
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
K
 
G
G
 
E
K
 
K
E
 
R
I
 
M
L
 
N
N
 
D
M
 
T
K
 
P
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
D
 
H
Y
 
L
R
 
L
H
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
T
x
A
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
S
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
A
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
R
K
 
L
N
 
G
M
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
V
I
 
A
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
Y
N
 
H
N
 
Y
P
 
P

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
29% identity, 98% coverage: 3:254/256 of query aligns to 1:237/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
K
V
 
A
E
 
Q
N
 
H
V
 
L
S
 
A
L
 
K
Q
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
V
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
V
N
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
L
H
 
Q
I
 
V
K
 
E
E
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
T
M
 
S
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
R
 
A
P
 
R
S
 
D
Y
 
E
G
 
G
S
 
T
I
 
I
R
 
T
F
 
I
K
 
D
G
 
D
K
 
N
E
 
D
I
 
I
L
 
S
N
 
I
M
 
L
K
 
P
P
 
M
Y
 
H
K
 
S
R
 
R
T
 
S
T
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
A
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
A
 
R
H
 
K
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
E
D
 
D
N
 
N
L
 
I
K
 
M
L
 
A
G
 
V
R
 
L
H
 
Q
T
 
T
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
K
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
L
E
 
T
H
 
H
R
x
E
R
 
E
A
 
R
V
 
Q
E
x
D
E
 
K
V
 
L
I
 
E
D
 
D
F
 
L
L
 
L
Q
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
H
L
 
I
Q
 
Q
D
 
H
Y
 
I
R
 
R
H
 
K
T
 
S
P
 
A
V
 
G
G
 
M
T
 
A
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
E
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
S
 
P
S
 
I
E
 
S
K
 
V
E
 
I
D
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
K
F
 
I
I
 
I
L
 
E
D
 
H
M
 
L
H
 
R
E
 
D
L
 
-
K
 
R
N
 
G
M
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
D
L
 
V
S
 
C
D
 
E
S
 
K
I
 
A
A
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
E
 
D
I
 
V
Q
 
L
N
 
N
N
 
N
P
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
K
K
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
Q

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
31% identity, 94% coverage: 5:244/256 of query aligns to 1:222/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
K
Q
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
N
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
N
Y
 
L
H
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
K
 
G
G
 
E
K
 
K
E
 
R
I
 
M
L
 
N
N
 
D
M
 
T
K
 
P
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
D
 
H
Y
 
L
R
 
L
H
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
T
x
A
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
S
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
A
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
R
K
 
L
N
 
G
M
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
V
I
 
A
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
Y
N
 
H
N
 
Y
P
 
P

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
32% identity, 99% coverage: 4:256/256 of query aligns to 1:233/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
I
 
M
L
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
N
 
S
V
 
L
S
 
S
L
 
R
Q
 
K
F
 
W
G
 
K
G
 
N
V
 
F
K
 
-
A
 
S
L
 
L
N
 
D
D
 
N
V
 
L
S
 
S
Y
 
L
H
 
K
I
 
V
K
 
E
E
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
F
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
L
M
 
F
L
 
L
N
 
E
C
 
L
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
H
R
 
V
P
 
P
S
 
D
Y
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
R
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
I
 
V
L
 
T
N
 
D
M
 
L
K
 
S
P
 
P
Y
 
E
K
 
K
R
 
H
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
F
A
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
Y
A
 
S
L
 
L
F
 
F
A
 
P
H
 
H
M
 
M
S
 
N
V
 
V
L
 
K
D
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
M
K
 
R
S
 
M
G
 
K
L
 
K
L
 
I
K
 
K
G
 
D
-
 
P
G
 
K
L
 
R
Y
 
V
W
 
L
G
 
D
S
 
T
A
 
A
Q
 
R
K
 
D
E
 
L
E
 
K
V
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
L
I
 
L
D
 
D
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
H
 
R
T
 
N
P
 
P
V
 
L
G
 
-
T
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
T
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
S
 
P
S
 
R
E
 
T
K
 
Q
E
 
E
D
 
N
M
 
A
S
 
R
R
 
E
F
 
M
I
 
L
L
 
S
D
 
V
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
K
K
 
N
N
 
K
M
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
L
L
 
H
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
T
V
 
E
V
 
A
M
 
R
D
 
I
L
 
M
S
 
A
D
 
D
S
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
M
F
 
D
G
 
G
K
 
K
Q
 
L
I
 
I
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
F
N
 
E
N
 
K
P
 
P
-
 
V
-
 
E
D
 
G
V
 
R
I
 
V
K
 
A
A
 
S
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
E
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
V

Sites not aligning to the query:

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
33% identity, 93% coverage: 3:241/256 of query aligns to 3:229/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
A
 
S
I
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
E
 
K
N
 
N
V
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
N
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
Y
 
L
H
 
N
I
 
I
K
 
R
E
 
R
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
Y
 
L
R
 
V
P
 
P
S
 
D
Y
 
Q
G
 
G
S
 
E
I
 
V
R
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
I
 
I
L
 
A
N
 
Q
M
 
M
K
 
S
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
R
T
 
Q
T
 
E
L
 
L
G
 
F
I
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
-
 
R
-
 
M
-
 
G
-
 
M
-
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
T
H
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
A
H
 
H
T
 
T
L
 
K
M
 
L
K
 
S
S
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
I
K
 
A
G
 
E
G
 
L
L
 
V
Y
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Q
 
L
K
 
K
E
 
L
E
 
E
V
 
S
E
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
A
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
T
x
E
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
S
 
P
S
 
I
E
 
V
K
 
K
E
 
G
D
 
V
M
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
M
 
L
H
 
R
E
 
E
L
 
A
K
 
L
N
 
D
M
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
S
 
Y
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
F
 
E
G
 
G
K
 
K
Q
 
I
I
 
Q
G
 
G
F
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
33% identity, 93% coverage: 3:241/256 of query aligns to 3:229/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
A
 
S
I
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
E
 
K
N
 
N
V
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
x
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
N
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
Y
 
L
H
 
N
I
 
I
K
 
R
E
 
R
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
Y
 
L
R
 
V
P
 
P
S
 
D
Y
 
Q
G
 
G
S
 
E
I
 
V
R
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
I
 
I
L
 
A
N
 
Q
M
 
M
K
 
S
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
R
T
 
Q
T
 
E
L
 
L
G
 
F
I
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
-
 
R
-
 
M
-
 
G
-
 
M
-
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
T
H
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
A
H
 
H
T
 
T
L
 
K
M
 
L
K
 
S
S
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
I
K
 
A
G
 
E
G
 
L
L
 
V
Y
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Q
 
L
K
 
K
E
 
L
E
 
E
V
 
S
E
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
A
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
S
 
P
S
 
I
E
 
V
K
 
K
E
 
G
D
 
V
M
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
M
 
L
H
 
R
E
 
E
L
 
A
K
 
L
N
 
D
M
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
S
 
Y
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
F
 
E
G
 
G
K
 
K
Q
 
I
I
 
Q
G
 
G
F
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
33% identity, 93% coverage: 3:241/256 of query aligns to 1:227/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
A
 
S
I
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
E
 
K
N
 
N
V
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
N
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
Y
 
L
H
 
N
I
 
I
K
 
R
E
 
R
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
Y
 
L
R
 
V
P
 
P
S
 
D
Y
 
Q
G
 
G
S
 
E
I
 
V
R
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
I
 
I
L
 
A
N
 
Q
M
 
M
K
 
S
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
R
T
 
Q
T
 
E
L
 
L
G
 
F
I
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
-
 
R
-
 
M
-
 
G
-
 
M
-
 
L
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
T
H
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
A
H
 
H
T
 
T
L
 
K
M
 
L
K
 
S
S
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
I
K
 
A
G
 
E
G
 
L
L
 
V
Y
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Q
 
L
K
 
K
E
 
L
E
 
E
V
 
S
E
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
A
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
S
 
P
S
 
I
E
 
V
K
 
K
E
 
G
D
 
V
M
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
M
 
L
H
 
R
E
 
E
L
 
A
K
 
L
N
 
D
M
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
L
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
S
 
Y
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
F
 
E
G
 
G
K
 
K
Q
 
I
I
 
Q
G
 
G
F
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
31% identity, 98% coverage: 3:252/256 of query aligns to 2:235/369 of P19566

query
sites
P19566
A
 
A
I
 
S
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
E
 
R
N
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
K
Q
 
A
F
 
W
G
 
G
G
 
D
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
N
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
N
Y
 
L
H
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
R
 
-
F
 
F
K
 
I
G
 
G
K
 
E
E
 
T
I
 
R
L
 
M
N
 
N
-
 
D
M
 
I
K
 
P
P
 
P
Y
 
A
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
|
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
L
 
M
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
V
 
M
E
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
D
 
H
Y
 
L
R
 
L
H
 
E
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
x
D
S
 
A
S
 
A
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
M
 
L
H
 
H
E
 
K
L
 
R
K
 
L
N
 
G
M
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
V
I
 
A
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
I
 
L
Q
 
Y
N
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
D
 
R
V
 
F
I
 
V
K
 
A
A
 
G
Y
 
F
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
29% identity, 94% coverage: 15:255/256 of query aligns to 37:267/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
G
 
G
G
 
A
V
x
T
K
x
V
A
x
G
L
 
V
N
 
Y
D
 
D
V
 
T
S
 
N
Y
 
F
H
 
E
I
 
I
K
 
N
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
L
S
 
N
G
 
R
L
 
L
Y
 
I
R
 
E
P
 
P
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
R
 
F
F
 
I
K
 
D
G
 
N
K
 
Q
E
 
D
I
 
V
L
 
A
N
 
T
M
 
L
K
 
N
P
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
Y
 
V
K
 
R
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
M
G
 
S
I
 
M
A
 
V
R
 
-
A
 
-
F
 
F
Q
 
Q
N
 
N
I
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
P
H
 
H
M
 
R
S
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
T
K
 
E
L
 
Y
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
E
W
 
V
G
 
Q
S
 
N
A
 
V
Q
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
V
 
-
E
 
-
H
 
R
R
 
R
R
 
K
A
 
R
V
 
A
E
 
E
E
 
K
V
 
A
I
 
L
D
 
D
F
 
N
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
Q
 
L
D
 
D
Y
 
F
R
 
K
H
 
D
T
 
Q
P
 
Y
V
 
P
G
 
K
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
G
V
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
N
E
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
M
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
S
 
P
S
 
L
E
 
I
K
 
R
E
 
R
D
 
E
M
 
M
S
 
Q
R
 
D
F
 
E
I
 
L
L
 
L
D
 
E
M
 
L
H
 
Q
E
 
A
L
 
K
K
 
F
N
 
Q
M
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
I
L
 
F
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
G
 
N
V
 
E
V
 
A
M
 
L
D
 
R
L
 
I
S
 
G
D
 
D
S
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
M
D
 
K
F
 
D
G
 
G
K
 
K
Q
 
I
I
 
M
G
 
Q
F
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
A
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
N
 
T
N
 
N
P
 
P
-
 
A
-
 
N
D
 
D
V
 
Y
I
 
V
K
 
K
A
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
E
E
 
D
E
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
29% identity, 94% coverage: 15:255/256 of query aligns to 37:267/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
G
 
G
G
 
A
V
 
T
K
 
V
A
 
G
L
 
V
N
 
Y
D
 
D
V
 
T
S
 
N
Y
 
F
H
 
E
I
 
I
K
 
N
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
L
S
 
N
G
 
R
L
 
L
Y
 
I
R
 
E
P
 
P
S
 
T
Y
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
R
 
F
F
 
I
K
 
D
G
 
N
K
 
Q
E
 
D
I
 
V
L
 
A
N
 
T
M
 
L
K
 
N
P
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
Y
 
V
K
 
R
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
M
G
 
S
I
 
M
A
 
V
R
 
-
A
 
-
F
 
F
Q
 
Q
N
 
N
I
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
P
H
 
H
M
 
R
S
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
T
K
 
E
L
 
Y
G
 
G
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
E
W
 
V
G
 
Q
S
 
N
A
 
V
Q
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
V
 
-
E
 
-
H
 
R
R
 
R
R
 
K
A
 
R
V
 
A
E
 
E
E
 
K
V
 
A
I
 
L
D
 
D
F
 
N
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
Q
 
L
D
 
D
Y
 
F
R
 
K
H
 
D
T
 
Q
P
 
Y
V
 
P
G
 
K
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
G
V
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
N
E
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
M
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
S
 
P
S
 
L
E
 
I
K
 
R
E
 
R
D
 
E
M
 
M
S
 
Q
R
 
D
F
 
E
I
 
L
L
 
L
D
 
E
M
 
L
H
 
Q
E
 
A
L
 
K
K
 
F
N
 
Q
M
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
I
L
 
F
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
G
 
N
V
 
E
V
 
A
M
 
L
D
 
R
L
 
I
S
 
G
D
 
D
S
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
M
D
 
K
F
 
D
G
 
G
K
 
K
Q
 
I
I
 
M
G
 
Q
F
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
A
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
N
 
T
N
 
N
P
 
P
-
 
A
-
 
N
D
 
D
V
 
Y
I
 
V
K
 
K
A
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
E
E
 
D
E
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
28% identity, 97% coverage: 5:252/256 of query aligns to 7:230/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
L
 
V
E
 
K
V
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
S
 
T
L
 
K
Q
 
R
F
|
F
G
 
G
G
 
N
V
x
F
K
 
T
A
 
A
L
 
V
N
 
N
D
 
K
V
 
L
S
 
N
Y
 
L
H
 
T
I
 
I
K
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
L
S
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
E
P
 
P
S
 
T
Y
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
I
R
 
Y
F
 
F
K
 
G
G
 
D
K
 
R
E
 
D
I
 
V
L
 
T
N
 
Y
M
 
L
K
 
P
P
 
P
Y
 
K
K
 
D
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
Q
 
-
N
 
N
I
 
I
A
 
S
L
 
M
-
 
V
F
 
F
A
 
Q
H
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
A
L
 
F
Y
 
P
W
 
L
G
 
K
S
 
K
A
 
F
Q
 
P
K
 
K
E
 
D
E
 
E
V
 
I
E
 
D
H
 
K
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
R
E
 
W
V
 
A
I
 
A
D
 
E
F
 
L
L
 
L
Q
 
Q
L
 
I
Q
 
E
D
 
E
Y
 
L
R
 
L
H
 
N
T
 
R
P
 
Y
V
 
P
G
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
L
 
V
E
 
E
P
 
P
E
 
D
L
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
K
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
A
M
 
M
S
 
R
R
 
A
F
 
E
I
 
I
L
 
K
D
 
K
M
 
L
H
 
Q
E
 
Q
L
 
K
K
 
L
N
 
K
M
 
V
T
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
M
S
 
G
D
 
D
S
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
M
D
 
N
F
 
R
G
 
G
K
 
Q
Q
 
L
I
 
L
G
 
Q
F
 
I
G
 
G
T
 
S
P
 
P
A
 
T
E
 
E
I
 
V
Q
 
Y
N
 
L
N
 
R
P
 
P
D
 
N
-
 
S
-
 
V
V
 
F
I
 
V
K
 
A
A
 
T
Y
 
F
I
 
I
G
 
G

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp-binding protein
30% identity, 95% coverage: 9:252/256 of query aligns to 11:244/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
N
 
N
V
 
I
S
 
W
L
 
K
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
D
V
 
V
K
 
T
A
 
A
L
 
V
N
 
K
D
 
D
V
 
L
S
 
S
Y
 
L
H
 
E
I
 
I
K
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
L
S
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
R
 
E
P
 
P
S
 
T
Y
 
R
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
R
 
Y
F
 
I
K
 
E
G
 
D
K
 
N
E
 
L
I
 
V
L
 
A
N
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
F
M
 
V
K
 
P
P
 
P
Y
 
K
K
 
E
R
 
R
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
M
A
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
P
H
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
I
K
 
A
L
 
F
G
 
P
R
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Y
 
K
W
 
L
G
 
R
S
 
K
A
 
V
Q
 
P
K
 
K
E
 
Q
E
 
E
V
 
I
E
 
D
H
 
K
R
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
M
L
 
L
Q
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
E
Y
 
L
R
 
L
H
 
N
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
R
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
I
L
 
R
E
 
R
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
S
 
A
S
 
K
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
K
M
 
M
S
 
R
R
 
A
F
 
E
I
 
L
L
 
K
D
 
K
M
 
L
H
 
Q
E
 
R
L
 
Q
K
 
L
N
 
G
M
 
V
T
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
L
 
M
S
 
G
D
 
D
S
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
M
D
 
N
F
 
K
G
 
G
K
 
E
Q
 
L
I
 
Q
G
 
Q
F
 
V
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
D
E
 
E
I
 
V
Q
 
Y
N
 
Y
N
 
K
P
 
P
-
 
V
-
 
N
D
 
T
V
 
F
I
 
V
K
 
A
A
 
G
Y
 
F
I
 
I
G
 
G

Query Sequence

>WP_078429041.1 NCBI__GCF_002019605.1:WP_078429041.1
MGAILEVENVSLQFGGVKALNDVSYHIKEGEIFSLIGPNGAGKTSMLNCISGLYRPSYGS
IRFKGKEILNMKPYKRTTLGIARAFQNIALFAHMSVLDNLKLGRHTLMKSGLLKGGLYWG
SAQKEEVEHRRAVEEVIDFLQLQDYRHTPVGTLSYGLQKRVEVGRALALEPELILLDEPM
AGMNSSEKEDMSRFILDMHELKNMTVVLIEHDLGVVMDLSDSIAVLDFGKQIGFGTPAEI
QNNPDVIKAYIGEEAI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory