SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_078430581.1 NCBI__GCF_002019605.1:WP_078430581.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5oasA Crystal structure of malate synthase g from pseudomonas aeruginosa in apo form. (see paper)
65% identity, 99% coverage: 1:721/727 of query aligns to 4:725/728 of 5oasA

query
sites
5oasA
M
 
M
K
 
T
D
 
E
Y
 
R
L
 
V
S
 
Q
V
 
V
G
 
G
N
 
G
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
K
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
G
L
 
V
T
 
S
S
 
A
E
 
D
Q
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
T
S
 
G
M
 
A
E
 
E
T
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
N
E
 
D
F
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
K
N
 
N
K
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
K
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
K
I
 
I
S
 
D
Q
 
G
W
 
W
H
 
H
K
 
Q
E
 
A
N
 
R
K
 
A
D
 
G
N
 
Q
-
 
A
F
 
H
N
 
D
F
 
A
E
 
V
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
T
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
E
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
A
E
 
E
D
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
A
T
 
G
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
V
 
A
L
 
R
Q
 
M
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
M
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
S
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
R
D
 
A
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
V
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
E
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
H
K
 
V
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
S
Y
 
Y
T
 
S
I
 
V
S
 
K
K
 
N
D
 
G
Q
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
K
G
 
N
G
 
G
Q
 
S
T
 
E
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
N
A
 
A
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
L
A
 
A
Y
 
F
Q
 
Q
G
 
G
H
 
D
P
 
A
E
 
A
D
 
K
L
 
P
S
 
Q
T
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
H
N
 
N
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
F
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
S
H
 
S
S
 
P
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
T
D
 
D
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
E
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
C
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
D
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
V
V
 
I
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
M
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
E
T
 
E
F
 
V
F
 
S
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
S
T
 
T
L
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
T
L
 
M
N
 
N
S
 
P
E
 
D
R
 
R
S
 
V
Y
 
Y
T
 
T
S
 
R
L
 
A
S
 
D
G
 
G
D
 
S
T
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
x
H
G
|
G
R
|
R
S
 
S
L
 
L
M
 
L
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
K
N
 
D
G
 
G
Q
 
N
E
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
Q
D
 
D
C
 
G
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
D
L
 
L
L
 
N
K
 
G
N
 
N
S
 
T
K
 
S
R
 
R
T
 
K
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
E
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
N
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
G
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
R
N
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
K
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
A
M
 
V
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
A
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
E
T
 
K
W
 
W
L
 
I
Q
 
G
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
N
S
 
N
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
T
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
W
 
W
A
 
A
S
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
H
L
 
P
K
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
T
A
 
A
W
 
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
F
F
 
A
V
 
R
Q
 
Q
N
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
A
K
 
K
G
 
R
I
 
T
T
 
P
D
 
A
L
 
S
K
 
V
D
 
D
S
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
P
N
 
N
S
 
T
N
 
N
W
 
W
S
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
Q
 
K
N
 
N
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
N
N
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
S
E
 
Q
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
E
 
E
T
 
S
M
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
S
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
C
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
E
G
 
G
I
 
T
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
V
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
K

5vfbA 1.36 angstrom resolution crystal structure of malate synthase g from pseudomonas aeruginosa in complex with glycolic acid.
65% identity, 99% coverage: 5:721/727 of query aligns to 4:721/724 of 5vfbA

query
sites
5vfbA
L
 
V
S
 
Q
V
 
V
G
 
G
N
 
G
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
K
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
G
L
 
V
T
 
S
S
 
A
E
 
D
Q
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
T
S
 
G
M
 
A
E
 
E
T
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
N
E
 
D
F
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
K
N
 
N
K
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
K
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
K
I
 
I
S
 
D
Q
 
G
W
 
W
H
 
H
K
 
Q
E
 
A
N
 
R
K
 
A
D
 
G
N
 
Q
-
 
A
F
 
H
N
 
D
F
 
A
E
 
V
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
T
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
E
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
A
E
 
E
D
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
A
T
 
G
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
V
 
A
L
 
R
Q
 
M
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
M
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
S
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
R
D
 
A
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
V
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
E
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
H
K
 
V
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
S
Y
 
Y
T
 
S
I
 
V
S
 
K
K
 
N
D
 
G
Q
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
K
G
 
N
G
 
G
Q
 
S
T
 
E
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
N
A
 
A
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
L
A
 
A
Y
 
F
Q
 
Q
G
 
G
H
 
D
P
 
A
E
 
A
D
 
K
L
 
P
S
 
Q
T
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
H
N
 
N
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
F
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
S
H
 
S
S
 
P
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
T
D
 
D
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
E
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
C
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
D
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
V
V
 
I
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
M
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
E
T
 
E
F
 
V
F
 
S
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
S
T
 
T
L
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
T
L
 
M
N
 
N
S
 
P
E
 
D
R
 
R
S
 
V
Y
 
Y
T
 
T
S
 
R
L
 
A
S
 
D
G
 
G
D
 
S
T
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
H
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
L
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
K
N
 
D
G
 
G
Q
 
N
E
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
Q
D
 
D
C
 
G
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
D
L
 
L
L
 
N
K
 
G
N
 
N
S
 
T
K
 
S
R
 
R
T
 
K
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
E
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
N
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
G
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
R
N
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
K
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
|
G
F
 
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
A
M
 
V
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
A
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
E
T
 
K
W
 
W
L
 
I
Q
 
G
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
N
S
 
N
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
T
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
W
 
W
A
 
A
S
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
H
L
 
P
K
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
F
F
 
A
V
 
R
Q
 
Q
N
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
A
K
 
K
G
 
R
I
 
T
T
 
P
D
 
A
L
 
S
K
 
V
D
 
D
S
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
P
N
 
N
S
 
T
N
 
N
W
 
W
S
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
Q
 
K
N
 
N
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
N
N
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
S
E
 
Q
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
E
 
E
T
 
S
M
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
S
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
C
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
V
K
 
E
G
 
G
I
 
T
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
V
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
K

6axeA Crystal structure of a malate synthase g from mycobacterium marinum bound to acetyl coa
59% identity, 99% coverage: 1:721/727 of query aligns to 2:727/729 of 6axeA

query
sites
6axeA
M
 
M
K
 
T
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
V
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
Q
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
T
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
R
 
T
R
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
H
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
L
N
 
D
F
 
P
E
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
A
V
 
P
E
 
E
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
|
V
P
 
P
V
 
I
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
|
R
Y
x
F
A
 
A
L
 
L
N
|
N
A
|
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
S
E
 
E
E
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
A
N
 
G
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
K
 
T
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
K
I
 
V
S
 
E
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
S
H
 
L
S
 
A
G
 
D
G
 
-
Q
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
L
 
L
Q
 
A
D
 
D
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
T
P
 
A
E
 
E
D
 
N
L
 
P
S
 
K
T
 
S
I
 
I
L
 
L
L
 
L
K
 
A
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
A
S
 
T
D
 
D
Q
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
D
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
R
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
S
A
 
E
T
 
D
F
 
V
F
 
T
K
 
K
G
 
-
N
 
-
Q
 
K
T
 
T
L
 
F
T
 
T
R
|
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
T
E
 
D
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
H
G
 
G
D
 
G
T
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
L
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
-
 
S
D
 
D
P
 
A
N
 
E
G
 
G
Q
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
P
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
R
K
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
A
N
 
N
S
 
G
K
 
L
R
 
L
T
 
T
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
G
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
A
M
 
M
K
 
K
S
 
N
S
 
T
T
 
A
W
 
W
L
 
I
Q
 
K
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
A
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
A
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
T
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
|
P
S
 
S
P
|
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
M
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
F
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
Q
K
 
G
G
 
K
I
 
T
T
 
R
D
 
T
L
 
S
K
 
V
D
 
D
S
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
|
C
S
 
S
K
|
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
N
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
E
Q
 
D
V
 
A
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
K
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
R
 
H
P
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
D
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
L
K
 
K
Q
 
A
K
 
R

P9WK16 Malate synthase G; EC 2.3.3.9 from Mycobacterium tuberculosis (strain CDC 1551 / Oshkosh) (see paper)
59% identity, 99% coverage: 1:723/727 of query aligns to 1:726/741 of P9WK16

query
sites
P9WK16
M
 
M
K
 
T
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
 
D
C
 
F
E
 
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
V
F
 
D
K
 
K
G
 
D
N
 
G
Q
 
T
T
 
A
L
 
F
T
 
L
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
K
K
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
V
N
 
N
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
 
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
 
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

4ex4B The structure of glcb from mycobacterium leprae
59% identity, 99% coverage: 3:721/727 of query aligns to 1:721/721 of 4ex4B

query
sites
4ex4B
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
V
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
N
S
 
P
E
 
N
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
S
S
 
G
M
 
V
E
 
A
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
S
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
H
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
F
N
 
D
F
 
V
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
S
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
M
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
T
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
S
G
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
M
D
 
D
Q
 
Q
V
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
A
N
 
S
A
 
D
S
 
S
H
 
W
K
 
T
D
 
N
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
V
T
 
S
I
 
I
S
 
F
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
Q
V
 
I
V
 
A
H
 
-
S
 
I
G
 
G
G
 
T
Q
 
N
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
S
A
 
P
T
 
E
K
 
K
L
 
F
V
 
V
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
R
D
 
S
L
 
N
S
 
W
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
A
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
V
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
T
D
 
D
Q
 
P
A
 
V
G
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
D
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
R
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
x
N
K
|
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
T
A
 
E
T
 
E
F
 
V
F
 
N
K
 
K
G
 
D
N
 
G
Q
 
K
T
 
T
L
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
A
E
 
D
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
S
 
T
L
 
P
S
 
D
G
 
G
D
 
G
T
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
L
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
T
T
 
T
N
 
S
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
L
D
 
V
P
 
D
N
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
-
 
K
-
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
D
 
D
C
 
A
M
 
V
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
A
A
 
A
K
 
I
H
|
H
D
 
G
L
 
L
L
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
E
K
 
A
N
|
N
S
 
G
K
 
P
R
x
L
T
|
T
N
|
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
G
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
A
M
 
M
K
 
K
S
 
N
S
 
S
T
 
T
W
 
W
L
 
I
Q
 
K
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
A
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
W
 
W
A
 
A
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
P
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
T
T
 
T
A
 
A
W
 
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
M
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
K
 
T
K
 
G
G
 
Q
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
V
D
 
D
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
K
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
D
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
I
G
 
G
C
 
C
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
N
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
 
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
Q
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
Q

2gq3A Mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with magnesium, malate, and coenzyme a (see paper)
59% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:719/720 of 2gq3A

query
sites
2gq3A
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
P
D
 
-
N
 
-
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
|
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
|
R
Y
x
F
A
 
A
L
 
L
N
|
N
A
|
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
V
F
 
D
K
|
K
G
 
D
N
 
G
Q
 
T
T
 
A
L
 
F
T
 
L
R
|
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
|
H
D
 
G
L
 
L
L
x
K
K
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
V
N
|
N
S
x
G
K
 
P
R
x
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
 
W
V
 
V
P
|
P
S
 
S
P
|
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
-
N
 
-
S
 
-
N
 
K
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
|
C
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

6dnpA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 2-f-3-methyl-6-f-phenyldiketoacid (see paper)
59% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:711/712 of 6dnpA

query
sites
6dnpA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
-
K
 
K
N
 
A
S
 
S
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
|
G
F
 
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

6dkoA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 2,6-f-phenyldiketoacid (see paper)
59% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:715/716 of 6dkoA

query
sites
6dkoA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
V
F
 
F
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
L
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
K
K
 
A
N
 
S
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
|
G
F
 
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
A
N
 
-
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

6bu1A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 2-br-3-oh-phenyldiketoacid (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 1:711/712 of 6bu1A

query
sites
6bu1A
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
K
K
 
A
N
 
S
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
|
G
F
 
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
x
V
R
|
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

3sb0A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 4-(2-chloro-6-fluoro-3-methylphenyl)-2,4-dioxobutanoic acid inhibitor (see paper)
59% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:707/708 of 3sb0A

query
sites
3sb0A
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
I
D
 
D
N
 
-
F
 
-
N
 
-
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
-
K
 
K
N
 
A
S
 
S
K
 
D
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
|
G
F
 
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5c9wA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with (z)-n-(2-bromophenyl)-2-(hydroxyimino)acetamide (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:712/713 of 5c9wA

query
sites
5c9wA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
D
 
I
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
-
 
K
L
 
A
K
 
S
N
 
D
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
x
V
R
|
R
K
 
K
S
 
G
D
x
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5c9rA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 3-((4-chlorophenyl)thio)propanoic acid (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:716/717 of 5c9rA

query
sites
5c9rA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
V
F
 
L
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
-
 
K
L
 
A
K
 
S
N
 
D
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5e9xA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 2-chloro-6h-thieno[2,3-b]pyrrole-5-carboxylic acid (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:714/715 of 5e9xA

query
sites
5e9xA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
P
D
 
-
N
 
-
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
|
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
V
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
K
K
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
V
N
 
N
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
 
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
|
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5cbbA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 5-(3h-indol-3-ylidene)-2,5-dihydro-1h-pyrazole-3- carboxylate (see paper)
59% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:712/713 of 5cbbA

query
sites
5cbbA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
I
D
 
D
N
 
-
F
 
-
N
 
-
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
|
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
K
K
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
V
N
 
N
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
|
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
|
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5cbiA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 5-chloro-2-hydroxybenzonitrile (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:718/719 of 5cbiA

query
sites
5cbiA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
|
L
Q
x
N
R
 
A
R
 
R
E
x
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
x
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
|
Y
D
|
D
A
 
A
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
V
T
 
D
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
K
K
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
V
N
 
N
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
|
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
x
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
|
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

6c2xA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 2-br-6-me-phenyldiketoacid (see paper)
59% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:710/711 of 6c2xA

query
sites
6c2xA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
-
K
 
R
D
 
V
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
F
T
 
L
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
-
K
 
-
N
 
K
S
 
A
K
 
S
R
 
D
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
|
G
F
 
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5drcA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 2-hydroxy-4-(1h-indol-3-yl)-4-oxobut-2-enoic acid (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:715/716 of 5drcA

query
sites
5drcA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
V
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
-
 
K
L
 
A
K
 
S
N
 
D
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
|
G
F
 
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
|
R
K
 
K
S
 
G
D
x
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
 
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5cjmA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 4h-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxylic acid (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:710/711 of 5cjmA

query
sites
5cjmA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
V
-
 
I
D
 
E
N
 
P
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
|
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
-
K
 
-
N
 
K
S
 
A
K
 
S
R
 
D
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
 
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
 
M
E
|
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5cczA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 3-(4-fluorophenyl)-4-methyl-1h-pyrazol-5-amine (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:712/713 of 5cczA

query
sites
5cczA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
R
K
 
P
D
 
-
N
 
-
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
|
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
 
H
D
 
G
L
 
L
L
 
K
K
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
V
N
 
N
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
|
W
V
 
V
P
|
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
|
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

5cjnA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis malate synthase in complex with 3-(3-oxo-3,4-dihydroquinoxalin-2-yl)acrylate (see paper)
58% identity, 99% coverage: 3:723/727 of query aligns to 2:711/712 of 5cjnA

query
sites
5cjnA
D
 
D
Y
 
R
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
D
F
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
I
T
 
D
S
 
P
E
 
D
Q
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
A
S
 
G
M
 
V
E
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
N
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
W
H
 
H
K
 
R
E
 
R
N
 
-
K
 
-
D
 
-
N
 
-
F
 
I
N
 
D
F
 
M
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
T
D
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
L
 
P
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
T
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Q
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
T
L
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
V
|
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
P
G
 
T
Y
 
Y
N
 
N
P
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
R
D
 
K
F
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
V
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
S
N
 
S
A
 
G
S
 
S
H
 
F
K
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
T
K
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
Q
K
 
D
D
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
A
H
 
L
S
 
P
G
 
D
G
 
-
Q
 
K
T
 
S
T
 
T
E
 
G
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
A
 
P
T
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
H
 
A
P
 
A
E
 
E
D
 
S
L
 
P
S
 
T
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
I
N
 
N
N
 
H
G
 
G
L
 
L
H
 
H
F
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
P
D
 
E
H
 
S
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
T
S
 
T
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
M
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
D
|
D
C
 
F
E
|
E
D
 
D
S
|
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
E
 
L
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
W
 
W
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
x
N
K
|
K
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
R
D
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
E
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
L
 
P
S
 
G
G
 
G
D
 
G
T
 
Q
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L
M
 
M
F
 
F
V
 
V
R
|
R
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
M
 
M
T
 
T
N
 
N
N
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
M
D
 
D
C
 
A
M
 
L
I
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
I
H
|
H
D
 
G
L
 
L
L
x
K
K
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
V
N
|
N
S
 
G
K
 
P
R
 
L
T
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
R
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
C
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
S
R
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
L
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
E
|
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
N
 
A
C
 
C
I
 
I
N
 
K
E
 
A
V
 
A
K
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
|
L
D
|
D
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
M
 
I
H
 
H
T
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
S
 
G
D
 
T
M
 
M
K
 
K
S
 
S
S
 
Q
T
 
P
W
 
W
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
S
 
H
N
 
N
V
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
|
M
W
 
W
A
 
T
S
 
M
P
 
T
D
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
A
E
 
D
M
 
M
L
 
V
K
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
P
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
S
T
 
T
A
 
A
W
 
W
V
 
V
P
 
P
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
A
F
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
E
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
G
G
 
K
I
 
R
T
 
R
D
 
A
L
 
T
K
 
I
D
 
E
S
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
E
S
 
L
N
 
A
W
 
W
S
 
A
A
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
R
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
N
N
 
N
A
 
C
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
R
 
R
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
N
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
|
M
E
|
E
D
|
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
H
 
L
V
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
I
 
L
H
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
V
C
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
S
M
 
L
K
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
P
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
R
Q
 
Q
N
 
N
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
A
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
M
 
M
A
 
A
T
 
P
D
 
N
F
 
F
D
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
F
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
F
K
 
K
Q
 
A
K
 
R
F
 
A
A
 
A

Query Sequence

>WP_078430581.1 NCBI__GCF_002019605.1:WP_078430581.1
MKDYLSVGNLQVASALYKFVNTEALPGSGLTSEQFWSSMETLITEFAPENKELLQRREEL
QTAISQWHKENKDNFNFEAYKTFLLDIGYLELEVEDFEITTQNVDEEIVLQAGPQLVVPV
NNARYALNAANARWGSLYDALYGTDAIPEEDGAERGKGYNPVRGEKVISFAKDFLDQVVP
LVNASHKDVEKYTISKDQLVVVHSGGQTTELQDATKLVAYQGHPEDLSTILLKNNGLHFE
IQIDRDHSIGKSDQAGVKDVLMESALTTIMDCEDSVAAVDAEDKVEVYRNWLGLMKGDLT
ATFFKGNQTLTRDLNSERSYTSLSGDTLTLRGRSLMFVRNVGHLMTNNAVLDPNGQEVPE
GILDCMITSLIAKHDLLKNSKRTNSTKGSIYIVKPKMHGSKEVAFSNQLFNRVEDLLGLE
RNTLKIGVMDEERRTSLNLKNCINEVKERVVFINTGFLDRTGDEMHTSMEAGPMIRKSDM
KSSTWLQSYEQSNVNVGLACGLQGRAQIGKGMWASPDLMAEMLKQKVGQLKAGANTAWVP
SPTAATLHALHYHQVEVPFVQNELKKGITDLKDSILEIPVAANSNWSAEEVQNELDNNAQ
GILGYVVRWVDQGVGCSKVPDINNVGLMEDRATLRISSQHVANWIHHGICTEEQVLETMK
RMAAVVDEQNEGDPEYRPMATDFDNSVAFQAACELVFKGIEQPSGYTEPILHRRRIEAKQ
KFAAQTK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory