SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_078716775.1 NCBI__GCF_900167125.1:WP_078716775.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
45% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 3:248/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
K
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
V
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
T
T
 
T
W
 
L
N
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
A
T
 
L
A
 
G
S
 
A
E
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
K
G
 
G
Q
 
V
L
 
T
P
 
D
E
 
D
N
 
R
R
 
V
E
 
T
V
 
V
L
 
A
I
 
V
F
 
F
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
T
 
P
A
 
W
L
 
L
K
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
E
A
 
V
L
 
L
Q
 
K
N
 
G
E
 
S
P
 
P
G
 
-
M
 
V
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
M
 
V
Y
 
S
P
 
S
A
 
E
A
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
A
M
 
M
L
 
L
L
 
L
D
 
E
V
 
T
G
 
G
A
 
C
S
 
K
W
 
Y
V
 
A
L
 
L
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
E
A
 
T
F
 
F
V
 
I
G
 
N
R
 
H
K
 
K
T
 
V
A
 
H
F
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
E
N
 
E
N
 
G
L
 
L
N
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
R
D
 
G
R
 
L
V
 
Q
E
 
E
E
 
R
V
 
V
L
 
F
S
 
Q
E
 
R
Q
 
Q
L
 
V
E
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
C
A
 
A
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
D
D
 
E
S
 
Q
-
 
F
-
 
G
-
 
R
L
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
A
A
 
Q
T
 
E
T
 
A
H
 
H
T
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
K
 
S
K
 
K
I
 
L
E
 
R
E
 
L
L
 
L
L
 
Y
-
 
G
P
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
D
E
 
S
I
 
T
S
 
P
I
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
D
 
D
N
 
N
I
 
T
S
 
V
A
 
G
I
 
L
M
 
M
T
 
S
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
A
E
 
D
S
 
S
F
 
F
S
 
L
K
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
K
A
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
44% identity, 97% coverage: 2:245/251 of query aligns to 403:642/654 of P36204

query
sites
P36204
K
 
K
Q
 
L
L
 
I
M
 
L
A
 
A
A
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
Y
 
H
K
 
K
T
 
T
W
 
I
N
 
S
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
K
T
 
F
A
 
V
S
 
S
E
 
L
L
 
L
A
 
V
Q
 
N
N
 
E
I
 
L
R
 
H
G
 
D
Q
 
V
L
 
-
P
 
-
E
 
K
N
 
E
R
 
F
E
 
E
V
 
I
L
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
S
G
 
E
V
 
V
A
 
G
E
 
E
A
 
I
L
 
L
Q
 
S
N
 
G
E
 
R
P
 
-
G
 
N
M
 
I
A
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
V
Y
 
F
P
 
Y
A
 
E
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
L
M
 
M
L
 
L
L
 
Q
D
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
E
W
 
Y
V
 
V
L
 
I
T
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
R
V
 
I
L
 
F
G
 
K
E
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
E
F
 
F
V
 
I
G
 
N
R
 
R
K
 
K
T
 
V
A
 
K
F
 
A
A
 
V
L
 
L
N
 
E
N
 
K
N
 
G
L
 
M
N
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
K
D
 
G
R
 
L
V
 
T
E
 
F
E
 
C
V
 
V
L
 
V
S
 
E
E
 
K
Q
 
Q
L
 
V
E
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
F
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
D
S
 
K
D
 
E
S
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
R
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
Q
E
 
Q
I
 
A
A
 
Q
T
 
E
T
 
V
H
 
H
T
 
A
F
 
F
V
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
L
I
 
L
E
 
S
E
 
E
L
 
M
L
 
Y
P
 
D
-
 
E
S
 
E
I
 
T
A
 
A
S
 
G
E
 
S
I
 
I
S
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
I
 
F
S
 
L
A
 
G
I
 
L
M
 
I
T
 
V
L
 
Q
D
 
K
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
-
E
 
E
S
 
S
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
42% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 9:253/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
K
 
K
Q
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
N
Q
 
G
A
 
S
R
 
R
D
 
D
T
 
D
A
 
N
S
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
L
Q
 
K
N
 
L
I
 
L
-
 
S
R
 
E
G
 
A
Q
 
H
L
 
F
P
 
D
E
 
D
N
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
S
T
 
V
A
 
F
L
 
L
K
 
H
G
 
E
V
 
I
A
 
R
E
 
K
A
 
S
L
 
L
Q
 
K
N
 
K
E
 
E
P
 
I
G
 
H
M
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
-
A
 
-
Q
 
Q
N
 
N
M
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
S
E
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
A
M
 
M
L
 
I
L
 
R
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
C
S
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
N
V
 
I
L
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
A
 
E
F
 
L
V
 
I
G
 
A
R
 
E
K
 
K
T
 
V
A
 
Q
F
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
A
N
 
E
N
 
G
L
 
L
N
 
S
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
N
R
 
K
V
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
C
S
 
V
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
K
A
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
N
E
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
S
G
 
A
L
 
D
T
 
E
S
 
W
D
 
K
S
 
R
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
Q
E
 
Q
I
 
A
A
 
Q
T
 
E
T
 
V
H
 
H
T
 
N
F
 
F
V
 
L
R
 
R
K
 
K
K
 
W
I
 
F
E
 
K
E
 
T
L
 
N
L
 
A
P
 
P
S
 
N
-
 
G
I
 
V
A
 
D
S
 
E
E
 
K
I
 
I
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
D
 
A
N
 
N
I
 
C
S
 
K
A
 
E
I
 
L
M
 
A
T
 
Q
L
 
Q
D
 
H
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
P
E
 
E
S
 
-
F
 
F
S
 
T
K
 
E
I
 
I
V
 
C
L
 
K
A
 
A

5zfxB Crystal structure of triosephosphate isomerase from opisthorchis viverrini (see paper)
44% identity, 95% coverage: 2:240/251 of query aligns to 2:236/248 of 5zfxB

query
sites
5zfxB
K
 
K
Q
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
N
Q
 
G
A
 
S
R
 
K
D
 
K
T
 
E
A
 
N
S
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
I
Q
x
E
N
 
M
I
 
L
-
 
T
R
x
H
G
 
A
Q
 
K
L
 
I
P
 
D
E
 
P
N
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
A
T
 
L
A
 
Y
L
 
L
K
 
P
G
 
S
V
 
V
A
 
R
E
 
E
A
 
K
L
 
L
Q
 
D
N
 
K
E
 
R
P
 
F
G
 
H
M
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
-
A
 
-
Q
 
Q
N
 
N
M
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
P
E
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
A
M
 
M
L
 
L
L
 
K
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
C
S
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
I
L
 
L
G
 
L
E
 
E
D
 
T
N
 
D
A
 
Q
F
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
E
K
 
K
T
 
T
A
 
N
F
 
H
A
 
A
L
 
I
N
 
S
N
 
A
N
 
G
L
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
K
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
C
S
 
F
E
 
R
Q
 
Q
L
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
I
L
 
R
A
 
K
E
 
N
I
 
L
P
 
S
V
 
S
G
 
A
L
 
D
T
 
M
S
 
W
D
 
N
S
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
|
A
I
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
E
x
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
E
D
 
Q
E
 
Q
I
 
A
A
 
Q
T
 
E
T
 
V
H
 
H
T
 
L
F
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
R
K
 
W
I
 
M
E
 
E
E
 
E
L
 
K
L
 
V
-
 
S
P
 
P
S
 
A
I
 
V
A
 
A
S
 
K
E
 
S
I
 
I
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
D
 
A
N
 
N
I
 
C
S
 
R
A
 
T
I
 
L
M
 
A
T
 
K
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L

8w06B Crystal structure of the reconstruction of the ancestral triosephosphate isomerase of the last opisthokont common ancestor obtained by maximum likelihood with pgh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 2:243/251 of query aligns to 5:241/251 of 8w06B

query
sites
8w06B
K
 
K
Q
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
G
T
 
T
W
 
I
N
 
E
Q
 
S
A
 
I
R
 
K
D
 
S
T
 
L
A
 
V
S
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
N
Q
 
N
N
 
-
I
 
-
R
 
-
G
 
A
Q
 
E
L
 
L
P
 
D
E
 
D
N
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Y
L
 
L
K
 
P
G
 
L
V
 
V
A
 
R
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
Q
 
R
N
 
K
E
 
D
P
 
I
G
 
Q
M
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
-
A
 
-
Q
 
Q
N
 
N
M
 
C
Y
 
Y
P
 
T
A
 
K
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
A
D
 
E
M
 
M
L
 
L
L
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
I
S
 
P
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
V
 
I
L
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
A
 
E
F
 
F
V
 
V
G
 
A
R
 
E
K
 
K
T
 
T
A
 
K
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
N
N
 
G
L
 
L
N
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
T
E
 
M
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
T
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
K
A
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
D
E
 
K
I
 
I
P
 
S
V
 
E
G
 
S
L
 
D
T
 
W
S
 
S
D
 
-
S
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
A
A
 
Q
T
 
E
T
 
V
H
 
H
T
 
A
F
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
W
I
 
L
-
 
A
E
 
E
E
 
N
L
 
V
L
 
S
P
 
A
S
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
S
I
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
G
D
 
G
N
 
N
I
 
C
S
 
K
A
 
E
I
 
L
M
 
A
T
 
K
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
P
E
 
E

P00942 Triosephosphate isomerase; TIM; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
43% identity, 96% coverage: 4:243/251 of query aligns to 6:239/248 of P00942

query
sites
P00942
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
N
Q
 
G
A
 
S
R
 
K
D
 
Q
T
 
S
A
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
V
Q
 
E
N
 
R
I
 
L
R
 
N
-
 
T
G
 
A
Q
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
E
N
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
A
T
 
T
A
 
Y
L
 
L
K
 
D
G
 
-
V
 
Y
A
 
S
E
 
V
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
N
 
K
E
 
K
P
 
P
G
 
Q
M
 
V
A
 
T
A
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
A
Y
 
Y
P
 
L
A
 
K
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
N
S
 
S
P
 
V
D
 
D
M
 
Q
L
 
I
L
 
K
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
K
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
S
V
 
Y
L
 
F
G
 
H
E
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
K
F
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
G
N
 
Q
N
 
G
L
 
V
N
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
K
R
 
K
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
T
E
 
L
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
E
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
N
A
 
A
G
 
V
L
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
V
P
 
K
V
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
D
S
 
W
D
 
T
S
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
Q
T
 
D
T
 
I
H
 
H
T
 
A
F
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
L
-
 
A
E
 
S
E
 
K
L
 
L
L
 
G
P
 
D
S
 
K
I
 
A
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
L
S
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
A
K
 
N
P
 
G
D
 
S
N
 
N
I
 
A
S
 
V
A
 
T
I
 
F
M
 
K
T
 
D
L
 
K
D
 
A
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
41% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 5:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
K
 
K
Q
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
G
T
 
T
W
 
L
N
 
E
Q
 
S
A
 
I
R
 
K
D
 
A
T
 
L
A
 
V
S
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
N
Q
 
S
N
 
-
I
 
-
R
 
-
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
D
E
 
P
N
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Y
L
 
L
K
 
P
G
 
F
V
 
A
A
 
R
E
 
S
A
 
K
L
 
L
Q
 
K
N
 
K
E
 
P
P
 
K
G
 
E
M
 
I
A
 
Q
A
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
C
Y
 
Y
P
 
T
A
 
K
A
 
P
E
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
A
D
 
E
M
 
M
L
 
L
L
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
P
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
T
V
 
I
L
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
A
 
E
F
 
L
V
 
I
G
 
A
R
 
E
K
 
K
T
 
V
A
 
K
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
Q
N
 
G
L
 
L
N
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
T
E
 
M
E
 
E
V
 
V
L
 
V
S
 
A
E
 
R
Q
 
Q
L
 
I
E
 
L
A
 
K
G
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
K
P
 
I
V
 
K
G
 
D
L
 
W
T
 
S
S
 
-
D
 
-
S
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
A
A
 
Q
T
 
E
T
 
V
H
 
H
T
 
A
F
 
A
V
 
L
R
 
R
K
 
K
K
 
W
I
 
L
E
 
K
E
 
E
-
 
N
L
 
V
L
 
S
P
 
P
S
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
S
I
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
A
N
 
N
I
 
C
S
 
K
A
 
E
I
 
L
M
 
A
T
 
K
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
A
E
 
P
S
 
E
F
 
F
S
 
V
K
 
D
I
 
I
V
 
I
L
 
N
A
 
A

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
40% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 6:248/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
K
 
K
Q
 
L
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
G
T
 
S
W
 
Y
N
 
S
Q
 
H
A
 
I
R
 
N
D
 
T
T
 
F
A
 
F
S
 
D
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
Q
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
K
G
 
A
Q
 
D
L
 
T
P
 
D
E
 
P
N
 
N
R
 
A
E
 
D
V
 
I
L
 
V
I
 
I
F
 
G
P
 
V
P
 
P
F
 
A
T
 
C
A
 
Y
L
 
L
K
 
K
G
 
Y
V
 
A
A
 
Q
E
 
D
A
 
-
L
 
-
Q
 
K
N
 
A
E
 
P
P
 
K
G
 
G
M
 
I
A
 
K
A
 
I
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
N
 
N
M
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
G
E
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
T
D
 
E
M
 
M
L
 
I
L
 
K
D
 
D
V
 
C
G
 
G
A
 
C
S
 
E
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
I
L
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
N
A
 
E
F
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
E
K
 
K
T
 
V
A
 
K
F
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
S
N
 
G
L
 
L
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
P
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
T
E
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
C
S
 
F
E
 
A
Q
 
Q
L
 
M
E
 
D
A
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
K
E
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
S
G
 
K
L
 
E
T
 
A
S
 
W
D
 
D
S
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
A
E
 
Q
I
 
A
A
 
Q
T
 
E
T
 
V
H
 
H
T
 
K
F
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
D
K
 
W
I
 
I
E
 
R
E
 
K
L
 
H
L
 
V
P
 
D
S
 
A
-
 
G
I
 
I
A
 
A
S
 
D
E
 
K
I
 
V
S
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
D
 
S
N
 
N
I
 
A
S
 
K
A
 
D
I
 
L
M
 
G
T
 
T
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
P
E
 
D
S
 
F
F
 
I
S
 
T
K
 
I
I
 
I

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
40% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 3:249/253 of P00943

query
sites
P00943
K
 
K
Q
 
P
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
Y
x
H
K
|
K
T
 
T
W
 
L
N
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
V
E
 
Q
L
 
F
A
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
R
 
K
G
 
G
Q
 
H
L
 
V
P
 
P
E
 
P
N
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
-
 
S
-
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
F
T
 
L
A
 
F
L
 
L
K
 
D
G
 
R
V
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
A
Q
 
D
N
 
G
E
 
T
P
 
-
G
 
D
M
 
L
A
 
K
A
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
T
M
 
M
Y
 
H
P
 
F
A
 
A
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
V
M
 
M
L
 
L
L
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
W
 
Y
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
V
 
M
L
 
F
G
 
A
E
 
E
D
 
T
N
 
D
A
 
E
F
 
T
V
 
V
G
 
N
R
 
K
K
 
K
T
 
V
A
 
L
F
 
A
A
 
A
L
 
F
N
 
T
N
 
R
N
 
G
L
 
L
N
 
I
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
A
D
 
G
R
 
Q
V
 
T
E
 
N
E
 
A
V
 
V
L
 
V
S
 
A
E
 
S
Q
 
Q
L
 
V
E
 
E
A
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
E
S
 
Q
L
 
V
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
N
T
 
S
T
 
V
H
 
C
T
 
G
F
 
H
V
 
I
R
 
R
K
 
S
K
 
V
I
 
V
E
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
F
-
 
G
P
 
P
S
 
E
I
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
A
I
 
I
S
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
I
 
I
S
 
R
A
 
D
I
 
F
M
 
L
T
 
A
L
 
Q
D
 
Q
N
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
E
A
 
P
E
 
A
S
 
S
F
 
F
S
 
L
K
 
Q
I
 
L
V
 
V
L
 
E
A
 
A

3ypiA Electrophilic catalysis in triosephosphase isomerase: the role of histidine-95 (see paper)
43% identity, 96% coverage: 4:243/251 of query aligns to 5:238/247 of 3ypiA

query
sites
3ypiA
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
N
Q
 
G
A
 
S
R
 
K
D
 
Q
T
 
S
A
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
V
Q
 
E
N
 
R
I
 
L
R
 
N
-
 
T
G
 
A
Q
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
E
N
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
A
T
 
T
A
 
Y
L
 
L
K
 
D
G
 
-
V
 
Y
A
 
S
E
 
V
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
N
 
K
E
 
K
P
 
P
G
 
Q
M
 
V
A
 
T
A
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
A
Y
 
Y
P
 
L
A
 
K
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
N
S
 
S
P
 
V
D
 
D
M
 
Q
L
 
I
L
 
K
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
K
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
x
Q
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
S
V
 
Y
L
 
F
G
 
H
E
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
K
F
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
G
N
 
Q
N
 
G
L
 
V
N
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
K
R
 
K
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
T
E
 
L
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
E
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
N
A
 
A
G
 
V
L
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
V
P
 
K
V
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
D
S
 
W
D
 
T
S
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
Q
T
 
D
T
 
I
H
 
H
T
 
A
F
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
L
-
 
A
E
 
S
E
 
K
L
 
L
L
 
G
P
 
D
S
 
K
I
 
A
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
L
S
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
P
 
G
D
 
S
N
 
N
I
 
A
S
 
V
A
 
T
I
 
F
M
 
K
T
 
D
L
 
K
D
 
A
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
P
E
 
E

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
40% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 2:248/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
K
 
K
Q
 
P
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
H
K
 
K
T
 
T
W
 
L
N
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
V
E
 
Q
L
 
F
A
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
R
 
K
G
 
G
Q
 
H
L
 
V
P
 
P
E
 
P
N
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
-
 
S
-
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
F
T
 
L
A
 
F
L
 
L
K
 
D
G
 
R
V
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
A
Q
 
D
N
 
G
E
 
T
P
 
-
G
 
D
M
 
L
A
 
K
A
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
T
M
 
M
Y
 
H
P
 
F
A
 
A
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
V
M
 
M
L
 
L
L
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
W
 
Y
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
V
 
M
L
 
F
G
 
A
E
 
E
D
 
T
N
 
D
A
 
E
F
 
T
V
 
V
G
 
N
R
 
K
K
 
K
T
 
V
A
 
L
F
 
A
A
 
A
L
 
F
N
 
T
N
 
R
N
 
G
L
 
L
N
 
I
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
A
D
 
G
R
 
Q
V
 
T
E
 
N
E
 
A
V
 
V
L
 
V
S
 
A
E
 
S
Q
 
Q
L
 
V
E
 
E
A
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
E
S
 
Q
L
 
V
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
N
T
 
S
T
 
V
H
 
C
T
 
G
F
 
H
V
 
I
R
 
R
K
 
S
K
 
V
I
 
V
E
 
S
E
 
R
L
 
L
L
 
F
-
 
G
P
 
P
S
 
E
I
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
A
I
 
I
S
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
I
 
I
S
 
R
A
 
D
I
 
F
M
 
L
T
 
A
L
 
Q
D
 
Q
N
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
E
A
 
P
E
 
A
S
 
S
F
 
F
S
 
L
K
 
Q
I
 
L
V
 
V
L
 
E
A
 
A

4ff7B Structure of c126s mutant of saccharomyces cerevisiae triosephosphate isomerase (see paper)
43% identity, 96% coverage: 4:243/251 of query aligns to 5:238/247 of 4ff7B

query
sites
4ff7B
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
N
Q
 
G
A
 
S
R
 
K
D
 
Q
T
 
S
A
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
V
Q
 
E
N
 
R
I
 
L
R
 
N
-
 
T
G
 
A
Q
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
E
N
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
A
T
 
T
A
 
Y
L
 
L
K
 
D
G
 
-
V
 
Y
A
 
S
E
 
V
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
N
 
K
E
 
K
P
 
P
G
 
Q
M
 
V
A
 
T
A
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
A
Y
 
Y
P
 
L
A
 
K
A
|
A
E
x
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
N
S
 
S
P
 
V
D
 
D
M
 
Q
L
 
I
L
 
K
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
K
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
S
V
 
Y
L
 
F
G
 
H
E
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
K
F
|
F
A
 
A
L
 
L
N
 
G
N
 
Q
N
 
G
L
 
V
N
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
K
R
 
K
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
T
E
 
L
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
E
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
N
A
 
A
G
 
V
L
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
V
P
 
K
V
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
D
S
 
W
D
 
T
S
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
Q
T
 
D
T
 
I
H
 
H
T
 
A
F
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
L
-
 
A
E
 
S
E
 
K
L
 
L
L
 
G
P
 
D
S
 
K
I
 
A
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
L
S
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
P
 
G
D
 
S
N
 
N
I
 
A
S
 
V
A
 
T
I
 
F
M
 
K
T
 
D
L
 
K
D
 
A
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
P
E
 
E

4ff7A Structure of c126s mutant of saccharomyces cerevisiae triosephosphate isomerase (see paper)
43% identity, 96% coverage: 4:243/251 of query aligns to 5:238/247 of 4ff7A

query
sites
4ff7A
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
N
Q
 
G
A
 
S
R
 
K
D
 
Q
T
 
S
A
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
V
Q
 
E
N
 
R
I
 
L
R
 
N
-
 
T
G
 
A
Q
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
E
N
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
A
T
 
T
A
 
Y
L
 
L
K
 
D
G
 
-
V
 
Y
A
 
S
E
 
V
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
N
 
K
E
 
K
P
 
P
G
 
Q
M
 
V
A
 
T
A
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
A
Y
 
Y
P
 
L
A
 
K
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
N
S
 
S
P
 
V
D
 
D
M
 
Q
L
 
I
L
 
K
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
K
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
S
V
 
Y
L
 
F
G
 
H
E
 
E
D
 
D
N
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
K
F
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
G
N
 
Q
N
 
G
L
 
V
N
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
K
R
 
K
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
T
E
 
L
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
E
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
N
A
 
A
G
 
V
L
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
V
P
 
K
V
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
D
S
 
W
D
 
T
S
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
Q
T
 
D
T
 
I
H
 
H
T
 
A
F
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
L
-
 
A
E
 
S
E
 
K
L
 
L
L
 
G
P
 
D
S
 
K
I
 
A
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
L
S
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
P
 
G
D
 
S
N
 
N
I
 
A
S
 
V
A
 
T
I
 
F
M
 
K
T
 
D
L
 
K
D
 
A
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
P
E
 
E

P00940 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Gallus gallus (Chicken) (see 3 papers)
41% identity, 96% coverage: 2:243/251 of query aligns to 5:239/248 of P00940

query
sites
P00940
K
 
K
Q
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
W
 
-
N
 
N
Q
 
G
A
 
D
R
 
K
D
 
K
T
 
S
A
 
L
S
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
I
Q
 
H
N
 
T
I
 
L
R
 
N
G
 
G
-
 
A
Q
 
K
L
 
L
P
 
S
E
 
A
N
 
D
R
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
C
F
 
G
P
 
A
P
 
P
F
 
S
T
 
I
A
 
Y
L
 
L
K
 
D
G
 
F
V
 
A
A
 
R
E
 
Q
A
 
K
L
 
L
Q
 
D
N
 
A
E
 
K
P
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
-
A
 
-
Q
 
Q
N
 
N
M
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
P
E
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
A
M
 
M
L
 
I
L
 
K
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
A
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
V
L
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
A
 
E
F
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
Q
K
 
K
T
 
V
A
 
A
F
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
A
N
 
E
N
 
G
L
 
L
N
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
K
I
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
A
D
 
G
R
 
I
V
 
T
E
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
V
S
 
F
E
 
E
Q
 
Q
L
 
T
E
 
K
A
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
D
E
 
N
I
 
V
P
 
K
V
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
D
S
 
W
D
 
S
S
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
P
D
 
Q
E
 
Q
I
 
A
A
 
Q
T
 
E
T
 
V
H
 
H
T
 
E
F
 
K
V
 
L
R
 
R
K
 
G
K
 
W
I
 
L
E
 
K
E
 
S
L
 
H
L
 
V
P
 
S
-
 
D
S
 
A
I
 
V
A
 
A
S
 
Q
E
 
S
I
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
D
 
G
N
 
N
I
 
C
S
 
K
A
 
E
I
 
L
M
 
A
T
 
S
L
 
Q
D
 
H
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 5:249/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
W
 
V
N
 
Q
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
V
S
 
N
E
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
T
N
 
-
I
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
L
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
K
 
D
G
 
A
V
 
L
A
 
T
E
 
T
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
-
 
E
-
 
G
N
 
K
E
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
L
A
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
D
 
V
M
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
L
 
F
G
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
A
 
E
F
 
E
V
 
I
G
 
N
R
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
A
 
I
L
 
F
N
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
N
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
G
R
 
K
V
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
S
S
 
E
D
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
S
 
S
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
N
T
 
E
T
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
K
 
T
I
 
I
E
 
A
E
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
S
S
 
K
I
 
E
A
 
V
S
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
T
-
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
I
 
I
S
 
K
A
 
E
I
 
Y
M
 
M
T
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
V
 
L

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 5:249/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
W
 
V
N
 
Q
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
V
S
 
N
E
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
T
N
 
-
I
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
L
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
K
 
D
G
 
A
V
 
L
A
 
T
E
 
T
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
-
 
E
-
 
G
N
 
K
E
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
L
A
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
D
 
V
M
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
L
 
F
G
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
A
 
E
F
 
E
V
 
I
G
 
N
R
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
A
 
I
L
 
F
N
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
N
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
G
R
 
K
V
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
S
S
 
E
D
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
S
 
S
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
N
T
 
E
T
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
K
 
T
I
 
I
E
 
A
E
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
S
S
 
K
I
 
E
A
 
V
S
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
T
-
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
I
 
I
S
 
K
A
 
E
I
 
Y
M
 
M
T
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
V
 
L

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 7:251/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
W
 
V
N
 
Q
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
V
S
 
N
E
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
T
N
 
-
I
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
L
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
K
 
D
G
 
A
V
 
L
A
 
T
E
 
T
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
-
 
E
-
 
G
N
 
K
E
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
L
A
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
D
 
V
M
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
L
 
F
G
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
A
 
E
F
 
E
V
 
I
G
 
N
R
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
A
 
I
L
 
F
N
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
N
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
G
R
 
K
V
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
S
S
 
E
D
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
S
 
S
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
N
T
 
E
T
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
K
 
T
I
 
I
E
 
A
E
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
S
S
 
K
I
 
E
A
 
V
S
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
T
-
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
I
 
I
S
 
K
A
 
E
I
 
Y
M
 
M
T
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
V
 
L

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 6:250/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
W
 
V
N
 
Q
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
V
S
 
N
E
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
T
N
 
-
I
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
L
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
K
 
D
G
 
A
V
 
L
A
 
T
E
 
T
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
-
 
E
-
 
G
N
 
K
E
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
L
A
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
D
 
V
M
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
L
 
F
G
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
A
 
E
F
 
E
V
 
I
G
 
N
R
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
A
 
I
L
 
F
N
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
N
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
G
R
 
K
V
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
G
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
S
S
 
E
D
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
S
 
S
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
D
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
N
T
 
E
T
 
M
H
 
C
T
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
K
 
T
I
 
I
E
 
A
E
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
S
S
 
K
I
 
E
A
 
V
S
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
T
-
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
I
 
I
S
 
K
A
 
E
I
 
Y
M
 
M
T
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L