SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_078717838.1 NCBI__GCF_900167125.1:WP_078717838.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

6n2oD 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus with 2-oxoglutarate, coenzyme a and succinyl-coa bound (see paper)
33% identity, 82% coverage: 20:228/256 of query aligns to 21:218/291 of 6n2oD

query
sites
6n2oD
P
 
P
T
 
T
H
 
T
Y
x
W
C
|
C
P
 
P
G
 
G
C
|
C
-
 
G
H
 
H
H
 
F
G
 
G
V
 
I
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
V
H
 
Y
R
 
R
L
 
A
V
 
M
G
 
A
E
 
E
L
 
L
-
 
G
L
 
I
D
 
D
E
 
S
M
 
T
K
 
K
L
 
F
R
 
A
E
 
A
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
S
S
 
G
I
|
I
G
|
G
C
|
C
S
|
S
V
 
S
F
x
R
L
 
M
Y
 
P
N
 
Y
Y
 
F
L
 
V
D
 
D
I
 
S
D
 
Y
A
 
K
V
 
M
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
|
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
P
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
T
K
 
Q
R
 
V
A
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
K
 
L
F
 
C
V
 
V
L
 
V
T
 
V
Y
 
A
Q
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
 
G
A
 
F
S
 
S
I
 
I
G
 
G
M
 
G
A
 
G
E
 
H
I
 
M
M
 
P
H
 
H
A
 
M
A
 
A
N
 
R
R
 
K
G
 
N
E
 
V
R
 
N
I
 
M
C
 
T
V
 
Y
V
 
V
F
 
L
V
 
M
N
 
D
N
|
N
T
 
G
V
x
I
Y
 
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
G
x
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
Y
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
S
L
 
R
V
 
P
G
 
E
Q
 
M
R
 
T
T
 
A
T
 
Y
T
 
T
C
 
T
P
 
P
G
 
Y
G
 
G
R
 
G
C
 
P
R
 
E
D
 
N
K
 
P
E
 
M
G
 
N
L
 
P
P
 
L
I
 
L
K
 
Y
M
 
M
T
 
L
E
 
T
I
 
Y
I
 
G
S
 
A
Q
 
T
L
 
Y
G
 
V
G
 
A
V
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
P
S
 
K
L
 
-
D
 
D
S
 
C
V
 
A
K
 
E
N
 
L
I
 
I
R
 
K
T
 
G
A
 
A
K
 
M
K
 
E
Y
 
H
L
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
C
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
-
D
 
-
R
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
N
L
 
I
L
 
F
S
 
S
A
 
Q
C
|
C
P
 
P
T
|
T
N
x
F
W
 
N
K
 
K
M
 
I
P
 
D
P
 
T
V
 
V
Q
 
D

6n2oB 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus with 2-oxoglutarate, coenzyme a and succinyl-coa bound (see paper)
33% identity, 82% coverage: 20:228/256 of query aligns to 21:218/291 of 6n2oB

query
sites
6n2oB
P
 
P
T
 
T
H
 
T
Y
x
W
C
|
C
P
 
P
G
 
G
C
|
C
-
 
G
H
 
H
H
 
F
G
 
G
V
 
I
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
V
H
 
Y
R
 
R
L
 
A
V
 
M
G
 
A
E
 
E
L
 
L
-
 
G
L
 
I
D
 
D
E
 
S
M
 
T
K
 
K
L
 
F
R
 
A
E
 
A
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
S
S
 
G
I
|
I
G
|
G
C
|
C
S
|
S
V
 
S
F
x
R
L
 
M
Y
 
P
N
 
Y
Y
 
F
L
 
V
D
 
D
I
 
S
D
 
Y
A
 
K
V
 
M
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
|
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
P
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
T
K
 
Q
R
 
V
A
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
K
 
L
F
 
C
V
 
V
L
 
V
T
 
V
Y
 
A
Q
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
 
G
A
 
F
S
 
S
I
 
I
G
 
G
M
 
G
A
 
G
E
 
H
I
 
M
M
 
P
H
 
H
A
 
M
A
 
A
N
 
R
R
 
K
G
 
N
E
 
V
R
 
N
I
 
M
C
 
T
V
 
Y
V
 
V
F
 
L
V
 
M
N
 
D
N
|
N
T
 
G
V
x
I
Y
|
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
G
x
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
Y
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
S
L
 
R
V
 
P
G
 
E
Q
 
M
R
 
T
T
 
A
T
x
Y
T
 
T
C
 
T
P
 
P
G
 
Y
G
 
G
R
 
G
C
 
P
R
 
E
D
 
N
K
 
P
E
 
M
G
 
N
L
 
P
P
 
L
I
 
L
K
 
Y
M
 
M
T
 
L
E
 
T
I
 
Y
I
 
G
S
 
A
Q
 
T
L
 
Y
G
 
V
G
 
A
V
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
P
S
 
K
L
 
-
D
 
D
S
 
C
V
 
A
K
 
E
N
 
L
I
 
I
R
 
K
T
 
G
A
 
A
K
 
M
K
 
E
Y
 
H
L
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
C
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
-
D
 
-
R
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
N
L
 
I
L
 
F
S
 
S
A
 
Q
C
|
C
P
 
P
T
|
T
N
x
F
W
 
N
K
 
K
M
 
I
P
 
D
P
 
T
V
 
V
Q
 
D

6n2nB Crystal structure of 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus (see paper)
33% identity, 82% coverage: 20:228/256 of query aligns to 21:218/291 of 6n2nB

query
sites
6n2nB
P
 
P
T
 
T
H
 
T
Y
x
W
C
|
C
P
 
P
G
 
G
C
|
C
-
 
G
H
|
H
H
 
F
G
 
G
V
 
I
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
V
H
 
Y
R
 
R
L
 
A
V
 
M
G
 
A
E
 
E
L
 
L
-
 
G
L
 
I
D
 
D
E
 
S
M
 
T
K
 
K
L
 
F
R
 
A
E
 
A
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
S
S
 
G
I
|
I
G
|
G
C
|
C
S
|
S
V
 
S
F
 
R
L
 
M
Y
 
P
N
 
Y
Y
 
F
L
 
V
D
 
D
I
 
S
D
 
Y
A
 
K
V
 
M
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
|
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
P
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
T
K
 
Q
R
 
V
A
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
K
 
L
F
 
C
V
 
V
L
 
V
T
 
V
Y
 
A
Q
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
 
G
A
 
F
S
 
S
I
 
I
G
 
G
M
 
G
A
 
G
E
 
H
I
 
M
M
 
P
H
 
H
A
 
M
A
 
A
N
 
R
R
 
K
G
 
N
E
 
V
R
 
N
I
 
M
C
 
T
V
 
Y
V
 
V
F
 
L
V
 
M
N
 
D
N
|
N
T
 
G
V
x
I
Y
|
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
G
 
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
Y
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
S
L
 
R
V
 
P
G
 
E
Q
 
M
R
 
T
T
 
A
T
 
Y
T
 
T
C
 
T
P
 
P
G
 
Y
G
 
G
R
 
G
C
 
P
R
 
E
D
 
N
K
 
P
E
 
M
G
 
N
L
 
P
P
 
L
I
 
L
K
 
Y
M
 
M
T
 
L
E
 
T
I
 
Y
I
 
G
S
 
A
Q
 
T
L
 
Y
G
 
V
G
 
A
V
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
P
S
 
K
L
 
-
D
 
D
S
 
C
V
 
A
K
 
E
N
 
L
I
 
I
R
 
K
T
 
G
A
 
A
K
 
M
K
 
E
Y
 
H
L
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
C
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
-
D
 
-
R
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
E
 
N
L
 
I
L
 
F
S
 
S
A
 
Q
C
|
C
P
 
P
T
|
T
N
x
F
W
 
N
K
 
K
M
 
I
P
 
D
P
 
T
V
 
V
Q
 
D

5b46B 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2 from sulfolobus tokodai - ligand free form (see paper)
31% identity, 77% coverage: 23:220/256 of query aligns to 8:196/301 of 5b46B

query
sites
5b46B
Y
x
W
C
|
C
P
 
P
G
 
G
C
|
C
H
 
G
H
 
D
G
 
F
V
 
G
A
 
I
H
 
L
R
 
R
L
 
A
V
 
E
G
 
E
E
 
M
L
 
A
L
 
I
D
 
R
E
 
E
M
 
L
K
 
G
L
 
I
R
 
N
E
 
P
E
 
K
S
 
S
I
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
V
S
 
S
-
 
G
I
|
I
G
|
G
C
|
C
S
|
S
V
 
G
F
 
K
L
 
I
Y
 
P
N
 
H
Y
 
F
L
 
M
D
 
N
-
 
L
-
 
P
I
 
I
D
 
S
A
 
G
V
 
V
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
|
H
G
 
G
R
 
R
A
 
S
P
 
I
A
 
A
V
 
F
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
I
K
 
K
R
 
L
A
 
S
R
 
N
P
 
P
D
 
S
K
 
L
F
 
E
V
 
V
L
 
I
T
 
V
Y
 
N
Q
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
 
G
A
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
M
A
 
G
E
 
H
I
 
F
M
 
V
H
 
H
A
 
L
A
 
G
N
 
R
R
 
R
G
 
N
E
 
I
R
 
D
I
 
I
C
 
A
V
 
V
V
 
L
F
 
V
V
 
H
N
 
N
N
|
N
T
 
G
V
|
V
Y
|
Y
G
|
G
M
x
L
T
|
T
G
 
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
L
 
H
V
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
K
T
 
T
T
 
K
T
 
S
C
 
L
P
 
P
G
 
K
G
 
P
R
 
N
C
 
I
R
 
M
D
 
D
K
 
A
E
 
V
G
 
N
L
 
-
P
 
P
I
 
L
K
 
A
M
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
V
S
 
A
Q
 
L
L
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
F
 
F
A
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
Y
L
 
A
D
 
Y
S
 
D
V
 
V
K
 
M
N
 
H
I
 
L
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
K
K
 
E
Y
 
L
L
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
A
F
 
I
E
 
-
C
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
L
D
 
H
R
 
K
G
 
G
F
 
S
G
 
A
F
 
L
V
 
V
E
 
D
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
A
 
P
C
|
C
P
 
P
T
|
T

Sites not aligning to the query:

Q96XT4 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2, subunit beta; OFOR2; EC 1.2.7.11 from Sulfurisphaera tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7) (Sulfolobus tokodaii) (see paper)
31% identity, 77% coverage: 23:220/256 of query aligns to 11:199/304 of Q96XT4

query
sites
Q96XT4
Y
 
W
C
|
C
P
 
P
G
 
G
C
|
C
H
 
G
H
 
D
G
 
F
V
 
G
A
 
I
H
 
L
R
 
R
L
 
A
V
 
E
G
 
E
E
 
M
L
 
A
L
 
I
D
 
R
E
 
E
M
 
L
K
 
G
L
 
I
R
 
N
E
 
P
E
 
K
S
 
S
I
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
V
S
 
S
-
 
G
I
|
I
G
|
G
C
|
C
S
|
S
V
 
G
F
 
K
L
 
I
Y
 
P
N
 
H
Y
 
F
L
 
M
D
 
N
-
 
L
-
 
P
I
 
I
D
 
S
A
 
G
V
 
V
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
S
P
 
I
A
 
A
V
 
F
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
I
K
 
K
R
 
L
A
 
S
R
 
N
P
 
P
D
 
S
K
 
L
F
 
E
V
 
V
L
 
I
T
 
V
Y
 
N
Q
 
V
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
 
G
A
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
M
A
 
G
E
 
H
I
 
F
M
 
V
H
 
H
A
 
L
A
 
G
N
 
R
R
 
R
G
 
N
E
 
I
R
 
D
I
 
I
C
 
A
V
 
V
V
 
L
F
 
V
V
 
H
N
 
N
N
|
N
T
 
G
V
|
V
Y
 
Y
G
|
G
M
x
L
T
 
T
G
 
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
L
 
H
V
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
K
T
 
T
T
 
K
T
 
S
C
 
L
P
 
P
G
 
K
G
 
P
R
 
N
C
 
I
R
 
M
D
 
D
K
 
A
E
 
V
G
 
N
L
 
-
P
 
P
I
 
L
K
 
A
M
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
V
S
 
A
Q
 
L
L
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
F
 
F
A
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
Y
L
 
A
D
 
Y
S
 
D
V
 
V
K
 
M
N
 
H
I
 
L
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
K
K
 
E
Y
 
L
L
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
A
F
 
I
E
 
-
C
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
L
D
 
H
R
 
K
G
 
G
F
 
S
G
 
A
F
 
L
V
 
V
E
 
D
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
A
 
P
C
|
C
P
 
P
T
 
T

Q96Y68 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 1, subunit beta; OFOR1; EC 1.2.7.11 from Sulfurisphaera tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7) (Sulfolobus tokodaii) (see 2 papers)
29% identity, 77% coverage: 23:220/256 of query aligns to 11:199/305 of Q96Y68

query
sites
Q96Y68
Y
 
W
C
|
C
P
 
P
G
 
G
C
|
C
-
 
G
H
 
N
H
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
L
H
 
N
R
 
A
L
 
E
V
 
Q
G
 
Q
E
 
A
L
 
I
L
 
V
D
 
E
E
 
L
M
 
G
K
 
V
L
 
D
R
 
T
E
 
K
E
 
N
S
 
V
I
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
S
S
 
G
I
 
I
G
 
G
C
|
C
S
 
S
V
 
G
F
x
K
L
 
I
Y
 
P
N
 
H
Y
 
F
L
 
F
-
 
R
-
 
T
D
 
P
I
 
I
D
 
S
A
 
G
V
 
V
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
P
 
I
A
 
A
V
 
F
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
I
K
 
K
R
 
L
A
 
S
R
 
N
P
 
P
D
 
D
K
 
L
F
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
V
Y
 
N
Q
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
 
L
A
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
A
A
 
G
E
 
H
I
 
F
M
 
V
H
 
A
A
 
A
A
 
G
N
 
R
R
 
R
G
 
N
E
 
V
R
 
D
I
 
M
C
 
V
V
 
V
V
 
I
F
 
L
V
 
H
N
 
D
N
|
N
T
 
G
V
|
V
Y
 
Y
G
|
G
M
x
L
T
 
T
G
x
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
L
 
K
V
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
K
T
 
P
T
 
K
T
 
S
C
 
L
P
 
P
G
 
R
G
 
P
R
 
N
C
 
I
R
 
N
D
 
D
K
 
A
E
 
V
G
 
N
L
 
-
P
 
P
I
 
I
K
 
A
M
 
L
T
 
A
E
 
-
I
 
-
I
 
I
S
 
S
Q
 
S
L
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
F
 
F
A
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
Y
L
 
A
D
 
Y
S
 
D
V
 
V
K
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
K
|
K
Y
 
H
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
L
F
 
I
E
 
K
C
 
S
Q
 
A
T
 
I
Q
 
K
D
 
H
R
 
K
G
 
G
F
 
L
G
 
A
F
 
L
V
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
P
C
|
C
P
 
P
T
 
T

P72579 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase subunit beta; OFOR; EC 1.2.7.11 from Sulfolobus sp. (see paper)
29% identity, 77% coverage: 23:220/256 of query aligns to 11:199/305 of P72579

query
sites
P72579
Y
 
W
C
 
C
P
 
P
G
 
G
C
 
C
-
 
G
H
 
N
H
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
L
H
 
N
R
 
A
L
 
E
V
 
Q
G
 
Q
E
 
A
L
 
I
L
 
V
D
 
E
E
 
L
M
 
G
K
 
V
L
 
D
R
 
T
E
 
K
E
 
N
S
 
V
I
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
S
S
 
G
I
 
I
G
 
G
C
 
C
S
 
S
V
 
G
F
x
K
L
 
I
Y
 
P
N
 
H
Y
 
F
L
 
F
-
 
R
-
 
T
D
 
P
I
 
I
D
 
S
A
 
G
V
 
V
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
P
 
I
A
 
A
V
 
F
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
I
K
 
K
R
 
L
A
 
S
R
 
N
P
 
P
D
 
D
K
 
L
F
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
V
Y
 
N
Q
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
A
A
 
G
E
 
H
I
 
F
M
 
V
H
 
A
A
 
A
A
 
G
N
 
R
R
 
R
G
 
N
E
 
V
R
 
D
I
 
M
C
 
V
V
 
V
V
 
I
F
 
L
V
 
H
N
 
D
N
 
N
T
 
G
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
M
x
L
T
 
T
G
 
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
L
 
K
V
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
K
T
 
P
T
 
K
T
 
S
C
 
L
P
 
P
G
 
R
G
 
P
R
 
N
C
 
I
R
 
N
D
 
D
K
 
A
E
 
V
G
 
N
L
 
-
P
 
P
I
 
I
K
 
A
M
 
L
T
 
A
E
 
-
I
 
-
I
 
I
S
 
S
Q
 
S
L
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
F
 
F
A
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
Y
L
 
A
D
 
Y
S
 
D
V
 
V
K
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
K
Y
 
H
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
L
F
 
I
E
 
K
C
 
S
Q
 
A
T
 
I
Q
 
K
D
 
H
R
 
K
G
 
G
F
 
L
G
 
A
F
 
L
V
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
P
C
 
C
P
 
P
T
 
T

5b47B 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2 from sulfolobus tokodai - pyruvate complex (see paper)
29% identity, 77% coverage: 23:220/256 of query aligns to 4:181/275 of 5b47B

query
sites
5b47B
Y
 
W
C
|
C
P
 
P
G
 
G
C
|
C
H
 
G
H
 
D
G
 
F
V
 
G
A
 
I
H
 
L
R
 
R
L
 
A
V
 
E
G
 
E
E
 
M
L
 
A
L
 
I
D
 
R
E
 
E
M
 
L
K
 
G
L
 
I
R
 
N
E
 
P
E
 
K
S
 
S
I
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
V
S
 
S
-
 
G
I
|
I
G
|
G
C
|
C
S
|
S
V
 
G
F
 
K
L
 
I
Y
 
P
N
 
H
Y
 
F
L
 
M
D
 
N
-
 
L
-
 
P
I
 
I
D
 
S
A
 
G
V
 
V
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
|
H
G
 
G
R
 
R
A
 
S
P
 
I
A
 
A
V
 
F
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
I
K
 
K
R
 
L
A
 
S
R
 
N
P
 
P
D
 
S
K
 
L
F
 
E
V
 
V
L
 
I
T
 
V
Y
 
N
Q
 
V
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
 
G
A
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
M
A
 
G
E
 
H
I
 
F
M
 
V
H
 
H
A
 
L
A
 
G
N
 
R
R
 
R
G
 
N
E
 
I
R
 
D
I
 
I
C
 
A
V
 
V
V
 
L
F
 
V
V
 
H
N
 
N
N
|
N
T
 
G
V
|
V
Y
|
Y
G
 
G
M
x
L
T
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
Q
M
 
A
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
L
 
H
V
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
N
T
 
I
T
 
M
T
 
D
C
 
A
P
 
V
G
 
N
G
 
-
R
 
-
C
 
-
R
 
-
D
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
P
I
 
L
K
 
A
M
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
V
S
 
A
Q
 
L
L
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
F
 
F
A
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
Y
L
 
A
D
 
Y
S
 
D
V
 
V
K
 
M
N
 
H
I
 
L
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
K
K
 
E
Y
 
L
L
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
A
F
 
I
E
 
-
C
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
L
D
 
H
R
 
K
G
 
G
F
 
S
G
 
A
F
 
L
V
 
V
E
 
D
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
A
 
P
C
|
C
P
 
P
T
 
T

5b48B 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 1 from sulfolobus tokodai (see paper)
29% identity, 77% coverage: 23:220/256 of query aligns to 7:185/286 of 5b48B

query
sites
5b48B
Y
 
W
C
|
C
P
 
P
G
 
G
C
|
C
-
 
G
H
 
N
H
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
L
H
 
N
R
 
A
L
 
E
V
 
Q
G
 
Q
E
 
A
L
 
I
L
 
V
D
 
E
E
 
L
M
 
G
K
 
V
L
 
D
R
 
T
E
 
K
E
 
N
S
 
V
I
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
S
S
 
G
I
|
I
G
|
G
C
|
C
S
|
S
V
 
G
F
 
K
L
 
I
Y
 
P
N
 
H
Y
 
F
L
 
T
D
 
P
I
 
I
D
 
S
A
 
G
V
 
V
E
 
H
A
 
T
P
 
L
H
|
H
G
 
G
R
 
R
A
 
A
P
 
I
A
 
A
V
 
F
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
I
K
 
K
R
 
L
A
 
S
R
 
N
P
 
P
D
 
D
K
 
L
F
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
V
Y
 
N
Q
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
 
L
A
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
A
A
 
G
E
 
H
I
 
F
M
 
V
H
 
A
A
 
A
A
 
G
N
 
R
R
 
R
G
 
N
E
 
V
R
 
D
I
 
M
C
 
V
V
 
V
V
 
I
F
 
L
V
 
H
N
 
D
N
|
N
T
 
G
V
|
V
Y
|
Y
G
|
G
M
x
L
T
 
T
G
 
K
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
L
 
K
V
 
R
G
 
G
Q
 
E
R
 
N
T
 
I
T
 
N
T
 
D
C
 
A
P
 
V
G
 
N
G
 
-
R
 
-
C
 
-
R
 
-
D
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
P
I
 
I
K
 
A
M
 
L
T
 
A
E
 
-
I
 
-
I
 
I
S
 
S
Q
 
S
L
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
F
 
F
A
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
Y
L
 
A
D
 
Y
S
 
D
V
 
V
K
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
K
Y
 
H
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
L
F
 
I
E
 
K
C
 
S
Q
 
A
T
 
I
Q
 
K
D
 
H
R
 
K
G
 
G
F
 
L
G
 
A
F
 
L
V
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
P
C
|
C
P
 
P
T
|
T

9bt4C Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from methanosarcina acetivorans (see paper)
24% identity, 78% coverage: 24:222/256 of query aligns to 13:210/291 of 9bt4C

query
sites
9bt4C
C
|
C
P
 
A
G
 
G
C
|
C
H
x
C
H
x
D
G
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
S
R
 
K
L
 
F
V
 
M
G
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
L
M
 
M
K
 
G
L
 
A
R
 
G
E
 
P
E
 
D
S
 
T
I
 
I
L
 
V
I
 
I
G
 
N
S
 
P
I
x
T
G
|
G
C
|
C
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
M
-
 
T
S
 
T
V
 
P
F
 
F
L
 
P
Y
 
E
N
 
S
Y
 
A
L
 
W
D
 
Q
I
 
V
D
 
P
A
 
W
V
 
I
E
 
H
A
 
S
P
 
L
H
x
F
G
x
E
R
 
N
A
 
G
P
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
V
K
 
E
R
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
R
 
K
P
 
G
D
 
N
K
 
T
F
 
R
V
 
V
L
 
I
T
 
G
Y
 
V
Q
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
D
x
S
L
 
T
A
 
M
S
 
D
I
 
I
G
 
G
M
 
I
A
 
R
E
 
S
I
 
L
M
 
S
H
 
G
A
 
A
A
 
F
N
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
H
R
 
D
I
 
I
C
 
T
V
 
Y
V
 
V
F
 
C
V
 
V
N
 
D
N
|
N
T
 
E
V
x
A
Y
|
Y
G
x
M
M
x
N
T
|
T
G
 
G
G
 
I
Q
 
Q
M
 
R
A
 
S
P
 
S
T
 
G
T
 
T
L
 
P
V
 
F
G
 
D
Q
 
A
R
 
S
T
 
T
T
 
T
T
 
T
C
 
S
P
 
P
G
 
A
G
 
G
R
 
K
C
 
V
R
 
S
D
 
F
K
 
G
E
 
N
G
 
P
L
 
R
P
 
P
I
 
K
K
 
K
M
 
D
T
 
M
E
 
P
I
 
A
I
 
I
S
 
M
Q
 
A
L
 
A
G
 
H
G
 
G
V
 
S
A
 
P
F
 
Y
A
 
V
G
 
A
R
 
T
A
 
T
S
 
S
L
 
I
D
 
G
S
 
F
V
 
P
K
 
R
N
 
D
I
 
M
R
 
M
T
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
R
Y
 
K
L
 
V
R
 
K
K
 
K
A
 
A
F
 
-
E
 
-
C
 
-
Q
 
-
T
 
T
Q
 
E
D
 
I
R
 
V
G
 
G
F
 
P
G
 
T
F
 
Y
V
 
I
E
 
H
L
 
S
L
 
H
S
 
A
A
 
P
C
|
C
P
 
P
T
|
T
N
 
G
W
 
W

5exdF Crystal structure of oxalate oxidoreductase from moorella thermoacetica bound with carboxy-di-oxido-methyl-tpp (coom-tpp) intermediate (see paper)
23% identity, 79% coverage: 24:225/256 of query aligns to 24:232/310 of 5exdF

query
sites
5exdF
C
|
C
P
 
A
G
 
G
C
|
C
H
 
G
H
x
P
G
 
A
V
 
L
A
 
T
H
 
Y
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
A
L
 
A
D
 
G
E
 
P
M
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
N
S
 
T
I
 
I
L
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
I
x
T
G
|
G
C
|
C
S
 
M
V
 
Y
F
 
V
L
 
A
Y
 
N
N
 
T
Y
 
S
L
 
Y
D
 
G
I
 
C
D
 
G
A
 
P
V
 
W
E
 
R
A
 
V
P
 
P
H
 
W
G
 
I
R
 
H
A
 
A
P
 
Q
A
x
I
V
 
T
G
 
N
T
 
G
G
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
I
-
 
R
K
 
K
R
 
K
A
 
K
R
 
T
P
 
D
D
 
A
K
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
N
V
 
I
L
 
I
T
 
V
Y
 
M
Q
 
A
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
 
G
L
 
A
A
 
V
S
 
D
I
 
I
G
 
G
M
 
L
A
 
Q
E
 
A
I
 
L
M
 
S
H
 
A
A
 
M
A
 
L
N
 
Y
R
 
R
G
 
G
E
 
H
R
 
D
I
 
V
C
 
L
V
 
F
V
 
I
F
 
C
V
x
Y
N
 
D
N
|
N
T
 
E
V
x
S
Y
|
Y
G
x
A
M
x
N
T
|
T
G
 
G
G
 
I
Q
 
Q
M
 
T
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
L
 
P
V
 
Y
G
 
G
Q
 
A
R
 
N
T
 
T
T
 
T
T
 
F
C
 
T
P
 
P
G
 
P
G
 
G
R
 
E
C
 
V
-
 
V
-
 
P
R
 
E
D
 
G
K
 
K
E
 
K
G
 
L
L
 
F
P
 
P
I
 
K
K
 
D
M
 
N
T
 
P
E
 
K
I
 
V
I
 
I
S
 
A
Q
 
H
L
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
G
R
 
H
A
 
P
S
 
E
L
 
L
D
 
K
S
 
Y
V
 
V
-
 
A
-
 
T
K
 
A
N
 
S
I
 
I
R
 
G
T
 
W
A
 
P
K
 
V
K
 
D
Y
 
L
L
 
M
R
 
N
K
 
K
A
 
V
F
 
R
E
 
K
C
 
G
Q
 
L
T
 
N
Q
 
Q
D
 
E
R
 
-
G
 
G
F
 
P
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
E
 
H
L
 
I
L
 
H
S
 
A
A
 
P
C
|
C
P
 
P
T
x
K
N
 
G
W
 
W
K
 
Q
M
 
F
P
 
P

5exeC Crystal structure of oxalate oxidoreductase from moorella thermoacetica bound with carboxy-tpp adduct (see paper)
23% identity, 79% coverage: 24:225/256 of query aligns to 24:232/314 of 5exeC

query
sites
5exeC
C
|
C
P
 
A
G
 
G
C
|
C
H
 
G
H
x
P
G
 
A
V
 
L
A
 
T
H
 
Y
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
A
L
 
A
D
 
G
E
 
P
M
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
N
S
 
T
I
 
I
L
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
I
x
T
G
|
G
C
|
C
S
 
M
V
 
Y
F
 
V
L
 
A
Y
 
N
N
 
T
Y
 
S
L
 
Y
D
 
G
I
 
C
D
 
G
A
 
P
V
 
W
E
 
R
A
 
V
P
 
P
H
 
W
G
 
I
R
 
H
A
 
A
P
 
Q
A
x
I
V
 
T
G
 
N
T
 
G
G
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
I
-
 
R
K
 
K
R
 
K
A
 
K
R
 
T
P
 
D
D
 
A
K
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
N
V
 
I
L
 
I
T
 
V
Y
 
M
Q
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
D
 
G
L
 
A
A
 
V
S
 
D
I
 
I
G
 
G
M
 
L
A
 
Q
E
 
A
I
 
L
M
 
S
H
 
A
A
 
M
A
 
L
N
 
Y
R
 
R
G
 
G
E
 
H
R
x
D
I
 
V
C
 
L
V
 
F
V
 
I
F
 
C
V
x
Y
N
 
D
N
|
N
T
 
E
V
x
S
Y
|
Y
G
x
A
M
x
N
T
|
T
G
 
G
G
 
I
Q
 
Q
M
 
T
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
L
 
P
V
 
Y
G
 
G
Q
 
A
R
 
N
T
 
T
T
 
T
T
 
F
C
 
T
P
 
P
G
 
P
G
 
G
R
 
E
C
 
V
-
 
V
-
 
P
R
 
E
D
 
G
K
 
K
E
 
K
G
 
L
L
 
F
P
 
P
I
 
K
K
 
D
M
 
N
T
 
P
E
 
K
I
 
V
I
 
I
S
 
A
Q
 
H
L
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
G
R
 
H
A
 
P
S
 
E
L
 
L
D
 
K
S
 
Y
V
 
V
-
 
A
-
 
T
K
 
A
N
 
S
I
 
I
R
 
G
T
 
W
A
 
P
K
 
V
K
 
D
Y
 
L
L
 
M
R
 
N
K
 
K
A
 
V
F
 
R
E
 
K
C
 
G
Q
x
L
T
 
N
Q
|
Q
D
 
E
R
 
-
G
 
G
F
 
P
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
E
 
H
L
 
I
L
 
H
S
 
A
A
 
P
C
|
C
P
|
P
T
x
K
N
 
G
W
 
W
K
 
Q
M
 
F
P
 
P

5c4iC Structure of an oxalate oxidoreductase (see paper)
23% identity, 79% coverage: 24:225/256 of query aligns to 24:232/312 of 5c4iC

query
sites
5c4iC
C
|
C
P
 
A
G
 
G
C
|
C
H
 
G
H
x
P
G
 
A
V
 
L
A
 
T
H
 
Y
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
A
L
 
A
D
 
G
E
 
P
M
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
N
S
 
T
I
 
I
L
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
I
x
T
G
|
G
C
|
C
S
 
M
V
 
Y
F
 
V
L
 
A
Y
 
N
N
 
T
Y
 
S
L
 
Y
D
 
G
I
 
C
D
 
G
A
 
P
V
 
W
E
 
R
A
 
V
P
 
P
H
 
W
G
 
I
R
 
H
A
 
A
P
 
Q
A
x
I
V
 
T
G
 
N
T
 
G
G
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
I
-
 
R
K
 
K
R
 
K
A
 
K
R
 
T
P
 
D
D
 
A
K
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
N
V
 
I
L
 
I
T
 
V
Y
 
M
Q
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
D
 
G
L
 
A
A
 
V
S
 
D
I
 
I
G
 
G
M
 
L
A
 
Q
E
 
A
I
 
L
M
 
S
H
 
A
A
 
M
A
 
L
N
 
Y
R
 
R
G
 
G
E
 
H
R
 
D
I
 
V
C
 
L
V
 
F
V
 
I
F
 
C
V
x
Y
N
 
D
N
|
N
T
 
E
V
x
S
Y
|
Y
G
x
A
M
x
N
T
|
T
G
 
G
G
 
I
Q
 
Q
M
 
T
A
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
L
 
P
V
 
Y
G
 
G
Q
 
A
R
 
N
T
 
T
T
 
T
T
 
F
C
 
T
P
 
P
G
 
P
G
 
G
R
 
E
C
 
V
-
 
V
-
 
P
R
 
E
D
 
G
K
 
K
E
 
K
G
 
L
L
 
F
P
 
P
I
 
K
K
 
D
M
 
N
T
 
P
E
 
K
I
 
V
I
 
I
S
 
A
Q
 
H
L
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
G
R
 
H
A
 
P
S
 
E
L
 
L
D
 
K
S
 
Y
V
 
V
-
 
A
-
 
T
K
 
A
N
 
S
I
 
I
R
 
G
T
 
W
A
 
P
K
 
V
K
 
D
Y
 
L
L
 
M
R
 
N
K
 
K
A
 
V
F
 
R
E
 
K
C
 
G
Q
 
L
T
 
N
Q
 
Q
D
 
E
R
 
-
G
 
G
F
 
P
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
E
 
H
L
 
I
L
 
H
S
 
A
A
 
P
C
|
C
P
|
P
T
x
K
N
 
G
W
 
W
K
 
Q
M
 
F
P
 
P

Query Sequence

>WP_078717838.1 NCBI__GCF_900167125.1:WP_078717838.1
MSEMQEKLVFDRPESVIDRPTHYCPGCHHGVAHRLVGELLDEMKLREESILIGSIGCSVF
LYNYLDIDAVEAPHGRAPAVGTGAKRARPDKFVLTYQGDGDLASIGMAEIMHAANRGERI
CVVFVNNTVYGMTGGQMAPTTLVGQRTTTCPGGRCRDKEGLPIKMTEIISQLGGVAFAGR
ASLDSVKNIRTAKKYLRKAFECQTQDRGFGFVELLSACPTNWKMPPVQANERIREEMIPY
FPLGVYKDVTEEGGAC

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory