SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_079558612.1 NCBI__GCF_002201795.1:WP_079558612.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4xkmA Crystal structure of xylose isomerase from an human intestinal tract microbe bacteroides thetaiotaomicron
68% identity, 98% coverage: 8:442/442 of query aligns to 1:435/435 of 4xkmA

query
sites
4xkmA
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
F
 
F
P
 
P
G
 
G
I
 
I
G
 
E
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
M
A
 
A
F
|
F
K
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
x
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
 
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
 
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
G
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
K
 
Q
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
G
A
 
N
G
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
E
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
F
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
I
P
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
V
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
A
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
E
I
 
I
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
A
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
A
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
A
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
H
 
H
M
 
L
G
 
A
R
 
Q
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
A
Q
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
N
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
N
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
T
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
L
 
M
V
 
Q
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
L
Q
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
F
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
I
S
 
A
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
S
A
 
A
D
 
A
K
 
A
V
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
K
K
 
K
M
 
M
R
 
L
A
 
A
A
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
K
E
 
E
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
V
R
 
V
N
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
K
Q
 
T
N
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
L
N
 
N
L
 
M
Y
 
Y
I
 
C

5nhcA Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 in complex with two co2+ ions and xylulose (see paper)
67% identity, 98% coverage: 8:441/442 of query aligns to 2:435/436 of 5nhcA

query
sites
5nhcA
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
H
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
V
 
E
V
 
V
G
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
 
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
|
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
K
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
I
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
A
I
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
I
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
H
 
H
M
 
M
G
 
A
R
 
T
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
S
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
 
H
G
 
N
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
C
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
A
G
|
G
M
 
M
L
|
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
W
L
 
M
V
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
x
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
Q
x
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
S
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
N
A
 
A
D
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
M
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
L
 
V
R
 
Y
N
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
K
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
A
L
 
M
Y
 
Y

5nhaA Crystal structure of xylose isomerase from piromyces sp. E2 in complex with two mn2+ ions and sorbitol (see paper)
67% identity, 98% coverage: 8:441/442 of query aligns to 2:435/436 of 5nhaA

query
sites
5nhaA
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
H
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
V
 
E
V
 
V
G
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
 
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
|
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
K
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
I
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
A
I
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
I
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
H
 
H
M
 
M
G
 
A
R
 
T
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
S
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
 
H
G
 
N
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
C
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
W
L
 
M
V
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
S
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
N
A
 
A
D
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
M
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
L
 
V
R
 
Y
N
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
K
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
A
L
 
M
Y
 
Y

5nh9A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 in complex with two mn2+ ions and xylose (see paper)
67% identity, 98% coverage: 8:441/442 of query aligns to 2:435/436 of 5nh9A

query
sites
5nh9A
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
H
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
V
 
E
V
 
V
G
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
 
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
|
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
|
G
T
 
T
Q
x
K
K
x
S
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
K
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
I
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
A
I
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
I
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
|
K
R
 
R
E
 
E
L
x
K
E
 
E
H
 
H
M
 
M
G
 
A
R
 
T
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
S
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
x
H
G
 
N
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
C
A
 
A
A
 
V
D
|
D
A
|
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
W
L
 
M
V
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
S
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
N
A
 
A
D
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
M
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
L
 
V
R
 
Y
N
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
K
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
A
L
 
M
Y
 
Y

5nh7A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 in complex with two mg2+ ions and xylose (see paper)
67% identity, 98% coverage: 8:441/442 of query aligns to 2:435/436 of 5nh7A

query
sites
5nh7A
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
|
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
H
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
V
 
E
V
 
V
G
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
x
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
|
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
|
G
T
 
T
Q
x
K
K
x
S
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
K
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
I
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
A
I
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
|
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
I
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
H
 
H
M
 
M
G
 
A
R
 
T
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
S
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
 
H
G
 
N
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
C
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
W
L
 
M
V
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
|
E
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
S
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
N
A
 
A
D
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
M
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
L
 
V
R
 
Y
N
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
K
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
A
L
 
M
Y
 
Y

5nh6A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 complexed with one mg2+ ion and xylitol (see paper)
67% identity, 98% coverage: 8:441/442 of query aligns to 2:435/436 of 5nh6A

query
sites
5nh6A
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
H
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
V
 
E
V
 
V
G
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
 
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
|
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
K
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
I
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
A
I
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
I
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
H
 
H
M
 
M
G
 
A
R
 
T
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
S
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
 
H
G
 
N
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
C
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
W
L
 
M
V
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
S
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
N
A
 
A
D
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
M
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
L
 
V
R
 
Y
N
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
K
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
A
L
 
M
Y
 
Y

5nh5A Crystal structure of native xylose isomerase from piromyces e2 (see paper)
67% identity, 98% coverage: 8:441/442 of query aligns to 2:435/436 of 5nh5A

query
sites
5nh5A
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
H
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
V
 
E
V
 
V
G
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
 
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
 
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
K
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
I
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
A
I
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
I
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
H
 
H
M
 
M
G
 
A
R
 
T
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
S
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
 
H
G
 
N
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
C
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
W
L
 
M
V
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
S
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
N
A
 
A
D
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
M
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
L
 
V
R
 
Y
N
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
K
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
A
L
 
M
Y
 
Y

5nh4A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 in complex with one mg2+ ions and glycerol (see paper)
67% identity, 98% coverage: 8:441/442 of query aligns to 2:435/436 of 5nh4A

query
sites
5nh4A
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
H
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
V
 
E
V
 
V
G
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
 
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
 
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
K
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
I
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
A
I
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
I
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
H
 
H
M
 
M
G
 
A
R
 
T
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
S
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
 
H
G
 
N
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
C
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
W
L
 
M
V
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
S
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
N
A
 
A
D
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
M
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
L
 
V
R
 
Y
N
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
K
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
A
L
 
M
Y
 
Y

5yn3A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces sp. E2 (see paper)
67% identity, 98% coverage: 8:441/442 of query aligns to 1:434/435 of 5yn3A

query
sites
5yn3A
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
S
K
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
H
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
V
 
E
V
 
V
G
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
M
 
M
K
 
K
E
 
D
H
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
S
 
A
Y
 
W
W
 
W
H
 
H
T
 
T
F
 
L
C
 
C
G
 
A
L
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
W
 
W
L
 
N
G
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
K
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
F
 
I
F
 
M
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
|
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
N
 
N
M
 
L
Q
 
K
S
 
A
I
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
L
K
 
K
A
 
E
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
H
P
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
G
 
I
T
 
V
Q
 
Q
V
 
I
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
H
 
H
M
 
M
G
 
A
R
 
T
F
 
M
L
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
S
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
M
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Y
 
H
G
 
N
L
 
L
E
 
D
K
 
K
D
 
D
F
 
F
K
 
K
V
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
 
N
H
|
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
V
 
C
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
I
N
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
T
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
M
 
W
L
 
M
V
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
A
 
A
K
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
S
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
F
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
E
I
 
N
A
 
A
D
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
S
 
S
D
 
P
Y
 
Y
K
 
T
K
 
K
M
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
L
 
V
R
 
Y
N
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
K
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
K
R
 
Q
I
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
A
L
 
M
Y
 
Y

P00944 Xylose isomerase; D-xylulose keto-isomerase; EC 5.3.1.5 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
54% identity, 98% coverage: 10:442/442 of query aligns to 4:437/440 of P00944

query
sites
P00944
Y
 
Y
F
 
F
P
 
D
G
 
Q
I
 
L
G
 
D
E
 
R
I
 
V
K
 
R
F
 
Y
E
 
E
G
 
G
K
 
S
E
 
K
S
 
S
K
 
S
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
K
 
R
W
 
H
Y
 
Y
N
 
N
A
 
P
D
 
D
Q
 
E
V
 
L
V
 
V
G
 
L
G
 
G
K
 
K
T
 
R
M
 
M
K
 
E
E
 
E
H
 
H
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
A
S
 
C
Y
 
Y
W
 
W
H
 
H
T
 
T
F
 
F
C
 
C
G
 
W
L
 
N
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
M
F
 
F
G
 
G
P
 
V
G
 
G
T
 
A
Q
 
F
K
 
N
Y
 
R
P
 
P
W
 
W
L
 
Q
G
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
E
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
R
K
 
K
M
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
A
F
 
F
E
 
E
F
 
F
F
 
F
T
 
H
K
 
K
L
 
L
G
 
H
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
I
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
S
S
 
P
E
 
E
G
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
L
A
 
K
E
 
E
Y
 
Y
E
 
I
K
 
N
N
 
N
M
 
F
Q
 
A
S
 
Q
I
 
M
V
 
V
D
 
D
Y
 
V
A
 
L
K
 
A
A
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
C
F
 
F
S
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
M
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
P
A
 
E
A
 
V
L
 
F
A
 
S
Y
 
W
A
 
A
G
 
A
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
K
 
V
N
 
T
A
 
A
I
 
M
D
 
E
A
 
A
T
 
T
I
 
H
A
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
F
 
L
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
M
 
E
S
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
N
 
D
M
 
L
K
 
R
R
 
Q
E
 
E
L
 
R
E
 
E
H
 
Q
M
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
F
L
 
M
S
 
Q
M
 
M
A
 
V
R
 
V
D
 
E
Y
 
H
A
 
K
R
 
H
K
 
K
Q
 
I
G
 
G
F
 
F
K
 
Q
G
 
G
C
 
T
F
 
L
Y
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
K
P
 
P
M
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
S
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
E
F
 
I
K
 
K
V
 
L
N
 
N
I
 
I
E
 
E
V
 
A
N
 
N
H
 
H
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
G
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
H
H
 
H
E
 
E
L
 
I
Q
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
I
D
 
A
A
 
L
G
 
G
M
 
L
L
 
F
G
 
G
S
 
S
I
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
A
Q
 
Q
N
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
D
T
 
T
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
I
 
N
N
 
S
I
 
V
Y
 
E
E
 
E
T
 
N
A
 
A
E
 
L
A
 
V
M
 
M
L
 
Y
V
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
T
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
L
N
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
A
K
 
K
I
 
V
R
 
R
R
 
R
N
 
Q
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
K
E
 
Y
D
 
D
I
 
L
F
 
F
I
 
Y
A
 
G
H
 
H
V
 
I
S
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
V
 
T
F
 
M
A
 
A
R
 
L
S
 
A
L
 
L
V
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
K
 
R
V
 
M
L
 
I
S
 
E
D
 
D
S
 
G
D
 
E
Y
 
L
K
 
D
K
 
K
M
 
R
R
 
I
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
S
 
G
Y
 
W
D
 
N
S
 
S
G
 
E
K
 
L
G
 
G
A
 
Q
E
 
Q
F
 
I
E
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
Q
L
 
M
T
 
S
L
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
A
N
 
K
F
 
Y
A
 
A
A
 
Q
Q
 
E
N
 
H
G
 
H
-
 
L
E
 
S
P
 
P
A
 
V
R
 
H
I
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
E
 
E
L
 
Q
Y
 
L
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
I
 
V
N
 
N
L
 
H
Y
 
Y
I