SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_079647858.1 NCBI__GCF_900167915.1:WP_079647858.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4gljA Crystal structure of methylthioadenosine phosphorylase in complex with rhodamine b (see paper)
42% identity, 97% coverage: 6:283/287 of query aligns to 6:287/287 of 4gljA

query
sites
4gljA
L
 
I
G
 
A
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
R
 
Q
M
 
M
P
 
Q
A
 
A
L
 
L
S
 
T
D
 
N
G
 
K
E
 
R
W
 
S
I
 
V
A
 
K
V
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
P
W
 
Y
G
 
G
A
 
E
P
 
P
S
 
S
D
 
D
S
 
D
L
 
I
L
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
T
R
 
R
H
|
H
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
L
A
 
T
P
 
P
H
 
S
E
 
E
V
 
V
N
 
P
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
T
A
 
L
G
 
G
C
 
V
T
 
R
E
 
Y
I
 
I
L
 
V
A
 
S
V
 
V
S
 
S
A
|
A
V
 
V
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
Q
A
 
E
D
 
T
V
 
L
P
 
K
P
 
P
G
 
L
S
 
D
F
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
P
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
M
V
 
I
D
 
D
R
 
M
T
 
T
T
 
K
R
 
Q
G
 
R
G
 
V
R
 
S
S
 
T
F
 
F
F
 
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
A
V
 
V
A
 
A
H
 
H
A
 
V
A
 
S
F
 
M
G
 
A
H
 
D
P
 
P
T
 
L
C
 
C
T
 
P
R
 
E
L
 
V
G
 
A
A
 
D
V
 
I
V
 
L
A
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
Y
A
 
D
E
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
A
E
 
D
G
 
G
G
 
Q
L
 
C
H
 
H
R
 
A
I
 
-
G
 
K
G
 
A
T
 
T
M
 
Y
L
 
V
V
 
C
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
F
|
F
S
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
H
L
 
W
H
 
Y
R
 
R
S
 
Q
W
 
M
G
 
Q
C
 
A
D
 
D
V
 
I
V
x
I
G
|
G
M
|
M
T
 
T
G
 
N
L
 
M
P
 
P
E
 
E
A
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
S
L
 
I
C
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
T
V
 
L
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
D
|
D
D
x
F
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
H
D
 
P
I
x
N
H
 
E
V
 
Q
D
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
A
V
 
D
I
 
Y
A
|
A
I
|
I
M
 
Q
E
 
N
-
x
L
-
 
M
A
 
K
N
 
N
V
 
A
A
 
D
R
 
N
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
V
V
 
I
E
 
K
A
 
Q
V
 
A
A
 
V
A
 
A
G
 
L
T
 
I
W
 
A
G
 
S
G
 
-
I
 
-
H
 
E
C
 
Q
P
 
P
Q
 
K
G
 
S
C
 
I
D
 
A
H
 
H
-
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
T
G
 
Q
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
V
L
 
E
A
 
A
W
 
M
P
 
S
P
 
A
A
 
E
T
 
T
K
 
K
R
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P

3t94A Crystal structure of 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase (mtap) ii complexed with 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine and sulfate (see paper)
45% identity, 82% coverage: 6:241/287 of query aligns to 10:246/270 of 3t94A

query
sites
3t94A
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
D
M
 
P
P
 
G
A
 
I
L
 
F
S
 
S
D
 
E
G
 
S
E
 
K
W
 
E
I
 
I
A
 
K
V
 
V
D
 
Y
T
 
T
A
 
P
W
 
Y
G
 
G
A
 
Q
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
F
L
 
I
L
 
T
L
 
I
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
G
G
 
N
R
 
K
E
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
G
H
|
H
R
 
R
I
|
I
A
x
P
P
 
P
H
 
H
E
 
K
V
 
I
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
L
G
 
G
C
 
V
T
 
R
E
 
W
I
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
V
S
 
S
A
|
A
V
 
V
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
M
D
 
D
V
 
Y
P
 
K
P
 
L
G
 
G
S
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
I
V
 
P
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
M
T
 
T
T
 
K
R
 
N
G
 
R
G
 
E
R
 
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
G
 
D
D
 
G
G
 
P
I
 
V
V
 
V
A
 
A
H
 
H
A
 
V
A
 
S
F
 
M
G
 
A
H
 
D
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
N
R
 
S
L
 
L
G
 
R
A
 
K
V
 
L
V
 
A
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
E
E
 
L
G
 
N
G
 
I
L
 
K
H
 
T
R
 
H
I
 
E
G
 
S
G
 
G
T
 
T
M
 
Y
L
 
I
V
 
C
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
R
L
 
T
H
 
W
R
 
R
S
 
E
-
 
V
W
 
Y
G
 
K
C
 
A
D
 
D
V
 
I
V
x
I
G
 
G
M
|
M
T
|
T
G
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
C
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
T
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
V
W
 
F
S
 
A
D
 
E
I
 
I
H
 
P
V
 
V
D
 
T
V
x
A
A
 
E
S
 
E
V
|
V
I
 
T
A
 
R
I
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
L
E
 
Y
A
 
A
V
 
L

Q97W94 S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase; 5'-methylthioadenosine phosphorylase; MTA phosphorylase; MTAP; MTAPII; EC 2.4.2.28 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see 2 papers)
45% identity, 82% coverage: 6:241/287 of query aligns to 10:246/270 of Q97W94

query
sites
Q97W94
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
D
M
 
P
P
 
G
A
 
I
L
 
F
S
 
S
D
 
E
G
 
S
E
 
K
W
 
E
I
 
I
A
 
K
V
 
V
D
 
Y
T
 
T
A
 
P
W
 
Y
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
S
 
S
D
 
D
S
 
F
L
 
I
L
 
T
L
 
I
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
G
G
 
N
R
 
K
E
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
P
P
 
P
H
 
H
E
 
K
V
 
I
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
L
G
 
G
C
 
V
T
 
R
E
 
W
I
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
M
D
 
D
V
 
Y
P
 
K
P
 
L
G
 
G
S
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
I
V
 
P
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
M
T
 
T
T
 
K
R
 
N
G
 
R
G
 
E
R
 
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
G
 
D
D
 
G
G
 
P
I
 
V
V
 
V
A
 
A
H
 
H
A
 
V
A
 
S
F
 
M
G
 
A
H
 
D
P
 
P
T
 
F
C
|
C
T
 
N
R
 
S
L
 
L
G
 
R
A
 
K
V
 
L
V
 
A
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
E
E
 
L
G
 
N
G
 
I
L
 
K
H
 
T
R
 
H
I
 
E
G
 
S
G
 
G
T
 
T
M
 
Y
L
 
I
V
 
C
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
S
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
R
L
 
T
H
 
W
R
 
R
S
 
E
-
 
V
W
 
Y
G
 
K
C
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
N
L
 
L
A
 
A
R
x
C
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
C
|
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
T
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
Y
D
 
D
A
 
V
W
 
F
S
 
A
D
 
E
I
 
I
H
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
A
A
 
E
S
 
E
V
 
V
I
 
T
A
 
R
I
 
V
M
 
M
E
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
L
E
 
Y
A
 
A
V
 
L

Sites not aligning to the query:

1sd2A Structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase complexed with 5'-methylthiotubercidin (see paper)
43% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:232/262 of 1sd2A

query
sites
1sd2A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
A
D
 
-
I
 
-
H
 
-
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

9jd2A Crystal structure of 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase from aeropyrum pernix complex with 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine 353k
44% identity, 90% coverage: 6:264/287 of query aligns to 12:273/273 of 9jd2A

query
sites
9jd2A
L
 
V
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
D
M
 
P
P
 
G
A
 
I
L
 
V
S
 
E
D
 
N
G
 
P
E
 
V
W
 
E
I
 
V
A
 
K
V
 
V
D
 
S
T
 
T
A
 
P
W
 
Y
G
 
G
A
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
D
S
 
F
L
 
I
L
 
V
L
 
V
G
 
G
T
 
D
I
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
V
E
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
P
P
 
P
H
 
H
E
 
A
V
 
I
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
C
 
V
T
 
K
E
 
W
I
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
|
V
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
Y
P
 
R
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
V
V
 
P
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
M
T
 
T
T
 
K
R
 
N
G
 
R
G
 
R
R
 
H
S
 
Y
F
 
T
F
 
F
G
 
Y
D
 
D
G
 
G
-
 
P
I
 
V
V
 
T
A
 
V
H
 
H
A
 
V
A
 
S
F
 
M
G
 
A
H
 
D
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
E
R
 
D
L
 
L
G
 
R
A
 
Q
V
 
R
V
 
L
A
 
I
A
 
D
A
 
S
L
 
G
A
 
R
E
 
R
E
 
L
G
 
G
G
 
Y
L
 
T
H
 
V
R
 
H
I
 
E
G
 
R
G
 
G
T
 
T
M
 
Y
L
 
V
V
 
C
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
R
L
 
V
H
 
W
R
 
K
S
 
D
-
 
V
W
 
F
G
 
K
C
 
A
D
 
D
V
 
I
V
x
I
G
 
G
M
|
M
T
 
T
G
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
I
R
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
C
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
T
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
 
D
A
 
V
W
 
W
S
 
A
D
 
D
I
 
R
H
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
A
A
 
E
S
 
E
V
|
V
I
 
E
A
 
R
I
 
V
M
 
M
E
 
I
A
 
S
N
 
N
V
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
L
 
M
V
 
L
E
 
Y
A
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
P
G
 
K
T
 
L
W
 
A
G
 
G
G
 
E
I
 
P
H
 
E
C
 
L
P
 
E
Q
 
R
-
 
C
G
 
S
C
 
C
D
 
C
H
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
T
A
 
A
V
 
A
I
 
I

1wtaA Crystal structure of 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine from aeropyrum pernix (r32 form)
44% identity, 90% coverage: 6:264/287 of query aligns to 12:273/273 of 1wtaA

query
sites
1wtaA
L
 
V
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
D
M
 
P
P
 
G
A
 
I
L
 
V
S
 
E
D
 
N
G
 
P
E
 
V
W
 
E
I
 
V
A
 
K
V
 
V
D
 
S
T
 
T
A
 
P
W
 
Y
G
 
G
A
 
N
P
 
P
S
 
S
D
 
D
S
 
F
L
 
I
L
 
V
L
 
V
G
 
G
T
 
D
I
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
V
E
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
P
P
 
P
H
 
H
E
 
A
V
 
I
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
C
 
V
T
 
K
E
 
W
I
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
|
V
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
Y
P
 
R
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
V
V
 
P
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
M
T
 
T
T
 
K
R
 
N
G
 
R
G
 
R
R
 
H
S
 
Y
F
 
T
F
 
F
G
 
Y
D
 
D
G
 
G
-
 
P
I
 
V
V
 
T
A
 
V
H
 
H
A
 
V
A
 
S
F
 
M
G
 
A
H
 
D
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
E
R
 
D
L
 
L
G
 
R
A
 
Q
V
 
R
V
 
L
A
 
I
A
 
D
A
 
S
L
 
G
A
 
R
E
 
R
E
 
L
G
 
G
G
 
Y
L
 
T
H
 
V
R
 
H
I
 
E
G
 
R
G
 
G
T
 
T
M
 
Y
L
 
V
V
 
C
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
R
L
 
V
H
 
W
R
 
K
S
 
D
-
 
V
W
 
F
G
 
K
C
 
A
D
 
D
V
 
I
V
x
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
I
R
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
C
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
T
V
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
V
W
 
W
S
 
A
D
 
D
I
 
R
H
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
A
A
 
E
S
 
E
V
 
V
I
 
E
A
 
R
I
 
V
M
 
M
E
 
I
A
 
S
N
 
N
V
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
L
 
M
V
 
L
E
 
Y
A
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
P
G
 
K
T
 
L
W
 
A
G
 
G
G
 
E
I
 
P
H
 
E
C
 
L
P
 
E
Q
 
R
-
 
C
G
 
S
C
 
C
D
 
C
H
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
T
A
 
A
V
 
A
I
 
I

1k27A Crystal structure of 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with a transition state analogue (see paper)
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:240/270 of 1k27A

query
sites
1k27A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
|
R
H
|
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
x
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
E
D
 
E
I
 
A
H
 
-
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

6dz0A Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with (3r,4s)-1-((4-amino-5h-pyrrolo[3,2- d]pyrimidin-7-yl)methyl)-4-((pent-4-yn-1-ylthio)methyl)pyrrolidin-3- ol (see paper)
42% identity, 83% coverage: 2:238/287 of query aligns to 2:245/274 of 6dz0A

query
sites
6dz0A
T
 
T
S
 
A
N
 
V
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
|
R
H
|
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
x
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
|
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

1sd1A Structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase complexed with formycin a (see paper)
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:238/268 of 1sd1A

query
sites
1sd1A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
A
D
 
-
I
 
-
H
 
-
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

1cg6A Structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase complexed with 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine and sulfate at 1.7 a resolution (see paper)
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:238/268 of 1cg6A

query
sites
1cg6A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
|
R
H
|
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
x
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
A
D
 
-
I
 
-
H
 
-
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

1cb0A Structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase at 1.7 a resolution (see paper)
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:238/268 of 1cb0A

query
sites
1cb0A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
 
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
A
D
 
-
I
 
-
H
 
-
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

5eubA Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with 2-amino-mta and sulfate
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 2:242/272 of 5eubA

query
sites
5eubA
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
|
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

6dz3A Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with (3r,4s)-1-((4-amino-5h-pyrrolo[3,2- d]pyrimidin-7-yl)methyl)-4-(((3-(1-butyl-1h-1,2,3-triazol-4-yl) propyl)thio)methyl)pyrrolidin-3-ol (see paper)
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:243/273 of 6dz3A

query
sites
6dz3A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
x
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
x
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

6dyzA Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with (3r,4s)-1-((4-amino-5h-pyrrolo[3,2- d]pyrimidin-7-yl)methyl)-4-((prop-2-yn-1-ylthio)methyl)pyrrolidin-3- ol (see paper)
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:243/273 of 6dyzA

query
sites
6dyzA
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
|
R
H
|
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
x
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

5tc8A Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with methylthio-dadme-immucillin-a
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:243/273 of 5tc8A

query
sites
5tc8A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
|
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

5tc6A Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with propylthio-immucillin-a
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:243/273 of 5tc6A

query
sites
5tc6A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
x
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

3ozcA Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methyladenosine phosphorylase in complex with pcl-phenylthiodadmeimma
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:243/273 of 3ozcA

query
sites
3ozcA
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
x
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

5tc5A Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with butylthio-dadme-immucillin-a and chloride
42% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 16:256/286 of 5tc5A

query
sites
5tc5A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
Q
H
|
H
R
 
T
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
T
S
 
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
 
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
|
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

Q8U4Q8 S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase; 5'-methylthioadenosine phosphorylase; MTA phosphorylase; MTAP; PfMTAP; EC 2.4.2.28 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) (see paper)
41% identity, 82% coverage: 5:239/287 of query aligns to 3:234/257 of Q8U4Q8

query
sites
Q8U4Q8
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
R
 
G
M
 
I
P
 
-
A
 
-
L
 
F
S
 
E
D
 
P
G
 
K
E
 
E
W
 
T
I
 
V
A
 
K
V
 
V
D
 
H
T
 
T
A
 
P
W
 
Y
G
 
G
A
 
R
P
 
P
S
 
S
D
 
A
S
 
P
L
 
V
L
 
E
L
 
I
G
 
G
T
 
E
I
 
I
A
 
E
G
 
G
R
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
I
P
 
P
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
K
G
 
Y
H
 
H
R
 
E
I
 
F
A
 
P
P
 
P
H
 
H
E
 
E
V
 
V
N
 
P
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
H
A
 
E
A
 
L
G
 
G
C
 
V
T
 
E
E
 
R
I
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
V
S
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
S
F
 
L
H
 
K
A
 
E
D
 
E
V
 
Y
P
 
K
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
F
T
 
T
T
 
K
R
 
K
G
 
R
G
 
E
R
 
Y
S
 
T
F
 
F
F
 
Y
G
 
N
D
 
G
G
 
P
I
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
A
 
I
A
 
S
F
 
M
G
 
A
H
 
D
P
 
P
T
 
F
C
|
C
T
 
P
R
 
E
L
 
L
G
 
R
A
 
R
V
 
I
V
 
F
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
E
E
 
L
G
 
N
G
 
L
L
 
P
H
 
V
R
 
H
I
 
E
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
Y
L
 
I
V
 
C
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
S
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
R
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
Q
W
 
F
G
 
A
C
 
-
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
L
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
L
E
 
G
L
 
M
C
|
C
Y
 
Y
A
 
V
S
 
N
V
 
I
A
 
S
M
 
T
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
Y
D
 
D
A
 
V
W
 
W
S
 
A
D
 
E
I
 
K
H
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
A
A
 
Q
S
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
R
I
 
V
M
 
M
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
E
A
 
E
R
 
K
A
 
V
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
V
 
L
E
 
K

Sites not aligning to the query:

6dz2A Crystal structure of human 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase in complex with (3r,4s)-1-((4-amino-5h-pyrrolo[3,2- d]pyrimidin-7-yl)methyl)-4-(((3-(1-benzyl-1h-1,2,3-triazol-4-yl) propyl)thio)methyl)pyrrolidin-3-ol (see paper)
41% identity, 82% coverage: 5:238/287 of query aligns to 3:240/270 of 6dz2A

query
sites
6dz2A
R
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
|
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
R
 
D
M
 
P
P
 
E
A
 
I
L
 
L
S
 
E
D
 
G
G
 
R
E
 
T
W
 
E
I
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
W
 
F
G
 
G
A
 
K
P
|
P
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
G
 
N
R
 
V
E
 
D
V
 
C
A
 
V
F
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
T
G
 
-
H
 
-
R
 
-
I
|
I
A
x
M
P
 
P
H
 
S
E
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
W
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
C
T
 
T
E
 
H
I
 
V
L
 
I
A
 
V
V
x
T
S
x
T
A
|
A
V
x
C
G
|
G
G
 
S
F
 
L
H
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
V
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
M
G
 
R
G
 
P
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
G
 
-
D
 
D
G
 
G
I
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
G
V
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
I
A
 
P
F
 
M
G
 
A
H
 
E
P
 
P
T
 
F
C
 
C
T
 
P
R
 
K
L
 
T
G
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
L
G
 
G
G
 
L
L
 
R
H
 
C
R
 
H
I
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
F
|
F
S
 
S
T
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
M
H
 
F
R
 
R
S
 
T
W
 
W
G
 
G
C
 
A
D
 
D
V
 
V
V
x
I
G
x
N
M
|
M
T
|
T
G
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
T
 
T
D
|
D
D
 
Y
D
|
D
A
 
C
W
 
W
S
 
K
D
 
E
I
 
H
H
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
V
D
 
S
V
|
V
A
 
D
S
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
K
I
 
T
M
x
L
E
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
A
A
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
L

Query Sequence

>WP_079647858.1 NCBI__GCF_900167915.1:WP_079647858.1
MTSNRLGLIGGSGLYRMPALSDGEWIAVDTAWGAPSDSLLLGTIAGREVAFLPRHGRGHR
IAPHEVNYRANIAALKAAGCTEILAVSAVGGFHADVPPGSFVLVDQYVDRTTRGGRSFFG
DGIVAHAAFGHPTCTRLGAVVAAALAEEGGLHRIGGTMLVIEGPQFSTRAESLLHRSWGC
DVVGMTGLPEARLAREAELCYASVAMVTDDDAWSDIHVDVASVIAIMEANVARAQALVEA
VAAGTWGGIHCPQGCDHALDGAVITAPLAWPPATKRRLATLLPRLFG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory