SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_079649353.1 NCBI__GCF_900167915.1:WP_079649353.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

8grjB Crystal structure of gamma-alpha subunit complex from burkholderia cepacia fad glucose dehydrogenase in complex with gluconolactone (see paper)
26% identity, 95% coverage: 20:551/562 of query aligns to 15:525/531 of 8grjB

query
sites
8grjB
A
 
V
A
 
A
K
 
H
E
 
Q
L
 
L
T
 
A
E
 
M
R
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
L
E
|
E
R
x
A
G
 
G
-
 
P
R
 
R
M
 
M
V
 
P
R
 
R
H
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
W
E
 
E
F
 
I
P
 
V
-
 
E
-
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
N
F
 
Q
G
 
P
D
 
D
R
 
K
L
 
M
L
 
D
Y
 
F
E
 
M
R
 
A
D
 
P
Y
 
Y
P
 
P
V
 
S
Q
 
S
R
 
P
R
 
W
G
 
A
R
 
P
G
 
H
F
 
P
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
S
 
P
V
 
P
Q
 
N
-
 
D
F
 
Y
F
 
L
V
 
I
N
 
L
D
 
K
R
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
K
Y
 
F
Q
 
N
V
 
S
E
x
Q
P
 
-
G
 
-
T
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
-
W
 
Y
L
 
I
R
|
R
G
 
A
Y
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
G
G
 
G
R
x
T
S
 
T
L
 
W
M
x
H
W
|
W
G
x
A
R
 
A
A
x
S
S
 
A
F
 
W
R
 
R
L
 
F
S
 
I
D
 
P
F
 
N
N
 
D
F
 
F
S
 
K
E
 
M
N
 
K
K
 
S
R
 
V
D
 
Y
G
 
G
H
 
V
G
 
G
I
 
R
D
 
D
W
 
W
P
 
P
I
 
I
R
 
Q
Y
 
Y
A
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
E
P
 
P
W
 
Y
Y
 
Y
D
 
Q
H
 
R
V
 
A
E
 
E
R
 
E
F
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
V
-
 
W
-
 
G
S
 
P
G
 
G
A
 
P
R
 
E
E
 
E
G
 
D
I
 
L
D
 
Y
E
 
S
L
 
P
P
 
R
D
 
K
G
 
Q
E
 
P
F
 
Y
-
 
P
L
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
L
A
 
P
M
 
L
N
 
S
C
 
F
I
 
N
E
 
E
E
 
Q
H
 
T
A
 
I
K
 
K
K
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
N
S
 
N
R
 
Y
F
 
D
P
 
P
G
 
K
R
 
F
R
 
H
M
 
V
I
 
V
N
 
T
E
 
E
R
 
P
T
 
V
A
 
A
V
 
R
L
 
N
S
 
S
R
 
R
D
 
P
H
 
Y
N
 
D
G
 
G
R
 
R
S
 
P
A
 
T
C
|
C
H
x
C
L
x
G
C
x
N
G
 
N
P
x
N
C
|
C
H
x
M
R
 
P
G
 
I
C
|
C
S
 
P
T
 
I
G
 
G
S
 
A
Y
 
M
F
 
Y
S
 
N
T
 
G
Q
 
I
S
 
V
S
 
H
T
 
V
L
 
E
P
 
K
A
 
A
A
 
E
Q
 
R
A
 
A
T
 
G
G
 
A
R
 
K
L
 
L
T
 
-
I
 
-
M
 
I
T
 
E
D
 
N
T
 
A
I
 
V
V
|
V
A
 
Y
G
 
K
V
 
L
D
 
E
Y
 
T
D
 
G
P
 
P
Q
 
D
S
 
K
K
 
R
R
 
I
V
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
-
T
 
-
I
 
Y
N
 
K
S
 
D
K
 
K
I
 
T
G
 
G
T
 
A
H
 
E
E
 
H
T
 
R
I
 
V
G
 
E
A
 
G
R
 
K
L
 
Y
I
 
F
F
 
V
L
 
L
N
 
A
A
|
A
S
x
N
T
 
G
L
 
I
G
x
E
T
 
T
I
 
P
Q
 
K
I
|
I
L
 
L
L
 
L
N
 
M
S
 
S
R
 
A
N
 
N
E
 
R
S
 
D
F
 
F
P
 
P
D
 
N
G
 
G
L
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
S
S
 
S
G
 
D
A
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
N
I
 
L
M
 
M
D
 
D
T
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
H
P
 
P
M
 
G
I
 
T
T
 
G
G
 
V
T
 
S
F
 
F
A
 
Y
G
 
A
F
 
S
D
 
E
Q
 
K
F
 
L
Q
 
W
P
 
P
V
 
-
G
 
G
N
 
R
R
 
G
P
|
P
T
 
Q
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
I
 
-
P
 
-
R
x
E
F
 
M
R
 
T
N
 
S
L
 
L
A
 
I
G
 
G
R
 
F
R
 
R
D
 
D
A
 
G
D
 
P
F
 
F
L
 
R
R
 
A
G
 
T
Y
 
E
G
 
A
Y
 
A
Q
 
K
G
 
K
S
 
I
G
x
H
S
 
L
R
 
S
A
 
N
L
 
L
W
 
S
T
 
R
R
 
I
G
 
D
V
 
Q
E
 
E
S
 
T
R
 
Q
S
 
K
I
 
I
G
 
F
P
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
M
-
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
E
L
 
L
K
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
I
R
 
R
K
 
D
P
 
R
G
 
S
P
 
A
W
 
R
T
 
Y
I
 
V
M
 
Q
L
 
F
G
 
D
G
 
C
M
 
F
G
 
H
E
 
E
P
 
I
L
 
L
P
 
P
N
 
Q
D
 
P
D
 
E
N
 
N
I
 
R
V
 
I
R
 
V
L
 
P
D
 
S
P
 
K
A
 
T
R
 
A
T
 
T
D
 
D
Q
 
A
W
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Q
 
R
L
 
P
L
 
E
V
 
I
S
 
T
H
 
Y
R
 
A
W
 
I
T
 
D
A
 
D
N
 
Y
E
 
V
E
 
K
R
 
R
M
 
G
A
 
A
Q
 
A
D
 
H
M
 
T
A
 
R
D
 
E
Q
 
V
G
 
Y
E
 
A
A
 
T
M
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
T
K
 
D
V
 
V
S
 
V
T
 
F
I
 
N
R
 
D
E
 
E
I
 
F
K
 
A
P
 
P
G
x
N
G
 
-
E
 
-
T
 
-
N
|
N
H
|
H
E
 
I
M
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
T
R
 
I
M
 
M
G
 
G
H
 
A
D
 
D
P
 
A
R
 
R
E
 
D
S
 
S
V
 
V
L
 
V
N
 
D
G
 
K
F
 
D
N
 
C
Q
 
R
A
 
T
H
 
F
D
 
D
I
 
H
P
 
P
N
 
N
L
 
L
F
 
F
V
 
I
T
 
S
D
 
S
G
 
S
S
 
A
C
 
T
M
 
M
T
 
P
S
 
T
S
 
V
P
 
G
C
 
T
Q
 
V
N
|
N
P
 
V
S
x
T
L
 
L
T
 
T
Y
 
I
M
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
L
R
 
R
A
 
M
A
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

8jejA Cryo-em structure of na-dithionite reduced membrane-bound fructose dehydrogenase from gluconobacter japonicus
24% identity, 98% coverage: 7:558/562 of query aligns to 7:540/540 of 8jejA

query
sites
8jejA
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
I
V
x
I
G
|
G
S
 
A
G
|
G
I
|
I
S
x
C
G
 
G
G
 
S
W
 
L
A
 
L
A
 
A
K
 
H
E
 
K
L
 
L
T
 
V
E
 
R
R
 
N
G
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
L
E
x
D
-
x
A
-
 
G
-
 
P
-
 
R
-
 
R
-
 
D
R
 
R
G
 
S
R
 
Q
M
 
I
V
 
V
R
 
E
H
 
N
G
 
W
E
 
R
D
 
N
Y
 
M
P
 
P
G
 
P
E
 
D
H
 
N
K
 
K
A
 
S
P
 
Q
W
 
Y
E
 
D
F
 
Y
-
 
A
-
 
T
P
 
P
F
 
Y
R
 
P
G
 
S
F
 
V
G
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
P
V
 
W
Q
 
A
R
 
P
R
 
H
G
 
T
R
 
N
G
 
Y
F
 
F
E
 
P
E
 
D
G
 
N
S
 
N
V
 
Y
Q
 
L
F
 
I
F
 
V
V
 
K
N
 
G
D
 
P
R
 
D
E
 
R
H
 
T
P
 
A
Y
 
Y
Q
 
K
V
 
Q
E
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
H
 
-
F
 
-
S
x
G
W
 
I
L
 
I
R
x
K
G
|
G
Y
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
G
G
|
G
R
x
T
S
x
T
L
 
W
M
x
H
W
|
W
G
x
A
R
 
A
A
x
S
S
 
S
F
 
W
R
 
R
L
 
Y
S
 
L
D
 
P
F
 
N
N
 
D
F
 
F
S
 
K
E
 
L
N
 
H
K
 
S
R
 
T
D
 
Y
G
 
G
H
 
V
G
 
G
I
 
R
D
 
D
W
 
Y
P
 
A
I
 
M
R
 
S
Y
 
Y
A
 
D
D
 
E
V
 
L
A
 
E
P
 
P
W
 
Y
Y
 
Y
D
 
Y
H
 
E
V
 
A
E
 
E
R
 
C
F
 
E
I
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
M
G
 
G
A
 
P
R
 
-
E
 
N
G
 
G
I
 
E
D
 
E
E
 
I
L
 
T
P
 
P
D
 
S
G
 
A
E
 
P
F
 
R
L
 
Q
P
 
N
P
 
P
F
 
W
A
 
P
M
 
M
N
 
T
C
 
S
I
 
M
E
 
P
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
E
 
D
H
 
R
A
 
T
K
 
F
K
 
T
A
 
E
I
 
I
E
 
V
S
 
S
R
 
K
F
 
L
P
 
-
G
 
G
R
 
F
R
 
S
M
 
N
I
 
T
N
 
P
E
 
V
R
 
P
T
 
Q
A
 
A
V
x
R
L
 
N
S
 
S
R
 
R
D
 
P
H
 
Y
N
 
D
G
 
G
R
 
R
S
 
P
A
 
Q
C
|
C
H
x
C
L
x
G
C
x
N
G
x
N
P
x
N
C
|
C
H
x
M
R
 
P
G
 
I
C
|
C
S
 
P
T
x
I
G
 
G
S
 
A
Y
x
M
F
 
Y
S
 
N
T
 
G
Q
 
V
S
 
Y
S
 
A
T
 
A
L
 
I
P
 
K
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
A
 
L
T
 
G
G
 
A
R
 
K
L
 
-
T
 
-
I
 
I
M
 
I
T
 
P
D
 
N
T
x
A
I
 
V
V
|
V
A
 
Y
G
 
A
V
 
M
D
 
E
Y
 
T
D
 
D
P
 
A
Q
 
K
S
 
N
K
 
-
R
 
R
V
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
I
R
 
S
T
 
F
I
 
Y
N
 
D
S
 
P
K
 
D
I
 
K
G
 
Q
T
 
S
H
 
H
E
 
R
T
 
V
I
 
V
G
 
-
A
 
A
R
 
K
L
 
T
I
 
F
F
 
V
L
 
I
N
 
A
A
|
A
S
x
N
T
 
G
L
 
I
G
x
E
T
 
T
I
 
P
Q
 
K
I
 
L
L
 
L
L
 
L
N
 
L
S
 
A
R
 
A
N
 
N
E
 
D
S
 
R
F
 
N
P
 
P
D
 
H
G
 
G
L
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
S
S
 
S
G
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
N
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
H
L
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
M
 
-
I
 
-
T
 
P
G
 
G
T
 
I
F
 
G
A
 
M
G
 
S
F
 
F
D
 
Q
Q
 
S
F
 
A
Q
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
W
N
 
A
R
 
G
P
 
G
T
 
G
G
x
S
I
 
V
Y
 
Q
I
 
M
P
 
S
R
 
S
F
 
I
R
 
T
N
 
N
L
 
F
A
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
R
D
 
D
A
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
R
R
 
S
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
N
Y
 
N
Q
 
T
G
 
A
S
 
Q
G
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
M
E
 
K
S
 
A
R
 
L
S
 
S
-
 
M
-
 
G
-
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
K
L
 
L
K
 
D
A
 
E
E
 
E
L
 
I
R
 
R
K
 
R
P
 
R
G
 
T
P
 
A
W
 
H
T
 
G
I
 
V
M
 
D
L
 
I
G
 
Y
G
 
A
M
 
N
G
 
H
E
 
E
P
 
V
L
 
L
P
 
P
N
 
D
D
 
P
D
 
N
N
 
N
I
 
R
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
S
P
 
K
A
 
D
R
 
Y
T
 
K
D
 
D
Q
 
A
W
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Q
 
H
L
 
P
L
 
E
V
 
V
S
 
T
H
 
Y
R
 
D
W
 
V
T
 
G
A
 
E
N
 
Y
E
 
V
E
 
R
R
 
K
M
 
S
A
 
A
Q
 
A
D
 
I
M
 
S
A
 
R
D
 
Q
Q
 
R
G
 
L
E
 
M
A
 
D
M
 
I
L
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
G
V
 
T
K
 
E
V
 
I
S
 
E
T
 
M
I
 
T
R
 
P
E
 
Y
I
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
N
N
|
N
H
|
H
E
 
I
M
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
I
M
 
M
G
 
G
H
 
H
D
 
D
P
 
P
R
 
R
E
 
D
S
 
S
V
 
V
L
 
V
N
 
D
G
 
K
F
 
W
N
 
L
Q
 
R
A
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
H
P
 
S
N
 
N
L
 
L
F
 
F
V
 
L
T
 
A
D
 
T
G
 
G
S
 
A
C
 
T
M
 
M
T
 
A
S
 
A
S
 
S
P
 
G
C
 
T
Q
 
V
N
|
N
P
 
S
S
x
T
L
 
L
T
 
T
Y
x
M
M
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
S
A
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
H
 
A
A
 
I
M
 
L
T
 
N
Q
 
D
L
 
L
Q
 
K

7w2jD Cryo-em structure of membrane-bound fructose dehydrogenase from gluconobacter japonicus
24% identity, 98% coverage: 7:558/562 of query aligns to 4:537/537 of 7w2jD

query
sites
7w2jD
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
I
V
 
I
G
|
G
S
 
A
G
|
G
I
 
I
S
 
C
G
 
G
G
 
S
W
 
L
A
 
L
A
 
A
K
 
H
E
 
K
L
 
L
T
 
V
E
 
R
R
 
N
G
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
L
E
x
D
-
x
A
-
 
G
-
 
P
-
 
R
-
 
R
-
 
D
R
 
R
G
 
S
R
 
Q
M
 
I
V
 
V
R
 
E
H
 
N
G
 
W
E
 
R
D
 
N
Y
 
M
P
 
P
G
 
P
E
 
D
H
 
N
K
 
K
A
 
S
P
 
Q
W
 
Y
E
 
D
F
x
Y
-
 
A
-
 
T
P
 
P
F
 
Y
R
 
P
G
 
S
F
 
V
G
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
P
V
 
W
Q
 
A
R
 
P
R
 
H
G
 
T
R
 
N
G
 
Y
F
 
F
E
 
P
E
 
D
G
 
N
S
 
N
V
 
Y
Q
 
L
F
 
I
F
 
V
V
 
K
N
 
G
D
 
P
R
 
D
E
 
R
H
 
T
P
 
A
Y
 
Y
Q
 
K
V
 
Q
E
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
G
W
 
I
L
 
I
R
x
K
G
 
G
Y
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
G
G
|
G
R
x
T
S
x
T
L
 
W
M
x
H
W
|
W
G
 
A
R
 
A
A
x
S
S
 
S
F
 
W
R
 
R
L
 
Y
S
 
L
D
 
P
F
 
N
N
 
D
F
 
F
S
 
K
E
 
L
N
 
H
K
 
S
R
 
T
D
 
Y
G
 
G
H
 
V
G
 
G
I
 
R
D
 
D
W
 
Y
P
 
A
I
 
M
R
 
S
Y
 
Y
A
 
D
D
 
E
V
 
L
A
 
E
P
 
P
W
 
Y
Y
 
Y
D
 
Y
H
 
E
V
 
A
E
 
E
R
 
C
F
 
E
I
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
M
G
 
G
A
 
P
R
 
-
E
 
N
G
 
G
I
 
E
D
 
E
E
 
I
L
 
T
P
 
P
D
 
S
G
 
A
E
 
P
F
 
R
L
 
Q
P
 
N
P
 
P
F
 
W
A
 
P
M
 
M
N
 
T
C
 
S
I
 
M
E
 
P
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
E
 
D
H
 
R
A
 
T
K
 
F
K
 
T
A
 
E
I
 
I
E
 
V
S
 
S
R
 
K
F
 
L
P
 
-
G
 
G
R
 
F
R
 
S
M
 
N
I
 
T
N
 
P
E
 
V
R
 
P
T
 
Q
A
 
A
V
x
R
L
 
N
S
 
S
R
 
R
D
 
P
H
 
Y
N
 
D
G
 
G
R
 
R
S
x
P
A
 
Q
C
|
C
H
 
C
L
x
G
C
x
N
G
x
N
P
 
N
C
|
C
H
 
M
R
 
P
G
 
I
C
|
C
S
 
P
T
x
I
G
 
G
S
x
A
Y
 
M
F
 
Y
S
 
N
T
 
G
Q
 
V
S
 
Y
S
 
A
T
 
A
L
 
I
P
 
K
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
A
 
L
T
 
G
G
 
A
R
 
K
L
 
-
T
 
-
I
 
I
M
 
I
T
 
P
D
 
N
T
 
A
I
 
V
V
|
V
A
 
Y
G
 
A
V
 
M
D
 
E
Y
 
T
D
 
D
P
 
A
Q
 
K
S
 
N
K
 
-
R
 
R
V
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
I
R
 
S
T
 
F
I
 
Y
N
 
D
S
 
P
K
 
D
I
 
K
G
 
Q
T
 
S
H
 
H
E
 
R
T
 
V
I
 
V
G
 
-
A
 
A
R
 
K
L
 
T
I
 
F
F
 
V
L
 
I
N
 
A
A
|
A
S
x
N
T
 
G
L
 
I
G
x
E
T
 
T
I
 
P
Q
x
K
I
x
L
L
 
L
L
 
L
N
 
L
S
 
A
R
 
A
N
 
N
E
 
D
S
 
R
F
 
N
P
 
P
D
 
H
G
 
G
L
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
S
S
 
S
G
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
N
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
H
L
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
M
 
-
I
 
-
T
 
P
G
 
G
T
 
I
F
 
G
A
 
M
G
 
S
F
 
F
D
 
Q
Q
 
S
F
 
A
Q
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
W
N
 
A
R
 
G
P
 
G
T
 
G
G
x
S
I
 
V
Y
 
Q
I
 
M
P
 
S
R
 
S
F
 
I
R
 
T
N
 
N
L
 
F
A
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
R
D
 
D
A
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
R
R
 
S
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
N
Y
 
N
Q
 
T
G
 
A
S
 
Q
G
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
-
W
 
G
T
 
M
R
 
K
G
 
A
V
 
L
E
 
S
S
 
M
R
 
G
S
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
K
L
 
L
K
 
D
A
 
E
E
 
E
L
 
I
R
 
R
K
 
R
P
 
R
G
 
T
P
 
A
W
 
H
T
 
G
I
 
V
M
 
D
L
 
I
G
 
Y
G
 
A
M
 
N
G
 
H
E
 
E
P
 
V
L
 
L
P
 
P
N
 
D
D
 
P
D
 
N
N
 
N
I
 
R
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
S
P
 
K
A
 
D
R
 
Y
T
 
K
D
 
D
Q
 
A
W
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Q
 
H
L
 
P
L
 
E
V
 
V
S
 
T
H
 
Y
R
 
D
W
 
V
T
 
G
A
 
E
N
 
Y
E
 
V
E
 
R
R
 
K
M
 
S
A
 
A
Q
 
A
D
 
I
M
 
S
A
 
R
D
 
Q
Q
 
R
G
 
L
E
 
M
A
 
D
M
 
I
L
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
G
V
 
T
K
 
E
V
 
I
S
 
E
T
 
M
I
 
T
R
 
P
E
 
Y
I
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
N
N
|
N
H
 
H
E
 
I
M
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
I
M
 
M
G
 
G
H
 
H
D
 
D
P
 
P
R
 
R
E
 
D
S
 
S
V
 
V
L
 
V
N
 
D
G
 
K
F
 
W
N
 
L
Q
 
R
A
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
H
P
 
S
N
 
N
L
 
L
F
 
F
V
 
L
T
 
A
D
 
T
G
 
G
S
 
A
C
 
T
M
 
M
T
 
A
S
 
A
S
 
S
P
 
G
C
 
T
Q
 
V
N
|
N
P
x
S
S
x
T
L
 
L
T
 
T
Y
 
M
M
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
S
A
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
H
 
A
A
 
I
M
 
L
T
 
N
Q
 
D
L
 
L
Q
 
K

P0DXE4 C-glycoside 3-oxidase; EC 1.1.3.50 from Microbacterium sp. (see paper)
31% identity, 23% coverage: 432:560/562 of query aligns to 369:496/501 of P0DXE4

query
sites
P0DXE4
V
 
V
R
 
R
L
 
F
D
 
D
P
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
P
D
 
D
Q
 
A
W
 
H
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Q
 
G
L
 
I
L
 
V
V
 
I
S
 
E
H
 
Y
R
 
G
W
 
L
T
 
T
A
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
D
R
 
R
M
 
D
A
 
R
Q
 
E
D
 
N
M
 
V
A
 
A
D
 
R
Q
 
A
G
 
K
E
 
R
A
 
E
M
 
V
L
 
A
R
 
A
A
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
G
V
 
E
S
 
Q
T
 
T
I
 
R
R
 
E
-
 
P
E
 
Q
I
 
L
K
 
L
P
 
P
G
 
A
G
 
G
E
 
S
T
 
S
N
 
L
H
|
H
E
 
Y
M
 
Q
G
 
G
G
 
S
A
 
V
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
S
-
 
V
D
 
D
P
 
D
R
 
G
E
 
E
S
 
S
V
 
V
L
 
C
N
 
D
G
 
G
F
 
S
N
 
G
Q
 
R
A
 
V
H
 
W
D
 
G
I
 
T
P
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
F
V
 
V
T
 
A
D
 
G
G
 
N
S
 
G
C
 
V
M
 
I
T
 
P
S
 
T
S
 
A
P
 
T
C
 
A
Q
 
C
N
 
N
P
 
P
S
 
T
L
 
L
T
 
T
Y
 
A
M
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
T
A
 
G
D
 
E
H
 
A
A
 
V
M
 
A
T
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
Q
 
G
G
 
G

8qveA C-glucosyl oxidoreductase (dacgo1) from deinococcus aerius (see paper)
29% identity, 22% coverage: 429:551/562 of query aligns to 368:487/495 of 8qveA

query
sites
8qveA
D
 
E
N
 
D
I
 
H
V
 
I
R
 
A
L
 
F
D
 
S
P
 
E
A
 
S
R
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
Y
W
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Q
 
R
L
 
M
L
 
T
V
 
V
S
 
H
H
 
H
R
 
T
W
 
L
T
 
T
A
 
P
N
 
A
E
 
D
E
 
E
R
 
A
M
 
V
A
 
I
Q
 
E
D
 
Q
M
 
A
A
 
K
D
 
A
Q
 
E
G
 
V
E
 
E
A
 
L
M
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
S
 
R
T
 
P
I
 
L
R
 
P
E
 
F
I
 
L
K
 
L
P
 
P
G
 
S
G
 
G
E
 
S
T
 
S
N
x
L
H
 
H
E
 
Y
M
 
Q
G
 
G
G
 
T
A
 
V
R
 
R
M
 
M
G
 
G
-
 
E
H
 
Q
D
 
D
P
 
D
R
 
G
E
 
Q
S
 
S
V
 
V
L
 
C
N
 
D
G
 
S
F
 
H
N
 
S
Q
 
R
A
 
V
H
 
W
D
 
G
I
 
Y
P
 
R
N
 
N
L
 
L
F
 
F
V
 
V
T
 
G
D
 
G
G
 
N
S
 
G
C
 
V
M
 
I
T
 
P
S
 
T
S
 
S
P
 
T
C
 
A
Q
 
C
N
|
N
P
 
P
S
x
T
L
 
I
T
 
T
Y
 
S
M
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7qvaA Crystal structure of a bacterial pyranose 2-oxidase in complex with mangiferin (see paper)
28% identity, 27% coverage: 410:562/562 of query aligns to 304:457/457 of 7qvaA

query
sites
7qvaA
K
 
S
P
 
P
G
 
V
P
 
P
W
 
G
T
 
S
I
 
I
M
 
V
L
 
G
G
 
L
G
 
G
M
 
L
-
 
F
-
 
C
G
 
A
E
 
K
P
 
D
L
 
L
P
 
Q
N
 
R
D
 
E
D
 
D
N
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
F
L
 
D
D
 
D
P
 
D
A
 
T
R
 
R
T
 
-
D
 
D
Q
 
S
W
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
M
L
 
R
V
 
I
S
 
H
H
 
Y
R
 
R
W
 
L
T
 
T
A
 
-
N
 
E
E
 
R
E
 
D
R
 
H
M
 
V
A
 
V
Q
 
L
D
 
D
M
 
R
A
 
A
D
 
R
Q
 
Q
G
 
E
E
 
I
A
 
V
M
 
R
L
 
L
R
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
V
A
 
G
V
 
E
K
 
P
V
 
L
S
 
D
T
 
E
I
 
R
R
 
P
E
 
F
I
 
V
K
 
L
P
 
P
G
 
P
G
 
G
E
x
A
T
x
S
N
x
L
H
|
H
E
 
Y
M
 
Q
G
 
G
G
 
T
A
 
T
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
E
-
 
T
D
 
D
P
 
D
R
 
G
E
 
E
S
 
S
V
 
V
L
 
C
N
 
S
G
 
P
F
 
D
N
 
S
Q
 
Q
A
 
V
H
 
W
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
N
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
V
T
 
A
D
 
G
G
 
N
S
 
G
C
 
V
M
 
I
T
 
P
S
 
T
S
 
A
P
 
T
C
 
A
Q
 
C
N
|
N
P
 
P
S
x
T
L
 
L
T
 
T
Y
 
S
M
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
A
D
 
R
H
 
K
A
 
I
M
 
A
T
 
E
Q
 
E
L
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
S
A
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7qfdA Crystal structure of a bacterial pyranose 2-oxidase complex with d- glucose (see paper)
29% identity, 23% coverage: 432:562/562 of query aligns to 328:458/458 of 7qfdA

query
sites
7qfdA
V
 
V
R
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
D
A
 
D
R
 
T
T
 
R
D
 
D
Q
 
S
W
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
M
L
 
R
V
 
I
S
 
H
H
 
Y
R
 
R
W
 
L
T
 
T
A
 
-
N
 
E
E
 
R
E
 
D
R
 
H
M
 
V
A
 
V
Q
 
L
D
 
D
M
 
R
A
 
A
D
 
R
Q
 
Q
G
 
E
E
 
I
A
 
V
M
 
R
L
 
L
R
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
V
A
 
G
V
 
E
K
 
P
V
 
L
S
 
D
T
 
E
I
 
R
R
 
P
E
 
F
I
 
V
K
 
L
P
 
P
G
 
P
G
 
G
E
 
A
T
 
S
N
x
L
H
|
H
E
 
Y
M
 
Q
G
 
G
G
 
T
A
 
T
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
E
-
 
T
D
 
D
P
 
D
R
 
G
E
 
E
S
 
S
V
 
V
L
 
C
N
 
S
G
 
P
F
 
D
N
 
S
Q
 
Q
A
 
V
H
 
W
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
N
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
V
T
 
A
D
 
G
G
 
N
S
 
G
C
 
V
M
 
I
T
 
P
S
 
T
S
 
A
P
 
T
C
 
A
Q
 
C
N
|
N
P
 
P
S
x
T
L
 
L
T
 
T
Y
 
S
M
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
A
D
 
R
H
 
K
A
 
I
M
 
A
T
 
E
Q
 
E
L
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
S
A
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7qf8A Crystal structure of a bacterial pyranose 2-oxidase from pseudoarthrobacter siccitolerans (see paper)
29% identity, 23% coverage: 432:562/562 of query aligns to 362:492/494 of 7qf8A

query
sites
7qf8A
V
 
V
R
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
D
A
 
D
R
 
T
T
 
R
D
 
D
Q
 
S
W
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
M
L
 
R
V
 
I
S
 
H
H
 
Y
R
 
R
W
 
L
T
 
T
A
 
-
N
 
E
E
 
R
E
 
D
R
 
H
M
 
V
A
 
V
Q
 
L
D
 
D
M
 
R
A
 
A
D
 
R
Q
 
Q
G
 
E
E
 
I
A
 
V
M
 
R
L
 
L
R
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
V
A
 
G
V
 
E
K
 
P
V
 
L
S
 
D
T
 
E
I
 
R
R
 
P
E
 
F
I
 
V
K
 
L
P
 
P
G
 
P
G
 
G
E
 
A
T
 
S
N
x
L
H
|
H
E
 
Y
M
 
Q
G
 
G
G
 
T
A
 
T
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
E
-
 
T
D
 
D
P
 
D
R
 
G
E
 
E
S
 
S
V
 
V
L
 
C
N
 
S
G
 
P
F
 
D
N
 
S
Q
 
Q
A
 
V
H
 
W
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
N
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
V
T
 
A
D
 
G
G
 
N
S
 
G
C
 
V
M
 
I
T
 
P
S
 
T
S
 
A
P
 
T
C
 
A
Q
 
C
N
|
N
P
 
P
S
x
T
L
 
L
T
 
T
Y
 
S
M
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
A
D
 
R
H
 
K
A
 
I
M
 
A
T
 
E
Q
 
E
L
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
S
A
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

9fl2B Crystal structure of oscillatoria princeps pyranose oxidase (see paper)
21% identity, 98% coverage: 7:554/562 of query aligns to 6:526/528 of 9fl2B

query
sites
9fl2B
D
 
E
A
 
V
I
 
V
V
 
I
V
 
I
G
|
G
S
 
S
G
|
G
I
x
P
S
x
V
G
 
G
G
 
A
W
 
T
A
 
F
A
 
A
K
 
R
E
 
H
L
 
L
T
 
V
E
 
E
R
 
N
G
 
G
A
 
K
R
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
V
E
x
D
R
x
A
G
 
G
R
 
P
M
 
-
V
 
-
R
 
-
H
 
Q
G
 
R
E
 
S
D
 
P
Y
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
 
H
-
 
L
K
 
K
A
 
N
P
 
A
W
 
Y
E
 
L
F
 
Y
P
 
Q
-
 
K
-
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
N
F
 
F
R
 
S
G
 
Q
F
 
I
G
x
V
D
 
N
R
 
S
L
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
K
R
 
L
D
 
S
Y
 
I
P
 
P
V
 
T
Q
 
S
R
 
N
R
 
V
G
 
K
R
 
L
G
 
P
F
 
N
E
 
L
E
 
D
G
 
P
S
 
S
V
 
A
Q
 
Y
F
 
W
F
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
A
V
 
V
N
 
R
D
 
N
R
 
N
E
 
M
H
 
N
P
 
P
Y
 
K
Q
 
Q
V
 
-
E
 
D
P
 
P
G
 
N
T
 
T
H
 
N
F
 
M
S
 
P
W
 
Y
L
 
A
R
 
Q
G
 
A
-
x
A
Y
x
F
Q
x
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
R
x
M
S
 
G
L
 
I
M
x
H
W
|
W
G
x
T
R
 
C
A
|
A
S
 
T
F
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
H
D
 
-
F
 
-
N
 
-
F
 
-
S
 
P
E
 
E
N
 
L
K
 
E
R
 
R
D
 
W
G
 
H
H
 
Y
G
 
I
I
 
T
D
 
E
W
 
W
P
 
D
I
 
E
R
 
L
Y
 
Y
A
 
A
D
 
Q
V
 
A
A
 
E
P
 
K
W
 
Y
Y
 
F
D
 
N
H
 
T
V
 
H
E
 
T
R
 
N
F
 
V
I
 
F
G
 
E
V
 
R
S
 
S
G
 
L
A
 
R
R
 
G
E
 
A
G
 
A
I
 
I
D
 
K
E
 
R
L
 
R
P
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
M
 
-
N
 
-
C
 
-
I
 
L
E
 
E
E
 
A
H
 
H
A
 
Y
K
 
N
K
 
N
A
 
Q
I
 
L
E
 
D
S
 
P
R
 
N
F
 
Y
P
 
P
G
 
I
R
 
Q
R
 
N
M
 
L
I
 
-
N
 
-
E
 
P
R
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
Q
L
 
R
S
 
R
R
 
E
D
 
D
H
 
G
N
 
E
G
 
G
R
 
E
S
 
A
A
 
F
C
 
I
H
 
H
L
 
W
C
 
T
G
 
G
P
 
P
C
 
Y
H
 
-
R
 
-
G
 
-
C
 
-
S
 
D
T
 
I
G
 
L
S
 
K
Y
 
P
F
 
V
S
 
L
T
 
T
Q
 
T
S
 
E
S
 
E
T
 
N
L
 
L
P
 
P
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
T
 
N
G
 
P
R
 
N
L
 
I
T
 
R
I
 
V
M
 
L
T
 
P
D
 
N
T
 
H
I
 
I
V
|
V
A
 
Q
G
 
K
V
 
L
D
 
H
Y
 
H
D
 
-
P
 
-
Q
 
K
S
 
G
K
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
E
A
 
Y
V
 
A
R
 
E
T
 
V
I
 
Q
N
 
S
S
 
T
K
 
E
I
 
P
G
 
W
T
 
E
H
 
K
E
 
V
T
 
E
I
 
I
G
 
Y
A
 
A
R
 
D
L
 
I
I
 
F
F
 
I
L
 
V
N
 
A
A
|
A
S
x
A
T
 
A
L
 
I
G
x
K
T
 
T
I
 
P
Q
 
Q
I
 
L
L
 
L
L
 
W
N
 
N
S
 
S
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
N
 
P
E
 
K
S
 
A
F
 
L
P
 
G
D
 
C
G
 
Y
L
 
L
A
 
S
N
 
E
R
 
H
S
 
I
G
 
M
A
 
T
V
 
F
G
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
S
R
 
K
G
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
A
T
 
E
L
 
I
K
 
K
G
 
A
P
 
P
M
 
Y
I
 
F
T
 
K
G
 
E
T
 
S
F
 
P
A
 
K
G
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
M
F
 
F
Q
 
H
P
 
V
V
 
A
G
 
G
N
 
N
R
 
Q
P
 
K
T
 
D
G
 
P
I
 
I
Y
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
L
F
 
Y
R
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
P
D
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
W
-
 
I
-
 
P
F
 
V
L
 
Q
R
 
K
G
 
D
Y
 
R
G
 
P
Y
 
W
Q
 
H
G
 
C
S
 
Q
G
 
I
S
 
H
R
 
K
A
 
D
L
 
N
W
x
F
T
 
S
R
 
Y
G
 
G
V
 
I
E
 
V
S
 
P
R
 
D
S
 
N
I
 
I
G
 
D
P
 
D
A
 
R
L
 
L
K
 
V
A
 
V
E
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
W
 
W
T
 
F
I
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
G
M
 
F
G
 
V
E
 
D
P
 
Q
L
 
M
P
 
P
N
 
T
D
 
-
D
 
-
N
 
N
I
 
Y
V
 
V
R
 
T
L
 
F
D
 
E
P
 
E
A
 
E
R
 
I
T
 
F
D
 
D
Q
 
I
W
 
H
G
 
G
L
 
M
P
 
P
Q
 
Q
L
 
P
L
 
T
V
 
F
S
 
H
H
 
F
R
 
Q
W
 
Y
-
 
P
-
 
E
-
 
Q
-
 
D
T
 
A
A
 
E
N
 
N
E
 
A
E
 
H
R
 
R
M
 
M
A
 
M
Q
 
Q
D
 
D
M
 
M
A
 
T
D
 
E
Q
 
V
G
 
G
E
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
S
A
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
F
V
 
L
K
 
P
V
 
T
S
 
P
T
 
E
I
 
A
R
 
R
-
 
P
E
 
Q
I
 
F
K
 
M
P
 
A
G
 
P
G
 
G
E
 
S
T
 
S
N
 
L
H
 
H
E
 
S
M
 
M
G
 
G
G
 
T
A
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
E
-
 
S
D
 
D
P
 
D
R
 
G
E
 
T
S
 
S
V
 
V
L
 
V
N
 
D
G
 
A
F
 
H
N
 
S
Q
 
K
A
 
V
H
 
W
D
 
G
I
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
V
 
L
T
 
G
D
 
G
G
 
P
S
 
G
C
 
V
M
 
I
T
 
P
S
 
K
S
 
P
P
 
N
C
 
G
Q
 
A
N
|
N
P
 
P
S
x
T
L
 
L
T
 
T
Y
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
N
H
 
H
A
 
I
M
 
L

Query Sequence

>WP_079649353.1 NCBI__GCF_900167915.1:WP_079649353.1
MTSSTFDAIVVGSGISGGWAAKELTERGARVLLIERGRMVRHGEDYPGEHKAPWEFPFRG
FGDRLLYERDYPVQRRGRGFEEGSVQFFVNDREHPYQVEPGTHFSWLRGYQVGGRSLMWG
RASFRLSDFNFSENKRDGHGIDWPIRYADVAPWYDHVERFIGVSGAREGIDELPDGEFLP
PFAMNCIEEHAKKAIESRFPGRRMINERTAVLSRDHNGRSACHLCGPCHRGCSTGSYFST
QSSTLPAAQATGRLTIMTDTIVAGVDYDPQSKRVTAVRTINSKIGTHETIGARLIFLNAS
TLGTIQILLNSRNESFPDGLANRSGAVGRGIMDTLKGPMITGTFAGFDQFQPVGNRPTGI
YIPRFRNLAGRRDADFLRGYGYQGSGSRALWTRGVESRSIGPALKAELRKPGPWTIMLGG
MGEPLPNDDNIVRLDPARTDQWGLPQLLVSHRWTANEERMAQDMADQGEAMLRAAGAVKV
STIREIKPGGETNHEMGGARMGHDPRESVLNGFNQAHDIPNLFVTDGSCMTSSPCQNPSL
TYMALTARAADHAMTQLQQGAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory