SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_082181234.1 NCBI__GCF_000295095.1:WP_082181234.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
36% identity, 90% coverage: 37:352/352 of query aligns to 7:282/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
V
 
V
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
K
Y
x
F
G
 
G
D
 
D
L
x
F
T
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
K
G
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
F
R
 
S
I
 
V
P
 
K
R
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
L
 
F
G
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
T
I
 
I
S
 
H
C
 
M
L
 
L
L
 
T
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
K
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
A
R
 
W
V
 
V
F
 
A
G
 
G
K
 
H
K
 
D
M
 
V
A
 
L
A
 
K
T
 
E
A
 
P
Y
 
R
G
 
E
L
 
V
K
 
R
R
 
R
R
 
K
I
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
V
P
 
F
Q
 
Q
E
 
D
V
 
Q
A
 
S
V
 
L
I
 
D
D
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
R
 
Y
E
 
E
N
 
N
I
 
M
D
 
Y
A
 
I
F
 
H
C
 
G
A
 
K
L
 
I
Y
 
Y
V
 
G
T
 
Y
D
 
G
R
 
G
A
 
E
R
 
K
R
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
R
V
 
I
E
 
L
E
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
E
F
 
F
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
L
R
 
E
F
 
F
T
 
K
K
 
D
F
 
K
H
 
P
P
 
V
K
 
K
K
x
T
L
x
F
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
N
 
E
I
 
I
A
 
A
C
 
R
G
 
S
I
 
L
A
 
I
H
 
H
K
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
G
V
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
S
 
T
R
 
R
E
 
A
S
 
H
I
 
M
L
 
W
Q
 
E
G
 
Y
I
 
I
R
 
S
R
 
K
L
 
M
N
 
K
A
 
K
D
 
E
-
 
H
G
 
N
A
 
M
T
 
T
I
 
I
I
 
F
Y
 
L
T
 
T
S
 
T
H
 
H
Y
 
Y
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
C
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
R
 
K
E
 
I
V
 
I
A
 
A
S
 
L
G
 
G
T
 
T
S
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
R
M
 
M
I
 
V
G
 
G
T
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
K
I
 
E
T
 
I
V
 
I
E
 
Y
V
 
V
V
 
R
D
 
D
P
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
F
L
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
C
R
 
R
S
 
K
L
 
L
P
 
P
C
 
D
V
 
G
R
 
R
S
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
L
E
 
E
L
 
L
T
 
N
V
 
V
E
 
E
C
 
D
R
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
H
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
I
G
 
E
R
 
E
V
 
I
T
 
T
S
 
Y
E
 
H
P
 
K
P
 
P
T
 
T
L
 
L
N
 
N
E
 
D
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
H
I
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
E
E
 
E
A
 
G

E9Q876 Glucosylceramide transporter ABCA12; ATP-binding cassette sub-family A member 12; EC 7.6.2.1 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
33% identity, 74% coverage: 5:264/352 of query aligns to 1316:1576/2595 of E9Q876

query
sites
E9Q876
Q
 
Q
R
 
N
P
 
T
G
 
N
P
 
P
P
 
S
A
 
A
A
 
S
P
 
K
A
 
T
S
 
S
P
 
P
A
 
D
P
 
C
A
 
A
P
 
F
P
 
P
A
 
S
P
 
N
T
 
I
A
 
E
S
 
P
S
 
E
P
 
P
E
 
K
T
 
D
T
 
L
A
 
Q
P
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
A
V
 
L
T
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
T
K
 
K
R
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
S
L
 
K
T
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
E
G
 
N
L
 
L
S
 
N
L
 
L
R
 
N
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
G
Q
 
H
I
 
I
L
 
T
G
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
T
 
T
I
|
I
S
|
S
C
x
M
L
|
L
L
x
T
Q
x
G
L
|
L
L
x
F
T
x
G
Y
x
A
D
x
T
R
x
A
G
|
G
E
x
T
V
x
I
R
x
F
V
|
V
F
x
Y
G
|
G
K
|
K
K
x
D
M
x
I
A
x
K
A
x
T
T
x
D
A
x
L
Y
x
N
G
x
T
L
x
V
K
x
R
R
x
K
R
x
N
I
x
M
G
|
G
L
x
V
I
x
C
P
x
M
Q
|
Q
E
x
H
V
x
D
A
x
V
V
x
L
I
x
F
D
x
S
E
x
Y
L
|
L
T
|
T
V
x
T
R
x
K
E
|
E
N
x
H
I
x
L
D
x
L
A
x
L
F
x
Y
C
x
G
A
x
S
L
x
I
Y
x
K
V
|
V
T
x
P
-
x
H
-
x
W
D
x
T
R
x
K
A
x
T
R
x
Q
R
x
L
R
x
H
E
|
E
L
x
E
V
|
V
E
x
K
E
x
R
A
 
T
I
 
L
A
 
K
F
 
D
V
 
T
G
 
G
L
 
L
E
 
Y
R
 
S
F
 
H
T
 
R
K
 
H
F
 
K
H
 
R
P
 
V
K
 
G
K
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
K
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
I
A
 
S
C
 
I
G
 
A
I
 
L
A
 
I
H
 
G
K
 
G
P
 
S
E
 
R
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
S
V
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
C
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
W
Q
 
D
G
 
V
I
 
I
R
 
S
R
 
K
L
 
-
N
 
N
A
 
K
D
 
T
G
 
A
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
L
T
 
S
S
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
L
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
E
E
 
V
L
 
L
C
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
F
M
 
L
D
 
E
H
 
Q
G
 
G
R
 
G
E
 
L
V
 
R
A
 
C
S
 
C
G
 
G
T
 
S
S
 
P
A
 
F
E
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
E
M
 
A
I
 
F
G
 
G
T
 
D
G
 
G
E
 
Y
R
 
H
I
 
L
T
 
T
V
 
L

Sites not aligning to the query:

7roqA Alternative structure of human abca1
32% identity, 85% coverage: 46:343/352 of query aligns to 783:1079/1831 of 7roqA

query
sites
7roqA
D
 
N
L
 
L
T
 
V
A
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
L
R
 
N
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
T
 
T
I
 
M
S
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
A
R
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
D
M
 
I
A
 
R
A
 
S
T
 
E
A
 
M
Y
 
S
G
 
T
L
 
I
K
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
V
 
N
A
 
V
V
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
M
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
I
 
I
D
 
W
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
R
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
K
R
 
H
R
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
Q
A
 
M
I
 
A
A
 
L
F
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
S
R
 
S
F
 
K
T
 
L
K
 
K
F
 
S
H
 
K
P
 
T
K
 
S
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
A
C
 
L
G
 
A
I
 
F
A
 
V
H
 
G
K
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
G
I
 
I
L
 
W
Q
 
E
G
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
G
 
G
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
L
T
 
S
S
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
V
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
S
H
 
H
G
 
G
R
 
K
E
 
L
V
 
C
A
 
C
S
 
V
G
 
G
T
 
S
S
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
Q
I
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
-
 
Y
-
 
Y
-
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
V
E
 
K
R
 
K
I
 
L
T
 
T
V
 
I
E
 
D
V
 
V
V
 
S
D
 
A
P
 
I
T
 
S
P
 
N
L
 
L
P
 
I
D
 
R
A
 
K
A
 
H
L
 
V
E
 
S
S
 
E
V
 
A
R
 
R
S
 
L
L
 
V
P
 
E
C
 
D
V
 
I
R
 
G
S
 
H
A
 
E
T
 
L
T
 
T
-
 
Y
-
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
E
S
 
A
A
 
A
D
 
K
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
F
T
 
V
E
 
E
L
 
L
T
 
F
V
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
H
 
H
N
 
E
L
 
I
A
 
D
D
 
D
V
 
R
L
 
L
A
 
S
A
 
D
L
 
L
A
 
G
A
 
I
S
 
S
G
 
S
A
 
Y
V
 
G
V
 
I
G
 
S
R
 
E
V
 
T
T
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
P
 
-
T
 
T
L
 
L
N
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

P41233 Phospholipid-transporting ATPase ABCA1; ATP-binding cassette sub-family A member 1; ATP-binding cassette transporter 1; ABC-1; ATP-binding cassette 1; EC 7.6.2.1 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
34% identity, 76% coverage: 34:300/352 of query aligns to 898:1170/2261 of P41233

query
sites
P41233
A
 
G
V
 
V
E
 
S
V
 
I
T
 
Q
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
V
Y
 
Y
G
 
R
D
 
D
-
 
G
-
 
M
L
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
L
R
 
N
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
T
 
T
I
 
M
S
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
A
R
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
D
M
 
I
A
 
R
A
 
S
T
 
E
A
 
M
Y
 
S
G
 
S
L
 
I
K
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
V
 
N
A
 
V
V
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
M
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
I
 
I
D
 
W
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
R
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
K
R
 
H
R
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
Q
A
 
M
I
 
A
A
 
L
F
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
P
F
 
-
T
 
S
K
 
K
F
 
L
H
 
K
P
 
S
K
 
K
-
 
T
-
 
S
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
A
C
 
L
G
 
A
I
 
F
A
 
V
H
 
G
K
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
G
I
 
I
L
 
W
Q
 
E
G
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
G
 
G
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
L
T
 
S
S
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
I
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
S
H
 
H
G
 
G
R
 
K
E
 
L
V
 
C
A
 
C
S
 
V
G
 
G
T
 
S
S
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
Q
I
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
Y
I
 
L
T
 
T
V
 
L
E
 
V
V
 
K
V
 
K
D
 
D
P
 
V
T
 
E
P
 
S
L
 
S
P
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
C
L
 
R
E
 
N
S
 
S
V
 
S
R
 
S
S
 
T
L
 
V
P
 
S
C
 
C
V
 
L
R
 
K
S
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
S
-
 
V
A
 
S
T
 
Q
T
 
S
S
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
G
A
 
L
S
 
G
T
 
S
E
 
D

Sites not aligning to the query:

O95477 Phospholipid-transporting ATPase ABCA1; ATP-binding cassette sub-family A member 1; ATP-binding cassette transporter 1; ABC-1; ATP-binding cassette 1; Cholesterol efflux regulatory protein; EC 7.6.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 35 papers)
37% identity, 66% coverage: 34:264/352 of query aligns to 898:1130/2261 of O95477

query
sites
O95477
A
 
G
V
 
V
E
 
S
V
 
I
T
 
Q
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
V
Y
 
Y
G
 
R
D
 
D
-
 
G
-
 
M
L
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
V
D
|
D
G
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
L
R
 
N
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
x
T
G
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
T
 
T
I
 
M
S
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
A
R
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
D
M
 
I
A
 
R
A
 
S
T
 
E
A
 
M
Y
 
S
G
 
T
L
 
I
K
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
V
 
N
A
 
V
V
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
M
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
I
 
I
D
 
W
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
R
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
K
R
 
H
R
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
Q
A
 
M
I
 
A
A
 
L
F
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
S
F
 
-
T
 
S
K
 
K
F
 
L
H
 
K
P
 
S
K
 
K
-
 
T
-
 
S
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
x
S
I
 
V
A
 
A
C
 
L
G
 
A
I
 
F
A
 
V
H
 
G
K
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
|
P
Q
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
G
I
 
I
L
 
W
Q
 
E
G
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
G
 
G
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
L
T
 
S
S
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
|
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
V
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
S
H
 
H
G
 
G
R
 
K
E
 
L
V
x
C
A
x
C
S
 
V
G
 
G
T
 
S
S
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
Q
I
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
Y
I
 
L
T
 
T
V
 
L

Sites not aligning to the query:

7tbwA The structure of atp-bound abca1 (see paper)
37% identity, 66% coverage: 34:264/352 of query aligns to 753:985/1928 of 7tbwA

query
sites
7tbwA
A
 
G
V
 
V
E
 
S
V
 
I
T
 
Q
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
V
Y
|
Y
G
 
R
D
|
D
-
 
G
-
 
M
L
x
K
T
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
L
R
 
N
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
 
T
T
 
T
I
 
M
S
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
A
R
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
D
M
 
I
A
 
R
A
 
S
T
 
E
A
 
M
Y
 
S
G
 
T
L
 
I
K
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
C
P
 
P
Q
|
Q
E
 
H
V
 
N
A
 
V
V
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
M
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
I
 
I
D
 
W
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
R
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
K
R
 
H
R
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
Q
A
 
M
I
 
A
A
 
L
F
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
S
F
 
-
T
 
S
K
 
K
F
 
L
H
 
K
P
 
S
K
 
K
-
 
T
-
 
S
K
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
A
C
 
L
G
 
A
I
 
F
A
 
V
H
 
G
K
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
G
I
 
I
L
 
W
Q
 
E
G
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
G
 
G
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
L
T
 
S
S
 
T
H
|
H
Y
 
H
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
V
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
S
H
 
H
G
 
G
R
 
K
E
 
L
V
 
C
A
 
C
S
 
V
G
 
G
T
 
S
S
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
Q
I
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
Y
I
 
L
T
 
T
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P34358 ABC transporter ced-7; Cell death protein 7 from Caenorhabditis elegans (see 2 papers)
33% identity, 74% coverage: 3:264/352 of query aligns to 514:776/1704 of P34358

query
sites
P34358
A
 
A
T
 
S
Q
 
T
R
 
S
P
 
L
G
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
N
A
 
A
P
 
D
A
 
S
S
 
D
P
 
S
A
 
L
P
 
L
A
 
E
P
 
G
P
 
S
A
 
T
P
 
E
T
 
A
A
 
D
S
 
G
S
 
A
P
 
R
E
 
D
T
 
T
T
 
A
A
 
R
P
 
A
A
 
D
V
 
I
E
 
I
V
 
V
T
 
R
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
I
Y
 
W
G
 
S
D
 
T
L
 
T
-
 
G
-
 
E
T
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
A
P
 
V
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
I
 
C
L
 
S
G
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
T
 
T
I
 
F
S
 
S
C
 
S
L
 
I
L
 
A
Q
 
G
L
 
I
L
 
I
T
 
R
Y
 
P
D
 
T
R
 
N
G
 
G
E
 
R
V
 
I
R
 
T
V
 
I
F
 
C
G
 
G
K
 
Y
K
 
D
M
 
V
A
 
G
A
 
N
T
 
E
A
 
P
Y
 
G
G
 
E
L
 
T
K
 
R
R
 
R
R
 
H
I
 
I
G
 
G
L
 
M
I
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
Y
V
 
N
A
 
P
V
 
L
I
 
Y
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
S
E
|
E
N
 
H
I
 
L
D
 
K
A
 
L
F
 
V
C
 
Y
A
 
G
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
A
D
 
R
R
 
E
A
 
K
R
 
D
R
 
F
R
 
K
E
 
Q
L
 
D
V
 
M
E
 
K
E
 
R
A
 
L
I
 
L
A
 
S
F
 
D
V
 
V
G
 
K
L
 
L
E
 
D
R
 
F
F
 
K
T
 
E
K
 
N
F
 
E
H
 
K
P
 
A
K
 
V
K
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
K
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
C
I
 
V
A
 
C
C
 
M
G
 
A
I
 
L
A
 
I
H
 
G
K
 
D
P
 
S
E
 
E
L
 
V
I
 
V
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
P
Q
 
G
S
 
A
R
 
R
E
 
Q
S
 
D
I
 
V
L
 
Q
Q
 
K
G
 
L
I
 
V
R
 
E
R
 
R
L
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
N
G
 
-
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
L
Y
 
L
T
 
T
S
 
T
H
 
H
Y
 
Y
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
W
I
 
V
V
 
F
I
 
I
M
 
M
D
 
S
H
 
H
G
 
G
R
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
N
A
 
Q
E
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
Q
M
 
K
I
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
L
I
 
L
T
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q99758 Phospholipid-transporting ATPase ABCA3; ABC-C transporter; ATP-binding cassette sub-family A member 3; ATP-binding cassette transporter 3; ATP-binding cassette 3; Xenobiotic-transporting ATPase ABCA3; EC 7.6.2.1; EC 7.6.2.2 from Homo sapiens (Human) (see 15 papers)
31% identity, 90% coverage: 26:343/352 of query aligns to 521:839/1704 of Q99758

query
sites
Q99758
S
 
A
S
 
E
P
 
P
E
 
E
T
 
D
T
 
L
A
 
V
P
 
A
A
 
G
V
 
I
E
 
K
V
 
I
T
 
K
G
 
H
L
 
L
V
 
S
K
 
K
-
 
V
-
 
F
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
-
 
N
-
 
K
D
 
D
L
 
R
T
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
R
G
 
D
L
 
L
S
 
N
L
 
L
R
 
N
I
 
L
P
 
Y
R
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
T
 
T
I
 
L
S
 
S
C
 
M
L
|
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
A
R
 
Y
V
 
I
F
 
S
G
 
G
K
 
Y
K
 
E
M
 
I
A
 
S
A
 
Q
T
 
D
A
 
M
Y
 
V
G
 
Q
L
 
I
K
x
R
R
 
K
R
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
V
 
D
A
 
I
V
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
H
I
 
L
D
 
Y
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
Q
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
L
D
 
S
R
 
R
A
 
Q
R
 
K
R
 
C
R
 
P
E
 
E
L
 
E
V
 
V
E
 
K
E
 
Q
A
 
M
I
 
L
A
 
H
F
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
D
F
 
K
T
 
W
K
 
N
F
 
S
H
 
R
P
 
S
K
 
R
K
 
F
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
R
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
I
A
 
G
C
 
I
G
 
A
I
 
L
A
 
I
H
 
A
K
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
I
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
x
S
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
A
Q
 
I
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
A
I
 
I
L
 
W
Q
 
D
G
 
L
I
 
L
R
 
Q
R
 
R
L
 
Q
N
 
K
A
 
S
D
 
D
G
 
-
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
V
Y
 
L
T
 
T
S
 
T
H
 
H
Y
 
F
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
L
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
M
D
 
A
H
 
K
G
 
G
R
 
E
E
 
L
V
 
Q
A
 
C
S
 
C
G
 
G
T
 
S
S
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
Q
M
 
K
I
 
Y
G
 
G
T
 
A
G
 
G
E
 
Y
R
 
H
I
 
M
T
 
T
V
 
L
E
 
-
V
 
V
V
 
K
D
 
E
P
|
P
T
 
H
P
 
C
L
 
N
P
 
P
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
D
V
 
I
R
 
S
S
 
Q
L
 
L
P
 
V
C
 
H
V
 
H
R
 
H
S
 
V
A
 
P
T
 
N
T
 
A
S
 
T
A
 
L
D
 
E
A
 
S
A
 
S
A
 
A
S
 
G
T
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
S
-
 
F
V
 
I
E
 
L
C
 
P
R
 
R
P
x
E
G
 
S
G
 
T
H
 
H
N
 
R
L
 
F
A
 
E
D
 
G
V
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
E
A
 
K
S
 
K
G
 
Q
A
 
K
V
 
E
V
 
L
G
 
G
R
 
I
V
 
A
T
 
S
-
 
F
-
 
G
S
 
A
E
 
S
P
 
I
P
 
T
T
 
T
L
 
M
N
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

7w02A Cryo-em structure of atp-bound abca3 (see paper)
31% identity, 90% coverage: 26:343/352 of query aligns to 486:804/1566 of 7w02A

query
sites
7w02A
S
 
A
S
 
E
P
 
P
E
 
E
T
 
D
T
 
L
A
 
V
P
 
A
A
 
G
V
 
I
E
 
K
V
 
I
T
 
K
G
 
H
L
 
L
V
 
S
K
 
K
-
 
V
-
x
F
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
-
 
N
-
 
K
D
 
D
L
 
R
T
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
R
G
 
D
L
 
L
S
 
N
L
 
L
R
 
N
I
 
L
P
 
Y
R
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
T
I
 
L
S
 
S
C
 
M
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
A
R
 
Y
V
 
I
F
 
S
G
 
G
K
 
Y
K
 
E
M
 
I
A
 
S
A
 
Q
T
 
D
A
 
M
Y
 
V
G
 
Q
L
 
I
K
 
R
R
 
K
R
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
C
P
 
P
Q
|
Q
E
 
H
V
 
D
A
 
I
V
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
H
I
 
L
D
 
Y
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
Q
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
L
D
 
S
R
 
R
A
 
Q
R
 
K
R
 
C
R
 
P
E
 
E
L
 
E
V
 
V
E
 
K
E
 
Q
A
 
M
I
 
L
A
 
H
F
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
D
F
 
K
T
 
W
K
 
N
F
 
S
H
 
R
P
 
S
K
 
R
K
 
F
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
R
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
I
A
 
G
C
 
I
G
 
A
I
 
L
A
 
I
H
 
A
K
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
I
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
V
 
S
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
A
Q
 
I
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
A
I
 
I
L
 
W
Q
 
D
G
 
L
I
 
L
R
 
Q
R
 
R
L
 
Q
N
 
K
A
 
S
D
 
D
G
 
-
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
V
Y
 
L
T
 
T
S
 
T
H
 
H
Y
 
F
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
L
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
M
D
 
A
H
 
K
G
 
G
R
 
E
E
 
L
V
 
Q
A
 
C
S
 
C
G
 
G
T
 
S
S
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
Q
M
 
K
I
 
Y
G
 
G
T
 
A
G
 
G
E
 
Y
R
 
H
I
 
M
T
 
T
V
 
L
E
 
-
V
 
V
V
 
K
D
 
E
P
 
P
T
 
H
P
 
C
L
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
D
A
 
I
L
 
S
E
 
Q
S
 
L
V
 
V
R
 
H
S
 
H
L
 
H
P
 
-
C
 
-
V
 
V
R
 
P
S
 
N
A
 
A
T
 
T
T
 
L
S
 
E
A
 
S
D
 
S
A
 
A
A
 
G
A
 
A
S
 
E
T
 
L
E
 
S
L
 
F
T
 
I
V
 
L
E
 
P
C
 
-
R
 
R
P
 
E
G
 
S
G
 
T
H
 
H
N
 
R
L
 
F
A
 
E
D
 
G
V
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
E
A
 
K
S
 
K
G
 
Q
A
 
K
V
 
E
V
 
L
G
 
G
R
 
I
V
 
A
T
 
S
-
 
F
-
 
G
S
 
A
E
 
S
P
 
I
P
 
T
T
 
T
L
 
M
N
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

7e7oA Cryo-em structure of human abca4 in nrpe-bound state (see paper)
36% identity, 70% coverage: 33:280/352 of query aligns to 813:1055/2003 of 7e7oA

query
sites
7e7oA
P
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
C
V
 
V
T
 
K
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
R
L
 
L
S
 
N
L
 
I
R
 
T
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
T
 
T
I
 
L
S
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
R
 
L
V
 
V
F
 
G
G
 
G
K
 
R
K
 
D
M
 
I
A
 
E
A
 
T
T
 
S
A
 
L
Y
 
D
G
 
A
L
 
V
K
 
R
R
 
Q
R
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
M
I
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
V
 
N
A
 
I
V
 
L
I
 
F
D
 
H
E
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
H
I
 
M
D
 
L
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
Q
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
K
D
 
S
R
 
Q
A
 
E
R
 
E
R
 
A
R
 
Q
E
 
L
L
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
A
A
 
M
I
 
L
A
 
E
F
 
D
V
 
T
G
 
G
L
 
L
E
 
H
R
 
H
F
 
K
T
 
R
K
 
N
F
 
E
H
 
E
P
 
A
K
 
Q
K
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
A
C
 
I
G
 
A
I
 
F
A
 
V
H
 
G
K
 
D
P
 
A
E
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
S
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
W
Q
 
D
G
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
N
 
R
A
 
S
D
 
-
G
 
G
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
M
T
 
S
S
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
L
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
A
H
 
Q
G
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
Y
A
 
C
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
P
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
C
I
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
R
 
Y
I
 
L
T
 
T
-
 
L
V
 
V
E
 
R
V
 
K
V
 
M
D
 
D
P
 
V
T
 
N
P
 
E
L
 
L
P
 
M
D
 
D
A
 
V
A
 
V
L
 
L
E
 
H
S
 
H
V
 
V

Sites not aligning to the query:

7e7qA Cryo-em structure of human abca4 in atp-bound state (see paper)
32% identity, 89% coverage: 33:344/352 of query aligns to 790:1091/1958 of 7e7qA

query
sites
7e7qA
P
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
C
V
 
V
T
 
K
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
I
Y
x
F
G
 
E
D
 
P
L
x
C
-
 
G
-
 
R
T
 
P
A
|
A
V
 
V
D
 
D
G
 
R
L
 
L
S
 
N
L
 
I
R
 
T
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
 
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
T
I
 
L
S
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
R
 
L
V
 
V
F
 
G
G
 
G
K
 
R
K
 
D
M
 
I
A
 
E
A
 
T
T
 
S
A
 
L
Y
 
D
G
 
A
L
 
V
K
 
R
R
 
Q
R
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
M
I
 
C
P
 
P
Q
|
Q
E
 
H
V
 
N
A
 
I
V
 
L
I
 
F
D
 
H
E
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
H
I
 
M
D
 
L
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
Q
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
K
D
 
S
R
 
Q
A
 
E
R
 
E
R
 
A
R
 
Q
E
 
L
L
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
A
A
 
M
I
 
L
A
 
E
F
 
D
V
 
T
G
 
G
L
 
L
E
 
H
R
 
H
F
 
K
T
 
R
K
 
N
F
 
E
H
 
E
P
 
A
K
 
Q
K
 
D
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
L
 
M
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
A
C
 
I
G
 
A
I
 
F
A
 
V
H
 
G
K
 
D
P
 
A
E
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
V
 
S
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
W
Q
 
D
G
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
N
 
R
A
 
S
D
 
-
G
 
G
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
M
T
 
S
S
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
L
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
A
H
 
Q
G
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
Y
A
 
C
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
P
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
C
I
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
R
 
Y
I
 
L
T
 
T
V
 
L
E
 
V
V
 
R
V
 
K
D
 
D
P
 
V
T
 
N
P
 
E
L
 
L
P
 
M
D
 
D
A
 
V
A
 
V
L
 
L
E
 
H
S
 
H
V
 
V
R
 
P
S
 
E
L
 
A
P
 
K
C
 
L
V
 
V
R
 
E
S
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
C
A
 
I
S
 
G
T
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
-
V
 
I
E
 
F
C
 
L
R
 
L
P
 
P
G
 
K
G
 
H
H
 
R
N
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
S
V
 
L
L
 
F
A
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
E
A
 
E
S
 
T
G
 
G
A
 
L
V
 
S
V
 
S
G
 
F
R
 
G
V
 
I
T
 
S
S
 
D
E
 
T
P
 
P
P
 
-
T
 
-
L
 
L
N
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7tbyA The structure of human abca1 in nanodisc (see paper)
34% identity, 69% coverage: 21:264/352 of query aligns to 677:912/1788 of 7tbyA

query
sites
7tbyA
P
 
P
A
 
R
P
 
C
T
 
M
A
 
E
S
 
E
S
 
E
P
 
P
E
 
T
T
 
H
T
 
L
A
 
K
P
 
L
A
 
G
V
 
V
E
 
S
V
 
I
T
 
Q
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
V
Y
 
Y
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
A
L
 
L
R
 
N
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
T
 
T
I
 
M
S
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
A
R
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
D
M
 
I
A
 
R
A
 
S
T
 
E
A
 
M
Y
 
S
G
 
T
L
 
I
K
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
V
 
N
A
 
V
V
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
M
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
I
 
I
D
 
W
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
R
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
K
R
 
H
R
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
Q
A
 
M
I
 
A
A
 
L
F
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
P
R
 
S
F
 
-
T
 
S
K
 
K
F
 
L
H
 
K
P
 
S
K
 
K
-
 
T
-
 
S
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
A
C
 
L
G
 
A
I
 
F
A
 
V
H
 
G
K
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
G
I
 
I
L
 
W
Q
 
E
G
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
G
 
G
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
L
T
 
S
S
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
V
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
S
H
 
H
G
 
G
R
 
K
E
 
L
V
 
C
A
 
C
S
 
V
G
 
G
T
 
S
S
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
Q
I
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
R
 
Y
I
 
L
T
 
T
V
 
L

Sites not aligning to the query:

8f5bA Human abca4 structure in complex with amp-pnp
35% identity, 70% coverage: 33:280/352 of query aligns to 719:968/1924 of 8f5bA

query
sites
8f5bA
P
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
C
V
 
V
T
 
K
G
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
I
Y
 
F
G
 
E
D
 
P
L
 
C
-
 
G
-
 
R
T
 
P
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
R
L
 
L
S
 
N
L
 
I
R
 
T
I
 
F
P
 
Y
R
 
E
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
L
 
T
G
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
T
 
T
I
 
L
S
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
P
Y
 
P
D
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
R
 
L
V
 
V
F
 
G
G
 
G
K
 
R
K
 
D
M
 
I
A
 
E
A
 
T
T
 
S
A
 
L
Y
 
D
G
 
A
L
 
V
K
 
R
R
 
Q
R
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
M
I
 
C
P
 
P
Q
|
Q
E
 
H
V
 
N
A
 
I
V
 
L
I
 
F
D
 
H
E
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
H
I
 
M
D
 
L
A
 
F
F
 
Y
C
 
A
A
 
Q
L
 
L
Y
 
K
V
 
G
T
 
K
D
 
S
R
 
Q
A
 
E
R
 
E
R
 
A
R
 
Q
E
 
L
L
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
A
A
 
M
I
 
L
A
 
E
F
 
D
V
 
T
G
 
G
L
 
L
E
 
H
R
 
H
F
 
K
T
 
R
K
 
N
F
 
E
H
 
E
P
 
A
K
 
Q
K
x
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
A
C
 
I
G
 
A
I
 
F
A
 
V
H
 
G
K
 
D
P
 
A
E
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
S
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
W
Q
 
D
G
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
N
 
R
A
 
S
D
 
-
G
 
G
A
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
M
T
 
S
S
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
L
L
 
L
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
I
 
I
M
 
I
D
 
A
H
 
Q
G
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
Y
A
 
C
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
P
A
 
L
E
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
C
I
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
R
 
Y
I
 
L
T
 
T
-
 
L
V
 
V
E
 
R
V
 
D
V
 
G
D
 
D
P
 
V
T
 
N
P
 
E
L
 
L
P
 
M
D
 
D
A
 
V
A
 
V
L
 
L
E
 
H
S
 
H
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q9BZC7 ATP-binding cassette sub-family A member 2; ATP-binding cassette transporter 2; ATP-binding cassette 2; EC 7.6.2.- from Homo sapiens (Human) (see paper)
29% identity, 89% coverage: 35:346/352 of query aligns to 2050:2363/2435 of Q9BZC7

query
sites
Q9BZC7
V
 
V
E
 
K
V
 
I
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
T
K
 
K
R
 
V
Y
 
Y
-
 
K
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
I
G
 
G
D
 
R
L
 
I
T
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
R
L
 
L
S
 
C
L
 
L
R
 
G
I
 
V
P
 
R
R
 
P
G
 
G
Q
 
E
I
 
C
L
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
V
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
S
T
 
T
I
 
F
S
 
K
C
 
M
L
 
L
L
 
T
Q
 
G
L
 
D
L
 
E
T
 
S
Y
 
T
D
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
A
R
 
F
V
 
V
F
 
N
G
 
G
K
 
H
K
 
S
M
 
V
A
 
L
A
 
K
T
 
E
A
 
L
Y
 
L
G
 
Q
L
 
V
K
 
Q
R
 
Q
R
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
Y
I
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
C
V
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
F
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
R
 
R
E
 
E
N
 
H
I
 
L
D
 
Q
A
 
L
F
 
Y
C
 
T
A
 
R
L
 
L
Y
 
R
V
 
G
T
 
I
D
 
S
R
 
W
A
 
K
R
 
D
R
 
E
R
 
A
E
 
R
L
 
V
V
 
V
E
 
K
E
 
W
A
 
A
I
 
L
A
 
E
F
 
K
V
 
L
G
 
E
L
 
L
E
 
T
R
 
K
F
 
Y
T
 
A
K
 
D
F
 
K
H
 
P
P
 
A
K
 
G
K
 
T
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
N
L
 
K
R
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
S
I
 
T
A
 
A
C
 
I
G
 
A
I
 
L
A
 
I
H
 
G
K
 
Y
P
 
P
E
 
A
L
 
F
I
 
I
I
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
S
 
A
R
 
R
E
 
R
S
 
F
I
 
L
L
 
W
Q
 
N
G
 
L
I
 
I
R
 
L
R
 
D
L
 
L
N
 
I
A
 
K
D
 
T
G
 
G
A
 
R
T
 
S
I
 
V
I
 
V
Y
 
L
T
 
T
S
 
S
H
 
H
Y
 
S
M
 
M
E
 
E
E
 
E
V
 
C
E
 
E
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
T
R
 
R
I
 
L
V
 
A
I
 
I
M
 
M
D
 
V
H
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
R
A
 
C
S
 
L
G
 
G
T
 
S
S
 
I
A
 
Q
E
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
N
M
 
R
I
 
F
G
 
G
T
 
D
G
 
G
E
 
Y
R
 
M
I
 
I
T
 
T
V
 
V
E
 
R
V
 
T
V
 
K
D
 
S
P
 
S
T
 
Q
P
 
S
L
 
V
P
 
K
D
 
D
A
 
V
A
 
V
L
 
R
E
 
F
S
 
F
V
 
N
R
 
R
S
 
N
L
 
F
P
 
P
C
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
E
T
 
A
S
 
M
A
 
L
D
 
K
A
 
E
A
 
R
A
 
H
S
 
H
T
 
T
E
 
K
L
 
V
T
 
Q
V
 
Y
E
 
Q
C
 
L
R
 
K
P
 
S
G
 
E
G
 
H
H
 
I
N
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
V
 
V
L
 
F
A
 
S
A
 
K
L
 
M
A
 
E
A
 
Q
S
 
V
G
 
S
A
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
-
 
I
-
 
E
R
 
D
V
 
Y
T
 
S
S
 
V
E
 
S
P
 
Q
P
 
T
T
 
T
L
 
L
N
 
D
E
 
N
V
 
V
F
 
F
L
 
V
E
 
N
I
 
F
T
 
A
G
 
K
R
 
K

Sites not aligning to the query:

P78363 Retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4; ATP-binding cassette sub-family A member 4; RIM ABC transporter; RIM proteinv; RmP; Retinal-specific ATP-binding cassette transporter; Stargardt disease protein; EC 7.6.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 43 papers)
35% identity, 66% coverage: 33:264/352 of query aligns to 927:1159/2273 of P78363

query
sites
P78363
P
|
P
A
x
G
V
|
V
E
x
C
V
|
V
T
x
K
G
x
N
L
|
L
V
|
V
K
|
K
R
x
I
Y
x
F
G
x
E
D
x
P
L
x
C
-
x
G
-
x
R
T
x
P
A
|
A