SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_082366659.1 NCBI__GCF_001298675.1:WP_082366659.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
46% identity, 88% coverage: 43:386/393 of query aligns to 2:343/343 of P30750

query
sites
P30750
V
 
I
A
 
K
F
 
L
R
 
S
D
 
N
V
 
I
A
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
 
F
R
 
H
S
 
Q
S
 
G
A
 
T
G
 
R
T
 
T
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
H
I
 
V
A
 
P
P
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
E
L
 
L
V
 
T
Q
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
L
A
 
D
G
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
I
 
V
A
 
K
A
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
H
D
 
D
T
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
|
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
T
 
T
T
 
T
H
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
I
V
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
Q
 
C
V
 
V
L
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
A
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
D
A
 
T
V
 
V
W
 
S
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
H
 
T
A
 
P
-
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
A
 
F
L
 
I
L
 
Q
A
 
S
P
 
T
L
 
L
Q
 
H
H
 
L
G
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
Q
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
E
P
 
P
P
 
F
A
 
T
G
 
D
A
 
C
Y
 
-
T
 
V
Q
 
P
I
 
M
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
G
 
E
Y
 
F
R
 
T
G
 
G
E
 
Q
D
 
S
G
x
V
L
x
D
E
x
A
P
|
P
D
x
L
L
|
L
P
 
S
R
 
E
I
 
T
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
L
 
F
G
 
N
A
 
V
R
 
N
V
 
N
R
x
N
L
x
I
L
 
I
H
 
S
G
 
A
G
 
Q
V
 
M
D
 
D
R
 
Y
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
H
 
V
A
 
K
Q
 
F
G
 
G
Q
 
I
L
 
M
L
 
L
V
 
T
A
 
E
L
 
M
E
 
H
G
 
G
A
 
-
A
 
-
A
 
T
R
 
Q
A
 
Q
D
 
D
W
 
T
T
 
Q
S
 
A
F
 
A
T
 
I
Q
 
A
G
 
W
R
 
L
E
 
Q
A
 
E
I
 
H
A
 
H
H
 
V
E
 
K
I
 
V
K
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
46% identity, 88% coverage: 43:386/393 of query aligns to 3:344/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
V
 
I
A
 
K
F
 
L
R
 
S
D
 
N
V
 
I
A
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
R
 
H
S
x
Q
S
 
G
A
 
T
G
 
R
T
 
T
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
H
I
 
V
A
 
P
P
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
E
L
 
L
V
 
T
Q
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
L
A
 
D
G
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
I
 
V
A
 
K
A
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
H
D
 
D
T
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
T
 
T
T
 
T
H
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
I
V
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
Q
 
C
V
 
V
L
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
A
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
D
A
 
T
V
 
V
W
 
S
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
H
 
T
A
 
P
-
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
A
 
F
L
 
I
L
 
Q
A
 
S
P
 
T
L
 
L
Q
 
H
H
 
L
G
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
Q
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
E
P
 
P
P
 
F
A
 
T
G
 
D
A
 
C
Y
 
-
T
 
V
Q
 
P
I
 
M
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
G
 
E
Y
x
F
R
 
T
G
 
G
E
 
Q
D
 
S
G
x
V
L
 
D
E
x
A
P
|
P
D
x
L
L
|
L
P
 
S
R
 
E
I
 
T
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
L
 
F
G
 
N
A
 
V
R
 
N
V
 
N
R
 
N
L
 
I
L
 
I
H
 
S
G
 
A
G
 
Q
V
 
M
D
 
D
R
 
Y
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
H
 
V
A
 
K
Q
 
F
G
|
G
Q
 
I
L
x
M
L
 
L
V
 
T
A
 
E
L
 
M
E
 
H
G
 
G
A
 
-
A
 
-
A
 
T
R
 
Q
A
 
Q
D
 
D
W
 
T
T
 
Q
S
 
A
F
 
A
T
 
I
Q
 
A
G
 
W
R
 
L
E
 
Q
A
 
E
I
 
H
A
 
H
H
 
V
E
 
K
I
 
V
K
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
46% identity, 88% coverage: 43:386/393 of query aligns to 3:344/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
V
 
I
A
 
K
F
 
L
R
 
S
D
 
N
V
 
I
A
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
R
 
H
S
 
Q
S
 
G
A
 
T
G
 
R
T
 
T
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
H
I
 
V
A
 
P
P
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
E
L
 
L
V
 
T
Q
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
L
A
 
D
G
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
I
 
V
A
 
K
A
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
H
D
 
D
T
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
T
 
T
T
 
T
H
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
I
V
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
Q
 
C
V
 
V
L
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
A
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
D
A
 
T
V
 
V
W
 
S
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
H
 
T
A
 
P
-
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
A
 
F
L
 
I
L
 
Q
A
 
S
P
 
T
L
 
L
Q
 
H
H
 
L
G
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
Q
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
E
P
 
P
P
 
F
A
 
T
G
 
D
A
 
C
Y
 
-
T
 
V
Q
 
P
I
 
M
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
G
 
E
Y
 
F
R
 
T
G
 
G
E
 
Q
D
 
S
G
 
V
L
 
D
E
 
A
P
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
S
R
 
E
I
 
T
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
L
 
F
G
 
N
A
 
V
R
 
N
V
 
N
R
 
N
L
 
I
L
 
I
H
 
S
G
 
A
G
 
Q
V
 
M
D
 
D
R
 
Y
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
H
 
V
A
 
K
Q
 
F
G
 
G
Q
 
I
L
 
M
L
 
L
V
 
T
A
 
E
L
 
M
E
 
H
G
 
G
A
 
-
A
 
-
A
 
T
R
 
Q
A
 
Q
D
 
D
W
 
T
T
 
Q
S
 
A
F
 
A
T
 
I
Q
 
A
G
 
W
R
 
L
E
 
Q
A
 
E
I
 
H
A
 
H
H
 
V
E
 
K
I
 
V
K
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
46% identity, 88% coverage: 43:386/393 of query aligns to 3:344/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
V
 
I
A
 
K
F
 
L
R
 
S
D
 
N
V
 
I
A
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
R
 
H
S
x
Q
S
 
G
A
 
T
G
 
R
T
 
T
V
x
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
H
I
 
V
A
 
P
P
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
E
L
 
L
V
 
T
Q
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
L
A
 
D
G
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
I
 
V
A
 
K
A
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
H
D
 
D
T
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
R
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
T
 
T
T
 
T
H
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
I
V
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
S
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
Q
 
C
V
 
V
L
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
A
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
D
A
 
T
V
 
V
W
 
S
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
H
 
T
A
 
P
-
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
A
 
F
L
 
I
L
 
Q
A
 
S
P
 
T
L
 
L
Q
 
H
H
 
L
G
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
Q
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
E
P
 
P
P
 
F
A
 
T
G
 
D
A
 
C
Y
 
-
T
 
V
Q
 
P
I
 
M
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
G
 
E
Y
 
F
R
 
T
G
 
G
E
 
Q
D
 
S
G
 
V
L
 
D
E
 
A
P
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
S
R
 
E
I
 
T
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
L
 
F
G
 
N
A
 
V
R
 
N
V
 
N
R
 
A
L
 
I
L
 
I
H
 
S
G
 
A
G
 
Q
V
 
M
D
 
D
R
 
Y
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
H
 
V
A
 
K
Q
 
F
G
 
G
Q
 
I
L
 
M
L
 
L
V
 
T
A
 
E
L
 
M
E
 
H
G
 
G
A
 
-
A
 
-
A
 
T
R
 
Q
A
 
Q
D
 
D
W
 
T
T
 
Q
S
 
A
F
 
A
T
 
I
Q
 
A
G
 
W
R
 
L
E
 
Q
A
 
E
I
 
H
A
 
H
H
 
V
E
 
K
I
 
V
K
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
44% identity, 62% coverage: 43:287/393 of query aligns to 3:241/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
V
 
I
A
 
R
F
 
I
R
 
R
D
 
N
V
 
L
A
 
H
K
 
K
T
 
W
Y
x
F
R
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
T
 
P
V
 
L
Q
 
H
A
x
V
L
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
I
S
 
H
L
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
E
I
 
K
F
 
L
G
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
P
 
F
T
 
Q
S
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
L
D
 
S
I
 
V
G
 
K
T
 
-
L
 
-
S
 
D
E
 
D
A
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
R
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
T
L
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
K
 
R
V
 
V
A
 
R
G
 
R
V
 
W
P
 
P
A
 
R
A
 
E
Q
 
K
I
 
A
A
 
E
A
 
K
R
 
K
V
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
E
L
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
Q
 
L
D
 
D
K
 
Q
A
 
A
D
 
R
T
 
K
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
G
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
T
 
V
H
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
Q
 
D
L
 
V
L
 
M
R
 
R
D
 
D
I
 
L
N
 
A
R
 
Q
T
 
G
L
 
-
G
 
G
I
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
L
 
V
V
 
F
L
 
M
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
A
 
V
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
R
V
 
P
W
 
E
Q
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
T
N
 
R
P
 
P
Q
 
K
H
 
E
A
 
E
A
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
F
L
 
L
A
 
Q
P
 
R
L
 
V
Q
 
L
H
 
H

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
41% identity, 62% coverage: 43:285/393 of query aligns to 2:239/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
V
 
I
A
 
F
F
 
V
R
 
N
D
 
D
V
 
V
A
 
Y
K
 
K
T
 
N
Y
x
F
R
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
T
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
V
S
 
T
L
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
N
P
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
V
G
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
C
I
 
I
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
K
I
 
I
G
 
N
T
 
N
L
 
-
S
 
G
E
 
K
A
 
V
G
 
N
L
 
I
V
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
R
 
K
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
L
T
 
T
V
 
A
A
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
V
K
 
K
V
 
V
A
 
K
G
 
K
V
 
M
P
 
N
A
 
K
A
 
K
Q
 
E
I
 
A
A
 
E
A
 
E
R
 
L
V
 
A
Q
 
V
E
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
A
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
L
D
 
D
K
 
K
A
 
K
D
 
D
T
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
S
 
I
R
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
G
 
Q
P
 
P
E
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
|
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
T
 
V
H
 
K
S
 
E
I
 
V
L
 
L
Q
 
N
L
 
V
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
R
 
N
T
 
E
L
 
-
G
 
G
I
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
L
 
I
V
 
F
L
 
M
E
 
D
Q
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
I
A
 
V
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
T
V
 
P
W
 
E
Q
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
Y
N
 
R
P
 
A
Q
 
K
H
 
N
A
 
E
A
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
E
L
 
F
L
 
L
A
 
S
P
 
K
L
 
I

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
43% identity, 59% coverage: 53:283/393 of query aligns to 10:239/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
R
 
K
S
 
K
S
 
S
A
x
F
G
 
G
T
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
I
S
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
A
 
R
P
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
P
 
F
T
 
D
S
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
I
 
L
G
 
K
T
 
A
L
 
-
S
 
K
E
 
D
A
 
T
G
 
N
L
 
L
V
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
K
 
K
V
 
V
A
 
R
G
 
K
V
 
W
P
 
P
A
 
R
A
 
E
Q
 
K
I
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
A
Q
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
K
 
K
A
 
A
D
 
H
T
 
A
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
G
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
T
 
V
H
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
Q
 
S
L
 
V
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
R
 
N
T
 
E
L
 
-
G
 
G
I
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
A
 
I
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
K
V
 
P
W
 
E
Q
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
A
 
E
A
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
43% identity, 59% coverage: 53:283/393 of query aligns to 10:239/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
R
 
K
S
 
K
S
 
S
A
x
F
G
 
G
T
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
I
S
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
A
 
R
P
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
P
 
F
T
 
D
S
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
I
 
L
G
 
K
T
 
A
L
 
-
S
 
K
E
 
D
A
 
T
G
 
N
L
 
L
V
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
K
 
K
V
 
V
A
 
R
G
 
K
V
 
W
P
 
P
A
 
R
A
 
E
Q
 
K
I
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
A
Q
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
K
 
K
A
 
A
D
 
H
T
 
A
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
G
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
|
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
T
 
V
H
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
Q
 
S
L
 
V
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
R
 
N
T
 
E
L
 
-
G
 
G
I
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
A
 
I
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
K
V
 
P
W
 
E
Q
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
A
 
E
A
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
43% identity, 59% coverage: 53:283/393 of query aligns to 10:239/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
R
 
K
S
 
K
S
 
S
A
x
F
G
 
G
T
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
I
S
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
A
 
R
P
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
P
 
F
T
 
D
S
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
I
 
L
G
 
K
T
 
A
L
 
-
S
 
K
E
 
D
A
 
T
G
 
N
L
 
L
V
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
K
 
K
V
 
V
A
 
R
G
 
K
V
 
W
P
 
P
A
 
R
A
 
E
Q
 
K
I
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
A
Q
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
K
 
K
A
 
A
D
 
H
T
 
A
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
G
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
T
 
V
H
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
Q
 
S
L
 
V
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
R
 
N
T
 
E
L
 
-
G
 
G
I
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
A
 
I
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
K
V
 
P
W
 
E
Q
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
A
 
E
A
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
43% identity, 59% coverage: 53:283/393 of query aligns to 10:239/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
R
 
K
S
 
K
S
 
S
A
x
F
G
 
G
T
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
I
S
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
A
 
R
P
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
T
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
P
 
F
T
 
D
S
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
I
 
L
G
 
K
T
 
A
L
 
-
S
 
K
E
 
D
A
 
T
G
 
N
L
 
L
V
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
L
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
K
 
K
V
 
V
A
 
R
G
 
K
V
 
W
P
 
P
A
 
R
A
 
E
Q
 
K
I
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
A
Q
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
K
 
K
A
 
A
D
 
H
T
 
A
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
G
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
M
T
 
V
H
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
Q
 
S
L
 
V
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
R
 
N
T
 
E
L
 
-
G
 
G
I
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
A
 
I
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
K
V
 
P
W
 
E
Q
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
A
 
E
A
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
38% identity, 59% coverage: 53:282/393 of query aligns to 34:263/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
R
 
K
S
 
K
S
 
T
A
 
G
G
 
A
T
|
T
V
|
V
Q
x
G
A
 
V
L
 
Y
D
 
D
A
 
T
I
 
-
S
 
N
L
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
N
P
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
L
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
D
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
K
-
 
T
I
 
M
G
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
R
T
 
T
V
 
I
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
L
 
Y
P
 
G
L
 
L
K
 
E
V
 
V
A
 
Q
G
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
I
 
R
A
 
R
A
 
K
R
 
R
V
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
A
L
 
L
L
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
Q
 
L
D
 
D
K
 
F
A
 
K
D
 
D
T
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
S
 
K
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
N
G
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
M
D
|
D
E
|
E
A
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
T
 
I
T
 
R
H
 
R
S
 
E
I
 
M
L
 
Q
Q
 
D
L
 
E
L
 
L
R
 
L
D
 
E
I
 
L
N
 
Q
R
 
A
T
 
K
L
 
F
G
 
Q
I
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
I
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
S
 
N
V
 
E
I
 
A
R
 
L
E
 
R
I
 
I
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
I
L
 
A
V
 
I
L
 
M
E
 
K
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
M
E
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
T
V
 
G
W
 
E
Q
 
E
V
 
I
F
 
L
G
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
H
 
N
A
 
D
A
 
Y
T
 
V
R
 
K
A
 
T
L
 
F
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
38% identity, 59% coverage: 53:282/393 of query aligns to 34:263/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
R
 
K
S
 
K
S
 
T
A
 
G
G
 
A
T
 
T
V
 
V
Q
 
G
A
 
V
L
 
Y
D
 
D
A
 
T
I
 
-
S
 
N
L
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
N
P
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
D
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
K
-
 
T
I
 
M
G
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
R
T
 
T
V
 
I
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
L
 
Y
P
 
G
L
 
L
K
 
E
V
 
V
A
 
Q
G
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
I
 
R
A
 
R
A
 
K
R
 
R
V
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
A
L
 
L
L
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
Q
 
L
D
 
D
K
 
F
A
 
K
D
 
D
T
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
S
 
K
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
N
G
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
T
 
I
T
 
R
H
 
R
S
 
E
I
 
M
L
 
Q
Q
 
D
L
 
E
L
 
L
R
 
L
D
 
E
I
 
L
N
 
Q
R
 
A
T
 
K
L
 
F
G
 
Q
I
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
I
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
S
 
N
V
 
E
I
 
A
R
 
L
E
 
R
I
 
I
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
I
L
 
A
V
 
I
L
 
M
E
 
K
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
M
E
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
T
V
 
G
W
 
E
Q
 
E
V
 
I
F
 
L
G
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
H
 
N
A
 
D
A
 
Y
T
 
V
R
 
K
A
 
T
L
 
F
L
 
V

Sites not aligning to the query:

8j5qD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- translocation state (see paper)
42% identity, 66% coverage: 24:282/393 of query aligns to 327:599/611 of 8j5qD

query
sites
8j5qD
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
I
R
 
Y
R
 
R
G
 
-
T
 
V
P
 
K
T
 
T
H
 
E
A
 
A
A
 
R
P
 
P
R
 
A
G
 
A
A
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
V
A
 
V
V
 
V
A
 
R
F
 
V
R
 
R
D
 
H
V
 
L
A
 
V
K
 
K
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
R
S
 
R
S
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
E
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
R
P
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
T
F
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
T
L
 
L
R
 
H
T
 
E
I
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
L
E
 
A
Q
 
A
P
 
P
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
L
 
E
V
 
V
D
 
L
G
 
G
V
 
T
D
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
G
E
 
T
A
 
A
G
 
E
L
 
R
V
 
R
Q
 
S
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
D
I
 
I
G
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
-
 
P
-
 
V
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
D
S
 
P
A
 
R
K
 
L
T
 
P
V
 
V
A
 
F
E
 
D
N
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
E
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
V
 
A
A
 
N
G
 
G
V
 
F
P
 
G
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
I
 
T
A
 
H
A
 
A
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
D
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
D
 
H
-
 
G
K
 
D
A
 
A
D
 
S
T
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
R
 
E
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
P
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
L
L
 
A
C
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
S
T
 
I
T
 
Q
H
 
A
S
 
G
I
 
I
L
 
I
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
R
 
L
D
 
D
I
 
L
N
 
Q
R
 
E
T
 
Q
L
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
S
V
 
Y
V
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
H
I
 
L
A
 
A
D
 
H
Q
 
Q
V
 
V
L
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
D
V
 
S
W
 
E
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
H
A
 
E
A
 
Y
T
 
T
R
 
R
A
 
R
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
39% identity, 56% coverage: 53:273/393 of query aligns to 34:254/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
R
 
K
S
 
K
S
 
T
A
 
G
G
 
A
T
|
T
V
 
V
Q
 
G
A
 
V
L
 
Y
D
 
D
A
 
T
I
 
-
S
 
N
L
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
N
P
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
L
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
D
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
K
-
 
T
I
 
M
G
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
A
 
H
K
 
R
T
 
T
V
 
I
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
L
 
Y
P
 
G
L
 
L
K
 
E
V
 
V
A
 
Q
G
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
I
 
R
A
 
R
A
 
K
R
 
R
V
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
A
L
 
L
L
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
Q
 
L
D
 
D
K
 
F
A
 
K
D
 
D
T
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
S
x
K
R
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
N
G
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
M
D
 
D
E
x
Q
A
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
T
 
I
T
 
R
H
 
R
S
 
E
I
 
M
L
 
Q
Q
 
D
L
 
E
L
 
L
R
 
L
D
 
E
I
 
L
N
 
Q
R
 
A
T
 
K
L
 
F
G
 
Q
I
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
I
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
|
H
E
 
D
M
 
L
S
 
N
V
 
E
I
 
A
R
 
L
E
 
R
I
 
I
A
 
G
D
 
D
Q
 
R
V
 
I
L
 
A
V
 
I
L
 
M
E
 
K
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
M
E
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
T
V
 
G
W
 
E
Q
 
E
V
 
I
F
 
L
G
 
T
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
44% identity, 55% coverage: 43:260/393 of query aligns to 2:215/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
V
 
I
A
 
R
F
 
F
R
 
E
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
K
 
K
T
 
R
Y
|
Y
R
 
P
S
 
N
S
 
-
A
 
-
G
 
G
T
x
H
V
 
V
Q
 
-
A
 
G
L
 
L
D
 
H
A
 
E
I
 
V
S
 
S
L
 
F
E
 
R
I
 
V
A
 
H
P
 
R
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
L
G
 
F
I
 
V
I
 
T
G
 
G
R
 
H
S
|
S
G
 
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
L
I
 
I
N
 
L
R
 
A
L
 
M
E
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
V
 
L
D
 
G
G
 
G
V
 
Q
D
 
D
I
 
L
G
 
G
T
 
R
L
 
I
S
 
T
E
 
T
A
 
A
G
 
Q
L
 
I
V
 
P
Q
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
H
N
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
V
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
M
P
 
P
A
 
K
A
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
E
 
S
L
 
A
L
 
L
L
 
E
L
 
R
V
 
V
G
 
N
L
 
L
Q
 
K
D
 
E
K
 
K
A
 
G
D
 
E
T
 
A
Y
 
L
P
 
P
S
 
S
R
x
D
L
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
Q
|
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
H
G
 
Q
P
 
P
E
 
A
I
 
L
L
 
L
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
T
 
L
T
 
A
H
 
S
S
 
E
I
 
I
L
 
M
Q
 
G
L
 
V
L
 
F
R
 
E
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
-
L
 
L
G
 
G
I
 
T
T
 
T
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
A
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
S
 
A
V
 
L
I
 
I
R
 
A
E
 
R
I
 
M
A
 
R
D
 
H
Q
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
T
L
 
L
E
 
Q
Q
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I

8j5tD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the catalytic intermediate state (see paper)
41% identity, 66% coverage: 24:282/393 of query aligns to 327:599/608 of 8j5tD

query
sites
8j5tD
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
I
R
 
Y
R
 
R
G
 
-
T
 
V
P
 
K
T
 
T
H
 
E
A
 
A
A
 
R
P
 
P
R
 
A
G
 
A
A
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
V
A
 
V
V
 
V
A
 
R
F
 
V
R
 
R
D
 
H
V
 
L
A
 
V
K
 
K
T
 
T
Y
|
Y
R
 
R
S
 
L
S
 
A
A
 
K
G
 
G
T
 
V
V
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
V
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
R
P
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
T
F
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
E
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
H
T
 
E
I
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
L
E
 
A
Q
 
A
P
 
P
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
L
 
E
V
 
V
D
 
L
G
 
G
V
 
T
D
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
G
E
 
T
A
 
A
G
 
E
L
 
R
V
 
R
Q
 
S
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
D
I
 
I
G
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
D
-
 
P
-
 
V
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
D
S
 
P
A
 
R
K
 
L
T
 
P
V
 
V
A
 
F
E
 
D
N
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
E
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
V
 
A
A
 
N
G
 
G
V
 
F
P
 
G
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
I
 
T
A
 
H
A
 
A
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
D
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
D
 
H
-
 
G
K
 
D
A
 
A
D
 
S
T
x
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
R
x
E
L
 
F
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
P
 
P
E
 
K
I
 
I
L
 
L
L
 
A
C
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
P
T
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
V
E
 
S
T
 
I
T
 
Q
H
 
A
S
 
G
I
 
I
L
 
I
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
R
 
L
D
 
D
I
 
L
N
 
Q
R
 
E
T
 
Q
L
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
S
V
 
Y
V
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
|
H
E
 
D
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
H
I
 
L
A
 
A
D
 
H
Q
 
Q
V
 
V
L
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
D
V
 
S
W
 
E
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
H
A
 
E
A
 
Y
T
 
T
R
 
R
A
 
R
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8j5sD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- catalytic intermediate state (see paper)
41% identity, 66% coverage: 24:282/393 of query aligns to 327:599/608 of 8j5sD

query
sites
8j5sD
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
I
R
 
Y
R
 
R
G
 
-
T
 
V
P
 
K
T
 
T
H
 
E
A
 
A
A
 
R
P
 
P
R
 
A
G
 
A
A
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
V
A
 
V
V
 
V
A
 
R
F
 
V
R
 
R
D
 
H
V
 
L
A
 
V
K
 
K
T
 
T
Y
|
Y
R
 
R
S
 
L
S
 
A
A
 
K
G
 
G
T
 
V
V
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
V
Q
 
R
A
|
A
L
 
V
D
 
D
A
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
R
P
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
T
F
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
E
S
 
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
H
T
 
E
I
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
L
E
 
A
Q
 
A
P
 
P
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
L
 
E
V
 
V
D
 
L
G
 
G
V
 
T
D
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
G
E
 
T
A
 
A
G
 
E
L
 
R
V
 
R
Q
 
S
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
D
I
 
I
G
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
D
-
 
P
-
 
V
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
D
S
 
P
A
 
R
K
 
L
T
 
P
V
 
V
A
 
F
E
 
D
N
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
E
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
V
 
A
A
 
N
G
 
G
V
 
F
P
 
G
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
I
 
T
A
 
H
A
 
A
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
D
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
D
 
H
-
 
G
K
 
D
A
 
A
D
 
S
T
 
R
Y