SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_082792869.1 NCBI__GCF_001584185.1:WP_082792869.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5dvjA Crystal structure of galactose complexed periplasmic glucose binding protein (ppgbp) from p. Putida csv86 (see paper)
39% identity, 82% coverage: 60:436/457 of query aligns to 2:380/396 of 5dvjA

query
sites
5dvjA
P
 
P
A
 
G
S
 
T
L
 
V
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
S
A
 
G
G
 
G
E
|
E
R
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
K
G
 
Q
K
 
Q
L
 
I
A
 
Q
D
 
K
E
 
D
N
 
G
I
 
F
Q
 
I
W
 
W
R
 
K
D
 
D
A
 
N
A
 
A
I
 
V
P
 
A
G
 
G
G
|
G
A
x
G
G
 
G
L
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
M
K
 
T
V
 
V
L
 
L
K
 
K
S
 
T
M
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
S
G
 
G
K
 
N
A
 
P
P
 
P
E
 
S
A
 
A
T
 
A
Q
 
Q
L
 
I
N
x
K
G
 
G
I
 
P
V
 
D
F
 
I
G
 
Q
E
 
E
W
 
W
A
 
G
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
T
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
A
P
 
A
G
 
N
N
 
K
W
 
W
Q
 
D
K
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
P
P
 
R
T
 
Q
V
 
V
W
 
A
S
 
D
L
 
I
V
 
M
L
 
K
N
 
Y
R
 
D
G
 
G
H
 
H
V
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
N
I
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
V
N
 
N
N
 
W
L
 
L
F
 
W
Y
 
I
N
 
N
K
 
P
K
 
Q
I
 
V
F
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
A
N
 
G
L
 
A
T
 
K
P
 
V
P
 
P
K
 
T
T
 
T
W
 
L
A
 
D
D
 
E
F
 
L
G
 
F
R
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
F
T
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
H
S
 
G
S
 
G
E
 
Q
A
 
P
W
 
W
Q
 
Q
V
 
D
A
 
S
T
 
T
L
 
V
F
 
F
E
 
E
T
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
I
S
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
K
Y
 
G
Y
 
Y
R
 
H
S
 
A
L
 
A
F
 
F
V
 
V
D
 
D
L
 
L
N
 
D
P
 
E
L
 
K
A
 
T
F
 
L
G
 
T
D
 
G
Q
 
P
R
 
Q
M
 
M
T
 
T
H
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
A
R
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
R
L
 
L
K
 
G
E
 
T
W
 
Y
M
 
M
P
 
D
T
 
P
P
 
N
L
 
R
R
 
A
E
 
G
R
 
R
P
 
D
W
|
W
P
 
N
D
 
I
M
 
A
T
 
A
R
 
A
Q
 
E
L
 
V
A
 
I
D
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
G
M
 
M
F
 
Q
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
S
E
 
E
L
 
W
L
 
S
A
 
A
W
 
A
G
 
G
L
 
K
N
 
V
T
 
A
D
 
G
Q
 
K
D
 
D
F
 
Y
A
 
Q
C
 
C
T
 
V
T
 
A
V
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
D
 
G
Y
 
S
H
 
F
L
 
A
Y
 
Y
S
 
N
V
 
I
D
|
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
K
-
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
A
S
 
N
H
 
D
Q
 
I
P
 
K
A
 
A
Q
 
Q
E
 
N
K
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
I
 
V
I
 
A
M
 
L
S
 
E
Q
 
P
P
 
E
V
 
F
Q
 
Q
T
 
T
A
 
V
Y
 
F
N
 
N
Q
 
Q
L
 
N
K
|
K
G
 
G
A
 
S
I
 
L
S
 
P
V
 
V
W
 
R
R
 
Q
A
 
D
P
 
M
D
 
D
L
 
M
S
 
S
K
 
K
M
 
F
D
 
D
S
 
A
C
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
A
 
D
F
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
S
 
D
A
 
G
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
-
P
 
P
S
 
S
L
 
M
V
 
A
H
|
H
R
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
T
D
 
T
E
 
L
T
 
A
A
 
V
K
 
Q
D
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
F
A
 
-
E
 
D
V
 
V
H
 
V
R
 
T
Y
 
N
F
 
F
I
 
L
D
 
N
D
 
D
K
 
P
M
 
Q
S
 
A
E
 
E

5dviA High resolution crystal structure of glucose complexed periplasmic glucose binding protein (ppgbp) from p. Putida csv86 (see paper)
39% identity, 82% coverage: 60:436/457 of query aligns to 2:380/396 of 5dviA

query
sites
5dviA
P
 
P
A
 
G
S
 
T
L
 
V
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
S
A
 
G
G
 
G
E
|
E
R
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
K
G
 
Q
K
 
Q
L
 
I
A
 
Q
D
 
K
E
 
D
N
 
G
I
 
F
Q
 
I
W
 
W
R
 
K
D
 
D
A
 
N
A
 
A
I
 
V
P
 
A
G
 
G
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
M
K
 
T
V
 
V
L
 
L
K
 
K
S
 
T
M
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
S
G
 
G
K
 
N
A
 
P
P
 
P
E
 
S
A
 
A
T
 
A
Q
 
Q
L
 
I
N
x
K
G
 
G
I
 
P
V
 
D
F
 
I
G
 
Q
E
 
E
W
 
W
A
 
G
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
T
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
A
P
 
A
G
 
N
N
 
K
W
 
W
Q
 
D
K
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
P
P
 
R
T
 
Q
V
 
V
W
 
A
S
 
D
L
 
I
V
 
M
L
 
K
N
 
Y
R
 
D
G
 
G
H
 
H
V
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
N
I
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
V
N
 
N
N
 
W
L
 
L
F
 
W
Y
 
I
N
 
N
K
 
P
K
 
Q
I
 
V
F
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
A
N
 
G
L
 
A
T
 
K
P
 
V
P
 
P
K
 
T
T
 
T
W
 
L
A
 
D
D
 
E
F
 
L
G
 
F
R
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
F
T
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
H
S
 
G
S
 
G
E
 
Q
A
 
P
W
 
W
Q
 
Q
V
 
D
A
 
S
T
 
T
L
 
V
F
 
F
E
 
E
T
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
I
S
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
K
Y
 
G
Y
 
Y
R
 
H
S
 
A
L
 
A
F
 
F
V
 
V
D
 
D
L
 
L
N
 
D
P
 
E
L
 
K
A
 
T
F
 
L
G
 
T
D
 
G
Q
 
P
R
 
Q
M
 
M
T
 
T
H
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
A
R
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
R
L
 
L
K
 
G
E
 
T
W
 
Y
M
 
M
P
 
D
T
 
P
P
 
N
L
 
R
R
 
A
E
 
G
R
 
R
P
 
D
W
 
W
P
 
N
D
 
I
M
 
A
T
 
A
R
 
A
Q
 
E
L
 
V
A
 
I
D
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
G
M
 
M
F
 
Q
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
S
E
 
E
L
 
W
L
 
S
A
 
A
W
 
A
G
 
G
L
 
K
N
 
V
T
 
A
D
 
G
Q
 
K
D
 
D
F
 
Y
A
 
Q
C
 
C
T
 
V
T
 
A
V
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
D
 
G
Y
 
S
H
 
F
L
 
A
Y
 
Y
S
x
N
V
 
I
D
|
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
K
-
 
L
G
 
K
D
 
D
Y
 
A
S
 
N
H
 
D
Q
 
I
P
 
K
A
 
A
Q
 
Q
E
 
N
K
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
I
 
V
I
 
A
M
 
L
S
 
E
Q
 
P
P
 
E
V
 
F
Q
 
Q
T
 
T
A
 
V
Y
 
F
N
 
N
Q
 
Q
L
 
N
K
|
K
G
 
G
A
 
S
I
 
L
S
 
P
V
 
V
W
 
R
R
 
Q
A
 
D
P
 
M
D
 
D
L
 
M
S
 
S
K
 
K
M
 
F
D
 
D
S
 
A
C
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
A
 
D
F
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
S
 
D
A
 
G
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
-
P
 
P
S
 
S
L
 
M
V
 
A
H
|
H
R
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
T
D
 
T
E
 
L
T
 
A
A
 
V
K
 
Q
D
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
F
A
 
-
E
 
D
V
 
V
H
 
V
R
 
T
Y
 
N
F
 
F
I
 
L
D
 
N
D
 
D
K
 
P
M
 
Q
S
 
A
E
 
E

4r2bA Crystal structure of sugar transporter oant_3817 from ochrobactrum anthropi, target efi-510528, with bound glucose
33% identity, 85% coverage: 58:445/457 of query aligns to 2:389/395 of 4r2bA

query
sites
4r2bA
Q
 
Q
P
 
D
P
 
K
A
 
Q
S
 
N
L
 
V
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
 
W
T
 
T
S
 
A
A
 
G
G
 
G
E
|
E
R
 
A
K
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
K
G
 
K
K
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
K
E
 
K
N
 
G
I
 
I
Q
 
S
W
 
W
R
 
T
D
 
D
A
 
M
A
 
P
I
 
V
P
 
A
G
 
G
G
|
G
A
x
G
G
 
G
L
 
T
G
 
E
A
 
A
S
 
M
K
 
T
V
 
V
L
 
L
K
 
R
S
 
A
M
 
R
V
 
V
L
 
T
A
 
A
G
 
G
K
 
N
A
 
A
P
 
P
E
 
T
A
 
A
T
 
V
Q
 
Q
L
 
M
N
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
D
F
 
I
G
 
R
E
 
D
W
 
W
A
 
A
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
L
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
E
V
 
I
A
 
A
T
 
N
P
 
K
G
 
E
N
 
G
W
 
W
Q
 
E
K
 
K
L
 
V
L
 
I
F
 
P
P
 
A
T
 
P
V
 
L
W
 
Q
S
 
E
L
 
F
V
 
A
L
 
K
N
 
Y
R
 
D
G
 
G
H
 
H
V
 
W
V
 
I
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
V
G
 
N
I
 
V
H
|
H
R
 
S
I
 
T
N
 
N
N
 
W
L
 
M
F
 
W
Y
 
I
N
 
N
K
 
K
K
 
A
I
 
A
F
 
L
D
 
D
R
 
K
L
 
A
N
 
G
L
 
G
T
 
K
P
 
E
P
 
P
K
 
T
T
 
N
W
 
W
A
 
D
D
 
E
F
 
L
G
 
I
R
 
A
V
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
F
K
 
K
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
Q
 
H
S
 
G
S
 
G
E
 
Q
A
 
P
W
 
W
Q
 
Q
V
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
I
F
 
F
E
 
D
T
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
-
S
 
F
G
 
G
P
 
T
A
 
D
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
K
S
 
K
L
 
A
F
 
F
V
 
I
D
 
D
L
 
L
N
 
D
P
 
P
L
 
E
A
 
T
F
 
L
G
 
G
D
 
S
Q
 
D
R
 
T
M
 
M
T
 
K
H
 
Q
A
 
A
L
 
F
K
 
D
R
 
R
L
 
M
R
 
T
A
 
K
L
 
L
K
 
R
E
 
S
W
 
Y
M
 
V
P
 
D
T
 
D
P
 
N
L
 
F
R
 
S
E
 
G
R
 
R
P
 
D
W
|
W
P
 
N
D
 
L
M
 
A
T
 
S
R
 
A
Q
 
M
L
 
V
A
 
I
D
 
E
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
G
M
 
L
F
 
Q
V
 
F
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
V
A
 
K
W
 
A
G
 
G
L
 
K
N
 
K
T
 
P
D
 
G
Q
 
E
D
 
D
F
 
F
A
 
V
C
 
C
T
 
M
T
 
R
V
 
Y
P
 
P
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
D
 
G
Y
 
A
H
 
I
L
 
T
Y
 
F
S
 
N
V
 
S
D
|
D
T
 
M
L
 
F
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
K
G
 
V
D
 
S
Y
 
E
S
 
D
H
 
K
Q
 
V
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
E
 
L
K
 
E
L
 
M
A
 
A
Q
 
S
I
 
A
I
 
I
M
 
E
S
 
S
Q
 
P
P
 
T
V
 
F
Q
 
Q
T
 
S
A
 
A
Y
 
F
N
 
N
Q
 
V
L
 
V
K
|
K
G
 
G
A
 
S
I
 
A
S
 
P
V
 
A
W
 
R
R
 
T
A
 
D
P
 
V
D
 
P
L
 
D
S
 
T
K
 
D
M
 
F
D
 
D
S
 
A
C
 
C
A
 
G
R
 
K
A
 
K
S
 
A
W
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
E
A
 
A
F
 
S
S
 
E
K
 
K
G
 
G
S
 
T
A
 
M
Y
 
L
Q
 
G
A
 
-
P
 
-
S
 
S
L
 
M
V
 
A
H
|
H
R
 
G
M
 
Y
A
 
A
A
 
N
D
 
P
E
 
A
T
 
A
A
 
V
K
 
K
D
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
Y
A
 
D
E
 
V
V
 
V
H
 
T
R
 
R
Y
 
Q
F
 
F
I
 
-
D
 
N
D
 
G
K
 
Q
M
 
L
S
 
S
E
 
S
S
 
E
D
 
D
V
 
A
Q
 
V
R
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
S

8kd0A Crystal structure of sar11_0769 from 'candidatus pelagibacter ubique' htcc1062 bound to a co-purified ligand, beta-galactopyranose (see paper)
36% identity, 82% coverage: 64:438/457 of query aligns to 5:384/397 of 8kd0A

query
sites
8kd0A
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
G
A
 
G
G
 
G
E
|
E
R
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
L
D
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
Q
G
 
D
K
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
A
E
 
Q
N
 
N
I
 
G
Q
 
V
W
 
W
R
 
L
D
 
D
A
 
M
A
 
P
I
 
V
P
 
S
G
 
G
G
|
G
A
x
G
G
 
G
L
 
D
G
 
A
A
 
A
S
 
M
K
 
Q
V
 
T
L
 
L
K
 
K
S
 
A
M
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
N
K
 
D
A
 
A
P
 
P
E
 
A
A
 
A
T
 
A
Q
 
Q
L
 
I
N
x
K
G
 
G
I
 
P
V
 
T
F
 
I
G
 
Q
E
 
E
W
 
Y
A
 
D
D
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
V
-
 
A
-
 
P
L
 
Y
E
 
N
L
 
I
D
 
D
D
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
K
P
 
K
G
 
E
N
 
G
W
 
W
Q
 
D
K
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
S
P
 
K
T
 
Q
V
 
V
W
 
A
S
 
S
-
 
H
L
 
M
V
 
K
L
 
C
N
 
D
R
 
D
G
 
G
H
 
K
V
 
A
-
 
Y
V
 
C
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
V
G
 
N
I
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
D
N
 
W
L
 
I
F
 
W
Y
 
A
N
 
N
K
 
K
K
 
K
I
 
V
F
 
L
D
 
D
R
 
S
L
 
N
N
 
G
L
 
I
T
 
K
P
 
M
P
 
P
K
 
S
T
 
T
W
 
W
A
 
A
D
 
E
F
 
F
G
 
N
R
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
H
S
 
G
S
 
S
E
 
Q
A
 
P
W
 
W
Q
 
Q
V
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
V
F
 
F
E
 
E
T
 
A
L
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
V
S
 
G
G
 
G
P
 
N
A
 
D
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
R
S
 
K
L
 
A
F
 
F
V
 
V
D
 
D
L
 
L
N
 
D
P
 
A
L
 
A
A
 
T
F
 
L
G
 
G
D
 
G
Q
 
S
R
 
T
M
 
M
T
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
F
K
 
D
R
 
Q
L
 
M
R
 
R
A
 
K
L
 
L
K
 
K
E
 
G
W
 
Y
M
 
T
P
 
D
T
 
A
P
 
G
L
 
S
R
 
P
E
 
G
R
 
R
P
 
D
W
|
W
P
 
N
D
 
V
M
 
A
T
 
T
R
 
G
Q
 
M
L
 
V
A
 
M
D
 
E
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
F
F
 
Q
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
A
A
 
A
W
 
N
G
 
N
L
 
M
N
 
A
T
 
P
D
 
G
Q
 
K
D
 
D
F
 
Y
A
 
I
C
 
C
T
 
A
T
 
P
V
 
T
P
 
P
G
 
S
T
 
N
A
 
N
D
 
G
Y
 
Y
H
 
-
L
 
L
Y
 
Y
S
 
N
V
 
V
D
|
D
T
 
S
L
 
F
A
 
I
M
 
F
F
 
Y
A
 
K
G
 
V
D
 
K
Y
 
G
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
-
 
V
P
 
E
A
 
G
Q
 
Q
E
 
K
K
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
I
 
L
I
 
M
M
 
M
S
 
G
Q
 
K
P
 
N
V
 
F
Q
 
Q
T
 
K
A
 
V
Y
 
F
N
 
N
Q
 
I
L
 
Y
K
|
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
S
 
P
V
 
A
W
 
R
R
 
L
A
 
D
P
 
V
D
 
S
L
 
M
S
 
D
K
 
E
M
 
F
D
 
D
S
 
M
C
 
C
A
 
A
R
 
K
A
 
K
S
 
S
W
 
N
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
T
A
 
A
F
 
G
S
 
S
K
 
K
G
 
G
S
 
G
A
 
L
Y
 
L
Q
 
-
A
 
-
P
 
P
S
 
S
L
 
F
V
 
A
H
|
H
R
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
L
D
 
R
E
 
L
T
 
A
A
 
Q
K
 
K
D
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
Q
A
 
D
E
 
V
V
 
V
H
 
T
R
 
E
Y
 
H
F
 
F
I
 
-
D
 
N
D
 
S
K
 
N
M
 
M
S
 
S
E
 
S
S
 
S
D
 
D

8hqqA Crystal structure of the glucose-binding protein sar11_0769 from "candidatus pelagibacter ubique" htcc1062 bound to glucose (see paper)
36% identity, 82% coverage: 64:438/457 of query aligns to 6:385/398 of 8hqqA

query
sites
8hqqA
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
 
W
T
 
T
S
 
G
A
 
G
G
 
G
E
|
E
R
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
L
D
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
Q
G
 
D
K
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
A
E
 
Q
N
 
N
I
 
G
Q
 
V
W
 
W
R
 
L
D
 
D
A
 
M
A
 
P
I
 
V
P
 
S
G
 
G
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
D
G
 
A
A
 
A
S
 
M
K
 
Q
V
 
T
L
 
L
K
 
K
S
 
A
M
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
N
K
 
D
A
 
A
P
 
P
E
 
A
A
 
A
T
 
A
Q
 
Q
L
 
I
N
x
K
G
 
G
I
 
P
V
 
T
F
 
I
G
 
Q
E
 
E
W
 
Y
A
 
D
D
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
V
-
 
A
-
 
P
L
 
Y
E
 
N
L
 
I
D
 
D
D
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
K
P
 
K
G
 
E
N
 
G
W
 
W
Q
 
D
K
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
S
P
 
K
T
 
Q
V
 
V
W
 
A
S
 
S
-
 
H
L
 
M
V
 
K
L
 
C
N
 
D
R
 
D
G
 
G
H
 
K
V
 
A
-
 
Y
V
 
C
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
V
G
 
N
I
 
I
H
|
H
R
 
R
I
 
I
N
 
D
N
 
W
L
 
I
F
 
W
Y
 
A
N
 
N
K
 
K
K
 
K
I
 
V
F
 
L
D
 
D
R
 
S
L
 
N
N
 
G
L
 
I
T
 
K
P
 
M
P
 
P
K
 
S
T
 
T
W
 
W
A
 
A
D
 
E
F
 
F
G
 
N
R
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Q
 
A
A
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
H
S
 
G
S
 
S
E
 
Q
A
 
P
W
 
W
Q
 
Q
V
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
V
F
 
F
E
 
E
T
 
A
L
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
V
S
 
G
G
 
G
P
 
N
A
 
D
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
R
S
 
K
L
 
A
F
 
F
V
 
V
D
 
D
L
 
L
N
 
D
P
 
A
L
 
A
A
 
T
F
 
L
G
 
G
D
 
G
Q
 
S
R
 
T
M
 
M
T
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
F
K
 
D
R
 
Q
L
 
M
R
 
R
A
 
K
L
 
L
K
 
K
E
 
G
W
 
Y
M
 
T
P
 
D
T
 
A
P
 
G
L
 
S
R
 
P
E
 
G
R
 
R
P
 
D
W
 
W
P
 
N
D
 
V
M
 
A
T
 
T
R
 
G
Q
 
M
L
 
V
A
 
M
D
 
E
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
F
F
 
Q
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
A
A
 
A
W
 
N
G
 
N
L
 
M
N
 
A
T
 
P
D
 
G
Q
 
K
D
 
D
F
 
Y
A
 
I
C
 
C
T
 
A
T
 
P
V
 
T
P
 
P
G
 
S
T
 
N
A
 
N
D
 
G
Y
 
Y
H
 
-
L
 
L
Y
 
Y
S
 
N
V
 
V
D
|
D
T
 
S
L
 
F
A
 
I
M
 
F
F
 
Y
A
 
K
G
 
V
D
 
K
Y
 
G
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
-
 
V
P
 
E
A
 
G
Q
 
Q
E
 
K
K
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
I
 
L
I
 
M
M
 
M
S
 
G
Q
 
K
P
 
N
V
 
F
Q
 
Q
T
 
K
A
 
V
Y
 
F
N
 
N
Q
 
I
L
 
Y
K
|
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
S
 
P
V
 
A
W
 
R
R
 
L
A
 
D
P
 
V
D
 
S
L
 
M
S
 
D
K
 
E
M
 
F
D
 
D
S
 
M
C
 
C
A
 
A
R
 
K
A
 
K
S
 
S
W
 
N
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
T
A
 
A
F
 
G
S
 
S
K
 
K
G
 
G
S
 
G
A
 
L
Y
 
L
Q
 
-
A
 
-
P
 
P
S
 
S
L
 
F
V
 
A
H
|
H
R
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
L
D
 
R
E
 
L
T
 
A
A
 
Q
K
 
K
D
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
Q
A
 
D
E
 
V
V
 
V
H
 
T
R
 
E
Y
 
H
F
 
F
I
 
-
D
 
N
D
 
S
K
 
N
M
 
M
S
 
S
E
 
S
S
 
S
D
 
D

2b3fA Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein bound with galactose (see paper)
26% identity, 77% coverage: 63:416/457 of query aligns to 3:355/392 of 2b3fA

query
sites
2b3fA
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
L
 
F
H
 
S
W
|
W
W
|
W
T
 
-
S
 
A
A
 
G
G
 
D
E
|
E
R
 
G
K
 
P
A
 
A
V
 
L
D
 
E
V
 
A
I
 
L
A
 
I
G
 
R
-
 
L
-
 
Y
K
 
K
L
 
Q
A
 
K
D
 
Y
E
 
P
N
 
G
I
 
V
Q
 
E
W
 
V
R
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
T
I
 
V
P
 
T
G
 
G
G
|
G
A
|
A
G
 
G
L
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
R
K
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
S
 
T
M
 
R
V
 
M
L
 
L
A
 
G
G
 
G
K
 
D
A
 
P
P
 
P
E
 
D
A
 
T
T
 
F
Q
 
Q
L
 
V
N
x
H
G
 
A
-
 
G
-
 
M
I
 
E
V
 
L
F
 
I
G
 
G
E
 
T
W
 
W
A
 
V
D
 
V
L
 
A
G
 
N
L
 
R
L
 
M
L
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
A
V
 
L
A
 
F
T
 
R
P
 
Q
G
 
E
N
 
G
W
 
W
Q
 
L
K
 
Q
L
 
A
L
 
F
F
 
P
P
 
K
T
 
G
V
 
L
W
 
I
S
 
D
L
 
L
V
 
I
L
 
S
N
 
Y
R
 
K
G
 
G
H
 
G
V
 
I
V
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
N
I
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
S
N
 
N
N
 
V
L
 
M
F
 
W
Y
 
Y
N
 
L
K
 
P
K
 
A
I
 
K
F
 
L
D
 
K
R
 
G
L
 
W
N
 
G
L
 
V
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
R
T
 
T
W
 
W
A
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
L
R
 
A
V
 
T
A
 
C
D
 
Q
K
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
T
 
E
P
 
A
L
 
P
A
 
L
Q
 
A
S
 
L
S
 
G
E
 
E
A
 
N
W
 
W
Q
 
T
V
 
Q
A
 
Q
T
 
H
L
 
L
F
 
W
E
 
E
T
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
V
S
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
D
Y
 
D
Y
 
W
R
 
N
S
 
N
L
 
L
F
 
W
V
 
N
D
 
-
L
 
-
N
 
G
P
 
K
L
 
L
A
 
K
F
 
F
G
 
T
D
 
D
Q
 
P
R
 
K
M
 
A
T
 
V
H
 
R
A
 
A
L
 
W
K
 
E
R
 
V
L
 
F
R
 
G
A
 
R
L
 
V
K
 
L
E
 
D
W
 
C
M
 
A
P
 
N
T
 
K
P
 
D
L
 
A
R
 
A
E
 
G
R
 
L
P
 
S
W
 
W
P
 
Q
D
 
Q
M
 
A
T
 
V
R
 
D
Q
 
R
L
 
V
A
 
V
D
 
Q
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
F
F
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
L
 
M
-
 
T
L
 
T
A
 
T
W
 
L
G
 
K
L
 
L
N
 
K
T
 
P
D
 
G
Q
 
T
D
 
D
F
 
F
A
 
A
C
 
W
T
 
A
T
 
P
V
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
D
 
G
Y
 
V
H
 
F
L
 
M
Y
 
M
S
 
L
V
 
S
D
|
D
T
 
S
L
 
F
A
 
G
M
 
L
F
 
P
A
 
K
G
 
G
D
 
A
Y
 
K
S
 
N
H
 
R
Q
 
Q
P
 
N
A
 
A
Q
 
I
E
 
N
K
 
W
L
 
L
A
 
-
Q
 
R
I
 
L
I
 
V
M
 
G
S
 
S
Q
 
K
P
 
E
V
 
G
Q
 
Q
T
 
D
A
 
T
Y
 
S
N
 
N
Q
 
P
L
 
L
K
|
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
S
 
A
V
 
A
W
 
R
R
 
L
A
 
D
P
 
S
D
 
D
L
 
P
S
 
S
K
 
K
M
 
Y
D
 
N
S
 
A
C
 
Y
A
 
G
R
 
Q
A
 
S
S
 
A
W
 
M
A
 
R
A
 
D
F
 
W
S
 
R
K
 
-
G
 
-
S
 
S
A
 
N
Y
 
R
Q
 
I
A
 
V
P
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
V
H
|
H
R
 
G
M
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
P
E
 
E
T
 
S

2b3bC Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein with bound glucose (see paper)
26% identity, 77% coverage: 63:416/457 of query aligns to 3:355/392 of 2b3bC

query
sites
2b3bC
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
L
 
F
H
 
S
W
|
W
W
 
W
T
 
-
S
 
A
A
 
G
G
 
D
E
|
E
R
 
G
K
 
P
A
 
A
V
 
L
D
 
E
V
 
A
I
 
L
A
 
I
G
 
R
-
 
L
-
 
Y
K
 
K
L
 
Q
A
 
K
D
 
Y
E
 
P
N
 
G
I
 
V
Q
 
E
W
 
V
R
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
T
I
 
V
P
 
T
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
R
K
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
S
 
T
M
 
R
V
 
M
L
 
L
A
 
G
G
 
G
K
 
D
A
 
P
P
 
P
E
 
D
A
 
T
T
 
F
Q
 
Q
L
 
V
N
x
H
G
 
A
-
 
G
-
 
M
I
 
E
V
 
L
F
 
I
G
 
G
E
 
T
W
 
W
A
 
V
D
 
V
L
 
A
G
 
N
L
 
R
L
 
M
L
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
A
V
 
L
A
 
F
T
 
R
P
 
Q
G
 
E
N
 
G
W
 
W
Q
 
L
K
 
Q
L
 
A
L
 
F
F
 
P
P
 
K
T
 
G
V
 
L
W
 
I
S
 
D
L
 
L
V
 
I
L
 
S
N
 
Y
R
 
K
G
 
G
H
 
G
V
 
I
V
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
N
I
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
S
N
 
N
N
 
V
L
 
M
F
 
W
Y
 
Y
N
 
L
K
 
P
K
 
A
I
 
K
F
 
L
D
 
K
R
 
G
L
 
W
N
 
G
L
 
V
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
R
T
 
T
W
 
W
A
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
L
R
 
A
V
 
T
A
 
C
D
 
Q
K
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
T
 
E
P
 
A
L
 
P
A
 
L
Q
 
A
S
 
L
S
 
G
E
 
E
A
 
N
W
 
W
Q
 
T
V
 
Q
A
 
Q
T
 
H
L
 
L
F
 
W
E
 
E
T
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
V
S
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
D
Y
 
D
Y
 
W
R
 
N
S
 
N
L
 
L
F
 
W
V
 
N
D
 
-
L
 
-
N
 
G
P
 
K
L
 
L
A
 
K
F
 
F
G
 
T
D
 
D
Q
 
P
R
 
K
M
 
A
T
 
V
H
 
R
A
 
A
L
 
W
K
 
E
R
 
V
L
 
F
R
 
G
A
 
R
L
 
V
K
 
L
E
 
D
W
 
C
M
 
A
P
 
N
T
 
K
P
 
D
L
 
A
R
 
A
E
 
G
R
 
L
P
 
S
W
 
W
P
 
Q
D
 
Q
M
 
A
T
 
V
R
 
D
Q
 
R
L
 
V
A
 
V
D
 
Q
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
F
F
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
L
 
M
-
 
T
L
 
T
A
 
T
W
 
L
G
 
K
L
 
L
N
 
K
T
 
P
D
 
G
Q
 
T
D
 
D
F
 
F
A
 
A
C
 
W
T
 
A
T
 
P
V
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
D
 
G
Y
 
V
H
 
F
L
 
M
Y
 
M
S
 
L
V
 
S
D
|
D
T
 
S
L
 
F
A
 
G
M
 
L
F
 
P
A
 
K
G
 
G
D
 
A
Y
 
K
S
 
N
H
 
R
Q
 
Q
P
 
N
A
 
A
Q
 
I
E
 
N
K
 
W
L
 
L
A
 
-
Q
 
R
I
 
L
I
 
V
M
 
G
S
 
S
Q
 
K
P
 
E
V
 
G
Q
 
Q
T
 
D
A
 
T
Y
 
S
N
 
N
Q
 
P
L
 
L
K
|
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
S
 
A
V
 
A
W
 
R
R
 
L
A
 
D
P
 
S
D
 
D
L
 
P
S
 
S
K
 
K
M
 
Y
D
 
N
S
 
A
C
 
Y
A
 
G
R
 
Q
A
 
S
S
 
A
W
 
M
A
 
R
A
 
D
F
 
W
S
 
R
K
 
-
G
 
-
S
 
S
A
 
N
Y
 
R
Q
 
I
A
 
V
P
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
V
H
|
H
R
 
G
M
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
P
E
 
E
T
 
S

2b3bA Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein with bound glucose (see paper)
26% identity, 77% coverage: 63:416/457 of query aligns to 3:355/392 of 2b3bA

query
sites
2b3bA
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
L
 
F
H
 
S
W
|
W
W
|
W
T
 
-
S
 
A
A
 
G
G
 
D
E
|
E
R
 
G
K
 
P
A
 
A
V
 
L
D
 
E
V
 
A
I
 
L
A
 
I
G
 
R
-
 
L
-
 
Y
K
 
K
L
 
Q
A
 
K
D
 
Y
E
 
P
N
 
G
I
 
V
Q
 
E
W
 
V
R
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
T
I
 
V
P
 
T
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
V
G
 
N
A
 
A
S
 
R
K
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
S
 
T
M
 
R
V
 
M
L
 
L
A
 
G
G
 
G
K
 
D
A
 
P
P
 
P
E
 
D
A
 
T
T
 
F
Q
 
Q
L
 
V
N
x
H
G
 
A
-
 
G
-
 
M
I
 
E
V
 
L
F
 
I
G
 
G
E
 
T
W
 
W
A
 
V
D
 
V
L
 
A
G
 
N
L
 
R
L
 
M
L
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
A
V
 
L
A
 
F
T
 
R
P
 
Q
G
 
E
N
 
G
W
 
W
Q
 
L
K
 
Q
L
 
A
L
 
F
F
 
P
P
 
K
T
 
G
V
 
L
W
 
I
S
 
D
L
 
L
V
 
I
L
 
S
N
 
Y
R
 
K
G
 
G
H
 
G
V
 
I
V
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
N
I
 
I
H
 
H
R
 
R
I
 
S
N
 
N
N
 
V
L
 
M
F
 
W
Y
 
Y
N
 
L
K
 
P
K
 
A
I
 
K
F
 
L
D
 
K
R
 
G
L
 
W
N
 
G
L
 
V
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
R
T
 
T
W
 
W
A
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
L
R
 
A
V
 
T
A
 
C
D
 
Q
K
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
T
 
E
P
 
A
L
 
P
A
 
L
Q
 
A
S
 
L
S
 
G
E
 
E
A
 
N
W
 
W
Q
 
T
V
 
Q
A
 
Q
T
 
H
L
 
L
F
 
W
E
 
E
T
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
V
S
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
D
Y
 
D
Y
 
W
R
 
N
S
 
N
L
 
L
F
 
W
V
 
N
D
 
-
L
 
-
N
 
G
P
 
K
L
 
L
A
 
K
F
 
F
G
 
T
D
 
D
Q
 
P
R
 
K
M
 
A
T
 
V
H
 
R
A
 
A
L
 
W
K
 
E
R
 
V
L
 
F
R
 
G
A
 
R
L
 
V
K
 
L
E
 
D
W
 
C
M
 
A
P
 
N
T
 
K
P
 
D
L
 
A
R
 
A
E
 
G
R
 
L
P
 
S
W
 
W
P
 
Q
D
 
Q
M
 
A
T
 
V
R
 
D
Q
 
R
L
 
V
A
 
V
D
 
Q
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
F
F
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
L
 
M
-
 
T
L
 
T
A
 
T
W
 
L
G
 
K
L
 
L
N
 
K
T
 
P
D
 
G
Q
 
T
D
 
D
F
 
F
A
 
A
C
 
W
T
 
A
T
 
P
V
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
D
 
G
Y
 
V
H
 
F
L
 
M
Y
 
M
S
 
L
V
 
S
D
|
D
T
 
S
L
 
F
A
 
G
M
 
L
F
 
P
A
 
K
G
 
G
D
 
A
Y
 
K
S
 
N
H
 
R
Q
 
Q
P
 
N
A
 
A
Q
 
I
E
 
N
K
 
W
L
 
L
A
 
-
Q
 
R
I
 
L
I
 
V
M
 
G
S
 
S
Q
 
K
P
 
E
V
 
G
Q
 
Q
T
 
D
A
 
T
Y
 
S
N
 
N
Q
 
P
L
 
L
K
|
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
S
 
A
V
 
A
W
 
R
R
 
L
A
 
D
P
 
S
D
 
D
L
 
P
S
 
S
K
 
K
M
 
Y
D
 
N
S
 
A
C
 
Y
A
 
G
R
 
Q
A
 
S
S
 
A
W
 
M
A
 
R
A
 
D
F
 
W
S
 
R
K
 
-
G
 
-
S
 
S
A
 
N
Y
 
R
Q
 
I
A
 
V
P
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
V
H
|
H
R
 
G
M
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
P
E
 
E
T
 
S

7ehpA Chitin oligosaccharide binding protein (see paper)
24% identity, 67% coverage: 84:390/457 of query aligns to 18:338/397 of 7ehpA

query
sites
7ehpA
K
 
K
L
 
M
A
 
L
D
 
E
E
 
D
N
 
I
I
 
A
Q
 
Q
W
 
R
R
 
M
D
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
P
G
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
V
G
 
E
A
x
D
G
x
K
L
 
V
G
 
N
A
x
R
S
 
F
K
 
E
V
 
K
L
 
L
K
 
P
S
 
A
M
 
E
V
 
M
L
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
N
A
 
P
P
 
P
E
 
K
A
 
I
T
 
F
Q
 
D
L
 
L
-
x
F
N
 
G
G
 
G
I
 
T
V
 
D
F
 
T
G
 
A
E
 
K
W
 
Y
A
 
V
D
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
L
D
 
T
D
 
P
V
 
I
A
 
L
T
 
N
P
 
E
G
 
L
N
 
G
W
 
L
Q
 
-
K
 
K
L
 
D
L
 
K
F
 
F
P
 
P
T
 
N
V
 
L
W
 
Q
S
 
E
L
 
F
V
 
T
L
 
V
N
 
D
R
 
-
G
 
G
H
 
K
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
A
 
L
P
 
P
L
 
T
G
 
A
I
 
-
H
 
Y
R
x
F
I
 
V
N
 
E
N
 
G
L
 
V
F
 
F
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
Q
I
 
I
F
 
F
D
 
K
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
L
 
V
T
 
D
P
 
V
P
 
P
K
 
R
T
 
R
W
 
W
A
 
E
D
 
D
F
 
L
G
 
M
R
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
A
K
 
K
L
 
A
K
 
K
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
I
 
F
T
 
V
P
 
P
L
 
F
A
 
A
-
 
F
Q
 
A
S
 
S
S
 
S
E
 
D
A
 
G
W
|
W
Q
 
V
V
 
A
A
 
N
T
 
M
L
 
M
F
 
L
E
 
N
T
 
T
L
 
L
V
 
W
L
 
V
A
 
R
E
 
T
S
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
S
-
 
V
P
 
P
A
 
G
Y
 
F
Y
 
V
R
 
R
S
 
G
L
 
T
F
 
R
V
 
R
D
 
W
L
 
T
N
 
D
P
 
P
-
 
D
L
 
V
A
 
A
F
 
D
G
 
G
D
 
F
Q
 
K
R
 
R
M
 
Y
T
 
D
H
 
T
A
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
K
E
 
G
W
 
Y
M
 
L
P
 
Q
T
 
E
P
 
G
L
 
S
R
 
L
E
 
G
R
 
Q
P
 
K
W
 
Y
P
 
A
D
 
E
M
 
Q
T
 
Q
R
 
Y
Q
 
A
L
 
F
A
 
R
D
 
E
G
 
G
E
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
M
F
 
M
V
 
F
M
 
D
G
 
G
D
 
S
W
|
W
A
 
A
K
 
S
G
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
D
W
 
A
G
 
G
L
 
K
N
 
T
T
 
K
D
 
I
Q
 
A
D
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
F
F
 
F
A
 
S
C
 
F
T
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
G
D
 
D
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
G
M
 
M
F
 
I
A
 
N
G
 
G
D
 
G
Y
 
Y
S
|
S
H
x
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
F
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
R
-
 
E
Q
 
K
P
 
K
A
 
A
Q
 
A
E
 
V
K
 
E
L
 
F
A
 
I
Q
 
K
I
 
I
I
 
M
M
 
Y
S
 
S
Q
 
E
P
 
E
V
 
M
Q
 
Q
T
 
K
A
 
R
Y
 
Q
N
 
L
Q
 
K
L
 
E
K
 
S
G
 
G
A
 
I
I
 
L
S
 
P
V
 
A
W
 
M
R
 
K
A
 
L
P
 
S
D
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
G
M
 
V
D
 
H
S
 
P
C
 
V
A
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3vxcA Crystal structure of xylobiose-bxle complex from streptomyces thermoviolaceus opc-520
29% identity, 38% coverage: 130:303/457 of query aligns to 77:249/398 of 3vxcA

query
sites
3vxcA
G
 
G
E
 
Q
W
 
L
A
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
T
L
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
K
L
 
S
D
 
D
D
 
E
V
 
V
A
 
L
T
 
S
P
 
T
G
 
G
N
 
-
W
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
F
F
 
L
P
 
P
T
 
S
V
 
V
W
 
V
S
 
A
L
 
A
V
 
G
L
 
S
N
 
L
R
 
D
G
 
G
H
 
H
V
 
E
V
 
Y
A
 
G
A
 
I
P
 
P
L
 
M
G
x
R
I
 
G
H
 
M
R
x
Q
I
 
P
N
 
V
N
 
L
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
S
I
 
V
F
 
F
D
 
A
R
 
E
L
 
H
N
 
K
L
 
L
T
 
T
P
 
P
P
 
P
K
 
T
T
 
T
W
 
W
A
 
D
D
 
Q
F
 
L
G
 
L
R
 
D
V
 
N
A
 
V
D
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
A
 
A
Q
 
L
S
 
G
S
 
G
-
 
V
E
 
E
A
 
I
W
|
W
Q
 
P
V
 
E
A
 
L
T
 
M
L
 
W
F
 
L
E
 
E
T
 
Y
L
 
L
V
 
V
L
 
D
A
 
R
E
 
I
S
 
G
G
 
G
P
 
P
A
 
Q
Y
 
V
Y
 
F
R
 
D
S
 
K
L
 
I
F
 
-
V
 
R
D
 
N
L
 
G
N
 
D
P
 
A
L
 
S
A
 
G
F
 
W
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
R
 
A
M
 
V
T
 
L
H
 
K
A
 
A
L
 
A
K
 
Q
R
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
Q
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
G
K
 
K
E
 
G
W
 
F
M
 
S
P
 
S
T
 
V
P
 
S
L
 
Y
R
 
N
E
 
N
R
 
G
P
 
G
W
 
A
P
 
P
D
 
A
M
 
L
T
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
A
 
A
D
 
K
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
G
M
 
M
F
 
H
V
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
S
W
|
W

Sites not aligning to the query:

4g68A Biochemical and structural insights into xylan utilization by the thermophilic bacteriumcaldanaerobius polysaccharolyticus (see paper)
25% identity, 43% coverage: 109:303/457 of query aligns to 48:242/392 of 4g68A

query
sites
4g68A
L
 
I
K
 
K
S
 
A
M
 
A
V
 
I
L
 
A
A
 
A
G
 
N
K
 
E
A
 
A
P
 
P
E
 
D
A
 
I
T
 
F
Q
 
Q
L
 
T
N
x
W
G
 
A
I
 
G
V
 
G
F
 
F
G
 
S
E
 
Q
-
 
P
W
 
F
A
 
V
D
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
D
 
S
V
 
Y
A
 
L
T
 
N
P
 
D
G
 
G
N
 
T
W
 
K
Q
 
D
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
F
 
-
P
 
P
T
 
G
V
 
S
W
 
F
S
 
D
L
 
N
V
 
V
L
 
T
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
A
 
I
P
 
P
L
 
F
G
 
D
I
 
-
H
 
Q
R
x
Q
I
 
A
N
 
S
N
 
V
L
 
L
F
 
Y
Y
 
I
N
 
N
K
 
K
K
 
E
I
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
Y
N
 
N
L
 
V
T
 
K
P
 
V
P
 
P
K
 
T
T
 
T
W
 
F
A
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
I
R
 
D
V
 
A
A
 
I
D
 
K
K
 
T
L
 
F
K
 
K
Q
 
S
A
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
A
 
A
-
 
L
Q
 
G
S
 
E
S
 
K
E
 
D
A
 
E
W
|
W
Q
 
P
V
 
G
A
 
M
T
x
W
L
 
Y
F
 
Y
E
 
D
T
 
M
L
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
E
S
 
G
G
 
G
P
 
V
A
 
Q
Y
 
L
Y
 
T
R
 
R
S
 
D
L
 
A
F
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
L
N
 
N
P
 
G
L
 
K
A
 
A
-
 
S
F
 
F
G
 
D
D
 
N
Q
 
Q
R
 
A
M
 
F
T
 
T
H
 
D
A
 
A
L
 
A
K
 
Q
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
D
L
 
M
K
 
V
E
 
N
-
 
A
-
 
G
W
 
A
M
 
F
P
 
D
T
 
S
P
 
G
L
 
F
R
 
M
E
 
G
R
 
L
P
 
T
W
x
R
P
 
D
D
 
E
M
 
A
T
 
T
R
 
A
Q
 
E
L
 
F
A
 
N
D
 
Q
G
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
F
 
Y
V
 
F
M
 
G
G
 
G
D
 
N
W
x
F

Sites not aligning to the query:

5vawA Fusion of maltose-binding protein and pila from acinetobacter baumannii ab5075 (see paper)
33% identity, 19% coverage: 129:217/457 of query aligns to 67:147/484 of 5vawA

query
sites
5vawA
F
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
T
D
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
A
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
F
Q
 
Q
K
 
A
L
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
F
V
 
T
W
 
W
S
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
R
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
V
H
 
E
R
 
A
I
 
L
N
 
-
N
 
S
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
D
 
P
R
 
N
L
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
E
D
 
E
F
 
I
G
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
D
D
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
S
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3oo6A Crystal structures and biochemical characterization of the bacterial solute receptor acbh reveal an unprecedented exclusive substrate preference for b-d-galactopyranose (see paper)
27% identity, 40% coverage: 121:301/457 of query aligns to 61:238/390 of 3oo6A

query
sites
3oo6A
A
 
A
T
 
T
Q
 
W
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
Y
V
x
R
F
 
L
G
 
Q
E
 
F
W
 
F
A
 
A
D
 
A
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
T
E
 
P
L
 
I
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
W
Q
 
D
K
 
K
L
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
T
L
 
F
F
 
N
P
 
D
T
 
A
V
 
A
W
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
S
L
 
K
N
 
G
-
 
L
R
 
D
G
 
G
H
 
H
V
 
Y
V
 
Y
A
 
L
A
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
Y
I
 
N
H
x
Y
R
 
P
I
x
W
N
 
V
N
 
-
L
 
V
F
 
F
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
S
I
 
V
F
 
F
D
 
Q
R
 
S
L
 
K
N
 
G
L
 
Y
T
 
E
P
 
V
P
 
P
K
 
A
T
 
S
W
 
W
A
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
I
R
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
R
K
 
K
L
 
M
K
 
Q
Q
 
S
A
 
D
G
 
G
I
 
L
T
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
-
 
F
Q
 
A
S
 
D
S
 
K
E
 
D
A
 
G
W
|
W
Q
 
P
V
 
A
A
 
L
T
 
G
L
 
T
F
 
F
E
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
N
L
 
L
A
 
R
E
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
A
 
D
Y
 
Y
Y
 
H
R
 
I
S
 
K
L
 
L
F
 
M
V
 
K
D
 
H
L
 
E
N
 
V
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
W
G
 
T
D
 
D
Q
 
P
R
 
G
M
 
V
T
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
F
K
 
D
R
 
Q
L
 
W
R
 
R
A
 
E
L
 
L
K
 
A
E
 
A
W
 
Y
M
 
Q
P
 
Q
T
 
K
P
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
G
R
 
R
P
 
T
W
 
W
P
 
Q
D
 
D
M
 
A
T
 
A
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
N
G
 
K
E
 
Q
A
 
A
A
 
G
M
 
M
F
 
M
V
 
F
M
 
Q
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7cy5A Crystal structure of cmd1 in complex with vitamin c (see paper)
33% identity, 19% coverage: 129:217/457 of query aligns to 64:144/862 of 7cy5A

query
sites
7cy5A
F
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
T
D
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
A
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
F
Q
 
Q
K
 
D
L
 
K
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
F
V
 
T
W
 
W
S
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
R
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
V
H
 
E
R
 
A
I
 
L
N
 
-
N
 
S
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
D
 
P
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
E
D
 
E
F
 
I
G
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
D
D
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
S
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7cy4A Crystal structure of cmd1 in apo form (see paper)
33% identity, 19% coverage: 129:217/457 of query aligns to 58:138/858 of 7cy4A

query
sites
7cy4A
F
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
T
D
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
A
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
F
Q
 
Q
K
 
D
L
 
K
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
F
V
 
T
W
 
W
S
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
R
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
V
H
 
E
R
 
A
I
 
L
N
 
-
N
 
S
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
D
 
P
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
E
D
 
E
F
 
I
G
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
D
D
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
S
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7cy6A Crystal structure of cmd1 in complex with 5mc-DNA (see paper)
33% identity, 19% coverage: 129:217/457 of query aligns to 66:146/872 of 7cy6A

query
sites
7cy6A
F
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
T
D
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
A
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
F
Q
 
Q
K
 
D
L
 
K
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
F
V
 
T
W
 
W
S
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
R
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
V
H
 
E
R
 
A
I
 
L
N
 
-
N
 
S
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
D
 
P
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
E
D
 
E
F
 
I
G
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
D
D
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
S
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6m4wA Crystal structure of mbp fused split fkbp-frb t2098l mutant in complex with rapamycin (see paper)
33% identity, 19% coverage: 129:217/457 of query aligns to 68:148/403 of 6m4wA

query
sites
6m4wA
F
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
T
D
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
A
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
F
Q
 
Q
K
 
D
L
 
K
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
F
V
 
T
W
 
W
S
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
R
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
V
H
x
E
R
 
A
I
 
L
N
 
-
N
 
S
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
D
 
P
R
 
N
L
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
E
D
 
E
F
 
I
G
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
D
D
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
S
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6wbjA High resolution crystal structure of mreck(cc4) in fusion with engineered mbp (see paper)
33% identity, 19% coverage: 129:217/457 of query aligns to 66:146/432 of 6wbjA

query
sites
6wbjA
F
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
T
D
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
A
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
F
Q
 
Q
K
 
D
L
 
K
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
F
V
 
T
W
 
W
S
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
R
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
V
H
x
E
R
 
A
I
 
L
N
 
-
N
 
S
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
D
 
P
R
 
N
L
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
E
D
 
E
F
 
I
G
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
D
D
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
S
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6xdsA Crystal structure of mbp-trem2 ig domain fusion with fragment, 2-((4- bromophenyl)amino)ethan-1-ol (see paper)
31% identity, 23% coverage: 114:217/457 of query aligns to 49:144/485 of 6xdsA

query
sites
6xdsA
L
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
D
A
 
G
P
 
P
E
 
D
A
 
I
T
 
I
Q
 
F
L
x
W
N
 
A
G
 
H
I
x
D
V
x
R
F
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
T
D
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
A
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
F
Q
 
Q
K
 
D
L
 
K
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
F
V
 
T
W
 
W
S
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
R
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
V
H
x
E
R
 
A
I
 
L
N
 
-
N
 
S
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
D
 
P
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
E
D
 
E
F
 
I
G
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
D
D
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
S
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8c5lB Nr2f6 ligand binding domain in complex with nsd1 peptide
33% identity, 19% coverage: 129:217/457 of query aligns to 68:148/557 of 8c5lB

query
sites
8c5lB
F
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
T
D
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
A
P
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
F
Q
 
Q
K
 
D
L
 
K
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
F
V
 
T
W
 
W
S
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
R
N
 
Y
R
 
N
G
 
G
H
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
A
I
 
V
H
x
E
R
 
A
I
 
L
N
 
-
N
 
S
L
 
L
F
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
D
 
P
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
E
D
 
E
F
 
I
G
 
P
R
 
A
V
 
L
A
 
D
D
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
S
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_082792869.1 NCBI__GCF_001584185.1:WP_082792869.1
MIDTRLPKRLSGQGTDNGGRWLTAYRNWIALLAFGCLLSGAGSAAGAAGLTPAVGASQPP
ASLQVLHWWTSAGERKAVDVIAGKLADENIQWRDAAIPGGAGLGASKVLKSMVLAGKAPE
ATQLNGIVFGEWADLGLLLELDDVATPGNWQKLLFPTVWSLVLNRGHVVAAPLGIHRINN
LFYNKKIFDRLNLTPPKTWADFGRVADKLKQAGITPLAQSSEAWQVATLFETLVLAESGP
AYYRSLFVDLNPLAFGDQRMTHALKRLRALKEWMPTPLRERPWPDMTRQLADGEAAMFVM
GDWAKGELLAWGLNTDQDFACTTVPGTADYHLYSVDTLAMFAGDYSHQPAQEKLAQIIMS
QPVQTAYNQLKGAISVWRAPDLSKMDSCARASWAAFSKGSAYQAPSLVHRMAADETAKDA
IVAEVHRYFIDDKMSESDVQRKLASIARTVTKTGKLE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory