SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_083666788.1 NCBI__GCF_001941485.1:WP_083666788.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 1 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9FMF7 Dicarboxylate transporter 2.1, chloroplastic; AtpDCT1; Glutamate/malate translocator from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
40% identity, 94% coverage: 29:493/493 of query aligns to 102:563/563 of Q9FMF7

query
sites
Q9FMF7
A
 
S
V
 
I
G
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
L
W
 
R
F
 
F
-
 
A
V
 
V
P
 
P
T
 
V
P
 
P
D
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
T
D
 
P
N
 
Q
A
 
G
W
 
W
G
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
S
L
 
I
F
 
F
V
 
L
A
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
A
M
 
G
I
 
L
I
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
P
A
 
L
P
 
P
M
 
V
G
 
G
T
 
A
V
 
W
S
 
A
V
 
F
V
 
I
A
 
G
M
 
L
A
 
T
A
 
A
C
 
S
A
 
I
A
 
V
T
 
T
G
 
K
V
 
T
L
 
L
A
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
S
I
 
F
T
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
F
S
 
S
G
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
S
S
 
E
T
 
V
I
 
I
W
 
W
L
 
L
I
 
I
V
 
V
S
 
I
A
 
S
F
 
F
F
 
F
I
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
G
V
 
F
I
 
V
A
 
K
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
D
R
 
R
L
 
I
G
 
A
Y
 
T
L
 
Y
F
 
F
V
 
V
R
 
K
I
 
W
F
 
L
G
|
G
R
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
G
 
T
L
 
L
A
 
S
D
 
E
L
 
A
V
 
L
T
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
M
P
 
P
S
 
S
N
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
F
Y
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
I
E
 
K
S
 
S
I
 
L
L
 
S
K
 
L
T
 
S
D
 
A
G
 
G
V
 
S
D
 
K
P
 
P
A
 
N
D
 
D
P
 
-
A
 
S
T
 
S
H
 
S
R
 
R
R
 
K
M
 
L
A
 
G
S
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
I
I
 
Q
S
 
S
T
 
Q
Y
 
F
N
 
Q
L
 
C
D
 
A
L
 
G
A
 
N
A
 
S
S
 
S
V
 
A
I
 
L
F
 
F
F
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
Q
N
 
N
A
 
L
L
 
L
G
 
C
T
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
E
Q
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
V
T
 
I
P
 
S
S
 
N
-
 
P
W
 
W
G
 
V
G
 
S
W
 
W
F
 
F
L
 
K
L
 
A
A
 
A
C
 
S
V
 
L
P
 
P
G
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
S
F
 
L
I
 
L
A
 
C
V
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
P
P
 
P
E
 
E
A
 
T
R
 
K
K
 
D
T
 
T
P
 
P
H
 
E
A
 
A
P
 
P
Q
 
G
E
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
T
R
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
P
 
P
M
 
V
A
 
T
T
 
K
R
 
N
E
 
E
K
 
W
I
 
I
T
 
M
L
 
V
G
 
G
V
 
T
F
 
M
V
 
L
T
 
L
V
 
A
I
 
V
A
 
T
L
 
L
W
 
W
V
 
I
A
 
C
G
 
G
G
 
E
S
 
T
W
 
L
L
 
G
N
 
I
P
 
P
T
 
S
T
 
V
V
 
V
-
 
A
A
 
A
F
 
M
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
S
L
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
V
C
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
N
W
 
W
S
 
D
D
 
D
V
 
C
K
 
L
G
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
S
A
 
A
W
 
W
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
M
 
G
M
 
M
G
 
A
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
T
E
 
N
T
 
L
G
 
G
F
 
V
I
 
V
D
 
T
W
 
W
L
 
M
G
 
S
G
 
D
L
 
C
V
 
V
E
 
A
G
 
K
P
 
V
L
 
L
G
 
Q
G
 
S
L
 
L
D
 
S
P
 
L
T
 
S
-
 
W
-
 
P
V
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
G
A
 
L
L
 
L
T
 
Q
V
 
A
V
 
A
Y
 
Y
A
 
F
A
 
F
S
 
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
 
Q
T
 
T
A
 
G
H
 
H
T
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
A
T
 
M
G
 
H
V
 
I
A
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
G
L
 
I
P
 
L
L
 
A
I
 
A
V
 
L
I
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
L
 
N
P
 
T
T
 
N
L
 
L
M
 
F
G
 
G
C
 
A
L
 
L
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
N
 
S
G
 
G
P
 
Q
A
 
A
P
 
A
L
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
D
V
 
L
G
 
P
R
 
D
W
 
V
W
 
F
S
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
F
V
 
V
I
 
M
G
 
A
L
 
T
V
 
I
H
 
N
L
 
A
A
 
I
V
 
I
W
 
W
L
 
G
G
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
T
L
 
F
W
 
W
W
 
W
Q
 
K
L
 
F
I
 
L
G
 
G
A
 
L
W
 
Y

Query Sequence

>WP_083666788.1 NCBI__GCF_001941485.1:WP_083666788.1
MTAPQSPPIDDAPSVTVRGEVRPGRLAAAVGVGLVLWFVPTPDGLADNAWGLFALFVATI
LMIILNAAPMGTVSVVAMAACAATGVLAPGDPGASITAALSGFSNSTIWLIVSAFFIARA
VIASGLGARLGYLFVRIFGRSTLGLAYGLGLADLVTSPAIPSNTARAGGIVYPVMESILK
TDGVDPADPATHRRMASFLAISTYNLDLAASVIFFTGAAPNALGTKLADQMGVDTPSWGG
WFLLACVPGIIGFIAVPLVLYLLYRPEARKTPHAPQEAARRLAALGPMATREKITLGVFV
TVIALWVAGGSWLNPTTVAFIGLALLLLCGVLTWSDVKGERSAWDTLVWFAALVMMGSQL
NETGFIDWLGGLVEGPLGGLDPTVAFVALTVVYAASHYLFASGTAHTAAMFSVFLGTGVA
LGLPALPLIVILAALPTLMGCLTHYGNGPAPLYFGTGYVPVGRWWSLGAVIGLVHLAVWL
GVGPLWWQLIGAW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory