SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_083710231.1 NCBI__GCF_900156495.1:WP_083710231.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5l9oB Crystal structure of agrobacterium tumefaciens c58 strain pbp soca in complex with glucopine (see paper)
40% identity, 40% coverage: 68:301/589 of query aligns to 5:241/243 of 5l9oB

query
sites
5l9oB
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
T
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
M
S
 
G
D
 
D
A
 
A
G
 
K
P
 
P
S
 
Y
I
 
A
C
 
F
V
 
T
N
 
T
G
 
A
K
 
D
G
 
G
S
x
N
F
|
F
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
K
 
L
A
 
N
I
 
V
A
 
A
A
 
G
K
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
K
K
 
K
L
 
E
R
 
Q
I
 
V
Q
 
V
F
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
E
 
E
F
|
F
S
 
S
G
 
A
L
 
L
L
 
M
S
 
P
Q
 
S
V
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
A
S
 
A
S
x
A
S
x
A
I
 
I
T
x
G
T
 
T
T
 
T
D
 
A
E
 
K
R
|
R
R
 
K
K
 
E
T
 
T
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
G
Y
 
Y
D
 
L
F
x
A
G
|
G
Y
 
F
F
 
L
S
 
S
L
 
V
V
 
L
A
 
T
P
 
S
A
 
E
G
 
A
G
 
G
S
 
-
I
 
I
K
 
T
G
 
D
F
 
A
A
 
A
N
 
G
L
 
L
S
 
-
K
 
K
S
 
G
T
 
K
R
 
R
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
|
T
V
x
L
Q
|
Q
D
 
E
D
 
I
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
-
 
K
N
 
N
T
 
F
L
 
A
H
 
G
L
 
T
E
 
D
A
 
L
V
 
V
K
 
K
F
 
F
P
 
P
D
 
D
Y
 
N
A
 
N
T
 
S
A
 
A
Y
 
V
A
 
S
N
 
A
L
 
L
K
 
N
S
 
N
G
 
G
Q
 
T
I
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
H
V
 
F
A
 
L
P
x
D
S
 
F
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
D
A
 
Y
I
 
S
R
 
A
P
 
R
G
 
Y
D
 
P
G
 
A
T
 
L
T
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
V
N
 
N
T
 
I
F
 
P
S
|
S
V
 
F
N
 
D
N
x
A
F
 
P
V
 
A
A
 
G
W
 
F
A
 
V
V
 
I
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
D
K
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
K
A
 
E
I
 
A
I
 
M
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
W
A
 
K
K
 
K
L
 
L
Y
 
H
T
 
E
D
 
K
W
 
W
V
 
F
P
 
P
-
 
G
R
 
T
E
 
P
L
 
M
P
 
P
K
 
A
G
 
A
W
 
Y
K
 
L
P
 
P

5lomB Crystal structure of the pbp soca from agrobacterium tumefaciens c58 in complex with dfg at 1.5 a resolution (see paper)
40% identity, 40% coverage: 68:301/589 of query aligns to 6:242/250 of 5lomB

query
sites
5lomB
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
T
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
M
S
 
G
D
 
D
A
 
A
G
 
K
P
 
P
S
 
Y
I
 
A
C
 
F
V
 
T
N
 
T
G
 
A
K
 
D
G
 
G
S
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
K
 
L
A
 
N
I
 
V
A
 
A
A
 
G
K
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
K
K
 
K
L
 
E
R
 
Q
I
 
V
Q
 
V
F
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
E
 
E
F
|
F
S
 
S
G
 
A
L
 
L
L
 
M
S
 
P
Q
 
S
V
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
A
S
 
A
S
x
A
S
x
A
I
 
I
T
x
G
T
 
T
T
 
T
D
 
A
E
 
K
R
|
R
R
 
K
K
 
E
T
 
T
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
G
Y
 
Y
D
 
L
F
x
A
G
|
G
Y
 
F
F
 
L
S
 
S
L
 
V
V
 
L
A
 
T
P
 
S
A
 
E
G
 
A
G
 
G
S
 
-
I
 
I
K
 
T
G
 
D
F
 
A
A
 
A
N
 
G
L
 
L
S
 
-
K
 
K
S
 
G
T
 
K
R
 
R
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
|
T
V
x
L
Q
|
Q
D
 
E
D
 
I
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
-
 
K
N
 
N
T
 
F
L
 
A
H
 
G
L
 
T
E
 
D
A
 
L
V
 
V
K
 
K
F
 
F
P
 
P
D
 
D
Y
 
N
A
 
N
T
 
S
A
 
A
Y
 
V
A
 
S
N
 
A
L
 
L
K
 
N
S
 
N
G
 
G
Q
 
T
I
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
H
V
 
F
A
 
L
P
x
D
S
 
F
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
D
A
 
Y
I
 
S
R
 
A
P
 
R
G
 
Y
D
 
P
G
 
A
T
 
L
T
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
V
N
 
N
T
 
I
F
 
P
S
|
S
V
 
F
N
 
D
N
x
A
F
 
P
V
 
A
A
 
G
W
 
F
A
 
V
V
 
I
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
D
K
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
K
A
 
E
I
 
A
I
 
M
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
W
A
 
K
K
 
K
L
 
L
Y
 
H
T
 
E
D
 
K
W
 
W
V
 
F
P
 
P
-
 
G
R
 
T
E
 
P
L
 
M
P
 
P
K
 
A
G
 
A
W
 
Y
K
 
L
P
 
P

5l9oA Crystal structure of agrobacterium tumefaciens c58 strain pbp soca in complex with glucopine (see paper)
40% identity, 40% coverage: 68:301/589 of query aligns to 4:240/241 of 5l9oA

query
sites
5l9oA
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
T
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
M
S
 
G
D
 
D
A
 
A
G
 
K
P
 
P
S
 
Y
I
 
A
C
 
F
V
 
T
N
 
T
G
 
A
K
 
D
G
 
G
S
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
K
 
L
A
 
N
I
 
V
A
 
A
A
 
G
K
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
K
K
 
K
L
 
E
R
 
Q
I
 
V
Q
 
V
F
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
E
 
E
F
|
F
S
 
S
G
 
A
L
 
L
L
 
M
S
 
P
Q
 
S
V
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
A
S
 
A
S
x
A
S
x
A
I
 
I
T
x
G
T
 
T
T
 
T
D
 
A
E
 
K
R
|
R
R
 
K
K
 
E
T
 
T
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
G
Y
 
Y
D
 
L
F
x
A
G
|
G
Y
 
F
F
 
L
S
 
S
L
 
V
V
 
L
A
 
T
P
 
S
A
 
E
G
 
A
G
 
G
S
 
-
I
 
I
K
 
T
G
 
D
F
 
A
A
 
A
N
 
G
L
 
L
S
 
-
K
 
K
S
 
G
T
 
K
R
 
R
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
|
T
V
x
L
Q
|
Q
D
 
E
D
 
I
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
E
-
 
K
N
 
N
T
 
F
L
 
A
H
 
G
L
 
T
E
 
D
A
 
L
V
 
V
K
 
K
F
 
F
P
 
P
D
 
D
Y
 
N
A
 
N
T
 
S
A
 
A
Y
 
V
A
 
S
N
 
A
L
 
L
K
 
N
S
 
N
G
 
G
Q
 
T
I
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
H
V
 
F
A
 
L
P
x
D
S
 
F
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
D
A
 
Y
I
 
S
R
 
A
P
 
R
G
 
Y
D
 
P
G
 
A
T
 
L
T
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
V
N
 
N
T
 
I
F
 
P
S
|
S
V
 
F
N
 
D
N
x
A
F
 
P
V
 
A
A
 
G
W
 
F
A
 
V
V
 
I
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
D
K
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
K
A
 
E
I
 
A
I
 
M
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
W
A
 
K
K
 
K
L
 
L
Y
 
H
T
 
E
D
 
K
W
 
W
V
 
F
P
 
P
-
 
G
R
 
T
E
 
P
L
 
M
P
 
P
K
 
A
G
 
A
W
 
Y
K
 
L
P
 
P

4ymtC Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines (see paper)
31% identity, 35% coverage: 358:565/589 of query aligns to 14:215/215 of 4ymtC

query
sites
4ymtC
L
 
L
L
 
F
K
 
I
T
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
I
N
 
M
T
 
T
L
 
L
I
 
K
L
 
L
S
 
T
V
 
F
V
 
L
S
 
A
G
 
V
V
 
T
L
 
I
G
 
G
T
 
V
I
 
L
L
 
M
G
 
G
M
 
L
V
 
F
L
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
M
G
 
K
I
 
M
S
 
S
R
 
S
S
 
I
R
 
K
W
 
P
L
 
I
R
 
K
W
 
L
P
 
V
A
 
A
R
 
S
I
 
S
Y
 
Y
T
 
I
D
 
E
I
 
V
F
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
T
P
|
P
A
x
L
V
 
L
V
 
V
V
 
Q
I
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
I
G
 
Y
L
 
N
G
 
G
I
 
L
G
 
M
P
 
Q
V
 
F
V
 
G
K
 
M
N
 
N
L
 
I
T
 
P
G
 
A
N
 
-
N
 
-
P
 
-
Y
 
F
W
 
T
L
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
I
L
x
N
A
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
I
 
V
G
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
I
R
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
P
G
 
G
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
R
A
 
S
I
 
L
G
 
G
F
 
M
S
 
T
Y
 
H
R
 
A
Q
 
M
S
 
A
M
 
M
R
 
R
L
 
Y
V
 
V
V
 
I
V
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
V
 
I
R
 
K
R
 
N
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
M
 
G
N
 
N
Q
x
E
F
 
F
I
 
I
S
 
V
L
x
M
I
 
L
K
|
K
D
x
E
S
 
S
S
 
A
L
 
I
V
 
V
Y
 
S
F
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
F
-
 
A
-
 
D
L
 
L
A
 
T
S
 
R
Q
 
Q
R
 
A
E
 
D
L
 
I
F
 
I
A
 
Q
V
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
S
A
 
V
Q
 
T
T
 
Y
G
 
R
N
 
Y
L
 
F
S
 
E
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
A
 
I
A
 
I
G
 
A
L
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
F
V
 
V
L
 
M
T
 
T
I
 
L
P
 
T
L
 
F
T
 
S
H
 
K
L
 
L
V
 
L
N
 
S
Y
 
L
I
 
F
D
 
E
H
 
R
R
 
R
L
 
L
R
 
R

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
33% identity, 37% coverage: 74:290/589 of query aligns to 4:222/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
G
 
G
T
 
T
I
 
L
S
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
T
L
x
E
S
 
A
D
 
T
A
x
F
G
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
G
C
 
F
V
 
K
N
 
D
G
 
E
K
 
N
G
 
G
S
 
K
F
 
L
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
G
L
 
V
R
 
K
I
 
V
Q
 
E
F
 
F
S
 
K
G
 
P
T
 
M
E
 
D
F
|
F
S
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
S
 
P
Q
 
A
V
 
L
A
 
Q
N
 
S
N
 
G
R
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
V
S
 
I
S
 
A
S
x
G
I
x
M
T
|
T
T
 
I
T
 
T
D
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
K
K
 
K
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
P
Y
 
Y
-
 
F
D
 
E
F
 
A
G
 
G
Y
 
Q
F
 
A
S
 
I
L
 
V
V
 
V
A
 
K
P
 
K
A
 
G
G
 
N
G
 
D
S
 
S
I
 
I
K
 
K
G
 
S
F
 
L
A
 
E
N
 
D
L
 
L
S
 
-
K
 
K
S
 
G
T
 
K
R
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
Q
Q
 
L
G
 
G
T
x
S
V
x
T
Q
 
S
D
 
E
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
Q
 
K
N
 
K
T
 
V
L
 
A
H
 
A
-
 
G
L
 
V
E
 
K
A
 
V
V
 
K
K
 
K
F
 
F
P
 
D
D
 
N
Y
 
F
A
 
S
T
 
E
A
 
A
Y
 
F
A
 
Q
N
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
V
V
 
V
A
 
T
P
x
D
S
 
N
Q
 
A
Q
 
V
A
 
A
E
 
L
G
 
A
A
 
Y
I
 
V
R
 
K
-
 
Q
-
 
N
P
 
P
G
 
N
D
 
A
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
I
A
 
V
E
 
G
N
 
E
T
 
T
F
 
F
S
 
S
V
 
G
N
 
E
N
 
P
F
 
Y
V
 
-
A
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
S
K
 
E
L
 
L
T
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
N
S
 
K
G
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
I
 
M
I
 
K
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
L
 
I
Y
 
Y
T
 
E
D
 
K
W
 
W

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
33% identity, 37% coverage: 74:290/589 of query aligns to 4:224/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
G
 
G
T
 
T
I
 
L
S
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
T
L
x
E
S
 
A
D
 
T
A
x
F
G
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
G
C
 
F
V
 
K
N
 
D
G
 
E
K
 
N
G
 
G
S
 
K
F
 
L
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
G
L
 
V
R
 
K
I
 
V
Q
 
E
F
 
F
S
 
K
G
 
P
T
 
M
E
 
D
F
|
F
S
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
S
 
P
Q
 
A
V
 
L
A
 
Q
N
 
S
N
 
G
R
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
V
S
 
I
S
x
A
S
x
G
I
x
M
T
|
T
T
 
I
T
 
T
D
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
K
K
 
K
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
P
Y
 
Y
-
 
F
D
 
E
F
 
A
G
 
G
Y
 
Q
F
 
A
S
 
I
L
 
V
V
 
V
A
 
K
P
 
K
A
 
G
G
 
N
G
 
D
S
 
S
I
 
I
K
 
K
G
 
S
F
 
L
A
 
E
N
 
D
L
 
L
S
 
-
K
 
K
S
 
G
T
 
K
R
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
x
Q
Q
 
L
G
 
G
T
x
S
V
x
T
Q
 
S
D
 
E
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
Q
 
K
N
 
K
T
 
V
L
 
A
H
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
G
L
 
V
E
 
K
A
 
V
V
 
K
K
 
K
F
 
F
P
 
D
D
 
N
Y
 
F
A
 
S
T
 
E
A
 
A
Y
 
F
A
 
Q
N
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
V
V
 
V
A
 
T
P
x
D
S
 
N
Q
 
A
Q
 
V
A
 
A
E
 
L
G
 
A
A
 
Y
I
 
V
R
 
K
-
 
Q
-
 
N
P
 
P
G
 
N
D
 
A
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
I
A
 
V
E
 
G
N
 
E
T
 
T
F
 
F
S
 
S
V
 
G
N
 
E
N
 
P
F
 
Y
V
 
-
A
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
S
K
 
E
L
 
L
T
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
N
S
 
K
G
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
I
 
M
I
 
K
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
L
 
I
Y
 
Y
T
 
E
D
 
K
W
 
W

4ymwC Crystal structure of an amino acid abc transporter with histidines (see paper)
31% identity, 35% coverage: 358:564/589 of query aligns to 14:214/214 of 4ymwC

query
sites
4ymwC
L
 
L
L
 
F
K
 
I
T
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
I
N
 
M
T
 
T
L
 
L
I
 
K
L
 
L
S
 
T
V
 
F
V
 
L
S
 
A
G
 
V
V
 
T
L
 
I
G
 
G
T
 
V
I
 
L
L
 
M
G
 
G
M
 
L
V
 
F
L
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
M
G
 
K
I
 
M
S
 
S
R
 
S
S
 
I
R
 
K
W
 
P
L
 
I
R
 
K
W
 
L
P
 
V
A
 
A
R
 
S
I
 
S
Y
 
Y
T
 
I
D
 
E
I
 
V
F
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
T
P
 
P
A
 
L
V
 
L
V
 
V
V
 
Q
I
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
I
G
 
Y
L
 
N
G
 
G
I
 
L
G
 
M
P
 
Q
V
 
F
V
 
G
K
 
M
N
 
N
L
 
I
T
 
P
G
 
A
N
 
-
N
 
-
P
 
-
Y
 
F
W
 
T
L
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
I
L
x
N
A
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
I
 
V
G
 
A
E
 
E
I
 
I
F
 
I
R
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
P
G
 
G
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
R
A
 
S
I
 
L
G
 
G
F
 
M
S
 
T
Y
 
H
R
 
A
Q
 
M
S
 
A
M
 
M
R
 
R
L
 
Y
V
 
V
V
 
I
V
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
V
 
I
R
 
K
R
 
N
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
M
 
G
N
 
N
Q
x
E
F
 
F
I
 
I
S
 
V
L
 
M
I
 
L
K
 
K
D
x
E
S
 
S
S
 
A
L
 
I
V
 
V
Y
 
S
F
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
F
-
 
A
-
 
D
L
 
L
A
 
T
S
 
R
Q
 
Q
R
 
A
E
 
D
L
 
I
F
 
I
A
 
Q
V
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
S
A
 
V
Q
 
T
T
 
Y
G
 
R
N
 
Y
L
 
F
S
 
E
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
A
 
I
A
 
I
G
 
A
L
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
F
V
 
V
L
 
M
T
 
T
I
 
L
P
 
T
L
 
F
T
 
S
H
 
K
L
 
L
V
 
L
N
 
S
Y
 
L
I
 
F
D
 
E
H
 
R
R
 
R
L
 
L

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
31% identity, 38% coverage: 70:290/589 of query aligns to 6:227/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
L
 
I
L
 
M
D
 
K
P
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
L
S
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
T
L
x
D
S
 
A
D
 
D
A
x
Y
G
 
K
P
 
P
S
 
F
I
 
S
C
 
F
V
 
K
N
 
D
G
 
K
K
 
N
G
 
G
S
 
Q
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
G
L
 
V
R
 
K
I
 
V
Q
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
P
T
 
T
E
 
T
F
x
W
S
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
I
S
 
P
Q
 
A
V
 
L
A
 
Q
N
 
T
N
 
G
R
 
K
F
 
F
D
 
D
V
 
I
G
 
V
S
 
M
S
|
S
S
x
G
I
x
M
T
|
T
T
 
I
T
 
T
D
 
P
E
 
E
R
|
R
R
 
K
K
 
K
T
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
P
Y
 
Y
-
 
M
D
 
T
F
 
A
G
 
G
Y
 
Q
F
 
T
S
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
K
P
 
K
A
 
D
G
 
N
G
 
A
-
 
D
S
 
K
I
 
I
K
 
K
G
 
S
F
 
F
A
 
E
N
 
D
L
 
L
S
 
N
K
 
K
-
 
P
S
 
D
T
 
V
R
 
K
I
 
V
G
 
A
V
 
V
V
x
Q
Q
 
L
G
 
G
T
|
T
V
x
T
Q
 
S
D
 
E
D
 
Q
Y
 
A
V
 
A
Q
 
K
N
 
E
T
 
F
L
 
L
H
 
P
L
 
K
E
 
A
A
 
K
V
 
I
K
 
R
-
 
T
F
 
F
P
 
E
D
 
N
Y
 
N
A
 
A
T
 
E
A
 
A
Y
 
F
A
 
Q
N
 
E
L
 
V
K
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
R
I
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
M
V
 
V
A
 
T
P
x
D
S
 
S
Q
 
P
Q
 
V
A
 
A
E
 
-
G
 
-
A
 
A
I
 
Y
R
 
Y
P
 
A
G
 
K
D
 
L
G
 
A
T
 
V
T
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
D
N
 
E
T
 
P
F
 
F
S
 
T
V
 
-
N
 
H
N
 
E
F
 
P
V
 
L
A
 
G
W
 
F
A
 
A
V
 
I
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
L
T
 
L
E
 
N
A
 
W
L
 
V
N
 
N
S
 
N
G
 
W
L
 
L
D
 
K
A
 
Q
I
 
M
I
 
K
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
T
 
E
D
 
K
W
 
W

3vv5A Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l- cysteine (aec) (see paper)
31% identity, 37% coverage: 74:290/589 of query aligns to 13:229/237 of 3vv5A

query
sites
3vv5A
G
 
G
T
 
E
I
 
I
S
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
L
x
E
S
 
G
D
 
A
A
x
F
G
 
P
P
 
P
S
 
F
I
x
N
C
 
Y
V
 
F
N
 
D
G
 
E
K
 
R
G
 
N
S
 
Q
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
E
N
 
V
E
 
D
L
 
L
L
 
G
K
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
P
Q
 
R
F
 
W
S
 
I
G
 
A
T
 
Q
E
 
S
F
|
F
S
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
I
Q
 
Q
V
 
L
A
 
N
N
 
Q
N
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
F
G
 
V
S
 
I
S
x
A
S
|
S
I
 
H
T
x
G
T
 
I
T
 
T
D
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
A
K
 
R
T
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
N
 
N
G
 
P
Y
 
H
D
 
Y
F
 
C
G
 
T
Y
 
G
F
 
G
S
 
V
L
 
I
V
 
V
A
 
S
P
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
P
I
 
R
K
 
T
G
 
-
F
 
-
A
 
A
N
 
K
L
 
D
S
 
L
K
 
Q
S
 
G
T
 
K
R
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
Q
Q
 
V
G
 
G
T
|
T
V
x
T
Q
x
Y
D
 
M
D
 
E
Y
 
A
V
 
A
Q
 
Q
N
 
K
T
 
I
L
 
P
H
 
G
L
 
I
E
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
R
-
 
T
F
 
Y
P
 
Q
D
 
R
Y
 
D
A
 
P
T
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
Q
N
 
D
L
 
L
K
 
L
S
 
A
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
T
W
 
W
V
 
I
A
 
T
P
 
D
S
 
R
Q
 
F
Q
 
V
A
 
A
E
 
K
G
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
P
 
E
G
 
R
D
 
K
G
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
L
S
 
Q
V
 
V
N
 
G
N
 
E
F
 
L
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
V
 
V
A
 
A
W
 
M
A
 
A
V
 
V
G
 
A
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
K
K
 
S
L
 
L
T
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
R
G
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
L
I
 
M
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
L
 
I
Y
 
S
T
 
Q
D
 
K
W
 
W

3vvfA Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine (see paper)
31% identity, 37% coverage: 74:290/589 of query aligns to 17:233/241 of 3vvfA

query
sites
3vvfA
G
 
G
T
 
E
I
 
I
S
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
L
x
E
S
 
G
D
 
A
A
x
F
G
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
N
C
 
Y
V
 
F
N
 
D
G
 
E
K
 
R
G
 
N
S
 
Q
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
E
N
 
V
E
 
D
L
 
L
L
 
G
K
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
P
Q
 
R
F
 
W
S
 
I
G
 
A
T
 
Q
E
 
S
F
|
F
S
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
I
Q
 
Q
V
 
L
A
 
N
N
 
Q
N
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
F
G
 
V
S
 
I
S
x
A
S
|
S
I
x
H
T
x
G
T
 
I
T
 
T
D
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
A
K
 
R
T
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
N
 
N
G
 
P
Y
 
H
D
 
Y
F
 
C
G
 
T
Y
 
G
F
 
G
S
 
V
L
 
I
V
 
V
A
 
S
P
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
P
I
 
R
K
 
T
G
 
-
F
 
-
A
 
A
N
 
K
L
 
D
S
 
L
K
 
Q
S
 
G
T
 
K
R
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
x
Q
Q
 
V
G
 
G
T
|
T
V
x
T
Q
x
Y
D
 
M
D
 
E
Y
 
A
V
 
A
Q
 
Q
N
 
K
T
 
I
L
 
P
H
 
G
L
 
I
E
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
R
-
 
T
F
 
Y
P
 
Q
D
 
R
Y
 
D
A
 
P
T
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
Q
N
 
D
L
 
L
K
 
L
S
 
A
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
T
W
 
W
V
 
I
A
 
T
P
 
D
S
 
R
Q
 
F
Q
 
V
A
 
A
E
 
K
G
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
P
 
E
G
 
R
D
 
K
G
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
L
S
 
Q
V
 
V
N
 
G
N
 
E
F
 
L
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
x
E
-
 
R
V
 
V
A
 
A
W
 
M
A
 
A
V
 
V
G
 
A
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
K
K
 
S
L
 
L
T
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
R
G
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
L
I
 
M
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
L
 
I
Y
 
S
T
 
Q
D
 
K
W
 
W

3vveA Crystal structure of ttc0807 complexed with lysine (see paper)
31% identity, 37% coverage: 74:290/589 of query aligns to 17:233/241 of 3vveA

query
sites
3vveA
G
 
G
T
 
E
I
 
I
S
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
L
x
E
S
 
G
D
 
A
A
x
F
G
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
N
C
 
Y
V
 
F
N
 
D
G
 
E
K
 
R
G
 
N
S
 
Q
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
E
N
 
V
E
 
D
L
 
L
L
 
G
K
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
P
Q
 
R
F
 
W
S
 
I
G
 
A
T
 
Q
E
 
S
F
|
F
S
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
I
Q
 
Q
V
 
L
A
 
N
N
 
Q
N
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
F
G
 
V
S
 
I
S
 
A
S
|
S
I
x
H
T
 
G
T
 
I
T
 
T
D
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
A
K
 
R
T
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
N
 
N
G
 
P
Y
 
H
D
 
Y
F
 
C
G
 
T
Y
 
G
F
 
G
S
 
V
L
 
I
V
 
V
A
 
S
P
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
P
I
 
R
K
 
T
G
 
-
F
 
-
A
 
A
N
 
K
L
 
D
S
 
L
K
 
Q
S
 
G
T
 
K
R
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
x
Q
Q
 
V
G
 
G
T
|
T
V
x
T
Q
x
Y
D
 
M
D
 
E
Y
 
A
V
 
A
Q
 
Q
N
 
K
T
 
I
L
 
P
H
 
G
L
 
I
E
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
R
-
 
T
F
 
Y
P
 
Q
D
 
R
Y
 
D
A
 
P
T
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
Q
N
 
D
L
 
L
K
 
L
S
 
A
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
T
W
 
W
V
 
I
A
 
T
P
 
D
S
 
R
Q
 
F
Q
 
V
A
 
A
E
 
K
G
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
P
 
E
G
 
R
D
 
K
G
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
L
S
 
Q
V
 
V
N
 
G
N
 
E
F
 
L
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
x
E
-
 
R
V
 
V
A
 
A
W
 
M
A
 
A
V
 
V
G
 
A
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
K
K
 
S
L
 
L
T
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
R
G
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
L
I
 
M
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
L
 
I
Y
 
S
T
 
Q
D
 
K
W
 
W

3vvdA Crystal structure of ttc0807 complexed with ornithine (see paper)
31% identity, 37% coverage: 74:290/589 of query aligns to 17:233/241 of 3vvdA

query
sites
3vvdA
G
 
G
T
 
E
I
 
I
S
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
L
x
E
S
 
G
D
 
A
A
 
F
G
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
N
C
 
Y
V
 
F
N
 
D
G
 
E
K
 
R
G
 
N
S
 
Q
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
E
N
 
V
E
 
D
L
 
L
L
 
G
K
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
P
Q
 
R
F
 
W
S
 
I
G
 
A
T
 
Q
E
 
S
F
|
F
S
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
I
Q
 
Q
V
 
L
A
 
N
N
 
Q
N
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
F
G
 
V
S
 
I
S
 
A
S
|
S
I
x
H
T
x
G
T
 
I
T
 
T
D
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
A
K
 
R
T
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
N
 
N
G
 
P
Y
 
H
D
 
Y
F
 
C
G
 
T
Y
 
G
F
 
G
S
 
V
L
 
I
V
 
V
A
 
S
P
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
P
I
 
R
K
 
T
G
 
-
F
 
-
A
 
A
N
 
K
L
 
D
S
 
L
K
 
Q
S
 
G
T
 
K
R
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
x
Q
Q
 
V
G
 
G
T
|
T
V
x
T
Q
x
Y
D
 
M
D
 
E
Y
 
A
V
 
A
Q
 
Q
N
 
K
T
 
I
L
 
P
H
 
G
L
 
I
E
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
R
-
 
T
F
 
Y
P
 
Q
D
 
R
Y
 
D
A
 
P
T
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
Q
N
 
D
L
 
L
K
 
L
S
 
A
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
T
W
 
W
V
 
I
A
 
T
P
 
D
S
 
R
Q
 
F
Q
 
V
A
 
A
E
 
K
G
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
P
 
E
G
 
R
D
 
K
G
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
L
S
 
Q
V
 
V
N
 
G
N
 
E
F
 
L
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
x
E
-
 
R
V
 
V
A
 
A
W
 
M
A
 
A
V
 
V
G
 
A
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
K
K
 
S
L
 
L
T
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
R
G
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
L
I
 
M
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
L
 
I
Y
 
S
T
 
Q
D
 
K
W
 
W

8gu1A Crystal structure of putative amino acid binding periplasmic abc transporter protein from candidatus liberibacter asiaticus in complex with pimozide (see paper)
30% identity, 35% coverage: 91:295/589 of query aligns to 20:225/234 of 8gu1A

query
sites
8gu1A
N
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
G
S
 
E
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
H
K
 
R
L
 
L
K
 
N
L
 
L
R
 
K
I
 
V
Q
 
E
F
 
F
S
 
F
G
 
E
T
 
T
E
 
A
F
x
V
S
 
S
G
 
G
L
|
L
L
 
I
S
 
T
Q
 
G
V
 
L
A
 
D
N
 
T
N
 
N
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
V
 
V
G
 
-
S
 
L
S
x
V
S
x
N
I
 
V
T
x
A
T
 
I
T
 
T
D
 
P
E
 
E
R
|
R
R
 
Q
K
 
K
T
 
K
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
I
G
 
P
Y
 
Y
D
 
I
F
 
A
G
 
H
Y
 
R
F
 
V
S
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
V
P
 
R
A
 
S
G
 
D
-
 
Q
G
 
Q
S
 
D
I
 
I
K
 
R
G
 
S
F
 
F
A
 
K
N
 
D
L
 
L
S
 
T
K
 
D
S
 
K
T
 
T
R
 
-
I
 
V
G
 
A
V
 
Q
V
 
I
Q
 
L
G
 
G
T
|
T
V
 
D
Q
x
L
D
 
S
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
Q
 
K
N
 
E
T
 
-
L
 
L
H
 
K
L
 
S
E
 
H
A
 
L
V
 
V
K
 
F
F
 
S
P
 
H
D
 
N
Y
x
F
A
 
E
T
 
Q
A
 
S
Y
 
L
A
 
Q
N
 
L
L
 
L
K
 
L
S
 
S
G
 
K
Q
 
R
I
 
T
D
 
D
A
 
A
W
 
T
V
 
M
A
 
I
P
|
P
S
 
D
Q
 
I
Q
 
P
A
 
F
E
 
F
G
 
N
A
 
F
I
 
L
-
 
E
-
 
R
R
 
R
P
 
P
G
 
H
D
 
D
G
 
G
T
 
N
T
 
L
I
 
F
A
 
K
-
 
I
E
 
A
N
 
D
T
 
R
F
 
M
S
 
K
V
 
D
N
 
N
N
 
S
F
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
F
A
 
M
V
 
M
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
N
K
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
N
S
 
E
G
 
I
L
 
L
D
 
C
A
 
A
I
 
I
I
 
H
A
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
K
K
 
K
L
 
I
Y
 
F
T
 
D
D
 
R
W
 
Y
V
 
F
P
 
D
R
 
K
E
 
N
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6aalA Crystal structure of putative amino acid binding periplasmic abc transporter protein from candidatus liberibacter asiaticus in complex with arginine (see paper)
30% identity, 35% coverage: 91:295/589 of query aligns to 20:225/234 of 6aalA

query
sites
6aalA
N
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
G
S
 
E
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
H
K
 
R
L
 
L
K
 
N
L
 
L
R
 
K
I
 
V
Q
 
E
F
 
F
S
 
F
G
 
E
T
 
T
E
 
A
F
 
V
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
I
S
 
T
Q
 
G
V
 
L
A
 
D
N
 
T
N
 
N
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
V
 
V
G
 
-
S
 
L
S
 
V
S
 
N
I
 
V
T
x
A
T
 
I
T
 
T
D
 
P
E
 
E
R
|
R
R
 
Q
K
 
K
T
 
K
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
I
G
 
P
Y
 
Y
D
 
I
F
 
A
G
x
H
Y
 
R
F
x
V
S
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
V
P
 
R
A
 
S
G
 
D
-
 
Q
G
 
Q
S
 
D
I
 
I
K
 
R
G
 
S
F
 
F
A
 
K
N
 
D
L
 
L
S
 
T
K
 
D
S
 
K
T
 
T
R
 
-
I
 
V
G
 
A
V
 
Q
V
 
I
Q
 
L
G
 
G
T
|
T
V
x
D
Q
 
L
D
 
S
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
Q
 
K
N
 
E
T
 
-
L
 
L
H
 
K
L
 
S
E
 
H
A
 
L
V
 
V
K
 
F
F
 
S
P
 
H
D
 
N
Y
 
F
A
 
E
T
 
Q
A
 
S
Y
 
L
A
 
Q
N
 
L
L
 
L
K
 
L
S
 
S
G
 
K
Q
 
R
I
 
T
D
 
D
A
 
A
W
 
T
V
 
M
A
 
I
P
 
P
S
 
D
Q
 
I
Q
 
P
A
 
F
E
 
F
G
 
N
A
 
F
I
 
L
-
 
E
-
 
R
R
 
R
P
 
P
G
 
H
D
 
D
G
 
G
T
 
N
T
 
L
I
 
F
A
 
K
-
 
I
E
 
A
N
 
D
T
 
R
F
 
M
S
 
K
V
 
D
N
 
N
N
x
S
F
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
F
A
 
M
V
 
M
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
N
K
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
N
S
 
E
G
 
I
L
 
L
D
 
C
A
 
A
I
 
I
I
 
H
A
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
K
K
 
K
L
 
I
Y
 
F
T
 
D
D
 
R
W
 
Y
V
 
F
P
 
D
R
 
K
E
 
N
L
 
I

6a80A Crystal structure of putative amino acid binding periplasmic abc transporter protein from candidatus liberibacter asiaticus in complex with cystine (see paper)
30% identity, 35% coverage: 91:295/589 of query aligns to 20:225/234 of 6a80A

query
sites
6a80A
N
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
G
S
 
E
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
H
K
 
R
L
 
L
K
 
N
L
 
L
R
 
K
I
 
V
Q
 
E
F
 
F
S
 
F
G
 
E
T
 
T
E
 
A
F
 
V
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
x
I
S
 
T
Q
 
G
V
 
L
A
 
D
N
 
T
N
 
N
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
V
 
V
G
 
-
S
 
L
S
 
V
S
 
N
I
 
V
T
x
A
T
 
I
T
 
T
D
 
P
E
 
E
R
|
R
R
 
Q
K
 
K
T
 
K
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
I
G
 
P
Y
 
Y
D
 
I
F
 
A
G
x
H
Y
 
R
F
 
V
S
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
V
P
 
R
A
 
S
G
 
D
-
 
Q
G
 
Q
S
 
D
I
 
I
K
 
R
G
 
S
F
 
F
A
 
K
N
 
D
L
 
L
S
 
T
K
 
D
S
 
K
T
 
T
R
 
-
I
 
V
G
 
A
V
 
Q
V
 
I
Q
 
L
G
 
G
T
|
T
V
 
D
Q
 
L
D
 
S
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
Q
 
K
N
 
E
T
 
-
L
 
L
H
 
K
L
 
S
E
 
H
A
 
L
V
 
V
K
 
F
F
 
S
P
 
H
D
 
N
Y
 
F
A
 
E
T
 
Q
A
 
S
Y
 
L
A
 
Q
N
 
L
L
 
L
K
 
L
S
 
S
G
 
K
Q
 
R
I
 
T
D
 
D
A
 
A
W
 
T
V
 
M
A
 
I
P
 
P
S
 
D
Q
 
I
Q
 
P
A
 
F
E
 
F
G
 
N
A
 
F
I
 
L
-
 
E
-
 
R
R
 
R
P
 
P
G
 
H
D
 
D
G
 
G
T
 
N
T
 
L
I
 
F
A
 
K
-
 
I
E
 
A
N
 
D
T
 
R
F
 
M
S
 
K
V
 
D
N
 
N
N
 
S
F
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
F
A
 
M
V
 
M
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
N
K
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
N
S
 
E
G
 
I
L
 
L
D
 
C
A
 
A
I
 
I
I
 
H
A
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
K
K
 
K
L
 
I
Y
 
F
T
 
D
D
 
R
W
 
Y
V
 
F
P
 
D
R
 
K
E
 
N
L
 
I

8gtuA Crystal structure of putative amino acid binding periplasmic abc transporter protein from candidatus liberibacter asiaticus in complex with clidinium (see paper)
30% identity, 35% coverage: 91:295/589 of query aligns to 22:227/236 of 8gtuA

query
sites
8gtuA
N
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
G
S
 
E
F
 
L
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
H
K
 
R
L
 
L
K
 
N
L
 
L
R
 
K
I
 
V
Q
 
E
F
 
F
S
 
F
G
 
E
T
 
T
E
 
A
F
x
V
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
x
I
S
 
T
Q
 
G
V
 
L
A
 
D
N
 
T
N
 
N
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
V
 
V
G
 
-
S
 
L
S
 
V
S
x
N
I
 
V
T
x
A
T
 
I
T
 
T
D
 
P
E
 
E
R
|
R
R
 
Q
K
 
K
T
 
K
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
I
G
 
P
Y
 
Y
D
 
I
F
 
A
G
x
H
Y
 
R
F
 
V
S
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
V
P
 
R
A
 
S
G
 
D
-
 
Q
G
 
Q
S
 
D
I
 
I
K
 
R
G
 
S
F
 
F
A
 
K
N
 
D
L
 
L
S
 
T
K
 
D
S
 
K
T
 
T
R
 
-
I
 
V
G
 
A
V
 
Q
V
 
I
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
V
x
D
Q
 
L
D
 
S
D
 
R
Y
 
F
V
 
A
Q
 
K
N
 
E
T
 
-
L
 
L
H
 
K
L
 
S
E
 
H
A
 
L
V
 
V
K
 
F
F
 
S
P
 
H
D
 
N
Y
 
F
A
 
E
T
 
Q
A
 
S
Y
 
L
A
 
Q
N
 
L
L
 
L
K
 
L
S
 
S
G
 
K
Q
 
R
I
 
T
D
 
D
A
 
A
W
 
T
V
 
M
A
 
I
P
 
P
S
 
D
Q
 
I
Q
 
P
A
 
F
E
 
F
G
 
N
A
 
F
I
 
L
-
 
E
-
 
R
R
 
R
P
 
P
G
 
H
D
 
D
G
 
G
T
 
N
T
 
L
I
 
F
A
 
K
-
 
I
E
 
A
N
 
D
T
 
R
F
 
M
S
 
K
V
 
D
N
 
N
N
 
S
F
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
F
A
 
M
V
 
M
G
 
R
K
 
K
N
 
G
K
 
N
P
 
N
K
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
N
S
 
E
G
 
I
L
 
L
D
 
C
A
 
A
I
 
I
I
 
H
A
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
K
K
 
K
L
 
I
Y
 
F
T
 
D
D
 
R
W
 
Y
V
 
F
P
 
D
R
 
K
E
 
N
L
 
I

Sites not aligning to the query:

4i62A 1.05 angstrom crystal structure of an amino acid abc transporter substrate-binding protein abpa from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a bound to l-arginine
28% identity, 35% coverage: 89:297/589 of query aligns to 26:237/237 of 4i62A

query
sites
4i62A
C
 
V
V
 
V
N
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
N
S
 
Q
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
S
D
 
D
N
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
T
K
 
E
L
 
L
K
 
G
L
 
V
R
 
E
I
 
L
Q
 
E
F
 
L
S
 
S
G
 
P
T
 
M
E
 
S
F
|
F
S
 
D
G
 
N
L
 
V
L
 
L
S
 
A
Q
 
S
V
 
V
A
 
Q
N
 
S
N
 
G
R
 
K
F
 
A
D
 
D
V
 
L
G
 
A
S
 
I
S
|
S
S
x
G
I
x
V
T
x
S
T
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
E
R
|
R
R
 
S
K
 
K
T
 
V
V
 
F
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
T
G
 
P
Y
 
Y
D
 
Y
F
 
T
G
 
A
Y
 
K
F
 
N
S
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
V
P
 
K
A
 
K
G
 
S
G
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
-
 
Q
S
 
S
I
 
V
K
 
N
G
 
D
F
 
L
A
 
A
N
 
Q
L
 
K
S
 
K
K
 
V
S
 
G
T
 
A
R
x
Q
I
 
K
G
 
G
V
x
S
V
x
I
Q
|
Q
G
 
E
T
 
T
V
 
M
Q
 
A
D
 
K
D
 
D
Y
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
T
 
S
L
 
-
H
 
-
L
 
-
E
 
S
A
 
L
V
 
V
K
 
S
F
 
L
P
 
P
D
 
K
Y
 
N
A
 
G
T
 
N
A
 
L
Y
 
I
A
 
T
N
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
V
V
 
I
A
 
F
P
x
E
S
 
E
Q
 
P
Q
 
V
A
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
F
I
 
V
R
 
E
P
 
N
G
 
N
D
 
P
G
 
D
T
 
L
T
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
D
N
 
L
T
 
N
F
 
F
S
 
E
-
 
K
V
 
Q
N
 
D
N
 
D
F
 
S
V
 
Y
A
 
A
W
 
V
A
 
A
V
 
M
G
 
K
K
 
K
N
 
D
K
 
S
P
 
K
K
 
E
L
 
L
T
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
D
S
 
K
G
 
T
L
 
I
D
 
Q
A
 
K
I
 
L
I
 
K
A
 
E
D
 
S
G
 
G
T
 
E
Y
 
L
A
 
D
K
 
K
L
 
L
Y
 
I
T
 
E
D
 
D
W
 
A
V
 
F
P
 
K
R
 
A
E
 
S
L
 
I
P
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
31% identity, 33% coverage: 98:294/589 of query aligns to 38:237/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
V
E
 
D
L
 
I
L
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
K
K
 
K
L
 
I
K
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
L
Q
 
G
F
 
D
S
 
N
G
 
G
-
 
K
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
E
L
 
V
L
 
T
S
|
S
Q
 
K
-
 
T
-
x
R
-
 
I
-
 
P
-
 
L
V
 
L
A
 
K
N
 
N
N
 
G
R
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
A
G
 
I
S
 
I
S
 
A
S
x
T
I
x
M
T
|
T
T
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
R
|
R
R
 
K
K
 
K
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
V
Y
 
Y
D
 
F
F
 
D
G
 
A
Y
 
G
F
 
Q
S
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
V
P
 
K
A
 
K
G
 
G
G
 
S
S
 
Q
I
 
I
K
 
K
G
 
S
F
 
V
A
 
D
N
 
D
L
 
L
S
 
N
K
 
A
S
 
S
T
 
T
R
 
T
I
 
V
G
 
L
V
 
A
V
 
V
Q
 
K
G
 
G
-
x
S
T
|
T
V
 
S
Q
 
A
D
 
A
D
 
N
Y
 
I
V
 
R
Q
 
Q
N
 
H
T
 
A
L
 
P
H
 
D
L
 
A
E
 
K
A
 
I
V
 
L
K
 
E
F
 
L
P
 
E
D
 
N
Y
|
Y
A
 
A
T
 
E
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
N
 
A
L
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
G
D
 
D
A
 
A
W
 
M
V
 
T
A
 
T
P
x
D
S
 
N
Q
 
A
Q
 
I
A
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
I
I
 
A
R
 
D
P
 
E
G
 
N
D
 
P
G
 
E
T
 
Y
T
 
E
I
 
L
A
 
V
E
 
G
N
 
G
T
 
T
F
 
F
S
 
T
V
 
-
N
 
N
N
 
E
F
 
P
V
 
Y
A
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
I
G
 
N
K
 
K
N
 
G
K
 
Q
P
 
E
K
 
N
L
 
F
T
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
V
N
 
N
S
 
Q
G
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
I
 
M
I
 
H
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
L
 
I
Y
 
Y
T
 
Q
D
 
K
W
 
W
V
 
F
P
 
P
R
 
N
E
 
E

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
30% identity, 37% coverage: 74:290/589 of query aligns to 10:226/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
G
 
G
T
 
Y
I
 
L
S
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
L
L
 
S
S
 
A
D
 
D
A
x
F
G
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
E
C
 
F
V
 
V
N
 
D
G
 
E
K
 
N
G
 
G
S
 
N
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
N
 
V
E
 
D
L
 
L
L
 
A
K
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
R
K
 
R
L
 
L
K
 
G
L
 
V
R
 
E
I
 
L
Q
 
K
F
 
I
S
 
V
G
 
D
T
 
M
E
 
T
F
|
F
S
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
I
S
 
P
Q
 
S
V
 
L
A
 
L
N
 
T
N
 
K
R
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
I
S
 
I
S
|
S
S
x
G
I
x
M
T
|
T
T
 
I
T
 
T
D
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
K
K
 
K
T
 
V
V
 
V
D
 
A
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
P
Y
 
Y
-
 
F
D
 
D
F
 
A
G
 
G
Y
 
Q
F
 
V
S
 
I
L
 
V
V
 
V
-
 
R
A
 
K
P
 
D
A
 
S
G
 
D
G
 
F
S
 
R
I
 
P
K
 
K
G
 
T
F
 
Y
A
 
E
N
 
D
L
 
L
S
 
V
K
 
G
S
 
K
T
 
T
R
 
-
I
 
V
G
 
A
V
 
V
V
x
Q
Q
 
I
G
 
G
T
|
T
V
x
T
Q
 
G
D
 
D
D
 
I
Y
 
E
V
 
V
Q
 
S
N
 
K
T
 
Y
L
 
D
H
 
G
L
 
I
E
 
K
A
 
V
V
 
V
K
 
R
F
 
F
P
 
D
D
 
K
Y
 
F
A
 
T
T
 
D
A
 
A
Y
 
F
A
 
L
N
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
R
G
 
G
Q
 
R
I
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
V
V
 
V
A
 
L
P
x
D
S
 
S
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
E
 
R
G
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
A
P
 
K
G
 
N
D
 
P
G
 
D
T
 
L
T
 
V
I
 
I
A
 
S
E
 
S
N
 
G
T
 
V
F
 
L
S
 
S
V
 
S
N
 
E
N
 
Q
F
 
Y
V
 
-
A
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
R
K
 
K
N
 
E
K
 
D
P
 
T
K
 
D
L
 
L
T
 
L
E
 
E
A
 
F
L
 
I
N
 
N
S
 
S
G
 
V
L
 
L
D
 
R
A
 
E
I
 
L
I
 
K
A
 
K
D
 
S
G
 
G
T
 
K
Y
 
Y
A
 
D
K
 
V
L
 
L
Y
 
I
T
 
E
D
 
K
W
 
W

P02911 Lysine/arginine/ornithine-binding periplasmic protein; LAO-binding protein from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
25% identity, 36% coverage: 73:286/589 of query aligns to 25:248/260 of P02911

query
sites
P02911
P
 
P
G
 
Q
T
 
T
I
 
V
S
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
T
L
x
D
S
 
T
D
 
T
A
x
Y
G
 
A
P
 
P
S
 
F
I
 
S
C
 
S
V
 
K
N
 
D
G
 
A
K
 
K
G
 
G
S
 
E
F
 
F
T
 
I
G
 
G
F
 
F
D
|
D
N
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
G
K
 
N
A
 
E
I
 
M
A
x
C
A
 
K
K
 
R
L
 
M
K
 
Q
L
 
V
R
 
K
I
x
C
Q
 
T
F
 
W
S
 
V
G
 
A
T
 
S
E
 
D
F
|
F
S
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
P
Q
 
S
V
 
L
A
 
K
N
 
A
N
 
K
R
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
A
G
 
I
S
 
I
S
|
S
S
|
S
I
 
L
T
x
S
T
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
K
R
|
R
R
 
Q
K
 
Q
T
 
E
V
 
I
D
 
A
F
 
F
T
 
S
N
 
D
G
 
K
Y
 
L
D
 
Y
F
 
A
G
 
A
Y
 
D
F
 
S
S
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
S
S
 
P
I
 
I
K
 
Q
G
 
P
F
 
T
A
 
L
N
 
E
L
 
S
S
 
L
K
 
K
S
 
G
T
 
K
R
 
H
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
x
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
V
x
T
Q
 
Q
D
 
E
D
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Q
 
N
N
 
D
T
 
N
L
 
W
H
 
R
L
 
T
E
 
K
A
 
G
V
 
V
K
 
D
F
 
V
P
 
V
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
I
Y
 
Y
A
 
S
N
 
D
L
 
L
K
 
T
S
 
A
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
A
W
 
A
V
 
L
A
 
Q