SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_083763540.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_083763540.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
34% identity, 86% coverage: 26:292/311 of query aligns to 2:284/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
I
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
L
A
 
N
R
 
M
D
 
D
E
 
L
V
 
V
I
 
L
R
 
R
L
 
V
D
 
K
H
 
R
R
 
L
L
 
P
R
 
R
E
 
P
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
V
Q
 
L
G
 
G
A
 
E
P
 
D
P
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
A
H
 
R
A
 
L
G
 
G
H
 
G
E
 
K
V
 
V
S
 
R
L
 
M
V
 
L
A
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
F
A
 
G
D
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
S
E
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
A
P
 
W
V
 
V
T
 
L
R
 
E
I
 
T
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
G
H
 
T
S
 
G
L
 
F
V
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
N
T
 
Q
I
 
I
V
 
A
N
 
V
L
 
A
T
 
P
R
 
G
A
 
A
R
 
N
E
 
A
S
 
R
R
 
L
P
 
V
P
 
P
R
 
E
R
 
D
L
 
L
L
 
P
D
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
F
D
 
Q
C
 
G
V
 
V
-
 
G
Y
 
V
V
 
V
R
 
L
S
 
L
N
 
Q
G
 
L
Q
 
E
V
 
I
-
 
P
L
 
L
E
 
E
D
 
T
L
 
V
L
 
V
R
 
R
E
 
A
K
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
K
A
 
A
L
 
G
C
 
A
P
 
R
I
 
I
I
 
L
A
 
L
Q
 
N
I
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
A
E
 
H
D
 
A
G
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
P
A
 
S
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
Q
G
 
S
S
 
V
H
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
V
G
x
N
D
 
E
L
 
V
D
 
E
A
 
A
D
 
A
L
 
Q
L
 
L
S
 
T
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
R
N
 
T
P
 
P
L
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
G
 
G
D
 
R
I
 
A
L
 
P
R
 
Q
-
 
A
W
 
Q
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
|
T
H
 
L
G
|
G
E
x
A
E
 
Q
G
|
G
A
 
A
E
 
V
A
 
W
F
 
S
G
 
G
V
 
T
D
 
E
G
 
E
R
 
S
R
 
H
L
 
F
R
 
P
A
 
A
T
 
F
A
 
-
P
 
-
D
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
|
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
F
|
F
A
 
A
A
 
G
G
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
E
G
 
G
L
 
Q
D
 
N
M
 
M
E
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
R
L
 
F
A
 
A
V
x
N
G
 
A
W
 
A
G
|
G
A
|
A
A
 
L
K
x
A
V
x
T
T
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
S
 
A

Sites not aligning to the query:

6znxC Ribokinase from thermus species
34% identity, 86% coverage: 26:292/311 of query aligns to 2:249/265 of 6znxC

query
sites
6znxC
I
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
L
A
 
N
R
 
M
D
 
D
E
 
L
V
 
V
I
 
L
R
 
R
L
 
E
D
 
D
H
 
Y
R
 
Q
L
 
T
R
 
H
E
 
P
G
 
G
A
 
-
H
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
A
H
 
R
A
 
L
G
 
G
H
 
G
E
 
K
V
 
V
S
 
R
L
 
M
V
 
L
A
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
F
A
 
G
D
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
S
E
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
A
P
 
W
V
 
V
T
 
L
R
 
E
I
 
T
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
G
H
 
T
S
 
A
L
 
F
V
 
V
L
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
N
T
 
Q
I
 
I
V
 
A
N
 
V
L
 
A
T
 
P
R
 
G
A
 
A
R
 
N
E
 
A
S
 
R
R
 
L
P
 
V
P
 
P
R
 
E
R
 
D
L
 
L
L
 
P
D
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
F
D
 
Q
C
 
G
V
 
V
-
 
G
Y
 
V
V
 
V
R
 
L
S
 
L
N
 
Q
G
 
L
Q
 
E
V
 
I
-
 
P
L
 
L
E
 
E
D
 
T
L
 
V
L
 
V
R
 
R
E
 
A
K
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
K
A
 
A
L
 
G
C
 
A
P
 
R
I
 
I
I
 
L
A
 
L
Q
 
N
I
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
A
E
 
H
D
 
A
G
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
P
A
 
S
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
-
G
 
-
S
 
Q
H
 
S
G
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
L
S
 
V
N
|
N
P
 
E
L
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
R
D
 
Q
I
 
L
L
 
R
R
 
G
W
 
A
V
 
Q
V
 
V
I
 
V
T
 
L
H
x
L
G
|
G
E
 
A
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
V
A
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
W
D
 
S
G
 
G
R
 
E
R
 
E
L
 
S
R
 
H
A
 
F
T
 
P
A
 
A
P
 
F
D
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
F
|
F
A
 
A
A
 
G
G
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
E
G
 
G
L
 
Q
D
 
N
M
 
M
E
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
R
L
 
F
A
 
A
V
x
N
G
 
A
W
 
A
G
|
G
A
|
A
A
 
L
K
 
A
V
x
T
T
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
S
 
A

6a8cA Ribokinase from leishmania donovani with adp (see paper)
27% identity, 87% coverage: 26:295/311 of query aligns to 16:315/327 of 6a8cA

query
sites
6a8cA
I
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
C
A
 
F
R
 
L
D
|
D
E
 
Y
V
 
V
I
 
G
R
 
Y
L
 
V
D
 
D
H
 
H
R
 
M
L
 
P
R
 
Q
E
 
V
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
M
Q
 
H
G
x
S
A
 
V
P
x
S
P
 
F
L
 
H
A
 
K
R
 
G
L
 
F
G
|
G
G
|
G
G
 
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
A
T
 
G
H
 
R
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
K
V
 
V
S
 
A
L
 
M
V
 
V
A
 
S
A
 
M
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
P
 
G
L
 
D
A
 
G
D
 
S
E
 
D
L
 
Y
L
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
E
R
 
R
H
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
T
G
 
A
P
 
Y
V
 
M
T
 
F
R
 
R
I
 
T
S
 
G
G
 
K
P
 
S
S
 
S
T
 
T
H
 
G
-
 
L
S
 
A
L
 
M
V
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
D
P
 
T
E
 
K
G
 
S
E
 
S
R
 
N
T
 
N
I
 
E
V
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
H
-
 
F
-
 
T
-
 
P
N
 
E
L
 
L
T
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
Q
E
 
T
S
 
N
R
 
N
P
 
Y
P
 
E
R
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
Y
-
 
L
-
 
I
-
 
C
-
 
Q
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
P
L
 
L
D
 
P
L
 
T
A
 
T
A
 
L
D
 
D
C
 
T
V
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
A
Y
 
H
V
 
S
R
 
R
S
 
G
N
 
V
G
 
Y
Q
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
N
D
 
S
L
 
A
L
 
P
R
 
A
E
 
P
K
 
K
A
 
P
A
 
A
L
 
E
C
 
V
P
 
E
I
 
Q
I
 
I
A
 
K
Q
 
P
I
 
F
R
 
L
P
 
P
L
 
Y
E
 
V
D
 
S
G
 
L
L
 
F
L
 
C
P
 
P
A
 
N
Q
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
T
L
 
L
V
 
I
G
 
T
S
 
G
H
 
V
G
 
K
D
 
V
L
 
T
D
 
D
A
 
T
D
 
E
L
 
S
L
 
A
S
 
F
N
 
S
P
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
L
R
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
V
R
 
R
W
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
L
G
|
G
-
x
A
-
 
A
-
 
G
-
 
F
-
 
V
-
 
L
-
 
S
E
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
P
F
 
V
G
 
H
V
 
V
D
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
H
L
 
V
R
 
K
A
 
A
T
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
A
 
C
F
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
M
A
 
V
H
 
Y
A
 
F
L
 
M
A
 
S
L
 
R
G
 
G
L
 
R
D
 
N
M
 
L
E
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
C
P
 
K
L
 
R
A
 
A
V
x
N
G
 
E
W
 
C
G
x
A
A
 
A
A
 
I
K
 
S
V
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
Q
L
 
L
D
 
S

6a8bA Ribokinase from leishmania donovani with amppcp (see paper)
27% identity, 87% coverage: 26:295/311 of query aligns to 16:315/327 of 6a8bA

query
sites
6a8bA
I
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
C
A
 
F
R
 
L
D
|
D
E
 
Y
V
 
V
I
 
G
R
 
Y
L
 
V
D
 
D
H
 
H
R
 
M
L
 
P
R
 
Q
E
 
V
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
M
Q
 
H
G
 
S
A
 
V
P
 
S
P
 
F
L
 
H
A
 
K
R
 
G
L
 
F
G
|
G
G
|
G
G
 
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
A
T
 
G
H
 
R
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
K
V
 
V
S
 
A
L
 
M
V
 
V
A
 
S
A
 
M
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
P
 
G
L
 
D
A
 
G
D
 
S
E
 
D
L
 
Y
L
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
E
R
 
R
H
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
T
G
 
A
P
 
Y
V
 
M
T
 
F
R
 
R
I
 
T
S
 
G
G
 
K
P
 
S
S
 
S
T
 
T
H
 
G
-
 
L
S
 
A
L
 
M
V
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
D
P
 
T
E
 
K
G
 
S
E
 
S
R
 
N
T
 
N
I
 
E
V
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
H
-
 
F
-
 
T
-
 
P
N
 
E
L
 
L
T
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
Q
E
 
T
S
 
N
R
 
N
P
 
Y
P
 
E
R
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
Y
-
 
L
-
 
I
-
 
C
-
 
Q
-
x
N
-
 
E
-
x
I
-
 
P
L
 
L
D
 
P
L
 
T
A
 
T
A
 
L
D
 
D
C
 
T
V
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
A
Y
 
H
V
 
S
R
 
R
S
 
G
N
 
V
G
 
Y
Q
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
N
D
 
S
L
 
A
L
 
P
R
 
A
E
 
P
K
 
K
A
 
P
A
 
A
L
x
E
C
 
V
P
 
E
I
 
Q
I
 
I
A
 
K
Q
 
P
I
 
F
R
 
L
P
 
P
L
 
Y
E
 
V
D
 
S
G
 
L
L
 
F
L
 
C
P
 
P
A
 
N
Q
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
T
L
 
L
V
 
I
G
 
T
S
 
G
H
 
V
G
 
K
D
 
V
L
 
T
D
 
D
A
 
T
D
 
E
L
 
S
L
 
A
S
 
F
N
 
S
P
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
L
R
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
V
R
 
R
W
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
L
G
|
G
-
x
A
-
 
A
-
 
G
-
 
F
-
 
V
-
 
L
-
 
S
E
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
P
F
 
V
G
 
H
V
 
V
D
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
H
L
 
V
R
 
K
A
 
A
T
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
A
 
C
F
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
M
A
 
V
H
 
Y
A
 
F
L
 
M
A
 
S
L
 
R
G
 
G
L
 
R
D
 
N
M
 
L
E
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
C
P
 
K
L
 
R
A
 
A
V
x
N
G
 
E
W
 
C
G
x
A
A
 
A
A
 
I
K
 
S
V
|
V
T
 
T
R
 
R
P
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
Q
L
 
L
D
 
S

6a8aA Ribokinase from leishmania donovani with atp (see paper)
27% identity, 87% coverage: 26:295/311 of query aligns to 16:315/327 of 6a8aA

query
sites
6a8aA
I
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
C
A
 
F
R
 
L
D
|
D
E
 
Y
V
 
V
I
 
G
R
 
Y
L
 
V
D
 
D
H
 
H
R
 
M
L
 
P
R
 
Q
E
 
V
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
M
Q
 
H
G
 
S
A
 
V
P
 
S
P
 
F
L
 
H
A
 
K
R
 
G
L
 
F
G
|
G
G
|
G
G
 
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
A
T
 
G
H
 
R
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
K
V
 
V
S
 
A
L
 
M
V
 
V
A
 
S
A
 
M
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
P
 
G
L
 
D
A
 
G
D
 
S
E
 
D
L
 
Y
L
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
E
R
 
R
H
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
T
G
 
A
P
 
Y
V
 
M
T
 
F
R
 
R
I
 
T
S
 
G
G
 
K
P
 
S
S
 
S
T
 
T
H
 
G
-
 
L
S
 
A
L
 
M
V
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
D
P
 
T
E
 
K
G
 
S
E
 
S
R
 
N
T
 
N
I
 
E
V
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
H
-
 
F
-
 
T
-
 
P
N
 
E
L
 
L
T
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
Q
E
 
T
S
 
N
R
 
N
P
 
Y
P
 
E
R
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
Y
-
 
L
-
 
I
-
 
C
-
 
Q
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
P
L
 
L
D
 
P
L
 
T
A
 
T
A
 
L
D
 
D
C
 
T
V
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
A
Y
 
H
V
 
S
R
 
R
S
 
G
N
 
V
G
 
Y
Q
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
N
D
 
S
L
 
A
L
 
P
R
 
A
E
 
P
K
 
K
A
 
P
A
 
A
L
 
E
C
 
V
P
 
E
I
 
Q
I
 
I
A
 
K
Q
 
P
I
 
F
R
 
L
P
 
P
L
 
Y
E
 
V
D
 
S
G
 
L
L
 
F
L
 
C
P
 
P
A
x
N
Q
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
T
L
 
L
V
 
I
G
 
T
S
 
G
H
 
V
G
 
K
D
 
V
L
 
T
D
 
D
A
 
T
D
 
E
L
 
S
L
 
A
S
 
F
N
 
S
P
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
L
R
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
V
R
 
R
W
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
|
T
H
 
L
G
|
G
-
x
A
-
 
A
-
x
G
-
 
F
-
 
V
-
 
L
-
 
S
E
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
P
F
 
V
G
 
H
V
 
V
D
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
H
L
 
V
R
 
K
A
 
A
T
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
A
 
C
F
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
M
A
 
V
H
 
Y
A
 
F
L
 
M
A
 
S
L
 
R
G
 
G
L
 
R
D
 
N
M
 
L
E
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
C
P
 
K
L
 
R
A
 
A
V
x
N
G
 
E
W
 
C
G
x
A
A
 
A
A
 
I
K
 
S
V
|
V
T
 
T
R
 
R
P
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
Q
L
 
L
D
 
S

P0A9J6 Ribokinase; RK; EC 2.7.1.15 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 77% coverage: 26:266/311 of query aligns to 7:265/309 of P0A9J6

query
sites
P0A9J6
I
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
x
N
R
x
A
D
|
D
E
 
H
V
 
I
I
 
L
R
 
N
L
 
L
D
 
Q
H
 
S
R
 
F
L
 
P
R
 
T
E
 
P
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
V
Q
 
T
G
 
G
A
 
N
P
 
H
P
 
Y
L
 
Q
A
 
V
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
|
G
G
x
K
G
|
G
A
|
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
A
T
 
G
H
 
R
A
 
S
G
 
G
H
 
A
E
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
C
V
 
T
G
 
G
T
 
D
D
 
D
P
 
S
L
 
I
A
 
G
D
 
E
E
 
S
L
 
V
L
 
R
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
T
H
 
D
G
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
T
 
S
R
 
V
I
 
I
S
 
K
G
 
G
P
 
E
S
 
S
T
 
T
H
 
G
-
 
V
S
 
A
L
 
L
V
 
I
L
 
F
L
 
V
D
 
N
P
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
N
T
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
L
V
 
V
N
 
E
L
 
A
T
 
Q
R
 
R
A
 
E
R
 
R
E
 
I
S
 
A
R
 
N
P
 
A
P
 
S
R
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
Q
L
 
L
A
x
E
A
 
S
D
 
P
C
 
L
V
 
E
Y
 
S
V
 
V
R
 
M
S
 
A
N
 
A
G
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
A
E
 
H
D
 
Q
L
 
-
L
 
N
R
 
K
E
 
T
K
 
I
A
 
V
A
 
A
L
 
L
C
 
N
P
 
P
I
 
-
I
 
-
A
 
A
Q
 
P
I
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
L
E
 
P
D
 
D
G
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
-
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
L
 
D
V
 
I
G
 
I
S
 
T
H
 
P
G
x
N
D
 
E
L
 
T
D
 
E
A
 
A
D
 
E
L
 
K
L
 
L
S
 
T
-
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
E
N
 
D
P
 
A
L
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
Q
 
V
L
 
L
A
 
H
G
 
E
D
 
K
I
 
G
L
 
I
R
 
R
W
 
T
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
|
T
H
x
L
G
|
G
E
x
S
E
x
R
G
|
G
A
 
V
E
 
W
A
 
A
F
 
-
G
 
S
V
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
E
R
 
G
L
 
Q
R
 
R
A
 
V
T
 
P
A
 
G
P
 
F
D
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
I
G
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
A
 
N
A
 
G
G
 
A
L
 
L
A
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1rk2A E. Coli ribokinase complexed with ribose and adp, solved in space group p212121 (see paper)
29% identity, 77% coverage: 26:266/311 of query aligns to 4:262/305 of 1rk2A

query
sites
1rk2A
I
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
x
N
R
 
A
D
|
D
E
 
H
V
 
I
I
 
L
R
 
N
L
 
L
D
 
Q
H
 
S
R
 
F
L
 
P
R
 
T
E
 
P
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
V
Q
 
T
G
 
G
A
 
N
P
 
H
P
 
Y
L
 
Q
A
 
V
R
 
A
L
 
F
G
|
G
G
|
G
G
x
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
A
T
 
G
H
 
R
A
 
S
G
 
G
H
 
A
E
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
C
V
 
T
G
 
G
T
 
D
D
 
D
P
 
S
L
 
I
A
 
G
D
 
E
E
 
S
L
 
V
L
 
R
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
T
H
 
D
G
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
T
 
S
R
 
V
I
 
I
S
 
K
G
 
G
P
 
E
S
 
S
T
 
T
H
 
G
-
 
V
S
 
A
L
 
L
V
 
I
L
 
F
L
 
V
D
 
N
P
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
N
T
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
L
V
 
V
N
 
E
L
 
A
T
 
Q
R
 
R
A
 
E
R
 
R
E
 
I
S
 
A
R
 
N
P
 
A
P
 
S
R
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
Q
L
 
L
A
x
E
A
 
S
D
 
P
C
 
L
V
 
E
Y
 
S
V
 
V
R
 
M
S
 
A
N
 
A
G
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
A
E
 
H
D
 
Q
L
 
-
L
 
N
R
 
K
E
 
T
K
 
I
A
 
V
A
 
A
L
 
L
C
 
N
P
 
P
I
 
-
I
 
-
A
 
A
Q
 
P
I
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
L
E
 
P
D
 
D
G
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
-
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
L
 
D
V
 
I
G
 
I
S
 
T
H
 
P
G
 
N
D
 
E
L
 
T
D
 
E
A
 
A
D
 
E
L
 
K
L
 
L
S
 
T
-
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
E
N
 
D
P
 
A
L
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
Q
 
V
L
 
L
A
 
H
G
 
E
D
 
K
I
x
G
L
 
I
R
|
R
W
 
T
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
|
T
H
 
L
G
|
G
E
x
S
E
 
R
G
 
G
A
 
V
E
 
W
A
 
A
F
 
-
G
 
S
V
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
E
R
 
G
L
 
Q
R
 
R
A
 
V
T
 
P
A
 
G
P
 
F
D
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
 
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
A
 
N
A
 
G
G
 
A
L
 
L
A
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1gqtB Activation of ribokinase by monovalent cations (see paper)
29% identity, 77% coverage: 26:266/311 of query aligns to 6:264/307 of 1gqtB

query
sites
1gqtB
I
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
x
N
R
 
A
D
|
D
E
 
H
V
 
I
I
 
L
R
 
N
L
 
L
D
 
Q
H
 
S
R
 
F
L
 
P
R
 
T
E
 
P
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
V
Q
 
T
G
 
G
A
 
N
P
 
H
P
 
Y
L
 
Q
A
 
V
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
|
G
G
 
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
A
T
 
G
H
 
R
A
 
S
G
 
G
H
 
A
E
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
C
V
 
T
G
 
G
T
 
D
D
 
D
P
 
S
L
 
I
A
 
G
D
 
E
E
 
S
L
 
V
L
 
R
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
T
H
 
D
G
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
T
 
S
R
 
V
I
 
I
S
 
K
G
 
G
P
 
E
S
 
S
T
 
T
H
 
G
-
 
V
S
 
A
L
 
L
V
 
I
L
 
F
L
 
V
D
 
N
P
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
N
T
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
L
V
 
V
N
 
E
L
 
A
T
 
Q
R
 
R
A
 
E
R
 
R
E
 
I
S
 
A
R
 
N
P
 
A
P
 
S
R
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
Q
L
 
L
A
x
E
A
 
S
D
 
P
C
 
L
V
 
E
Y
 
S
V
 
V
R
 
M
S
 
A
N
 
A
G
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
A
E
 
H
D
 
Q
L
 
-
L
 
N
R
 
K
E
 
T
K
 
I
A
 
V
A
 
A
L
 
L
C
 
N
P
 
P
I
 
-
I
 
-
A
 
A
Q
 
P
I
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
L
E
 
P
D
 
D
G
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
-
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
L
 
D
V
 
I
G
 
I
S
 
T
H
 
P
G
x
N
D
 
E
L
 
T
D
 
E
A
 
A
D
 
E
L
 
K
L
 
L
S
 
T
-
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
E
N
 
D
P
 
A
L
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
Q
 
V
L
 
L
A
 
H
G
 
E
D
 
K
I
 
G
L
 
I
R
 
R
W
 
T
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
|
T
H
 
L
G
|
G
E
x
S
E
 
R
G
 
G
A
 
V
E
 
W
A
 
A
F
 
-
G
 
S
V
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
E
R
 
G
L
 
Q
R
 
R
A
 
V
T
 
P
A
 
G
P
 
F
D
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
x
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
A
 
N
A
 
G
G
 
A
L
 
L
A
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6ilsB Structure of arabidopsis thaliana ribokinase complexed with ribose and atp (see paper)
26% identity, 90% coverage: 26:304/311 of query aligns to 5:310/313 of 6ilsB

query
sites
6ilsB
I
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
A
A
x
N
R
 
A
D
|
D
E
 
I
V
 
Y
I
 
V
R
 
E
L
 
I
D
 
E
H
 
R
R
 
L
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
I
Q
 
S
G
 
A
A
 
K
P
 
T
P
 
G
L
 
Q
A
 
T
R
 
L
L
 
A
G
 
G
G
|
G
G
x
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
A
A
 
C
L
 
G
T
 
A
H
 
K
A
 
L
G
 
M
H
 
Y
E
 
P
V
 
T
S
 
Y
L
 
F
V
 
V
A
 
G
A
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
E
D
 
D
P
 
A
L
 
H
A
 
G
D
 
-
E
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
L
R
 
G
H
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
C
G
 
G
V
 
V
D
 
H
I
 
L
G
 
D
P
 
Y
V
 
V
T
 
R
R
 
S
I
 
V
S
 
N
G
 
N
-
 
E
P
 
P
S
 
T
T
 
G
H
 
H
S
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
M
L
 
L
D
 
Q
P
 
S
E
 
D
G
 
G
E
 
Q
R
 
N
T
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
I
L
 
V
T
 
G
R
 
G
A
 
A
R
 
N
E
 
M
S
 
K
R
 
A
P
 
W
P
 
P
R
 
E
R
 
I
L
 
M
L
 
S
D
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
D
D
 
D
C
 
L
V
 
E
Y
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
|
E
-
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
I
-
 
N
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
V
K
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
G
C
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
I
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
D
R
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
P
D
 
N
G
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
D
A
 
S
Q
 
I
V
 
D
L
 
I
V
 
L
G
 
S
S
 
P
H
x
N
G
 
E
D
 
T
L
 
E
D
 
L
A
 
S
D
 
R
L
 
L
L
 
T
S
 
G
N
 
M
P
 
P
L
 
T
E
 
E
A
 
T
G
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
I
A
 
S
G
 
Q
D
 
A
I
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
C
-
 
H
-
 
K
-
 
L
-
 
G
L
 
V
R
 
K
W
 
Q
V
 
V
V
 
L
I
 
V
T
x
K
H
 
L
G
|
G
E
 
S
E
 
K
G
 
G
A
 
S
E
 
A
A
 
L
F
 
F
G
 
-
V
 
I
D
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
K
-
 
P
-
 
I
L
 
Q
R
 
Q
A
 
S
T
 
I
A
x
I
P
 
P
D
x
A
V
 
A
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
A
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
F
A
 
A
H
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
V
L
 
E
G
 
G
L
 
K
D
 
S
M
 
H
E
 
E
R
 
E
A
 
C
L
 
L
P
 
R
L
 
F
A
 
A
V
 
A
G
 
A
W
 
A
G
x
A
A
x
S
A
 
L
K
 
C
V
 
V
T
 
Q
R
 
V
P
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
P
S
 
S
F
 
M
L
 
P
D
 
D
R
 
R
E
 
K
T
 
S
V
 
V
R
 
L
E
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
K

A1A6H3 Ribokinase; AtRBSK; RK; EC 2.7.1.15 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
26% identity, 90% coverage: 26:304/311 of query aligns to 71:376/379 of A1A6H3

query
sites
A1A6H3
I
x
L
V
|
V
V
|
V
L
x
V
G
 
G
S
 
S
V
 
A
A
 
N
R
 
A
D
 
D
E
 
I
V
 
Y
I
 
V
R
 
E
L
 
I
D
 
E
H
 
R
R
 
L
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
E
H
 
T
L
 
I
Q
 
S
G
 
A
A
 
K
P
 
T
P
 
G
L
 
Q
A
 
T
R
 
L
L
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
A
A
 
C
L
 
G
T
 
A
H
 
K
A
 
L
G
 
M
H
 
Y
E
 
P
V
 
T
S
 
Y
L
 
F
V
 
V
A
 
G
A
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
E
D
 
D
P
 
A
L
 
H
A
 
G
D
 
-
E
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
L
R
 
G
H
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
C
G
 
G
V
 
V
D
 
H
I
 
L
G
 
D
P
 
Y
V
 
V
T
 
R
R
 
S
I
 
V
S
 
N
G
 
N
-
 
E
P
 
P
S
 
T
T
 
G
H
 
H
S
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
M
L
 
L
D
 
Q
P
 
S
E
 
D
G
 
G
E
 
Q
R
 
N
T
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
I
L
 
V
T
 
G
R
 
G
A
 
A
R
 
N
E
 
M
S
 
K
R
 
A
P
 
W
P
 
P
R
 
E
R
 
I
L
 
M
L
 
S
D
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
D
D
 
D
C
 
L
V
 
E
Y
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
I
-
 
N
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
V
K
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
G
C
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
I
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
D
R
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
P
D
 
N
G
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
D
A
 
S
Q
 
I
V
 
D
L
 
I
V
 
L
G
 
S
S
 
P
H
 
N
G
 
E
D
 
T
L
 
E
D
 
L
A
 
S
D
 
R
L
 
L
L
 
T
S
 
G
N
 
M
P
 
P
L
 
T
E
 
E
A
 
T
G
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
I
A
 
S
G
 
Q
D
 
A
I
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
C
-
 
H
-
 
K
-
 
L
-
 
G
L
 
V
R
 
K
W
 
Q
V
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
K
H
 
L
G
 
G
E
 
S
E
 
K
G
 
G
A
 
S
E
 
A
A
 
L
F
 
F
G
 
-
V
 
I
D
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
K
-
 
P
-
 
I
L
 
Q
R
 
Q
A
 
S
T
 
I
A
 
I
P
 
P
D
 
A
V
 
A
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
T
F
 
F
A
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
F
A
 
A
H
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
V
L
 
E
G
 
G
L
 
K
D
 
S
M
 
H
E
 
E
R
 
E
A
 
C
L
 
L
P
 
R
L
 
F
A
 
A
V
 
A
G
 
A
W
 
A
G
 
A
A
 
S
A
 
L
K
 
C
V
 
V
T
 
Q
R
 
V
P
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
P
S
 
S
F
 
M
L
 
P
D
 
D
R
 
R
E
 
K
T
 
S
V
 
V
R
 
L
E
 
K
I
 
L
L
 
L
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3ikhA Crystal structure of ribokinase in complex with atp and glycerol in the active site from klebsiella pneumoniae
26% identity, 79% coverage: 25:270/311 of query aligns to 3:248/286 of 3ikhA

query
sites
3ikhA
R
 
R
I
 
V
V
 
Y
V
 
V
L
 
T
G
 
G
S
 
N
V
 
I
A
 
T
R
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
T
I
 
W
R
 
S
L
 
I
D
 
P
H
 
D
R
 
I
L
 
P
R
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
S
L
 
I
Q
 
H
G
 
G
A
 
V
P
 
K
P
 
V
L
 
S
A
 
Q
R
 
D
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
I
L
 
L
T
 
S
H
 
R
A
 
C
G
 
G
H
 
I
E
 
E
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
N
D
 
D
P
 
S
L
 
N
A
 
G
D
 
A
E
 
W
L
 
I
L
 
R
A
 
Q
E
 
Q
L
 
I
A
 
K
R
 
N
H
 
E
G
 
P
V
 
L
D
 
M
I
 
L
G
 
L
P
 
P
V
 
D
T
 
G
R
 
H
I
 
F
S
 
N
G
 
Q
P
 
H
S
 
S
T
 
D
H
 
T
S
 
S
L
 
I
V
 
I
L
 
L
L
 
N
D
 
S
P
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
D
R
 
N
T
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
T
T
 
T
R
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
S
 
T
R
 
F
P
 
S
P
 
L
R
 
D
R
 
E
L
 
M
L
 
I
D
 
P
L
 
H
A
 
M
A
 
A
D
 
D
C
 
A
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
A
R
 
R
S
 
S
N
 
R
G
 
G
Q
 
M
V
 
T
L
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
T
L
 
V
R
 
F
E
 
N
K
 
P
A
 
S
A
 
P
L
 
V
C
 
N
P
 
P
I
 
D
I
 
F
A
 
C
Q
 
H
I
 
L
R
 
W
P
 
P
L
 
L
E
 
I
D
 
D
G
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
I
G
 
A
S
 
V
H
 
V
G
x
N
D
 
E
L
 
S
D
 
E
A
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
Q
L
 
P
A
 
Y
G
 
G
D
 
-
I
 
-
L
 
V
R
 
K
W
 
T
V
 
L
V
 
V
I
 
I
T
|
T
H
 
Q
G
|
G
E
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
W
A
 
L
F
 
V
G
 
Q
V
 
-
D
 
E
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
L
 
Q
R
 
F
A
 
C
T
 
P
A
 
A
P
 
V
D
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
L
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
-
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
M
L
 
L
A
 
A
H
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
L
L
 
R
G
 
G
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3i3yD Crystal structure of ribokinase in complex with d-ribose from klebsiella pneumoniae
26% identity, 79% coverage: 25:270/311 of query aligns to 2:247/285 of 3i3yD

query
sites
3i3yD
R
 
R
I
 
V
V
 
Y
V
 
V
L
 
T
G
 
G
S
 
N
V
 
I
A
 
T
R
 
V
D
|
D
E
 
E
V
 
T
I
 
W
R
 
S
L
 
I
D
 
P
H
 
D
R
 
I
L
 
P
R
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
S
L
 
I
Q
 
H
G
 
G
A
 
V
P
 
K
P
 
V
L
 
S
A
 
Q
R
 
D
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
x
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
I
L
 
L
T
 
S
H
 
R
A
 
C
G
 
G
H
 
I
E
 
E
V
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
N
D
 
D
P
 
S
L
 
N
A
 
G
D
 
A
E
 
W
L
 
I
L
 
R
A
 
Q
E
 
Q
L
 
I
A
 
K
R
 
N
H
 
E
G
 
P
V
 
L
D
 
M
I
 
L
G
 
L
P
 
P
V
 
D
T
 
G
R
 
H
I
 
F
S
 
N
G
 
Q
P
 
H
S
 
S
T
 
D
H
 
T
S
|
S
L
 
I
V
 
I
L
 
L
L
 
N
D
 
S
P
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
D
R
 
N
T
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
T
T
 
T
R
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
S
 
T
R
 
F
P
 
S
P
 
L
R
 
D
R
 
E
L
 
M
L
 
I
D
 
P
L
 
H
A
 
M
A
 
A
D
 
D
C
 
A
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
A
R
 
R
S
 
S
N
 
R
G
 
G
Q
 
M
V
 
T
L
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
T
L
 
V
R
 
F
E
 
N
K
 
P
A
 
S
A
 
P
L
 
V
C
 
N
P
 
P
I
 
D
I
 
F
A
 
C
Q
 
H
I
 
L
R
 
W
P
 
P
L
 
L
E
 
I
D
 
D
G
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
I
G
 
A
S
 
V
H
 
V
G
 
N
D
 
E
L
 
S
D
 
E
A
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
Q
L
 
P
A
 
Y
G
 
G
D
 
-
I
 
-
L
 
V
R
 
K
W
 
T
V
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
Q
G
 
G
E
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
W
A
 
L
F
 
V
G
 
Q
V
 
-
D
 
E
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
L
 
Q
R
 
F
A
 
C
T
 
P
A
 
A
P
 
V
D
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
L
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
-
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
M
L
 
L
A
 
A
H
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
L
L
 
R
G
 
G
L
 
V

7aghA Crystal structure of sf kinase yihv from e. Coli in complex with amppnp-mg (see paper)
27% identity, 70% coverage: 74:291/311 of query aligns to 52:277/295 of 7aghA

query
sites
7aghA
G
 
G
H
 
A
E
 
Q
V
 
V
S
 
D
L
 
F
V
 
I
A
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
D
D
 
D
P
 
D
L
 
T
A
 
G
D
 
N
E
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
E
R
 
S
H
 
W
G
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
T
G
 
R
P
 
Y
V
 
T
T
 
K
R
 
R
I
 
Y
S
 
N
-
 
Q
G
 
A
P
 
K
S
 
S
T
 
S
H
 
Q
S
 
S
L
 
A
V
 
I
L
 
M
L
 
V
D
 
D
P
 
T
E
 
K
G
 
G
E
 
E
R
|
R
T
 
I
I
 
I
V
 
I
N
 
N
-
 
Y
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
Q
-
 
W
-
 
D
-
 
V
-
 
V
L
 
L
T
 
A
R
 
D
A
 
V
R
 
R
E
 
W
S
 
H
R
 
D
P
 
G
P
 
A
R
 
K
R
 
K
L
 
A
L
 
F
D
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
R
D
 
Q
C
 
A
-
 
G
V
 
V
Y
 
M
V
 
T
R
 
V
S
 
L
N
 
D
G
 
G
Q
 
D
V
 
I
L
 
T
E
 
P
D
 
Q
L
 
D
L
 
I
R
 
S
E
 
E
K
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
C
 
S
-
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
S
-
 
E
P
 
P
I
 
G
I
 
L
A
 
A
Q
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
E
L
 
M
E
 
A
D
 
S
G
 
A
L
 
L
L
 
K
P
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
V
 
T
G
 
N
S
 
G
H
 
H
G
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
R
 
-
W
 
-
V
 
V
V
 
Y
I
 
V
T
|
T
H
 
Q
G
|
G
E
 
S
E
 
A
G
|
G
A
 
C
E
 
D
A
 
W
F
 
-
G
 
-
V
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
Q
L
 
-
R
 
H
A
 
Q
T
 
P
A
 
A
P
 
F
D
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
A
 
V
F
 
F
A
 
H
A
 
G
G
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
S
L
 
G
D
 
D
M
 
L
E
 
A
R
 
E
A
 
S
L
 
V
P
 
R
L
 
F
A
 
A
V
x
S
G
 
G
W
 
V
G
x
A
A
 
A
A
 
L
K
 
K
V
 
C
T
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G

8ug3A Crystal structure of khk-c and compound 23 (see paper)
27% identity, 81% coverage: 24:276/311 of query aligns to 4:278/298 of 8ug3A

query
sites
8ug3A
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
V
 
L
V
 
C
L
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
L
D
 
D
E
 
V
V
 
I
I
 
S
R
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
K
R
 
Y
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
D
A
 
S
H
 
E
L
 
I
Q
 
R
G
 
C
A
 
L
P
 
S
P
 
Q
L
 
R
A
 
W
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
N
G
 
A
A
 
S
N
 
N
T
 
S
A
 
C
I
 
T
A
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
P
V
 
C
S
 
A
L
 
F
V
 
M
A
 
G
A
 
S
V
 
M
G
 
A
T
 
P
D
 
G
P
 
H
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
F
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
R
R
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
S
P
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
W
I
 
Q
S
 
S
G
 
K
P
 
G
S
 
D
T
 
T
H
 
P
S
 
S
-
 
S
-
 
C
L
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
N
D
 
N
P
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
N
R
|
R
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
D
L
 
T
T
 
S
R
 
L
A
 
P
R
 
D
E
 
V
S
 
S
R
 
A
P
 
T
P
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
-
 
F
D
 
K
C
 
W
V
 
I
Y
 
H
V
 
I
-
 
E
-
 
G
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
S
Q
 
E
V
 
Q
L
 
V
E
 
K
D
 
M
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
I
K
 
D
A
 
A
-
 
H
-
 
N
A
 
T
L
 
R
C
 
Q
P
 
P
I
 
P
I
 
E
A
 
Q
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
P
 
V
L
 
S
E
 
V
D
 
E
G
 
V
L
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
F
G
 
Q
S
 
L
H
 
F
G
 
G
D
 
Y
L
 
G
D
 
D
A
 
V
D
 
V
L
 
F
L
 
V
S
 
S
N
 
K
P
x
D
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
V
L
 
R
R
 
K
W
 
G
V
 
A
V
 
V
I
 
L
T
 
V
-
 
C
-
x
A
H
 
W
G
x
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
L
L
 
L
R
 
H
A
 
S
T
 
D
A
 
A
-
 
F
P
|
P
D
 
P
V
 
P
E
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
T
F
 
F
A
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
V
A
 
I
H
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
D
 
S
M
 
V
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8omkA Hkhk-c in complex with adp & fructose 1-phosphate
27% identity, 81% coverage: 24:276/311 of query aligns to 4:278/298 of 8omkA

query
sites
8omkA
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
V
 
L
V
 
C
L
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
L
D
|
D
E
 
V
V
 
I
I
 
S
R
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
K
R
 
Y
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
D
A
 
S
H
 
E
L
 
I
Q
 
R
G
 
C
A
 
L
P
 
S
P
 
Q
L
 
R
A
 
W
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
|
G
G
x
N
G
 
A
A
 
S
N
|
N
T
 
S
A
 
C
I
 
T
A
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
P
V
 
C
S
 
A
L
 
F
V
 
M
A
 
G
A
 
S
V
 
M
G
 
A
T
 
P
D
 
G
P
 
H
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
F
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
R
R
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
S
P
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
W
I
 
Q
S
 
S
G
 
K
P
 
G
S
 
D
T
 
T
H
 
P
S
 
S
-
 
S
-
 
C
L
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
N
D
 
N
P
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
N
R
|
R
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
x
L
-
 
H
N
 
D
L
 
T
T
 
S
R
 
L
A
 
P
R
 
D
E
 
V
S
 
S
R
 
A
P
 
T
P
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
-
 
F
D
 
K
C
 
W
V
 
I
Y
 
H
V
 
I
-
 
E
-
 
G
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
S
Q
 
E
V
 
Q
L
 
V
E
 
K
D
 
M
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
I
K
 
D
A
 
A
-
 
H
-
 
N
A
 
T
L
 
R
C
 
Q
P
 
P
I
 
P
I
 
E
A
 
Q
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
P
 
V
L
 
S
E
 
V
D
 
E
G
 
V
L
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
F
G
 
Q
S
 
L
H
 
F
G
 
G
D
 
Y
L
 
G
D
 
D
A
 
V
D
 
V
L
 
F
L
 
V
S
 
S
N
 
K
P
 
D
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
V
L
 
R
R
 
K
W
 
G
V
 
A
V
 
V
I
 
L
T
 
V
-
 
C
-
x
A
H
 
W
G
x
A
E
 
E
E
 
E
G
|
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
L
L
 
L
R
 
H
A
 
S
T
 
D
A
 
A
-
 
F
P
|
P
D
 
P
V
 
P
E
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
A
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
V
A
 
I
H
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
D
 
S
M
 
V
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8ug1B Crystal structure of khk-c and compound 13 (see paper)
27% identity, 81% coverage: 24:276/311 of query aligns to 11:285/305 of 8ug1B

query
sites
8ug1B
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
V
 
L
V
 
C
L
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
L
D
 
D
E
 
V
V
 
I
I
 
S
R
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
K
R
 
Y
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
D
A
 
S
H
 
E
L
 
I
Q
 
R
G
 
C
A
 
L
P
 
S
P
 
Q
L
 
R
A
 
W
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
N
G
 
A
A
 
S
N
 
N
T
 
S
A
 
C
I
 
T
A
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
P
V
 
C
S
 
A
L
 
F
V
 
M
A
 
G
A
 
S
V
 
M
G
 
A
T
 
P
D
 
G
P
 
H
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
F
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
R
R
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
S
P
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
W
I
 
Q
S
 
S
G
 
K
P
 
G
S
 
D
T
 
T
H
 
P
S
 
S
-
 
S
-
 
C
L
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
N
D
 
N
P
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
N
R
 
R
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
D
L
 
T
T
 
S
R
 
L
A
 
P
R
 
D
E
 
V
S
 
S
R
 
A
P
 
T
P
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
-
 
F
D
 
K
C
 
W
V
 
I
Y
 
H
V
 
I
-
 
E
-
 
G
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
S
Q
 
E
V
 
Q
L
 
V
E
 
K
D
 
M
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
I
K
 
D
A
 
A
A
 
H
L
 
N
C
 
T
-
 
R
-
 
Q
P
 
P
I
 
P
I
 
E
A
 
Q
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
P
 
V
L
 
S
E
 
V
D
 
E
G
 
V
L
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
F
G
 
Q
S
 
L
H
 
F
G
 
G
D
 
Y
L
 
G
D
 
D
A
 
V
D
 
V
L
 
F
L
 
V
S
 
S
N
 
K
P
 
D
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
V
L
 
R
R
 
K
W
 
G
V
 
A
V
 
V
I
 
L
T
 
V
-
 
C
-
x
A
H
 
W
G
x
A
E
|
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
L
L
 
L
R
 
H
A
 
S
T
 
D
A
 
A
-
 
F
P
|
P
D
 
P
V
 
P
E
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
D
 
D
A
 
T
F
 
F
A
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
V
A
 
I
H
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
D
 
S
M
 
V
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3qa2A X-ray structure of ketohexokinase in complex with a pyrimidopyrimidine analog 2 (see paper)
27% identity, 81% coverage: 24:276/311 of query aligns to 3:277/297 of 3qa2A

query
sites
3qa2A
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
V
 
L
V
 
C
L
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
L
D
 
D
E
 
V
V
 
I
I
 
S
R
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
K
R
 
Y
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
D
A
 
S
H
 
E
L
 
I
Q
 
R
G
 
C
A
 
L
P
 
S
P
 
Q
L
 
R
A
 
W
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
N
G
 
A
A
 
S
N
 
N
T
 
S
A
 
C
I
 
T
A
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
P
V
 
C
S
 
A
L
 
F
V
 
M
A
 
G
A
 
S
V
 
M
G
 
A
T
 
P
D
 
G
P
 
H
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
F
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
R
R
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
S
P
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
W
I
 
Q
S
 
S
G
 
K
P
 
G
S
 
D
T
 
T
H
 
P
S
 
S
-
 
S
-
 
C
L
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
N
D
 
N
P
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
N
R
 
R
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
D
L
 
T
T
 
S
R
 
L
A
 
P
R
 
D
E
 
V
S
 
S
R
 
A
P
 
T
P
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
-
 
F
D
 
K
C
 
W
V
 
I
Y
 
H
V
 
I
-
 
E
-
 
G
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
S
Q
 
E
V
 
Q
L
 
V
E
 
K
D
 
M
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
I
K
 
D
A
 
A
-
 
H
-
 
N
A
 
T
L
 
R
C
 
Q
P
 
P
I
 
P
I
 
E
A
 
Q
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
P
 
V
L
 
S
E
 
V
D
 
E
G
 
V
L
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
F
G
 
Q
S
 
L
H
 
F
G
 
G
D
 
Y
L
 
G
D
 
D
A
 
V
D
 
V
L
 
F
L
 
V
S
 
S
N
 
K
P
 
D
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
V
L
 
R
R
 
K
W
 
G
V
 
A
V
 
V
I
 
L
T
 
V
-
 
C
-
x
A
H
 
W
G
x
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
L
L
 
L
R
 
H
A
 
S
T
 
D
A
 
A
-
 
F
P
|
P
D
 
P
V
 
P
E
 
R
V
|
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
A
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
V
A
 
I
H
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
D
 
S
M
 
V
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
L
 
L

8omfA Crystal structure of hkhk-c in complex with compound-4 (see paper)
27% identity, 81% coverage: 24:276/311 of query aligns to 2:276/296 of 8omfA

query
sites
8omfA
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
V
 
L
V
 
C
L
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
L
D
 
D
E
 
V
V
 
I
I
 
S
R
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
K
R
 
Y
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
D
A
 
S
H
 
E
L
 
I
Q
 
R
G
 
C
A
 
L
P
 
S
P
 
Q
L
 
R
A
 
W
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
N
G
 
A
A
 
S
N
 
N
T
 
S
A
 
C
I
 
T
A
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
P
V
 
C
S
 
A
L
 
F
V
 
M
A
 
G
A
 
S
V
 
M
G
 
A
T
 
P
D
 
G
P
 
H
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
F
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
R
R
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
S
P
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
W
I
 
Q
S
 
S
G
 
K
P
 
G
S
 
D
T
 
T
H
 
P
S
 
S
-
 
S
-
 
C
L
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
N
D
 
N
P
 
S
E
x
N
G
 
G
E
 
N
R
 
R
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
D
L
 
T
T
 
S
R
 
L
A
 
P
R
 
D
E
 
V
S
 
S
R
 
A
P
 
T
P
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
-
 
F
D
 
K
C
 
W
V
 
I
Y
 
H
V
 
I
-
 
E
-
 
G
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
S
Q
 
E
V
 
Q
L
 
V
E
 
K
D
 
M
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
I
K
 
D
A
 
A
-
 
H
-
 
N
A
 
T
L
 
R
C
 
Q
P
 
P
I
 
P
I
 
E
A
 
Q
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
P
 
V
L
 
S
E
 
V
D
 
E
G
 
V
L
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
F
G
 
Q
S
 
L
H
 
F
G
 
G
D
 
Y
L
 
G
D
 
D
A
 
V
D
 
V
L
 
F
L
 
V
S
 
S
N
 
K
P
 
D
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
V
L
 
R
R
 
K
W
 
G
V
 
A
V
 
V
I
 
L
T
 
V
-
 
C
-
 
A
H
 
W
G
x
A
E
|
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
L
L
 
L
R
 
H
A
 
S
T
 
D
A
 
A
-
 
F
P
 
P
D
 
P
V
 
P
E
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
T
F
|
F
A
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
V
A
 
I
H
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
D
 
S
M
 
V
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6w0zA Structure of khk in complex with compound 8 (2-[(1~{s},5~{r})-3-[2- [(2~{s})-2-methylazetidin-1-yl]-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-3- azabicyclo[3.1.0]hexan-6-yl]ethanoic acid) (see paper)
27% identity, 81% coverage: 24:276/311 of query aligns to 2:276/296 of 6w0zA

query
sites
6w0zA
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
V
 
L
V
 
C
L
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
L
D
 
D
E
 
V
V
 
I
I
 
S
R
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
K
R
 
Y
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
D
A
 
S
H
 
E
L
 
I
Q
 
R
G
 
C
A
 
L
P
 
S
P
 
Q
L
 
R
A
 
W
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
N
G
 
A
A
 
S
N
 
N
T
 
S
A
 
C
I
 
T
A
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
P
V
 
C
S
 
A
L
 
F
V
 
M
A
 
G
A
 
S
V
 
M
G
 
A
T
 
P
D
 
G
P
 
H
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
F
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
R
R
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
S
P
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
W
I
 
Q
S
 
S
G
 
K
P
 
G
S
 
D
T
 
T
H
 
P
S
 
S
-
 
S
-
 
C
L
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
N
D
 
N
P
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
N
R
|
R
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
D
L
 
T
T
 
S
R
 
L
A
 
P
R
 
D
E
 
V
S
 
S
R
 
A
P
 
T
P
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
-
 
F
D
 
K
C
 
W
V
 
I
Y
 
H
V
 
I
-
 
E
-
 
G
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
S
Q
 
E
V
 
Q
L
 
V
E
 
K
D
 
M
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
I
K
 
D
A
 
A
-
 
H
-
 
N
A
 
T
L
 
R
C
 
Q
P
 
P
I
 
P
I
 
E
A
 
Q
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
P
 
V
L
 
S
E
 
V
D
 
E
G
 
V
L
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
F
G
 
Q
S
 
L
H
 
F
G
 
G
D
 
Y
L
 
G
D
 
D
A
 
V
D
 
V
L
 
F
L
 
V
S
 
S
N
 
K
P
 
D
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
V
L
 
R
R
 
K
W
 
G
V
 
A
V
 
V
I
 
L
T
 
V
-
 
C
-
x
A
H
 
W
G
x
A
E
|
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
L
L
 
L
R
 
H
A
 
S
T
 
D
A
 
A
-
 
F
P
|
P
D
 
P
V
 
P
E
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
A
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
V
A
 
I
H
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
D
 
S
M
 
V
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6w0yA Structure of khk in complex with compound 6 (2-[(1~{r},5~{s})-3-[5- cyano-6-[(2~{s},3~{r})-2-methyl-3-oxidanyl-azetidin-1-yl]-4- (trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-6-yl]ethanoic acid) (see paper)
27% identity, 81% coverage: 24:276/311 of query aligns to 2:276/296 of 6w0yA

query
sites
6w0yA
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
V
 
L
V
 
C
L
 
V
G
 
G
S
 
L
V
 
V
A
 
V
R
 
L
D
 
D
E
 
V
V
 
I
I
 
S
R
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
K
R
 
Y
L
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
D
A
 
S
H
 
E
L
 
I
Q
 
R
G
 
C
A
 
L
P
 
S
P
 
Q
L
 
R
A
 
W
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
N
G
 
A
A
 
S
N
 
N
T
 
S
A
 
C
I
 
T
A
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
A
E
 
P
V
 
C
S
 
A
L
 
F
V
 
M
A
 
G
A
 
S
V
 
M
G
 
A
T
 
P
D
 
G
P
 
H
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
F
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
R
R
 
R
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
S
P
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
W
I
 
Q
S
 
S
G
 
K
P
 
G
S
 
D
T
 
T
H
 
P
S
 
S
-
 
S
-
 
C
L
 
C
V
 
I
L
 
I
L
 
N
D
 
N
P
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
N
R
|
R
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
L
-
 
H
N
 
D
L
 
T
T
 
S
R
 
L
A
 
P
R
 
D
E
 
V
S
 
S
R
 
A
P
 
T
P
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
-
 
F
D
 
K
C
 
W
V
 
I
Y
 
H
V
 
I
-
 
E
-
 
G
R
 
R
S
 
N
N
 
A
G
 
S
Q
 
E
V
 
Q
L
 
V
E
 
K
D
 
M
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
E
 
I
K
 
D
A
 
A
-
 
H
-
 
N
A
 
T
L
 
R
C
 
Q
P
 
P
I
 
P
I
 
E
A
 
Q
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
P
 
V
L
 
S
E
 
V
D
 
E
G
 
V
L
 
E
L
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
F
G
 
Q
S
 
L
H
 
F
G
 
G
D
 
Y
L
 
G
D
 
D
A
 
V
D
 
V
L
 
F
L
 
V
S
 
S
N
 
K
P
 
D
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
D
 
R
I
 
V
L
 
R
R
 
K
W
 
G
V
 
A
V
 
V
I
 
L
T
 
V
-
 
C
-
x
A
H
 
W
G
x
A
E
 
E
E
 
E
G
|
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
L
L
 
L
R
 
H
A
 
S
T
 
D
A
|
A
-
x
F
P
|
P
D
 
P
V
 
P
E
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
A
 
N
A
 
A
G
 
S
L
 
V
A
 
I
H
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
D
 
S
M
 
V
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_083763540.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_083763540.1
MTVIMASPGVWSYPEGRSREAVVARIVVLGSVARDEVIRLDHRLREGAHLQGAPPLARLG
GGGANTAIALTHAGHEVSLVAAVGTDPLADELLAELARHGVDIGPVTRISGPSTHSLVLL
DPEGERTIVNLTRARESRPPRRLLDLAADCVYVRSNGQVLEDLLREKAALCPIIAQIRPL
EDGLLPAQVLVGSHGDLDADLLSNPLEAGRQLAGDILRWVVITHGEEGAEAFGVDGRRLR
ATAPDVEVVDTTGAGDAFAAGLAHALALGLDMERALPLAVGWGAAKVTRPGSFLDRETVR
EILKSAPGPRL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory