SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084055927.1 NCBI__GCF_900176285.1:WP_084055927.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

5mzzB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with 3- methylglutaconate (see paper)
28% identity, 91% coverage: 12:264/279 of query aligns to 1:231/241 of 5mzzB

query
sites
5mzzB
E
 
D
Y
 
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
D
 
E
L
 
T
M
 
V
T
 
V
V
 
S
A
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
V
 
I
R
 
D
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
A
A
 
T
G
|
G
T
x
V
G
 
A
M
 
S
P
 
P
M
 
L
-
 
A
-
 
I
I
 
L
S
 
A
I
 
I
M
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
K
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
A
P
 
P
N
 
D
L
 
L
K
 
T
L
 
Y
I
 
L
F
 
A
E
 
C
A
 
V
G
 
G
T
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
P
R
 
E
-
 
I
P
 
P
R
 
T
E
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
S
S
 
S
V
 
-
G
 
E
D
 
D
P
 
L
R
 
G
C
 
Y
E
 
L
V
 
D
G
 
G
A
 
R
S
 
S
V
 
A
A
 
E
S
 
I
G
 
T
L
 
I
Y
 
P
E
 
D
A
 
L
F
 
F
S
 
D
I
 
H
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
R
V
 
V
D
 
D
L
 
T
G
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
G
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
E
 
A
Y
 
E
G
 
G
N
 
R
V
 
T
N
 
N
T
 
M
T
 
T
S
 
A
I
 
S
G
 
G
D
 
S
Y
 
L
L
 
D
N
 
K
P
 
P
L
 
R
L
 
T
R
 
K
L
 
F
T
 
P
G
 
G
S
 
V
G
x
A
G
|
G
N
 
A
P
 
A
D
 
T
I
 
L
N
 
R
S
 
Q
F
 
W
S
 
V
Q
 
R
R
 
R
T
 
P
V
 
V
Y
 
L
I
 
L
M
 
V
V
 
P
H
 
R
E
 
Q
K
 
S
R
 
R
R
 
R
-
 
N
-
 
L
F
 
V
P
 
P
K
 
E
-
 
V
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
Y
 
T
I
 
T
T
 
R
S
 
D
P
 
P
G
 
-
W
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
-
W
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
R
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
P
S
 
V
A
 
T
V
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
 
E
F
 
L
D
 
G
E
 
A
E
 
S
T
 
G
G
 
A
R
 
R
M
 
L
Y
 
L
L
 
A
E
 
R
T
 
-
C
 
-
H
 
H
P
 
P
G
 
W
K
 
A
T
 
S
P
 
A
E
 
A
E
 
H
I
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
R
C
 
T
E
 
G
F
 
F
D
 
A
L
 
F
D
 
Q
I
 
V
S
 
S
R
 
E
V
 
A
I
 
L
G
 
S
E
 
V
T
 
T
L
 
S
A
 
L
P
 
P
T
 
D
H
 
A
E
 
R
E
 
T
I
 
V
R
 
A
L
 
A
I
 
I
H
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
-
D
 
D
P
 
P

5mzxB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with 4'- diphospho pantetheine (see paper)
28% identity, 91% coverage: 12:264/279 of query aligns to 1:231/241 of 5mzxB

query
sites
5mzxB
E
 
D
Y
 
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
D
 
E
L
 
T
M
 
V
T
 
V
V
 
S
A
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
V
 
I
R
 
D
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
A
A
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
A
M
 
S
P
 
P
M
 
L
-
 
A
-
 
I
I
 
L
S
 
A
I
 
I
M
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
K
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
A
P
 
P
N
 
D
L
 
L
K
 
T
L
 
Y
I
 
L
F
 
A
E
 
C
A
 
V
G
 
G
T
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
P
R
 
E
-
 
I
P
 
P
R
 
T
E
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
S
S
 
S
V
 
-
G
 
E
D
 
D
P
 
L
R
 
G
C
 
Y
E
 
L
V
 
D
G
 
G
A
 
R
S
 
S
V
 
A
A
 
E
S
 
I
G
 
T
L
 
I
Y
 
P
E
 
D
A
 
L
F
 
F
S
 
D
I
 
H
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
R
V
 
V
D
 
D
L
 
T
G
 
V
F
 
F
L
x
F
G
|
G
G
x
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
E
 
A
Y
 
E
G
 
G
N
 
R
V
 
T
N
 
N
T
 
M
T
 
T
S
 
A
I
 
S
G
 
G
D
 
S
Y
 
L
L
 
D
N
 
K
P
 
P
L
 
R
L
 
T
R
 
K
L
 
F
T
x
P
G
 
G
S
 
V
G
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
T
I
 
L
N
 
R
S
 
Q
F
 
W
S
 
V
Q
 
R
R
 
R
T
 
P
V
 
V
Y
 
L
I
 
L
M
 
V
V
 
P
H
 
R
E
 
Q
K
 
S
R
 
R
R
 
R
-
 
N
-
 
L
F
 
V
P
 
P
K
 
E
-
 
V
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
Y
 
T
I
 
T
T
 
R
S
 
D
P
 
P
G
 
-
W
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
-
W
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
R
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
P
S
 
V
A
 
T
V
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
 
E
F
 
L
D
 
G
E
 
A
E
 
S
T
 
G
G
 
A
R
 
R
M
 
L
Y
 
L
L
 
A
E
 
R
T
 
-
C
 
-
H
 
H
P
 
P
G
 
W
K
 
A
T
 
S
P
 
A
E
 
A
E
 
H
I
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
R
C
 
T
E
 
G
F
 
F
D
 
A
L
 
F
D
 
Q
I
 
V
S
 
S
R
 
E
V
 
A
I
 
L
G
 
S
E
 
V
T
 
T
L
 
S
A
 
L
P
 
P
T
 
D
H
 
A
E
 
R
E
 
T
I
 
V
R
 
A
L
 
A
I
 
I
H
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
-
D
 
D
P
 
P

5mzyB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with a possible transition state analog (see paper)
28% identity, 91% coverage: 12:264/279 of query aligns to 4:234/244 of 5mzyB

query
sites
5mzyB
E
 
D
Y
 
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
D
 
E
L
 
T
M
 
V
T
 
V
V
 
S
A
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
V
 
I
R
 
D
D
 
D
H
 
G
E
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
A
A
 
T
G
|
G
T
x
V
G
 
A
M
 
S
P
 
P
M
 
L
-
 
A
-
 
I
I
 
L
S
 
A
I
 
I
M
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
K
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
A
P
 
P
N
 
D
L
 
L
K
 
T
L
 
Y
I
 
L
F
 
A
E
 
C
A
 
V
G
 
G
T
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
P
R
 
E
-
 
I
P
 
P
R
 
T
E
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
S
S
 
S
V
 
-
G
 
E
D
 
D
P
 
L
R
 
G
C
 
Y
E
 
L
V
 
D
G
 
G
A
 
R
S
 
S
V
 
A
A
 
E
S
 
I
G
 
T
L
 
I
Y
 
P
E
 
D
A
 
L
F
|
F
S
 
D
I
 
H
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
R
V
 
V
D
 
D
L
 
T
G
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
G
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
E
 
A
Y
 
E
G
 
G
N
 
R
V
 
T
N
 
N
T
 
M
T
 
T
S
 
A
I
 
S
G
 
G
D
 
S
Y
 
L
L
 
D
N
 
K
P
 
P
L
 
R
L
 
T
R
 
K
L
 
F
T
 
P
G
 
G
S
 
V
G
x
A
G
|
G
N
 
A
P
 
A
D
 
T
I
 
L
N
 
R
S
 
Q
F
 
W
S
 
V
Q
 
R
R
 
R
T
 
P
V
 
V
Y
 
L
I
 
L
M
 
V
V
 
P
H
 
R
E
 
Q
K
 
S
R
 
R
R
 
R
-
 
N
-
 
L
F
 
V
P
 
P
K
 
E
-
 
V
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
Y
 
T
I
 
T
T
 
R
S
 
D
P
 
P
G
 
-
W
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
-
W
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
R
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
P
S
 
V
A
 
T
V
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
 
E
F
 
L
D
 
G
E
 
A
E
 
S
T
 
G
G
 
A
R
 
R
M
 
L
Y
 
L
L
 
A
E
 
R
T
 
-
C
 
-
H
 
H
P
 
P
G
 
W
K
 
A
T
 
S
P
 
A
E
 
A
E
 
H
I
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
R
C
 
T
E
 
G
F
 
F
D
 
A
L
 
F
D
 
Q
I
 
V
S
 
S
R
 
E
V
 
A
I
 
L
G
 
S
E
 
V
T
 
T
L
 
S
A
 
L
P
 
P
T
 
D
H
 
A
E
 
R
E
 
T
I
 
V
R
 
A
L
 
A
I
 
I
H
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
-
D
 
D
P
 
P

6cojB Crystal structure of rhodococcus jostii rha1 ipdab e105a cochea-coa complex (see paper)
27% identity, 92% coverage: 12:267/279 of query aligns to 2:241/248 of 6cojB

query
sites
6cojB
E
 
E
Y
 
V
T
 
T
L
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
Y
M
 
C
T
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
C
A
 
A
R
 
D
E
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
I
F
 
F
A
 
S
G
 
G
T
 
A
G
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
x
M
-
 
A
-
 
T
M
 
L
P
 
P
M
 
L
I
 
I
S
 
G
I
 
A
M
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
K
 
L
T
 
T
H
 
T
A
 
E
P
 
P
N
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
E
K
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
A
A
 
D
G
 
T
T
 
P
L
 
A
D
 
V
G
 
G
R
 
A
P
 
-
R
 
-
E
 
K
L
 
A
P
 
P
T
 
I
S
 
E
V
 
G
G
 
W
D
 
M
P
 
P
R
 
F
C
 
R
E
 
K
V
 
V
G
x
F
A
 
D
S
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
R
G
x
R
Y
 
H
V
 
V
D
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
V
L
x
M
G
|
G
G
x
A
A
x
N
E
 
Q
V
 
I
D
 
D
E
 
R
Y
 
H
G
 
G
N
 
N
V
 
Q
N
 
N
T
x
L
T
 
S
S
 
A
I
x
F
G
 
G
D
 
P
Y
 
L
L
 
Q
N
 
Q
P
 
P
L
x
T
L
x
R
R
 
Q
L
 
M
T
 
F
G
 
G
S
 
V
G
x
R
G
 
G
N
 
A
P
 
P
D
 
G
I
 
-
N
|
N
S
 
T
F
 
I
S
 
N
Q
 
H
R
 
P
T
 
T
V
 
S
Y
 
Y
-
 
W
I
 
V
M
 
G
V
 
K
H
 
H
E
 
T
K
 
S
R
|
R
R
 
V
F
 
F
P
 
C
K
 
D
H
 
T
V
 
V
S
 
D
Y
 
I
I
 
V
T
 
S
S
 
G
P
 
V
G
 
G
W
 
Y
R
 
D
V
 
Q
-
 
I
-
 
D
K
 
P
K
 
E
W
 
N
P
 
P
S
 
A
G
 
Y
E
 
R
W
 
F
V
 
H
H
 
H
R
 
L
R
 
H
E
 
R
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
V
I
 
V
S
 
S
T
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
F
D
 
G
E
 
G
E
 
P
T
 
D
G
 
H
R
 
T
M
 
F
Y
 
R
L
 
A
E
 
L
T
 
S
C
 
L
H
 
H
P
 
P
G
 
G
K
 
V
T
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
R
 
A
E
 
D
L
 
N
C
 
T
E
 
S
F
 
F
D
 
E
L
 
V
D
 
A
I
 
G
S
 
L
R
 
A
V
 
D
I
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
T
L
 
R
A
 
E
P
 
P
T
 
T
H
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
H
 
R
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
S
I
 
L

Q0S7Q0 Cholesterol ring-cleaving hydrolase IpdB subunit; (3E)-2-(2-carboxylatoethyl)-3-methyl-6-oxocyclohex-1-ene-1-carboxyl-CoA hydrolase beta subunit; COCHEA-CoA hydrolase beta subunit; EC 4.1.99.- from Rhodococcus jostii (strain RHA1) (see paper)
27% identity, 92% coverage: 12:267/279 of query aligns to 7:246/253 of Q0S7Q0

query
sites
Q0S7Q0
E
 
E
Y
 
V
T
 
T
L
 
R
A
 
A
D
 
E
L
 
Y
M
 
C
T
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
C
A
 
A
R
 
D
E
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
I
F
 
F
A
 
S
G
 
G
T
 
A
G
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
 
M
-
 
A
-
 
T
M
 
L
P
 
P
M
 
L
I
 
I
S
 
G
I
 
A
M
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
K
 
L
T
 
T
H
 
T
A
 
E
P
 
P
N
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
x
E
K
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
A
A
 
D
G
 
T
T
 
P
L
 
A
D
 
V
G
 
G
R
 
A
P
 
-
R
 
-
E
 
K
L
 
A
P
 
P
T
 
I
S
 
E
V
 
G
G
 
W
D
 
M
P
 
P
R
 
F
C
 
R
E
 
K
V
 
V
G
 
F
A
 
D
S
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
R
G
x
R
Y
 
H
V
 
V
D
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
V
L
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
N
E
 
Q
V
 
I
D
 
D
E
 
R
Y
 
H
G
 
G
N
 
N
V
 
Q
N
 
N
T
 
L
T
 
S
S
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
P
Y
 
L
L
 
Q
N
 
Q
P
 
P
L
 
T
L
 
R
R
 
Q
L
 
M
T
 
F
G
 
G
S
 
V
G
x
R
G
 
G
N
 
A
P
 
P
D
 
G
I
 
-
N
 
N
S
 
T
F
 
I
S
 
N
Q
 
H
R
 
P
T
 
T
V
 
S
Y
 
Y
-
 
W
I
 
V
M
 
G
V
 
K
H
 
H
E
 
T
K
 
S
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
C
K
 
D
H
 
T
V
 
V
S
 
D
Y
 
I
I
 
V
T
 
S
S
 
G
P
 
V
G
 
G
W
 
Y
R
 
D
V
 
Q
-
 
I
-
 
D
K
 
P
K
 
E
W
 
N
P
 
P
S
 
A
G
 
Y
E
 
R
W
 
F
V
 
H
H
 
H
R
 
L
R
 
H
E
 
R
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
V
I
 
V
S
 
S
T
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
F
D
 
G
E
 
G
E
 
P
T
 
D
G
 
H
R
 
T
M
 
F
Y
 
R
L
 
A
E
 
L
T
 
S
C
 
L
H
 
H
P
 
P
G
 
G
K
 
V
T
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
R
 
A
E
 
D
L
 
N
C
 
T
E
 
S
F
 
F
D
 
E
L
 
V
D
 
A
I
 
G
S
 
L
R
 
A
V
 
D
I
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
T
L
 
R
A
 
E
P
 
P
T
 
T
H
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
H
 
R
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
S
I
 
L

9ctdB Ctfab f42ts45c mutant co-crystallized with acetyl-coa (see paper)
23% identity, 57% coverage: 19:176/279 of query aligns to 6:164/214 of 9ctdB

query
sites
9ctdB
M
 
I
T
 
A
V
 
I
A
 
R
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
V
 
L
R
 
K
D
 
K
H
 
G
E
 
Q
V
 
L
V
 
V
F
 
N
A
 
L
G
 
G
T
 
I
G
 
G
M
x
L
P
 
P
-
 
T
M
 
L
I
 
V
S
 
A
I
 
N
M
 
Y
L
 
I
A
 
P
Q
 
K
K
 
D
T
 
I
H
 
H
A
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
V
K
 
T
L
 
F
I
 
Q
F
 
C
E
|
E
A
 
N
G
 
G
T
 
I
L
 
I
D
 
G
G
 
M
R
 
G
P
 
P
R
 
A
E
 
P
L
 
K
P
 
E
T
 
G
S
 
Y
V
 
E
G
 
N
D
 
S
P
 
D
R
 
L
C
 
T
E
 
N
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
Y
A
 
I
S
 
T
G
 
A
L
 
L
Y
 
P
E
 
G
A
 
A
-
 
M
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
S
F
 
F
S
 
G
I
 
I
A
 
I
Q
 
R
R
 
G
G
 
G
Y
 
H
V
 
L
D
 
D
L
 
V
G
 
T
F
 
V
L
 
L
G
 
G
G
|
G
A
x
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
E
 
E
Y
 
E
G
 
G
N
 
H
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
L
G
 
A
D
 
N
Y
 
W
L
 
M
N
 
I
P
 
P
L
 
G
L
 
K
R
x
M
L
 
I
T
 
P
G
 
G
S
 
M
G
|
G
G
|
G
N
 
A
P
 
M
D
 
D
I
 
L
N
 
V
S
 
T
F
 
G
S
 
A
Q
 
K
R
 
K
T
 
V
V
 
I
Y
 
V
I
 
A
M
 
M
V
 
T
H
 
H
E
 
T
K
x
A
R
 
K
R
 
G
F
 
T
P
 
P
K
|
K
H
 
I
V
 
V
S
 
K
Y
 
K
I
 
C
T
 
T
S
 
L
P
 
P
G
 
L
W
 
T
R
 
S
V
 
I
K
 
R
K
 
K

Sites not aligning to the query:

9cryB Ctfab e46s active site mutant inactive (see paper)
29% identity, 30% coverage: 93:176/279 of query aligns to 86:164/214 of 9cryB

query
sites
9cryB
A
 
S
F
 
F
S
 
G
I
 
I
A
 
I
Q
 
R
R
 
G
G
 
G
Y
 
H
V
 
L
D
 
D
L
 
V
G
 
T
F
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
E
 
E
Y
 
E
G
 
G
N
 
H
V
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
L
G
 
A
D
 
N
Y
 
W
L
 
M
N
 
I
P
 
P
L
 
G
L
 
K
R
 
M
L
 
I
T
 
P
G
 
G
S
 
M
G
 
G
G
|
G
N
 
A
P
 
M
D
 
D
I
 
L
N
 
V
S
 
T
F
 
G
S
 
A
Q
 
K
R
 
K
T
 
V
V
 
I
Y
 
V
I
 
A
M
 
M
V
 
T
H
 
H
E
 
T
K
 
A
R
 
K
R
 
G
F
 
T
P
 
P
K
 
K
H
 
I
V
 
V
S
 
K
Y
 
K
I
 
C
T
 
T
S
 
L
P
 
P
G
 
L
W
 
T
R
 
S
V
 
I
K
 
R
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_084055927.1 NCBI__GCF_900176285.1:WP_084055927.1
MTSARDTAQPDEYTLADLMTVAAAREVRDHEVVFAGTGMPMISIMLAQKTHAPNLKLIFE
AGTLDGRPRELPTSVGDPRCEVGASVASGLYEAFSIAQRGYVDLGFLGGAEVDEYGNVNT
TSIGDYLNPLLRLTGSGGNPDINSFSQRTVYIMVHEKRRFPKHVSYITSPGWRVKKWPSG
EWVHRRELYGSAFRGGPSAVISTAGVFRFDEETGRMYLETCHPGKTPEEIRELCEFDLDI
SRVIGETLAPTHEEIRLIHEVLDPEEIFLPRPKKRGSAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory