SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084056568.1 NCBI__GCF_900176285.1:WP_084056568.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

P59846 Argininosuccinate synthase; Citrulline--aspartate ligase; EC 6.3.4.5 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see 2 papers)
68% identity, 98% coverage: 5:398/403 of query aligns to 2:395/400 of P59846

query
sites
P59846
K
 
K
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
|
A
Y
|
Y
S
|
S
G
|
G
G
|
G
L
|
L
D
|
D
T
|
T
S
|
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
K
 
K
W
 
W
L
 
L
I
 
K
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
C
 
A
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
T
A
|
A
D
 
D
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
D
 
E
L
 
V
S
 
E
G
 
E
I
 
A
E
 
R
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
K
 
K
A
 
A
R
 
I
V
 
A
E
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
F
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
V
F
 
F
P
 
P
A
 
M
F
 
M
R
 
R
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
V
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
Q
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
T
S
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
H
Q
 
L
V
 
V
E
 
R
I
 
I
A
 
A
H
 
E
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
A
H
 
H
G
|
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
F
 
F
E
 
E
L
 
L
T
 
T
Y
 
A
M
 
Y
T
 
A
L
 
L
D
 
K
P
 
P
S
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
W
R
 
R
E
 
E
W
 
W
D
 
S
L
 
F
K
 
Q
S
 
G
R
 
R
Q
 
K
A
 
E
L
 
M
M
 
I
D
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
H
 
A
H
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
K
 
Q
E
 
E
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
C
 
M
D
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
K
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
K
S
 
G
M
 
M
F
 
F
T
 
R
L
 
M
T
 
T
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
K
 
A
P
 
P
E
 
E
T
 
Y
I
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
F
 
F
Q
 
F
K
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
 
M
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
Y
I
 
H
A
 
A
H
 
R
R
 
R
A
 
A
M
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
L
T
 
T
M
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
H
L
 
Q
R
 
R
D
 
D
S
 
M
L
 
L
I
 
S
P
 
P
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
A
K
 
E
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
N
 
Y
G
 
G
F
 
F
W
 
W
F
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
 
E
R
 
R
V
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
T
 
H
S
 
V
Q
 
A
Q
 
R
T
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
A
R
 
R
V
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
N
C
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
S
 
A
D
 
P
L
 
K
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
R
P
 
Q
E
 
D
L
 
L
A
 
V
T
 
S
F
 
F
E
 
D
E
 
E
E
 
A
D
 
G
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
E
G
 
G
F
 
F
I
 
I
R
 
K
L
 
I
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
V
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
K
 
R

1j20A Crystal structure of thermus thermophilus hb8 argininosuccinate synthetase in complex with product (see paper)
66% identity, 98% coverage: 5:398/403 of query aligns to 2:386/386 of 1j20A

query
sites
1j20A
K
 
K
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
|
A
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
|
T
S
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
K
 
K
W
 
W
L
 
L
I
 
K
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
C
 
A
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
T
A
|
A
D
 
D
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
D
 
E
L
 
V
S
 
E
G
 
E
I
 
A
E
 
R
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
K
 
K
A
 
A
R
 
I
V
 
A
E
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
F
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
V
F
 
F
P
 
P
A
 
M
F
 
M
R
 
R
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
V
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
Q
 
Y
Y
|
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
S
I
 
I
A
 
A
R
|
R
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
H
Q
 
L
V
 
V
E
 
R
I
 
I
A
 
A
H
 
E
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
A
H
|
H
G
|
G
A
|
A
T
|
T
G
 
G
K
 
K
G
|
G
N
|
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
R
|
R
F
|
F
E
 
E
L
 
L
T
 
T
Y
 
A
M
 
Y
T
 
A
L
 
L
D
 
K
P
 
P
S
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
W
R
 
R
E
 
E
W
 
W
D
 
S
L
 
F
K
 
Q
S
 
G
R
 
R
Q
 
K
A
 
E
L
 
M
M
 
I
D
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
H
 
A
H
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
Y
 
Y
S
|
S
C
 
M
D
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
I
 
I
S
|
S
Y
 
Y
E
|
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
K
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
K
S
 
G
M
 
M
F
 
F
T
 
R
L
 
M
T
 
T
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
K
 
A
P
 
P
E
 
E
T
 
Y
I
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
F
 
F
Q
 
F
K
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
|
E
S
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
 
M
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
Y
I
 
H
A
 
A
H
 
R
R
 
R
A
 
A
M
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
L
T
 
T
M
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
H
L
 
Q
R
 
R
D
 
D
S
 
M
L
 
L
I
 
S
P
 
P
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
A
K
 
E
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
N
 
Y
G
 
G
F
 
F
W
 
W
F
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
 
E
R
 
R
V
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
T
 
H
S
 
V
Q
 
A
Q
 
R
T
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
A
R
 
R
V
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
N
C
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
S
 
A
D
 
P
L
 
K
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
R
P
 
Q
E
 
D
L
 
L
A
 
V
T
 
S
F
 
F
E
 
G
E
 
-
E
 
-
D
 
-
V
 
-
Y
 
Y
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
E
G
 
G
F
 
F
I
 
I
R
 
K
L
 
I
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
V
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
K
 
R

1j1zA Crystal structure of thermus thermophilus hb8 argininosuccinate synthetase in complex with substrate (see paper)
66% identity, 98% coverage: 5:398/403 of query aligns to 2:386/386 of 1j1zA

query
sites
1j1zA
K
 
K
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
|
A
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
|
T
S
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
K
 
K
W
 
W
L
 
L
I
 
K
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
C
 
A
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
T
A
|
A
D
 
D
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
D
 
E
L
 
V
S
 
E
G
 
E
I
 
A
E
 
R
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
K
 
K
A
 
A
R
 
I
V
 
A
E
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
F
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
V
F
 
F
P
 
P
A
 
M
F
 
M
R
 
R
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
V
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
Q
 
Y
Y
|
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
S
I
 
I
A
 
A
R
|
R
P
 
P
L
 
L
I
|
I
A
 
A
K
 
K
R
 
H
Q
 
L
V
 
V
E
 
R
I
 
I
A
 
A
H
 
E
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
A
H
|
H
G
|
G
A
|
A
T
|
T
G
 
G
K
 
K
G
|
G
N
|
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
R
|
R
F
|
F
E
 
E
L
 
L
T
 
T
Y
 
A
M
 
Y
T
 
A
L
 
L
D
 
K
P
 
P
S
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
W
R
 
R
E
 
E
W
 
W
D
 
S
L
 
F
K
 
Q
S
 
G
R
 
R
Q
 
K
A
 
E
L
 
M
M
 
I
D
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
H
 
A
H
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
Y
 
Y
S
|
S
C
x
M
D
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
I
 
I
S
|
S
Y
 
Y
E
|
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
K
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
K
S
 
G
M
 
M
F
 
F
T
 
R
L
 
M
T
 
T
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
K
 
A
P
 
P
E
 
E
T
 
Y
I
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
F
 
F
Q
 
F
K
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
|
E
S
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
 
M
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
Y
I
 
H
A
 
A
H
 
R
R
 
R
A
 
A
M
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
L
T
 
T
M
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
H
L
 
Q
R
 
R
D
 
D
S
 
M
L
 
L
I
 
S
P
 
P
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
A
K
 
E
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
N
 
Y
G
 
G
F
 
F
W
 
W
F
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
 
E
R
 
R
V
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
T
 
H
S
 
V
Q
 
A
Q
 
R
T
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
A
R
 
R
V
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
N
C
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
S
 
A
D
 
P
L
 
K
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
R
P
 
Q
E
 
D
L
 
L
A
 
V
T
 
S
F
 
F
E
 
G
E
 
-
E
 
-
D
 
-
V
 
-
Y
 
Y
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
E
G
 
G
F
 
F
I
 
I
R
 
K
L
 
I
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
V
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
K
 
R

1kh3A Crystal structure of thermus thermophilus hb8 argininosuccinate synthetase in complex with inhibitor (see paper)
66% identity, 98% coverage: 5:398/403 of query aligns to 2:380/380 of 1kh3A

query
sites
1kh3A
K
 
K
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
|
A
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
|
T
S
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
K
 
K
W
 
W
L
 
L
I
 
K
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
C
 
A
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
F
A
x
T
A
|
A
D
 
D
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
D
 
E
L
 
V
S
 
E
G
 
E
I
 
A
E
 
R
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
K
 
K
A
 
A
R
 
I
V
 
A
E
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
F
 
F
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
V
F
 
F
P
 
P
A
 
M
F
 
M
R
 
R
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
V
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
Q
 
Y
Y
|
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
S
I
 
I
A
 
A
R
|
R
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
H
Q
 
L
V
 
V
E
 
R
I
 
I
A
 
A
H
 
E
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
A
H
|
H
G
|
G
A
|
A
T
|
T
G
 
G
K
 
K
G
|
G
N
|
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
R
|
R
F
|
F
E
 
E
L
 
L
T
 
T
Y
 
A
M
 
Y
T
 
A
L
 
L
D
 
K
P
 
P
S
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
W
R
 
R
E
 
E
W
 
W
D
 
S
L
 
F
K
 
Q
S
 
G
R
 
R
Q
 
K
A
 
E
L
 
M
M
 
I
D
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
H
 
A
H
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
Y
 
Y
S
|
S
C
x
M
D
|
D
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
I
 
I
S
|
S
Y
 
Y
E
|
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
K
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
P
P
 
K
S
 
G
M
 
M
F
 
F
T
 
R
L
 
M
T
 
T
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
K
 
A
P
 
P
E
 
E
T
 
Y
I
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
F
 
F
Q
 
F
K
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
|
E
S
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
 
M
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
Y
I
 
H
A
 
A
H
 
R
R
 
R
A
 
A
M
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
L
T
 
T
M
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
H
L
 
Q
R
 
R
D
 
D
S
 
M
L
 
L
I
 
S
P
 
P
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
A
K
 
E
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
N
 
Y
G
 
G
F
 
F
W
 
W
F
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
 
E
R
 
R
V
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
T
 
H
S
 
V
Q
 
A
Q
 
R
T
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
A
R
 
R
V
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
N
C
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
S
 
A
D
 
P
L
 
K
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
R
P
 
G
E
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
-
V
 
-
Y
 
Y
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
E
G
 
G
F
 
F
I
 
I
R
 
K
L
 
I
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
V
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
K
 
R

P00966 Argininosuccinate synthase; Citrulline--aspartate ligase; EC 6.3.4.5 from Homo sapiens (Human) (see 16 papers)
52% identity, 97% coverage: 6:396/403 of query aligns to 7:409/412 of P00966

query
sites
P00966
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
S
 
S
I
 
C
I
 
I
L
 
L
K
 
V
W
 
W
L
 
L
I
 
K
E
 
E
T
 
Q
Y
 
-
Q
 
G
C
 
Y
Q
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
A
 
L
A
 
A
D
 
N
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
K
E
 
E
D
 
D
L
 
F
S
 
E
G
 
E
I
 
A
E
 
R
E
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
K
K
 
K
A
 
V
R
 
F
V
 
I
E
 
E
D
 
D
L
x
V
K
 
S
E
 
R
E
 
E
F
 
F
V
 
V
R
 
E
D
 
E
F
 
F
V
 
I
F
 
W
P
 
P
A
 
A
F
 
I
R
 
Q
A
 
S
N
 
S
V
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
Q
 
R
Y
|
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
|
S
I
 
L
A
 
A
R
|
R
P
|
P
L
 
C
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
K
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
Q
E
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
Y
V
 
V
S
 
S
H
 
H
G
|
G
A
|
A
T
|
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
|
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
R
|
R
F
 
F
E
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
C
M
 
Y
T
 
S
L
 
L
D
 
A
P
 
P
S
 
Q
I
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
W
R
 
R
E
 
M
W
 
P
D
 
E
L
 
F
-
 
Y
-
 
N
-
 
R
-
 
F
K
 
K
S
 
G
R
|
R
Q
 
N
A
 
D
L
 
L
M
 
M
D
 
E
F
 
Y
A
 
A
R
x
K
H
 
Q
H
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
T
K
 
P
E
x
K
K
 
N
P
 
P
Y
x
W
S
|
S
C
 
M
D
 
D
A
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
M
H
 
H
I
 
I
S
|
S
Y
 
Y
E
|
E
G
x
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
E
 
E
D
 
N
P
 
P
W
 
K
K
 
N
E
 
Q
P
 
A
D
 
P
P
 
P
S
 
G
M
 
L
F
 
Y
T
 
T
L
 
K
T
 
T
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
E
 
A
K
 
K
A
 
A
P
 
P
D
 
N
K
 
T
P
 
P
E
 
D
T
 
I
I
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
F
 
F
Q
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
K
V
 
V
N
 
T
G
 
N
E
 
V
K
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
H
L
 
Q
S
 
T
P
 
S
A
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
M
R
 
Y
L
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
K
H
 
H
G
 
G
V
|
V
G
 
G
R
|
R
A
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
|
E
S
 
N
R
|
R
F
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
M
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
|
G
V
 
I
Y
|
Y
E
 
E
T
|
T
P
 
P
G
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
Y
I
 
H
A
 
A
H
 
H
R
 
L
A
 
D
M
 
I
E
 
E
S
 
A
I
 
F
T
 
T
M
|
M
D
 
D
R
|
R
E
 
E
V
 
V
M
 
R
F
 
K
L
 
I
R
 
K
D
 
Q
S
 
G
L
 
L
I
 
G
P
 
L
Q
 
K
Y
 
F
A
 
A
K
 
E
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
N
 
T
G
|
G
F
 
F
W
 
W
F
 
H
A
 
S
P
 
P
E
 
E
R
 
C
V
 
E
A
 
F
L
 
V
Q
 
R
S
 
H
L
 
C
I
 
I
D
 
A
T
 
K
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
T
 
R
V
 
V
T
 
E
G
|
G
T
 
K
V
 
V
R
 
Q
V
 
V
K
 
S
L
 
V
F
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
Q
C
 
V
M
x
Y
V
 
I
T
 
L
G
|
G
R
 
R
K
 
E
S
 
S
D
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
P
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
V
T
 
S
F
 
M
E
 
N
E
 
V
E
 
Q
D
 
G
V
 
D
Y
 
Y
Q
 
E
Q
 
P
S
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
T
G
|
G
F
 
F
I
 
I
R
 
N
L
 
I
Q
 
N
G
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
H
R
 
R
I
 
L
Q
 
Q
S
 
S
L
 
K
V
 
V

2nz2A Crystal structure of human argininosuccinate synthase in complex with aspartate and citrulline (see paper)
53% identity, 96% coverage: 6:391/403 of query aligns to 4:395/402 of 2nz2A

query
sites
2nz2A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
T
S
 
S
I
 
C
I
 
I
L
 
L
K
 
V
W
 
W
L
 
L
I
 
K
E
 
E
T
 
Q
Y
 
-
Q
 
G
C
 
Y
Q
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
A
 
L
A
 
A
D
 
N
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
K
E
 
E
D
 
D
L
 
F
S
 
E
G
 
E
I
 
A
E
 
R
E
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
K
K
 
K
A
 
V
R
 
F
V
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
V
K
 
S
E
 
R
E
 
E
F
 
F
V
 
V
R
 
E
D
 
E
F
 
F
V
 
I
F
 
W
P
 
P
A
 
A
F
 
I
R
 
Q
A
 
S
N
 
S
V
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
Q
 
R
Y
|
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
S
I
 
L
A
 
A
R
|
R
P
 
P
L
 
C
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
K
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
Q
E
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
Y
V
 
V
S
 
S
H
 
H
G
 
G
A
|
A
T
|
T
G
 
G
K
 
K
G
|
G
N
|
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
R
|
R
F
 
F
E
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
C
M
 
Y
T
 
S
L
 
L
D
 
A
P
 
P
S
 
Q
I
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
W
R
 
R
E
 
M
-
 
P
-
 
E
-
 
F
W
 
Y
D
 
N
L
 
R
K
 
F
S
 
K
R
 
R
Q
 
N
A
 
D
L
 
L
M
 
M
D
 
E
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
H
 
Q
H
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
T
K
 
P
E
 
K
K
 
N
P
 
P
Y
 
W
S
|
S
C
 
M
D
|
D
A
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
M
H
 
H
I
 
I
S
|
S
Y
 
Y
E
|
E
G
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
E
 
E
D
 
N
P
 
P
W
 
K
K
 
N
E
 
Q
P
 
A
D
 
P
P
 
P
S
 
G
M
 
L
F
 
Y
T
 
T
L
 
K
T
 
T
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
E
 
A
K
 
K
A
 
A
P
 
P
D
 
N
K
 
T
P
 
P
E
 
D
T
 
I
I
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
F
 
F
Q
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
K
V
 
V
N
 
T
G
 
N
E
 
V
K
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
H
L
 
Q
S
 
T
P
 
S
A
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
M
R
 
Y
L
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
V
G
 
A
G
 
G
R
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
|
E
S
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
M
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
|
Y
E
 
E
T
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
Y
I
 
H
A
 
A
H
 
H
R
 
L
A
 
D
M
 
I
E
 
E
S
 
A
I
 
F
T
 
T
M
 
M
D
 
D
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
R
F
 
K
L
 
I
R
 
K
D
 
Q
S
 
G
L
 
L
I
 
G
P
 
L
Q
 
K
Y
 
F
A
 
A
K
 
E
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
N
 
T
G
 
G
F
 
F
W
 
W
F
 
H
A
 
S
P
 
P
E
 
E
R
 
C
V
 
E
A
 
F
L
 
V
Q
 
R
S
 
H
L
 
C
I
 
I
D
 
A
T
 
K
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
T
 
R
V
 
V
T
 
E
G
 
G
T
 
K
V
 
V
R
 
Q
V
 
V
K
 
S
L
 
V
F
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
Q
C
 
V
M
 
Y
V
 
I
T
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
E
S
 
S
D
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
P
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
V
T
 
S
F
 
N
E
 
V
E
 
Q
E
 
G
D
 
D
V
 
-
Y
 
Y
Q
 
E
Q
 
P
S
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
I
 
I
R
 
N
L
 
I
Q
 
N
G
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
K

7k5zA Crystal structure of argininosuccinate synthase from legionella pneumophila philadelphia 1 in complex with anppnp and a substrate analogue arginine
49% identity, 99% coverage: 3:399/403 of query aligns to 3:386/390 of 7k5zA

query
sites
7k5zA
V
 
I
K
 
K
K
 
K
V
 
I
V
 
A
L
 
L
A
|
A
Y
|
Y
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
T
S
 
S
I
 
I
I
 
M
L
 
I
K
 
P
W
 
W
L
 
L
I
 
K
E
 
E
T
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
-
 
H
C
 
A
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
V
A
 
I
A
x
C
D
 
D
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
Q
E
 
E
D
 
D
L
 
L
S
 
D
G
 
A
I
 
I
E
 
K
E
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
S
K
 
K
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
E
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
K
E
 
N
E
 
E
F
 
F
V
 
A
R
 
T
D
 
Q
F
 
Y
V
 
L
F
 
W
P
 
P
A
 
L
F
 
V
R
 
K
A
 
S
N
 
G
V
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
I
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
-
I
 
I
A
 
S
R
|
R
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
R
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
L
E
 
T
E
 
E
G
 
Q
A
 
V
D
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
H
 
H
G
|
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
R
|
R
F
|
F
E
 
E
L
 
Y
T
 
S
Y
 
I
M
 
K
T
 
A
L
 
L
D
 
A
P
 
P
S
 
Q
I
 
L
K
 
E
V
 
I
I
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
W
R
 
R
E
 
T
W
 
W
D
 
D
L
 
I
K
 
K
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
A
 
E
L
 
A
M
 
I
D
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
H
 
A
H
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
T
K
 
P
E
 
K
K
 
A
P
 
P
Y
 
Y
S
|
S
C
 
R
D
 
D
A
 
H
N
 
N
L
 
I
L
 
W
H
 
Y
I
 
I
S
|
S
Y
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
S
K
 
Q
E
 
E
P
 
M
D
 
P
P
 
N
S
 
D
M
 
V
F
 
L
T
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
A
D
 
P
P
 
V
E
 
S
K
 
Q
A
 
T
P
 
P
D
 
D
K
 
E
P
 
E
E
 
E
T
 
V
I
 
V
E
 
V
I
 
L
E
 
D
F
 
F
Q
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
G
E
 
Q
K
 
E
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
R
 
S
L
 
L
N
 
N
E
 
Q
I
 
K
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
R
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
|
E
S
 
N
R
 
R
F
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
K
 
K
S
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
|
Y
E
 
E
T
 
A
P
 
P
G
 
A
G
 
A
T
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
Y
I
 
K
A
 
A
H
 
H
R
 
K
A
 
L
M
 
L
E
 
E
S
 
S
I
 
L
T
 
C
M
 
L
D
 
T
R
 
R
E
 
S
V
 
T
M
 
L
F
 
H
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
Q
P
 
Q
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
K
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
N
 
E
G
 
G
F
 
R
W
 
W
F
 
F
A
 
S
P
 
Q
E
 
T
R
 
K
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
S
 
A
L
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
V
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
T
 
H
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
C
V
 
V
R
 
K
V
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
K
 
K
G
 
G
H
 
N
C
 
I
M
 
I
V
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
M
K
 
H
S
 
S
D
 
P
L
 
Y
S
 
S
L
 
L
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
-
V
 
-
Y
 
H
Q
 
H
Q
 
Q
S
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
E
G
 
G
F
 
F
I
 
I
R
 
N
L
 
L
Q
 
F
G
 
S
L
 
L
R
 
S
L
 
A
R
 
K
I
 
I
Q
 
Y
S
 
S
L
 
Q
V
 
V
R
 
H
K
 
Q
G
 
G

4xfjB Crystal structure of argininosuccinate synthase from mycobacterium thermoresistibile in complex with amppnp and arginine
42% identity, 97% coverage: 4:394/403 of query aligns to 2:392/397 of 4xfjB

query
sites
4xfjB
K
 
E
K
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
A
|
A
Y
|
Y
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
|
T
S
 
S
I
 
V
I
 
A
L
 
I
K
 
S
W
 
W
L
 
I
I
 
G
E
 
K
T
 
E
Y
 
T
Q
 
G
C
 
R
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
V
A
 
A
A
x
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
-
 
G
E
 
E
D
 
D
L
 
M
S
 
E
G
 
V
I
 
V
E
 
R
E
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
D
T
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
S
R
 
I
V
 
V
E
 
I
D
 
D
L
 
A
K
 
R
E
 
D
E
 
E
F
 
F
V
 
A
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
C
F
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
I
R
 
Q
A
 
S
N
 
N
V
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
M
G
 
D
Q
 
R
Y
|
Y
L
 
P
L
 
L
G
 
V
T
x
S
S
 
A
I
 
L
A
 
S
R
|
R
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
V
K
 
K
R
 
H
Q
 
L
V
 
V
E
 
K
I
 
A
A
 
A
H
 
R
E
 
E
E
 
H
G
 
G
A
 
G
D
 
T
A
 
I
V
 
V
S
 
A
H
 
H
G
|
G
A
x
C
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
R
|
R
F
|
F
E
 
E
L
 
V
T
 
G
Y
 
F
M
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
A
P
 
P
S
 
D
I
 
L
K
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
P
 
P
W
 
V
R
 
R
E
 
D
W
 
Y
D
 
A
L
 
W
K
 
-
S
 
T
R
 
R
Q
 
E
A
 
K
L
 
A
M
 
I
D
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
E
H
 
N
G
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
I
P
 
N
V
 
V
T
 
T
K
 
K
E
 
R
K
 
S
P
 
P
Y
 
F
S
|
S
C
 
I
D
 
D
A
 
Q
N
 
N
L
 
V
L
 
W
H
 
G
I
 
R
S
x
A
Y
 
V
E
|
E
G
 
T
G
 
G
I
 
F
L
 
L
E
 
E
D
 
H
P
 
L
W
 
W
K
 
N
E
 
A
P
 
P
D
 
T
P
 
K
S
 
D
M
 
V
F
 
Y
T
 
S
L
 
Y
T
 
T
V
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
T
K
 
V
A
 
N
P
 
W
D
 
S
K
 
T
P
 
P
E
 
D
T
 
E
I
 
V
E
 
I
I
 
V
E
 
G
F
 
F
Q
 
E
K
 
Q
G
 
G
D
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
D
G
 
G
E
 
R
K
 
S
L
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
L
A
 
Q
L
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
R
I
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
E
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
|
E
S
 
D
R
 
R
F
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
x
E
V
 
I
Y
|
Y
E
 
E
T
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
M
I
 
V
L
 
L
R
 
I
I
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
T
A
 
E
M
 
L
E
 
E
S
 
H
I
 
V
T
 
T
M
 
L
D
 
E
R
 
R
E
 
E
V
 
L
M
 
G
F
 
R
L
 
F
R
 
K
D
 
R
S
 
I
L
 
T
I
 
D
P
 
Q
Q
 
K
Y
 
W
A
 
G
K
 
E
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
N
 
D
G
 
G
F
 
L
W
 
W
F
 
F
A
 
S
P
 
P
E
 
L
R
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
L
 
F
I
 
V
D
 
A
T
 
K
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
T
 
H
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
M
K
 
V
L
 
L
F
 
H
K
 
G
G
 
G
H
 
H
C
 
I
M
 
A
V
 
V
T
 
N
G
 
G
R
 
R
K
 
R
S
 
S
D
 
P
L
 
K
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
F
E
 
N
L
 
L
A
 
A
T
 
T
F
 
Y
E
 
D
E
 
E
E
 
G
D
 
D
V
 
T
Y
 
F
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
S
D
 
A
A
 
A
T
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
V
R
 
Q
L
 
I
Q
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
S
L
 
S
R
 
S
I
 
I
Q
 
S
S
 
A

5us8A 2.15 angstrom resolution crystal structure of argininosuccinate synthase from bordetella pertussis
29% identity, 96% coverage: 4:388/403 of query aligns to 15:414/445 of 5us8A

query
sites
5us8A
K
 
Q
K
 
K
V
 
V
V
 
G
L
 
I
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
T
S
 
S
I
 
A
I
 
A
L
 
L
K
 
L
W
 
W
L
 
M
I
 
R
E
 
Q
T
 
K
Y
 
G
Q
 
A
C
 
V
Q
 
P
V
 
Y
V
 
-
A
 
A
F
 
Y
A
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
P
E
 
D
-
 
E
-
 
P
D
 
D
L
 
Y
S
 
D
G
 
E
I
 
I
E
 
P
E
 
R
K
 
R
A
 
A
L
 
M
K
 
Q
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
E
K
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
L
E
 
V
D
 
D
L
 
C
K
 
R
E
 
A
E
 
Q
F
 
L
V
 
V
R
 
A
D
 
E
F
 
G
V
 
I
F
 
-
P
 
A
A
 
A
F
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
F
Y
 
H
E
 
I
G
 
S
Q
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
T
Y
 
Y
L
 
F
L
 
N
G
 
T
T
 
T
S
 
P
I
 
I
A
 
G
R
|
R
P
 
A
L
 
V
I
 
T
A
 
G
K
 
T
R
 
M
Q
 
L
V
 
V
E
 
A
I
 
A
A
 
M
H
 
K
E
 
E
E
 
D
G
 
G
A
 
V
D
 
N
A
 
I
V
 
W
S
 
G
H
 
D
G
 
G
A
 
S
T
 
T
G
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
N
D
|
D
Q
 
I
V
 
E
R
 
R
F
 
F
E
 
Y
L
 
R
T
 
Y
Y
 
G
M
 
L
T
 
L
L
 
T
D
 
N
P
 
P
S
 
D
I
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
Y
A
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
L
E
 
D
W
 
Q
-
 
T
-
 
F
-
 
I
-
 
D
D
 
E
L
 
L
K
 
G
S
 
G
R
 
R
Q
 
A
A
 
E
L
 
M
M
 
S
D
 
E
F
 
Y
A
 
M
R
 
R
H
 
Q
H
 
A
G
 
G
I
 
F
P
 
D
V
 
Y
P
 
K
V
 
M
T
 
S
K
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
A
Y
 
Y
S
|
S
C
 
T
D
 
D
A
 
S
N
 
N
L
 
M
L
 
L
H
 
G
I
 
A
S
 
T
Y
 
H
E
 
E
G
 
A
G
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
S
D
 
A
P
 
G
W
 
I
K
 
R
E
 
I
P
 
V
D
 
Q
P
 
P
S
 
I
M
 
M
F
 
-
T
 
G
L
 
V
T
 
A
V
 
F
D
 
W
P
 
Q
E
 
D
K
 
S
A
 
V
P
 
Q
D
 
I
K
 
K
P
 
A
E
 
E
T
 
E
I
 
V
E
 
T
I
 
V
E
 
R
F
 
F
Q
 
E
K
 
E
G
 
G
D
 
Q
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
G
-
 
V
E
 
E
K
 
Y
L
 
A
S
 
D
P
 
P
A
 
V
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
L
R
 
E
L
 
A
N
 
N
E
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
G
R
 
M
A
 
S
D
 
D
V
 
Q
V
 
I
E
 
E
S
 
N
R
 
R
F
 
I
V
 
I
G
 
E
M
 
A
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
E
 
E
T
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
L
T
 
A
I
 
L
L
 
L
R
 
F
I
 
I
A
 
A
H
 
Y
R
 
E
A
 
R
M
 
L
E
 
V
S
 
T
I
 
G
T
 
I
M
 
H
D
 
N
R
 
E
E
 
D
V
 
T
M
 
I
F
x
E
L
 
Q
R
 
Y
D
x
R
S
x
E
L
 
N
I
 
G
P
x
R
Q
x
K
Y
 
L
A
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
Q
G
 
G
F
 
R
W
 
W
F
 
F
A
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
M
L
 
L
Q
 
R
S
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
E
T
 
T
S
 
A
Q
 
Q
-
 
R
-
 
W
-
 
V
-
 
A
Q
 
R
T
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
V
R
 
T
V
 
L
K
 
E
L
 
L
F
 
R
K
 
R
G
 
G
-
 
N
-
 
D
H
 
Y
C
 
S
M
 
L
V
 
L
T
 
N
G
 
T
R
 
E
K
 
S
S
 
A
D
 
N
L
 
L
S
 
T
L
 
-
Y
 
Y
D
 
A
P
 
P
E
 
E
L
 
R
A
 
L
T
 
S
F
 
M
E
 
E
-
 
K
-
 
V
E
 
E
E
 
N
D
 
A
V
 
P
Y
 
F
Q
 
T
Q
 
P
S
 
A
D
 
D
A
 
R
T
 
I
G
 
G
F
 
Q
I
 
L
R
 
T
L
 
M
Q
 
R
G
 
N
L
 
L

6e5yA 1.50 angstrom resolution crystal structure of argininosuccinate synthase from bordetella pertussis in complex with amp.
29% identity, 96% coverage: 4:388/403 of query aligns to 11:410/438 of 6e5yA

query
sites
6e5yA
K
 
Q
K
 
K
V
 
V
V
 
G
L
 
I
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
T
S
 
S
I
 
A
I
 
A
L
 
L
K
 
L
W
 
W
L
 
M
I
 
R
E
 
Q
T
 
K
Y
 
G
Q
 
A
C
 
V
Q
 
P
V
 
Y
V
 
-
A
 
A
F
 
Y
A
x
T
A
|
A
D
 
N
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
P
E
 
D
-
 
E
-
 
P
D
 
D
L
 
Y
S
 
D
G
 
E
I
 
I
E
 
P
E
 
R
K
 
R
A
 
A
L
 
M
K
 
Q
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
E
K
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
L
E
 
V
D
 
D
L
 
C
K
 
R
E
 
A
E
 
Q
F
 
L
V
 
V
R
 
A
D
 
E
F
 
G
V
 
I
F
 
-
P
 
A
A
 
A
F
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
F
Y
 
H
E
 
I
G
 
S
Q
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
T
Y
 
Y
L
 
F
L
 
N
G
 
T
T
 
T
S
 
P
I
 
I
A
 
G
R
|
R
P
 
A
L
 
V
I
 
T
A
 
G
K
 
T
R
 
M
Q
 
L
V
 
V
E
 
A
I
 
A
A
 
M
H
 
K
E
 
E
E
 
D
G
 
G
A
 
V
D
 
N
A
 
I
V
 
W
S
 
G
H
 
D
G
 
G
A
 
S
T
 
T
G
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
N
D
|
D
Q
 
I
V
 
E
R
 
R
F
 
F
E
 
Y
L
 
R
T
 
Y
Y
 
G
M
 
L
T
 
L
L
 
T
D
 
N
P
 
P
S
 
D
I
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
Y
A
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
L
E
 
D
W
 
Q
-
 
T
-
 
F
-
 
I
-
 
D
D
 
E
L
 
L
K
 
G
S
 
G
R
 
R
Q
 
A
A
 
E
L
 
M
M
 
S
D
 
E
F
 
Y
A
 
M
R
 
R
H
 
Q
H
 
A
G
 
G
I
 
F
P
 
D
V
 
Y
P
 
K
V
 
M
T
 
S
K
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
A
Y
 
Y
S
|
S
C
 
T
D
|
D
A
 
S
N
 
N
L
 
M
L
 
L
H
 
G
I
 
A
S
 
T
Y
 
H
E
 
E
G
 
A
G
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
S
D
 
A
P
 
G
W
 
I
K
 
R
E
 
I
P
 
V
D
 
Q
P
 
P
S
 
I
M
 
M
F
 
-
T
 
G
L
 
V
T
 
A
V
 
F
D
 
W
P
 
Q
E
 
D
K
 
S
A
 
V
P
 
Q
D
 
I
K
 
K
P
 
A
E
 
E
T
 
E
I
 
V
E
 
T
I
 
V
E
 
R
F
 
F
Q
 
E
K
 
E
G
 
G
D
 
Q
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
G
-
 
V
E
 
E
K
 
Y
L
 
A
S
 
D
P
 
P
A
 
V
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
L
R
 
E
L
 
A
N
 
N
E
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
G
R
 
M
A
 
S
D
 
D
V
 
Q
V
 
I
E
 
E
S
 
N
R
 
R
F
 
I
V
 
I
G
 
E
M
 
A
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
E
 
E
T
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
L
T
 
A
I
 
L
L
 
L
R
 
F
I
 
I
A
 
A
H
 
Y
R
 
E
A
 
R
M
 
L
E
 
V
S
 
T
I
 
G
T
 
I
M
 
H
D
 
N
R
 
E
E
 
D
V
 
T
M
 
I
F
 
E
L
 
Q
R
 
Y
D
 
R
S
 
E
L
 
N
I
 
G
P
 
R
Q
 
K
Y
 
L
A
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
Q
G
 
G
F
 
R
W
 
W
F
 
F
A
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
M
L
 
L
Q
 
R
S
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
E
T
 
T
S
 
A
Q
 
Q
-
 
R
-
 
W
-
 
V
-
 
A
Q
 
R
T
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
V
R
 
T
V
 
L
K
 
E
L
 
L
F
 
R
K
 
R
G
 
G
-
 
N
-
 
D
H
 
Y
C
 
S
M
 
L
V
 
L
T
 
N
G
 
T
R
 
E
K
 
S
S
 
A
D
 
N
L
 
L
S
 
T
L
 
-
Y
 
Y
D
 
A
P
 
P
E
 
E
L
 
R
A
 
L
T
 
S
F
 
M
E
 
E
-
 
K
-
 
V
E
 
E
E
 
N
D
 
A
V
 
P
Y
 
F
Q
 
T
Q
 
P
S
 
A
D
 
D
A
 
R
T
 
I
G
 
G
F
 
Q
I
 
L
R
 
T
L
 
M
Q
 
R
G
 
N
L
 
L

P0A6E4 Argininosuccinate synthase; Citrulline--aspartate ligase; EC 6.3.4.5 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
30% identity, 96% coverage: 4:388/403 of query aligns to 12:410/447 of P0A6E4

query
sites
P0A6E4
K
 
Q
K
 
R
V
 
I
V
 
G
L
 
I
A
|
A
Y
x
F
S
|
S
G
|
G
G
|
G
L
|
L
D
|
D
T
|
T
S
|
S
I
 
A
I
 
A
L
 
L
K
 
L
W
 
W
L
 
M
I
 
R
E
 
Q
T
 
K
Y
 
G
Q
 
A
C
 
V
Q
 
P
V
 
Y
V
 
-
A
 
A
F
 
Y
A
 
T
A
|
A
D
 
N
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
-
 
P
-
 
D
G
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
Y
S
 
D
G
 
A
I
 
I
E
 
P
E
 
R
K
 
R
A
 
A
L
 
M
K
 
E
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
E
K
 
N
A
 
A
R
 
R
V
 
L
E
 
I
D
 
D
L
 
C
K
 
R
E
 
K
E
 
Q
F
 
L
V
 
V
R
 
A
D
 
E
F
 
G
V
 
I
F
 
A
P
 
A
-
 
I
-
 
Q
-
 
C
-
 
G
A
 
A
F
 
F
R
 
H
A
 
-
N
 
N
V
 
T
I
 
T
Y
 
G
E
 
G
G
 
L
Q
 
T
Y
|
Y
L
 
F
L
 
N
G
 
T
T
 
T
S
 
P
I
 
L
A
 
G
R
 
R
P
 
A
L
 
V
I
 
T
A
 
G
K
 
T
R
 
M
Q
 
L
V
 
V
E
 
A
I
 
A
A
 
M
H
 
K
E
 
E
E
 
D
G
 
G
A
 
V
D
 
N
A
 
I
V
 
W
S
 
G
H
 
D
G
|
G
A
 
S
T
|
T
G
 
Y
K
 
K
G
 
G
N
|
N
D
|
D
Q
 
I
V
 
E
R
|
R
F
 
F
E
 
Y
L
 
R
T
 
Y
Y
 
G
M
 
L
T
 
L
L
 
T
D
 
N
P
 
A
S
 
E
I
 
L
K
 
Q
V
 
I
I
 
Y
A
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
L
E
 
D
W
 
T
D
 
D
-
 
F
-
 
I
-
 
D
-
 
E
L
 
L
K
 
G
S
 
G
R
 
R
Q
 
H
A
 
E
L
 
M
M
 
S
D
 
E
F
 
F
A
 
M
R
 
I
H
 
A
H
 
C
G
 
G
I
 
F
P
 
D
V
 
Y
P
 
K
V
 
M
T
 
S
K
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
A
Y
 
Y
S
|
S
C
 
T
D
|
D
A
 
S
N
 
N
L
 
M
L
 
L
H
 
G
I
 
A
S
x
T
Y
 
H
E
|
E
G
 
A
G
 
K
I
 
D
L
 
L
E
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
N
D
 
S
P
 
S
W
 
V
K
 
K
E
 
I
P
 
V
D
 
N
P
 
P
S
 
I
M
 
M
F
 
G
T
 
V
L
 
K
T
 
F
V
 
W
D
 
D
P
 
-
E
 
E
K
 
S
A
 
V
P
 
K
D
 
I
K
 
P
P
 
A
E
 
E
T
 
E
I
 
V
E
 
T
I
 
V
E
 
R
F
 
F
Q
 
E
K
 
Q
G
 
G
D
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
G
E
 
K
K
 
T
L
 
F
S
 
S
P
 
D
-
 
D
A
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
M
A
 
L
R
 
E
L
 
A
N
 
N
E
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
G
R
 
M
A
 
S
D
 
D
V
 
Q
V
 
I
E
|
E
S
 
N
R
 
R
F
 
I
V
 
I
G
 
E
M
 
A
K
 
K
S
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
E
 
E
T
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
M
T
 
A
I
 
L
L
 
L
R
 
H
I
 
I
A
 
A
H
 
Y
R
 
E
A
 
R
M
 
L
E
 
L
S
 
T
I
 
G
T
 
I
M
 
H
D
 
N
R
 
E
E
 
D
V
 
T
M
 
I
F
 
E
L
 
Q
R
 
Y
D
 
H
S
 
A
L
 
H
I
 
G
P
 
R
Q
 
Q
Y
 
L
A
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
Q
G
 
G
F
 
R
W
 
W
F
 
F
A
 
D
P
 
S
E
 
Q
R
 
A
V
 
L
A
 
M
L
 
L
Q
 
R
-
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
Q
D
 
R
T
 
W
S
 
V
Q
 
A
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
V
R
 
T
V
 
L
K
 
E
L
 
L
F
 
R
K
 
R
G
 
G
H
 
N
-
 
D
C
 
Y
M
 
S
V
 
I
T
 
L
G
 
N
R
 
T
K
 
V
S
 
S
D
 
E
L
 
N
S
 
L
L
 
T
Y
 
Y
D
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
R
A
 
L