SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084057039.1 NCBI__GCF_900176285.1:WP_084057039.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

P0A7B5 Glutamate 5-kinase; Gamma-glutamyl kinase; GK; EC 2.7.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
42% identity, 87% coverage: 45:403/412 of query aligns to 7:365/367 of P0A7B5

query
sites
P0A7B5
V
 
L
V
 
V
L
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
G
P
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
A
M
 
H
I
 
I
H
 
V
R
 
E
L
 
L
S
 
V
D
 
R
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
R
 
H
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
H
 
H
E
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
M
 
R
R
 
E
K
 
H
V
 
L
G
 
G
L
 
Y
K
 
P
E
 
E
R
 
L
P
 
P
R
 
A
T
 
T
I
 
I
P
 
A
Q
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
L
T
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
R
L
 
L
M
 
I
H
 
Q
A
 
L
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
A
 
L
F
 
F
D
 
S
K
 
I
F
 
Y
D
 
G
I
 
I
L
 
H
T
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
R
E
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
E
H
 
D
R
 
R
H
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
W
 
N
N
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
V
 
A
V
 
T
E
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
F
 
V
G
 
G
D
 
D
N
|
N
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
K
V
 
L
V
 
L
N
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
Q
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
T
C
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
F
 
S
H
 
N
R
 
P
D
 
Q
A
 
A
N
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
K
V
 
D
V
 
V
R
 
Y
G
 
G
F
 
I
S
 
D
P
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
T
 
G
P
 
D
Q
 
S
P
 
V
G
 
S
S
 
G
V
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
M
W
 
S
S
 
T
K
 
K
V
 
L
N
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
D
R
 
V
C
 
A
L
 
C
A
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
D
M
 
T
V
 
I
I
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
S
E
 
K
K
 
P
D
 
G
V
 
V
L
 
I
L
 
G
R
 
D
L
 
V
F
 
M
Q
 
E
G
 
G
E
 
I
V
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
L
 
H
P
 
A
K
 
Q
E
 
A
R
 
T
L
 
P
Y
 
L
H
 
E
G
 
N
K
 
R
K
 
K
V
 
R
W
 
W
L
 
I
A
 
F
N
 
G
L
 
A
P
 
P
K
 
-
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
E
L
 
I
V
 
T
L
 
V
D
 
D
P
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
L
K
 
E
S
 
R
G
 
G
K
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
K
Q
 
S
V
 
V
R
 
T
G
 
G
S
 
N
F
 
F
G
 
S
V
 
R
G
 
G
A
 
E
P
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
I
L
 
C
S
 
N
E
 
L
D
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
D
V
 
I
G
 
A
V
 
H
G
 
G
L
 
V
T
 
S
N
 
R
Y
 
Y
K
 
N
A
 
S
S
 
D
E
 
A
I
 
L
D
 
R
K
 
R
I
 
I
K
 
A
G
 
G
H
 
H
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
D
 
E
I
 
I
E
 
D
T
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
H
 
Y
S
 
G
D
 
P
E
 
V
V
 
A
I
 
V
H
 
H
R
 
R
N
 
D
N
 
D
F
 
M
V
 
I

2j5tD Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamate (see paper)
42% identity, 87% coverage: 45:403/412 of query aligns to 5:363/365 of 2j5tD

query
sites
2j5tD
V
 
L
V
 
V
L
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
G
P
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
A
M
 
H
I
 
I
H
 
V
R
 
E
L
 
L
S
 
V
D
 
R
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
R
 
H
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
H
 
H
E
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
M
 
R
R
 
E
K
 
H
V
 
L
G
 
G
L
 
Y
K
 
P
E
 
E
R
 
L
P
 
P
R
 
A
T
 
T
I
 
I
P
 
A
Q
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
L
T
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
R
L
 
L
M
 
I
H
 
Q
A
 
L
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
A
 
L
F
 
F
D
 
S
K
 
I
F
 
Y
D
 
G
I
 
I
L
 
H
T
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
R
E
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
E
H
 
D
R
 
R
H
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
W
 
N
N
 
N
I
 
V
I
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
N
|
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
V
 
A
V
 
T
E
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
F
 
V
G
 
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
K
V
 
L
V
 
L
N
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
Q
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
T
C
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
F
 
S
H
 
N
R
 
P
D
 
Q
A
 
A
N
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
K
V
 
D
V
 
V
R
 
Y
G
 
G
F
 
I
S
 
D
P
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
T
 
G
P
 
D
Q
 
S
P
 
V
G
 
S
S
 
G
V
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
M
W
 
S
S
 
T
K
 
K
V
 
L
N
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
D
R
 
V
C
 
A
L
 
C
A
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
D
M
 
T
V
 
I
I
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
S
E
 
K
K
 
P
D
 
G
V
 
V
L
 
I
L
 
G
R
 
D
L
 
V
F
 
M
Q
 
E
G
 
G
E
 
I
V
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
L
 
H
P
 
A
K
 
Q
E
 
A
R
 
T
L
 
P
Y
 
L
H
 
E
G
 
N
K
 
R
K
 
K
V
 
R
W
 
W
L
 
I
A
 
F
N
 
G
L
 
A
P
 
P
K
 
-
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
E
L
 
I
V
 
T
L
 
V
D
 
D
P
 
E
G
 
G
A
|
A
V
 
T
R
 
A
A
|
A
L
 
I
Q
 
L
K
 
E
S
 
R
G
 
G
K
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
K
Q
 
S
V
 
V
R
 
T
G
 
G
S
 
N
F
 
F
G
 
S
V
 
R
G
 
G
A
 
E
P
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
I
L
 
C
S
 
N
E
 
L
D
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
D
V
 
I
G
 
A
V
 
H
G
 
G
L
 
V
T
 
S
N
 
R
Y
 
Y
K
 
N
A
 
S
S
 
D
E
 
A
I
 
L
D
 
R
K
 
R
I
 
I
K
 
A
G
 
G
H
 
H
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
D
 
E
I
 
I
E
 
D
T
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
H
 
Y
S
 
G
D
 
P
E
 
V
V
 
A
I
 
V
H
 
H
R
 
R
N
 
D
N
 
D
F
 
M
V
 
I

2j5vB Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamyl-5- phosphate and pyroglutamic acid (see paper)
38% identity, 87% coverage: 45:403/412 of query aligns to 5:323/325 of 2j5vB

query
sites
2j5vB
V
 
L
V
 
V
L
 
V
K
|
K
V
 
L
G
 
G
S
x
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
G
P
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
A
M
 
H
I
 
I
H
 
V
R
 
E
L
 
L
S
 
V
D
 
R
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
R
 
H
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
H
 
H
E
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
x
I
A
|
A
S
 
A
G
 
G
M
 
R
R
 
E
K
 
H
V
 
L
G
 
G
L
 
Y
K
 
P
E
 
E
R
 
L
P
 
P
R
 
A
T
 
T
I
 
I
P
 
A
Q
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
L
T
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
R
L
 
L
M
 
I
H
 
Q
A
 
L
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
A
 
L
F
 
F
D
 
S
K
 
I
F
 
Y
D
 
G
I
 
I
L
 
H
T
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
R
E
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
E
H
 
D
R
 
R
H
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
W
 
N
N
 
N
I
 
V
I
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
V
 
A
V
 
T
E
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
F
 
V
G
|
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
K
V
 
L
V
 
L
N
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
F
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
Q
G
 
G
G
 
G
M
 
M
W
 
S
S
 
T
K
 
K
V
 
L
N
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
D
R
 
V
C
 
A
L
 
C
A
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
D
M
 
T
V
 
I
I
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
S
E
 
K
K
 
P
D
 
G
V
 
V
L
 
I
L
 
G
R
 
D
L
 
V
F
 
M
Q
 
E
G
 
G
E
 
I
V
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
L
 
H
P
 
A
K
 
Q
E
 
A
R
 
T
L
 
P
Y
 
L
H
 
E
G
 
N
K
 
R
K
 
K
V
 
R
W
 
W
L
 
I
A
 
F
N
 
G
L
 
A
P
 
P
K
 
-
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
E
L
 
I
V
 
T
L
 
V
D
 
D
P
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
L
K
 
E
S
 
R
G
 
G
K
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
K
Q
 
S
V
 
V
R
 
T
G
 
G
S
 
N
F
 
F
G
 
S
V
 
R
G
 
G
A
 
E
P
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
I
L
 
C
S
 
N
E
 
L
D
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
D
V
 
I
G
 
A
V
 
H
G
 
G
L
 
V
T
 
S
N
 
R
Y
 
Y
K
 
N
A
 
S
S
 
D
E
 
A
I
 
L
D
 
R
K
 
R
I
 
I
K
 
A
G
 
G
H
 
H
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
D
 
E
I
 
I
E
 
D
T
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
H
 
Y
S
 
G
D
 
P
E
 
V
V
 
A
I
 
V
H
 
H
R
 
R
N
 
D
N
 
D
F
 
M
V
 
I

2j5vA Glutamate 5-kinase from escherichia coli complexed with glutamyl-5- phosphate and pyroglutamic acid (see paper)
37% identity, 87% coverage: 45:403/412 of query aligns to 5:321/323 of 2j5vA

query
sites
2j5vA
V
 
L
V
 
V
L
 
V
K
|
K
V
 
L
G
|
G
S
x
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
G
P
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
A
M
 
H
I
 
I
H
 
V
R
 
E
L
 
L
S
 
V
D
 
R
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
R
 
H
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
H
 
H
E
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
|
G
A
|
A
V
x
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
M
 
R
R
 
E
K
 
H
V
 
L
G
 
G
L
 
Y
K
 
P
E
 
E
R
 
L
P
 
P
R
 
A
T
 
T
I
 
I
P
 
A
Q
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
L
T
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
R
L
 
L
M
 
I
H
 
Q
A
 
L
W
 
W
E
 
E
E
 
Q
A
 
L
F
 
F
D
 
S
K
 
I
F
 
Y
D
 
G
I
 
I
L
 
H
T
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
R
E
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
E
H
 
D
R
 
R
H
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
R
N
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
W
 
N
N
 
N
I
 
V
I
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
V
 
A
V
 
T
E
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
F
 
V
G
 
G
D
|
D
N
|
N
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
K
V
 
L
V
 
L
N
 
L
L
|
L
T
 
T
D
 
D
T
 
Q
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
F
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
M
 
M
W
 
S
S
 
T
K
 
K
V
 
L
N
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
D
R
 
V
C
 
A
L
 
C
A
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
D
M
 
T
V
 
I
I
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
S
E
 
K
K
 
P
D
 
G
V
 
V
L
 
I
L
 
G
R
 
D
L
 
V
F
 
M
Q
 
E
G
 
G
E
 
I
V
 
S
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
L
 
H
P
 
A
K
 
Q
E
 
A
R
 
T
L
 
P
Y
 
L
H
 
E
G
 
N
K
 
R
K
 
K
V
 
R
W
 
W
L
 
I
A
 
F
N
 
G
L
 
A
P
 
P
K
 
-
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
E
L
 
I
V
 
T
L
 
V
D
 
D
P
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
L
K
 
E
S
 
R
G
 
G
K
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
K
Q
 
S
V
 
V
R
 
T
G
 
G
S
 
N
F
 
F
G
 
S
V
 
R
G
 
G
A
 
E
P
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
I
L
 
C
S
 
N
E
 
L
D
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
D
V
 
I
G
 
A
V
 
H
G
 
G
L
 
V
T
 
S
N
 
R
Y
 
Y
K
 
N
A
 
S
S
 
D
E
 
A
I
 
L
D
 
R
K
 
R
I
 
I
K
 
A
G
 
G
H
 
H
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
D
 
E
I
 
I
E
 
D
T
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
H
 
Y
S
 
G
D
 
P
E
 
V
V
 
A
I
 
V
H
 
H
R
 
R
N
 
D
N
 
D
F
 
M
V
 
I

2akoA Crystal structure of glutamate 5-kinase from campylobacter jejuni
36% identity, 61% coverage: 43:292/412 of query aligns to 1:240/241 of 2akoA

query
sites
2akoA
R
 
K
R
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
x
H
V
 
V
L
 
I
T
 
S
G
 
E
P
 
E
R
 
N
G
 
T
L
 
L
D
 
S
R
 
F
V
 
E
M
 
R
I
 
L
H
 
K
R
 
N
L
 
L
S
 
V
D
 
A
Q
 
F
V
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
R
 
M
Q
 
E
R
 
K
G
 
-
H
 
Y
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
T
S
 
S
G
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
S
S
 
A
G
 
G
M
 
H
R
 
T
K
 
K
V
 
L
G
 
D
L
 
I
K
 
D
E
 
R
R
 
K
P
 
-
R
 
-
T
 
N
I
 
L
P
 
I
Q
 
N
K
 
K
Q
 
Q
A
 
V
T
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
P
F
 
F
L
 
L
M
 
I
H
 
S
A
 
V
W
 
Y
E
 
N
E
 
E
A
 
L
F
 
L
D
 
A
K
 
K
F
 
F
D
 
N
I
 
K
L
 
L
T
 
G
A
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
K
D
 
D
L
 
F
A
 
D
H
 
S
R
 
R
H
 
K
R
 
A
Y
 
T
L
 
K
N
 
H
A
 
A
R
 
K
N
 
N
T
 
A
L
 
I
E
 
D
T
 
M
L
 
M
L
 
I
D
 
N
W
 
L
N
 
G
I
 
I
I
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
V
 
T
V
 
A
V
 
I
E
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
V
F
 
F
G
 
G
D
 
D
N
 
N
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
Y
I
 
A
A
 
T
G
 
H
L
 
F
V
 
F
G
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
V
N
 
I
L
 
L
T
x
S
D
|
D
T
x
I
Q
 
D
G
 
G
L
x
F
Y
|
Y
D
 
D
C
 
K
D
x
N
P
|
P
R
 
S
F
 
E
H
 
F
R
 
S
D
 
D
A
 
A
N
 
K
L
 
R
I
 
L
R
 
E
V
 
K
V
 
I
R
 
T
G
 
H
F
 
I
S
 
K
P
 
E
K
 
E
L
 
W
L
 
L
A
 
H
C
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
G
T
|
T
G
 
G
G
|
G
M
 
I
W
 
V
S
 
T
K
|
K
V
 
L
N
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
F
C
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
H
G
 
N
I
 
K
P
 
K
M
 
M
V
 
F
I
 
L
A
 
A
P
 
S
G
 
G
R
 
F
E
 
D
K
 
L
D
 
S
V
 
V
-
 
A
-
 
K
L
 
T
L
 
F
R
 
L
L
 
L
F
 
E
Q
 
D
G
 
K
E
 
Q
V
 
I
L
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F

7wx3B Gk domain of drosophila p5cs filament with glutamate, atp, and NADPH (see paper)
34% identity, 62% coverage: 37:292/412 of query aligns to 7:256/258 of 7wx3B

query
sites
7wx3B
S
 
S
W
 
Q
F
 
L
G
 
K
R
 
Y
C
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
L
V
 
V
L
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
I
T
 
T
-
 
R
-
 
E
G
 
D
P
 
N
R
 
H
G
 
G
L
 
L
D
 
A
R
 
L
V
 
G
M
 
R
I
 
L
H
 
A
R
 
S
L
 
I
S
 
V
D
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
C
R
 
H
Q
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
M
L
 
M
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
A
S
 
F
G
 
G
M
 
K
R
 
Q
K
 
K
V
 
L
G
 
A
-
 
Q
-
x
E
-
 
L
-
 
L
-
x
M
-
 
S
L
|
L
K
x
S
E
x
M
R
|
R
P
 
E
R
 
T
T
 
L
I
 
N
P
 
L
Q
 
E
K
 
P
Q
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
G
L
 
L
M
 
M
H
 
S
A
 
L
W
 
Y
E
 
D
E
 
A
A
 
M
F
 
F
D
 
A
K
 
Q
F
 
Y
D
 
G
I
 
V
L
 
K
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
K
E
 
P
D
 
D
L
 
F
A
 
Y
H
 
N
R
 
E
H
 
E
R
 
T
Y
 
R
L
 
N
N
 
N
A
 
L
R
 
F
N
 
C
T
 
T
L
 
L
E
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
S
W
 
L
N
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
I
N
|
N
E
x
T
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
V
 
S
V
 
P
E
 
P
E
x
M
-
 
F
I
 
I
K
 
P
F
 
I
G
 
K
D
 
D
N
|
N
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
M
I
 
L
A
 
A
G
 
A
L
 
E
V
 
V
G
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
I
N
 
L
L
 
M
T
 
S
D
 
D
T
 
V
Q
 
D
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
D
 
N
C
 
-
D
 
K
P
 
P
R
 
P
F
 
W
H
 
E
R
 
D
D
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
L
I
 
M
R
 
H
V
 
T
V
 
Y
R
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
T
T
 
S
P
 
D
Q
 
D
P
 
S
G
 
N
S
 
S
V
 
I
G
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
M
 
M
W
 
D
S
 
S
K
 
K
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
R
 
W
C
 
A
L
 
L
A
 
D
S
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
S
M
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
C
P
 
N
G
 
G
R
 
M
E
 
Q
K
 
E
D
 
K
V
 
A
L
 
I
L
 
K
R
 
T
L
 
I
F
 
I
Q
 
G
G
 
G
E
 
R
V
 
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
F

7f5xA Gk domain of drosophila p5cs filament with glutamate (see paper)
33% identity, 62% coverage: 37:292/412 of query aligns to 7:234/236 of 7f5xA

query
sites
7f5xA
S
 
S
W
 
Q
F
 
L
G
 
K
R
 
Y
C
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
L
V
 
V
L
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
I
T
 
T
-
 
R
-
 
E
G
 
D
P
 
N
R
 
H
G
 
G
L
 
L
D
 
A
R
 
L
V
 
G
M
 
R
I
 
L
H
 
A
R
 
S
L
 
I
S
 
V
D
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
C
R
 
H
Q
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
M
L
 
M
V
 
V
S
 
T
S
|
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
A
S
 
F
G
 
G
M
 
K
R
 
Q
K
 
K
V
 
L
G
 
A
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
S
L
 
L
K
 
S
E
 
M
R
 
R
P
 
P
R
 
R
T
 
-
I
 
-
P
 
-
Q
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
G
L
 
L
M
 
M
H
 
S
A
 
L
W
 
Y
E
 
D
E
 
A
A
 
M
F
 
F
D
 
A
K
 
Q
F
 
Y
D
 
G
I
 
V
L
 
K
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
K
E
 
P
D
 
D
L
 
F
A
 
Y
H
 
N
R
 
E
H
 
E
R
 
T
Y
 
R
L
 
N
N
 
N
A
 
L
R
 
F
N
 
C
T
 
T
L
 
L
E
 
S
T
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
S
W
 
L
N
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
I
N
|
N
E
 
T
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
V
V
 
S
V
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
F
 
-
G
 
P
D
 
D
N
 
N
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
M
I
 
L
A
 
A
G
 
A
L
 
E
V
 
V
G
 
Q
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
I
N
 
L
L
 
M
T
 
S
D
 
D
T
 
V
Q
 
D
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
D
 
N
C
 
-
D
 
K
P
 
P
R
 
P
F
 
W
H
 
E
R
 
D
D
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
L
I
 
M
R
 
H
V
 
T
V
 
Y
R
 
T
G
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
M
 
-
W
 
-
S
 
S
K
 
K
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
R
 
W
C
 
A
L
 
L
A
 
D
S
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
S
M
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
C
P
 
N
G
 
G
R
 
M
E
 
Q
K
 
E
D
 
K
V
 
A
L
 
I
L
 
K
R
 
T
L
 
I
F
 
I
Q
 
G
G
 
G
E
 
R
V
 
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
F

8j0gB Gk monomer complexes with glutamate and atp
32% identity, 62% coverage: 43:299/412 of query aligns to 8:274/274 of 8j0gB

query
sites
8j0gB
R
 
K
R
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
V
K
|
K
V
 
V
G
|
G
S
x
T
A
|
A
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
P
 
K
R
 
G
G
 
G
L
 
-
D
 
-
R
 
R
V
 
L
M
 
A
I
 
L
H
 
G
R
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
S
 
C
D
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
N
Q
 
S
R
 
D
G
 
G
H
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
 
S
G
 
G
A
|
A
V
 
V
A
 
G
S
 
L
G
 
G
M
 
R
R
 
Q
K
 
R
V
 
L
G
 
R
L
x
Y
K
 
R
E
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
 
N
-
 
S
-
 
S
-
x
F
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
Q
R
 
K
P
 
P
R
 
Q
T
 
M
I
 
E
P
 
L
Q
 
D
K
 
G
Q
 
K
A
 
A
T
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
S
L
 
L
M
 
M
H
 
A
A
 
Y
W
 
Y
E
 
E
E
 
T
A
 
M
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
F
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
T
T
 
V
A
 
A
Q
 
Q
I
 
M
L
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
D
E
 
S
D
 
S
L
 
F
A
 
R
H
 
D
R
 
K
H
 
D
R
 
F
Y
 
R
L
 
K
N
 
Q
A
 
L
R
 
S
N
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
K
T
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
R
W
 
M
N
 
R
I
 
V
I
 
I
P
 
P
I
 
V
I
 
F
N
|
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
I
V
 
S
V
 
T
E
 
R
E
 
R
I
 
T
K
 
G
-
 
I
F
 
F
G
 
W
D
 
D
N
|
N
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
L
L
 
E
V
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
I
N
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
T
x
V
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
T
C
x
G
D
 
P
P
|
P
R
 
S
-
 
D
-
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
H
-
 
T
F
 
F
H
 
I
R
 
K
D
 
E
A
 
K
N
 
H
L
 
Q
I
 
D
R
 
E
V
 
I
V
 
T
R
x
F
G
 
G
F
 
E
S
 
K
P
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
G
T
x
R
G
|
G
G
|
G
M
|
M
W
 
T
S
 
A
K
|
K
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
V
R
 
N
C
 
A
L
 
A
A
 
Y
S
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
M
 
V
V
 
I
I
 
I
A
 
T
P
 
S
G
 
G
R
 
Y
E
 
A
K
 
A
D
 
E
V
 
N
L
 
I
L
 
S
R
 
K
L
 
V
F
 
L
Q
 
R
G
 
G
E
 
L
V
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
L
 
H
P
 
Q
K
 
D
E
 
A
R
 
H
L
 
L
Y
 
W

8j0eB Gk monomer complexes with catalytic intermediate
31% identity, 65% coverage: 34:299/412 of query aligns to 1:269/269 of 8j0eB

query
sites
8j0eB
D
 
D
R
 
R
P
 
S
S
 
R
W
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
K
-
 
D
C
 
V
R
 
K
R
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
V
K
|
K
V
 
V
G
|
G
S
x
T
A
|
A
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
P
 
K
R
 
G
G
 
G
L
 
-
D
 
-
R
 
R
V
 
L
M
 
A
I
 
L
H
 
G
R
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
S
 
C
D
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
N
Q
 
S
R
 
D
G
 
G
H
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
|
S
G
|
G
A
 
A
V
|
V
A
 
G
S
 
L
G
 
G
M
 
R
R
 
Q
K
 
R
V
 
L
G
 
R
L
x
Y
K
 
R
E
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
 
N
-
x
S
-
 
S
-
x
F
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
x
Q
R
 
K
P
 
P
R
 
Q
T
 
M
I
 
E
P
 
L
Q
 
D
K
 
G
Q
 
K
A
 
A
T
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
S
L
 
L
M
 
M
H
 
A
A
 
Y
W
 
Y
E
 
E
E
 
T
A
 
M
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
F
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
T
T
 
V
A
 
A
Q
 
Q
I
 
M
L
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
D
E
 
S
D
 
S
L
 
F
A
 
R
H
 
D
R
 
K
H
 
D
R
 
F
Y
 
R
L
 
K
N
 
Q
A
 
L
R
 
S
N
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
K
T
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
R
W
 
M
N
 
R
I
 
V
I
 
I
P
 
P
I
 
V
I
 
F
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
I
V
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
S
I
 
T
K
 
R
F
 
F
G
 
W
D
 
D
N
|
N
D
|
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
L
L
 
E
V
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
I
N
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
T
x
V
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
T
C
 
G
D
 
P
P
|
P
R
 
S
F
 
D
H
 
S
R
 
T
D
 
S
A
 
K
N
 
L
L
 
I
I
 
H
R
 
T
V
 
F
V
 
I
R
 
K
G
 
E
F
 
K
S
 
H
P
 
Q
K
 
D
L
 
E
L
 
I
A
 
T
C
 
F
A
 
G
T
 
E
P
x
K
Q
x
R
P
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
|
G
G
|
G
M
|
M
W
 
T
S
 
A
K
 
K
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
V
R
 
N
C
 
A
L
 
A
A
 
Y
S
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
M
 
V
V
 
I
I
 
I
A
 
T
P
 
S
G
 
G
R
 
Y
E
 
A
K
 
A
D
 
E
V
 
N
L
 
I
L
 
S
R
 
K
L
 
V
F
 
L
Q
 
R
G
 
G
E
 
L
V
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
L
 
H
P
 
Q
K
 
D
E
 
A
R
 
H
L
 
L
Y
 
W

8j0fA Gk tetramer with adjacent hooks at reaction state (see paper)
32% identity, 65% coverage: 33:299/412 of query aligns to 1:268/270 of 8j0fA

query
sites
8j0fA
V
 
I
D
 
D
R
 
R
P
 
S
S
 
R
W
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
K
-
 
D
C
 
V
R
 
K
R
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
V
K
|
K
V
 
V
G
 
G
S
x
T
A
|
A
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
P
 
K
R
 
G
G
 
G
L
 
-
D
 
-
R
 
R
V
 
L
M
 
A
I
 
L
H
 
G
R
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
S
 
C
D
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
N
Q
 
S
R
 
D
G
 
G
H
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
S
|
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
G
S
 
L
G
 
G
M
 
R
R
 
Q
K
 
R
V
 
L
G
 
R
L
 
Y
K
 
R
E
 
Q
-
x
L
-
x
V
-
x
N
-
x
S
-
x
S
-
x
F
-
x
A
-
 
D
-
x
L
-
 
Q
R
 
K
P
 
P
R
 
Q
T
 
M
I
 
E
P
 
L
Q
 
D
K
 
G
Q
 
K
A
 
A
T
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
S
L
 
L
M
 
M
H
 
A
A
 
Y
W
 
Y
E
 
E
E
 
T
A
 
M
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
F
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
T
T
 
V
A
 
A
Q
 
Q
I
 
M
L
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
D
E
 
S
D
 
S
L
 
F
A
 
R
H
 
D
R
 
K
H
 
D
R
 
F
Y
 
R
L
 
K
N
 
Q
A
 
L
R
 
S
N
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
K
T
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
R
W
 
M
N
 
R
I
 
V
I
 
I
P
 
P
I
 
V
I
 
F
N
 
N
E
 
E
N
 
N
D
|
D
T
 
A
V
 
I
V
 
S
V
 
T
E
 
R
E
 
-
I
 
-
K
 
-
F
 
-
G
 
W
D
 
D
N
|
N
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
L
L
 
E
V
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
I
N
 
L
L
 
L
T
 
S
D
|
D
T
x
V
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
D
 
T
C
x
G
D
 
P
P
 
P
R
 
S
F
 
-
H
 
D
R
 
S
D
 
T
A
 
S
N
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
H
V
 
T
V
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
F
L
 
I
A
 
K
C
 
E
A
 
K
T
 
H
P
 
Q
Q
 
D
P
 
E
G
 
I
S
 
T
V
x
F
G
 
G
T
 
E
-
x
R
G
|
G
G
|
G
M
|
M
W
 
T
S
 
A
K
 
K
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
V
R
 
N
C
 
A
L
 
A
A
 
Y
S
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
M
 
V
V
 
I
I
 
I
A
 
T
P
 
S
G
 
G
R
 
Y
E
 
A
K
 
A
D
 
E
V
 
N
L
 
I
L
 
S
R
 
K
L
 
V
F
 
L
Q
 
R
G
 
G
E
 
L
V
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
L
 
H
P
 
Q
K
 
D
E
 
A
R
 
H
L
 
L
Y
 
W

Query Sequence

>WP_084057039.1 NCBI__GCF_900176285.1:WP_084057039.1
MELEIEKVATSQNTLDQEGSRSPATIIANGDSVDRPSWFGRCRRVVLKVGSAVLTGPRGL
DRVMIHRLSDQVAELRQRGHEVVLVSSGAVASGMRKVGLKERPRTIPQKQATAAIGQTFL
MHAWEEAFDKFDILTAQILLTNEDLAHRHRYLNARNTLETLLDWNIIPIINENDTVVVEE
IKFGDNDQLSALIAGLVGADLVVNLTDTQGLYDCDPRFHRDANLIRVVRGFSPKLLACAT
PQPGSVGTGGMWSKVNAAKRCLASGIPMVIAPGREKDVLLRLFQGEVLGTLFLPKERLYH
GKKVWLANLPKPAGDLVLDPGAVRALQKSGKSLLPIGIRQVRGSFGVGAPVRCLSEDGTL
VGVGLTNYKASEIDKIKGHHSDDIETLIGYKHSDEVIHRNNFVLVDPPVNGM

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory