SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084058000.1 NCBI__GCF_900176285.1:WP_084058000.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:268/270 of query aligns to 7:271/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
D
 
D
T
 
S
A
 
Y
T
 
T
V
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
G
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
I
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
A
L
 
V
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
S
P
 
P
E
 
S
R
 
R
L
 
I
V
 
K
V
 
T
F
 
A
D
 
I
V
 
H
S
 
S
R
 
N
E
 
P
R
 
A
L
 
R
E
 
R
H
 
T
L
 
A
E
 
F
G
 
E
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
T
R
 
V
A
 
L
E
 
S
T
 
S
L
 
N
S
 
D
A
 
D
C
 
V
A
 
V
Q
 
R
A
 
D
S
 
S
Q
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
V
V
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
N
 
L
M
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
L
S
 
K
M
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
L
T
 
L
P
 
T
H
 
K
R
 
D
P
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
I
 
M
Q
 
K
T
 
D
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
W
L
 
A
P
 
G
Q
 
H
G
 
E
I
 
-
P
 
R
V
 
F
I
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
V
Q
 
G
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
L
 
M
A
 
S
R
 
L
G
 
G
T
 
G
H
 
A
A
 
A
E
 
T
D
 
E
T
 
E
H
 
D
M
 
A
E
 
N
A
 
L
A
 
I
L
 
S
T
 
Q
L
 
L
F
 
F
R
 
G
S
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
K
A
 
I
H
 
W
E
 
K
L
 
A
D
 
D
E
 
D
K
 
K
L
 
Y
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
Y
H
 
L
F
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
A
M
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
S
L
 
L
V
 
A
V
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
I
 
A
L
 
T
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
I
 
I
H
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
H
V
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
A
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
I
I
 
L
M
 
M
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
A
 
E
L
 
L

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:268/270 of query aligns to 7:271/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
D
 
D
T
 
S
A
 
Y
T
 
T
V
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
G
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
I
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
A
L
 
V
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
S
P
 
P
E
 
S
R
 
R
L
 
I
V
 
K
V
 
T
F
 
A
D
 
I
V
x
H
S
|
S
R
x
N
E
 
P
R
 
A
L
 
R
E
 
R
H
 
T
L
 
A
E
 
F
G
 
E
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
T
R
 
V
A
 
L
E
 
S
T
 
S
L
x
N
S
 
D
A
 
D
C
 
V
A
 
V
Q
 
R
A
 
D
S
 
S
Q
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
V
V
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
N
x
L
M
 
L
G
 
K
E
 
D
V
|
V
L
 
V
E
 
L
S
 
K
M
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
L
T
 
L
P
 
T
H
 
K
R
 
D
P
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
I
 
M
Q
 
K
T
 
D
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
W
L
 
A
P
 
G
Q
 
H
G
 
E
I
 
-
P
 
R
V
 
F
I
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
V
Q
 
G
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
L
 
M
A
 
S
R
 
L
G
 
G
T
 
G
H
 
A
A
 
A
E
 
T
D
 
E
T
 
E
H
 
D
M
 
A
E
 
N
A
 
L
A
 
I
L
 
S
T
 
Q
L
 
L
F
 
F
R
 
G
S
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
K
A
 
I
H
 
W
E
 
K
L
 
A
D
 
D
E
 
D
K
 
K
L
 
Y
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
Y
H
 
L
F
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
A
M
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
S
L
 
L
V
 
A
V
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
I
 
A
L
 
T
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
H
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
H
V
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
A
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
I
I
 
L
M
 
M
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
A
 
E
L
 
L

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:268/270 of query aligns to 7:271/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
D
 
D
T
 
S
A
 
Y
T
 
T
V
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
G
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
I
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
A
L
 
V
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
S
P
 
P
E
 
S
R
 
R
L
 
I
V
 
K
V
 
T
F
 
A
D
 
I
V
x
H
S
 
S
R
 
N
E
 
P
R
 
A
L
 
R
E
 
R
H
 
T
L
 
A
E
 
F
G
 
E
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
T
R
 
V
A
 
L
E
 
S
T
 
S
L
x
N
S
 
D
A
 
D
C
 
V
A
 
V
Q
 
R
A
 
D
S
 
S
Q
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
V
V
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
N
x
L
M
 
L
G
 
K
E
 
D
V
|
V
L
 
V
E
 
L
S
 
K
M
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
L
T
 
L
P
 
T
H
 
K
R
 
D
P
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
A
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
I
 
M
Q
 
K
T
 
D
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
W
L
 
A
P
 
G
Q
 
H
G
 
E
I
 
-
P
 
R
V
 
F
I
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
V
Q
 
G
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
L
 
M
A
 
S
R
 
L
G
 
G
T
 
G
H
 
A
A
 
A
E
 
T
D
 
E
T
 
E
H
 
D
M
 
A
E
 
N
A
 
L
A
 
I
L
 
S
T
 
Q
L
 
L
F
 
F
R
 
G
S
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
K
A
 
I
H
 
W
E
 
K
L
 
A
D
 
D
E
 
D
K
 
K
L
 
Y
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
Y
H
 
L
F
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
A
M
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
S
L
 
L
V
 
A
V
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
I
 
A
L
 
T
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
H
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
H
V
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
A
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
I
I
 
L
M
 
M
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
A
 
E
L
 
L

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:268/270 of query aligns to 7:271/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
D
 
D
T
 
S
A
 
Y
T
 
T
V
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
G
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
I
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
A
L
 
V
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
S
P
 
P
E
 
S
R
 
R
L
 
I
V
 
K
V
 
T
F
 
A
D
 
I
V
 
H
S
 
S
R
 
N
E
 
P
R
 
A
L
 
R
E
 
R
H
 
T
L
 
A
E
 
F
G
 
E
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
T
R
 
V
A
 
L
E
 
S
T
 
S
L
 
N
S
 
D
A
 
D
C
 
V
A
 
V
Q
 
R
A
 
D
S
 
S
Q
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
V
V
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
N
 
L
M
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
L
S
 
K
M
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
L
T
 
L
P
 
T
H
 
K
R
 
D
P
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
I
 
M
Q
 
K
T
 
D
I
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
W
L
 
A
P
 
G
Q
 
H
G
 
E
I
 
-
P
 
R
V
 
F
I
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
V
Q
 
G
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
L
 
M
A
 
S
R
 
L
G
 
G
T
 
G
H
 
A
A
 
A
E
 
T
D
 
E
T
 
E
H
 
D
M
 
A
E
 
N
A
 
L
A
 
I
L
 
S
T
 
Q
L
 
L
F
 
F
R
 
G
S
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
K
A
 
I
H
 
W
E
 
K
L
 
A
D
 
D
E
 
D
K
 
K
L
 
Y
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
Y
H
 
L
F
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
A
M
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
S
L
 
L
V
 
A
V
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
I
 
A
L
 
T
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
K
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
H
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
H
V
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
A
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
I
I
 
L
M
 
M
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
A
 
E
L
 
L

8tcuA Structure of pycr1 complexed with 2-chloro-5-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 5:275/279 of 8tcuA

query
sites
8tcuA
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
 
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8td9A Structure of pycr1 complexed with nadh and l-pipecolic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 2:272/279 of 8td9A

query
sites
8td9A
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
x
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
x
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8tddA Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(furan-2-yl)acetic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 1:271/278 of 8tddA

query
sites
8tddA
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
x
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8td6B Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(methylthio)acetic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 4:274/281 of 8td6B

query
sites
8td6B
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
 
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
x
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
N
x
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8td3A Structure of pycr1 complexed with nadh and (s)-tetrahydro-2h-pyran-2- carboxylic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 4:274/281 of 8td3A

query
sites
8td3A
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
x
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
N
x
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 5:275/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
 
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8td4A Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiolane-2-carboxylic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 1:271/279 of 8td4A

query
sites
8td4A
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
x
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
x
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8tcvB Structure of pycr1 complexed with 4-bromobenzene-1,3-dicarboxylic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 4:274/279 of 8tcvB

query
sites
8tcvB
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
 
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8td5A Structure of pycr1 complexed with nadh and tetrahydrothiophene-2- carboxylic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 5:275/280 of 8td5A

query
sites
8td5A
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
x
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
x
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
x
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8td1A Structure of pycr1 complexed with 3-(6-oxa-9-azaspiro(4.5)decane-9- carbonyl)benzoic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 5:275/280 of 8td1A

query
sites
8td1A
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
 
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8td0A Structure of pycr1 complexed with 5-oxo-7a-phenyl-hexahydropyrrolo[2, 1-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 5:275/280 of 8td0A

query
sites
8td0A
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
 
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8tczA Structure of pycr1 complexed with 2-(pyridin-2-yl)cyclopropane-1- carboxylic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 5:275/280 of 8tczA

query
sites
8tczA
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
I
V
 
M
V
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
R
 
L
E
 
A
R
 
T
L
 
V
E
 
S
H
 
A
L
 
L
E
 
R
G
 
-
A
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
K
R
 
L
A
 
T
E
 
P
T
 
H
L
 
N
S
 
K
A
 
E
C
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
Q
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
N
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
S
 
E
M
 
I
A
 
G
P
 
A
S
 
D
T
 
I
P
 
E
H
 
D
R
 
R
P
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
I
Q
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
G
 
F
I
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
A
E
 
Q
D
 
V
T
 
E
H
 
D
M
 
G
E
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
E
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
H
 
T
E
 
E
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
L
 
F
H
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
R
P
 
R
V
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
I
 
L
L
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
G
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
S
E
 
G
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
A
 
E
L
 
L

8tcxA Structure of pycr1 complexed with 2,4-dioxo-1,2,3,4- tetrahydroquinazoline-6-carboxylic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:268/270 of query aligns to 5:275/280 of 8tcxA

query
sites
8tcxA
L
 
F
D
 
Q
T
 
S
A
 
M
T
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
F
L
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
H
R