SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084296009.1 NCBI__GCF_003046325.1:WP_084296009.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:370/382 of query aligns to 7:386/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
R
 
N
K
|
K
P
 
D
L
 
L
T
 
I
L
x
K
T
 
D
G
 
I
S
x
N
A
 
R
L
 
Y
A
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
N
A
 
L
L
 
I
V
 
R
E
 
E
R
 
K
G
 
G
P
 
E
S
 
I
T
 
T
R
 
R
P
x
T
Q
 
E
L
 
I
G
 
A
Q
 
K
D
 
K
L
 
C
G
 
D
L
 
F
S
 
G
R
 
M
P
x
S
T
|
T
M
 
L
S
 
T
A
 
Y
A
 
I
M
 
L
A
 
D
E
 
D
L
 
L
M
 
Q
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
I
V
 
I
E
 
L
P
 
E
I
 
G
G
 
A
S
 
E
V
 
T
H
 
S
G
 
S
G
x
T
M
x
G
G
|
G
R
|
R
R
|
R
A
|
A
V
x
K
E
 
L
Y
 
V
R
 
R
V
 
F
A
 
N
T
 
K
H
 
D
A
 
Y
G
 
G
H
 
F
V
 
V
I
 
V
A
 
S
V
 
V
D
 
K
A
 
V
G
 
E
S
 
E
T
 
E
H
 
Q
I
 
L
R
 
L
L
 
F
R
 
A
L
 
L
S
 
T
T
 
D
L
 
L
D
 
N
R
 
A
R
 
E
L
 
I
L
 
I
H
 
E
A
 
N
S
 
T
L
 
-
H
 
-
P
 
S
L
 
I
P
 
P
K
 
F
S
 
S
Q
 
S
Y
 
E
S
 
K
L
 
K
T
 
P
P
 
E
Q
 
E
I
 
A
S
 
I
S
 
E
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
N
V
 
V
A
 
K
E
 
K
A
 
M
L
 
C
E
 
-
K
 
-
T
 
G
E
 
N
A
 
R
D
 
D
W
 
M
G
 
N
P
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
G
M
 
V
V
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
I
P
 
S
T
 
G
R
 
L
V
 
V
V
 
N
G
 
R
P
 
K
E
 
K
G
 
G
D
 
-
T
 
T
A
 
V
A
 
I
T
 
R
D
 
S
Q
 
T
E
 
M
V
 
L
I
 
G
F
 
W
T
 
E
N
 
N
F
 
V
A
 
A
P
 
L
P
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
H
-
 
F
P
 
P
Q
 
D
V
 
I
D
 
P
C
 
V
T
 
Y
L
 
V
V
 
D
N
 
K
N
 
N
V
 
I
N
 
N
C
 
C
A
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
H
 
W
Y
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
G
R
 
K
G
 
Q
R
 
S
Q
 
N
T
 
N
F
 
F
A
 
A
F
 
T
M
 
V
Q
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
A
K
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
R
Q
 
Q
I
 
I
L
 
Y
P
 
Y
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
T
T
 
T
F
 
I
P
 
Q
F
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
G
T
 
Y
P
 
K
V
x
C
-
 
H
-
x
C
-
 
G
-
 
Q
P
 
K
G
 
G
E
x
C
A
 
L
E
 
E
R
 
M
Y
 
Y
I
 
A
G
 
S
T
 
E
E
 
F
A
 
Y
F
 
F
M
 
R
T
 
N
R
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
V
 
L
R
 
K
A
 
E
D
 
A
W
 
Y
P
 
P
E
 
T
S
 
S
S
 
E
-
 
L
G
 
N
R
 
D
P
 
F
P
 
H
A
 
F
D
 
D
T
 
K
Y
 
V
E
 
A
L
 
K
L
 
S
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
D
G
 
E
D
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
M
H
 
G
V
 
K
E
 
M
G
 
G
H
 
E
A
 
Y
A
 
-
E
 
-
I
 
L
G
 
G
A
 
Y
V
 
G
I
 
I
A
 
R
I
 
N
C
 
I
V
 
I
S
 
N
V
 
T
I
 
F
D
 
N
P
 
P
-
 
E
G
 
K
L
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
V
G
 
G
G
 
E
G
 
G
Y
 
L
G
 
H
A
 
H
S
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
F
R
 
L
P
 
T
K
 
K
V
 
I
E
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
A
R
 
S
H
 
Q
-
 
N
-
 
F
-
 
F
-
 
S
-
 
G
L
 
A
A
 
G
F
 
F
P
 
E
A
 
T
E
 
E
I
 
I
T
 
T
T
 
T
S
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
E
 
P
A
 
A
T
 
W
V
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
A
R
 
L
L
 
L
A
 
V
V
 
I

Sites not aligning to the query:

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
28% identity, 52% coverage: 173:372/382 of query aligns to 98:304/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
A
 
A
P
 
H
P
 
F
P
 
P
Q
 
D
V
 
I
D
 
P
C
 
V
T
 
Y
L
 
V
V
 
D
N
 
K
N
|
N
V
 
I
N
 
N
C
 
C
A
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
H
 
W
Y
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
G
R
 
K
G
 
Q
R
 
S
Q
 
N
T
 
N
F
 
F
A
 
A
F
 
T
M
 
V
Q
x
S
V
|
V
G
 
G
V
 
A
K
x
G
I
x
L
G
|
G
L
 
L
G
 
S
L
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
R
Q
 
Q
I
 
I
L
 
Y
P
 
Y
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
 
G
E
|
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
T
T
 
T
F
 
I
P
 
Q
F
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
G
T
 
Y
P
 
K
V
x
C
-
 
H
-
x
C
-
 
G
-
 
Q
P
 
K
G
 
G
E
x
C
A
 
L
E
|
E
R
 
M
Y
 
Y
I
 
A
G
 
S
T
 
E
E
 
F
A
 
Y
F
 
F
M
 
R
T
 
N
R
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
V
 
L
R
 
K
A
 
E
D
 
A
W
 
Y
P
 
P
E
 
L
S
 
N
S
 
D
G
 
F
R
 
H
P
 
-
P
 
-
A
 
F
D
 
D
T
 
K
Y
 
V
E
 
A
L
 
K
L
 
S
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
D
G
 
E
D
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
M
H
 
G
V
 
K
E
 
M
G
 
G
H
 
E
A
 
Y
A
 
-
E
 
-
I
 
L
G
 
G
A
 
Y
V
 
G
I
 
I
A
 
R
I
 
N
C
 
I
V
 
I
S
 
N
V
 
T
I
 
F
D
 
N
P
 
P
-
 
E
G
 
K
L
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
V
G
 
G
G
x
E
G
 
G
Y
 
L
G
 
H
A
 
H
S
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
F
R
 
L
P
 
T
K
 
K
V
 
I
E
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
A
R
 
S
H
 
Q
-
 
N
-
 
F
-
 
F
-
 
S
-
 
G
L
 
A
A
 
G
F
 
F
P
 
E
A
 
T
E
 
E
I
 
I
T
 
T
T
 
T
S
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
E
 
P
A
 
A
T
x
W
V
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
A
R
 
L
L
 
L
A
 
V
V
 
I
D
 
H
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
20% identity, 92% coverage: 15:365/382 of query aligns to 11:377/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
V
 
V
L
 
Y
R
 
K
A
 
L
L
 
I
V
 
D
E
 
Q
R
 
K
G
 
G
P
 
P
S
 
I
T
 
S
R
 
R
P
 
I
Q
 
D
L
 
L
G
 
S
Q
 
K
D
 
E
L
 
S
G
 
E
L
 
L
S
 
A
R
 
P
P
 
A
T
 
S
M
 
I
S
 
T
A
 
K
A
 
I
M
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
G
 
H
L
 
L
V
 
I
E
 
H
P
 
E
I
 
T
G
 
-
S
 
T
V
 
V
H
 
Q
G
 
E
G
 
A
M
 
I
-
 
S
-
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
P
A
 
A
V
 
V
E
 
G
Y
 
L
R
 
Q
V
 
T
A
 
N
T
 
N
H
 
L
A
 
G
G
 
W
H
 
Q
V
 
F
I
 
L
A
 
S
V
 
M
D
 
R
A
 
L
G
 
G
S
 
R
T
 
G
H
 
Y
I
 
L
R
 
T
L
 
I
R
 
A
L
 
L
S
 
H
T
 
E
L
 
L
D
 
G
R
 
G
R
 
E
L
 
V
L
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
T
H
 
K
A
 
I
S
 
D
L
 
I
H
 
H
P
 
E
L
 
I
P
 
D
K
 
Q
S
 
D
Q
 
D
Y
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
I
 
V
S
 
L
S
 
A
V
 
R
V
 
L
A
 
L
A
 
F
A
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
F
L
 
F
E
 
Q
K
 
T
T
 
Y
E
 
A
A
 
A
D
 
Q
W
 
L
G
 
D
P
 
R
L
 
V
L
 
T
A
 
S
M
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
T
I
 
L
P
 
P
T
 
G
R
 
L
V
 
V
V
 
N
G
 
S
P
 
E
E
 
Q
G
 
G
D
 
I
T
 
V
A
 
L
A
 
Q
T
 
M
D
 
P
Q
 
H
E
 
Y
V
 
N
I
 
V
F
 
-
T
 
K
N
 
N
F
 
L
A
 
A
P
 
L
P
 
G
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
D
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
P
C
 
V
T
 
F
L
 
V
V
 
A
N
 
N
N
 
D
V
 
T
N
 
R
C
 
A
A
 
W
A
 
A
V
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
K
H
 
L
Y
 
F
G
 
G
A
 
H
A
 
S
R
 
Q
G
 
D
R
 
V
Q
 
D
T
 
N
F
 
S
A
 
V
F
 
L
M
 
I
Q
 
S
V
 
I
G
 
H
V
 
H
K
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
A
G
 
G
L
 
I
M
 
V
L
 
L
N
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
V
 
R
N
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
I
T
 
Q
F
 
I
P
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
x
C
-
 
H
-
x
C
-
 
G
-
 
N
F
 
Y
A
 
G
P
x
C
G
 
L
L
 
E
T
 
T
P
 
V
V
 
A
P
 
S
G
 
S
E
 
Q
A
 
A
E
 
I
R
 
R
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
D
A
 
Q
F
 
V
M
 
T
T
 
A
R
 
R
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
D
 
G
W
 
E
P
 
P
E
 
S
S
 
C
S
 
L
G
 
A
R
 
T
P
 
V
P
 
E
A
 
E
D
 
I
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
-
 
D
L
 
I
L
 
C
A
 
A
R
 
A
A
 
A
G
 
A
E
 
D
G
 
G
D
 
D
A
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
V
R
 
D
H
 
V
V
 
I
E
 
Q
G
 
Q
H
 
L
A
 
G
A
 
R
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
I
C
 
V
V
 
I
S
 
N
V
 
L
I
 
F
D
 
N
P
 
P
G
 
E
L
 
K
V
 
I
V
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
V
Y
 
I
G
 
N
-
 
Q
A
 
A
S
 
K
P
 
S
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
P
 
P
K
 
S
V
 
I
E
 
E
E
 
Q
V
 
C
V
 
I
R
 
R
H
 
E
L
 
Q
A
 
S
F
 
L
P
 
P
A
 
V
-
 
Y
-
 
H
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
E
 
K
I
 
L
T
 
V
T
 
E
S
 
S
T
 
R
L
 
F
A
 
Y
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
M
L
 
P
G
 
G
A
 
A

7p9lAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 41% coverage: 184:338/382 of query aligns to 105:267/303 of 7p9lAAA

query
sites
7p9lAAA
N
|
N
N
x
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
A
 
F
A
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
E
Y
 
A
H
 
W
Y
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
E
Q
 
P
T
 
S
F
 
V
A
 
L
F
 
G
M
 
L
Q
 
I
V
 
L
G
|
G
V
x
T
K
x
G
I
x
V
G
|
G
L
 
G
G
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
F
N
 
N
G
 
G
Q
 
K
I
 
V
L
 
H
P
 
S
G
 
G
V
 
R
N
 
A
G
 
N
A
 
I
A
 
A
G
 
G
E
|
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
T
 
R
F
 
L
P
 
P
F
 
Y
A
 
D
P
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
E
P
 
N
V
 
A
P
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
P
-
x
C
-
 
G
-
x
C
-
 
K
-
 
N
-
 
S
G
 
G
E
x
C
A
 
I
E
x
D
R
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
S
T
 
G
E
 
R
A
 
G
F
 
F
M
 
E
T
 
Q
R
 
L
V
 
Y
R
 
D
A
 
H
D
 
Y
W
 
F
P
 
S
E
 
E
S
 
K
S
 
L
G
 
S
R
 
A
P
 
P
P
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
|
E
L
 
I
L
 
I
A
 
A
R
x
H
A
 
Y
G
 
E
E
 
Q
G
 
G
D
 
E
A
 
R
T
 
R
A
 
A
L
 
V
R
 
Q
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
R
H
 
F
A
 
M
A
 
E
E
 
L
I
 
L
G
 
A
A
 
I
V
 
C
I
 
L
A
 
A
I
 
N
C
 
I
V
 
F
S
 
T
V
 
C
I
 
L
D
 
D
P
 
P
G
 
H
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
G
 
S
A
 
N
S
 
F
P
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
Y
P
 
Q
K
 
E
V
 
L

Sites not aligning to the query:

7p7wBBB Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 41% coverage: 184:338/382 of query aligns to 108:270/306 of 7p7wBBB

query
sites
7p7wBBB
N
 
N
N
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
A
 
F
A
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
E
Y
 
A
H
 
W
Y
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
E
Q
 
P
T
 
S
F
 
V
A
 
L
F
 
G
M
 
L
Q
 
I
V
 
L
G
|
G
V
x
T
K
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
F
N
 
N
G
 
G
Q
 
K
I
 
V
L
 
H
P
 
S
G
 
G
V
 
R
N
 
A
G
 
N
A
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
T
 
R
F
 
L
P
 
P
F
 
Y
A
 
D
P
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
E
P
 
N
V
 
A
P
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
P
-
x
C
-
 
G
-
x
C
-
 
K
-
 
N
-
 
S
G
 
G
E
x
C
A
 
I
E
 
D
R
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
S
T
x
G
E
 
R
A
 
G
F
 
F
M
x
E
T
 
Q
R
 
L
V
 
Y
R
 
D
A
 
H
D
 
Y
W
 
F
P
 
S
E
 
E
S
 
K
S
 
L
G
 
S
R
 
A
P
 
P
P
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
E
L
 
I
L
 
I
A
 
A
R
 
H
A
 
Y
G
 
E
E
 
Q
G
 
G
D
 
E
A
 
R
T
 
R
A
 
A
L
 
V
R
 
Q
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
R
H
 
F
A
 
M
A
 
E
E
 
L
I
 
L
G
 
A
A
 
I
V
 
C
I
 
L
A
 
A
I
 
N
C
 
I
V
 
F
S
 
T
V
 
C
I
 
L
D
 
D
P
 
P
G
 
H
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
Y
 
L
G
 
S
A
x
N
S
 
F
P
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
Y
P
 
Q
K
 
E
V
 
L

7p9pAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 41% coverage: 184:338/382 of query aligns to 106:268/304 of 7p9pAAA

query
sites
7p9pAAA
N
 
N
N
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
A
 
F
A
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
E
Y
 
A
H
 
W
Y
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
E
Q
 
P
T
 
S
F
 
V
A
 
L
F
 
G
M
 
L
Q
 
I
V
 
L
G
|
G
V
x
T
K
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
F
N
 
N
G
 
G
Q
 
K
I
 
V
L
 
H
P
 
S
G
 
G
V
 
R
N
 
A
G
 
N
A
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
T
 
R
F
 
L
P
 
P
F
 
Y
A
 
D
P
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
E
P
 
N
V
 
A
P
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
P
-
x
C
-
 
G
-
x
C
-
 
K
-
 
N
-
 
S
G
 
G
E
x
C
A
 
I
E
 
D
R
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
S
T
x
G
E
 
R
A
 
G
F
 
F
M
x
E
T
 
Q
R
 
L
V
 
Y
R
 
D
A
 
H
D
 
Y
W
 
F
P
 
S
E
 
E
S
 
K
S
 
L
G
 
S
R
x
A
P
 
P
P
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
|
E
L
 
I
L
 
I
A
 
A
R
x
H
A
 
Y
G
 
E
E
 
Q
G
 
G
D
 
E
A
 
R
T
 
R
A
 
A
L
 
V
R
 
Q
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
R
H
 
F
A
 
M
A
 
E
E
 
L
I
 
L
G
 
A
A
 
I
V
 
C
I
 
L
A
 
A
I
 
N
C
 
I
V
 
F
S
 
T
V
 
C
I
 
L
D
 
D
P
 
P
G
 
H
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
Y
 
L
G
 
S
A
x
N
S
 
F
P
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
Y
P
 
Q
K
 
E
V
 
L

Sites not aligning to the query:

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
28% identity, 49% coverage: 182:370/382 of query aligns to 114:320/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
L
 
L
V
 
D
N
|
N
N
 
D
V
 
A
N
|
N
C
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
E
Y
 
R
H
 
W
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
G
R
 
E
G
 
N
R
 
N
Q
 
P
T
 
D
F
 
V
A
 
I
F
 
F
M
 
I
Q
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
T
K
 
G
I
 
V
G
 
G
L
x
G
G
 
G
L
 
I
M
 
V
L
 
A
N
 
A
G
 
G
Q
 
K
I
 
L
L
 
L
P
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
C
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
G
 
G
H
|
H
I
 
V
T
 
T
F
 
V
P
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
x
C
-
 
T
-
x
C
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
x
C
-
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
S
F
 
S
A
 
A
P
 
T
G
 
G
L
 
V
T
 
V
P
 
R
V
 
V
P
 
A
G
 
R
E
 
H
A
 
L
E
 
S
R
 
E
Y
 
E
I
 
F
G
 
A
T
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
E
M
 
L
T
 
K
R
 
Q
V
 
A
R
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
G
P
 
Q
E
 
D
S
 
V
S
 
S
G
 
S
R
 
K
P
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
V
Y
 
F
E
 
E
L
 
F
L
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
G
 
E
E
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
H
T
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
M
H
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
R
H
 
V
A
 
C
A
 
F
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
L
V
 
A
I
 
T
A
 
G
I
 
N
C
 
L
V
 
G
S
 
N
V
 
T
I
 
L
D
 
N
P
 
P
G
 
D
L
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
G
 
S
A
 
A
S
 
A
-
 
G
P
 
E
L
 
F
L
 
L
R
 
R
P
 
S
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
K
V
 
Y
V
 
F
R
 
Q
H
 
E
L
 
F
A
 
T
F
 
F
P
 
P
-
 
Q
-
 
V
-
 
R
-
 
N
-
 
S
A
 
T
E
 
K
I
 
I
T
 
K
T
 
L
S
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
N
E
 
E
A
 
A
T
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
A
R
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L

6jdbA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac-6p and adp from haemophilus influenzae
27% identity, 50% coverage: 182:371/382 of query aligns to 100:287/290 of 6jdbA

query
sites
6jdbA
L
 
L
V
 
L
N
|
N
N
x
D
V
 
A
N
 
Q
C
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
Y
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
H
 
Q
Y
 
L
G
 
Q
A
 
N
A
 
F
R
 
E
G
 
Q
R
 
V
Q
 
S
T
 
N
F
 
F
A
 
V
F
 
F
M
 
I
Q
 
T
V
 
V
G
x
S
V
x
T
K
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
L
 
I
M
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
Q
Q
 
I
I
 
L
L
 
Q
P
 
T
G
 
G
V
 
S
N
 
R
G
 
G
A
 
I
A
 
A
G
 
G
E
x
H
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
-
T
 
-
F
 
-
P
 
T
F
 
L
A
 
A
P
 
D
G
 
P
L
 
N
T
 
G
P
 
A
V
 
I
P
x
C
G
 
G
E
x
C
A
 
G
E
 
R
R
 
R
Y
 
G
I
x
C
G
 
-
T
 
V
E
|
E
A
 
A
F
 
I
M
 
A
T
 
S
R
 
G
V
 
R
R
 
A
A
 
I
D
 
E
W
 
A
P
 
V
E
 
S
S
 
S
S
 
Q
G
 
W
R
 
E
P
 
D
P
 
P
A
 
C
D
 
D
T
x
P
Y
x
K
E
 
E
L
 
V
L
 
F
A
 
E
R
 
R
A
 
F
G
 
R
E
 
K
G
 
N
D
 
D
A
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
T
R
 
A
H
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
R
H
 
S
A
 
A
A
 
K
E
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
N
V
 
L
I
 
I
A
 
A
I
 
D
C
 
L
V
 
V
S
 
I
V
 
S
I
 
L
D
 
D
P
 
I
G
 
Q
L
 
K
V
 
I
V
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
x
S
Y
 
V
G
 
G
A
 
L
S
 
A
P
 
E
L
 
G
L
 
Y
R
 
L
P
 
S
K
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
K
V
 
Y
V
 
L
R
 
Q
H
 
D
L
 
F
-
 
P
-
 
S
A
 
I
F
 
Y
P
 
C
A
 
C
E
 
E
I
 
I
T
 
E
T
 
T
S
 
A
T
 
K
L
 
F
A
 
G
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
T
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
A
R
 
Y
L
 
W
A
 
V
V
 
K
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6jdoA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase with amp-pnp from pasteurella multocida
30% identity, 50% coverage: 182:371/382 of query aligns to 101:288/293 of 6jdoA

query
sites
6jdoA
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
D
V
 
V
N
 
Q
C
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
C
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
H
 
K
Y
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
K
R
 
N
G
 
A
R
 
V
Q
 
Q
T
 
N
F
 
F
A
 
V
F
 
F
M
 
I
Q
 
T
V
 
V
G
x
S
V
x
T
K
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
L
 
I
M
 
I
L
 
L
N
 
E
G
 
R
Q
 
R
I
 
L
L
 
L
P
 
T
G
 
E
V
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
H
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
T
 
-
F
 
-
P
 
-
F
 
L
A
 
A
P
 
D
G
 
P
L
 
N
T
 
G
P
 
P
V
 
V
P
x
C
G
 
G
E
 
-
A
x
C
E
 
G
R
|
R
Y
 
V
I
 
G
G
 
C
T
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
V
M
 
A
T
 
A
R
x
G
V
 
R
R
 
A
A
 
I
D
 
E
W
 
A
P
 
V
E
 
S
S
 
S
S
 
Q
G
 
W
R
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
C
-
 
T
-
x
P
-
 
K
D
 
Q
T
 
A
Y
x
F
E
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
-
R
 
R
A
 
K
G
 
N
E
 
D
G
 
E
D
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
-
H
 
-
V
 
I
E
 
Q
G
 
R
H
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
N
V
 
L
I
 
I
A
 
A
I
 
D
C
 
L
V
 
V
S
 
I
V
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
V
G
 
Q
L
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
x
S
Y
 
V
G
 
G
A
 
L
S
 
A
P
 
E
L
 
G
L
 
Y
R
 
L
P
 
P
K
 
L
V
 
V
E
 
K
E
 
Q
V
 
Y
V
 
L
R
 
N
H
 
T
L
 
M
-
 
P
-
 
H
A
 
F
F
 
Y
P
 
H
A
 
C
E
 
T
I
 
V
T
 
E
T
 
Q
S
 
A
T
 
R
L
 
H
A
 
G
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
A
R
 
W
L
 
W
A
 
V
V
 
A
D
 
D

6jdhA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase from pasteurella multocida
30% identity, 50% coverage: 182:371/382 of query aligns to 101:288/293 of 6jdhA

query
sites
6jdhA
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
D
V
 
V
N
 
Q
C
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
C
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
H
 
K
Y
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
K
R
 
N
G
 
A
R
 
V
Q
 
Q
T
 
N
F
 
F
A
 
V
F
 
F
M
 
I
Q
 
T
V
 
V
G
 
S
V
 
T
K
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
L
 
I
M
 
I
L
 
L
N
 
E
G
 
R
Q
 
R
I
 
L
L
 
L
P
 
T
G
 
E
V
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
H
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
T
 
-
F
 
-
P
 
-
F
 
L
A
 
A
P
 
D
G
 
P
L
 
N
T
 
G
P
 
P
V
 
V
P
x
C
G
 
G
E
 
-
A
x
C
E
 
G
R
 
R
Y
 
V
I
 
G
G
x
C
T
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
V
M
 
A
T
 
A
R
 
G
V
 
R
R
 
A
A
 
I
D
 
E
W
 
A
P
 
V
E
 
S
S
 
S
S
 
Q
G
 
W
R
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
C
-
 
T
-
 
P
-
 
K
D
 
Q
T
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
-
R
 
R
A
 
K
G
 
N
E
 
D
G
 
E
D
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
-
H
 
-
V
 
I
E
 
Q
G
 
R
H
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
A
I
 
I
G
 
A
A
 
N
V
 
L
I
 
I
A
 
A
I
 
D
C
 
L
V
 
V
S
 
I
V
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
V
G
 
Q
L
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
S
Y
 
V
G
 
G
A
 
L
S
 
A
P
 
E
L
 
G
L
 
Y
R
 
L
P
 
P
K
 
L
V
 
V
E
 
K
E
 
Q
V
 
Y
V
 
L
R
 
N
H
 
T
L
 
M
-
 
P
-
 
H
A
 
F
F
 
Y
P
 
H
A
 
C
E
 
T
I
 
V
T
 
E
T
 
Q
S
 
A
T
 
R
L
 
H
A
 
G
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
A
R
 
W
L
 
W
A
 
V
V
 
A
D
 
D

Q93LQ8 Beta-glucoside kinase; EC 2.7.1.85 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
25% identity, 52% coverage: 169:365/382 of query aligns to 81:281/297 of Q93LQ8

query
sites
Q93LQ8
F
 
F
T
 
D
N
 
N
F
 
F
A
 
A
P
 
M
P
 
K
P
 
S
Q
 
W
V
 
L
D
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
P
C
 
V
T
 
S
L
 
V
V
 
E
N
 
N
N
x
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
A
 
V
A
 
L
V
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
H
 
W
Y
 
Q
G
 
G
A
 
K
A
 
A
R
 
A
G
 
E
R
 
M
Q
 
A
T
 
N
F
 
F
A
 
L
F
 
V
M
 
L
Q
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
T
K
x
G
I
 
I
G
|
G
L
 
G
G
 
A
L
 
I
M
 
F
L
 
C
N
 
Q
G
 
H
Q
 
Q
I
 
L
L
 
I
P
 
N
G
 
G
V
 
A
N
 
R
G
 
F
A
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
 
Y
I
 
M
T
 
-
F
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
L
T
 
T
P
 
D
V
 
R
P
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
R
E
 
D
A
 
P
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
I
 
S
G
 
M
T
 
N
E
 
E
A
 
N
F
 
C
M
 
T
T
 
L
R
 
R
V
 
V
-
 
L
R
 
R
A
 
H
D
 
R
W
 
Y
P
 
A
E
 
Q
S
 
H
S
 
I
G
 
G
R
 
A
P
 
P
-
 
L
P
 
D
A
 
S
D
 
V
T
 
T
Y
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
I
-
 
F
A
 
D
R
 
R
A
 
Y
G
 
D
E
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
P
T
 
V
A
 
C
L
 
Q
R
 
R
H
 
L
V
 
V
E
 
A
G
 
E
H
 
F
A
 
F
A
 
N
E
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
H
V
 
G
I
 
L
A
 
Y
I
 
N
C
 
L
V
 
V
S
 
H
V
 
I
I
 
F
D
 
D
P
 
P
G
 
Q
L
 
T
V
 
I
V
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
G
 
V
A
 
E
S
 
R
P
 
P
L
 
G
L
 
F
R
 
L
P
 
T
K
 
L
V
 
L
E
 
R
E
 
Q
V
 
H
V
 
L
R
 
A
H
 
W
L
 
F
A
 
G
F
 
I
P
 
A
A
 
D
E
 
Y
I
 
L
T
 
D
T
 
T
S
 
V
T
 
S
L
 
H
A
 
G
A
 
N
E
 
D
A
 
A
T
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
34% identity, 36% coverage: 182:319/382 of query aligns to 102:236/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
L
 
L
V
 
E
N
 
N
N
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
H
 
H
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
R
 
E
Q
 
E
T
 
S
F
 
S
A
 
L
F
 
Y
M
 
L
Q
 
T
V
 
V
G
 
S
V
 
T
K
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
G
G
 
G
L
 
V
M
 
V
L
 
L
N
 
G
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
E
N
 
R
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
T
 
T
F
 
L
P
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
G
A
 
P
E
 
A
R
x
C
Y
 
G
I
x
C
G
 
G
T
 
L
E
 
E
A
 
G
F
x
C
M
 
L
T
 
E
R
 
A
V
 
L
R
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
R
D
 
D
W
 
A
P
 
T
E
 
Y
S
 
A
S
 
F
G
 
Q
R
 
R
P
 
-
P
 
P
A
 
V
D
 
D
T
 
T
Y
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
R
R
 
L
A
 
F
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
P
T
 
K
A
 
A
L
 
E
R
 
R
H
 
L
V
 
V
E
 
L
G
 
Q
H
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
Y
I
 
V
G
 
G
A
 
I
V
 
G
I
 
L
A
 
A
I
 
S
C
 
L
V
 
V
S
 
K
V
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
P

Q8ZPZ9 N-acetyl-D-glucosamine kinase; GlcNAc kinase; EC 2.7.1.59 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
24% identity, 69% coverage: 83:345/382 of query aligns to 5:273/303 of Q8ZPZ9

query
sites
Q8ZPZ9
V
 
F
D
 
D
A
 
I
G
 
G
S
 
G
T
 
T
H
 
K
I
 
I
R
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
V
S
 
F
T
 
D
L
 
S
D
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
Q
H
 
W
A
 
E
S
 
K
L
 
R
H
 
V
P
 
P
L
 
T
P
 
P
K
 
H
S
 
T
Q
 
S
Y
 
Y
S
 
S
L
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
I
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
A
V
 
F
A
 
L
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
C
E
 
E
A
 
L
L
 
V
E
 
E
K
 
E
T
 
A
E
 
D
A
 
Q
D
 
R
W
 
F
G
 
G
P
 
V
L
 
K
L
 
G
A
 
S
M
 
V
V
 
G
I
 
I
A
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
G
R
 
M
V
 
P
V
 
E
G
 
T
P
 
E
E
 
D
G
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
D
 
N
T
 
V
A
 
P
A
 
A
T
 
A
D
 
S
Q
 
G
E
 
K
V
 
P
I
 
L
F
 
R
T
 
A
N
 
D
F
 
L
A
 
S
P
 
A
P
 
R
P
 
L
Q
 
D
V
 
R
D
 
D
C
 
V
T
 
R
L
 
L
V
 
D
N
 
N
N
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
A
 
F
A
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
E
Y
 
A
H
 
W
Y
 
D
G
 
D
A
 
E
A
 
F
R
 
T
G
 
Q
R
 
Y
Q
 
P
T
 
L
F
 
V
A
 
M
F
 
G
M
 
L
Q
 
I
V
 
L
G
 
G
V
 
T
K
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
L
 
L
M
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
K
I
 
P
L
 
I
P
 
T
G
 
G
V
 
Q
N
 
S
G
 
Y
A
 
I
A
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
M
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
M
-
 
G
-
 
F
T
 
D
F
 
F
P
 
P
F
 
L
A
 
R
P
 
R
G
x
C
L
 
G
T
x
C
P
 
G
V
 
Q
P
 
M
G
 
G
E
x
C
A
 
I
E
 
E
R
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
S
T
 
G
E
 
R
A
 
G
F
 
F
M
 
A
T
 
W
R
 
L
V
 
Y
R
 
Q
A
 
H
D
 
Y
W
 
Y
P
 
D
E
 
Q
S
 
S
S
 
L
G
 
Q
R
 
A
P
 
P
P
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
E
L
 
I
L
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
W
G
 
E
E
 
Q
G
 
G
D
 
D
A
 
E
T
 
Q
A
 
A
L
 
H
R
 
A
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
R
H
 
Y
A
 
L
A
 
D
E
 
L
I
 
L
G
 
A
A
 
V
V
 
C
I
 
L
A
 
G
I
 
N
C
 
I
V
 
L
S
 
T
V
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
G
 
S
A
 
N
S
 
F
P
 
T
L
 
A
L
 
I
R
 
T
P
 
T
K
 
Q
V
 
L
-
 
A
E
 
E
E
 
R
V
 
L
V
 
P
R
 
R
H
 
H
L
 
L

2ap1A Crystal structure of the putative regulatory protein
24% identity, 69% coverage: 83:345/382 of query aligns to 7:275/305 of 2ap1A

query
sites
2ap1A
V
 
F
D
 
D
A
 
I
G
 
G
S
 
G
T
 
T
H
 
K
I
 
I
R
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
V
S
 
F
T
 
D
L
 
S
D
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
Q
H
 
W
A
 
E
S
 
K
L
 
R
H
 
V
P
 
P
L
 
T
P
 
P
K
 
H
S
 
T
Q
 
S
Y
 
Y
S
 
S
L
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
I
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
A
V
 
F
A
 
L
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
C
E
 
E
A
 
L
L
 
V
E
 
E
K
 
E
T
 
A
E
 
D
A
 
Q
D
 
R
W
 
F
G
 
G
P
 
V
L
 
K
L
 
G
A
 
S
M
 
V
V
 
G
I
 
I
A
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
G
R
 
M
V
 
P
V
 
E
G
 
T
P
 
E
E
 
D
G
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
D
 
N
T
 
V
A
 
P
A
 
A
T
 
A
D
 
S
Q
 
G
E
 
K
V
 
P
I
 
L
F
 
R
T
 
A
N
 
D
F
 
L
A
 
S
P
 
A
P
 
R
P
 
L
Q
 
D
V
 
R
D
 
D
C
 
V
T
 
R
L
 
L
V
 
D
N
 
N
N
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
A
 
F
A
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
E
Y
 
A
H
 
W
Y
 
D
G
 
D
A
 
E
A
 
F
R
 
T
G
 
Q
R
 
Y
Q
 
P
T
 
L
F
 
V
A
 
M
F
 
G
M
 
L
Q
 
I
V
 
L
G
 
G
V
 
T
K
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
L
 
L
M
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
K
I
 
P
L
 
I
P
 
T
G
 
G
V
 
Q
N
 
S
G
 
Y
A
 
I
A
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
M
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
M
-
 
G
-
 
F
T
 
D
F
 
F
P
 
P
F
 
L
A
 
R
P
 
R
G
x
C
L
 
G
T
x
C
P
 
G
V
 
Q
P
 
M
G
 
G
E
x
C
A
 
I
E
 
E
R
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
S
T
 
G
E
 
R
A
 
G
F
 
F
M
 
A
T
 
W
R
 
L
V
 
Y
R
 
Q
A
 
H
D
 
Y
W
 
Y
P
 
D
E
 
Q
S
 
S
S
 
L
G
 
Q
R
 
A
P
 
P
P
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
E
L
 
I
L
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
W
G
 
E
E
 
Q
G
 
G
D
 
D
A
 
E
T
 
Q
A
 
A
L
 
H
R
 
A
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
R
H
 
Y
A
 
L
A
 
D
E
 
L
I
 
L
G
 
A
A
 
V
V
 
C
I
 
L
A
 
G
I
 
N
C
 
I
V
 
L
S
 
T
V
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
G
 
S
A
 
N
S
 
F
P
 
T
L
 
A
L
 
I
R
 
T
P
 
T
K
 
Q
V
 
L
-
 
A
E
 
E
E
 
R
V
 
L
V
 
P
R
 
R
H
 
H
L
 
L

Query Sequence

>WP_084296009.1 NCBI__GCF_003046325.1:WP_084296009.1
MTRKPLTLTGSALAVLRALVERGPSTRPQLGQDLGLSRPTMSAAMAELMEAGLVEPIGSV
HGGMGRRAVEYRVATHAGHVIAVDAGSTHIRLRLSTLDRRLLHASLHPLPKSQYSLTPQI
SSVVAAAVAEALEKTEADWGPLLAMVIAIPTRVVGPEGDTAATDQEVIFTNFAPPPQVDC
TLVNNVNCAAVAEYHYGAARGRQTFAFMQVGVKIGLGLMLNGQILPGVNGAAGEIGHITF
PFAPGLTPVPGEAERYIGTEAFMTRVRADWPESSGRPPADTYELLARAGEGDATALRHVE
GHAAEIGAVIAICVSVIDPGLVVLGGGYGASPLLRPKVEEVVRHLAFPAEITTSTLAAEA
TVLGAERLAVDRAVCVLLGLPA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory