SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084527958.1 NCBI__GCF_001653335.1:WP_084527958.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 2:286/295 of query aligns to 5:282/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
M
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
V
R
 
D
T
 
G
A
 
P
D
 
D
G
 
P
A
 
A
V
 
-
G
 
-
E
 
E
H
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
P
A
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
D
V
 
V
R
 
D
F
 
L
A
 
L
T
 
T
A
 
H
Y
 
I
A
 
G
D
x
R
D
 
D
E
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
R
L
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
E
H
 
Y
L
 
I
A
 
E
G
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
S
|
S
D
x
G
P
 
S
H
 
Q
V
 
T
V
 
A
R
 
D
R
 
R
T
 
T
S
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
T
A
 
A
T
 
R
I
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
T
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
L
D
 
E
W
 
W
R
 
Q
L
 
I
G
 
P
E
 
D
V
 
T
P
 
P
Q
 
P
D
 
V
P
 
A
T
 
P
P
 
P
L
 
L
A
 
L
L
 
V
H
 
H
V
 
T
C
 
G
S
 
S
L
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
R
A
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
C
E
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
A
R
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
A
 
A
R
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
V
T
 
S
Y
 
F
D
 
D
V
 
P
N
 
N
M
 
V
R
 
R
P
 
P
A
 
S
V
 
L
T
 
S
G
 
-
A
 
A
G
 
D
P
 
P
E
 
D
V
 
L
V
 
T
-
 
R
E
 
R
Q
 
R
V
 
I
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
E
L
 
R
A
 
S
D
 
D
L
 
I
V
 
I
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
H
V
 
W
L
 
I
L
 
D
P
 
P
M
 
T
L
 
Q
G
 
P
V
 
P
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
A
L
 
W
L
 
L
S
 
A
L
 
C
G
 
G
P
 
P
R
 
A
A
 
I
V
 
V
V
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
L
G
 
G
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
V
W
 
A
W
 
F
S
 
C
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
P
V
 
A
D
 
S
V
 
V
S
 
P
P
 
-
R
 
-
A
 
A
V
 
Q
E
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
 
F
A
 
M
A
 
A
A
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
D
G
 
T
L
 
L
W
 
W
H
 
E
L
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
A
-
 
D
R
 
R
L
 
R
P
 
T
T
 
E
L
 
L
S
 
R
E
 
K
A
 
I
S
 
G
V
 
V
H
 
S
G
 
A
L
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
A
L
 
L
D
 
E
H
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
L
A
 
T
A
 
S
A
 
A
V
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
A
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
34% identity, 100% coverage: 1:294/295 of query aligns to 8:312/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
M
 
I
M
 
L
V
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
M
V
 
L
-
 
P
R
 
R
T
 
E
A
 
T
D
 
T
G
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
T
A
 
A
V
 
F
G
 
Q
E
 
P
H
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
V
A
 
F
N
 
N
V
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
P
V
 
T
R
 
G
F
 
F
A
 
F
T
 
S
A
 
G
Y
 
I
A
 
S
D
 
S
D
 
D
E
 
F
R
 
F
G
 
G
A
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
R
R
 
D
H
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
R
A
 
S
G
 
N
V
 
V
R
 
D
L
 
Y
A
 
-
S
 
S
D
 
F
P
 
A
H
 
A
V
 
I
V
 
S
R
 
N
R
 
R
T
 
P
S
 
T
T
 
T
A
 
L
E
 
A
A
 
F
T
 
V
I
 
R
G
 
L
T
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
D
 
Y
L
 
D
D
 
E
W
 
N
R
 
T
L
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
M
-
 
L
P
 
S
Q
 
R
D
 
N
P
 
D
T
 
M
P
 
P
L
 
Y
A
 
V
L
 
D
H
 
E
V
 
T
C
 
I
S
 
S
-
 
A
-
 
M
L
 
L
G
 
F
A
 
G
V
 
C
V
 
I
A
 
S
P
 
L
G
 
I
A
 
S
E
 
E
A
 
P
V
 
C
V
 
G
R
 
S
L
 
V
V
 
Y
E
 
E
A
 
T
L
 
L
R
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
-
 
A
-
 
P
-
 
N
-
 
R
T
 
V
I
 
M
T
 
F
Y
 
L
D
 
D
V
 
P
N
 
N
M
 
I
R
 
R
P
 
A
A
 
N
V
 
L
T
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
R
P
 
K
E
 
T
V
 
H
V
 
L
E
 
T
Q
 
R
V
 
M
E
 
K
R
 
R
L
 
M
V
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
D
V
 
W
L
 
F
L
 
G
P
 
E
M
 
K
L
 
G
G
 
S
V
 
H
E
 
D
D
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
A
R
 
E
L
 
W
L
 
L
S
 
K
L
 
L
G
 
G
P
 
P
R
 
K
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
I
T
|
T
R
 
K
G
|
G
A
|
A
E
 
H
G
|
G
A
 
A
T
 
V
W
 
A
W
 
Y
S
 
T
E
 
N
A
 
H
G
 
A
A
 
T
V
 
V
D
 
P
V
 
V
S
 
P
P
 
G
R
 
V
A
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
x
V
A
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
A
G
 
S
L
 
L
W
 
H
H
 
S
L
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
T
G
 
K
R
 
D
-
 
A
L
 
L
P
 
A
T
 
N
L
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
D
S
 
Q
V
 
I
H
 
H
G
 
S
L
 
A
L
 
V
D
 
A
H
 
L
A
 
G
S
x
V
R
 
R
A
 
A
A
|
A
A
 
A
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
P
 
P
P
 
P
Y
 
W
R
 
A
S
 
H
E
 
E
L
 
M

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
30% identity, 84% coverage: 3:250/295 of query aligns to 6:266/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
V
 
L
V
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
V
 
V
D
|
D
V
 
L
V
 
I
R
 
P
T
 
D
A
 
G
D
 
Q
G
 
Q
A
 
H
V
 
Y
G
 
L
E
 
K
H
 
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
 
P
A
 
A
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
R
 
G
P
 
R
V
 
S
R
 
A
F
 
F
A
 
F
T
 
G
A
 
R
Y
 
V
A
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
F
L
 
M
A
 
Q
R
 
Q
H
 
T
L
 
L
A
 
T
G
 
D
A
 
E
G
 
Q
V
 
V
-
 
D
-
 
C
-
 
Q
R
 
H
L
 
L
A
 
H
S
 
F
D
 
D
P
 
P
H
 
-
V
 
-
V
 
V
R
 
H
R
 
R
T
 
T
S
 
S
T
 
T
A
 
V
E
 
V
A
 
V
T
 
D
I
 
L
G
 
D
T
 
E
D
x
H
G
 
G
G
 
E
A
 
R
S
 
S
Y
x
F
V
 
T
F
|
F
-
 
M
-
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
S
-
 
A
D
 
D
L
 
Q
D
 
F
W
 
L
R
 
Q
L
 
L
G
 
S
E
 
D
V
 
I
P
 
P
Q
 
S
D
 
F
P
 
Q
T
 
K
P
 
G
L
 
E
A
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
C
 
C
S
 
S
L
 
I
G
 
A
A
 
L
V
 
A
V
 
N
A
 
Q
P
 
P
G
 
S
A
 
R
E
 
S
A
 
S
V
 
T
V
 
F
R
 
A
L
 
A
V
 
I
E
 
A
A
 
Q
L
 
M
R
 
K
-
 
E
A
 
V
R
 
G
T
 
G
T
 
Y
I
 
V
T
 
S
Y
 
F
D
 
D
V
 
P
N
 
N
M
 
L
R
|
R
P
 
E
A
 
E
V
 
V
T
 
W
G
 
S
A
 
E
G
 
P
P
 
Q
E
 
E
V
 
L
V
 
Q
E
 
A
Q
 
T
V
 
V
E
 
M
R
 
R
L
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
V
 
F
L
 
L
L
 
T
P
 
G
M
 
T
L
 
Q
G
 
S
V
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
G
A
 
L
R
 
Q
R
 
A
L
 
I
L
 
A
S
 
D
L
 
F
G
 
Q
P
 
I
R
 
P
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
L
W
 
V
W
 
A
S
 
T
E
 
P
A
 
N
G
 
S
A
 
Q
V
 
Q
D
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
G
R
 
K
A
|
A
V
|
V
E
 
K
V
 
P
A
 
I
D
 
D
T
|
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
A
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
Y
G
 
R
L
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
W
 
W
H
 
H

Sites not aligning to the query:

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
30% identity, 84% coverage: 3:250/295 of query aligns to 10:270/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
V
 
L
V
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
V
 
V
D
|
D
V
 
L
V
 
I
R
 
P
T
 
D
A
 
G
D
 
Q
G
 
Q
A
 
H
V
 
Y
G
 
L
E
 
K
H
 
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
 
P
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
R
 
G
P
 
R
V
 
S
R
 
A
F
 
F
A
 
F
T
 
G
A
 
R
Y
 
V
A
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
F
L
 
M
A
 
Q
R
 
Q
H
 
T
L
 
L
A
 
T
G
 
D
A
 
E
G
 
Q
V
 
V
-
 
D
-
 
C
-
 
Q
R
 
H
L
 
L
A
 
H
S
 
F
D
 
D
P
 
P
H
 
-
V
 
-
V
 
V
R
 
H
R
 
R
T
 
T
S
 
S
T
 
T
A
 
V
E
 
V
A
 
V
T
 
D
I
 
L
G
 
D
T
 
E
D
 
C
G
 
G
G
 
E
A
 
R
S
 
S
Y
x
F
V
 
T
F
|
F
-
 
M
-
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
S
-
 
A
D
 
D
L
 
Q
D
 
F
W
 
L
R
 
Q
L
 
L
G
 
S
E
 
D
V
 
I
P
 
P
Q
 
S
D
 
F
P
 
Q
T
 
K
P
 
G
L
 
E
A
 
W
L
 
L
H
 
H
V
 
V
C
 
C
S
 
S
L
 
I
G
 
A
A
 
L
V
 
A
V
 
N
A
 
Q
P
 
P
G
 
S
A
 
R
E
 
S
A
 
S
V
 
T
V
 
F
R
 
A
L
 
A
V
 
I
E
 
A
A
 
Q
L
 
M
R
 
K
-
 
E
A
 
V
R
 
G
T
 
G
T
 
Y
I
 
V
T
 
S
Y
 
F
D
 
D
V
 
P
N
 
N
M
 
L
R
|
R
P
 
E
A
 
E
V
 
V
T
 
W
G
 
S
A
 
E
G
 
P
P
 
Q
E
 
E
V
 
L
V
 
Q
E
 
A
Q
 
T
V
 
V
E
 
M
R
 
R
L
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
K
|
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
V
 
F
L
 
L
L
 
T
P
 
G
M
 
T
L
 
Q
G
 
S
V
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
G
A
 
L
R
 
Q
R
 
A
L
 
I
L
 
A
S
 
D
L
 
F
G
 
Q
P
 
I
R
 
P
A
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
L
W
 
V
W
 
A
S
 
T
E
 
P
A
 
N
G
 
S
A
 
Q
V
 
Q
D
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
G
R
 
K
A
|
A
V
|
V
E
 
K
V
 
P
A
 
I
D
 
D
T
 
C
I
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
A
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
Y
G
 
R
L
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
W
 
W
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
30% identity, 94% coverage: 3:280/295 of query aligns to 5:267/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
S
V
 
V
D
|
D
V
 
L
V
 
V
R
 
P
T
 
E
A
 
K
D
 
Q
G
 
N
A
 
S
V
 
Y
G
 
L
E
 
K
H
x
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
A
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
E
V
 
C
R
 
G
F
 
F
A
 
I
T
 
G
A
 
C
Y
 
L
A
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
D
R
 
A
G
 
G
A
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
H
 
V
L
 
F
A
 
Q
G
 
D
A
 
N
G
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
F
-
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
D
S
 
A
D
 
D
P
 
L
H
 
T
V
 
S
V
 
A
R
 
V
R
 
L
T
 
I
S
 
V
T
 
N
A
 
S
E
x
F
A
 
T
T
x
Y
I
 
L
G
 
V
T
 
H
D
 
P
G
 
G
G
 
A
A
 
D
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
S
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
P
 
L
T
 
P
P
 
P
L
 
F
A
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
-
 
W
L
 
F
H
 
Y
V
 
F
C
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
V
 
T
V
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
E
L
 
G
V
 
A
E
 
R
A
 
R
L
 
M
R
 
R
-
 
E
A
 
A
R
 
G
T
 
G
T
 
Y
I
 
V
T
 
L
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
N
|
N
M
 
L
R
|
R
P
 
S
A
 
K
V
x
M
T
 
W
G
 
G
A
 
N
G
 
T
P
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
P
E
 
E
Q
 
L
V
 
I
E
 
A
R
 
R
L
 
S
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
S
L
 
I
V
 
C
K
|
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
x
E
L
 
L
E
 
C
V
 
Q
L
 
L
L
 
S
P
 
G
M
 
A
L
 
S
G
 
H
V
 
W
E
 
Q
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
Y
R
 
Y
L
 
L
L
 
R
S
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
C
R
 
D
A
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
T
x
S
R
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
D
G
|
G
A
 
A
T
 
L
W
 
L
W
 
I
S
 
T
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
E
V
 
F
D
 
H
V
 
F
S
 
P
P
 
A
R
 
P
A
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
A
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
L
L
 
L
P
 
F
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
R
A
 
A
S
 
N
V
 
C
H
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
W
D
 
D
H
 
H
A
 
A
S
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
S

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
30% identity, 94% coverage: 3:280/295 of query aligns to 5:267/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
x
S
V
 
V
D
|
D
V
 
L
V
 
V
R
 
P
T
 
E
A
 
K
D
 
Q
G
 
N
A
 
S
V
 
Y
G
 
L
E
 
K
H
x
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
A
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
E
V
 
C
R
 
G
F
 
F
A
 
I
T
 
G
A
 
C
Y
 
L
A
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
D
R
 
A
G
 
G
A
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
H
 
V
L
 
F
A
 
Q
G
 
D
A
 
N
G
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
F
-
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
D
S
 
A
D
 
D
P
 
L
H
 
T
V
 
S
V
 
A
R
 
V
R
x
L
T
 
I
S
 
V
T
 
N
A
 
S
E
x
F
A
 
T
T
x
Y
I
 
L
G
 
V
T
 
H
D
 
P
G
 
G
G
 
A
A
 
D
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
S
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
P
 
L
T
 
P
P
 
P
L
 
F
A
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
-
 
W
L
 
F
H
 
Y
V
 
F
C
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
V
 
T
V
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
E
L
 
G
V
 
A
E
 
R
A
 
R
L
 
M
R
 
R
-
 
E
A
 
A
R
 
G
T
 
G
T
 
Y
I
 
V
T
 
L
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
L
R
|
R
P
 
S
A
 
K
V
x
M
T
 
W
G
 
G
A
 
N
G
 
T
P
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
P
E
 
E
Q
 
L
V
 
I
E
 
A
R
 
R
L
 
S
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
S
L
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
C
V
 
Q
L
 
L
L
 
S
P
 
G
M
 
A
L
 
S
G
 
H
V
 
W
E
 
Q
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
Y
R
 
Y
L
 
L
L
 
R
S
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
C
R
 
D
A
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
L
W
 
L
W
 
I
S
 
T
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
E
V
 
F
D
 
H
V
 
F
S
 
P
P
 
A
R
 
P
A
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
A
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
L
L
 
L
P
 
F
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
R
A
 
A
S
 
N
V
 
C
H
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
W
D
 
D
H
 
H
A
 
A
S
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
S

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
31% identity, 94% coverage: 3:280/295 of query aligns to 9:278/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
V
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
V
D
|
D
V
 
L
V
 
V
R
 
P
T
 
E
A
 
K
D
 
Q
G
 
N
A
 
S
V
 
Y
G
 
L
E
 
K
H
 
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
A
A
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
E
V
 
C
R
 
G
F
 
F
A
 
I
T
 
G
A
 
C
Y
 
L
A
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
D
R
 
A
G
 
G
A
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
H
 
V
L
 
F
A
 
Q
G
 
D
A
 
N
G
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
F
-
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
D
S
 
A
D
 
D
P
 
L
H
 
T
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
L
V
 
I
V
 
V
R
 
N
R
 
L
T
 
T
S
 
A
T
 
D
A
 
G
E
 
E
A
 
R
T
 
S
I
 
F
G
 
T
T
x
Y
-
 
L
-
 
V
-
 
H
D
 
P
G
 
G
G
 
A
A
 
D
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
S
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
P
 
L
T
 
P
P
 
P
L
 
F
A
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
-
 
W
L
 
F
H
 
Y
V
 
F
C
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
V
 
T
V
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
E
L
 
G
V
 
A
E
 
R
A
 
R
L
 
M
R
 
R
-
 
E
A
 
A
R
 
G
T
 
G
T
 
Y
I
 
V
T
 
L
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
L
R
|
R
P
 
S
A
 
K
V
 
M
T
 
W
G
 
G
A
 
N
G
 
T
P
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
P
E
 
E
Q
 
L
V
 
I
E
 
A
R
 
R
L
 
S
V
x
A
A
|
A
L
 
L
A
|
A
D
 
S
L
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
C
V
 
Q
L
 
L
L
 
S
P
 
G
M
 
A
L
 
S
G
 
H
V
 
W
E
 
Q
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
Y
R
 
Y
L
 
L
L
 
R
S
 
D
L
 
L
G
|
G
P
 
C
R
 
D
A
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
L
W
 
L
W
 
I
S
 
T
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
E
V
 
F
D
 
H
V
 
F
S
 
P
P
 
A
R
 
P
A
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
|
D
T
 
T
I
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
A
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
L
L
 
L
P
 
F
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
R
A
 
A
S
 
N
V
 
C
H
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
W
D
 
D
H
 
H
A
 
A
S
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
S

Sites not aligning to the query:

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
27% identity, 83% coverage: 4:248/295 of query aligns to 6:256/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
V
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
I
R
 
S
T
 
V
A
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
D
V
 
L
G
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
K
H
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
A
 
P
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
K
V
 
S
R
 
S
F
 
L
A
 
I
T
 
S
A
 
K
Y
 
V
A
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
A
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
I
R
 
E
H
 
E
L
 
L
A
 
S
G
 
K
A
 
E
G
 
N
V
 
V
R
 
D
-
 
T
-
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
V
S
 
K
D
 
D
P
 
E
H
 
K
V
 
-
V
 
-
R
 
K
R
 
H
T
 
T
S
 
G
T
 
I
A
 
V
E
 
F
A
 
V
T
 
Q
I
 
L
G
 
K
T
 
G
D
 
A
G
 
S
G
 
P
A
 
S
S
 
F
Y
 
L
V
 
L
F
 
Y
D
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
L
 
F
D
 
N
W
 
M
R
 
T
L
 
L
G
 
N
E
 
D
V
 
I
P
 
N
Q
 
W
D
 
D
P
 
I
T
 
V
P
 
E
L
 
E
A
 
A
L
 
-
H
 
K
V
 
I
C
 
V
S
 
N
L
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
R
A
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
R
E
 
E
A
 
T
V
 
V
V
 
M
R
 
K
L
 
V
V
 
I
E
 
K
A
 
K
L
 
I
R
 
K
A
 
G
R
 
S
T
 
S
T
 
L
I
 
I
T
 
A
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
L
R
 
R
P
 
L
A
 
D
V
 
L
-
 
W
T
 
R
G
 
G
A
 
Q
G
 
E
P
 
E
E
 
E
V
 
M
V
 
I
E
 
K
Q
 
V
V
 
L
E
 
E
R
 
E
L
 
S
V
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
-
V
 
L
L
 
Y
L
 
L
P
 
E
M
 
N
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
E
D
 
V
A
 
K
A
 
G
R
 
S
R
 
M
L
 
L
-
 
T
-
 
A
L
 
I
S
x
T
L
 
L
G
|
G
P
 
P
R
 
K
A
 
G
V
 
F
V
 
R
L
 
L
T
 
I
R
 
K
G
 
N
A
 
E
E
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
T
A
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
P
P
 
S
R
 
Y
A
 
N
V
|
V
E
 
N
V
 
P
A
 
L
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
A
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
V
G
 
G
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
27% identity, 83% coverage: 4:248/295 of query aligns to 5:255/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
V
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
I
R
 
S
T
 
V
A
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
D
V
 
L
G
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
K
H
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
A
 
P
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
K
V
 
S
R
 
S
F
 
L
A
 
I
T
 
S
A
 
K
Y
 
V
A
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
A
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
I
R
 
E
H
 
E
L
 
L
A
 
S
G
 
K
A
 
E
G
 
N
V
 
V
R
 
D
-
 
T
-
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
V
S
 
K
D
 
D
P
 
E
H
 
K
V
 
-
V
 
-
R
 
K
R
 
H
T
 
T
S
 
G
T
 
I
A
 
V
E
 
F
A
 
V
T
 
Q
I
 
L
G
 
K
T
 
G
D
 
A
G
 
S
G
 
P
A
 
S
S
 
F
Y
 
L
V
 
L
F
 
Y
D
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
L
 
F
D
 
N
W
 
M
R
 
T
L
 
L
G
 
N
E
 
D
V
 
I
P
 
N
Q
 
W
D
 
D
P
 
I
T
 
V
P
 
E
L
 
E
A
 
A
L
 
-
H
 
K
V
 
I
C
 
V
S
 
N
L
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
R
A
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
R
E
 
E
A
 
T
V
 
V
V
 
M
R
 
K
L
 
V
V
 
I
E
 
K
A
 
K
L
 
I
R
 
K
A
 
G
R
 
S
T
 
S
T
 
L
I
 
I
T
 
A
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
L
R
 
R
P
 
L
A
 
D
V
 
L
-
 
W
T
 
R
G
 
G
A
 
Q
G
 
E
P
 
E
E
 
E
V
 
M
V
 
I
E
 
K
Q
 
V
V
 
L
E
 
E
R
 
E
L
 
S
V
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
-
V
 
L
L
 
Y
L
 
L
P
 
E
M
 
N
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
E
D
 
V
A
 
K
A
 
G
R
 
S
R
 
M
L
 
L
-
 
T
-
 
A
L
 
I
S
x
T
L
 
L
G
|
G
P
 
P
R
 
K
A
 
G
V
 
F
V
 
R
L
 
L
T
 
I
R
 
K
G
 
N
A
 
E
E
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
T
A
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
P
P
 
S
R
 
Y
A
 
N
V
|
V
E
 
N
V
x
P
A
 
L
D
 
D
T
 
T
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
A
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
D
 
V
G
 
G
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
33% identity, 83% coverage: 1:245/295 of query aligns to 5:260/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
M
 
I
M
 
L
V
 
C
V
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
M
V
 
L
-
 
A
R
 
Q
T
 
P
A
 
L
D
 
P
G
 
R
A
 
A
V
 
F
G
 
L
E
 
Q
H
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
A
A
 
P
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
V
 
V
R
 
Q
F
 
F
A
 
V
T
 
G
A
 
M
Y
 
L
A
 
G
D
 
S
D
 
D
E
 
M
R
 
F
G
 
G
A
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
F
R
 
D
H
 
S
L
 
F
A
 
A
G
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
-
L
 
-
A
 
V
S
 
T
D
 
D
P
 
G
H
 
I
V
 
V
V
 
-
R
 
-
R
 
R
T
 
T
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
L
A
 
A
T
 
F
I
 
V
G
 
A
T
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
E
A
 
R
S
 
S
Y
 
F
V
 
S
F
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
L
W
 
F
R
 
R
L
 
V
G
 
-
E
 
E
V
 
H
P
 
F
Q
 
Q
D
 
D
P
 
A
T
 
S
-
 
F
-
 
S
-
 
D
P
 
A
L
 
L
A
 
I
L
 
F
H
 
H
V
 
A
C
 
C
S
 
S
L
 
N
G
 
S
A
 
M
V
 
T
V
 
D
A
 
A
P
 
D
G
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
T
V
 
F
R
 
E
-
 
G
L
 
M
V
 
R
E
 
R
A
 
A
L
 
Q
R
 
A
A
 
A
R
 
G
T
 
A
T
 
I
I
 
V
T
 
S
Y
 
F
D
 
D
V
 
L
N
 
N
M
 
F
R
 
R
P
 
P
A
 
M
V
 
L
T
 
W
G
 
P
A
 
N
G
 
G
P
 
E
E
 
N
V
 
P
V
 
A
E
 
S
Q
 
R
V
 
L
E
 
W
R
 
K
L
 
G
V
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
D
V
 
Y
L
 
L
L
 
A
P
 
N
M
 
T
L
 
L
G
 
A
V
 
A
E
 
D
-
 
A
D
 
N
A
 
A
A
 
V
R
 
I
R
 
Q
L
 
Q
L
 
L
S
 
W
L
 
Q
G
 
G
P
 
R
R
 
A
A
 
Q
V
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
V
R
x
T
G
x
D
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
P
T
 
V
-
 
H
W
 
W
W
 
Y
S
 
T
E
 
R
A
 
T
G
 
A
A
 
G
V
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
P
P
x
T
R
 
F
A
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
A
 
Q
D
 
D
T
 
S
I
 
N
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
A
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
M
V
 
L

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
33% identity, 78% coverage: 22:251/295 of query aligns to 31:265/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
H
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
A
 
E
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
K
V
 
V
R
 
G
F
 
F
A
 
V
T
 
G
A
 
R
Y
 
V
A
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
L
 
V
A
 
E
R
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
R
G
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
L
A
 
T
S
 
H
D
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
-
V
 
F
R
 
R
R
 
R
T
 
A
S
 
P
T
 
G
A
 
F
E
 
T
A
 
G
T
 
L
I
 
Y
G
 
L
T
 
R
D
 
E
G
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
A
 
Q
S
 
G
Y
 
R
V
 
V
F
 
F
D
 
Y
L
 
-
D
 
-
W
 
Y
R
 
R
L
 
K
G
 
G
E
 
S
V
 
A
P
 
G
Q
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
F
D
 
D
P
 
P
T
 
D
P
 
Y
L
 
L
A
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
F
L
 
L
H
 
H
V
 
L
C
 
S
S
 
G
L
 
I
G
 
T
A
 
P
V
 
A
V
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
S
-
 
L
-
 
W
R
 
A
L
 
M
V
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
K
R
 
R
A
 
R
R
 
G
T
 
V
T
 
R
I
 
V
T
 
S
Y
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
Y
R
 
R
P
 
Q
A
 
T
V
 
L
T
 
W
G
 
-
A
 
S
G
 
P
P
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
R
E
 
G
Q
 
F
V
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
P
L
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
L
 
F
P
 
G
M
 
R
L
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
R
R
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
A
R
 
P
A
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
A
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
W
W
 
A
W
 
F
S
 
V
E
 
D
A
 
G
G
 
R
A
 
R
V
 
V
D
 
E
V
 
G
S
 
S
P
x
A
R
x
F
A
 
A
V
|
V
E
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
V
 
L
D
 
A
G
 
G
-
 
A
L
 
V
W
 
W
H
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
33% identity, 78% coverage: 22:251/295 of query aligns to 31:265/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
H
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
 
E
A
 
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
K
V
 
V
R
 
G
F
 
F
A
 
V
T
 
G
A
 
R
Y
 
V
A
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
L
 
V
A
 
E
R
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
R
G
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
L
A
 
T
S
 
H
D
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
-
V
 
F
R
 
R
R
 
R
T
 
A
S
 
P
T
 
G
A
 
F
E
 
T
A
 
G
T
 
L
I
x
Y
G
 
L
T
 
R
D
 
E
G
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
A
 
Q
S
 
G
Y
 
R
V
 
V
F
 
F
D
 
Y
L
 
-
D
 
-
W
 
Y
R
|
R
L
 
K
G
 
G
E
 
S
V
 
A
P
 
G
Q
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
F
D
 
D
P
 
P
T
 
D
P
 
Y
L
 
L
A
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
F
L
 
L
H
 
H
V
 
L
C
 
S
S
 
G
L
 
I
G
 
T
A
 
P
V
 
A
V
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
S
-
 
L
-
 
W
R
 
A
L
 
M
V
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
K
R
 
R
A
 
R
R
 
G
T
 
V
T
 
R
I
 
V
T
 
S
Y
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
Y
R
|
R
P
 
Q
A
 
T
V
 
L
T
 
W
G
 
-
A
 
S
G
 
P
P
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
R
E
 
G
Q
 
F
V
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
P
L
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
L
 
F
P
 
G
M
 
R
L
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
R
R
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
A
R
 
P
A
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
A
|
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
W
W
 
A
W
 
F
S
 
V
E
 
D
A
 
G
G
 
R
A
 
R
V
 
V
D
 
E
V
 
G
S
 
S
P
 
A
R
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
V
 
L
D
 
A
G
 
G
-
 
A
L
 
V
W
 
W
H
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
33% identity, 78% coverage: 22:251/295 of query aligns to 31:265/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
H
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
x
E
A
x
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
K
V
 
V
R
 
G
F
 
F
A
 
V
T
 
G
A
 
R
Y
 
V
A
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
L
 
V
A
 
E
R
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
R
G
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
L
A
 
T
S
 
H
D
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
-
V
 
F
R
 
R
R
 
R
T
 
A
S
 
P
T
 
G
A
 
F
E
 
T
A
 
G
T
 
L
I
 
Y
G
 
L
T
 
R
D
 
E
G
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
A
 
Q
S
 
G
Y
 
R
V
 
V
F
 
F
D
x
Y
L
 
-
D
 
-
W
x
Y
R
|
R
L
 
K
G
 
G
E
 
S
V
 
A
P
 
G
Q
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
F
D
 
D
P
 
P
T
 
D
P
 
Y
L
 
L
A
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
F
L
 
L
H
 
H
V
 
L
C
 
S
S
 
G
L
 
I
G
 
T
A
 
P
V
 
A
V
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
S
-
 
L
-
 
W
R
 
A
L
 
M
V
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
K
R
 
R
A
 
R
R
 
G
T
 
V
T
 
R
I
 
V
T
 
S
Y
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
Y
R
|
R
P
 
Q
A
 
T
V
 
L
T
 
W
G
 
-
A
 
S
G
 
P
P
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
R
E
 
G
Q
 
F
V
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
P
L
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
|
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
L
 
F
P
 
G
M
 
R
L
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
R
R
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
A
R
 
P
A
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
x
K
R
|
R
G
|
G
A
|
A
E
x
K
G
|
G
A
|
A
T
 
W
W
 
A
W
 
F
S
 
V
E
 
D
A
 
G
G
 
R
A
 
R
V
 
V
D
 
E
V
 
G
S
 
S
P
 
A
R
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
I
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
V
 
L
D
 
A
G
 
G
-
 
A
L
 
V
W
 
W
H
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
24% identity, 83% coverage: 1:245/295 of query aligns to 4:262/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
M
 
V
M
 
F
V
 
T
V
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
I
L
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
I
V
 
M
R
 
A
T
 
S
A
 
K
D
 
I
G
 
G
A
 
Q
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
I
-
 
W
V
 
N
G
 
G
E
 
P
H
 
Y
A
 
P
G
 
S
G
 
G
S
 
A
A
 
P
A
 
A
N
 
I
V
 
F
A
 
I
V
 
D
A
 
Q
L
 
V
A
 
T
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
P
V
 
C
R
 
G
F
 
I
A
 
I
T
 
S
A
 
C
Y
 
V
A
 
G
D
 
N
D
 
D
E
 
G
R
 
F
G
 
G
A
 
D
L
 
I
L
 
N
A
 
I
R
 
H
H
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
I
A
 
R
S
 
G
D
 
I
P
 
S
H
 
-
V
 
V
V
 
L
R
 
P
R
 
L
T
 
E
S
 
A
T
 
T
A
 
G
E
 
S
A
 
A
T
 
F
I
 
V
G
 
-
T
 
T
D
 
Y
G
 
G
G
 
D
A
 
R
S
 
D
Y
 
F
V
 
I
F
 
F
D
 
N
L
 
I
D
 
K
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
C
W
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
S
E
 
A
V
 
Q
P
 
H
Q
 
V
D
 
D
P
 
E
T
 
N
P
 
I
L
 
L
A
 
K
-
 
D
-
 
C
-
 
T
-
 
H
L
 
F
H
 
H
V
 
I
C
 
M
S
 
G
L
 
S
G
 
S
A
 
L
V
 
F
V
 
S
A
 
F
P
 
H
G
 
M
A
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
K
R
 
K
L
 
A
V
 
V
E
 
T
A
 
I
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
N
T
 
G
-
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
S
Y
 
F
D
 
D
V
 
P
N
 
N
M
 
I
R
 
R
P
 
K
A
 
E
V
 
M
T
 
L
G
 
D
A
 
I
G
 
-
P
 
P
E
 
E
V
 
M
V
 
R
E
 
D
Q
 
A
V
 
L
E
 
H
R
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
Y
K
 
M
V
 
P
S
|
S
D
 
E
E
 
G
D
 
E
L
 
V
E
 
L
V
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
M
 
H
L
 
S
G
 
T
V
 
P
E
 
E
D
 
R
A
 
A
A
 
I
R
 
A
R
 
G
L
 
F
L
 
L
S
 
E
L
 
E
G
 
G
P
 
V
R
 
K
A
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
V
T
x
K
R
 
R
G
|
G
A
 
N
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
S
W
 
Y
W
 
Y
S
 
S
E
 
A
A
 
N
G
 
E
A
 
Q
V
 
F
D
 
H
V
 
V
S
 
E
P
 
S
R
 
Y
A
 
P
V
 
V
E
 
E
V
x
E
A
 
V
D
 
D
T
 
P
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
C
F
|
F
A
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
W
V
 
I

Sites not aligning to the query:

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
30% identity, 100% coverage: 1:294/295 of query aligns to 2:294/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
M
 
I
M
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
S
A
 
L
L
 
N
V
 
M
D
 
D
V
 
L
V
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
P
R
 
R
T
 
P
A
 
G
D
 
E
G
 
T
A
 
V
V
 
L
G
 
G
E
 
E
-
 
D
-
 
Y
-
 
Q
-
 
T
H
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
K
V
 
V
R
 
R
F
 
M
A
 
L
T
 
G
A
 
R
Y
 
V
A
 
G
D
 
E
D
 
D
E
 
P
R
 
F
G
 
G
A
 
Q
L
 
A
L
 
L
A
 
K
R
 
S
H
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
A
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
V
A
 
A
S
 
W
D
 
V
P
 
L
H
 
E
V
 
T
V
 
P
R
 
G
R
 
P
T
 
S
S
 
G
T
 
T
A
 
G
E
 
F
A
 
I
T
 
L
I
 
V
G
 
D
T
 
P
D
 
E
G
 
G
G
 
Q
A
 
N
S
 
Q
Y
 
I
V
 
A
F
 
V
D
 
A
L
 
P
D
 
G
W
 
A
R
 
N
L
 
A
G
 
R
E
 
L
V
 
V
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
P
 
L
T
 
P
P
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
F
H
 
Q
V
 
-
C
 
-
S
 
G
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
L
P
 
Q
-
 
L
-
 
E
-
 
I
G
 
P
A
 
L
E
 
E
A
 
T
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
-
V
 
A
E
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
R
R
 
K
T
 
A
T
 
G
I
 
A
T
 
R
Y
 
I
D
 
L
V
 
L
N
 
N
M
 
A
R
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
-
T
 
H
G
 
A
A
 
L
G
 
P
P
 
S
E
 
E
V
 
I
V
 
L
E
 
Q
Q
 
S
V
 
V
E
 
D
R
 
L
L
 
L
V
 
L
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
V
V
x
N
K
 
E
V
 
V
S
 
E
D
 
A
E
 
A
D
 
Q
L
 
L
E
 
T
V
 
E
L
 
A
L
 
S
P
 
P
M
 
P
L
 
R
G
 
T
V
 
P
E
 
E
D
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
R
S
 
G
L
 
R
G
 
A
P
 
P
R
 
Q
A
 
A
-
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
|
T
R
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
Q
G
|
G
A
 
A
T
 
V
W
 
W
-
 
S
W
 
G
S
 
T
E
 
E
A
 
E
G
 
S
A
 
H
V
 
F
D
 
P
V
 
A
S
 
F
P
 
P
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
R
V
 
A
A
 
V
D
|
D
T
 
T
I
x
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
|
F
A
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
L
G
 
G
L
 
L
W
 
A
H
 
E
L
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
G
A
 
Q
S
 
N
V
 
M
H
 
R
G
 
A
L
 
A
L
 
L
D
 
R
H
 
F
A
 
A
S
x
N
R
 
A
A
 
A
A
x
G
A
|
A
V
 
L
T
x
A
V
x
T
S
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
P
 
P
-
x
S
-
 
L
P
 
P
Y
 
F
R
 
R
S
 
D
E
 
E
L
 
V

3kd6A Crystal structure of nucleoside kinase from chlorobium tepidum in complex with amp
21% identity, 99% coverage: 1:291/295 of query aligns to 3:280/300 of 3kd6A

query
sites
3kd6A
M
 
L
M
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
E
x
S
A
 
L
L
 
A
V
 
F
D
|
D
V
 
D
V
 
I
R
 
E
T
 
T
A
 
P
D
 
F
G
 
G
A
 
R
V
 
S
G
 
D
E
 
N
H
 
T
A
 
L
G
 
G
G
|
G
S
 
S
A
 
S
A
 
T
N
 
Y
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
S
L
 
A
A
 
S
R
 
Y
L
 
F
-
 
T
G
 
D
R
 
E
P
 
P
V
 
I
R
 
R
F
 
M
-
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
V
A
 
G
T
 
S
A
 
D
Y
 
F
A
 
G
D
 
K
D
 
E
E
 
H
R
 
F
G
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
H
A
 
A
R
 
K
H
 
N
L
 
I
A
 
D
G
 
T
A
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
Q
L
 
V
A
 
I
S
 
E
D
 
D
P
 
G
H
 
K
V
 
T
V
x
F
R
 
R
R
x
W
T
 
A
S
 
G
T
 
R
A
 
Y
E
 
H
A
 
Y
T
 
D
I
 
M
G
 
N
T
 
T
-
x
R
-
 
D
-
 
T
-
 
L
D
 
D
G
 
T
G
 
Q
A
 
L
S
 
N
Y
 
V
V
 
F
F
 
A
D
 
E
L
 
F
D
 
D
W
 
P
R
 
H
L
 
V
G
 
P
E
 
Q
V
 
Y
P
 
Y
Q
 
R
D
 
D
P
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
S
L
 
K
H
 
F
V
 
V
C
 
C
S
 
-
L
 
L
G
 
G
A
x
N
V
 
I
V
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
D
A
 
P
E
 
E
A
 
L
V
 
Q
V
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
L
E
 
D
A
 
Q
L
 
I
R
 
D
A
 
D
R
 
P
T
 
K
T
 
L
I
 
V
T
 
V
Y
 
C
D
 
D
V
 
T
N
 
-
M
|
M
R
 
N
P
x
F
A
x
W
V
 
I
T
 
E
G
 
G
A
 
K
G
 
P
P
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
E
Q
 
E
V
 
L
E
 
K
R
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
F
K
 
I
V
 
V
S
 
N
D
 
D
E
 
S
D
 
E
L
 
A
E
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
G
M
 
D
L
 
P
G
 
N
V
 
L
E
 
V
D
 
K
A
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
I
L
 
I
L
 
R
S
 
E
L
 
M
G
 
G
P
 
P
R
 
K
A
 
T
V
 
L
V
 
I
L
 
I
T
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
E
E
 
H
G
 
G
A
 
A
T
 
L
W
 
L
W
 
F
S
 
T
E
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
I
V
 
F
D
 
A
V
 
A
S
 
P
P
 
A
R
 
F
A
 
P
V
 
L
E
 
E
-
 
S
V
 
I
A
 
Y
D
 
D
T
 
P
I
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
G
A
 
G
L
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
H
L
 
L
W
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
A
R
 
R
L
 
C
P
 
G
T
 
N
L
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
V
 
M
H
 
R
G
 
K
L
 
A
L
 
V
D
 
L
H
 
Y
A
 
G
S
 
S
R
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
S
V
 
F
T
 
C
V
 
V
S
 
E
R
 
Q
P
 
F
G
 
G
A
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R

3i3yD Crystal structure of ribokinase in complex with d-ribose from klebsiella pneumoniae
26% identity, 77% coverage: 19:245/295 of query aligns to 32:239/285 of 3i3yD

query
sites
3i3yD
V
 
V
G
 
S