SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084932211.1 NCBI__GCF_002095475.1:WP_084932211.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

6voqA Crystal structure of ygbl, a putative aldolase/epimerase/decarboxylase from klebsiella pneumoniae
44% identity, 86% coverage: 4:185/212 of query aligns to 4:186/207 of 6voqA

query
sites
6voqA
E
 
E
N
 
Q
T
 
Q
I
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
M
C
 
V
Q
 
Q
T
 
I
G
 
G
H
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
F
R
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
V
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
L
S
 
S
A
 
L
K
 
L
L
 
L
E
 
P
D
 
D
G
 
G
W
 
N
L
 
L
I
 
L
-
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
D
 
G
V
 
A
C
 
C
L
 
L
G
 
G
S
 
E
L
 
L
R
 
Q
P
 
A
D
 
Q
M
 
R
I
 
L
A
 
S
K
 
V
V
 
V
N
 
T
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
E
 
E
W
 
W
V
 
I
N
 
S
G
 
G
G
 
D
K
 
K
P
 
P
S
 
S
K
 
K
T
x
E
L
 
V
K
 
T
L
 
F
H
 
H
R
 
R
T
 
A
I
 
V
Y
 
Y
E
 
L
N
 
H
N
 
N
D
 
P
A
 
A
V
 
C
R
 
K
G
 
A
I
 
I
V
 
V
H
|
H
T
 
L
H
|
H
S
 
S
T
 
H
H
 
Y
L
 
L
V
 
T
A
 
A
M
 
L
T
 
S
L
 
C
G
 
L
E
 
Q
V
 
G
W
 
L
S
 
D
K
 
P
E
 
H
S
 
N
I
 
C
L
 
I
P
 
R
P
 
P
I
 
F
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Q
 
V
V
 
V
M
 
M
K
 
R
V
 
V
G
 
G
R
 
D
I
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
S
 
P
Y
 
Y
C
 
Y
R
 
R
P
 
P
G
 
G
S
 
D
P
 
D
D
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
Q
Q
 
A
A
 
L
G
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
A
H
 
P
D
 
R
V
 
Y
K
 
N
G
 
A
I
 
F
M
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
N
L
x
H
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
W
 
T
G
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L
T
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
T
E
 
N
I
 
N
L
 
T
E
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
K
 
R
L
 
L

Q58813 L-fuculose phosphate aldolase; L-fuculose-1-phosphate aldolase; EC 4.1.2.17 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii)
33% identity, 86% coverage: 8:189/212 of query aligns to 3:176/181 of Q58813

query
sites
Q58813
R
 
K
E
 
K
E
 
Q
I
 
F
C
 
I
Q
 
K
T
 
I
G
 
C
H
 
R
S
 
K
L
 
L
H
 
Y
R
 
D
R
 
R
G
 
K
Y
 
Y
T
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
S
 
G
G
 
G
N
|
N
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
K
L
 
E
E
 
G
D
 
D
G
 
K
W
 
I
L
 
Y
I
 
L
T
 
T
P
 
P
T
 
T
D
 
G
V
 
S
C
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
F
L
 
L
R
 
K
P
 
E
D
 
D
M
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
M
N
 
D
L
 
L
E
 
D
G
 
G
E
 
N
W
 
V
V
 
I
N
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
P
 
P
S
 
T
K
 
S
T
 
E
L
 
K
K
 
N
L
 
L
H
 
H
R
 
L
T
 
M
I
 
I
Y
 
Y
E
 
R
N
 
K
N
 
R
D
 
N
A
 
D
V
 
I
R
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
I
H
 
H
T
 
T
H
 
H
S
 
S
T
 
-
H
 
-
L
 
L
V
 
I
A
 
S
M
 
T
T
 
F
L
 
L
G
 
S
E
 
T
V
 
I
W
 
N
S
 
K
K
 
E
E
 
I
S
 
E
I
 
L
L
 
L
P
 
T
P
 
P
I
 
E
T
 
G
P
 
K
Y
 
I
Q
 
F
V
 
L
M
 
K
K
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
Y
I
 
V
S
 
D
Y
 
Y
C
 
Y
R
 
E
P
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
L
D
 
K
V
 
L
A
 
A
V
 
E
Q
 
E
A
 
T
G
 
A
E
 
K
L
 
R
A
 
D
H
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
-
G
 
-
I
 
I
M
 
I
L
 
L
E
 
K
R
 
N
L
 
H
G
 
G
P
 
V
V
 
V
I
 
C
W
 
L
G
 
G
T
 
K
S
 
D
V
 
L
T
 
I
K
 
D
A
 
A
A
 
Y
E
 
I
I
 
K
L
 
V
E
 
E
E
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
T
 
Q
A
 
A
K
 
K
L
 
L
W
 
T
L
 
L
M
 
L
T
 
N

1dzuP L-fuculose-1-phosphate aldolase from escherichia coli mutant t26a (see paper)
26% identity, 87% coverage: 5:189/212 of query aligns to 4:184/209 of 1dzuP

query
sites
1dzuP
N
 
N
T
 
K
I
 
L
R
 
A
E
 
R
E
 
Q
I
 
I
C
 
I
Q
 
D
T
 
T
G
 
C
H
 
L
S
 
E
L
 
M
H
 
T
R
 
R
R
 
L
G
 
G
Y
 
L
T
 
N
V
 
Q
G
 
G
S
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
R
L
 
Y
E
 
Q
D
 
D
G
 
G
W
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
T
 
T
D
 
G
V
 
I
C
 
P
L
 
Y
G
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
T
P
 
E
D
 
S
M
 
H
I
 
I
A
 
V
K
 
F
V
 
I
N
 
D
L
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
K
W
 
H
V
 
E
N
 
E
G
 
G
G
 
K
K
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
S
T
x
E
L
 
W
K
 
R
L
 
F
H
 
H
R
 
M
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
S
N
 
R
D
 
P
A
 
D
V
 
A
R
 
N
G
 
A
I
 
V
V
 
V
H
|
H
T
 
N
H
|
H
S
 
A
T
 
V
H
 
H
L
 
C
V
 
T
A
 
A
M
 
V
T
 
S
L
 
I
G
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
S
 
L
K
 
N
E
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
-
P
 
-
P
 
P
I
 
A
T
 
I
P
 
H
Y
 
Y
Q
 
M
V
 
I
M
 
A
K
 
A
V
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
N
R
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
C
I
 
A
S
 
P
Y
 
Y
C
 
A
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
D
 
E
V
 
L
A
 
S
V
 
E
Q
 
H
A
 
V
G
 
A
E
 
L
L
 
A
A
 
L
H
 
K
D
 
N
V
 
R
K
 
K
G
 
A
I
 
T
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
H
L
x
H
G
 
G
P
 
L
V
 
I
I
 
A
W
 
C
G
 
E
T
 
V
S
 
N
V
 
L
T
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
W
I
 
L
L
 
A
E
 
H
E
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
V
T
 
L
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
M
 
T
T
 
T

4fuaA L-fuculose-1-phosphate aldolase complex with pgh (see paper)
26% identity, 87% coverage: 5:189/212 of query aligns to 4:184/206 of 4fuaA

query
sites
4fuaA
N
 
N
T
 
K
I
 
L
R
 
A
E
 
R
E
 
Q
I
 
I
C
 
I
Q
 
D
T
 
T
G
 
C
H
 
L
S
 
E
L
 
M
H
 
T
R
 
R
R
 
L
G
 
G
Y
 
L
T
 
N
V
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
A
G
|
G
N
|
N
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
R
L
 
Y
E
 
Q
D
 
D
G
 
G
W
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
T
|
T
D
 
G
V
 
I
C
 
P
L
 
Y
G
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
T
P
 
E
D
 
S
M
 
H
I
 
I
A
 
V
K
 
F
V
 
I
N
 
D
L
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
K
W
 
H
V
 
E
N
 
E
G
 
G
G
 
K
K
 
L
P
 
P
S
|
S
K
x
S
T
x
E
L
 
W
K
 
R
L
 
F
H
 
H
R
 
M
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
S
N
 
R
D
 
P
A
 
D
V
 
A
R
 
N
G
 
A
I
 
V
V
 
V
H
|
H
T
 
N
H
|
H
S
 
A
T
 
V
H
 
H
L
 
C
V
 
T
A
 
A
M
 
V
T
 
S
L
 
I
G
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
S
 
L
K
 
N
E
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
-
P
 
-
P
 
P
I
 
A
T
 
I
P
 
H
Y
|
Y
Q
 
M
V
 
I
M
 
A
K
x
A
V
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
N
R
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
C
I
 
A
S
 
P
Y
 
Y
C
 
A
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
D
 
E
V
 
L
A
 
S
V
 
E
Q
 
H
A
 
V
G
 
A
E
 
L
L
 
A
A
 
L
H
 
K
D
 
N
V
 
R
K
 
K
G
 
A
I
 
T
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
H
L
x
H
G
 
G
P
 
L
V
 
I
I
 
A
W
 
C
G
 
E
T
 
V
S
 
N
V
 
L
T
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
W
I
 
L
L
 
A
E
 
H
E
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
V
T
 
L
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
M
 
T
T
 
T

2fuaA L-fuculose 1-phosphate aldolase crystal form t with cobalt (see paper)
26% identity, 87% coverage: 5:189/212 of query aligns to 4:184/210 of 2fuaA

query
sites
2fuaA
N
 
N
T
 
K
I
 
L
R
 
A
E
 
R
E
 
Q
I
 
I
C
 
I
Q
 
D
T
 
T
G
 
C
H
 
L
S
 
E
L
 
M
H
 
T
R
 
R
R
 
L
G
 
G
Y
 
L
T
 
N
V
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
R
L
 
Y
E
 
Q
D
 
D
G
 
G
W
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
T
 
T
D
 
G
V
 
I
C
 
P
L
 
Y
G
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
T
P
 
E
D
 
S
M
 
H
I
 
I
A
 
V
K
 
F
V
 
I
N
 
D
L
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
K
W
 
H
V
 
E
N
 
E
G
 
G
G
 
K
K
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
S
T
x
E
L
 
W
K
 
R
L
 
F
H
 
H
R
 
M
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
S
N
 
R
D
 
P
A
 
D
V
 
A
R
 
N
G
 
A
I
 
V
V
 
V
H
|
H
T
 
N
H
|
H
S
 
A
T
 
V
H
 
H
L
 
C
V
 
T
A
 
A
M
 
V
T
 
S
L
 
I
G
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
S
 
L
K
 
N
E
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
-
P
 
-
P
 
P
I
 
A
T
 
I
P
 
H
Y
|
Y
Q
 
M
V
 
I
M
 
A
K
x
A
V
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
N
R
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
C
I
 
A
S
 
P
Y
 
Y
C
 
A
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
D
 
E
V
 
L
A
 
S
V
 
E
Q
 
H
A
 
V
G
 
A
E
 
L
L
 
A
A
 
L
H
 
K
D
 
N
V
 
R
K
 
K
G
 
A
I
 
T
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
H
L
x
H
G
 
G
P
 
L
V
 
I
I
 
A
W
 
C
G
 
E
T
 
V
S
 
N
V
 
L
T
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
W
I
 
L
L
 
A
E
 
H
E
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
V
T
 
L
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
M
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P0AB87 L-fuculose phosphate aldolase; D-ribulose-phosphate aldolase; L-fuculose-1-phosphate aldolase; EC 4.1.2.17 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
26% identity, 87% coverage: 5:189/212 of query aligns to 4:184/215 of P0AB87

query
sites
P0AB87
N
 
N
T
 
K
I
 
L
R
 
A
E
 
R
E
 
Q
I
 
I
C
 
I
Q
 
D
T
 
T
G
 
C
H
 
L
S
 
E
L
 
M
H
 
T
R
 
R
R
 
L
G
 
G
Y
 
L
T
 
N
V
 
Q
G
 
G
S
x
T
S
x
A
G
|
G
N
|
N
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
R
L
 
Y
E
 
Q
D
 
D
G
 
G
W
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
T
|
T
D
x
G
V
 
I
C
 
P
L
 
Y
G
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
T
P
 
E
D
 
S
M
 
H
I
 
I
A
 
V
K
 
F
V
 
I
N
 
D
L
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
K
W
 
H
V
 
E
N
 
E
G
 
G
G
 
K
K
 
L
P
 
P
S
|
S
K
x
S
T
x
E
L
 
W
K
 
R
L
 
F
H
 
H
R
 
M
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
S
N
 
R
D
 
P
A
 
D
V
 
A
R
 
N
G
 
A
I
 
V
V
 
V
H
|
H
T
 
N
H
|
H
S
 
A
T
 
V
H
 
H
L
 
C
V
 
T
A
 
A
M
 
V
T
 
S
L
 
I
G
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
S
 
L
K
 
N
E
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
-
P
 
-
P
 
P
I
 
A
T
 
I
P
 
H
Y
|
Y
Q
 
M
V
 
I
M
 
A
K
 
A
V
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
N
R
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
C
I
 
A
S
 
P
Y
 
Y
C
 
A
R
 
T
P
x
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
D
 
E
V
 
L
A
 
S
V
 
E
Q
 
H
A
 
V
G
 
A
E
 
L
L
 
A
A
 
L
H
 
K
D
 
N
V
 
R
K
 
K
G
 
A
I
 
T
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
H
L
x
H
G
 
G
P
 
L
V
 
I
I
 
A
W
 
C
G
 
E
T
 
V
S
 
N
V
 
L
T
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
W
I
 
L
L
 
A
E
 
H
E
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
V
T
 
L
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
M
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P0DTQ0 5-deoxy-D-ribulose 1-phosphate aldolase; 5-deoxyribose disposal aldolase; EC 4.1.2.- from Bacillus thuringiensis serovar kurstaki (strain ATCC 35866 / NRRL B-4488 / HD73) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 8:209/212 of query aligns to 7:208/213 of P0DTQ0

query
sites
P0DTQ0
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
C
 
V
Q
 
A
T
 
Y
G
 
G
H
 
K
S
 
K
L
 
M
H
 
I
R
 
S
R
 
S
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
V
 
K
G
 
G
S
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
I
S
 
S
A
 
I
-
 
F
K
 
N
L
 
R
E
 
E
D
 
Q
G
 
G
W
 
L
L
 
V
-
 
A
I
 
I
T
 
S
P
 
P
T
 
S
D
 
G
V
 
L
C
 
E
L
 
Y
G
 
Y
S
 
E
L
 
T
R
 
K
P
 
P
D
 
E
M
 
D
I
 
V
A
 
V
K
 
I
V
 
L
N
 
N
L
 
L
E
 
D
G
 
G
E
 
E
W
 
V
V
 
I
N
 
E
G
 
G
G
 
E
-
 
R
K
 
K
P
 
P
S
 
S
K
 
S
T
x
E
L
 
L
K
 
D
L
 
M
H
 
H
R
 
L
T
 
I
I
 
Y
Y
 
Y
E
 
R
N
 
K
N
 
R
D
 
E
A
 
D
V
 
I
R
 
N
G
 
A
I
 
L
V
 
V
H
|
H
T
 
T
H
|
H
S
 
S
T
 
P
H
 
Y
L
 
-
V
 
-
A
 
A
M
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
A
E
 
S
V
 
L
-
 
G
W
 
W
S
 
E
K
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
P
 
A
I
 
V
T
 
S
P
 
Y
Y
 
L
Q
 
I
V
 
A
M
 
F
K
 
A
V
 
G
G
 
P
R
 
N
I
 
V
P
 
R
L
 
C
I
 
A
S
 
P
Y
 
Y
C
 
E
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
K
D
 
Q
V
 
L
A
 
A
V
 
D
Q
 
A
A
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
G
A
 
M
H
 
I
D
 
D
V
 
R
K
 
R
G
 
A
I
 
V
M
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
N
L
x
H
G
 
G
P
 
L
V
 
I
I
 
A
W
 
G
G
 
A
T
 
N
S
 
N
V
 
I
T
 
K
K
 
M
A
 
A
A
 
F
E
 
T
I
 
V
L
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
I
E
 
E
E
 
F
T
 
C
A
 
A
K
 
Q
L
 
I
W
 
Y
L
 
Y
M
 
Q
T
 
T
H
 
K
P
 
S
-
 
I
-
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
K
S
 
L
L
 
L
S
 
P
Q
 
E
P
 
D
A
 
E
L
 
M
Q
 
E
D
 
N
L
 
L
F
 
A
D
 
K
T
 
K
F
 
F
D
 
E

6btgA Crystal structure of deoxyribose-phosphate aldolase bound with dhap from bacillus thuringiensis (see paper)
27% identity, 95% coverage: 8:208/212 of query aligns to 7:207/207 of 6btgA

query
sites
6btgA
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
C
 
V
Q
 
A
T
 
Y
G
 
G
H
 
K
S
 
K
L
 
M
H
 
I
R
 
S
R
 
S
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
V
 
K
G
 
G
S
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
I
S
 
S
A
 
I
-
 
F
K
 
N
L
 
R
E
 
E
D
 
Q
G
 
G
W
 
L
L
 
V
-
 
A
I
 
I
T
 
S
P
 
P
T
 
S
D
 
G
V
 
L
C
 
E
L
 
Y
G
 
Y
S
 
E
L
 
T
R
 
K
P
 
P
D
 
E
M
 
D
I
 
V
A
 
V
K
 
I
V
 
L
N
 
N
L
 
L
E
 
D
G
 
G
E
 
E
W
 
V
V
 
I
N
 
E
G
 
G
G
 
E
-
 
R
K
 
K
P
 
P
S
 
S
K
 
S
T
x
E
L
 
L
K
 
D
L
 
M
H
 
H
R
 
L
T
 
I
I
 
Y
Y
 
Y
E
 
R
N
 
K
N
 
R
D
 
E
A
 
D
V
 
I
R
 
N
G
 
A
I
 
L
V
 
V
H
|
H
T
 
T
H
|
H
S
 
S
T
 
P
H
 
Y
L
 
-
V
 
-
A
 
A
M
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
A
E
 
S
V
 
L
-
 
G
W
 
W
S
 
E
K
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
P
 
A
I
 
V
T
 
S
P
x
Y
Y
 
L
Q
 
I
V
 
A
M
 
F
K
 
A
V
 
G
G
 
P
R
 
N
I
 
V
P
 
R
L
 
C
I
 
A
S
 
P
Y
 
Y
C
 
E
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
K
D
 
Q
V
 
L
A
 
A
V
 
D
Q
 
A
A
 
A
G
 
F
E
 
E
L
 
G
A
 
M
H
 
I
D
 
D
V
 
R
K
 
R
G
 
A
I
 
V
M
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
N
L
x
H
G
 
G
P
 
L
V
 
I
I
 
A
W
 
G
G
 
A
T
 
N
S
 
N
V
 
I
T
 
K
K
 
M
A
 
A
A
 
F
E
 
T
I
 
V
L
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
I
E
 
E
E
 
F
T
 
C
A
 
A
K
 
Q
L
 
I
W
 
Y
L
 
Y
M
 
Q
T
 
T
H
 
K
P
 
S
-
 
I
-
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
K
S
 
L
L
 
L
S
 
P
Q
 
E
P
 
D
A
 
E
L
 
M
Q
 
E
D
 
N
L
 
L
F
 
A
D
 
K
T
 
K
F
 
F

7x78A L-fuculose 1-phosphate aldolase (see paper)
26% identity, 87% coverage: 5:189/212 of query aligns to 4:181/203 of 7x78A

query
sites
7x78A
N
 
N
T
x
R
I
 
L
R
 
A
E
x
R
E
 
Q
I
 
I
C
 
I
Q
 
D
T
 
T
G
 
C
H
 
L
S
 
E
L
 
M
H
 
T
R
 
R
R
 
L
G
 
G
Y
 
L
T
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
N
S
 
A
G
 
G
N
|
N
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
R
L
 
Y
E
 
Q
D
 
G
G
 
G
W
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
T
|
T
D
 
G
V
 
I
C
 
P
L
 
Y
G
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
T
P
 
E
D
 
D
M
 
K
I
 
I
A
 
V
K
 
F
V
 
I
N
 
D
L
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
Q
W
x
H
V
 
E
N
x
Q
G
 
G
G
 
K
K
 
L
P
 
P
S
|
S
K
x
S
T
x
E
L
 
W
K
 
R
L
 
F
H
 
H
R
 
Q
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
T
N
 
R
D
 
P
A
 
D
V
 
A
R
 
Q
G
 
A
I
 
V
V
 
V
H
|
H
T
 
N
H
|
H
S
 
A
T
 
V
H
 
H
L
 
C
V
 
T
A
 
A
M
 
V
T
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
S
I
 
I
L
 
L
P
 
N
-
 
R
-
 
P
-
 
I
P
 
P
I
 
A
T
 
I
P
 
H
Y
 
Y
Q
 
M
V
 
I
M
 
A
K
 
A
V
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
N
R
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
C
I
 
A
S
 
P
Y
 
Y
C
 
A
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
D
 
E
V
 
L
A
 
S
V
 
E
Q
 
H
A
 
V
G
 
A
E
 
V
L
 
A
A
 
L
H
 
K
D
 
H
V
 
R
K
 
K
G
 
A
I
 
T
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
H
L
x
H
G
 
G
P
 
L
V
 
I
I
 
A
W
 
C
G
 
E
T
 
A
S
 
S
V
 
L
T
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
W
I
 
L
L
 
A
E
 
H
E
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
V
T
 
L
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
M
 
S
T
 
T

4c25A L-fuculose 1-phosphate aldolase (see paper)
23% identity, 91% coverage: 7:199/212 of query aligns to 9:199/212 of 4c25A

query
sites
4c25A
I
 
V
R
 
K
E
 
Q
E
 
E
I
 
L
C
 
I
Q
 
K
T
 
Y
G
 
G
H
 
K
S
 
K
L
 
L
H
 
V
R
 
E
R
 
T
G
 
D
Y
 
L
T
 
T
V
 
K
G
 
G
S
 
T
S
x
G
G
 
G
N
 
N
I
 
L
S
 
S
A
 
V
K
 
F
L
 
D
E
 
R
D
 
E
G
 
K
W
 
Q
L
 
L
-
 
M
-
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
T
 
S
D
 
G
V
 
I
C
 
D
L
 
F
G
 
F
S
 
E
L
 
I
R
 
K
P
 
E
D
 
S
M
 
D
I
 
I
A
 
V
K
 
V
V
 
M
N
 
D
L
 
I
E
 
N
G
 
G
E
 
N
W
 
V
V
 
V
N
 
E
G
 
G
G
 
E
K
 
R
-
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
S
T
x
E
L
 
W
K
 
Y
L
 
M
H
 
H
R
 
L
T
 
I
I
 
Q
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
T
N
 
R
D
 
D
A
 
D
V
 
I
R
 
D
G
 
A
I
 
I
V
 
I
H
|
H
T
 
A
H
|
H
S
 
T
T
 
T
H
 
Y
L
 
A
V
 
T
A
 
V
M
 
L
T
 
A
L
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
C
S
 
L
K
 
R
E
 
E
S
 
P
I
 
L
L
 
-
P
 
-
P
 
P
I
 
A
T
 
S
P
 
H
Y
|
Y
Q
 
M
V
 
I
M
 
A
K
 
V
V
 
A
G
 
G
R
 
K
-
 
D
I
 
V
P
 
R
L
 
V
I
 
A
S
 
E
Y
 
Y
C
 
A
R
 
T
P
 
Y
G
 
G
S
 
T
P
 
K
D
 
E
V
 
L
A
 
A
V
 
V
Q
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
A
A
 
M
H
 
E
D
 
G
V
 
R
K
 
R
G
 
A
I
 
V
M
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
N
L
x
H
G
 
G
P
 
I
V
 
L
I
 
A
W
 
G
G
 
A
T
 
Q
S
 
N
V
 
L
T
 
L
K
 
N
A
 
A
A
 
F
E
 
N
I
 
I
L
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
Y
T
 
C
A
 
A
K
 
K
L
 
I
W
 
Y
L
 
C
M
 
L
T
 
A
H
 
K
P
 
N
K
 
F
P
 
G
E
 
E
S
 
P
L
 
V
S
 
V
Q
 
L
P
 
P

1jdiA Crystal structure of l-ribulose-5-phosphate 4-epimerase (see paper)
25% identity, 86% coverage: 7:188/212 of query aligns to 5:199/223 of 1jdiA

query
sites
1jdiA
I
 
L
R
 
K
E
 
R
E
 
Q
I
 
V
C
 
L
Q
 
E
T
 
A
G
 
N
H
 
L
S
 
A
L
 
L
H
 
P
R
 
K
R
 
H
G
 
N
Y
 
L
T
 
V
V
 
T
G
 
L
S
 
T
S
 
W
G
 
G
N
 
N
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
V
K
 
D
L
 
R
E
 
E
D
 
R
G
 
G
-
 
V
W
 
F
L
 
V
I
 
I
T
 
K
P
 
P
T
 
S
D
 
G
V
 
V
C
 
D
L
 
Y
G
 
S
S
 
I
L
 
M
R
 
T
P
 
A
D
 
D
M
 
D
I
 
M
A
 
V
K
 
V
V
 
V
N
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
V
V
 
V
N
 
E
G
 
G
G
 
A
K
 
K
-
 
K
P
 
P
S
 
S
K
 
S
T
x
D
L
 
T
K
 
P
L
 
T
H
 
H
R
 
R
T
 
L
I
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
A
N
 
F
D
 
P
A
 
S
V
 
I
R
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
H
|
H
T
 
T
H
|
H
S
 
S
T
 
R
H
 
H
L
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
A
E
 
T
V
 
I
W
 
W
S
 
A
K
 
Q
-
 
A
-
 
G
E
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
P
P
 
A
P
 
T
I
 
G
T
|
T
P
 
T
Y
 
H
Q
 
A
V
x
D
M
 
Y
K
 
F
V
 
Y
G
 
G
R
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
-
I
 
-
S
 
-
Y
 
-
C
 
C
R
 
T
P
 
R
G
 
K
S
 
M
P
 
T
D
 
D
V
 
A
A
 
E
V
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
Y
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
F
-
 
E
Q
 
K
A
 
Q
G
 
G
E
 
I
L
 
D
A
 
A
H
 
A
D
 
Q
V
 
M
K
 
P
G
 
G
I
 
V
M
 
L
L
 
V
E
 
H
R
 
S
L
x
H
G
 
G
P
 
P
V
 
F
I
 
A
W
 
W
G
 
G
T
 
K
S
 
N
V
 
A
T
 
E
K
 
D
A
 
A
A
 
V
E
 
H
I
 
N
L
 
A
E
 
I
E
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
A
K
 
Y
L
 
M
W
 
G
L
 
I
M
 
F

P08203 L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase AraD; Phosphoribulose isomerase; EC 5.1.3.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
25% identity, 86% coverage: 7:188/212 of query aligns to 5:199/231 of P08203

query
sites
P08203
I
 
L
R
 
K
E
 
R
E
 
Q
I
 
V
C
 
L
Q
 
E
T
 
A
G
 
N
H
 
L
S
 
A
L
 
L
H
 
P
R
 
K
R
 
H
G
 
N
Y
 
L
T
 
V
V
 
T
G
 
L
S
 
T
S
 
W
G
 
G
N
|
N
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
V
K
 
D
L
 
R
E
 
E
D
 
R
G
 
G
-
 
V
W
 
F
L
 
V
I
 
I
T
x
K
P
 
P
T
 
S
D
 
G
V
 
V
C
 
D
L
 
Y
G
 
S
S
 
V
L
 
M
R
 
T
P
 
A
D
 
D
M
 
D
I
 
M
A
 
V
K
 
V
V
 
V
N
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
V
V
 
V
N
 
E
G
 
G
-
 
T
G
 
K
K
 
K
P
 
P
S
 
S
K
 
S
T
x
D
L
 
T
K
 
P
L
 
T
H
 
H
R
 
R
T
 
L
I
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
N
 
A
N
 
F
D
 
P
A
 
S
V
 
I
R
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
H
|
H
T
 
T
H
|
H
S
 
S
T
 
R
H
 
H
L
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
A
E
 
T
V
 
I
W
 
W
S
 
A
K
 
Q
-
 
A
-
 
G
E
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
P
P
 
A
P
 
T
I
 
G
T
|
T
P
 
T
Y
 
H
Q
 
A
V
x
D
M
 
Y
K
 
F
V
 
Y
G
 
G
R
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
-
I
 
-
S
 
-
Y
 
-
C
 
C
R
 
T
P
 
R
G
 
K
S
 
M
P
 
T
D
 
D
V
 
A
A
 
E
V
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
Y
-
x
E
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
F
-
 
E
Q
 
K
A
 
Q
G
 
G
E
 
I
L
 
D
A
 
A
H
 
A
D
 
Q
V
 
M
K
 
P
G
 
G
I
 
V
M
 
L
L
 
V
E
 
H
R
 
S
L
x
H
G
 
G
P
 
P
V
 
F
I
 
A
W
 
W
G
 
G
T
 
K
S
 
N
V
 
A
T
 
E
K
 
D
A
 
A
A
 
V
E
 
H
I
 
N
L
 
A
E
 
I
E
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
A
K
 
Y
L
 
M
W
 
G
L
 
I
M
 
F

Sites not aligning to the query:

4m6rA Structural and biochemical basis for the inhibition of cell death by apip, a methionine salvage enzyme (see paper)
24% identity, 83% coverage: 3:177/212 of query aligns to 5:194/224 of 4m6rA

query
sites
4m6rA
H
 
H
E
 
P
N
 
R
T
 
Y
I
 
L
R
 
I
E
 
P
E
 
E
I
 
L
C
 
C
Q
 
K
T
 
Q
G
 
F
H
 
Y
S
 
H
L
 
L
H
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
G
Y
 
W
T
 
V
V
 
T
G
 
G
S
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
L
K
 
K
L
 
H
E
 
G
D
 
D
G
 
E
W
 
I
L
 
Y
I
 
I
T
 
A
P
 
P
T
 
S
D
 
G
V
 
V
C
 
Q
L
 
K
G
 
E
S
 
R
L
 
I
R
 
Q
P
 
P
D
 
E
M
 
D
I
 
M
A
 
F
K
 
V
V
 
C
N
 
D
L
 
I
E
 
N
G
 
E
E
 
K
W
 
D
V
 
I
N
 
S
G
 
G
G
 
P
K
 
S
P
 
P
S
 
S
K
 
K
T
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
K
H
 
S
R
 
Q
T
 
C
-
 
T
-
 
P
I
 
L
Y
 
F
E
 
M
N
 
N
N
 
A
D
 
Y
A
 
T
V
 
M
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
I
H
|
H
T
 
T
H
|
H
S
 
S
T
 
K
H
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
M
M
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
F
P
 
P
I
 
G
T
 
R
P
 
E
Y
 
F
Q
 
K
V
 
I
M
 
T
K
 
H
V
 
Q
G
 
E
R
 
M
I
 
I
P
 
K
L
 
G
I
 
I
S
 
K
Y
 
K
C
 
C
R
 
T
P
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
Y
-
 
R
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
N
S
 
T
P
 
P
D
 
E
V
 
E
A
 
K
V
 
D
Q
 
L
A
 
K
G
 
D
E
 
R
L
 
M
A
 
A
H
 
H
-
 
A
-
 
M
-
 
N
-
 
E
-
 
Y
-
 
P
D
 
D
V
 
S
K
 
C
G
 
A
I
 
V
M
 
L
L
 
V
E
 
R
R
 
R
L
x
H
G
 
G
P
 
V
V
 
Y
I
 
V
W
 
W
G
 
G
T
 
E
S
 
T
V
 
W
T
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
K
E
 
T
I
 
M
L
 
C
E
 
E

Q96GX9 Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase; MTRu-1-P dehydratase; APAF1-interacting protein; hAPIP; EC 4.2.1.109 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
24% identity, 83% coverage: 3:177/212 of query aligns to 23:212/242 of Q96GX9

query
sites
Q96GX9
H
|
H
E
 
P
N
 
R
T
 
Y
I
 
L
R
 
I
E
 
P
E
 
E
I
 
L
C
 
C
Q
 
K
T
 
Q
G
 
F
H
 
Y
S
 
H
L
 
L
H
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
G
Y
 
W
T
 
V
V
 
T
G
 
G
S
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
L
K
 
K
L
 
H
E
 
G
D
 
D
G
 
E
W
 
I
L
 
Y
I
 
I
T
 
A
P
 
P
T
 
S
D
 
G
V
 
V
C
 
Q
L
 
K
G
 
E
S
 
R
L
 
I
R
 
Q
P
 
P
D
 
E
M
 
D
I
 
M
A
 
F
K
 
V
V
x
C
N
 
D
L
 
I
E
 
N
G
 
E
E
 
K
W
 
D
V
 
I
N
x
S
G
 
G
G
 
P
K
x
S
P
 
P
S
|
S
K
 
K
T
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
K
H
 
S
R
x
Q
T
x
C
-
 
T
-
 
P
I
 
L
Y
 
F
E
 
M
N
 
N
N
 
A
D
 
Y
A
 
T
V
 
M
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
I
H
|
H
T
 
T
H
|
H
S
 
S
T
 
K
H
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
M
M
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
F
P
 
P
I
 
G
T
 
R
P
 
E
Y
 
F
Q
 
K
V
 
I
M
 
T
K
 
H
V
 
Q
G
x
E
R
 
M
I
 
I
P
 
K
L
 
G
I
 
I
S
 
K
Y
 
K
C
 
C
R
 
T
P
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
Y
-
 
R
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
N
S
 
T
P
 
P
D
 
E
V
 
E
A
 
K
V
 
D
Q
 
L
A
 
K
G
 
D
E
 
R
L
 
M
A
 
A
H
 
H
-
 
A
-
x
M
-
 
N
-
 
E
-
 
Y
-
 
P
D
 
D
V
 
S
K
 
C
G
 
A
I
 
V
M
 
L
L
 
V
E
 
R
R
 
R
L
x
H
G
 
G
P
 
V
V
 
Y
I
 
V
W
 
W
G
 
G
T
 
E
S
 
T
V
 
W
T
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
K
E
 
T
I
 
M
L
 
C
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_084932211.1 NCBI__GCF_002095475.1:WP_084932211.1
MSHENTIREEICQTGHSLHRRGYTVGSSGNISAKLEDGWLITPTDVCLGSLRPDMIAKVN
LEGEWVNGGKPSKTLKLHRTIYENNDAVRGIVHTHSTHLVAMTLGEVWSKESILPPITPY
QVMKVGRIPLISYCRPGSPDVAVQAGELAHDVKGIMLERLGPVIWGTSVTKAAEILEELE
ETAKLWLMTHPKPESLSQPALQDLFDTFDCRW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory